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文檔簡介
第六章
微生物群體感應(yīng)系統(tǒng)及其應(yīng)用課時(shí):4學(xué)時(shí)
授課方式:講授+討論開課時(shí)間:2014年秋季學(xué)期第6章群體感應(yīng)系統(tǒng)主要內(nèi)容群體感應(yīng)的概念群體感應(yīng)的分子機(jī)制群體感應(yīng)的生物效應(yīng)群體感應(yīng)的應(yīng)用群體感應(yīng)的研究歷史第6章群體感應(yīng)系統(tǒng)群體感應(yīng)的定義群體感應(yīng)(quorum
sensing,
QS)微生物間通過分泌、釋放一些特定的信號分子,感知濃度變化,監(jiān)測菌群密度、調(diào)控菌群生理功能,從而適應(yīng)環(huán)境條件的一種信號交流機(jī)制,又稱細(xì)胞交流或自誘導(dǎo)(Auto-induce)群體感應(yīng)調(diào)節(jié)細(xì)菌釋放自誘導(dǎo)物質(zhì)
(Auto-inducer,
AI)的信號分子臨界濃度時(shí),AI能啟動(dòng)菌體相關(guān)基因的表達(dá),調(diào)控細(xì)菌的生物行為(產(chǎn)生毒素、生物膜、抗生素、孢子、熒光等),使其調(diào)節(jié)自身行為以適應(yīng)環(huán)境變化感應(yīng)現(xiàn)象在細(xì)菌密度達(dá)到一定閾值
后發(fā)生,這一現(xiàn)象也被稱為細(xì)胞密
度基因表達(dá)
(cell
density
dependent
control
of
gene
expression)第6章群體感應(yīng)系統(tǒng)群體感應(yīng)調(diào)節(jié)示意圖信號分子臨界濃度基因表達(dá)生物行為調(diào)節(jié)群體感應(yīng)的定義第6章群體感應(yīng)系統(tǒng)
QS信號分子特點(diǎn)分子量?。喝珲;?高絲氨酸內(nèi)酯(AHL)衍生物、寡肽等,能自由進(jìn)出細(xì)胞或通過寡肽通透酶分泌到環(huán)境種屬特異性:一種細(xì)菌調(diào)節(jié)蛋白能響應(yīng)多種信息素,已建立多種革蘭氏陰性菌信息素檢測系統(tǒng)依賴生長期和細(xì)胞密度:對數(shù)期或穩(wěn)定期在環(huán)境中積累達(dá)到較高濃度,其所調(diào)節(jié)的基因表達(dá)量最大細(xì)菌感染調(diào)控:許多信息素產(chǎn)生菌是動(dòng)植物致病菌或共生菌,它在細(xì)菌和宿主之間的相互作用中起著重要的調(diào)控作用兼具抗生素活性:Lactococcuslastis產(chǎn)生的乳鏈球菌素nisin,既作為信息調(diào)節(jié)細(xì)胞生物合成和免疫基因的表達(dá),也拮抗其他微生物;植物乳球菌(L.
plantarum)產(chǎn)生的植物乳桿菌素A也有信息素和抗生素的雙重活性群體感應(yīng)的定義第6章群體感應(yīng)系統(tǒng)
QS信號分子分類(1)革蘭氏陽性菌中多肽AIP
(2)革蘭氏陰性菌的AHL/AI-1型(3)
LuxS/AI-2型(4)
AI-3/腎上腺素/去甲腎上腺素群體感應(yīng)的定義第6章群體感應(yīng)系統(tǒng)1970年,Nealson等首次發(fā)現(xiàn)費(fèi)式弧菌(Vibrio
fischeri)的生物發(fā)光現(xiàn)象
V.fischeri與某些海生動(dòng)物共生,宿主利用其發(fā)光撲獲食
物、躲避天敵,同時(shí)V.fischeri獲得營養(yǎng)豐富的環(huán)境
1983年,Engebrecht等找到了費(fèi)式弧菌群體感應(yīng)的相關(guān)基因和群體模型群體感應(yīng)的研究進(jìn)展第6章群體感應(yīng)系統(tǒng)
20世紀(jì)90年代初,QS研究開始大部分細(xì)菌均有兩套群體感應(yīng)系統(tǒng):一套用于種內(nèi)信息交流,一套用于種間信息交流QS調(diào)節(jié)細(xì)菌的生理功能:如生物發(fā)光、毒素的產(chǎn)生、質(zhì)粒的轉(zhuǎn)移、根瘤菌的結(jié)瘤、抗生素合成QS調(diào)控細(xì)菌的多種生活習(xí)性:如質(zhì)粒的接合轉(zhuǎn)移、生物膜形成、孢子形成、細(xì)胞分化、運(yùn)動(dòng)性、胞外多糖形成QS參與致病菌的毒力因子誘導(dǎo)、細(xì)菌與真核生物的共生、抗生素與細(xì)菌素合成等與人類關(guān)系密切的細(xì)菌生理特性群體感應(yīng)的研究進(jìn)展第6章群體感應(yīng)系統(tǒng)了解單細(xì)胞微生物的信息交流與行為特性關(guān)系,建立化學(xué)信號物質(zhì)和生理行為的聯(lián)系,例如:齲齒周圍生物膜形成參與的菌種,所有細(xì)菌均參與群體感應(yīng)
Nature
Reviews,
Biotechnology群體感應(yīng)的研究意義第6章群體感應(yīng)系統(tǒng)通過人為干擾或促進(jìn)微生物群體感應(yīng)而調(diào)控某種功能,
在環(huán)境科學(xué)和工程研究中意義重要
群體感應(yīng)可以促進(jìn)胞外聚合物(EPS)中胞外DNA
(eDNA)的大量釋放,產(chǎn)生的eDNA促進(jìn)細(xì)胞間和細(xì)胞與表面的互聯(lián),促使生物膜有效形成
研究表明,可通過有效抑制破壞胞外聚合物的eDNA,抑制生物膜形成EnvironmentalMicrobiologyReports(2013)5(6),778–786群體感應(yīng)的研究意義第6章群體感應(yīng)系統(tǒng)群體感應(yīng)(quorum
sensing,
QS)種內(nèi)QS系統(tǒng)種間QS系統(tǒng)G-菌QS系統(tǒng)G+菌QS系統(tǒng)
QS
系統(tǒng)分類群體感應(yīng)的分子機(jī)制第6章群體感應(yīng)系統(tǒng)
革蘭氏陰性菌QS系統(tǒng)—LuxI-AHL型自誘導(dǎo)分子:脂肪酰基高絲氨酸內(nèi)酯(acyl
homoserine
lactones,
AHL)AI合成蛋白(LuxI蛋白酶):可催化帶有酰基載體蛋白的?;鶄?cè)鏈與S-腺苷蛋氨酸上的高絲
氨酸結(jié)合生成AHL受體(LuxR蛋白酶):AHL與
IuxR蛋白結(jié)合為濃度依賴型;
無AHL時(shí),LuxR無活性,
且很快被降解掉群體感應(yīng)的分子機(jī)制第6章群體感應(yīng)系統(tǒng)革蘭氏陰性菌QS系統(tǒng)—LuxI-AHL型AHL可自由出入細(xì)胞體內(nèi)外細(xì)胞達(dá)到一定密度,信號分子接近濃度閾值信號分子通過細(xì)胞膜的方式:自由擴(kuò)散群體感應(yīng)的分子機(jī)制第6章群體感應(yīng)系統(tǒng)革蘭氏陰性菌QS系統(tǒng)—LuxI-AHL型AHL-LuxR復(fù)合物作為轉(zhuǎn)錄因子,激活目標(biāo)基因的表達(dá)還可激活LuxI的表達(dá),形成級聯(lián)放大正反饋反應(yīng)群體感應(yīng)的分子機(jī)制第6章群體感應(yīng)系統(tǒng)革蘭氏陰性菌QS系統(tǒng)—LuxI-AHL型AHL合成及LuxR結(jié)合作用示意圖群體感應(yīng)的分子機(jī)制第6章群體感應(yīng)系統(tǒng)革蘭氏陰性菌QS系統(tǒng)—LuxI-AHL型不同革蘭陰性菌的LuxI-AHL型QS系統(tǒng)有所差別,其AHL類自誘導(dǎo)劑都以高絲氨酸為主體,差別只是酰基側(cè)鏈的有無、側(cè)鏈的有無及側(cè)鏈的長短不同費(fèi)式弧菌
LuxI-LuxR
型QS系統(tǒng)
示意圖群體感應(yīng)的分子機(jī)制第6章群體感應(yīng)系統(tǒng)革蘭氏陰性菌QS系統(tǒng)—LuxI-AHL型
常見的AHL分子及其功能群體感應(yīng)的分子機(jī)制第6章群體感應(yīng)系統(tǒng)革蘭氏陽性菌的QS系統(tǒng)—AIP-TCS三組分系統(tǒng)信號分子:AIP(autoinducing
peptides,自誘導(dǎo)肽)
AIP前體肽經(jīng)轉(zhuǎn)錄一系列修飾加工,
在不同細(xì)菌中形成長短不同、
穩(wěn)定特異的AIP雙組份信號交換系統(tǒng):
Two-componentsignal
transductionsystem,
TCSTS)群體感應(yīng)的分子機(jī)制第6章群體感應(yīng)系統(tǒng)革蘭氏陽性菌QS系統(tǒng)—AIP-TCS三組分系統(tǒng)AIP通過細(xì)胞膜的方式:ABC(ATPbindingcassette)轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)群體感應(yīng)的分子機(jī)制第6章群體感應(yīng)系統(tǒng)革蘭氏陽性菌QS系統(tǒng)—ATP-TCS三組分系統(tǒng)金黃色葡萄球菌的雙組份QS系統(tǒng)AIP分子由體內(nèi)產(chǎn)生前導(dǎo)肽AgrD蛋白加工,被膜通道蛋白AgrB加工為短肽信號分子,由ABC輸出系統(tǒng)輸出,被AgrCTCSTS識別,引起毒性因子表達(dá)群體感應(yīng)的分子機(jī)制第6章群體感應(yīng)系統(tǒng)
種間QS系統(tǒng)——AI-2介導(dǎo)的通信信號分子:AI-2(呋喃酰硼酸二酯類化合物)此類信號分子在G+菌和G-菌中均存在費(fèi)式弧菌AI-2受體是周質(zhì)結(jié)合蛋白LuxPAI-2產(chǎn)生依賴于一種LuxS蛋白質(zhì)細(xì)菌識別AI-2分子方式與革蘭式陽性菌中雙組分識別系統(tǒng)一致,即雙組份激酶識別AI-2分子后把磷酸化基團(tuán)傳遞給受體蛋白并啟動(dòng)相關(guān)基因表達(dá)群體感應(yīng)的分子機(jī)制第6章群體感應(yīng)系統(tǒng)
種間QS系統(tǒng)——AI-2介導(dǎo)的通信群體感應(yīng)的分子機(jī)制第6章群體感應(yīng)系統(tǒng)
種間QS系統(tǒng)——AI-2介導(dǎo)的通信群體感應(yīng)的分子機(jī)制第6章群體感應(yīng)系統(tǒng)
QS系統(tǒng)的特點(diǎn)—多樣性信號分子分布多樣性:細(xì)菌種內(nèi)、種間;細(xì)菌與植物、動(dòng)物間信號分子產(chǎn)生機(jī)制多樣性:G-菌—信號分子合成酶,G+菌—前體,經(jīng)蛋白酶切割信號分子運(yùn)輸多樣性:G+菌—ABC轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng),G-菌—直接透過細(xì)胞膜信號多樣性:G+菌—雙組份信號轉(zhuǎn)導(dǎo)系統(tǒng);G-菌—受體蛋白信號分子功能復(fù)雜性:有的QS系統(tǒng)信號分子不僅作為環(huán)境信號,而且具有其他功能(如某些乳酸菌QS系統(tǒng)的信號分子具有抗菌活性)系統(tǒng)組成復(fù)雜性:在V.harveryi中發(fā)現(xiàn)與眾不同的QS系統(tǒng),該信號分子系統(tǒng)與G-菌相似,而信號分子的識別與G+菌相似QS系統(tǒng)之間關(guān)系復(fù)雜性:多種QS系統(tǒng)構(gòu)成復(fù)雜的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),如P.aeruginosa中含有3個(gè)QS系統(tǒng)
QS系統(tǒng)的特點(diǎn)—復(fù)雜性群體感應(yīng)的分子機(jī)制第6章群體感應(yīng)系統(tǒng)生物發(fā)光生物膜形成致病因子產(chǎn)生抗生素合成毒力因子誘導(dǎo)細(xì)菌宿主侵襲孢子形成不同種屬競爭細(xì)菌運(yùn)動(dòng)群體感應(yīng)的生物效應(yīng)第6章群體感應(yīng)系統(tǒng)
生物發(fā)光(例1:海洋細(xì)菌用光引誘浮游動(dòng)物和魚)細(xì)菌發(fā)光吸引浮游生物(攝食細(xì)菌但不能消化細(xì)菌),繼續(xù)在浮游動(dòng)物腸道內(nèi)發(fā)光,透露了浮游動(dòng)物的存在夜行魚容易檢測到發(fā)光浮游動(dòng)物并吃掉它們,發(fā)光細(xì)菌繼續(xù)存活在魚腸道PNAS,109(3),853-857,
2012浮游動(dòng)物被細(xì)菌光輝吸引并食用發(fā)光物質(zhì)與它們的生存本能矛盾,增加了被魚攻擊與吞食的機(jī)會,調(diào)節(jié)細(xì)菌生物發(fā)光的群體感應(yīng)現(xiàn)象能解釋這項(xiàng)發(fā)現(xiàn)浮游動(dòng)物知道,水中光暗示存在有表面長有細(xì)菌的豐富有機(jī)物在漆黑深海中,食物數(shù)量非常有限,因此,值得浮游動(dòng)物冒在接觸并吞食具發(fā)光細(xì)菌粒子使自己發(fā)光的風(fēng)險(xiǎn),因?yàn)殡y得找到食物的誘惑要比將自己暴露于相對罕見食性魚類的危險(xiǎn)大得多群體感應(yīng)的生物效應(yīng)第6章群體感應(yīng)系統(tǒng)
生物發(fā)光(例1:海洋細(xì)菌用光引誘浮游動(dòng)物和魚)(左)室溫下和(右)黑暗中拍攝到的接觸并攝食發(fā)光細(xì)菌的浮游微生物
幾種浮游微生物被發(fā)光細(xì)菌吸引的平均比例
被捕食的發(fā)光(黑色)和不發(fā)光(無色)的浮游生物平均數(shù)量(左)室溫下和(右)黑暗中拍攝到的食用發(fā)光細(xì)菌后浮游生物的排泄物PNAS,109(3),853-857,2012群體感應(yīng)的生物效應(yīng)第6章群體感應(yīng)系統(tǒng)
生物膜形成調(diào)控(例2:幫助細(xì)菌擴(kuò)大地盤)銅綠假單胞菌,是一種常見的革蘭氏陰性致病菌,群體感應(yīng)系統(tǒng)可以使其感知環(huán)境中菌群數(shù)量,并做出及時(shí)反應(yīng)酰基高絲氨酸在許多變形細(xì)菌中扮演著群體感應(yīng)信號的角色,而該信號常常可以控制細(xì)菌進(jìn)行群體的致病性等活性綠膿桿菌的群體感應(yīng)系統(tǒng)調(diào)節(jié)子發(fā)生改變,會對綠膿桿菌的菌落生態(tài)學(xué)有明顯影響研究者測定了群體感應(yīng)系統(tǒng)調(diào)節(jié)基因的編碼特征和細(xì)菌分離的生態(tài)環(huán)境之間的關(guān)系,結(jié)果表明,群體感應(yīng)系統(tǒng)在細(xì)菌進(jìn)行棲息地延伸的過程中扮演著重要角色為理解細(xì)菌的致病性以及難根除的感染性疾病機(jī)制提供了新思路PNAS,/cgi/doi/10.1073/pnas.1214128109
,2012群體感應(yīng)的生物效應(yīng)第6章群體感應(yīng)系統(tǒng)
生物膜形成調(diào)控(例2:幫助細(xì)菌擴(kuò)大地盤)PNAS,/cgi/doi/10.1073/pnas.1214128109
,2012P.Aeruginosa
和生態(tài)環(huán)境分離菌的群感基因相互關(guān)系韋恩圖4種環(huán)境分離菌基因調(diào)控相互關(guān)系圖群感活性基因的表達(dá)群體感應(yīng)的生物效應(yīng)第6章群體感應(yīng)系統(tǒng)
對宿主侵襲和定植(例3:霍亂弧菌的侵襲和定植)霍亂弧菌:菌體少量時(shí),有利于早期定植,之后細(xì)胞密度增大,信號分子濃度增高,HapR表達(dá),有利于病原體的釋放群體感應(yīng)的生物效應(yīng)第6章群體感應(yīng)系統(tǒng)
宿主侵襲和定植(例4:宿主致病體系中群體感應(yīng)社會生物學(xué))Current
Biology,
24(20),2417-2422,
2014微生物通過分泌物質(zhì)來實(shí)現(xiàn)與相鄰細(xì)胞的合作,這些物質(zhì)包括群感分子和相應(yīng)激活的毒力因子自然系統(tǒng)中,這些分泌物質(zhì)可被無效突變體利用,但是無效突變體(數(shù)量與規(guī)模)無法與有效菌群抗?fàn)幯芯勘砻鳎琎S淬滅劑可在臨床有效應(yīng)用而不影響毒力進(jìn)化群體感應(yīng)的生物效應(yīng)第6章群體感應(yīng)系統(tǒng)
細(xì)菌群集運(yùn)動(dòng)群集運(yùn)動(dòng)是指細(xì)菌以群體方式在培養(yǎng)基表面由接種點(diǎn)向周圍進(jìn)行的依賴鞭毛的遷移運(yùn)動(dòng)QS通過調(diào)控鞭毛操縱子FIHDC而調(diào)節(jié)細(xì)胞群集運(yùn)動(dòng)細(xì)胞群集決定了FIHDC蛋白的活化,是全面調(diào)節(jié)鞭毛和運(yùn)動(dòng)相關(guān)的趨化作用基因群體感應(yīng)的生物效應(yīng)第6章群體感應(yīng)系統(tǒng)群體感應(yīng)的應(yīng)用第6章群體感應(yīng)系統(tǒng)
病原菌診斷根據(jù)QS信號分子特異性:是否產(chǎn)生、種類、環(huán)境信號分子消長變化物理學(xué)的檢測手段和微生物傳感菌檢測
新的抗菌策略降解/抑制信號分子:產(chǎn)生可以使AHL滅活的AHL酶使用信號分子類似物:產(chǎn)生病原菌信號分子類似物,阻斷病原菌QS系統(tǒng)
環(huán)境污染修復(fù)控制生物膜形成:防止生物淤積、管道腐蝕、水體污染環(huán)境污染修復(fù):功能菌群體感應(yīng)有效競爭其他微生物群體感應(yīng)的應(yīng)用第6章群體感應(yīng)系統(tǒng)
控制生物膜形成(例1:調(diào)節(jié)廢水處理反應(yīng)器運(yùn)行)通過調(diào)節(jié)群體感應(yīng)、控制生物膜形成和生物淤積、提高反應(yīng)器運(yùn)行效果和壽命ES&T,
43,380-385,
2009生物淤積會導(dǎo)致膜生物反應(yīng)器流動(dòng)性差、堵塞、壽命減低生物淤積的成因?yàn)樯锬さ拇罅啃纬裳芯刻岢鐾ㄟ^添加群體感應(yīng)信號分子分解物質(zhì),使群感系統(tǒng)活性降低,來控制生物淤積,提高反應(yīng)器運(yùn)行效果和壽命群體感應(yīng)的應(yīng)用第6章群體感應(yīng)系統(tǒng)
控制生物膜形成(例1:調(diào)節(jié)廢水處理反應(yīng)器運(yùn)行)ES&T,
43(2),380-385,
2009反應(yīng)器內(nèi)不同時(shí)間段檢測的AHL信號分子添加?;D(zhuǎn)移酶(信號分子分解劑)的膜壓變化;添加轉(zhuǎn)移酶后信號分子的培養(yǎng)情況群體感應(yīng)的應(yīng)用第6章群體感應(yīng)系統(tǒng)
控制生物膜形成(例2:調(diào)節(jié)廢水處理反應(yīng)器運(yùn)行)Water
research
,
47,187-196,
2013將?;纸饷腹潭ㄓ谀し磻?yīng)器中(QQ-MBR),EEM熒光圖譜顯示生物膜EMP,LB/TB-胞外分泌物以及膜污垢含量大大低于未固定群體感應(yīng)猝滅劑的反應(yīng)器(Control-MBR)群體感應(yīng)的應(yīng)用第6章群體感應(yīng)系統(tǒng)
控制生物膜形成(例2:調(diào)節(jié)廢水處理反應(yīng)器運(yùn)行)Water
research
,
47,187-196,
2013群體感應(yīng)淬滅反應(yīng)器中,運(yùn)行效果未受任何影響由于對生物膜的破壞,生物淤積得到明顯控制,添加淬滅劑的反應(yīng)器(QQ-MBR)水阻力指標(biāo)遠(yuǎn)小于未添加的群體感應(yīng)的應(yīng)用第6章群體感應(yīng)系統(tǒng)生物修復(fù)(例3:信號分子參與苯酚分解轉(zhuǎn)化)研究發(fā)現(xiàn),PseudomonasaeruginosaCGMCC
氧化分解苯酚等一些列芳香族化合物時(shí),釋放出群體感應(yīng)信號分子AHL研究對分解過程產(chǎn)生的AHL類型進(jìn)行一系列分析鑒定薄層液相色譜分析AHL類型Process
Biochemistry,
45,1944-1948,2010HPLC-MS-MS分析AHL的類型群體感應(yīng)的應(yīng)用第6章群體感應(yīng)系統(tǒng)生物修復(fù)(例3:信號分子參與苯酚分解轉(zhuǎn)化)研究發(fā)現(xiàn),外加合成的AHL有效促進(jìn)苯酚的分解過程,說明AHL參與了污染物的分解Process
Biochemistry,
45,1944-1948,2010添加合成的AHL對苯酚分解影響(圖為50小時(shí)的分解效果)群體感應(yīng)的應(yīng)用第6章群體感應(yīng)系統(tǒng)生物修復(fù)(例4:厭氧氨氧化細(xì)菌群體感應(yīng)系統(tǒng))厭氧氨氧化細(xì)菌(AAOB)以銨為電子供體將亞硝酸鹽轉(zhuǎn)化為氮?dú)饣钚悦芏纫蕾囆袨椋篈AOB厭氧氨氧化純培養(yǎng)不可能;細(xì)胞密度高于1010
-1011
個(gè)/mL時(shí),AAOB才顯現(xiàn)出Anammox活性生物團(tuán)聚行為:以微生物團(tuán)聚體形式存在,出現(xiàn)
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