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PAGEPAGE12020年湖北省科技獎(jiǎng)公示材料一、項(xiàng)目名稱:鯉形目魚類系統(tǒng)發(fā)育與適應(yīng)性進(jìn)化研究二、提名單位:中國科學(xué)院武漢分院三、提名意見:該項(xiàng)目長期致力于現(xiàn)生淡水魚類的最大類群-鯉形目魚類的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系及重要類群的適應(yīng)性進(jìn)化研究,探討特定生態(tài)環(huán)境下的魚類物種分化現(xiàn)象。研究確立了基于自然分類的鯉科系統(tǒng),澄清了傳統(tǒng)人為分類對鯉科亞科的劃分以及對亞科間關(guān)系的解釋;發(fā)現(xiàn)了青藏高原冰川湖泊中兩種裸鯉的同域物種分化現(xiàn)象,為驗(yàn)證同域物種形成理論找到了新的分子證據(jù);還發(fā)現(xiàn)了青藏高原特有的裂腹魚類適應(yīng)青藏高原極端環(huán)境的遺傳基礎(chǔ)。通過對鯉形目魚類系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系的重建及重要類群的物種形成和適應(yīng)性進(jìn)化分子機(jī)制的揭示,為理解東亞地區(qū)復(fù)雜的環(huán)境條件與鯉形目魚類物種分化之間的相互關(guān)系提供了重要的分子證據(jù),也為認(rèn)識鯉形目魚類生物多樣性歷史提供了新的觀點(diǎn)。 提名該項(xiàng)目為湖北省自然科學(xué)一等獎(jiǎng)。四、項(xiàng)目簡介: 鯉形目魚類是現(xiàn)生淡水魚類中最大的一個(gè)類群,共約有280屬、2660余種,僅在中國就分布有近200屬、750余種,幾乎包括了鯉形目中所有具代表性的類群,在世界魚類區(qū)系中占有重要地位。一些具有世界影響的專著如《中國鯉科魚類志》和《中國動物志鯉形目》等對鯉形目魚類物種多樣性有過詳細(xì)的描述,但對其多樣性格局及物種分化過程和適應(yīng)性進(jìn)化機(jī)制缺乏系統(tǒng)性研究。該成果基于多種分子標(biāo)記和廣泛物種取樣,重建了鯉形目魚類重要類群的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系;發(fā)現(xiàn)了青藏高原特有裂腹魚類同域物種形成的分子生態(tài)學(xué)機(jī)制;揭示了裂腹魚類適應(yīng)青藏高原極端環(huán)境的遺傳基礎(chǔ),為理解東亞地區(qū)復(fù)雜的環(huán)境條件與鯉形目魚類物種分化之間的關(guān)系提供了重要分子證據(jù)。主要科學(xué)發(fā)現(xiàn)如下:(1)重建了鯉形目及其內(nèi)部類群的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,提出了新的自然分類系統(tǒng),糾正了人為分類系統(tǒng)對魚類演化歷史認(rèn)識所造成的干擾和偏差。研究支持鯉形目中鯉科魚類為單系群,確認(rèn)了鯉科中鲃系和雅羅魚系,明確提出了一個(gè)單系的東亞特有鯉科類群概念;發(fā)現(xiàn)鰍類中沙鰍亞科、花鰍亞科和條鰍亞科應(yīng)該提升為科級水平。研究中有關(guān)鯉科中單系類群,特別是東亞特有鯉科類群的定義使得對鯉科魚類分類地位、系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系和地理分布格局的認(rèn)知更趨于統(tǒng)一。(2)發(fā)現(xiàn)了青藏高原冰川湖泊—遜木措湖中特有的斜口裸鯉和分布于同一湖泊中的花斑裸鯉是由共同祖先經(jīng)過同域物種分化而成。斜口裸鯉很可能起源自目前同域分布在遜木措湖的花斑裸鯉種群,由于各自生態(tài)位的特有性,斜口裸鯉和遜木措湖花斑裸鯉通過自然選擇促進(jìn)了同域條件下的種群分歧。該研究為進(jìn)化生物學(xué)長期爭論的同域物種形成理論提供了新的分子生態(tài)學(xué)證據(jù)。(3)揭示了青藏高原特有裂腹魚類適應(yīng)極端環(huán)境的遺傳基礎(chǔ),發(fā)現(xiàn)裂腹魚在全基因組水平進(jìn)化速率顯著加快,與低氧調(diào)控和能量代謝相關(guān)的功能基因在裂腹魚類中發(fā)生了加速進(jìn)化。該研究對于理解變溫動物魚類適應(yīng)青藏高原極端環(huán)境的遺傳機(jī)制提供了新的認(rèn)識。該成果共發(fā)表論文26篇,他引566余次,其中8篇系列論文連續(xù)發(fā)表在領(lǐng)域權(quán)威期刊《MolecularPhylogeneticsandEvolution》及《GenomeBiologyandEvolution》上。5篇代表性論文引起國內(nèi)外同行的廣泛關(guān)注,并被《BiologicalReviews》和《PNAS》等生物領(lǐng)域頂尖期刊文章多次引用,總計(jì)SCI他引126次,單篇最高他引46次。第二完成人是“世界鯉形目魚類生命之樹”國際計(jì)劃的成員,擔(dān)任“國際魚類生物條形碼計(jì)劃”東北亞區(qū)副主席,主辦了“第一屆鯉形目魚類生物學(xué)國際特別研討會”;在“紀(jì)念達(dá)爾文《物種起源》發(fā)表150周年國際學(xué)術(shù)會議”做了有關(guān)東亞淡水魚類的物種分化研究的大會報(bào)告。五、代表性論文專著目錄:(一)代表性論文(專著)目錄(不超過5篇,其中國內(nèi)科技期刊論文原則上不少于1/3)序號論文(專著)名稱/刊名/作者年、卷、頁碼發(fā)表時(shí)間(年月日)通訊作者(含共同)第一作者(含共同)國內(nèi)作者他引總次數(shù)檢索數(shù)據(jù)庫論文署名單位是否包含國外單位1MolecularphylogeneticrelationshipsofEasternAsianCyprinidae(Pisces:Cypriniformes)inferredfromcytochromebsequences/ScienceinChinaSeriesC:LifeSciences/ShunpingHe,HuanzhangLiu,YiyuChen,MasayukiKuwahara,TsuneoNakajima&YangZhong2004,47,130–1382004.04.01何舜平何舜平劉煥章,陳宜瑜,鐘揚(yáng)33Webofscience是2SequenceanalysisofcytochromebgeneindicatesthatEastAsiangroupofcyprinidsubfamilyLeuciscinae(Teleostei:Cyprinidae)evolvedindependently/ProgressinNaturalScience/XuzhenWang,HuanzhangLiu,ShunpingHe&YiyuChen2004,14,132-1372006.11.19何舜平王緒禎劉煥章,陳宜瑜2Webofscience否3MolecularphylogeneticsofthefamilyCyprinidae(Actinopterygii:Cypriniformes)asevidencedbysequencevariationinthefirstintronofS7ribosomalprotein-codinggene:Furtherevidencefromanucleargeneofthesystematicchaosinthefamily/MolecularPhylogeneticsandEvolution/ShunpingHe,RichardL.Mayden,XuzhengWang,WeiWang,KevinL.Tang,Wei-JenChen,YiyuChen2008,46,818-8292008.03.01何舜平,RichardL.Mayden何舜平王緒禎,王偉,陳宜瑜46Webofscience是4Theyoungestsplitinsympatricschizothoracinefish(Cyprinidae)isshapedbyecologicaladaptationsinaTibetanPlateauglacierlake/MolecularEcology/KaiZhao,ZiyuanDuan,ZuogangPeng,SongchangGuo,JunbingLi,ShunpingHe,andXinquanZhao2009,18,3616-36282009.08.20何舜平,趙新全趙凱,段子淵彭作剛,郭松長,李俊兵15Webofscience否5ComprehensivetranscriptomeanalysisrevealsacceleratedgenicevolutioninaTibetfish,Gymnodiptychuspachycheilus/GenomeBiologyandEvolution/LiandongYang,YingWang,ZhaoleiZhang,andShunpingHe2015,7,251-2612014.12.30何舜平楊連東王瑩30Webofscience是(二)代表性論文專著被他人引用的情況(不超過5篇)序號被引代表性論文(專著)序號引文名稱/作者引文刊名引文發(fā)表時(shí)間(年月日)1MolecularphylogeneticrelationshipsofEasternAsianCyprinidae(Pisces:Cypriniformes)inferredfromcytochromebsequences/ScienceinChinaSeriesC:LifeSciences/ShunpingHe,HuanzhangLiu,YiyuChen,MasayukiKuwahara,TsuneoNakajima&YangZhongGenus-levelsupertreeofCyprinidae(Actinopterygii:Cypriniformes),partitionedqualitativecladesupportandtestofmacro-evolutionaryscenarios/PhilippeGaubert,GaelDenys,ThierryOberdorffBiologicalReviews2009.10.222MolecularphylogeneticsofthefamilyCyprinidae(Actinopterygii:Cypriniformes)asevidencedbysequencevariationinthefirstintronofS7ribosomalprotein-codinggene:Furtherevidencefromanucleargeneofthesystematicchaosinthefamily/MolecularPhylogeneticsandEvolution/ShunpingHe,RichardL.Mayden,XuzhengWang,WeiWang,KevinL.Tang,Wei-JenChen,YiyuChenPhylogeneticrelationshipsofthewesternNorthAmericancyprinidgenusRichardsonius,withanoverviewofphylogeographicstructure/DerekD.Houston,DennisK.Shiozawa,BrettR.RiddleMolecularPhylogeneticsandEvolution2009.10.273Theyoungestsplitinsympatricschizothoracinefish(Cyprinidae)isshapedbyecologicaladaptationsinaTibetanPlateauglacierlake/MolecularEcology/KaiZhao,ZiyuanDuan,ZuogangPeng,SongchangGuo,JunbingLi,ShunpingHe,andXinquanZhaoDiversificationofsympatricbroadcast-spawninglimpets(Cellanaspp.)withintheHawaiianarchipelago/ChristopherE.Bird,BrendenS.Holland,BrianW.Bowen,RobertJ.ToonenMolecularEcology2011.04.114ComprehensivetranscriptomeanalysisrevealsacceleratedgenicevolutioninaTibetfish,Gymnodiptychuspachycheilus/GenomeBiologyandEvolution/LiandongYang,YingWang,ZhaoleiZhang,andShunpingHeSpeciesgroupsdistributedacrosselevationalgradientsrevealconvergentandcontinuousgeneticadaptationtohighelevations/Yan-BoSun,Ting-TingFu,Jie-QiongJin,RobertW.Murphy,DavidM.Hillis,Ya-PingZhang,andJingCheProcNatlAcadSciUSA2018.11.065ComprehensivetranscriptomeanalysisrevealsacceleratedgenicevolutioninaTibetfish,Gymnodiptychuspachycheilus/GenomeBiologyandEvolution/LiandongYang,YingWang,ZhaoleiZhang,andShunpingHeComparativetranscriptomicsof3high-altitudepasserinebirdsandtheirlow-altituderelatives/YanHao,YingXiong,YalinCheng,GangSong,ChenxiJia,YanhuaQu,andFuminLeiProcNatlAcadSciUSA2019.06.11六、主要完成人(完成單位)情況:排名1姓名陳宜瑜性別男國籍中國黨派中共出生年月1944年4月出生地福建民族漢族身份證號420106440422481歸國人員否歸國時(shí)間-技術(shù)職稱研究員最高學(xué)歷本科最高學(xué)位學(xué)士畢業(yè)學(xué)校廈門大學(xué)畢業(yè)時(shí)間1964年8月所學(xué)專業(yè)魚類學(xué)電子郵箱chenyy@辦公電動電話通訊地址北京市海淀區(qū)雙清路83號郵政編碼100085工作單位法人單位名稱:國家自然科學(xué)基金委員會行政職務(wù)主任具體二級單位名稱:完成單位中國科學(xué)院水生生物研究所所在地湖北武漢單位性質(zhì)科研院所參加本項(xiàng)目的起止時(shí)間1997年1月1日年2010年12月31日對本項(xiàng)目技術(shù)創(chuàng)造性貢獻(xiàn):提出研究總體思路和方案,是代表性論文1、2和3的主要作者,是重要發(fā)現(xiàn)點(diǎn)1的主要完成者之一,對鯉科魚類的進(jìn)化格局、單系類群識別及類群間相互關(guān)系提出了新的觀點(diǎn);本項(xiàng)研究占本人工作量的30%。曾獲科技獎(jiǎng)勵(lì)情況:中國鯉科魚類志,1982年國家自然科學(xué)二等獎(jiǎng)中國生態(tài)系統(tǒng)研究網(wǎng)絡(luò)的創(chuàng)建及其觀測研究和試驗(yàn)示范,2012年國家科技進(jìn)步獎(jiǎng)一等獎(jiǎng)排名2姓名何舜平性別男國籍中國黨派中共出生年月1962年12月出生地四川民族漢族身份證國人員是歸國時(shí)間1997年12月技術(shù)職稱研究員最高學(xué)歷研究生最高學(xué)位博士畢業(yè)學(xué)校法國國家自然歷史博物館畢業(yè)時(shí)間1997年12月所學(xué)專業(yè)魚類學(xué)電子郵箱clad@辦公電動電訊地址湖北武漢東湖南路7號郵政編碼430072工作單位法人單位名稱:中國科學(xué)院水生生物研究所行政職務(wù)中國科學(xué)院水生生物多樣性與保護(hù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室主任具體二級單位名稱:水生生物多樣性與資源保護(hù)研究中心完成單位中國科學(xué)院水生生物研究所所在地湖北武漢單位性質(zhì)科研院所參加本項(xiàng)目的起止時(shí)間1997年1月1日年2015年12月31日對本項(xiàng)目技術(shù)創(chuàng)造性貢獻(xiàn):提出研究總體思路和方案,組織實(shí)施項(xiàng)目研究工作,指導(dǎo)和參與當(dāng)時(shí)在讀博士研究生進(jìn)行研究設(shè)計(jì)、實(shí)驗(yàn)、和論文寫作。5篇代表性論文中,2篇本人為第一作者,本人是全部5篇代表性論文的通訊作者。通過這些研究,發(fā)現(xiàn)了東亞的赤眼鱒、鳡、鰱、鲴類和鲌類及其附屬的小型鯉科魚類共同的單系類群;發(fā)現(xiàn)青藏高原物種形成的新證據(jù)以及青藏高原第四紀(jì)劇烈的環(huán)境改變對該地區(qū)生物區(qū)系地理學(xué)的格局影響;發(fā)現(xiàn)了魚類適應(yīng)極端環(huán)境的分子機(jī)制。本項(xiàng)研究占本人工作量的80%以上。曾獲科技獎(jiǎng)勵(lì)情況:無排名3姓名劉煥章性別男國籍中國黨派九三學(xué)社出生年月1966年7月出生地湖北鄂州民族漢族身份證國人員否歸國時(shí)間-技術(shù)職稱研究員最高學(xué)歷研究生最高學(xué)位博士畢業(yè)學(xué)校中國科學(xué)院水生生物研究所畢業(yè)時(shí)間1993年7月所學(xué)專業(yè)魚類學(xué)電子郵箱hzliu@辦公電動電訊地址湖北武漢東湖南路7號郵政編碼430072工作單位法人單位名稱:中國科學(xué)院水生生物研究所行政職務(wù)中心主任具體二級單位名稱:水生生物多樣性與資源保護(hù)研究中心完成單位中國科學(xué)院水生生物研究所所在地湖北武漢單位性質(zhì)科研院所參加本項(xiàng)目的起止時(shí)間1997年1月1日年2015年12月31日對本項(xiàng)目技術(shù)創(chuàng)造性貢獻(xiàn):是代表性論文1和2的共同作者,是重要發(fā)現(xiàn)點(diǎn)1的主要完成者之一,對東亞鯉形目、鯉科、鰍總科魚類的系統(tǒng)發(fā)育格局進(jìn)行了較全面的研究,提出了新的觀點(diǎn)。本項(xiàng)研究占本人工作量的60%。曾獲科技獎(jiǎng)勵(lì)情況:無排名4姓名楊連東性別男國籍中國黨派中共出生年月1987年12月出生地安徽民族漢族身份

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