醫(yī)學文獻檢索與利用

醫(yī)學文獻檢索與利用郭繼軍guo@主要內(nèi)容文獻基本知識文獻檢索基本知識Pubmed檢索中文文獻檢索全文數(shù)據(jù)庫檢索網(wǎng)絡資源檢索與利用論文寫作文獻檢索教學意識：信息應用能力：信息檢索與評價技能：檢出效率、結(jié)果、技巧

知識更新速度半衰期：

18世紀為80～90年

19～20世紀初30年

20世紀60年代15年

20世紀80年代5年

21世紀初3年左右文獻數(shù)量全世界每天發(fā)表的論文達13000～14000篇，每年登記的新專利達70萬項，每年出版的圖書達50多萬種。Pubmed文獻：

1980年28萬

1990年40萬

2000年53萬

2010年93萬問題遼寧省所有高校名錄低密度脂蛋白膽固醇(LDL-C)正常值P53基因堿基序列結(jié)直腸癌循證醫(yī)學治療方案問題

最近科里有個比較棘手的病例，診斷為紫癜性腎炎(腎病型)，先后經(jīng)過甲強龍、環(huán)磷酰胺沖擊，口服雷公藤、驍悉等治療，但血尿和蛋白尿仍無好轉(zhuǎn)。科里的老師決定組織病例討論會，研究下一步治療方案，也要求每位研究生針對患者的實際情況查找相關文獻，準備在會上發(fā)言。

。。。哪有時間查文獻?何況文獻的作者們也是百家爭鳴，各執(zhí)己見，很多觀點只是推測而已。。。摸索下班之后，去了圖書館的計算機室，進入維普期刊數(shù)據(jù)庫。在關鍵詞中輸入“紫癜性腎炎”，搜出了幾千條索引。再輸入“腎病綜合征激素耐藥”，又搜出了幾千條……當時就暈了，看來找到真正有價值的文獻也不那么容易。回歸我趕緊到現(xiàn)刊閱覽室，把最新一期《中國實用兒科雜志》關于腎病綜合癥診療進展的專題仔細閱讀了幾遍，認真作了筆記。再回到電腦室有針對性地查找，這次終于找到了有價值的文獻。

回去之后，我認真學習了這些文獻，漸漸對這個患者的診治有了更深入的認識。。。體會我們的前輩和同行們，在工作中也同樣遇到過許多亟待解決卻又找不到現(xiàn)成答案的實際問題。他們把豐富的個人經(jīng)驗和最新的科研成果結(jié)合，針對具體患者的實際情況，提出了各種解決方案。研究生信息需求（開題）目的：了解國內(nèi)外研究動態(tài)與進展，掌握前人研究成果，尋找課題設計思路和依據(jù)方法：1、準確描述研究背景信息需求：機構(gòu)、人員、熱點與趨 勢、相似研究的材料與方法2、識別與選擇合適信息源：期刊、專著、會議、學位論 文、專利、專業(yè)數(shù)據(jù)庫、科研基金項目、學術論壇3、文獻檢索、獲取全文：專業(yè)工具、數(shù)據(jù)庫4、信息跟蹤：Alert(注冊，email);RSS(網(wǎng)絡訂閱）文獻基本知識文獻(documents，literature)：是記錄有知識的一切載體文獻組成四要素：記錄知識的具體內(nèi)容記錄知識的手段：如文字、圖像、符號、聲頻、視頻等記錄知識的物質(zhì)載體：紙張、光盤、錄像帶等記錄知識的表現(xiàn)形態(tài)：圖書、期刊、專利說明書等文獻的作用積累、繼承和交流作用科學研究的依據(jù)評價醫(yī)學科技人員造詣的依據(jù)評價一個國家、單位的醫(yī)學科技發(fā)展水平的依據(jù)領導決策的依據(jù)優(yōu)先權作用文獻信息特點數(shù)量龐大增長迅速分布分散內(nèi)容交叉重復類型多樣新陳代謝加快語種復雜性增加交流速度加快文獻基本知識文獻類型及其特點

1.按載體劃分:

印刷型:book,serials,proceedings,thesis, patent,tech.Reports…

非印刷型:microfilm,A-Vmaterials,e-j…2.按內(nèi)容加工深度:

一次文獻,二次文獻,三次文獻,零次文獻

3、按文獻獲取難以程度：

白色文獻、灰色文獻、黑色文獻圖書教材（textbook)

根據(jù)各專業(yè)的教學需要，闡述某一學科或?qū)I(yè)的基本知識的教學用書，基本按教學大綱編寫

只介紹基礎知識和公認的見解，內(nèi)容相對穩(wěn)定，闡述系統(tǒng)完整，表達概括清楚，能使人獲得有關學科領域的一般知識專著（monograph)

針對某一專門題目分章節(jié)做出系統(tǒng)深入全面敘述的一種著作

外文名著與著名出版社參考工具書（Referencebooks)

根據(jù)一定需要收集有關資料并按特定的方法編排起來供人查考的文獻

（查考性、概括性、易檢性）

參考工具書字典、詞典（dictionary)百科全書（encyclopedia)年鑒（yearbook,manual,almanac)手冊（handbook)

指南（directory)藥學工具書：藥典—Martindale:Extrapharmacopiea,手冊—MerckIndex,字典—中藥大辭典

期刊(Periodical，Journal，magazine)特點：

連續(xù)出版發(fā)行有固定的名稱（刊名）相對固定的版式、篇幅和內(nèi)容范圍按一定的卷期號或年月順序號連續(xù)出版內(nèi)容：

每期發(fā)表多個作者的多篇文章，內(nèi)容不重復作者眾多內(nèi)容新穎、出版周期短，通報速度快信息量大，約占整個信息量的70%

醫(yī)學期刊類型按出版周期劃分按內(nèi)容功能劃分：學術、檢索、綜述按學科類別劃分按出版機構(gòu)劃分按載體形態(tài)劃分期刊文獻類型論著(originalarticle,journalarticle)綜述(review)短篇報道(shortreport,briefcommunication)病例報告來信(letter)編者述評(editorial)更正(comment)摘要(abstract)消息(news)講座(lecture,guide)書評(bookreview)期刊論文質(zhì)量要求主要看其“三性”：創(chuàng)新性、科學性、規(guī)范性論文內(nèi)容上是否有創(chuàng)新性；科學性：目的明確、方法清楚、推導論證合理、結(jié)果真實、結(jié)論嚴謹、不夸大不延伸；規(guī)范性：論文的格式、語言文字、學術名詞、量與單位、圖表等論文評價標準：發(fā)表刊物、被引頻次、下載次數(shù)、參考文獻質(zhì)量及時間專家評議：F1000期刊(Periodical）核心期刊研究中文核心期刊要目總覽

4/evaluation/

中國科學引文數(shù)據(jù)庫（CSCD）中國科技論文引文數(shù)據(jù)庫（CSTPC）

/

中國社會科學引文數(shù)據(jù)庫（CSSCI）期刊評價影響因子（IF）、主辦單位、學會背景、檢索工具收錄期刊學術水平評價指標JCR出版機構(gòu)學術背景編輯部及編委組成作者組成基金論文比例出版頻率發(fā)行量期刊學術水平評價指標國內(nèi)外檢索工具收錄情況(Indexed)總被引頻次(citedtimes)影響因子(IF)載文量(sourceitem)文摘率閱覽利用率期刊評價方法文摘法引文法專家調(diào)查法流通統(tǒng)計法其它文獻組織與分類學科分類:《中國圖書館分類法》R1預防醫(yī)學、衛(wèi)生學R2中國醫(yī)學R3基礎醫(yī)學R4臨床醫(yī)學R5內(nèi)科學R6外科學R7婦產(chǎn)科學R72兒科學R73腫瘤學R74神經(jīng)病學與精神病學R75皮膚病學與性病學R76耳鼻咽喉科學R77眼科R78口腔科學

R8特種醫(yī)學 R9藥學R醫(yī)藥、衛(wèi)生.........（第一級類目）

R5內(nèi)科學.................（第二級類目）

R56呼吸系及胸部系統(tǒng)疾病..

（第三級類目）

R563肺疾病...............（第四級類目）

R563.1肺炎..................（第五級類目）

R563.1+1大葉性肺炎......（第六級類目）中國圖書館分類法5大部類，22大類，6個總論復分表，30多個專類復分表、55811條類目混合小數(shù)層累制：復分表：對于臨床各科（R5-R8），有專門復分表：01預防、控制和衛(wèi)生02病理學、病因?qū)W03微生物學、免疫學04診斷學05治療學06并發(fā)癥07預后08診療器械、用具09康復

例：R563.1-05肺炎治療學

文獻組織標識詞組織法

keyword:同義詞、近義詞

subjectheadings:唯一性

textword:checktags:animal,human…檢索語言描述文獻特征和表達檢索提問的專用語言類型：

組合方法：先組式（分類、標題詞）、后組式（單元詞、敘詞）

規(guī)范程度：規(guī)范（類目、主題詞）、非規(guī)范（關鍵詞、單元詞）

描述特征：內(nèi)容（分類、主題）、外部（書名、作者、序號）

本體語言（ontology)檢索步驟確定完整的題目：(綜述\原始研究)

aspirin的藥理學研究

肝纖維化患者血清或肝組織內(nèi)轉(zhuǎn)移生長因子的檢測及其臨床意義分析檢索目的、要求：了解背景、現(xiàn)狀、基本知識提煉名詞術語：選擇檢索工具：確定檢索途徑：制定檢索策略：檢索文獻：獲取全文：根據(jù)文獻修正檢索策略并重新檢索文獻：文獻檢索基本知識計算機檢索工具：非印刷型數(shù)據(jù)庫：數(shù)值型:CDC

事實型:PDQ

文獻型:全文(fulltext):Springer

檢索型：pubmed,CBM

文獻信息檢索效果的評價查全率:（recall）：指系統(tǒng)在進行某一檢索時，檢出的相關文獻量占系統(tǒng)文獻庫中相關文獻量的比率，反映該系統(tǒng)文獻庫中實有的相關文獻量在多大程度上被檢索出來。

R＝（檢出相關文獻量/系統(tǒng)中相關文獻總量）×100%查準率（precision):指系統(tǒng)在進行某一檢索時，檢出的相關文獻量占檢出的文獻總量的比率，反映每次從該系統(tǒng)文獻庫中實際檢出的全部文獻中有多少是相關的。

P=(檢出相關文獻量/檢出文獻總量)×100%查全率和查準率之間存在互逆關系。如果一檢索工具的查全率較高，則其查準率將相對下降；反之查準率高，則查全率低。查全率和查準率只能相對提高，二者永遠不可能同時達到100%。文獻信息檢索工具的類型及特點

目錄：bibliography題錄：title摘要：abstract索引：index全文：Full-text檢索方法

工具法：優(yōu)點：查全、查準缺點：收錄范圍、時差、檢索途徑瀏覽法：優(yōu)點：獲得最新文獻缺點：遺漏文獻追溯法：利用參考文獻查找資料優(yōu)點：擴大查找范圍缺點：片面、遺漏文獻檢索途徑Authorname:姓在前全稱，名首字母縮寫Title:Address:Keyword:Mesh（MedicalSubjectHeadings):Abstract:Grant:Publicationyear:Volume,issue:Subheadings:83個Source:計算機文獻檢索數(shù)據(jù)庫類型及其構(gòu)成

database—file—record—field計算機檢索技術邏輯運算：NOT,AND,OR,()

字符運算：通配符：?(colo?r,wom?n,rat?)

截詞符：＊(transplant*,pregnan*)

鄰近運算：near,with,same

字段限定：［］，IN

其它：詞組限定、擴展檢索、加權檢索、精確與模糊檢索、跨庫檢索檢索策略構(gòu)建分析檢索課題，明確檢索要求：內(nèi)容、信息類型、限定條件選擇檢索工具，確定檢索途徑：編制檢索表達式：檢索結(jié)果評價，調(diào)整檢索策略：獲取全文：檢索策略制定檢索詞提煉與轉(zhuǎn)換：懷孕－＞妊娠，子宮纖維瘤－＞活性、降解、吸收－＞普查、防治－＞邏輯組織：因果關系：阿司匹林致胃潰瘍眼結(jié)核致失明相關關系：眼弓形體病并發(fā)青光眼幽門螺旋桿菌與胃潰瘍應用關系：維生素C對哮喘的治療作用

阿司匹林致胃潰瘍阿司匹林／副作用AND胃潰瘍／病因?qū)W，化學誘導眼結(jié)核致失明眼結(jié)核／并發(fā)癥AND盲／病因?qū)W眼弓形體病并發(fā)青光眼弓形體?。l(fā)癥AND青光眼／并發(fā)癥幽門螺旋桿菌與胃潰瘍幽門螺旋桿菌／微生物學AND胃潰瘍／病因?qū)W，病理學維生素C對哮喘的治療作用維生素C／治療應用AND哮喘／藥物療法計算機檢索注意事項多個檢索詞逐個分步檢索，最后用邏輯運算組合

１．肺纖維化２．細胞因子３．肺泡灌洗液４．#1AND#2AND#3選擇檢索字段并利用二次檢索功能充分利用各種限定功能注意檢索結(jié)果的存儲與打印處理格式

全文獲取本館館藏網(wǎng)絡數(shù)據(jù)庫館際互借（NSTL)網(wǎng)絡免費資源與作者聯(lián)系其它pubmed/pubmed//文獻來源：

medline:有meshin-processcitations：無mesholdmedline：有meshpublishersupplied:無meshpubmed檢索方法一般檢索：術語，作者姓名自動匹配功能：mesh->journal->phrase->author->拆分術語用AND組合截詞運算：不包括空格詞組，關閉自動匹配功能，不能主題擴展詞組：“”，包括主題但不擴展，拆分組合限定檢索方式：詞組、主題詞、字段、輔助命令：limit,preview/index,history,clipboard,detail,display,sendSinglecitation,batchcitation,clinicalqueriesRSS,PMC,myNCBI結(jié)果處理格式練習題工具:CBM,PUBMED近五年有關高血壓遺傳學研究的綜述文獻心功衰竭的體外反博療法臨床研究文獻肝纖維化患者肝組織或血清中轉(zhuǎn)移生長因子的檢測方法及其臨床意義研究文獻練習題肺動脈高壓藥物治療現(xiàn)狀慢性乙型肝炎的免疫治療進展C反應蛋白與糖尿病血管并發(fā)癥的關系骨髓干細胞治療心肌梗死的研究與展望生物信息學數(shù)據(jù)庫Entrez:/SRS:www.lionbio.co.uk/publicsrs/序列數(shù)據(jù)庫結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫基因組數(shù)據(jù)庫文獻數(shù)據(jù)庫其他二次數(shù)據(jù)庫中國生物醫(yī)學文獻數(shù)據(jù)庫（CBM)文獻來源：國內(nèi)出版生物醫(yī)學刊物數(shù)據(jù)庫類型：檢索型，可鏈接全文數(shù)據(jù)庫主要特點：同pubmed,有分類檢索檢索鏈接：作者、期刊、關鍵詞、特征詞、主題詞和副主題詞、相關文獻

主題詞：《醫(yī)學主題詞表》、《中國中醫(yī)藥學主題詞表》分類：《中國圖書館分類法·醫(yī)學專業(yè)分類表》缺?。侯}目、主題詞、關鍵詞、文摘、刊名中國知網(wǎng)（CNKI）按學科分專輯：全文型數(shù)據(jù)庫檢索方法：初級檢索、高級檢索、專業(yè)檢索檢索途徑：主題、篇名、關鍵詞、摘要、作者、第一責任人、單位、刊名、參考文獻、全文、年、期、基金、中圖分類號、ISSN、統(tǒng)一刊號

主題途徑：中英文篇名、中英文關鍵詞、機標關鍵詞、中英文摘要關鍵詞：中文關鍵詞、英文關鍵詞、機標關鍵詞結(jié)果超鏈：作者、機構(gòu)、關鍵詞（中英文）、知網(wǎng)節(jié)注意事項：精確與模糊、增加檢索項、詞頻、最近詞、擴展詞萬方數(shù)據(jù)分G網(wǎng)與醫(yī)學網(wǎng)（中華系列）全文數(shù)據(jù)庫（可跨庫檢索）期刊論文可做主題詞、副主題詞檢索附加服務：作者空間、機構(gòu)空間、關鍵詞導航檢索工具常用工具：pubmed,BA(BIOSIS),CA(SciFinder),SCICBM

全文數(shù)據(jù)庫收錄范圍：檢索途徑：結(jié)果處理方式：檢索輔助命令：文獻檢索型數(shù)據(jù)庫檢索檢索型數(shù)據(jù)庫：如PUBMED、SCI、BA

特點：收錄某一學科的全部或大部分各語種文獻，文獻類型和數(shù)量多文獻格式規(guī)范，著錄標準文獻標引全面、深入，揭示完整、規(guī)范檢索途徑多，檢索策略規(guī)范，可應用多種技術檢索文獻檢索結(jié)果多為題錄或摘要，幾乎不提供全文全文數(shù)據(jù)庫：如EBSCO、OVID、CNKI、萬方數(shù)據(jù)庫收錄特定某一出版集團出版或代理商代理的全部或部分期刊，收錄文獻的數(shù)量和范圍都有限文獻格式不規(guī)范，著錄標準不嚴格文獻標引不全面、深入檢索途徑少，可應用的檢索技術少，一般僅有二次檢索功能檢索結(jié)果為全文，可提供全文文獻全文數(shù)據(jù)庫使用收錄文獻范圍檢索途徑是否提供二次檢索或相應手段瀏覽器類型檢索策略選詞：主次->詞性（主題詞、關鍵詞、自由詞->相關詞（同義詞、近義詞）->詞義轉(zhuǎn)換組合：邏輯運算、字符運算、限定檢索實施策略修訂：重新選擇合適的詞及檢索途徑擴檢方法OR組配主題詞擴展去掉副主題詞減少限制使用自由詞字符運算(*、?)縮檢方法AND組配加權檢索，使用主要主題詞增加副主題詞增加限制使用專指主題詞使用文中詞文獻整理EndnoteRefviz科技查新查新題目委托：立題、立項、成果、論文項目申報級別：國家、省、市、校查新材料匯總：論文、報告、總結(jié)查新要點：突出成果查新范圍：文獻類型、語言、時間文獻檢索以及相關文獻分析查新報告網(wǎng)絡資源類型參考資源：資源導航；辭典與百科全書；文摘與索引；統(tǒng)計資料；其他參考資料全文資源：數(shù)據(jù)庫；電子期刊；研究報告；政府出版物教學資源：教學資料多媒體資源：圖像資料；音頻資料；視頻資料黃頁資源：協(xié)會／學會；大學院系；研究機構(gòu)／中心；其他組織機構(gòu)；專