Cancer Research 三級淋巴結(jié)構(gòu)中的細胞亞型作為癌癥復(fù)發(fā)的預(yù)測標志物

CancerResearch|PCF空間單細胞蛋白組發(fā)現(xiàn)三級淋巴結(jié)構(gòu)中關(guān)鍵細胞亞型作為癌癥復(fù)發(fā)的預(yù)測標志物越來越多的證據(jù)表明腫瘤浸潤淋巴細胞的空間組織關(guān)系可能是腫瘤進展和治療反應(yīng)的主要決定因素。因此，繪制和分析精細的腫瘤免疫微環(huán)境結(jié)構(gòu)可能為預(yù)測癌癥預(yù)后提供新的見解。近期Cancerresearch雜志發(fā)表了一項探索性和前瞻性的臨床研究，用來評估腫瘤微環(huán)境內(nèi)的結(jié)構(gòu)是否可以預(yù)測頭頸鱗狀細胞癌（HNSCC）的術(shù)后復(fù)發(fā)。該研究使用PhenoCycler-Fusion（PCF）空間單細胞蛋白組（原CODEX）檢測了主要的免疫亞群?？臻g細胞鄰域分析發(fā)現(xiàn)了高頻率的由CD31highCD38high漿細胞組成的三級淋巴結(jié)構(gòu)（TLS）與HNSCC術(shù)后復(fù)發(fā)率降低顯著相關(guān)。通過PCF空間單細胞蛋白組技術(shù)對來自9個病人的組織全片進行了30個抗體的檢測，這些抗體可以識別主要的淋巴細胞亞群、腫瘤細胞、血管和基質(zhì)細胞。質(zhì)控之后對79萬多個單細胞進行了定義，總共注釋了20種細胞亞型，說明了腫瘤微環(huán)境復(fù)雜的細胞組成?？臻g關(guān)系分析定義了11個細胞鄰域（cellularneighborhood,CN）。這些CN由不同的細胞類型組成，反映了不同細胞類型間在空間上存在復(fù)雜的互作關(guān)系。對每個CN中細胞類型進行配對細胞-細胞互作分析（pairwisecell–cellcontacts）發(fā)現(xiàn)了有些CN中同源性互作占主導(dǎo)，有些CN中主要是異源性互作為主。異源性互作占比最多的是TLS1、TLS2和hottumor這3個CN。例如漿細胞主導(dǎo)了TLS1附近的細胞相互作用。這些細胞與其他漿細胞相互作用，還與CD90+MSC-like細胞、血管細胞以及CD4+和CD8+T細胞相互作用。對比之前的研究說明TLS1或許關(guān)聯(lián)好的預(yù)后。而在TLS2中，M2型巨噬細胞主導(dǎo)了相互作用，這些巨噬細胞與Treg、PMN-MDSC、CD4+和CD8+T細胞相互作用，暗示了TLS2中或許與抑制抗腫瘤免疫相關(guān)。在hottumor中，大約三分之一的腫瘤細胞與淋巴細胞亞群接觸，例如中性粒細胞、CD4+和CD8+T細胞，還有M2巨噬細胞和PMN-MDSC。相比之下，在coldtumor中，大多數(shù)腫瘤細胞是同類型的互作?？傊?，這些CN對于腫瘤生長和免疫逃逸或有效抗腫瘤免疫的產(chǎn)生可能具有重要的功能。臨床相關(guān)性分析表明了細胞鄰域TLS1在腫瘤未復(fù)發(fā)的患者中更為常見，高頻率的TLS1與不復(fù)發(fā)顯著相關(guān)，并且可預(yù)測無復(fù)發(fā)生存期。同樣，組織漿細胞的占比與無復(fù)發(fā)相關(guān)，并預(yù)測無復(fù)發(fā)生存期。蛋白定量分析發(fā)現(xiàn)了TLS1中漿細胞表達更高的CD38和CD31，外部TCGA數(shù)據(jù)也表明了更高的CD38和CD31轉(zhuǎn)錄水平與更好的疾病生存率顯著相關(guān)。總而言之，這項研究強調(diào)了PCF空間單細胞蛋白組在免疫監(jiān)測中的作用，揭示了HNSCC患者腫瘤微環(huán)境的異常復(fù)雜性，再次說明了腫瘤微環(huán)境的空間組織結(jié)構(gòu)對于細胞功能和預(yù)后至關(guān)重要性，并發(fā)現(xiàn)了TLS1和CD31highCD38high漿細胞是腫瘤復(fù)發(fā)的重要預(yù)測因子。PCF空間單細胞蛋白組學(xué)介紹PCF采用oligo偶聯(lián)抗體檢測技術(shù)結(jié)合自動化高分辨熒光顯微鏡，可實現(xiàn)超多靶標的空間定位及單細胞分辨率下的細胞表型分析。所有抗體先一次性與組織切片結(jié)合，再啟動抗體和熒光探針的“雜交—成像—剝離”三步循環(huán)，每次循環(huán)后通過熒光顯微鏡收集檢測抗體的熒光信號。PCF空間單細胞蛋白組學(xué)優(yōu)勢華盈生物PhenoCycler-Fusion單細胞原位空間蛋白組學(xué)技術(shù)資格證書華盈生物是美國AkoyaBioscience公司的PhenoCycler-Fusion空間單細胞蛋白組學(xué)技術(shù)認證服務(wù)商，已經(jīng)被納入了該技術(shù)的全球CRO服務(wù)提供者體系。借助全球領(lǐng)先的PhenoCycler-Fusion空間單細胞蛋白組學(xué)技術(shù)平臺的建立，華盈生物將為中國客戶提供更具精準醫(yī)學(xué)特色的服務(wù)與合作，推動中國團隊在空間生物學(xué)領(lǐng)域的研究水平，加快構(gòu)建符合中國人群的精準醫(yī)學(xué)模式。即刻加入“STAMP郵戳”計劃華盈生物推出腫瘤微環(huán)境空間蛋白組解剖分析項目”STAMP郵戳”計劃(SpatialTumorAnatomyofMicroenvironmentProteome),常備15-plex、25-plex、35-plex三款組合性panel,與國內(nèi)腫瘤研究領(lǐng)域的科學(xué)家共同推進腫瘤空間生物學(xué)研究。相關(guān)文獻WeedDT,ZilioS,McGeeC,MarnissiB,SargiZ,FranzmannE,ThomasG,LeibowitzJ,NicolliE,ArnoldD,BicciatoS,SerafiniP.TheTumorImmuneMicroenvironmentArchitectureCorrelateswithRiskofRecurrenceinHeadandNeckSquamousCellCarcinoma.CancerRes.2023;83(23):3886-3900.相關(guān)閱讀血液腫瘤進展｜免疫細胞空間關(guān)系是細胞治療應(yīng)答的關(guān)鍵決定因素CancerCell|PCF空間單細胞蛋白組鑒定三陰乳腺癌不同的治療反應(yīng)軌跡PCF空間單