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第十四章DNA的生物合成DNABiosynthesis(Replication)前言1958年FrancisCrick提出遺傳信息傳遞的中心法則1970年DBaltimore對(duì)遺傳信息傳遞的中心法則作出補(bǔ)充復(fù)制(replication)是以DNA為模板的DNA合成,是基因組的復(fù)制過(guò)程。在這個(gè)過(guò)程中,親代DNA作為合成模板,按照堿基配對(duì)原則合成子代分子,其化學(xué)本質(zhì)是酶促脫氧核苷酸聚合反應(yīng)。復(fù)制親代DNA子代DNA本章主要內(nèi)容:DNA復(fù)制的基本特征
DNA復(fù)制的酶學(xué)和拓?fù)鋵W(xué)變化原核生物DNA復(fù)制過(guò)程真核生物DNA生物合成過(guò)程逆轉(zhuǎn)錄和其他復(fù)制方式DNA復(fù)制的基本特征BasicRulesofDNAReplication第一節(jié)半保留復(fù)制(semi-conservativereplication)雙向復(fù)制(bidirectionalreplication)半不連續(xù)復(fù)制(semi-discontinuousreplication)DNA復(fù)制的主要特征一、半保留復(fù)制的實(shí)驗(yàn)依據(jù)和意義DNA生物合成時(shí),母鏈DNA解開為兩股單鏈,各自作為模板(template)按堿基配對(duì)規(guī)律,合成與模板互補(bǔ)的子鏈。子代細(xì)胞的DNA,一股單鏈從親代完整地接受過(guò)來(lái),另一股單鏈則完全從新合成。兩個(gè)子細(xì)胞的DNA都和親代DNA堿基序列一致。這種復(fù)制方式稱為半保留復(fù)制。半保留復(fù)制的概念子鏈繼承母鏈遺傳信息的幾種可能方式:
全保留式半保留式混合式AGGTACTGCCACTGGTCCATGACGGTGACCCCACTGGGGTGACCAGGTACTGTCCATGACTCCATGACAGGTACTGAGGTACTGCCACTGGTCCATGACGGTGACCAGGTACTGCCACTGGTCCATGACGGTGACC+母鏈DNA
復(fù)制過(guò)程中形成的復(fù)制叉子代DNA
目錄1958–MatthewMeselson和FranklinStahl美國(guó)科學(xué)家馬修.梅塞爾(MatthewKeelson)福蘭克林.斯塔爾(FranklinStahl)密度梯度實(shí)驗(yàn)
——實(shí)驗(yàn)結(jié)果支持半保留復(fù)制的設(shè)想。含重氮-DNA的細(xì)菌培養(yǎng)于普通培養(yǎng)液
第一代繼續(xù)培養(yǎng)于普通培養(yǎng)液
第二代梯度離心結(jié)果按半保留復(fù)制方式,子代DNA與親代DNA的堿基序列一致,即子代保留了親代的全部遺傳信息,體現(xiàn)了遺傳的保守性。半保留復(fù)制的意義遺傳的保守性,是物種穩(wěn)定性的分子基礎(chǔ),但不是絕對(duì)的。原核生物基因組是環(huán)狀DNA,只有一個(gè)復(fù)制起點(diǎn)(origin)。復(fù)制從起點(diǎn)開始,向兩個(gè)方向進(jìn)行解鏈,進(jìn)行的是單點(diǎn)起始雙向復(fù)制。二、DNA復(fù)制從起點(diǎn)向兩個(gè)方向延伸復(fù)制中的放射自顯影圖象A.環(huán)狀雙鏈DNA及復(fù)制起始點(diǎn)B.復(fù)制中的兩個(gè)復(fù)制叉C.復(fù)制接近終止點(diǎn)(termination,ter)oriterABC真核生物每個(gè)染色體有多個(gè)起始點(diǎn),是多復(fù)制子的復(fù)制。習(xí)慣上把兩個(gè)相鄰起始點(diǎn)之間的距離定為一個(gè)復(fù)制子(replicon)
。復(fù)制子是獨(dú)立完成復(fù)制的功能單位。5’3’oriorioriori5’3’5’3’oriorioriori5’3’5’5’3’3’5’5’3’復(fù)制3’三、復(fù)制的半不連續(xù)性3
5
3
5
解鏈方向3′5′3′3′5′領(lǐng)頭鏈(leadingstrand)隨從鏈(laggingstrand)順著解鏈方向生成的子鏈,復(fù)制是連續(xù)進(jìn)行的,這股鏈稱為領(lǐng)頭鏈。另一股鏈因?yàn)閺?fù)制的方向與解鏈方向相反,不能順著解鏈方向連續(xù)延長(zhǎng),這股不連續(xù)復(fù)制的鏈稱為隨從鏈。復(fù)制中的不連續(xù)片段稱為岡崎片段(okazakifragment)。
領(lǐng)頭鏈連續(xù)復(fù)制而隨從鏈不連續(xù)復(fù)制,就是復(fù)制的半不連續(xù)性。
DNA復(fù)制的酶學(xué)和拓?fù)鋵W(xué)變化TheEnzymologyofDNAReplication第二節(jié)參與DNA復(fù)制的物質(zhì)底物(substrate):
dATP,dGTP,dCTP,dTTP聚合酶(polymerase):
依賴DNA的DNA聚合酶,簡(jiǎn)寫為DNA-pol模板(template):
解開成單鏈的DNA母鏈引物(primer):
提供3
-OH末端使dNTP可以依次聚合
其他的酶和蛋白質(zhì)因子一、復(fù)制的化學(xué)反應(yīng)
(dNMP)n
+dNTP→(dNMP)n+1
+PPi
目錄聚合反應(yīng)的特點(diǎn)DNA新鏈生成需引物和模板;新鏈的延長(zhǎng)只可沿5→3
方向進(jìn)行。二、DNA聚合酶全稱:依賴DNA的DNA聚合酶(DNA-dependentDNApolymerase)簡(jiǎn)稱:DNA-pol活性:1.5
3
的聚合活性2.核酸外切酶活性5′AGCTTCAGGATA
3′
|||||||||||3′TCGAAGTCCTAGCGAC5′3
5
外切酶活性5
3
外切酶活性?能切除突變的DNA片段。能辨認(rèn)錯(cuò)配的堿基對(duì),并將其水解。
核酸外切酶活性目錄(一)原核生物的DNA聚合酶DNA-polⅠDNA-polⅡDNA-polⅢ(一)原核生物的DNA聚合酶功能:對(duì)復(fù)制中的錯(cuò)誤進(jìn)行校讀,對(duì)復(fù)制和修復(fù)中出現(xiàn)的空隙進(jìn)行填補(bǔ)。(損傷修復(fù),填補(bǔ)空隙)DNA-polⅠ(109kD)323個(gè)氨基酸小片段5
核酸外切酶活性大片段/Klenow片段
604個(gè)氨基酸DNA聚合酶活性
3
5
核酸外切酶活性N端C端木瓜蛋白酶DNA-polⅠKlenow片段是實(shí)驗(yàn)室合成DNA,進(jìn)行分子生物學(xué)研究中常用的工具酶。
DNA-polⅡ(120kD)DNA-polII基因發(fā)生突變,細(xì)菌依然能存活。DNA-polⅡ?qū)δ0宓奶禺愋圆桓?,即使在已發(fā)生損傷的DNA模板上,它也能催化核苷酸聚合。因此認(rèn)為,它參與DNA損傷的應(yīng)急狀態(tài)修復(fù)。功能是原核生物復(fù)制延長(zhǎng)中真正起催化作用的酶。
DNA-polⅢ(250kD)2個(gè)核心酶1個(gè)
-復(fù)合物(
、
、
、
、
、
6種亞基)1對(duì)
-亞基(可滑動(dòng)的DNA夾子)DNA聚合酶Ⅲ全酶結(jié)構(gòu)全酶結(jié)構(gòu)包括:
亞基(132000)主要功能是5
方向合成DNA
亞基具有3
5
外切酶活性(復(fù)制保真性所必需)
亞基可增強(qiáng)其活性
亞基可能起組裝作用核心酶由
、
和
亞基組成:兩側(cè)的β亞基發(fā)揮夾穩(wěn)DNA模板鏈,并使酶沿模板滑動(dòng)的作用2個(gè)
-亞基分別和1個(gè)核心酶相互作用,其柔性連接區(qū)可以確保在復(fù)制叉1個(gè)全酶分子的2個(gè)核心酶能夠相對(duì)獨(dú)立運(yùn)動(dòng),分別負(fù)責(zé)合成前導(dǎo)鏈和后隨鏈。功能:有促進(jìn)全酶組裝至模板上及增強(qiáng)核心酶活性的作用
-復(fù)合物由6種亞基組成:
、
、
、
、
、
α亞基具有5′→3′方向合成DNA的催化活性ε亞基具有3′→5′外切酶活性,起校對(duì)功能,可提高聚合酶Ⅲ復(fù)制DNA的保真性亞基可能起組建的作用β亞基猶如夾子,功能是識(shí)別引物、夾住DNA
分子向前滑動(dòng)
亞基起著促使核心酶二聚化的作用其余的亞基構(gòu)成-復(fù)合物,主要功能是幫助亞基夾住DNA(也稱夾子裝置器),并有增強(qiáng)核心酶活性的作用亞基相對(duì)分子質(zhì)量亞基數(shù)目亞基功能α1320002聚合活性ε2700025
外切酶校對(duì)活性θ100002組建核心酶τ710002核心酶二聚化γ520002依賴DNA的ATP酶,形成γ復(fù)合體δ350001可與β亞基結(jié)合,形成γ復(fù)合體δ,330001形成γ復(fù)合體χ150001形成γ復(fù)合體φ120001形成γ復(fù)合體β370004兩個(gè)β亞基形成滑動(dòng)夾子,以提高酶的持續(xù)合成能力夾子裝置器DNA聚合酶ⅠDNA聚合酶ⅡDNA聚合酶Ⅲ不同種類亞基數(shù)目1≥7≥10相對(duì)分子質(zhì)量103000880009000005′→3′核酸聚合酶活性+++3′→5′核酸外切酶活性+++5′→3′核酸外切酶活性+--聚合速度(核苷酸/分)1000~1200240015000~60000持續(xù)合成能力3~2001500≥500000分子數(shù)/細(xì)胞40010010~20功能切除引物,修復(fù)修復(fù)復(fù)制(二)真核生物的DNA聚合酶DNA-pol
起始引發(fā),有引物酶活性。延長(zhǎng)子鏈的主要酶,有解螺旋酶活性。參與低保真度的復(fù)制,參與核DNA的修復(fù).在復(fù)制過(guò)程中起校讀、修復(fù)和填補(bǔ)缺口的作用。在線粒體DNA復(fù)制中起催化作用。DNA-pol
DNA-pol
DNA-pol
DNA-pol
真核生物和原核生物DNA聚合酶的比較E.Coli真核細(xì)胞
功能Ⅰ填補(bǔ)復(fù)制中的DNA空隙,DNA修復(fù)和重組Ⅱ復(fù)制中的校對(duì),DNA修復(fù)
DNA修復(fù)
線粒體DNA合成Ⅲ
錯(cuò)配修復(fù)DnaG
引物酶
前導(dǎo)鏈和平后隨鏈合成三、復(fù)制保真性的酶學(xué)依據(jù)復(fù)制按照堿基配對(duì)規(guī)律進(jìn)行,是遺傳信息能準(zhǔn)確傳代的基本原理。復(fù)制保真性的酶學(xué)機(jī)制:(一)DNA-pol的核酸外切酶活性和及時(shí)校讀
(二)復(fù)制的保真性和堿基選擇(一)DNA-pol的核酸外切酶活性和及時(shí)校讀A:DNA-pol的外切酶活性切除錯(cuò)配堿基;并用其聚合活性摻入正確配對(duì)的底物。B:堿基配對(duì)正確,DNA-pol不表現(xiàn)活性。(二)復(fù)制的保真性和堿基選擇?DNA聚合酶靠其大分子結(jié)構(gòu)協(xié)調(diào)非共價(jià)(氫鍵)與共價(jià)(磷酸二酯鍵)鍵的有序形成。?利用“錯(cuò)配”實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),DNApolⅢ對(duì)核苷酸的參入(incorporation)具有選擇功能。
嘌呤的化學(xué)結(jié)構(gòu)能形成順式和反式構(gòu)型,與相應(yīng)的嘧啶形成氫鍵配對(duì),嘌呤應(yīng)處于反式構(gòu)型
DNApolⅢ對(duì)嘌呤的不同構(gòu)型表現(xiàn)不同親和力,
因此實(shí)現(xiàn)其選擇功能。
1.遵守嚴(yán)格的堿基配對(duì)規(guī)律;2.聚合酶在復(fù)制延長(zhǎng)時(shí)對(duì)堿基的選擇功能;3.復(fù)制出錯(cuò)時(shí)DNA-pol的及時(shí)校讀功能。DNA復(fù)制的保真性至少要依賴三種機(jī)制
三、復(fù)制中的分子解鏈及DNA分子拓?fù)鋵W(xué)變化
DNA分子的堿基埋在雙螺旋內(nèi)部,只有把DNA解成單鏈,它才能起模板作用。
(一)解螺旋酶、引物酶和單鏈DNA結(jié)合蛋白E.Coli基因圖目錄解螺旋酶(helicase)——利用ATP供能,作用于氫鍵,使DNA雙鏈解開成為兩條單鏈引物酶(primase)——復(fù)制起始時(shí)催化生成RNA引物的酶單鏈DNA結(jié)合蛋白(singlestrandedDNAbindingprotein,SSB)——在復(fù)制中維持模板處于單鏈狀態(tài)并保護(hù)單鏈的完整
解旋酶(helicase)解螺旋酶作用:斷裂互補(bǔ)堿基間的氫鍵,使DNA成單鏈dnaA、B、C…DnaA、B、C…ATP引物酶(Primase)
5′5′催化RNA引物合成的酶叫引物酶,它是一種特殊的RNA聚合酶DNA合成需在RNA引物的基礎(chǔ)上進(jìn)行RNA引物5′3′5′3′單鏈DNA結(jié)合蛋白(SSB)作用:防止單鏈DNA重新形成雙鏈,防止單鏈DNA被核酸酶水解(協(xié)同效應(yīng))SSB108
局部解鏈后(二)DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶(DNAtopoisomerase)
解鏈過(guò)程中正超螺旋的形成目錄拓?fù)洚悩?gòu)酶作用特點(diǎn)既能水解、又能連接磷酸二酯鍵
拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅰ
拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅱ分類拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅰ切斷DNA雙鏈中一股鏈,使DNA解鏈旋轉(zhuǎn)不致打結(jié);適當(dāng)時(shí)候封閉切口,DNA變?yōu)樗沙跔顟B(tài)。反應(yīng)不需ATP。拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅱ切斷DNA分子兩股鏈,斷端通過(guò)切口旋轉(zhuǎn)使超螺旋松弛。利用ATP供能,連接斷端,DNA分子進(jìn)入負(fù)超螺旋狀態(tài)。作用機(jī)制
五、DNA連接酶連接DNA鏈3
-OH末端和相鄰DNA鏈5
-P末端,使二者生成磷酸二酯鍵,從而把兩段相鄰的DNA鏈連接成一條完整的鏈。DNA連接酶(DNAligase)作用方式HO5’3’3’5’DNA連接酶ATPADP5’3’5’3’目錄DNA連接酶在復(fù)制中起最后接合缺口的作用。在DNA修復(fù)、重組及剪接中也起縫合缺口作用。也是基因工程的重要工具酶之一。功能提供核糖3
-OH提供5
-P結(jié)果DNA聚合酶引物或延長(zhǎng)中的新鏈游離dNTP去PPi(dNTP)n+1連接酶復(fù)制中不連續(xù)的兩條單鏈不連續(xù)→連續(xù)鏈拓?fù)涿盖袛?、整理后的兩鏈改變拓?fù)錉顟B(tài)DNA聚合酶,拓?fù)涿负瓦B接酶催化3
,5
-磷酸二酯鍵生成的比較
小結(jié)主要成員
主要作用DnaA識(shí)別復(fù)制起始位點(diǎn)解螺旋酶解開DNA雙鏈SSB維持已解開單鏈DNA的穩(wěn)定引物酶合成RNA引物TOPO使打結(jié)、纏繞、正超螺旋的DNA松馳DNA-polⅢDNA復(fù)制DNA-polⅠ水解引物、填補(bǔ)空隙、修復(fù)作用DNA連接酶催化雙鏈DNA中單鏈缺口的連接原核生物DNA復(fù)制過(guò)程TheProcessofDNAReplicationinProkaryotes第三節(jié)1.復(fù)制的起始2.復(fù)制的延長(zhǎng)3.復(fù)制的終止起始是復(fù)制中較為復(fù)雜的環(huán)節(jié),在此過(guò)程中,各種酶和蛋白因子在復(fù)制起始點(diǎn)處裝配引發(fā)體,形成復(fù)制叉并合成RNA引物。
需要解決兩個(gè)問(wèn)題:1.DNA解開成單鏈,提供模板。2.形成引發(fā)體,合成引物,提供3-OH末端。一、復(fù)制的起始E.coli復(fù)制起始點(diǎn)oriCGATTNTTTATTT···GATCTNTTNTATT···GATCTCTTATTAG···11317293244···TGTGGATTA-‖-TTATACACA-‖-TTTGGATAA-‖-TTATCCACA5866166174201209237245
串聯(lián)重復(fù)序列
反向重復(fù)序列5
3
5
3
1.DNA解鏈E.coli復(fù)制起始點(diǎn)oriC跨度為245bp,有3組串聯(lián)重復(fù)序列和2對(duì)反向重復(fù)序列
GATTNTTTATTT…GATCTNTTNTATT…GATCTCTTATTAG串聯(lián)重復(fù)序列
反向重復(fù)序列…TTTGGATAA…..TTATCCACA
TGTGGATTA……TTATACACA…
2.引發(fā)體和引物原核生物的復(fù)制起始部位及解鏈
前引發(fā)復(fù)合體DnaADnaB、DnaCDNA拓?fù)洚悩?gòu)酶引物酶SSB3
5
3
5
含有解螺旋酶、DnaC蛋白、引物酶和DNA復(fù)制起始區(qū)域的復(fù)合結(jié)構(gòu)稱為引發(fā)體。
3
5
3
5
引物是由引物酶催化合成的短鏈RNA分子。
引物3'HO5'引物酶引發(fā)體和復(fù)制叉的生成
(二)復(fù)制的延長(zhǎng)復(fù)制的延長(zhǎng)指在DNA-pol催化下,dNTP以dNMP的方式逐個(gè)加入引物或延長(zhǎng)中的子鏈上,其化學(xué)本質(zhì)是磷酸二酯鍵的不斷生成。
5'3'5'dATPdGTPdTTPdCTPdTTPdGTPdATPdCTPOH3'3'DNA-pol目錄領(lǐng)頭鏈的合成目錄隨從鏈的合成目錄復(fù)制過(guò)程簡(jiǎn)圖
在復(fù)制叉同時(shí)合成前導(dǎo)鏈和后隨鏈原核生物基因是環(huán)狀DNA,雙向復(fù)制的復(fù)制片段在復(fù)制的終止點(diǎn)(ter)處匯合。oriter
E.coli8232oriterSV40500三、復(fù)制的終止終止子位點(diǎn):terA-terFTus:與終止子位點(diǎn)結(jié)合的蛋白質(zhì)5
5
5
RNA酶OHP5
DNA-polⅠdNTP5
5
PATPADP+Pi5
5
DNA連接酶
子鏈中的RNA引物被取代
由DNA聚合酶I完成切除引物,并且填補(bǔ)空隙,由DNA連接酶將DNA片段連接起來(lái)。真核生物DNA生物合成過(guò)程TheProcessofDNABiosynthesisineukaryotes第四節(jié)1.復(fù)制時(shí)需要解開和重新組裝核小體結(jié)構(gòu);2.多起點(diǎn)復(fù)制3.RNA引物及岡崎片段的長(zhǎng)度均小于原核生物4.真核生物染色體全部復(fù)制完成以前不會(huì)發(fā)動(dòng)新一輪的復(fù)制.真核生物與原核生物DNA復(fù)制的差異:哺乳動(dòng)物的細(xì)胞周期DNA合成期G1G2SM?細(xì)胞能否分裂,決定于進(jìn)入S期及M期這兩個(gè)關(guān)鍵點(diǎn)。與蛋白激酶活性有關(guān)。?蛋白激酶通過(guò)磷酸化激活或抑制各種復(fù)制因子而實(shí)施調(diào)控作用。?真核生物每個(gè)染色體有多個(gè)起始點(diǎn),是多復(fù)制子復(fù)制。復(fù)制有時(shí)序性,即復(fù)制子以分組方式激活而不是同步起動(dòng)。?復(fù)制的起始需要DNA-polα(引物酶活性)和polδ(解螺旋酶活性)參與。還需拓?fù)涿负蛷?fù)制因子(replicationfactor,RF)。?增殖細(xì)胞核抗原(proliferationcellnuclearantigen,PCNA)在復(fù)制起始和延長(zhǎng)中起關(guān)鍵作用。(一)復(fù)制的起始DNA-polδ和polα分別兼有解螺旋酶和引物酶活性。在復(fù)制叉及引物生成后,DNA-polδ通過(guò)PCNA的協(xié)同作用,逐步取代polα,在RNA引物的3
-OH基礎(chǔ)上連續(xù)合成領(lǐng)頭鏈。隨從鏈引物也由polα催化合成。然后由PCNA協(xié)同,polδ置換polα,繼續(xù)合成DNA子鏈。二、真核生物復(fù)制的延長(zhǎng)發(fā)生DNA聚合酶α/δ轉(zhuǎn)換3
5
5
3
領(lǐng)頭鏈3
5
3
5
親代DNA隨從鏈引物核小體(二)復(fù)制的延長(zhǎng)3
5
5
3
領(lǐng)頭鏈3
5
3
5
親代DNA后隨鏈引物核小體三、真核生物DNA合成后立即組裝成核小體染色體DNA呈線狀,復(fù)制在末端停止。復(fù)制中岡崎片段的連接,復(fù)制子之間的連接。染色體兩端DNA子鏈上最后復(fù)制的RNA引物,去除后留下空隙。四、端粒酶參與解決染色體末端復(fù)制問(wèn)題5
3
3
55
3
3
5+5
3
3
3
3
5
5
目錄端粒(telomere)指真核生物染色體線性DNA分子末端的結(jié)構(gòu)。功能?維持染色體的穩(wěn)定性?維持DNA復(fù)制的完整性結(jié)構(gòu)特點(diǎn)?由末端單鏈DNA序列和蛋白質(zhì)構(gòu)成。?末端DNA序列是多次重復(fù)的富含T、G堿基的短序列。TTTTGGGGTTTTGGGG…端粒酶(telomerase)端粒酶RNA(humantelomeraseRNA,hTR)端粒酶協(xié)同蛋白(humantelomeraseassociatedprotein1,hTP1)端粒酶逆轉(zhuǎn)錄酶(humantelomerasereversetranscriptase,hTRT)
組成
對(duì)外:抵御核酸酶等外界對(duì)內(nèi):染色體脫氧核糖核酸的因素的襲擊末端復(fù)制問(wèn)題保護(hù)染色體結(jié)構(gòu)和功能的完整性染色體染色體脫氧核糖核酸的末端復(fù)制問(wèn)題:3’5’5’3’RNA引物3’3’RNA引物水解
即DNA復(fù)制過(guò)程不能"自始至終"完整地復(fù)制整個(gè)線性染色體,而是每次都在其5'末端留下一個(gè)空缺未能填補(bǔ)(即RNA引物降解),如果細(xì)胞沒(méi)有辦法添補(bǔ)這些空隙,染色體DNA將隨著每一次的細(xì)胞分裂而不斷縮短,直至這種缺隙侵蝕到染色體的結(jié)構(gòu)基因而使細(xì)胞消亡。端粒酶的催化延長(zhǎng)作用爬行模型目錄DNA聚合酶復(fù)制子鏈進(jìn)一步加工目錄逆轉(zhuǎn)錄和其他復(fù)制方式ReverseTranscription&OtherDNAReplicationWays第五節(jié)雙鏈DNA是大多數(shù)生物的遺傳物質(zhì)。某些病毒的遺傳物質(zhì)是RNA。原核生物的質(zhì)粒,真核生物的線粒體DNA,都是染色體外存在的DNA。這些非染色體基因組,采用特殊的方式進(jìn)行復(fù)制。反轉(zhuǎn)錄酶(reversetranscriptase)反轉(zhuǎn)錄(reversetranscription)RNADNA反轉(zhuǎn)錄酶一、反轉(zhuǎn)錄病毒和反轉(zhuǎn)錄酶
反轉(zhuǎn)錄病毒細(xì)胞內(nèi)的反轉(zhuǎn)錄現(xiàn)象RNA模板反轉(zhuǎn)錄酶DNA-RNA雜化雙鏈RNA酶單鏈DNA反轉(zhuǎn)錄酶雙鏈DNARNA病毒在細(xì)胞內(nèi)復(fù)制成雙鏈DNA的前病毒(provirus)。前病毒保留了RNA病毒全部遺傳信息,并可在細(xì)胞內(nèi)獨(dú)立繁殖。在某些情況下,前病毒基因組通過(guò)基因重組(recombination),參加到細(xì)胞基因組內(nèi),并隨宿主基因一起復(fù)制和表達(dá)。這種重組方式稱為整合(integration)。前病毒獨(dú)立繁殖或整合,都可成為致病的原因。逆轉(zhuǎn)錄酶催化的cDNA合成
二、反轉(zhuǎn)錄研究的意義
反轉(zhuǎn)錄酶和反轉(zhuǎn)錄現(xiàn)象,是分子生物學(xué)研究中的重大發(fā)現(xiàn)。
反轉(zhuǎn)錄現(xiàn)象說(shuō)明:至少在某些生物,RNA同樣兼有遺傳信息傳代與表達(dá)功能。對(duì)反轉(zhuǎn)錄病毒的研究,拓寬了20世紀(jì)初已注意到的病毒致癌理論。
滾環(huán)復(fù)制(rollingcirclereplication)三、滾環(huán)復(fù)制和D環(huán)復(fù)制
是某些低等生物的復(fù)制形式,如
X174和M13噬菌體等。3
-OH5
-P5
5
5
3
3
3
3
5'滾環(huán)復(fù)制5'
5
3
3
5
目錄dNTPDNA-polγ
D環(huán)復(fù)制(D-loopreplication)
是線粒體DNA(mitochondrialDNA,mtDNA)的復(fù)制形式。
D-環(huán)復(fù)制時(shí)需合成引物。mtDNA為雙鏈,第一個(gè)引物以內(nèi)環(huán)為模板延伸。至第二個(gè)復(fù)制起始點(diǎn)時(shí),又合成另一個(gè)反向引物,以外環(huán)為模板進(jìn)行反向的延伸。最后完成兩個(gè)雙鏈環(huán)狀DNA的復(fù)制。復(fù)制中呈字母D形狀而得名。D環(huán)復(fù)制的特點(diǎn)是復(fù)制起始點(diǎn)不在雙鏈DNA同一位點(diǎn),內(nèi)、外環(huán)復(fù)制有時(shí)序差別。DNA損傷(突變)與修復(fù)DNADamage(Mutation)andRepair第六節(jié)遺傳物質(zhì)的結(jié)構(gòu)改變而引起的遺傳信息改變,均可稱為突變。在復(fù)制過(guò)程中發(fā)生的DNA突變稱為DNA損傷(DNAdamage)。從分子水平來(lái)看,突變就是DNA分子上堿基的改變。
一、突變的意義(一)突變是進(jìn)化、分化的分子基礎(chǔ)(二)突變導(dǎo)致基因型改變(三)突變導(dǎo)致死亡(四)突變是某些疾病的發(fā)病基礎(chǔ)
二、引發(fā)突變的因素物理因素紫外線(ultraviolet,UV)、各種輻射
UV化學(xué)因素目錄三、突變的分子改變類型錯(cuò)配(mismatch)缺失(deletion)插入(insertion)重排(rearrangement)框移(frame-shift)
DNA分子上的堿基錯(cuò)配稱點(diǎn)突變(pointmutation)。發(fā)生在同型堿基之間,即嘌呤代替另一嘌呤,或嘧啶代替另一嘧啶。1.轉(zhuǎn)換發(fā)生在異型堿基之間,即嘌呤變嘧啶或嘧啶變嘌呤。
2.顛換(一)錯(cuò)配鐮形紅細(xì)胞貧血病人Hb(HbS)β亞基N-val
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his
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val
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C肽鏈CACGTG基因正常成人Hb(HbA)β亞基N-val
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glu
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glu
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C肽鏈CTCGAG基因(二)缺失、插入和框移缺失:一個(gè)堿基或一段核苷酸鏈從DNA大分子上消失。插入:原來(lái)沒(méi)有的一個(gè)堿基或一段核苷酸鏈插入到DNA大分子中間。移碼突變是指三聯(lián)體密碼的閱讀方式改變,造成蛋白質(zhì)氨基酸排列順序發(fā)生改變。
缺失或插入都可導(dǎo)致移碼突變
。谷酪蛋絲5’……GCA
GUA
CAU
GUC……丙纈組纈正常5’……GAG
UAC
AUG
UC……缺失C缺失引起框移突變(三)重排DNA分子內(nèi)較大片段的交換,稱為重組或重排。
由基因重排引起的兩種地中海貧血基因型目錄四、DNA損傷的修復(fù)修復(fù)(repairing)
是對(duì)已發(fā)生分子改變的補(bǔ)償措施,使其回復(fù)為原有的天然狀態(tài)。光修復(fù)(lightrepairing)切除修復(fù)(excisionrepairing)重組修復(fù)(recombinationrepairing)SOS修復(fù)
修復(fù)的主要類型(一)光修復(fù)光修復(fù)酶(photolyase)
UVUvrAUvrBUvrCOHPDNA聚合酶ⅠOHP
(二)切除修復(fù)是細(xì)胞內(nèi)最重要和有效的修復(fù)機(jī)制,主要由DNA-polⅠ和連接酶完成。DNA連接酶ATPE.coli的切除修復(fù)機(jī)制目錄切除修復(fù)動(dòng)畫著色性干皮病(XP)案例分析
著色性干皮病(XP)
此病為常染色體隱性遺傳病,患者皮膚對(duì)日光敏感,病變累及顏面,肩,臂等.發(fā)病機(jī)制
XPA基因第631位堿基由胞嘧啶突變?yōu)樾叵汆奏?轉(zhuǎn)換)第211位氨
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