英文醫(yī)學數(shù)據(jù)庫檢索課件

0英文醫(yī)學數(shù)據(jù)庫檢索1問題的提出阿司匹林能否預(yù)防大腸癌？國內(nèi)專業(yè)文獻檢索結(jié)果文獻結(jié)論不一致很多國內(nèi)文獻摘譯自國外專業(yè)文獻23大綱一、英文數(shù)據(jù)庫概述

二、Pubmed文獻檢索系統(tǒng)4一、英文數(shù)據(jù)庫概述按專業(yè)可分為：綜合性數(shù)據(jù)庫和專業(yè)數(shù)據(jù)庫。綜合性數(shù)據(jù)庫：三大索引SCI科學引文索引ISTP科技會議錄索引EI工程索引WebofScienceEngineeringVillages25一、英文數(shù)據(jù)庫概述專業(yè)數(shù)據(jù)庫：醫(yī)學領(lǐng)域常用四大索引SCI科學引文索引(WebofScience)BA生物學文摘(BIOSISPreview)CA化學文摘(CAPlus)WebofKnowledgeSciFinderScholarIM醫(yī)學索引(Medline數(shù)據(jù)庫〕PubmedDialog聯(lián)機檢索系統(tǒng)6一、英文數(shù)據(jù)庫概述7一、英文數(shù)據(jù)庫概述按收費與否，可分為收費數(shù)據(jù)庫與免費數(shù)據(jù)庫。英文數(shù)據(jù)庫大局部收費。免費數(shù)據(jù)庫：Pubmed：://medscape:://medscapeGoogleScholar:://scholar.google8GoogleScholar查找國外專業(yè)文獻檢索提問式“colorectalcanceraspirin"時間限定在“2021年以來〞獲取結(jié)果16，900條結(jié)果9GoogleScholar查找國內(nèi)專業(yè)文獻記錄來源包括ＣＮＫＩ、維普、萬方以及其他網(wǎng)頁信息10二、Pubmed文獻檢索系統(tǒng)

知識精要（一）檢索指南（二）11〔一〕、Pubmed知識精要沿革1資源2檢索途徑4

常用字段3特色512PubmedMedline光盤Medline聯(lián)機檢索IndexMedicus1997-1983-1964-1879-1.Pubmed沿革1314Medline免費檢索效勞Pubmed：://MedscapeHighwire：://15利用Medscape檢索Medline162.Pubmed可獲取資源172.Pubmed可獲取資源〔1〕生物醫(yī)學期刊論文線索MEDLINE：可獲取1950年以來80多個國家的5000余種生物醫(yī)學期刊中的文獻線索。In-processcitations：待標引的MEDLINE的前期數(shù)據(jù)庫。Publishersuppliedcitation：出版商提供的文獻，主要是MEDLINE選擇性收錄的期刊中超出收錄范圍的文獻。OLDMEDLINE:1965年以前的記錄1819Pubmed記錄來源標識〔1〕[PubMed–indexedforMedline]

[PubMed-inprocess]

[PubMed-assuppliedbypublisher]20Pubmed記錄來源標識〔2〕免費全文213.PubMed記錄的主要字段(P85〕字段標識：字段名稱

AB：AbstractAD：AffiliationALL：AllField

AU：Authors1AU：FirstAuthorFAU：FullAuthorNamePMID：PubMedUniqueIdentifierDP：PublicationDate

字段標識：字段名稱LA：Language

MH：MeSHTerms

MAJR：MeSHMajorTopic

SH：MeSHSubheadings

PT：PublicationType

SO：Source

TA：JournalTitle

TI：TitleTW：TextWords224.PubMed檢索途徑高級檢索根本檢索23Pubmed高級檢索限定字段進行檢索利用索引選擇提問詞查看并利用已有檢索式進行檢索24PubmedMeshDatabase2525

MeSHDatabase:查看并利用主題詞檢索MeSH主題詞檢索是PubMed最具特色的檢索功能之一，能保證較好的查全率和查準率主題詞對同一概念的不同表達方式進行了標準主題詞組配副主題詞，使檢索結(jié)果更加專指主題詞的樹狀結(jié)構(gòu)表：可自由調(diào)整檢索策略擴展檢索：利用下位詞同時進行檢索，提高查全率限定檢索：將檢索結(jié)果限定在主要主題詞，使檢索結(jié)果更加準確注意：用MeSH詞檢索時，只檢索來源于MEDLILNE的文獻，不檢索PubMed其他來源的文獻26JournalsinNCBIDatabases查找期刊詳細信息并獲取期刊論文查找期刊詳細信息并獲取期刊論文27PubmedSingleCitationMatcher準確查找指定論文285.Pubmed特色生物醫(yī)學領(lǐng)域首選數(shù)據(jù)庫收錄期刊范圍側(cè)重生物醫(yī)學領(lǐng)域檢索免費，并可免費獲取局部全文及相關(guān)生物信息學資源。文獻報道速度快收錄文獻加工質(zhì)量高，經(jīng)Mesh主題詞標引。檢索功能強大，支持自動詞語匹配檢索，并提供主題詞檢索、臨床查詢、引文檢索等特色檢索效勞。29檢索詞Mesh轉(zhuǎn)換表期刊名轉(zhuǎn)換表作者索引表經(jīng)過轉(zhuǎn)換后的檢索式Pubmed系統(tǒng)進行檢索Details分析29作者姓名轉(zhuǎn)換表PubMed特色：自動詞語匹配功能30PubMed自動詞語匹配功能舉例：欲查找大腸癌與阿司匹林同時出現(xiàn)的文獻，輸入“colorectalcanceraspirin〞，系統(tǒng)轉(zhuǎn)換后實際檢索策略為("colorectalneoplasms"[MeSHTerms]OR("colorectal"[AllFields]AND"neoplasms"[AllFields])OR"colorectalneoplasms"[AllFields]OR("colorectal"[AllFields]AND"cancer"[AllFields])OR"colorectalcancer"[AllFields])AND("aspirin"[MeSHTerms]OR"aspirin"[AllFields])31智能檢索功能不僅能準確拆分詞，而且能將提問詞轉(zhuǎn)換為MESH詞，并在Mesh字段與全字段同時進行檢索，有效保證文獻的查全和查準。SearchDetails框詳細顯示自動詞語匹配的實際檢索式。32查看系統(tǒng)轉(zhuǎn)換后的檢索策略原始提問式系統(tǒng)轉(zhuǎn)換過程系統(tǒng)實際檢索策略33

問題？

Q：是否可以完全依賴詞語的自動詞語匹配功能？

例如：單細胞Singlecell3334自動詞語匹配3435如何防止系統(tǒng)進行自動詞語匹配？檢索詞加上""〔半角狀態(tài)的雙引號〕,進行強制檢索系統(tǒng)不進行自動詞語匹配，不擴展檢索singlecell直接輸入"singlecell"或者single-cell353636以下情形不進行自動詞語匹配精確短語匹配,如“kidneyallograft〞截詞檢索,如bacter*連字符時,如kidney-allograftHistory檢索,如#1AND#２字段檢索,如toothache[ti]37〔二〕、Pubmed檢索指南如何查找阿司匹林預(yù)防大腸癌的文獻？1如何查找指定文獻？2381.如何查找阿司匹林預(yù)防大腸癌的文獻？課題分析兩個主要概念組面阿司匹林〔aspirin)大腸癌(colorectalcancer)如何翻譯英文提問詞？CNKI翻譯助手Google翻譯有道391.如何查找阿司匹林預(yù)防大腸癌的文獻？試檢：Pubmed根本檢索效勞提問詞：colorectalcanceraspirin40獲取檢索結(jié)果〔上〕限定條件進行檢索，相當于原來的“Limits〞功能自動獲取相關(guān)文獻轉(zhuǎn)換顯示格式記錄輸出41獲取檢索結(jié)果〔下〕獲取免費全文查找相關(guān)生物信息學數(shù)據(jù)庫查看系統(tǒng)轉(zhuǎn)換后的檢索策略42轉(zhuǎn)換記錄顯示格式AspirinforprophylacticuseintheprimarypreventionAspirinforprophylacticuseintheprimaryprevention43也可單擊題名超鏈進入ABSTRACT格式作者單位來源查找刊名全稱44NLMCatalog:獲取刊名全稱45將檢索結(jié)果限定為近5年綜述設(shè)置文獻過濾器查找特定類型文獻過濾條件一經(jīng)選擇持續(xù)起作用已選擇的文件過濾器46?利用主題詞進行檢索〔難點〕1.進入“MeshDatabase〞界面2.在此界面查找“colorectalcancer(大腸癌)〞對應(yīng)的主題詞(點擊選定主題詞超鏈，可獲取主題詞詳細信息〕3.輸入提問框"Addtosearchbuilder"4.找到“aspirin〞對應(yīng)的主題詞后，“Addtosearchbuilder〞，邏輯運算符選擇“And〞5.“searchpubmed〞進行檢索6.在檢索結(jié)果界面，點擊選定文獻題名超鏈，進行其文摘格式，在此界面下方點擊“PublicationTypes,MeSHTerms,Substances〞選項，獲取主題詞及主要主題詞信息〔注：主要主題詞有“*〞標志〕471.進入“MeshDatabase〞界面兩種方式進入MeshDatabase482.查找主題詞〔上〕定義及主題詞引進年代c組配副主題詞添加到檢索框檢索文獻492.查找主題詞〔下〕c加權(quán)檢索c相關(guān)參照擴展檢索款目詞：主題詞同義詞或近義詞樹狀結(jié)構(gòu)c上位詞下位詞503.利用主題詞進行檢索添加到檢索框檢索文獻(("ColorectalNeoplasms"[Mesh])OR"CecalNeoplasms"[Mesh])AND"Aspirin"[Mesh]514.獲取檢索結(jié)果點擊題名超鏈獲取詳細信息525.獲取記錄詳細信息53PublicationTypes,MeSHTerms,Substances：

獲取題錄的文獻類型、主題詞及物質(zhì)信息獲取指定題錄的主題詞信息，其中帶*號的為主要主題詞54LinkOut：獲取題錄相關(guān)資源獲取全文獲取醫(yī)學背景知識獲取相關(guān)生物信息學數(shù)據(jù)55利用Linkout獲取醫(yī)學背景知識免費在線醫(yī)學百科全書56課題2：如何查找英文原文？方法一：可以利用根本檢索57如何查找中文摘譯的英文原文？1.提取文中關(guān)鍵信息發(fā)表日期：2021年7月16日期刊名：AnnalsofInternalMedicine關(guān)鍵詞：colorectalcancer,aspirin2.訪問Pubmed，確定檢索方法根本檢索SingleCitationMatcher58(1)根本檢索方式aspirincolorectalcancer"annalsofinternalmedicine"2021Q:為什么期刊名annalsofinternalmedicine要加雙引號？59獲取原文線索60在摘要頁面點擊“Linkout〞61獲取原文62(2)singlecitationmatcher檢索63PubmedSingleCitationMatcherc檢索提問式：Journal:annalsofinternalmedicineData:2021/07/16TitleWords:aspirin64annalsofinternalmedicine[Jour]and2021/07/16[pdat]andaspirin65Pubmed檢索小結(jié)自動詞語匹配檢索一般適合檢索經(jīng)驗有限的初級用戶，也適合對課題做初步檢索。檢索經(jīng)驗豐富的用戶，或者對查全率查準率有較高要求的檢索課題，需要仔細分析課題，編制