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醫(yī)學(xué)圖像處理信自學(xué)院生醫(yī)系1第六章醫(yī)學(xué)圖像分類6.1醫(yī)學(xué)圖像分類概述6.2單譜圖像分類6.3多譜圖像分類6.4模糊聚類分割26.1醫(yī)學(xué)圖像分類概述圖像分析技術(shù)分類的三種基本范疇低級處理:圖像獲取、預(yù)處理,不需要智能中級處理:圖像分割、表示與描述,需要智能高級處理:圖像識別、解釋,缺少理論,為降低難度,設(shè)計得更專用。3圖像分析技術(shù)分類的三種基本范疇知識庫分割表達(dá)與描述識別與解釋預(yù)處理圖像獲取低級處理高級處理中級處理結(jié)果問題6.1醫(yī)學(xué)圖像分類概述46.1醫(yī)學(xué)圖像分類概述分類:根據(jù)被識別對象的某些特征判明其屬于已知類別中的哪一類。匹配:確定被識別對象和一個已知對象在某個方面是否相同或相似,以及相似的程度。MRI分類:腦灰質(zhì)、腦白質(zhì)、腦脊液、大腦皮層、背景56.2單譜圖像分類6.2.1單譜圖像分類原理6.2.2基于灰度和紋理參數(shù)的組織分類6.2.3基于松弛迭代法的分類66.2.1單譜圖像分類原理單譜圖像:單一模式、單通道的醫(yī)學(xué)圖像。MRI圖像中,腦灰質(zhì)、腦白質(zhì)、腦脊液、大腦皮層、背景五類分布函數(shù)間相互覆蓋,所以不能用簡單的閾值進(jìn)行分類。76.2.1單譜圖像分類原理利用單譜圖像的灰度和某一特征參量進(jìn)行分類,例如:灰度紋理特征二維特征空間86.2.2基于灰度和紋理參數(shù)的組織分類1、選取聚類中心(灰度,紋理參數(shù))的值,N類組織共有N個中心;2、計算被識別象素到各中心的歐式距離,與哪一類中心的距離最近就歸為該類(或用K近鄰法);3、重新計算各類組織的聚類中心值;4、若收斂則對被識別象素進(jìn)行歸類,否則至2繼續(xù)。96.2.2基于灰度和紋理參數(shù)的組織分類
K-近鄰分類法K近鄰分類法(K-NN)是模式識別中一種非常有效的分類器。方法:1、設(shè)有M個類別L1,L2,…,LM,每類有Ni個學(xué)習(xí)樣本,每個學(xué)習(xí)樣本有K個特征值。2、計算被識別的象素與每個學(xué)習(xí)樣本的距離:其中Cj是被識別對象的第j個特征值,Clj是第l個樣本的第j個特征值。106.2.2基于灰度和紋理參數(shù)的組織分類
K-近鄰分類法3、將dl按從小到大的順序排列,并選取前n個距離值;4、分析這n個距離值中各有多少個距離分別屬于L1,L2,…,LM類5、若屬于Li類的距離值最多,則被識別象素屬于Li類。若取n=1來進(jìn)行判斷,則稱為最近鄰法。116.2.3基于松弛迭代法的分類
對邊界處象素的分類,根據(jù)被識別象素的鄰域中各象素的概率迭代更新該象素的概率。算法:1、初始分類:根據(jù)Bayes準(zhǔn)則對各類組織計算初始概率Pi0(λ)(n=0);2、計算相容系數(shù)ri,i+δ(λ,λ’)
;3、根據(jù)8鄰域中的象素概率ri,i+δ(λ,λ’)重新計算Pin+1
(λ);4、重復(fù)(3),直至Pin
(λ)=Pin+1
(λ);5、Pin
(λ)最大則被識別象素屬于λ類。126.3多譜MR圖像分類6.3.1基本概念多譜圖像:同一時間獲取的同一個人相同解剖結(jié)構(gòu)的Pd、T1、T2加權(quán)象。人體不同器官的正常組織與病理組織的T1是相對固定的,而且它們之間有一定的差別,T2也是如此(見下表)。這種組織間弛豫時間上的差別,是MRI的成像基礎(chǔ)。有如CT時,組織間吸收系數(shù)(CT值)差別是CT成像基礎(chǔ)的道理。但MRI不像CT只有一個參數(shù),即吸收系數(shù),而是有T1、T2和自旋核密度(Pd)等幾個參數(shù),其中T1與T2尤為重要。因此,獲得選定層面中各種組織的T1(或T2)值,就可獲得該層面中包括各種組織影像。正常顱腦的T1與T2值(ms)組織T1T2胼胝體38080橋腦44575延髓475100小腦58590大腦600100腦脊液1155145頭皮23560骨髓3208013人體不同組織T1WI和T2WI上的灰度MRI圖像雖然也以不同灰度顯示,但反映的是MR信號強(qiáng)度的不同或弛豫時間T1與T2的長短,而不象CT圖象,灰度反映的是組織密度。MRI圖像如主要反映組織間T1特征參數(shù)時,為T1加權(quán)象(T1weightedimage,T1WI),它反映的是組織間T1的差別。如主要反映組織間T2特征參數(shù)時,則為T2加權(quán)像(T2weightedimage,T2WI)。因此,一個層面可有T1WI和T2WI兩種掃描成像方法。分別獲得T1WI與T2WI有助于顯示正常組織與病變組織。正常組織,如腦神經(jīng)各種軟組織間T1差別明顯,所以T1WI有利于觀察解剖結(jié)構(gòu),而T2WI則對顯示病變組織較好。在T1WI上,脂肪T1短,MR信號強(qiáng),影像白;腦與肌肉T1居中,影像灰;腦脊液T1長;骨與空氣含氫量少,MR信號弱,影像黑。在T2WI上,則與T1WI不同,例如腦脊液T2長,MR信號強(qiáng)而呈白影。14156.3多譜MR圖像分類6.3.2原理1、人工選取初始分類點(diǎn),計算各類組織的均值形成初始聚類中心;2、采用k-近鄰法對象素進(jìn)行分類;3、迭代校正聚類中心(各類組織的均值);4、若收斂,即聚類中心穩(wěn)定,則迭代結(jié)束。加權(quán)距離公式:K=1,2,…,5166.4聚類分割技術(shù)6.4.1C均值聚類6.4.2模糊C均值聚類法6.4.3ISODATA算法176.4.1C均值聚類法186.4.2模糊C均值聚類法一、原理求使代價函數(shù)達(dá)到最小的和象素點(diǎn)的集合(共有n個象素)第j個象素點(diǎn)屬于第k類組織的隸屬度第k類組織的中心灰度第j個象素點(diǎn)的灰度隸屬度的加權(quán)指數(shù),決定模糊程度組織類別數(shù)196.4.2模糊C均值聚類法二、算法步驟(P=1)1、確定C、m及容許誤差εmax
(P=1)2、確定初始聚類中心(P=1)3、計算隸屬度Ujlj=1,…n,l=1,…,C(P=P+1)4、修正Vl(P+1),l=1,…,C206.4.2模糊C均值聚類法二、算法步驟5、計算誤差ε6、若ε<εmax,則算法結(jié)束;否則轉(zhuǎn)向37、算法結(jié)束后對象素進(jìn)行分類
方法一:若ujl
>
ujk
,則Xj歸入l類方法二:若,則Xj歸入l類216.4.2模糊C均值聚類法三、FCM(FuzzyC—mean,模糊C均值)算法總結(jié)
由MR成像設(shè)備獲取的圖像具有內(nèi)在的不確定性或模糊性,這種不確定性的程度依賴于許多因素,如:熱/電噪聲,磁場的不均勻性,生物組織的多樣性,不同個體之間的差異性以及部分容積效應(yīng)(partialvolumeeffect)等。這些因素造成了MR圖像組織之間的混迭,在不同的組織之間難以找到清晰的邊界,這給分割磁共振圖像帶來了很大的困難。經(jīng)典的聚類算法將每一個辨識對象嚴(yán)格地劃分為屬于某一類。但是在實(shí)際上某些對象并不具有嚴(yán)格的屬性,它們可能位于兩類之間,這時采用模糊聚類可以獲得更好的效果。226.4.2模糊C均值聚類法三、FCM(FuzzyC—mean,模糊C均值)算法總結(jié)模糊聚類分析是非監(jiān)督模式識別的主要技術(shù)之一。在各種聚類算法中,模糊C一均值(FCM)聚類算法的應(yīng)用較為廣泛。FCM用于圖像分割時是一種非監(jiān)督模糊聚類過程,應(yīng)用時可以減少人為干預(yù),非常適合于灰度圖像中存在不確定性和模糊性的特點(diǎn),而且對噪聲不太敏感。MR成像設(shè)備獲取的圖像具有內(nèi)在的不確定性或模糊性,因此模糊C一均值(FCM)聚類算法也非常適合于核磁共振圖像。作為一種模糊聚類算法,該算法是通過模糊目標(biāo)函數(shù)的最優(yōu)化來實(shí)現(xiàn)聚類,因而一般要迭代求解。該類算法的特點(diǎn)是賦予每個數(shù)據(jù)點(diǎn)一個用來表明該數(shù)據(jù)點(diǎn)對各個類隸屬程度的概率值,而不是像“硬”聚類那樣,認(rèn)為每點(diǎn)只能屬于某一特定類。236.4.2模糊C均值聚類法模糊c均值聚類算法中m表示模糊隸屬度的加權(quán)指數(shù),m值越大,對應(yīng)劃分的模糊性越強(qiáng)。模糊參數(shù)m可以取大于或等于1的任何值。當(dāng)m=1時,模糊聚類就退化為硬c均值聚類;當(dāng)m→∞時,所有對象聚類的隸屬度傾向于c的倒數(shù)1/c,此時的劃分是最模糊的;m的最佳選擇范圍為[1.5,2.5],通常m=2是比較理想的取值。246.4.3ISODATA算法迭代自組織的數(shù)據(jù)分析算法(ISODATA)是一種動態(tài)聚類,在模式識別領(lǐng)域里的應(yīng)用比較廣泛,它是一種基于樣本間相似性度量的非監(jiān)督學(xué)習(xí)方法。
ISODATA算法在沒有什么先驗(yàn)知識的情況下進(jìn)行分類,是一種無監(jiān)督分類,它是先選擇若干樣本作為聚類中心,再按照最小距離準(zhǔn)則使其余樣本向各中心聚集,從而得到初始聚類,然后判斷初始聚類結(jié)果是否符合要求,若不符,則將聚類集進(jìn)行分裂和合并處理,以獲得新的聚類中心(聚類中心是通過樣本均值的迭代運(yùn)算來決定的),再判斷聚類結(jié)果是否符合要求。如此反復(fù)迭代,直到完成聚類劃分操作。25ISODATA算法基本步驟:(1)設(shè)置聚類分析控制參數(shù);(2)將準(zhǔn)備分類的樣本值讀人;(3)初始化分類,按照與聚類中心距離最小的原則將各樣本分類;(4)類分裂,如果在同一類中樣本分布太過密集或者類的數(shù)目太過少,這說明在這一空間上一定還存在不止一個的集群中心,從而需要將該類進(jìn)行分裂操作,具體來說,就是設(shè)置類內(nèi)各樣本分布標(biāo)準(zhǔn)差上限,如果同類中樣本距離超過此限度將被分裂,否則保留,然后再次轉(zhuǎn)到第二步;(5)類合并,如果兩類相隔太近,說明這兩類中的樣本分類的必要性不充分,根據(jù)一定條件將其合并,具體來說,就是設(shè)置類與類之間的距離下限,如果低于此下限則合并兩類,或者是某一類中的樣本數(shù)目過于少而不足以成為一類時,也可以考慮將該類合并到其他類中去,然后再次轉(zhuǎn)到第二步;(6)如此往復(fù)的進(jìn)行分類、判斷、分裂或合并操作,如果達(dá)到了預(yù)計的分類效果,或者操作次數(shù)已經(jīng)達(dá)到一定數(shù)目,則完成算法。
26第1步:給定以下控制參數(shù):是期望得到的聚類數(shù);是一個聚類中的最少樣本數(shù);是標(biāo)準(zhǔn)偏差參數(shù);是類間合并參數(shù);是每次迭代允許合并的最大聚類對數(shù);是允許迭代的次數(shù)。同時設(shè)定初始聚類數(shù)以及初始聚類中心第2步:按照最近鄰準(zhǔn)則將所有樣本分到各個不同聚類中去,即若,其中,則
。是第個聚類,其中心為。具體算法如下:設(shè)有N個樣本組成的樣本集,27第3步:若有任何一個,其基數(shù)(即屬于該類的樣本個數(shù)),則舍去,并令。第4步:計算各類的參數(shù):(1)聚合中心(2)類內(nèi)平均距離(3)類內(nèi)總平均距離第5步:若是偶數(shù)次迭代或分類數(shù)大于期望分類數(shù)的2倍,轉(zhuǎn)向第8步。
28第6步:對每個聚類,用下列公式求標(biāo)準(zhǔn)偏差式中是第個樣本的第個分量,是第個聚類中心的第個分量。,若大于規(guī)定值且有(1)且類內(nèi)樣本數(shù)或(2)分類數(shù)小于期望分類數(shù)的0.5倍,則將其分裂為兩個新的聚類。
對每一個聚類,求出具有最大標(biāo)準(zhǔn)偏差的分量29第7步:對所有聚類中心,計算兩兩之間的距離將小于指定值的前個從小到大排列,是第1步給定的每次迭代可允許合并的最大聚類對數(shù)。從最小的
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