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文檔簡介
Q/LB.□XXXXX-XXXXT/SASXXXX—XXXX目次TOC\o"1-1"\h\t"標準文件_一級條標題,2,標準文件_二級條標題,3,標準文件_三級條標題,4,標準文件_四級條標題,5,標準文件_五級條標題,6,標準文件_附錄一級條標題,2,標準文件_附錄二級條標題,3,標準文件_附錄三級條標題,4,標準文件_附錄四級條標題,5,標準文件_附錄五級條標題,6,"16025前言 II31695引言 III1范圍 12規(guī)范性引用文件 3術語和定義 4總體流程 25基本原則 36主要內(nèi)容及通用要求 319607附錄A(資料性)樣本信息登記表 723204附錄B(資料性)樣本貼片示意圖及要求 820095附錄C(資料性)上機前儀器日常檢查點確認表 96288附錄D(資料性)樣本收樣確認及存儲登記表 1031343附錄E(資料性)切片質(zhì)量評估登記表 1127953附錄F(資料性)空間代謝組儀器設備性能評估記錄表 122970附錄G(資料性)質(zhì)量控制數(shù)據(jù)分析及評價方法 13前言本文件按照GB/T1.1—2020《標準化工作導則第1部分:標準化文件的結構和起草規(guī)則》的規(guī)定起草。請注意本文件的某些內(nèi)容可能涉及專利。本文件的發(fā)布機構不承擔識別專利的責任。本文件由上海鹿明生物科技有限公司提出。本文件由上海市標準化協(xié)會歸口。本文件起草單位:上海鹿明生物科技有限公司、中國醫(yī)學科學院藥物研究所、沃特世科技(上海)有限公司、維科托(北京)科技有限公司、齊魯工業(yè)大學(山東省科學院)、哈爾濱敷爾佳科技發(fā)展有限公司、北京東方淼森生物科技有限公司、杭州環(huán)特生物科技股份有限公司。本文件主要起草人:胡哲、彭章曉、賀玖明、舒烈波、付艷蕾、陸嘉偉、段光前、季佩佩、袁媛、李明利、胡緒俊、黃建鵬、蘆勤瑋、史俊穩(wěn)、孫成龍、王巍、張立國、王維、任晗堃。本文件首期承諾執(zhí)行單位:上海鹿明生物科技有限公司、中國醫(yī)學科學院藥物研究所、沃特世科技(上海)有限公司、維科托(北京)科技有限公司、齊魯工業(yè)大學(山東省科學院)、哈爾濱敷爾佳科技發(fā)展有限公司、北京東方淼森生物科技有限公司、杭州環(huán)特生物科技股份有限公司。本標準為首次發(fā)布。引言代謝組學技術是一種全面分析和研究生物體代謝網(wǎng)絡的方法,利用高通量分析儀器,如質(zhì)譜儀和核磁共振儀,對機體內(nèi)代謝小分子(分子量<1500D)進行定性和定量研究。隨著質(zhì)譜成像技術的發(fā)展,空間代謝組學應運而生,可應對微空間差異大、異質(zhì)性高的復雜生物組織樣本的分析挑戰(zhàn);它突破了代謝組學常規(guī)技術限制,能實現(xiàn)生物組織樣本中代謝組的高通量定性、定量和定位分析。2022年國際著名學術期刊Nature將空間代謝組學列為未來七大值得關注的技術之一,在生物育種、新藥研發(fā)、腦和類腦科學、臨床精準醫(yī)學、美麗健康科學等戰(zhàn)略前沿領域中均具有廣闊的應用前景??臻g代謝組分析技術是一門新興的高科技技術,尚處在初級應用階段,起到重要規(guī)范作用的技術標準尚未建立。為了推動空間代謝組學技術體系更好地在基礎及應用科學研究和生物醫(yī)藥等焦點領域的產(chǎn)業(yè)化和應用,我們制定了《基于質(zhì)譜成像技術的空間代謝組學通用要求》?!痘谫|(zhì)譜成像技術的空間代謝組學通用要求》是指導基于質(zhì)譜成像的空間代謝組技術從樣本收集、運輸、存儲到樣本制備、上機檢測、質(zhì)量控制、數(shù)據(jù)分析等全流程關鍵步驟的基本原則和通用要求。質(zhì)譜成像技術空間代謝組學應用要求范圍本文件提供了基于質(zhì)譜成像技術的空間代謝組學分析技術的總體流程以及樣本收集、運輸、存儲、制備、儀器調(diào)試和性能評估、數(shù)據(jù)采集、質(zhì)量控制、數(shù)據(jù)處理和分析、分析報告出具等關鍵技術的主要內(nèi)容和通用要求。本文件適用于對人類及動植物來源的新鮮組織、組織冰凍包埋塊或組織冰凍切片等樣本類型進行基于質(zhì)譜成像的空間代謝組學檢測分析。規(guī)范性引用文件下列文件中的內(nèi)容通過文中的規(guī)范性引用而構成本文件必不可少的條款。其中,注日期的引用文件,僅該日期對應的版本適用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本文件。GB/T6041-2020質(zhì)譜分析方法通則GB/T14666-2003分析化學術語GB/T27025-2008檢測和校準實驗室能力的通用要求GB/T27407-2010實驗室質(zhì)量控制利用統(tǒng)計質(zhì)量保證和控制圖技術評價分析測量系統(tǒng)的性能GB/Z27426—2022化學分析實驗室結果有效性監(jiān)控指南GB/T33464-2016化學分析標準操作程序編寫與使用指南術語和定義GB/T14666-2003、GB/T6041-2020、GB/T19000-2016界定的以及下列術語和定義適用于本文件??臻g代謝組學SpatialMetabolomics用于研究生物體內(nèi)代謝物在空間上的分布和變化的技術。它結合了質(zhì)譜成像分析和生物信息處理和可視化,可以揭示代謝物在具有復雜結構生物組織或整體動植物中的空間分布,從而幫助多維度理解生物體內(nèi)代謝的復雜網(wǎng)絡和生物學過程。全譜空間代謝組學GlobalSpatialMetabolomics無偏向性的空間代謝組分析,是對生物體內(nèi)代謝物進行系統(tǒng)全面的空間成像分析,獲取大量代謝物的數(shù)據(jù)并對其處理,從而找出與生物功能相關的差異代謝物的研究方法。靶向空間代謝組學TargetedSpatialMetabolomics具有有偏向性的空間代謝組分析,針對生物體內(nèi)特定的目標代謝物進行空間成像分析,獲取其定量和定位信息,又稱為定量空間代謝組。解吸電噴霧離子化DesorptionElectrosprayIonization(DESI)質(zhì)譜法中一種常用的軟電離技術。能夠在無需復雜樣品前處理的情況下,采用帶電荷的噴霧液滴,將化合物直接從固體表面或溶液中解吸出來,并實現(xiàn)離子化??諝鈩恿o助(解吸電噴霧)離子化AirFlowAssisted(DesorptionElectrospray)Ionization(AFADESI)改良的解吸電噴霧離子化技術,利用空氣流與傳輸管對帶電液滴進行高效收集和遠距離傳輸,帶電液滴在高速氣流和電壓的作用下進一步脫溶劑、富集、離子化,繼而提高檢測靈敏度,同時擴展了待測樣品的空間和操作靈活性。不僅適用于小生物組織樣本,也適合于大體積樣品如整體大鼠切片等的遠距離離子采集和成像分析。質(zhì)譜成像MassSpectrometryImaging(MSI)是一種最新的成像分析技術,它結合了質(zhì)譜分析的高特異性和成像技術的空間信息解析能力,可用于直接獲取樣品表面分子的空間分布信息。組織包埋塊TissueEmbeddingBlocks經(jīng)過專用包埋膠包埋的組織樣本。組織冰凍切片TissueFrozenSection將組織在冷凍狀態(tài)下直接通過切片機切成微米級薄片,黏附于特定玻片上。冰凍切片厚度FrozenSectionThickness組織冰凍切片的厚度,一般為幾微米到幾十微米不等。蘇木精和伊紅染色HematoxylinAndEosinStains(H&Estains)組織病理學中應用最廣泛的染色技術。蘇木精染液呈堿性,能夠?qū)⒓毎藘?nèi)染色質(zhì)與胞漿內(nèi)的核酸染成藍色或紫色,而伊紅染液呈酸性,能夠?qū)⒓毎|(zhì)、細胞外基質(zhì)中的蛋白質(zhì)等染成紅色或粉紅色。通過這種染色方法,可以使組織樣本中的細胞結構和組成清晰可見,從而幫助病理學家和組織學家進行診斷和研究。質(zhì)控樣本QualityControlSample按照標準操作流程制備的樣本,包含被分析物的真實樣品,用于監(jiān)控和保障分析檢測結果的準確度??傮w流程基于質(zhì)譜成像的空間代謝組技術總體流程如圖1所示?;谫|(zhì)譜成像的空間代謝組技術總體流程圖基本原則標準化原則確保實驗操作的標準化和規(guī)范化,從樣本收集、運輸、接收、存儲、切片樣本制備及存儲、儀器調(diào)試及性能評估、數(shù)據(jù)采集、質(zhì)量控制、數(shù)據(jù)處理及分析到出具報告的每一個環(huán)節(jié),都應遵循統(tǒng)一的標準和流程。減少實驗誤差,提高數(shù)據(jù)的準確性和可重復性。科學性原則建立在科學理論和實驗數(shù)據(jù)的基礎上,確保技術的可靠性和有效性。同時,應不斷追蹤新的科研成果和技術進展,對標準進行更新和完善。實用性原則結合實際應用的需求和可行性,避免過于復雜或繁瑣的操作步驟,以提高實驗效率和可操作性。并持續(xù)關注技術的普及和推廣,使更多的研究者及行業(yè)能夠應用這一技術。安全性原則在樣本收集、處理和分析過程中,應確保實驗人員的安全和健康。對于涉及有毒或有害物質(zhì)的樣本,應采取相應的防護措施和操作規(guī)程。同時,應遵守國家相關的倫理規(guī)范,保護參與者的權益和隱私。創(chuàng)新性原則質(zhì)譜成像技術作為一種前沿技術,還在不斷地發(fā)展與升級,在遵循已有標準和規(guī)范的基礎上,鼓勵技術創(chuàng)新和方法優(yōu)化。在遵循現(xiàn)有標準和規(guī)范的基礎上,鼓勵研究者探索和應用新的實驗方法和數(shù)據(jù)處理技術,以提升質(zhì)譜成像的靈敏度和分辨率,從而促進空間代謝組學領域的持續(xù)創(chuàng)新和快速發(fā)展。主要內(nèi)容及通用要求樣本收集及運輸樣本收集是空間代謝組學研究的基礎,樣本質(zhì)量直接關系到后續(xù)質(zhì)譜成像分析的結果和準確性??臻g代謝組樣本類型主要為人源及動植物來源的新鮮樣本或組織冰凍包埋塊樣本,為了保證生物樣本在運輸過程中的安全、完整和可追溯性,針對空間代謝組樣本收集及運輸過程做出以下建議:樣本收集原則樣本收集原則包括:確保樣本的代表性:在收集樣本時,應選擇能充分反映研究對象整體代謝特征的部位和時間點,避免因個體差異、生理狀態(tài)或環(huán)境因素導致的偏差,確保樣本的代表性。完整性:確保樣本在收集過程中不受污染或破壞,保持其原有的組織代謝狀態(tài)。一致性:實驗組和對照組的樣本在取材部位、時間處理等方面應保持一致,以確保實驗結果的準確性和可比性。這有助于減少實驗誤差,提高實驗的可靠性。時效性:快速完成樣本收集,減少代謝物在體外的變化。低溫原則:樣本離體后,應盡快進行低溫處理。分離步驟應在4℃或冰上進行,分離好的樣本應立即存于-80℃冰箱中。低溫保存有助于抑制樣本中的酶活性,防止代謝物的進一步變化。樣本類型針對人類和動物來源的樣本,建議使用新鮮組織樣本、冰凍包埋組織樣本或冰凍組織切片樣本;植物來源的完整樣本、冰凍包埋組織樣本或冰凍切片樣本。樣本取材人類及動物來源新鮮樣本宜取新鮮組織,用濾紙吸干凈多余液體,如血液等,盡可能保證組織無液體殘留,注意不要粘附組織以外的雜質(zhì);且盡量保證組織的完整性,選擇合適容器存儲樣本,避免樣本擠壓變形。植物來源新鮮樣本需保證植株的完整性和鮮活性,取研究部位前用濾紙吸干凈多余液體,盡可能保證組織無液體殘留,注意不要粘附組織以外的雜質(zhì);且盡量保證組織的完整性,選擇合適容器存儲樣本,避免樣本擠壓變形。樣本包埋對于組織樣品,通常需要進行適當?shù)陌窆潭ㄌ幚?,以保持樣品的形態(tài)結構和代謝物的空間分布。由于不同的包埋膠會對質(zhì)譜信號的檢測產(chǎn)生干擾,因此,推薦采用CMC、明膠、Cryo-Gel等對質(zhì)譜檢測影響較小的包埋膠。包埋過程中,需避免氣泡產(chǎn)生,以免影響后續(xù)切片質(zhì)量。樣本標識及打包生物樣本需要在包裝上標注清晰的標識信息,建議填寫樣本信息登記表,包括樣本類型、數(shù)量、收發(fā)單位信息等,以便在運輸過程中進行準確的追蹤和識別,具體可參考附錄A樣本信息登記表。樣本運輸需要采取相應的溫度控制措施,如使用冷藏箱或干冰等。收樣及存儲標識確認生物樣本收到后,需對樣本標識進行核對確認,確保樣本包裝上的標注信息清晰可辨認,且和信息登記表上的信息可對應。樣本狀態(tài)確認確保樣本收到后,組織形態(tài)完整,未受到擠壓變形。樣本存儲標識對于不同樣本,應進行清晰的標識和記錄,包括樣本編號、采樣時間、處理方法等信息,以便后續(xù)的追蹤和分析。樣本存儲確認樣品無誤后,建議立即儲存在樣品室中的-80℃超低溫冰箱,且樣品室的環(huán)境溫度控制在28℃以下,以確保樣本的穩(wěn)定性和保存時間,存儲時間建議在6個月以內(nèi)。存儲過程中,樣本容器要具有良好的密封性能,以防止樣本中代謝物的揮發(fā)和氧化,保持樣本的原始狀態(tài),部分代謝物在光照條件下容易分解,因此樣本存儲時應避光,可以使用遮光袋或避光管進行保護。冰凍切片樣本制備及存儲空間代謝組學的樣品應以能夠保持代謝物的空間分布的方式進行準備,當前主要以組織切片的方式準備,以保持樣品的空間完整性。以下是基于組織包埋塊的空間代謝組學樣本準備主要內(nèi)容和要求:冰凍切片制備對于組織樣品,通常需要進行切片制備,切片厚度通常在幾微米至幾百微米之間,取決于所研究的樣本類型、實驗目的和所需的空間分辨率。切片制備過程包含樣本信息核對、樣本預冷、樣本固定、修片、切片、展片、貼片等步驟,確保當前步驟無問題后方可進行下一步,其中,貼片示意圖及具體要求參見附錄B;切片標記及存儲在玻片書寫區(qū)上標明樣本編號,放入玻片盒,玻片盒上寫上對應編號,制樣日期,做好防止存儲過程中水分進入的密封性措施。實驗條件記錄完成切片樣本制備后,對上述實驗條件、切片樣品制備過程、切片質(zhì)量確認過程和任何可能影響代謝物空間分布的因素進行實驗記錄,以確保實驗的可重復性和結果的可靠性。數(shù)據(jù)采集儀器日常檢查點確認在每次數(shù)據(jù)采集前后,均需對儀器進行日常檢查點確認,并使用質(zhì)量控制樣本進行定期校準,確保數(shù)據(jù)采集的準確性和一致性,日常檢查點確認表參見附錄C。空間分辨率設置根據(jù)樣品的尺寸和所需的空間分辨率設定空間分辨率,通常為10μm~400μm不等,按實驗目的及需求進行設置。質(zhì)譜參數(shù)設置在進行數(shù)據(jù)采集前,根據(jù)實驗的目的(全譜空間代謝組和靶向空間代謝組)、樣品的特性和所需的代謝物信息進行合理的選擇和優(yōu)化。主要包括掃描范圍、質(zhì)量分辨率、掃描速度、重要質(zhì)譜參數(shù)等。數(shù)據(jù)存儲和管理在數(shù)據(jù)采集完成后,將數(shù)據(jù)存儲在指定位置,包括原始數(shù)據(jù)、處理后的數(shù)據(jù)和相關的實驗記錄,以便后續(xù)的數(shù)據(jù)分析和驗證。數(shù)據(jù)處理與分析基于質(zhì)譜成像的空間代謝組學的數(shù)據(jù)處理應包括轉(zhuǎn)格式、峰對齊、峰提取、峰定性、背景篩選、峰篩選、數(shù)據(jù)校準和統(tǒng)計分析,來識別和定量樣品中的代謝物及其空間分布,具體內(nèi)容及要求如下:轉(zhuǎn)格式在進行數(shù)據(jù)分析前需要對下機數(shù)據(jù)進行轉(zhuǎn)格式操作,確保數(shù)據(jù)的兼容性和可比性。推薦采用imzML格式。數(shù)據(jù)預處理使用質(zhì)譜成像數(shù)據(jù)處理程序包中的相關函數(shù),獲取每個像素點的質(zhì)譜數(shù)據(jù)。采用程序包對每個像素點的質(zhì)譜數(shù)據(jù)進行峰提取,并對所有像素點的質(zhì)譜峰進行峰對齊,從質(zhì)譜數(shù)據(jù)中提取出具有代表性特征峰的峰值。峰定性原位質(zhì)譜的代謝物定性首先需要進行數(shù)據(jù)清洗,消除原位裂解、加合離子、同位素峰、分子離子峰的干擾后,再利用空間代謝本地數(shù)據(jù)庫進行峰定性。數(shù)據(jù)標準化在進行數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析前,需要對質(zhì)譜信號的質(zhì)量準確性和穩(wěn)定性進行校準。推薦采用以質(zhì)量控制樣品為基準進行數(shù)據(jù)標準化,并查看質(zhì)量控制樣品的聚攏情況評估是否校準過擬合。統(tǒng)計分析在上述過程完成后,需要進行數(shù)據(jù)的統(tǒng)計分析,包括數(shù)據(jù)的降維聚類分析、多元統(tǒng)計分析、差異比較分析、相關性分析、通路富集分析等。數(shù)據(jù)降維聚類分析對超高維度且具有空間信息的數(shù)據(jù)進行空間收縮質(zhì)心聚類分析,能較好地呈現(xiàn)不同區(qū)域的輪廓,獲取分區(qū)信息,用于后續(xù)選區(qū)參考。數(shù)據(jù)差異比較分析先進行數(shù)據(jù)的多元統(tǒng)計分析,可按VIP值、Pvalue值及FC值等指標篩選差異代謝物,再針對差異代謝物進行相關性分析、通路富集分析等。質(zhì)量控制空間代謝組檢測分析過程中質(zhì)量控制的主要內(nèi)容包括原始樣本質(zhì)量控制、切片樣本質(zhì)量控制、儀器設備性能控制、數(shù)據(jù)質(zhì)量控制。原始樣本質(zhì)量控制的主要內(nèi)容和要求收到原始樣本后,均需對樣本形態(tài)進行檢查,主要通過觀測樣本編號及樣本形態(tài),確保樣本與編號一一對應,樣本形態(tài)完整,未受到擠壓變形,并進行樣本收樣確認及存儲登記,具體可參見附錄D。若樣本不符合原始樣本質(zhì)量控制要求,則需重新收集樣本。切片樣本質(zhì)量控制的主要內(nèi)容和要求在進行空間代謝組實驗前,均需要對切片樣本的質(zhì)量進行評估。主要推薦采用光學成像結合組織染色法對樣本進行完整性評估,確保樣本的質(zhì)量符合實驗要求。推薦通過顯微鏡觀察、組織染色或其他方法進行切片樣品質(zhì)量控制。通常推薦根據(jù)組織類型及研究目標,選擇合適的組織染色方法。切片質(zhì)量評價:通過上述顯微鏡光學成像分析或掃描儀光學成像分析得到的光學成像圖,對樣本的完整性、研究關注的區(qū)域是否可見、質(zhì)核分明程度、切片平整程度、有無損傷、有無氣泡等情況對切片質(zhì)量進行評價,并記錄,切片質(zhì)量評估登記表參見附錄E。儀器設備性能控制的主要內(nèi)容和要求在進行空間代謝組學實驗前,需要對空間代謝組儀器設備進行質(zhì)譜質(zhì)量精度評估、設備靈敏度及檢測動態(tài)范圍評估、設備代謝物檢測范圍及覆蓋度評估、設備檢測穩(wěn)定性評估。主要方法及要求,推薦參考附錄F。數(shù)據(jù)質(zhì)量控制的主要內(nèi)容和要求空間代謝組實驗數(shù)據(jù)采集完畢后,需對數(shù)據(jù)質(zhì)量進行評估,確保實驗結果的準確性、可靠性及可重復性。主要內(nèi)容包括:數(shù)據(jù)完整性檢查:首先,對所有收集到的質(zhì)譜數(shù)據(jù)進行完整性檢查,確保沒有數(shù)據(jù)丟失或損壞。這包括檢查每個像素點的質(zhì)譜數(shù)據(jù)是否完整,以及是否有異常值或噪聲干擾;通過質(zhì)控樣品,并結合數(shù)據(jù)可視化技術,如質(zhì)控樣本箱線圖,展示質(zhì)控樣本數(shù)據(jù)采集時變異情況,具體方法參考附錄G。分析報告分析報告中主要包括材料和方法、數(shù)據(jù)分析與統(tǒng)計、數(shù)據(jù)描述和解釋和數(shù)據(jù)處理方法的詳細描述。材料和方法:展示實驗所用到的材料和方法信息,包括試劑、儀器、切片染色流程、質(zhì)譜成像數(shù)據(jù)采集時移動平臺和質(zhì)譜掃描設定的參數(shù)信息。數(shù)據(jù)分析與統(tǒng)計:報告中需要對數(shù)據(jù)進行詳細的分析和統(tǒng)計,建議包括代謝物的定量和定性分析、成像分析、定量矩陣的降維聚類分析及其可視化、多元統(tǒng)計分析、差異比較分析、相關性分析和通路富集分析等。數(shù)據(jù)分析和統(tǒng)計需要使用統(tǒng)一的方法和工具,以確保結果的可靠性和可重復性。數(shù)據(jù)描述和解釋:實驗數(shù)據(jù)進行詳細的描述和解釋,包括樣品信息、實驗設計、數(shù)據(jù)處理方法、結果展示、重要參數(shù)釋義等。圖表展示:對實驗結果進行展示,包括質(zhì)譜成像圖、降維聚類圖、數(shù)據(jù)分析圖表等。圖表的展示建議參考學術期刊的要求或者團體標準的規(guī)定,包括圖表的格式、標注、字體等方面。
(資料性)
樣本信息登記表附錄A給出了樣本信息登記表示例。項目編號物種樣本類型樣本狀態(tài)□新鮮組織□組織包埋塊□冰凍切片樣本數(shù)量樣本編號樣本名稱保存介質(zhì)(若為組織包埋或冰凍切片塊則填寫,否則空)備注1□CMC□明膠□Cryo-gel□其他()2□CMC□明膠□Cryo-gel□其他()3□CMC□明膠□Cryo-gel□其他()4□CMC□明膠□Cryo-gel□其他()5□CMC□明膠□Cryo-gel□其他()...□CMC□明膠□Cryo-gel□其他()
(資料性)
樣本貼片示意圖及要求附錄B給出了樣本貼片示意圖及要求。樣本貼片示意圖貼片要求質(zhì)控樣本黏附于其他樣本旁邊,宜避免包埋膠區(qū)域不同組別的樣本宜貼在一張玻片上,方便分析比較;貼片范圍距離玻片白邊書寫區(qū)至少1cm;應避免樣本區(qū)域被其他樣本的包埋膠覆蓋污染;包埋膠與包埋膠之間的距離相距2mm左右。
(資料性)
上機前儀器日常檢查點確認表附錄C給出了上機前儀器日常檢查點確認表示例。設備編號設備名稱設備型號日期操作人員序號檢查內(nèi)容檢查方法情況記錄1設備間溫濕度記錄看/記錄2質(zhì)譜真空度檢查確認看/記錄3氣路壓力是否正常看/記錄4真空機械泵的油量是否充足看/記錄5原位離子源幾何位置確認看/記錄6信號及儀表是否靈敏可靠試/看/記錄7原位離子源部分、MS部分是否正常試/看/記錄8其他試/看9101112故障停臺時間記錄123每個項目前將重點事項檢查情況按符號劃入格內(nèi)正常為:√異常為:△待修為:×修好為:○設檢查員簽字:日日期:
(資料性)
樣本收樣確認及存儲登記表附錄C給出了樣本收樣確認及存儲登記表示例。項目編號樣本數(shù)量樣本狀態(tài)□新鮮組織□組織包埋塊□冰凍切片存儲位置樣本編號確認事項判斷備注1樣本是否受到擠壓或變形□是□否2樣本標識是否清晰可見□是□否3樣本數(shù)量是否一致□是□否異常樣本登記編號拍照登記
(資料性)
切片質(zhì)量評估登記表附錄E給出了切片質(zhì)量評估登記表示例。項目編號樣本數(shù)量樣本編號光學成像圖質(zhì)量是否符合備注1□是□否2□是□否3□是□否...異常樣本登記編號異?,F(xiàn)象描述
(資料性)
空間代謝組儀器設備性能評估記錄表附錄F給出了空間代謝組儀器設備性能評估記錄表示例。設備編號設備名稱設備型號日期操作人員序號評估內(nèi)容分析方法情況記錄1設備質(zhì)量準確度評估質(zhì)譜質(zhì)量準確度的計算主要基于質(zhì)譜儀測到的質(zhì)荷比與其實際質(zhì)荷比之間的差值,并將這個差值除以它真實的質(zhì)荷比與1,000,000的乘積。這種計算方式以ppm(百萬分之一)為單位來表示,使得數(shù)值的解讀更為直觀和方便2設備靈敏度和動態(tài)范圍評估通過使用已知的不同濃度梯度的代謝物標準品進行測試,獲得最大和最小信號強度及對應的濃度,靈敏度即最小信號強度對應的濃度,動態(tài)范圍即最小強度與最大強度對應的濃度區(qū)間。3設備代謝物檢測范圍和覆蓋度評估通過統(tǒng)計標準切片樣本鑒定到的代謝物種類和數(shù)量評估設備檢測的范圍和覆蓋度4設備穩(wěn)定性評估短期穩(wěn)定性:通過記錄并計算標準樣本在1-3小時內(nèi)連續(xù)多次檢測的信號及典型離子RSD評估設備的短期穩(wěn)定性;長期穩(wěn)定性:通過記錄并計算標準樣本在7內(nèi)連續(xù)多次檢測的信號及典型離子RSD評估設備的短期穩(wěn)定性;操作人員簽字:日期:
(資料性)
質(zhì)量控制數(shù)據(jù)分析及評價方法質(zhì)量控制數(shù)據(jù)分析方法對QC樣本質(zhì)譜檢測數(shù)據(jù)進行分析,分析流程:a.原始質(zhì)譜下機數(shù)據(jù)格式轉(zhuǎn)化;b.QC樣本切片區(qū)域信息提??;c.各QC樣本質(zhì)譜數(shù)據(jù)進行處理(包括但不限于,質(zhì)量軸校正、峰對齊、峰過濾、峰簡并等操作),得到質(zhì)譜峰離子強度數(shù)據(jù);d.質(zhì)譜峰離子強度數(shù)據(jù)的統(tǒng)計分析;e.統(tǒng)計分析的可視化。數(shù)據(jù)質(zhì)量評價指標數(shù)據(jù)質(zhì)控指標主要分為兩個大類:一是所有QC樣本最終得到的峰的個數(shù)統(tǒng)計,二是所有QC樣本最終得到的共有峰的離子強度(Intensity)的分布情況。指標編碼的格式為LM+大類+小類+序列號。相關分類
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