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1、生物化學(xué),一 蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和生物學(xué)功能,(一)蛋白質(zhì)的概述,蛋白質(zhì)(protein)是最基本的生命物質(zhì)之一。 1、元素組成:平均含N量約16%(特征代表) 2、基本結(jié)構(gòu)單位:氨基酸 3、大?。旱鞍踪|(zhì)是大分子化合物 4、空間結(jié)構(gòu):一級(jí)結(jié)構(gòu)、二級(jí)結(jié)構(gòu)、三級(jí)結(jié)構(gòu)、四級(jí)結(jié)構(gòu) 5、重要性:數(shù)量多、種類多、功能多 6、蛋白質(zhì)的合成:AA順序的遺傳編碼,1.結(jié)構(gòu)通式 -氨基酸,各種氨基酸的區(qū)別在于側(cè)鏈R基的不同。20種基本氨基酸按R的極性可分為非極性氨基酸、極性性氨基酸、酸性氨基酸和堿性氨基酸,(二) 氨基酸,(1)、天然蛋白質(zhì)僅有20種AA、均為- AA (2)、旋光性:、(除甘氨酸沒(méi)有旋光性) (3)、

2、構(gòu)型:D、L(除甘氨酸,天然蛋白質(zhì)的AA均為L(zhǎng)AA)。 (4)、構(gòu)象,人類8種必需AA:(人體體內(nèi)不能自身合成,必須從食物中獲得) 賴、色、甲硫、苯丙、蘇、纈、亮、異亮,2.氨基酸的性質(zhì),3.氨基酸的分類,法一:按R基化學(xué)結(jié)構(gòu)特點(diǎn)分為四大類: 1、脂肪AA(15種) 2、芳得族AA(2種):苯丙氨酸、酪氨酸 3、雜環(huán)族AA(2種):組氨酸、色氨酸 4、雜環(huán)亞AA(1種):脯氨酸,法二:按R基極性分兩類: 極性AA:11種 非極性AA:9種 法三: 1、中性AA(有極性與非極性15種) 2、酸性AA(2種):天冬氨酸、谷氨酸 3、堿性AA(3種):組、賴、精,4.理化性質(zhì),(1)、物理性質(zhì):無(wú)色

3、晶體、有味(甜、鮮、苦)或無(wú)味,不同強(qiáng)度溶于水、稀酸、稀堿,但不溶于任何有機(jī)溶劑,酒精可使AA發(fā)生沉淀。 (2)、光學(xué)性質(zhì):具旋光性,有紫外吸收現(xiàn)象,波長(zhǎng)為280nm,但僅有酪氨酸、色氨酸、苯丙氨酸有此性質(zhì)。 除甘氨酸外,氨基酸均含有一個(gè)手性-碳原子,因此都具有旋光性。比旋光度是氨基酸的重要物理常數(shù)之一,是鑒別各種氨基酸的重要依據(jù)。,(3)、兩性解離:等電點(diǎn)PIAA分子所帶的凈電荷為零(即分子內(nèi)正電負(fù)電)時(shí)溶液的PH值。 PH 1 7 10 凈電荷 +1 0 -1 正離子 兩性離子 負(fù)離子 等電點(diǎn)PI,(三)肽與肽鍵,一個(gè)氨基酸的羧基與另一個(gè)氨基酸的氨基之間失水形成的酰胺鍵稱為肽鍵,所形成的化

4、合物稱為肽。,由兩個(gè)氨基酸組成的肽稱為二肽,由多個(gè)氨基酸組成的肽則稱為多肽。組成多肽的氨基酸單元稱為氨基酸殘基。,1.肽鍵(peptide bond):,肽鍵的特點(diǎn)是氮原子上的孤對(duì)電子與羰基具有明顯的共軛作用。 組成肽鍵的原子處于同一平面。,0.127nm 鍵長(zhǎng)=0.132nm 0.148nm,2.肽鏈中AA的排列順序和命名,在多肽鏈中,氨基酸殘基按一定的順序排列,這種排列順序稱為氨基酸順序。 通常在多肽鏈的一端含有一個(gè)游離的-氨基,稱為氨基端或N-端;在另一端含有一個(gè)游離的-羧基,稱為羧基端或C-端。 氨基酸的順序是從N端的氨基酸殘基開(kāi)始,以C端氨基酸殘基為終點(diǎn)的排列順序。如上述五肽可表示為

5、: Ser-Val-Tyr-Asp-Gln,3.肽的顏色反應(yīng),多肽可與多種化合物作用,產(chǎn)生不同的顏色反應(yīng)。這些顯色反應(yīng),可用于多肽的定性或定量鑒定。 如黃色反應(yīng),是由硝酸與氨基酸的苯基(酪氨酸和苯丙氨酸)反應(yīng)生成二硝基苯衍生物而顯黃色。 多肽的雙縮脲反應(yīng)是多肽特有的顏色反應(yīng);雙縮脲是兩分子的尿素經(jīng)加熱失去一分子NH3而得到的產(chǎn)物。 雙縮脲能夠與堿性硫酸銅作用,產(chǎn)生蘭色的銅-雙縮脲絡(luò)合物,稱為雙縮脲反應(yīng)。含有兩個(gè)以上肽鍵的多肽,具有與雙縮脲相似的結(jié)構(gòu)特點(diǎn),也能發(fā)生雙縮脲反應(yīng),生成紫紅色或藍(lán)紫色絡(luò)合物。這是多肽定量測(cè)定的重要反應(yīng)。,(四)蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu),1.蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu),蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)(Pr

6、imary structure)包括組成蛋白質(zhì)的多肽鏈數(shù)目. 多肽鏈的氨基酸數(shù)目、種類和順序。 以及多肽鏈內(nèi)或鏈間二硫鍵的數(shù)目和位置。 其中最重要的是多肽鏈的氨基酸順序,它是蛋白質(zhì)生物功能的基礎(chǔ)。,2.蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu),蛋白質(zhì)的二級(jí)(Secondary)結(jié)構(gòu)是指多肽鏈的主鏈在空間的排列,或規(guī)則的幾何走向、旋轉(zhuǎn)及折疊。它只涉及肽鏈主鏈的構(gòu)象及鏈內(nèi)或鏈間形成的氫鍵。 主要有-螺旋、-折疊、-轉(zhuǎn)角。,(1)、-螺旋,(1)螺旋走向,穩(wěn)定以氫鍵連接,氫鍵與軸平行。 (2)側(cè)基R伸向螺旋外側(cè)。 (3)棒狀結(jié)構(gòu),高度壓縮,緊密排列。 (4)規(guī)律排列 (5)由1條充分伸展的肽鏈的肽鍵平面折疊成的右手螺旋。 (

7、6)每隔3.6個(gè)氨基酸殘基螺旋上升一圈,螺距0.54nm。 (7)1個(gè)螺圈內(nèi)有13個(gè)原子。,蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)(Tertiary Structure)是指在二級(jí)結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)上,肽鏈的不同區(qū)段的側(cè)鏈基團(tuán)相互作用在空間進(jìn)一步盤繞、折疊形成的包括主鏈和側(cè)鏈構(gòu)象在內(nèi)的特征三維結(jié)構(gòu)。 維系這種特定結(jié)構(gòu)的力主要有氫鍵、疏水鍵、離子鍵和范德華力等。尤其是疏水鍵,在蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)中起著重要作用。,3.蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu),蛋白質(zhì)的四級(jí)結(jié)構(gòu)(Quaternary Structure)是指由多條各自具有一、二、三級(jí)結(jié)構(gòu)的肽鏈通過(guò)非共價(jià)鍵連接起來(lái)的結(jié)構(gòu)形式;各個(gè)亞基在這些蛋白質(zhì)中的空間排列方式及亞基之間的相互作用關(guān)系。 這種蛋

8、白質(zhì)分子中,最小的單位通常稱為亞基或亞單位Subunit,它一般由一條肽鏈構(gòu)成,無(wú)生理活性; 維持亞基之間的化學(xué)鍵主要是疏水力。 由多個(gè)亞基聚集而成的蛋白質(zhì)常常稱為寡聚蛋白;,4.蛋白質(zhì)四級(jí)結(jié)構(gòu),(五)蛋白質(zhì)的性質(zhì),1.蛋白質(zhì)的兩性解離和等電點(diǎn) 蛋白質(zhì)與多肽一樣,能夠發(fā)生兩性離解,也有等電點(diǎn)。在等電點(diǎn)時(shí),蛋白質(zhì)的溶解度最小,在電場(chǎng)中不移動(dòng)。 在電場(chǎng)中,如果蛋白質(zhì)分子所帶正電荷多于負(fù)電荷,凈電荷為正,則向負(fù)電極移動(dòng),反之,凈電荷為負(fù),向正極移動(dòng),這種泳動(dòng)現(xiàn)象稱電泳。 蛋白質(zhì)在等電點(diǎn)PH條件下,不發(fā)生電泳現(xiàn)象,利用蛋白質(zhì)的電泳現(xiàn)象,可以將蛋白質(zhì)的電泳現(xiàn),可以將蛋白質(zhì)進(jìn)行分離純化。,2.這是蛋白質(zhì)特

9、有的性質(zhì)-膠體。 由于蛋白質(zhì)的分子量很大,它在水中能夠形成膠體溶液。蛋白質(zhì)溶液具有膠體溶液的典型性質(zhì),如丁達(dá)爾現(xiàn)象、布郎運(yùn)動(dòng)等。 由于膠體溶液中的蛋白質(zhì)不能通過(guò)半透膜,因此可以應(yīng)用透析法將非蛋白的小分子雜質(zhì)除去,3.蛋白質(zhì)的沉淀作用 蛋白質(zhì)膠體溶液的穩(wěn)定性與它的分子量大小、所帶的電荷和水化作用有關(guān)。 改變?nèi)芤旱臈l件,將影響蛋白質(zhì)的溶解性質(zhì) 在適當(dāng)?shù)臈l件下,蛋白質(zhì)能夠從溶液中沉淀出來(lái)。 蛋白質(zhì)的沉淀分為可逆沉淀和不可逆沉淀。,4.蛋白質(zhì)的變性作用 天然蛋白質(zhì)因受物理或化學(xué)因素的影響,分子構(gòu)象發(fā)生變化,致使蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)和生物學(xué)功能隨之發(fā)生變化,但一級(jí)結(jié)構(gòu)未遭破壞,這種現(xiàn)象稱為變性作用。 變性后

10、的蛋白質(zhì)稱為變性蛋白。 導(dǎo)致蛋白質(zhì)變性的因素:熱、紫外光、激烈的攪拌以及強(qiáng)酸和強(qiáng)堿等。 類型:不可逆變性、可逆變性(可復(fù)性),(六)蛋白質(zhì)的生物學(xué)功能,(1)作為酶,蛋白質(zhì)具有催化功能。 (2)作為結(jié)構(gòu)成分,它規(guī)定和維持細(xì)胞的構(gòu)造。 (3)作為代謝的調(diào)節(jié)者(激素或阻遏物),它能 協(xié)調(diào)和指導(dǎo)細(xì)胞內(nèi)的化學(xué)過(guò)程。 (4)作為運(yùn)輸工具,它能在細(xì)胞內(nèi)或者透過(guò)細(xì)胞 膜傳遞小分子或離子。 (5)作為抗體,它起著保護(hù)有機(jī)體,防御外物入 侵的作用。,二 核酸的結(jié)構(gòu)和生物學(xué)功能,核酸是生物體內(nèi)極其重要的生物大分子,是生命的最基本的物質(zhì)之一。最早是瑞士的化學(xué)家米歇爾于1870年從膿細(xì)胞的核中分離出來(lái)的,由于它們是酸

11、性的,并且最先是從核中分離的,故稱為核酸。核酸的發(fā)現(xiàn)比蛋白質(zhì)晚得多。核酸分為脫氧核糖核酸(簡(jiǎn)稱DNA)和核糖核酸(簡(jiǎn)稱RNA)兩大類,基本結(jié)構(gòu)單位都是核苷酸,(一) 核甘酸,核苷酸是核苷的磷酸酯。作為DNA或RNA結(jié)構(gòu)單元的核苷酸分別是5-磷酸-脫氧核糖核苷和5-磷酸-核糖核苷。,1.核甘,糖與堿基之間的C-N鍵,稱為C-N糖苷鍵,2.組成核甘的戊糖,組成核酸的戊糖有兩種。DNA所含的糖為-D-2-脫氧核糖;RNA所含的糖則為-D-核糖。,腺嘌呤Adenine,鳥(niǎo)嘌呤guanine,尿嘧啶uracil,胞嘧啶cytosine,胸腺嘧啶thymine,3.組成核甘的堿基,(二) 核酸的分子結(jié)構(gòu),

12、1.DNA的分子結(jié)構(gòu),(1)DNA的一級(jí)結(jié)構(gòu) 概念:DNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)是指DNA分子中脫氧核苷酸的排列順序。 不同的DNA分子(或片段)其一級(jí)結(jié)構(gòu)不同,即脫氧核苷酸排列順序不同,也就是堿基排列順序不同。 意義:遺傳信息 基本結(jié)構(gòu)單位:脫氧核糖核苷酸 連接鍵:3,5磷酸二酯鍵 書寫及閱讀方向:從5端到3端,(2)DNA的二級(jí)結(jié)構(gòu) 概念:DNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)是指DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)。,DNA雙螺旋結(jié)構(gòu),DNA分子由兩條DNA單鏈組成。 DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)是分子中兩條DNA單鏈之間基團(tuán)相互識(shí)別和作用的結(jié)果。 雙螺旋結(jié)構(gòu)是DNA二級(jí)結(jié)構(gòu)的最基本形式。,.DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的特點(diǎn),a.DNA分子由兩條多聚脫氧核糖

13、核苷酸鏈(簡(jiǎn)稱DNA單鏈)組成。兩條鏈沿著同一根軸平行盤繞,形成右手雙螺旋結(jié)構(gòu)。螺旋中的兩條鏈方向相反,即其中一條鏈的方向?yàn)?3,而另一條鏈的方向?yàn)?5。,b.嘌呤堿和嘧啶堿基位于螺旋的內(nèi)側(cè),磷酸和脫氧核糖基位于螺旋外側(cè)。堿基環(huán)平面與螺旋軸垂直,糖基環(huán)平面與堿基環(huán)平面成90角 C.螺旋橫截面的直徑約為2 nm,每條鏈相鄰兩個(gè)堿基平面之間的距離為3.4 nm,每10個(gè)核苷酸形成一個(gè)螺旋,其螺矩(即螺旋旋轉(zhuǎn)一圈)高度為34 nm。 d.兩條DNA鏈相互結(jié)合以及形成雙螺旋的力是鏈間的堿基對(duì)所形成的氫鍵。堿基的相互結(jié)合具有嚴(yán)格的配對(duì)規(guī)律,即腺嘌呤(A)與胸腺嘧啶(T)結(jié)合,鳥(niǎo)嘌呤(G)與胞嘧啶(C)結(jié)

14、合,這種配對(duì)關(guān)系,稱為堿基互補(bǔ)。A和T之間形成兩個(gè)氫鍵,G與C之間形成三個(gè)氫鍵。 在DNA分子中,嘌呤堿基的總數(shù)與嘧啶堿基的總數(shù)相等。,(3)核酸的紫外吸收,在核酸分子中,由于嘌呤堿和嘧啶堿具有共軛雙鍵體系,因而具有獨(dú)特的紫外線吸收光譜,一般在260nm左右有最大吸收峰,可以作為核酸及其組份定性和定量測(cè)定的依據(jù),(4)核酸的變性與復(fù)性,A. 核酸的變性 核酸的變性是指核酸雙螺旋區(qū)的多聚核苷酸鏈間的氫鍵斷裂,變成單鏈結(jié)構(gòu)的過(guò)程。變性核酸將失去其部分或全部的生物活性。核酸的變性并不涉及磷酸二酯鍵的斷裂,所以它的一級(jí)結(jié)構(gòu)(堿基順序)保持不變。 能夠引起核酸變性的因素很多。溫度升高、酸堿度改變、甲醛和

15、尿素等的存在均可引起核酸的變性。RNA本身只有局部的雙螺旋區(qū),所以變性行為所引起的性質(zhì)變化沒(méi)有DNA那樣明顯。,利用紫外吸收的變化,可以檢測(cè)核酸變性的情況。 而RNA變性后,約增加1.1%。這種現(xiàn)象稱為增色效應(yīng)。,變性DNA在適當(dāng)?shù)臈l件下,兩條彼此分開(kāi)的單鏈可以重新締合成為雙螺旋結(jié)構(gòu),這一過(guò)程稱為復(fù)性。DNA復(fù)性后,一系列性質(zhì)將得到恢復(fù),但是生物活性一般只能得到部分的恢復(fù)。 DNA復(fù)性的程度、速率與復(fù)性過(guò)程的條件有關(guān)。 將熱變性的DNA驟然冷卻至低溫時(shí),DNA不可能復(fù)性。但是將變性的DNA緩慢冷卻時(shí),可以復(fù)性。分子量越大復(fù)性越難。濃度越大,復(fù)性越容易。此外,DNA的復(fù)性也與它本身的組成和結(jié)構(gòu)有

16、關(guān)。,三 酶的特點(diǎn)及功能,酶是由活細(xì)胞產(chǎn)生的具有催化作用的有機(jī)物, 又叫生物催化劑Biocatalysts 。 絕大多數(shù)的酶都是蛋白質(zhì)(Enzyme)。,(一)酶的作用特點(diǎn),(1)酶和一般催化劑的共性 用量少而催化率高。 它能夠改變化學(xué)反應(yīng)的速度,但是不能改變化學(xué)反應(yīng)平衡。酶本身在反應(yīng)前后也不發(fā)生變化。 酶能夠穩(wěn)定底物形成的過(guò)渡狀態(tài),降低反應(yīng)的活化能,從而加速反應(yīng)的進(jìn)行。,(2)酶作為生物催化劑的特性,A、高效性,B、專一性,C、反應(yīng)條件溫和,D、酶易失活,E、酶活力可調(diào)節(jié)控制,F、某些酶催化活力與輔酶、 輔基及金屬離子有關(guān)。,(二)酶的化學(xué)本質(zhì),通過(guò)對(duì)酶的性質(zhì)、組成和結(jié)構(gòu)等等方面的研究證實(shí),

17、酶是蛋白質(zhì)(也有RNA)。這些酶除了蛋白質(zhì)組分外,還含有對(duì)熱穩(wěn)定的非蛋白的小分子物質(zhì),前者稱酶蛋白,后者稱輔因子。此完整的酶分子稱為全酶(全酶酶蛋白十輔因子)。有的酶的輔因子是金屬離子,有的是小分子有機(jī)化合物。通常將這些小分子有機(jī)化合物稱為輔酶或輔基。,(三)酶的活性中心和必需基團(tuán),酶的活性中心(active center):是指酶分子中與底物直接結(jié)合并使之轉(zhuǎn)變出產(chǎn)物的小區(qū),也稱活性部位(active site)。 酶的活性中心有兩個(gè)功能部位:結(jié)合部位和催化部位。,1結(jié)合部位( Binding site) 酶分子中與底物結(jié)合的部位或區(qū)域一般稱為結(jié)合部位。此部位決定酶的專一性。 2催化部位( c

18、atalytic site ) 酶分子中促使底物發(fā)生化學(xué)變化的部位稱為催化部位。此部位決定酶所催化反應(yīng)的性質(zhì)。,酶的活性中心具有以下特點(diǎn): (1)活性中心是酶分子表面的一個(gè)凹穴,有一定的大小和特殊的構(gòu)象,但它們不是剛性的,在與底物接觸時(shí)表現(xiàn)一定的柔性。 (2)構(gòu)成活性中心的大多數(shù)氨基酸殘基為疏水性,使此小區(qū)形成一個(gè)非極性的微環(huán)境,有利于與底物結(jié)合。 (3)有活性中心,底物以弱鍵與酶結(jié)合。,酶的活性中心的必需基團(tuán)可分為兩種: 一種是與作用物結(jié)合的必需基團(tuán),稱為結(jié)合基團(tuán),它決定酶的專一性; 另一種是促進(jìn)作用物發(fā)生化學(xué)變化的基團(tuán),稱為催化基團(tuán),它決定酶的催化能力。,(四)酶的催化機(jī)理,(1)酶反應(yīng)的

19、過(guò)渡態(tài)學(xué)說(shuō) 1931年Michaelis和Menten假設(shè)酶(E)與底物(S)先形成中間復(fù)合物(ES),再轉(zhuǎn)變成反應(yīng)產(chǎn)物(P),釋放出游離酶: ESESPE 過(guò)渡態(tài)學(xué)說(shuō): E + S = ES = ES* EP E + P 式中:ES為米氏復(fù)合物;ES* 為過(guò)渡態(tài)中間物;EP為酶產(chǎn)物中間物。,鄰近效應(yīng):在酶促反應(yīng)中,由于酶和底物分子之間的親和性,底物分子向酶的活性中心靠近,最終結(jié)合到酶的活性中心,使底物在酶活性中心的有效濃度大大增加的效應(yīng)。 定向效應(yīng):當(dāng)專一性底物向酶活性中心靠近時(shí),會(huì)誘導(dǎo)酶分子構(gòu)象發(fā)生改變,使酶活性中心的相關(guān)基團(tuán)和底物的反應(yīng)基團(tuán)正確定向排列,同時(shí)使反應(yīng)基團(tuán)之間的分子軌道以正確

20、方向嚴(yán)格定位,使酶促反應(yīng)易于進(jìn)行。 以上兩種效應(yīng)使酶具有高效率和專一性特點(diǎn)。,(2)鄰近和定向效應(yīng),(3)誘導(dǎo)楔合學(xué)說(shuō),該學(xué)說(shuō)認(rèn)為酶表面并沒(méi)有一種與底物互補(bǔ)的固定形狀,而只是由于底物的誘導(dǎo)才形成了互補(bǔ)形狀,從而有利于底物折結(jié)合。,(四)影響酶反應(yīng)速度的因素,(1)酶濃度對(duì)酶反應(yīng)速度的影響,E,酶濃度對(duì)反應(yīng)速度的影響,(2)底物濃度與酶促反應(yīng)的關(guān)系,在低底物濃度時(shí), 反應(yīng)速度與底物濃度成正比,表現(xiàn)為一級(jí)反應(yīng)特征。 當(dāng)?shù)孜餄舛冗_(dá)到一定值,反應(yīng)速度達(dá)到最大值(Vmax),此時(shí)再增加底物濃度,反應(yīng)速度不再增加,表現(xiàn)為零級(jí)反應(yīng)。,(3)溫度對(duì)酶反應(yīng)速度的影響,一方面是溫度升高,酶促反應(yīng)速度加快。 另一方

21、面,溫度升高,酶的高級(jí)結(jié)構(gòu)將發(fā)生變化或變性,導(dǎo)致酶活性降低甚至喪失。 因此大多數(shù)酶都有一個(gè)最適溫度。 在最適溫度條件下,反應(yīng)速度最大。,(4)PH值對(duì)酶反應(yīng)速度的影響,在一定的pH 下, 酶具有最大的催化活性,通常稱此pH 為最適 pH,(5)激活劑對(duì)酶反應(yīng)速度的影響,凡能提高酶活性的物質(zhì),都稱為激活劑(activator) (1)無(wú)機(jī)離子:金屬離子(K+ Na+ Mg2+ Zn2+ Fe2+ Ca2+、陰離子(Cl- Br-)、氫離子 (2)中等大小的有機(jī)分子:某些還原劑、乙二胺四乙酸(EDTA) (3)某些酶類:酶原激活過(guò)程中的酶類 原理:a.酶活性中心的必需基團(tuán) b.酶-底絡(luò)合物形成的橋

22、梁 c.作為某些酶的輔助因子 d.保護(hù)-SH酶不被氧化,1、抑制作用與抑制劑 凡使酶的活性降低或喪失,但并不引起酶蛋白變性的作用稱為抑制作用(inhibition)。 能夠引起抑制作用的化合物則稱為抑制劑(inhibitor)。(抑制劑不同于變性劑) 2、抑制作用的類型 (1)不可逆抑制作用(irreversible inhibition) (2)可逆抑制作用(reversible inhibition) ,(1)不可逆抑制作用(irreversibleinhibition) 抑制劑與酶蛋白中的必需基團(tuán)以共價(jià)形式結(jié)合,引起酶的永久性失活,不能用透析或超濾等物理方法除去抑制劑而恢復(fù)酶活性。 專一

23、性不可逆抑制作用:這類抑制劑只作用于與酶活性部位有關(guān)的氨基酸殘基或一類酶。 非專一性不可逆抑制作用:這類抑制劑作用于酶分子上不同的基團(tuán)或作用于幾類不同的酶。如:酰化劑酸酐和磺酰氯等可使酶蛋白的-OH、 SH、NH2等發(fā)生?;?。,(2)可逆抑制作用 (reversibleinhibition) 抑制劑與酶蛋白以非共價(jià)方式結(jié)合,引起酶活性暫時(shí)性喪失。抑制劑可以通過(guò)透析等方法被除去,并且能部分或全部恢復(fù)酶的活性。根椐抑制劑與酶結(jié)合的情況,又可以分為三類: a.競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用 b.非競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用 C.反競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用,四 糖和糖代謝,(一)糖的概況,(二)糖的分類,單糖:甘油醛 、二羥丙酮、戊糖、己

24、糖、庚糖,二糖:蔗糖、乳糖、麥芽糖、纖維二糖,多糖:,同多糖: 淀粉、纖維素、糖原、幾丁質(zhì),糖胺聚糖(透明質(zhì)酸、硫酸角質(zhì)素)、蛋白聚糖,雜多糖:,細(xì)菌多糖(肽聚糖、脂多糖、磷壁酸),糖蛋白:糖肽鍵(N、O型);糖鏈(寡糖鏈,具重要功能),(三)糖代謝,1.糖酵解(EMP途徑),定義:糖酵解是酶將葡萄糖降解為丙酮酸并伴隨ATP生成的過(guò)程。是一切有機(jī)體中普遍存在的葡萄糖降解途徑。 1940年被闡明。(研究歷史) Embden,Meyerhof,Parnas等人貢獻(xiàn)最多,故糖酵解過(guò)程一也叫Embdem-Meyerhof-Parnas途徑,簡(jiǎn)稱EMP途徑。 在細(xì)胞質(zhì)中進(jìn)行,葡萄糖+2Pi+2ADP+2

25、NAD+ 2丙酮酸+2ATP+2NADH+2H+ +2H2O,葡萄糖,6-磷酸-葡萄糖,6-磷酸-果糖,1,6-二磷酸-果糖,磷酸二羥丙酮,3-磷酸-甘油醛,第一階段,1,3-二磷酸甘油酸,3-磷酸甘油酸,2-磷酸甘油酸,磷酸烯醇式丙酮酸,丙酮酸,第二階段,己糖激酶,磷酸葡萄糖異構(gòu)酶,磷酸果糖激酶,醛縮酶,磷酸丙糖異構(gòu)酶,磷酸甘油醛脫氫酶,磷酸甘油酸激酶,磷酸甘油酸變位酶,烯醇化酶,丙酮酸激酶,(2)糖酵解的調(diào)控,細(xì)胞對(duì)酵解速度的調(diào)控是為了滿足細(xì)胞對(duì)能量及碳骨架的需求。 在代謝途徑中,催化不可逆反應(yīng)的酶所處的部位是控制代謝反應(yīng)的有力部位。 糖酵解中有三步反應(yīng)不可逆,分別由己糖激酶、磷酸果糖激酶

26、、丙酮酸激酶催化,因此這三種酶對(duì)酵解速度起調(diào)節(jié)作用。糖酵解的調(diào)控,(3)糖酵解的意義,A、糖酵解是存在一切生物體內(nèi)糖分解代謝的普遍途徑。 B、通過(guò)糖酵解使葡萄糖降解生成ATP,為生命活動(dòng)提供部分能量,尤其對(duì)厭氧生物是獲得能量的主要方式。 C、糖酵解途徑的許多中間產(chǎn)物可作為合成其他物質(zhì)的原料(提供碳骨架), 如磷酸二羥丙酮 甘油。 D、是糖有氧分解的準(zhǔn)備階段。 E、由非糖物質(zhì)轉(zhuǎn)變?yōu)樘堑漠惿緩交緸橹孢^(guò)程。,(4)丙酮酸的去路,A.酵母在無(wú)氧條件下將丙酮酸轉(zhuǎn)化為乙醇和CO2,H+,C2O,丙酮酸脫羧酶 TPP,NADH+H+,NAD+,乙醇脫氫酶,丙酮酸,乙醛,乙醇,由葡萄糖轉(zhuǎn)變?yōu)橐掖嫉倪^(guò)程稱

27、為酒精發(fā)酵: 葡萄糖+2Pi+2ADP+2H+ 2乙醇+2C2O+2ATP+2H2O,O H H C O- C O H C OH C O CH3 CH3 CH3,O O C O- +NADH+H+ C O- +NAD+ C O HO C H CH3 CH3,丙酮酸,L-乳酸,乳酸脫氫酶,葡萄糖+2Pi+2ADP 2乳酸+2ATP+2H2O,B.動(dòng)物在激烈運(yùn)動(dòng)時(shí)或由于呼吸、循環(huán)系統(tǒng)障礙而發(fā)生供氧不足時(shí)。 生長(zhǎng)在厭氧或相對(duì)厭氧條件下的許多細(xì)菌。,C.在有氧條件下,丙酮酸進(jìn)入線粒體生成乙酰CoA,參加TCA循環(huán)(檸檬酸循環(huán)),被徹底氧化成CO2和H2O。 D.轉(zhuǎn)化為脂肪酸或酮體。當(dāng)細(xì)胞ATP水平較高

28、時(shí),檸檬酸循環(huán)的速率下降,乙酰CoA開(kāi)始積累,可用作脂肪的合成或酮體的合成。,2.三羧酸循環(huán)(TCA循 環(huán)),概念:在有氧的情況下,葡萄糖酵解產(chǎn)生的丙酮酸氧化脫羧形成乙酰CoA。乙酰CoA經(jīng)一系列氧化、脫羧,最終生成C2O和H2O并產(chǎn)生能量的過(guò)程,稱為檸檬酸循環(huán),亦稱為三羧酸循環(huán)(tricarboxylic acid cycle), 簡(jiǎn)稱TCA循環(huán)。由于它是由H.A.Krebs(德國(guó))正式提出的,所以又稱Krebs循環(huán)。,三羧酸循環(huán)在線粒體基質(zhì)中進(jìn)行,(1)由丙酮酸形成乙酰CoA,丙酮酸進(jìn)入線粒體轉(zhuǎn)變?yōu)橐阴oA,這是連接糖酵解和三羧酸循環(huán)的紐帶: 丙酮酸+CoA+NAD+ 乙酰CoA+ C2

29、O+NADH+H+ 反應(yīng)不可逆,分5步進(jìn)行,由丙酮酸脫氫酶復(fù)合體催化。 丙酮酸脫氫酶復(fù)合體是一個(gè)十分大的多酶復(fù)合體,包括丙酮酸脫氫酶E1、二氫硫辛酸乙酰轉(zhuǎn)移酶E2、二氫硫辛酸脫氫酶E3三種不同的酶及焦磷酸硫胺素(TPP)、硫辛酸,F(xiàn)AD, NAD+,CoA 及Mg2+六種輔助因子組裝而成。,由丙酮酸到乙酰CoA是一個(gè)重要步驟,處于代謝途徑的分支點(diǎn),所以此體系受到嚴(yán)密的調(diào)節(jié)控制: 1、產(chǎn)物抑制:乙酰CoA抑制乙酰轉(zhuǎn)移酶E2組分,NADH抑制二氫硫辛酸脫氫酶E3組分。抑制效應(yīng)被CoA和NAD+逆轉(zhuǎn)。 2、核苷酸反饋調(diào)節(jié):丙酮酸脫氫酶E1受GTP抑制,被AMP活化。 3、砷化物與E2中的輔基硫辛酰胺

30、形成無(wú)催化能力的砷化物。 4、可逆磷酸化作用的調(diào)節(jié):丙酮酸脫氫酶E1的磷酸化狀態(tài)無(wú)活性,反之有活性。 5、Ca2+激活,丙酮酸氧化脫羧的調(diào)控,(2)TCA循環(huán)的過(guò)程,三羧酸循環(huán)的總反應(yīng)式為: 乙酰CoA+3NAD+FAD+GDP+Pi+2H2O 2CO2+3NADH+FADH2+GTP+CoA+2H+ 循環(huán)有以下特點(diǎn): 1、乙酰CoA與草酰乙酸縮合形成檸檬酸,使兩個(gè)C原子進(jìn)入循環(huán)。在以后的兩步脫羧反應(yīng)中,有兩個(gè)C原子以CO2的形式離開(kāi)循環(huán),相當(dāng)于乙酰CoA的2個(gè)C原子形成CO2。 2、在循環(huán)中有4對(duì)H原子通過(guò)4步氧化反應(yīng)脫下,其中3對(duì)用以還原NAD+生成3個(gè)NADH+H+,1對(duì)用以還原FAD,

31、生成1個(gè)FADH2。,3、由琥珀酰CoA形成琥珀酸時(shí),偶聯(lián)有底物水平磷酸化生成1個(gè)GTP, 1GTP 1ATP。 4、循環(huán)中消耗兩分子水。 5、3NADH 9 ATP , 1FADH2 2 ATP,再加上1個(gè)GTP。 6、單向進(jìn)行。 7、整個(gè)循環(huán)不需要氧,但離開(kāi)氧無(wú)法進(jìn)行。 1分子乙酰CoA通過(guò)TCA循環(huán)被氧化,可生成12分子ATP。,(3)三羧酸循環(huán)的化學(xué)計(jì)量,(4)三羧酸循環(huán)的回補(bǔ)反應(yīng),三羧酸循環(huán)不僅是產(chǎn)生ATP的途徑,它的中間產(chǎn)物也是生物合成的前體, -酮戊二酸 谷氨酸 草酰乙酸 天冬氨酸 琥珀酰CoA 卟啉環(huán) 上述過(guò)程均可導(dǎo)致草酰乙酸濃度下降,從而影響三羧酸循環(huán)的運(yùn)轉(zhuǎn),因此必須不斷補(bǔ)充

32、才能維持其正常進(jìn)行,這種補(bǔ)充稱為回補(bǔ)反應(yīng)(anaplerotic reaction)。,B、PEP羧化(在植物、酵母、細(xì)菌),A、丙酮酸羧化(動(dòng)物體內(nèi)的主要回補(bǔ)反應(yīng)),五 生物氧化,(1)生物氧化概述,一切生命活動(dòng)都需要能量,維持生命活動(dòng)的能量主要有兩個(gè)來(lái)源: 光能(太陽(yáng)能):光合自養(yǎng)生物通過(guò)光合作用將光能轉(zhuǎn)變成有機(jī)物中穩(wěn)定的化學(xué)能。 化學(xué)能:異養(yǎng)生物或非光合組織通過(guò)生物氧化作用將有機(jī)物質(zhì)(主要是各種光合作用產(chǎn)物)氧化分解,使存儲(chǔ)的穩(wěn)定的化學(xué)能轉(zhuǎn)變成ATP中活躍的化學(xué)能,ATP直接用于需要能量的各種生命活動(dòng)。,1.概念 有機(jī)物質(zhì)(糖、脂肪和蛋白質(zhì))在生物細(xì)胞內(nèi)進(jìn)行氧化分解而生成CO2和H2O并

33、釋放出能量的過(guò)程稱為生物氧化。生物氧化通常需要消耗氧,所以又稱為呼吸作用。,(1)細(xì)胞如何在酶的催化下將有機(jī)化合物中的C變成CO2CO2如何形成? 脫羧反應(yīng) (2)在酶的作用下細(xì)胞怎樣利用分子氧將有機(jī)化合物中的H氧化成H2OH2O如何形成? 電子傳遞鏈 (3)當(dāng)有機(jī)物被氧化成CO2和H2O時(shí),釋放的能量怎樣轉(zhuǎn)化成ATP能量如何產(chǎn)生? 底物水平磷酸化 氧化磷酸化,2、生物氧化的特點(diǎn),生物氧化和有機(jī)物在體外氧化(燃燒)的實(shí)質(zhì)相同,都是脫氫、失電子或與氧結(jié)合,消耗氧氣,都生成CO2和H2O,所釋放的能量也相同。但二者進(jìn)行的方式和歷程卻不同: 細(xì)胞內(nèi)溫和條件 高溫或高壓、干燥條件 (常溫、常壓、中性p

34、H、水溶液) 一系列酶促反應(yīng) 無(wú)機(jī)催化劑 逐步氧化放能,能量利用率高 能量爆發(fā)釋放 釋放的能量轉(zhuǎn)化成ATP被利用 轉(zhuǎn)換為光和熱,散失,生物氧化 體外燃燒,(二)電子傳遞鏈,1.概念 需氧細(xì)胞內(nèi)糖、脂肪、氨基酸等通過(guò)各自的分解途徑所形成的還原性輔酶,包括NADH和FADH2通過(guò)電子傳遞途徑被重新氧化。 在生物氧化過(guò)程中,還原型輔酶上的氫原子以質(zhì)子的形式脫下,其電子沿一系列按一定順序排列的電子傳遞體轉(zhuǎn)移,最后轉(zhuǎn)移給分子氧并生成水,這個(gè)電子傳遞體系稱為電子傳遞鏈。由于消耗氧,故也叫呼吸鏈。 電子傳遞鏈在原核生物存在于質(zhì)膜上,在真核細(xì)胞存在于線粒體內(nèi)膜上。,2.呼吸鏈的組成,呼吸鏈由一系列的氫傳遞體和

35、電子傳遞體組成。包括: NADH-Q還原酶、琥珀酸-Q還原酶、細(xì)胞色素還原酶、細(xì)胞色素氧化酶。,NADH,NADH-Q 還原酶,Q,細(xì)胞色素 還原酶,細(xì)胞 色素C,細(xì)胞色素 氧化酶,O2,琥珀酸-Q還原酶,FADH2,3.呼吸鏈的電子傳遞順序,呼吸鏈的各組分在線粒體內(nèi)膜上是按一定順序排列的,在線粒體內(nèi)膜上主要有兩條呼吸鏈:,FMN Fe-S,Cytb Fe-S cytc1,cytaa3,Fe-S FADH2,NADH+H+,CoQ,cytc,O2,琥珀酸,ADP+Pi,ADP+Pi,ADP+Pi,ATP,ATP,ATP,呼吸鏈的電子傳遞抑制劑圖示 NADH NADH-Q還原酶 被魚藤酮、安密妥

36、、殺蝶素A抑制 CoQ cytb 被抗霉素A抑制 cytc1 cytc cytaa3 被氰化物、一氧化碳、硫化氫、疊氮化合物抑制 O2,(三)氧化磷酸化,1、概念,生物體內(nèi)高能磷酸化合物ATP的生成主要由三種方式: 氧化磷酸化 底物水平磷酸化 光合磷酸化,(1)氧化磷酸化,是與電子傳遞過(guò)程偶聯(lián)的磷酸化過(guò)程。即伴隨電子從底物到O2的傳遞,ADP被磷酸化生成ATP的酶促過(guò)程,這種氧化與磷酸化相偶聯(lián)的作用稱為氧化磷酸化。 這是需氧生物合成ATP的主要途徑。 真核生物的電子傳遞和氧化磷酸化均在線粒體內(nèi)膜上進(jìn)行。原核生物則在質(zhì)膜上進(jìn)行。,底物水平磷酸化指ATP的形成直接與一個(gè)代謝中間物(PEP)上的磷酸基團(tuán)轉(zhuǎn)移相偶聯(lián)的作用。,特點(diǎn):ATP的形成直接與中間代謝物進(jìn)行的反應(yīng)相偶聯(lián);在有O2或無(wú)O2條件下均可發(fā)生底物水平的磷酸化。,(2)底物水平磷酸化,(四)氧化磷酸化作用的機(jī)理,1、有關(guān)氧化磷酸化機(jī)理的幾種假說(shuō) 化學(xué)偶聯(lián)假說(shuō) 構(gòu)象偶聯(lián)假說(shuō) 化學(xué)滲透假說(shuō),(1)化學(xué)偶聯(lián)假說(shuō)(1953年)(掌握要點(diǎn)) 認(rèn)為電子傳遞反應(yīng)釋放的能量

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