《結(jié)構(gòu)化學(xué)選讀》PPT課件.ppt

結(jié)構(gòu)化學(xué)選讀,課程基本目的,生物大分子結(jié)構(gòu)與生物分子識別的基本原理 研究生物大分子結(jié)構(gòu)與識別的生物物理化學(xué)方法 生物大分子結(jié)構(gòu)與生物分子識別研究進(jìn)展,課程主要內(nèi)容,1、蛋白質(zhì)及核酸結(jié)構(gòu)原理 2、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測方法 3、蛋白質(zhì)折疊研究 4、用于蛋白質(zhì)、核酸構(gòu)象研究的光譜學(xué)方法 （紫外、熒光、圓二色光譜等） 5、生物分子識別研究的物理化學(xué)方法 （等溫滴定量熱，超速離心等） 6、 生物大分子結(jié)構(gòu)測定 7、蛋白質(zhì)及藥物分子設(shè)計,蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分類： 球蛋白（水溶性蛋白） 膜蛋白 纖維蛋白,蛋白質(zhì)功能分類,催化功能 運(yùn)輸功能 營養(yǎng)和貯存功能 收縮和運(yùn)動功能 結(jié)構(gòu)功能 防御功能 調(diào)控功能 其它,蛋白質(zhì)折疊問題,蛋白質(zhì)序列、結(jié)構(gòu)、功能,序列,結(jié)構(gòu),功能,有關(guān)的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫,蛋白質(zhì)晶體結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫 Brookhaven PDB (生物信息服務(wù)器） RCSB-PDB （) 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分類庫 SCOP CATH PDBSUM,一級結(jié)構(gòu) 二級結(jié)構(gòu) 三級結(jié)構(gòu) 四級結(jié)構(gòu),蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu),20種氨基酸殘基由肽鍵相連成的序列 AGPFSCHEDSGPFCSFPGA?,蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)原理 1、20種標(biāo)準(zhǔn)氨基酸 疏水性Ala Val Leu Ile Phe Pro Met 帶電：Arg Lys Asp Glu (His) 極性：Ser Thr Cys Asn Gln His Tyr Trp 特殊：Gly (Pro) 2、多肽鏈狀結(jié)構(gòu) 3、二硫鍵 CYS-S-H + H-S-CYS CYS-S-S-CYS,20種標(biāo)準(zhǔn)氨基酸 疏水性Ala Val Leu Ile Phe Pro Met 帶電：Arg Lys Asp Glu (His) 極性：Ser Thr Cys Asn Gln His Tyr Trp 特殊：Gly (Pro),氨基酸的穩(wěn)定性與后修飾,Cys, Met Asn Ser, Thr, Tyr Gly Pro,His0.360 Cys0.210 Ser0.130 Lys0.100 Thr0.100 Asn0.080 Arg0.055 Gln0.050 Glu0.050 Asp0.045 Ala0.025 Met0.025,Ile-0.005 Tyr-0.040 Val-0.060 Gly-0.070 Phe-0