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文檔簡(jiǎn)介

1、第2章 染色體與DNA名詞解釋原癌基因:細(xì)胞內(nèi)與細(xì)胞增殖相關(guān)的正?;?,是維持機(jī)體正常生命活動(dòng)所必須的,在進(jìn)化上高等保守。 當(dāng)原癌基因的結(jié)構(gòu)或調(diào)控區(qū)發(fā)生變異,基因產(chǎn)物增多或活性增強(qiáng)時(shí),使細(xì)胞過(guò)度增殖,從而形成腫瘤。半保留復(fù)制:以親代DNA雙鏈為模板以堿基互補(bǔ)方式合成子代DNA,這樣新形成的子代DNA中,一條鏈來(lái)自親代DNA,而另一條鏈則是新合成的,這種復(fù)制方式叫半保留復(fù)制。填空題3.在聚合酶鏈反應(yīng)中,除了需要模板DNA外,還需加入引物、DNA聚合酶、dNTP和鎂離子。4.引起DNA損傷的因素有自發(fā)因素、物理因素、化學(xué)因素。5.DNA復(fù)制時(shí)與DNA解鏈有關(guān)的酶和蛋白質(zhì)有拓?fù)洚悩?gòu)酶、解螺旋酶、單鏈

2、DNA結(jié)合蛋白。6.參與DNA切除修復(fù)的酶有DNA聚合酶、DNA連接酶、特異的核酸內(nèi)切酶。7.在真核生物中DNA復(fù)制的主要酶是DNA聚合酶。在原核生物中是DNA聚合酶。8.端粒酶是端粒酶是含一段RNA的逆轉(zhuǎn)錄酶。9.DNA的修復(fù)方式有錯(cuò)配修復(fù)、堿基切除修復(fù)、核苷酸切除修復(fù)、DNA的直接修復(fù)。簡(jiǎn)述DNA復(fù)制的過(guò)程 DNA的復(fù)制過(guò)程可被分為3個(gè)階段,即復(fù)制的起始、延伸和終止。每個(gè)DNA復(fù)制的獨(dú)立單元主要包括復(fù)制起始位點(diǎn)和終止位點(diǎn)。 DNA復(fù)制的起始包括預(yù)引發(fā)和引發(fā)兩個(gè)階段。在預(yù)引發(fā)階段,DNA解旋解鏈,形成復(fù)制叉,引發(fā)體組裝;在引發(fā)階段,在引發(fā)酶的催化下以DNA鏈為模板合成一段短的RNA引物。復(fù)制

3、時(shí)DNA鏈的延伸由DNA聚合酶催化,以親代DNA鏈為模板,引發(fā)體移動(dòng),從53方向聚合子代DNA鏈。當(dāng)子鏈延伸到達(dá)終止位點(diǎn)是,DNA復(fù)制就終止了,切除RNA引物,填補(bǔ)缺口,在DNA連接酶的催化下將相鄰的岡崎片段連接起來(lái)形成完整的DNA長(zhǎng)鏈。試述真原核生物的DNA復(fù)制的特點(diǎn)的不同之處真核生物染色體有多個(gè)復(fù)制起點(diǎn),多復(fù)制眼,呈雙向復(fù)制,多復(fù)制子。原核生物的染色體只有一個(gè)復(fù)制起點(diǎn),單復(fù)制子也呈雙向復(fù)制。 真核生物岡崎片段長(zhǎng)約200bp比原核生物略短。真核生物DNA復(fù)制速度比原核慢,速度為10003000bp/min(僅為原核生物的1/201/50)。 真核生物復(fù)制的終止在端粒處,原核生物的復(fù)制叉相遇時(shí)

4、即終止。真核生物染色體在全部復(fù)制完之前起點(diǎn)不再重新開(kāi)始復(fù)制;而在快速生長(zhǎng)的原核生物染色體DNA復(fù)制中,起點(diǎn)可以連續(xù)發(fā)動(dòng)復(fù)制。真核生物快速生長(zhǎng)時(shí),往往采用更多的復(fù)制起點(diǎn)。 真核生物有多種DNA聚合酶,DNA聚合酶是真正的復(fù)制酶,在PCNA存在下有持續(xù)的合成能力。PCNA稱為增殖細(xì)胞核抗原,相當(dāng)于大腸桿菌DNA聚合酶的-夾子,RFC蛋白相當(dāng)于夾子裝配器。原核生物的DNA聚合酶有三種DNA聚合酶DNA的真正復(fù)制酶:多亞基酶,含十種亞基,該酶DNA合成的持續(xù)能力強(qiáng)。真核生物線性染色體兩端有端粒結(jié)構(gòu),它是由許多成串的重短復(fù)序列組成,端粒功能是穩(wěn)定染色體末段結(jié)構(gòu),防止染色體間的末端連接,并可補(bǔ)償滯后鏈5-

5、末段在消除RNA引物后造成的空缺,使染色體保持一定長(zhǎng)度。端粒酶是含一段RNA的逆轉(zhuǎn)錄酶。RPA:真核生物的單鏈結(jié)合蛋白;RNaseH1和MF-1切除RNA引物,DNA聚合酶填補(bǔ)缺口。簡(jiǎn)述半保留復(fù)制的生物學(xué)意義DNA的復(fù)制過(guò)程(以大腸桿菌為例)復(fù)制起始:(1)、拓?fù)洚悩?gòu)酶解開(kāi)超螺旋。(2)、Dna A蛋白識(shí)別并在ATP存在下結(jié)合于四個(gè)9bp的重復(fù)序列。(3)、在類組蛋白(HU、ATP參與下, Dan A蛋白變性13個(gè)bp的重復(fù)序列,形成開(kāi)鏈復(fù)合物。(4) 、Dna B借助于水解ATP產(chǎn)生的能量在Dna C的幫助下沿5 3 方向移動(dòng),解開(kāi)DNA雙鏈,形成前引發(fā)復(fù)合物。(5)、單鏈結(jié)合蛋白結(jié)合于單鏈

6、。(6)、引物合成酶(Dna G蛋白)開(kāi)始合成RNA引物。 鏈的延長(zhǎng)(岡崎片段的合成):在DNA聚合酶的催化下,以四種5 -脫氧核苷三磷酸為底物,在RNA引物的3端以磷酸二酯鍵連接上脫氧核糖核苷酸并釋放出焦磷酸。DNA鏈的延伸同時(shí)進(jìn)行前導(dǎo)鏈和滯后鏈的合成。兩條鏈方向相反。6、PCR的基本原理?PCR是在試管中進(jìn)行的DNA復(fù)制反應(yīng),基本原理是依據(jù)細(xì)胞內(nèi)DNA半保留復(fù)制的機(jī)理,以及體外DNA分子于不同溫度下雙鏈和單鏈可以互相轉(zhuǎn)變的性質(zhì),人為地控制體外合成系統(tǒng)的溫度,以促使雙鏈DNA變成單鏈,單鏈DNA與人工合成的引物退火,然后耐熱DNA聚合酶以dNTP為原料使引物沿著單鏈模板延伸為雙鏈DNA。PC

7、R全過(guò)程每一步的轉(zhuǎn)換是通過(guò)溫度的改變來(lái)控制的。需要重復(fù)進(jìn)行DNA模板解鏈、引物與模板DNA結(jié)合、DNA聚合酶催化新生DNA的合成,即高溫變性、低溫退火、中溫延伸個(gè)步驟構(gòu)成PCR反應(yīng)的一個(gè)循環(huán),此循環(huán)的反復(fù)進(jìn)行,就可使目的DNA得以迅速擴(kuò)增。DNA模板變性:模板雙鏈DNA?單鏈DNA,94。退火:引物單鏈DNA?雜交鏈,引物的Tm值。引物的延伸:溫度至70 左右, Taq DNA聚合酶以種dNTP為原料,以目的DNA為模板,催化以引物末端為起點(diǎn)的53DNA鏈延伸反應(yīng),形成新生DNA鏈。新合成的引物延伸鏈經(jīng)過(guò)變性后又可作為下一輪循環(huán)反應(yīng)的模板PCR,就是如此反復(fù)循環(huán),使目的DNA得到高效快速擴(kuò)增。

8、第三章啟動(dòng)子:是一段位于結(jié)構(gòu)基因5,端上游區(qū)的DNA序列,能活化RNA聚合酶,使之與模板DNA準(zhǔn)確地相結(jié)合并具有轉(zhuǎn)錄起始的特異性。指RNA聚合酶識(shí)別、結(jié)合和開(kāi)始轉(zhuǎn)錄的一段特定的DNA序列。增強(qiáng)子:能強(qiáng)化轉(zhuǎn)錄起始的序列稱為增強(qiáng)子。轉(zhuǎn)錄:以DNA為模板,按照堿基配對(duì)原則合成RNA,即將DNA所含的遺傳信息傳給RNA,形成一條與DNA鏈互補(bǔ)的RNA的過(guò)程。RNA的編輯:是某些RNA,特別是mRNA的一種加工方式,它導(dǎo)致了DNA所編碼的遺傳信息的改變。外顯子(Exon) :真核細(xì)胞基因DNA中的編碼序 列,這些序列被轉(zhuǎn)錄成RNA并進(jìn)而翻譯為蛋白質(zhì)。內(nèi)含子(Intron) :真核細(xì)胞基因DNA中的間插序

9、列,這些序列被轉(zhuǎn)錄成RNA,但隨即被剪除而不翻譯。 復(fù)制子:生物體的復(fù)制單位稱為復(fù)制子(replicon) ,是在同一個(gè)復(fù)制起點(diǎn)控制下的一段DNA序列。轉(zhuǎn)錄單元:是一段啟動(dòng)子開(kāi)始至終止子結(jié)束的DNA序列。轉(zhuǎn)錄起點(diǎn):是與新生RNA鏈的第一個(gè)核苷酸相對(duì)應(yīng)的DNA鏈上的堿基,通常為一個(gè)嘌呤。轉(zhuǎn)錄開(kāi)始時(shí)模板上的第一個(gè)堿基,在原核中常為A或G,而且位置固定。填空1轉(zhuǎn)錄的基本過(guò)程包括:模板識(shí)別,轉(zhuǎn)錄起始,轉(zhuǎn)錄的延伸,轉(zhuǎn)錄的終止。2基因表達(dá)包括:轉(zhuǎn)錄和翻譯 兩個(gè)階段。3RNA的編輯方式:堿基突變,尿甘酸的缺失和添加。4在原核生物中,-35區(qū)與-10區(qū)之間的距離大約是1619bp5帽子結(jié)構(gòu)的功能:1在翻譯中起

10、識(shí)別作用2使mRNA免遭核苷酸的破壞6原核生物只有一種RNA聚合酶而真核生物有三種,每一種都有其特定的功能。聚合酶合成rRNA,聚合酶合成mRNA,聚合酶合成tRNA和5s rRNA。三種聚合酶都是具有多亞基的大的蛋白復(fù)合體。7 轉(zhuǎn)錄因子通常具有兩個(gè)獨(dú)立的結(jié)構(gòu)域:一個(gè)結(jié)合DNA,一個(gè)激活轉(zhuǎn)錄。8 在真核細(xì)胞mRNA的修飾中,“帽子”結(jié)構(gòu)由甲基組成,“尾”由多聚腺嘌呤組成。9原核生物的絕大部分起啟動(dòng)子都存在共同的序列,即位于-10bp處的 區(qū)和-35bp處的 區(qū),他們都是RNA聚合酶與啟動(dòng)子結(jié)合的位點(diǎn),能與因子相互識(shí)別而具高度親和性。真核生物中,在轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游-25-35bp處有 區(qū)和位于-

11、70-80bp處 的 區(qū)。簡(jiǎn)答題1增強(qiáng)子的特點(diǎn)1有遠(yuǎn)距離效應(yīng)2無(wú)方向性3順勢(shì)調(diào)節(jié)4無(wú)物種和基因的特異性5具有組織的特異性6有相位性,其作用與DNA的構(gòu)象有關(guān)7有的增強(qiáng)子可以對(duì)外部信號(hào)產(chǎn)生反應(yīng)。2比較DNA復(fù)制和轉(zhuǎn)錄的異同點(diǎn)相同點(diǎn):都以DNA鏈作為模板,合成方向均為5,端到3,端,聚合反應(yīng)均遵循堿基配對(duì)原則,通過(guò)核苷酸之間形成的3,5,磷酸二酯鍵使核苷酸鍵延長(zhǎng)。不同點(diǎn):復(fù)制轉(zhuǎn)錄模板兩條鏈均被復(fù)制模板鏈轉(zhuǎn)錄(不對(duì)稱轉(zhuǎn)錄)原料DntpNTP酶DNA聚合酶RNA聚合酶產(chǎn)物子代雙鏈DNA(半保留復(fù)制)mRNA tRNA rRNA配對(duì)方式A-T G-CA-U A-T G-C引物RNA引物不需要引物DNA復(fù)

12、制與轉(zhuǎn)錄的異同相同點(diǎn): 都需要模板 都以三磷酸核苷酸為底物(NTP或dNTP) 合成方向都是53不同點(diǎn)轉(zhuǎn)錄不需引物;只轉(zhuǎn)錄DNA分子中的一個(gè)片段(稱為轉(zhuǎn)錄單位或操縱子,operon);雙鏈DNA中只有一條鏈具有轉(zhuǎn)錄活性(稱為模板鏈);哪個(gè)基因被轉(zhuǎn)錄與特定的時(shí)間、空間、生理狀態(tài)有關(guān)。RNA聚合酶無(wú)校對(duì)功能。原核生物與真核生物mRNA的比較(1)、原核生物mRNA的半衰期短;(2)、許多原核生物mRNA以多順?lè)醋有问酱嬖冢唬?)、原核生物5端無(wú)帽子結(jié)構(gòu),3或只有短的poly(A)。(4)、真核生物mRNA5端有帽子結(jié)構(gòu),(5)、絕大多數(shù)真核生物mRNA3具有poly(A)尾巴,是轉(zhuǎn)錄后加上的,是m

13、RNA從核到質(zhì)轉(zhuǎn)移所必需的形式,提高mRNA的穩(wěn)定性。大腸桿菌的轉(zhuǎn)錄過(guò)程:(1)、識(shí)別階段:RNA聚合酶在亞基的引導(dǎo)下結(jié)合于啟動(dòng)子上;(2)、DNA雙鏈局部解開(kāi);(3)、起始階段:在模板鏈上通過(guò)堿基配對(duì)合成最初RNA鏈;(4)、延伸階段:核心酶向前移動(dòng),RNA鏈不斷生長(zhǎng);(5)、終止階段:RNA聚合酶到達(dá)終止子;(6)、RNA和RNA聚合酶從DNA上脫落。論述題1 真核生物轉(zhuǎn)錄的前體hnRNA如何加工為成熟的mRNA?真核生物mRNA的結(jié)構(gòu)組成:5,端存在帽子結(jié)構(gòu),3,端通常具有poly(A)尾巴,無(wú)內(nèi)含子,部分堿基發(fā)生甲基化。5,端加帽:當(dāng)RNA聚合酶聚合的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物達(dá)到25堿基長(zhǎng)時(shí),在其5,

14、端加上一個(gè)以5,3,方向相連的7甲基鳥(niǎo)苷帽,防止5,核苷酸外切酶的攻擊,有利于剪接、轉(zhuǎn)運(yùn)和翻譯的進(jìn)行;3,端加尾:很多真核生物的hnRNA的3,端經(jīng)過(guò)剪切后再加上多聚A殘基即poly(A)尾巴,這有助于整個(gè)分子的穩(wěn)定;剪接:在真核生物的mRNA加工過(guò)程中,內(nèi)含子序列被切除,兩側(cè)的外顯子片段連接。剪接反應(yīng)在核內(nèi)進(jìn)行,需要內(nèi)含子有5,GU,AU3,以及一段分支點(diǎn)序列。其過(guò)程是:內(nèi)含子先以一個(gè)具尾的環(huán)狀分子或套索狀分子形式被刪除,然后被降解,剪接包括snRNP與保守序列結(jié)合,形成剪接體,在其內(nèi)發(fā)生剪接與連接反應(yīng);編輯;甲基化修飾:當(dāng)序列為5,RRACX3,時(shí)會(huì)在第6位N原子位置發(fā)生甲基化。2概括細(xì)菌

15、細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄過(guò)程轉(zhuǎn)錄是通過(guò)RNA聚合酶的作用,以一條DNA鏈為模板產(chǎn)生一條單鏈RNA過(guò)程。步驟如下:與RNA聚合酶全酶的結(jié)合:一個(gè)RNA聚合酶全酶分子與待轉(zhuǎn)錄的DNA編碼序列上游的啟動(dòng)子序列松弛的結(jié)合。起始:RNA聚合酶往下游移動(dòng)了幾個(gè)核苷酸到達(dá)啟動(dòng)子的另一段短序列Pribnow框,緊密地與DNA結(jié)合。DNA上的啟動(dòng)子區(qū)域解鏈,RNA便從Pribnow框下游的幾個(gè)核苷酸處開(kāi)始合成,通常是DNA的反義鏈作為模板,合成幾個(gè)核苷酸后,因子被釋放并循環(huán)使用,以下步驟不再需要因子。延伸:RNA聚合酶核心酶沿著DNA模板移動(dòng),使DNA解鏈,與DNA模板的下一堿基互補(bǔ)核苷三磷酸聚合到鏈上。RNA聚合酶繼續(xù)在D

16、NA上移動(dòng),RNA鏈從模板鏈被釋放出來(lái),DNA雙螺旋重新形成。當(dāng)所有編碼序列被轉(zhuǎn)錄后,RNA聚合酶移動(dòng)一個(gè)終止序列,即終止子。轉(zhuǎn)錄復(fù)合體解體,RNA聚合酶和新形成的RNA從DNA模板上脫落下來(lái)。3、復(fù)雜轉(zhuǎn)錄單位的原始轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的加工方式有幾種?分別是什么?(1)剪、利用多個(gè)5端轉(zhuǎn)錄起始為點(diǎn)或接位點(diǎn)產(chǎn)生不同的蛋白質(zhì)。(2)、利用多個(gè)加poly(A)位點(diǎn)和不同的剪接方式產(chǎn)生不同的蛋白質(zhì)。(3)、雖無(wú)剪接,但有多個(gè)轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)或加poly(A)位點(diǎn)的基因。第四章.SD序列:在原核生物mRNA起始密碼AUG上游,存在49個(gè)富含嘌呤堿的一致性序列,如-AGGAGG-,稱為S-D序列。位于原核生物起始密碼子

17、上游7-12個(gè)核苷酸處的保守區(qū),該序列與16SrRNA3端反向互補(bǔ)。又稱為核蛋白體結(jié)合位點(diǎn)(ribosomal binding site,RBS)正轉(zhuǎn)錄調(diào)控:負(fù)轉(zhuǎn)錄調(diào)控:填空題1tRNA的種類有:起始tRNA和延伸tRNA,同工tRNA,校正tRNA。2. tRNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)為三葉草型,三級(jí)結(jié)構(gòu)為倒L型。tRNA結(jié)構(gòu)3.原核生物蛋白質(zhì)合成的起始tRNA是甲酰甲硫氨酰tRNA(fMet-tRNA fMet),它攜帶的氨基酸是甲酰甲硫氨酸(fMet),而真核生物蛋白質(zhì)合成的起始tRNA是甲硫氨酰tRNA(Met-tRNA Met),它攜帶的氨基酸是甲硫氨酸(Met)。4新生肽鏈每增加一個(gè)氨基酸單位

18、都要經(jīng)過(guò)AA-tRNA與核糖體的結(jié)合,肽鍵形成,移位三步反應(yīng)。5. 核糖體的作用位點(diǎn)有:A位點(diǎn)、P位點(diǎn)、E位點(diǎn)。5在真核生物中蛋白質(zhì)合成起始時(shí)先形成起始因子和起始tRNA復(fù)合物,再和40S亞基形成40S起始復(fù)合物。6氨酰tRNA合成酶既能識(shí)別氨基酸,又能識(shí)別相應(yīng)的tRNA。7多肽合成的起始密碼子是AUG,而UAA,UAG,UGA是終止密碼子。8遺傳密碼的特點(diǎn)包括連續(xù)性,簡(jiǎn)并性,擺動(dòng)性,普遍性與特殊性。9核酸復(fù)制時(shí),DNA聚合酶沿模板鏈35方向移動(dòng);轉(zhuǎn)錄時(shí),RNA聚合酶沿模板鏈35方向移動(dòng);翻譯時(shí),核糖體沿模板鏈5 3方向移動(dòng)。10原核生物蛋白質(zhì)合成形成起始復(fù)合物時(shí),其mRNA先與核糖體的30S

19、亞基結(jié)合,然后再與結(jié)合起始因子和GTP的甲酰甲硫氨酰tRNA結(jié)合,形成30S起始復(fù)合物,然后再與50S形成70S起始復(fù)合物。簡(jiǎn)答題:1簡(jiǎn)述核糖體的結(jié)構(gòu)及功能特點(diǎn):答:核糖體的結(jié)構(gòu):真核生物:由60S大亞基和40S小亞基組成的80S的核糖體;原核生物:由50S大亞基和30S小亞基組成的70S的核糖體功能特點(diǎn):合成蛋白質(zhì) 。在單個(gè)核糖體上,包括至少5個(gè)功能活性中心,在蛋白質(zhì)合成過(guò)程中,各有專一的識(shí)別作用和功能:mRNA的結(jié)合部位小亞基 ,結(jié)合或接受AA-tRNA的部位大亞基A位,結(jié)合或接受肽基tRNA部位大亞基,肽基轉(zhuǎn)移部位大亞基P位,形成肽鍵部位(轉(zhuǎn)肽酶中心)大亞基E位。2.簡(jiǎn)述氨基酸的活化過(guò)程

20、答:游離的氨基酸必須經(jīng)過(guò)活化以獲得能量,才能參與蛋白質(zhì)的合成,活化反應(yīng)由氨酰tRNA合成酶催化?;罨謨刹剑夯罨篴a + ATP+ E氨基酰-AMP釋放出 PPi 轉(zhuǎn)移:氨基酰-AMP轉(zhuǎn)移到 tRNA 并釋放出 AMP。3、論述蛋白質(zhì)的翻譯過(guò)程。答:蛋白質(zhì)的翻譯即合成過(guò)程可分為四個(gè)階段:氨基酸的活化、肽鏈合成的起始、延伸和終止。 氨基酸的活化:游離的氨基酸必須經(jīng)過(guò)活化以獲得能量,才能參與蛋白質(zhì)的合成,活化反應(yīng)由氨酰tRNA合成酶催化,最終氨基酸連接在tRNA的3端合成氨酰- tRNA。 肽鏈合成的起始:核蛋白體大小亞基分離 ,mRNA在小亞基上定位結(jié)合,起始氨基酰tRNA與小亞基結(jié)合,核蛋白

21、體大亞基結(jié)合。肽鏈的延伸:肽鏈的延長(zhǎng)是在核蛋白體上連續(xù)性循環(huán)式進(jìn)行,每次循環(huán)增加一個(gè)氨基酸,分為以下三步:(一)進(jìn)位:根據(jù)mRNA下一組遺傳密碼指導(dǎo),使相應(yīng)氨基酰-tRNA進(jìn)入核蛋白體A位。(二)成肽:肽酰轉(zhuǎn)移酶將相鄰的兩個(gè)氨基酸相連形成肽鍵,該過(guò)程不需要能量的輸入;(三)轉(zhuǎn)位:移位酶利用GTP水解釋放的能量使核糖體沿mRNA移動(dòng)一個(gè)密碼子,釋放出空載的tRNA并將新生肽鏈運(yùn)至P位點(diǎn)。 肽鏈合成的的終止與釋放:釋放因子識(shí)別并與終止密碼子結(jié)合,水解P位上多肽鏈與tRNA之間的二脂鍵,接著,新生肽鏈和tRNA從核糖體上釋放,核糖體大、小亞基解體,蛋白質(zhì)合成結(jié)束。4、原核生物翻譯的起始過(guò)程(1)核糖

22、體大小亞基分離(2)30s小亞基通過(guò)SD序列與mRNA模板相結(jié)合(3)在IF-2和GTP的幫助下fMet-tRNAfMet進(jìn)入小亞基的P位,tRNA的反密碼子與mRNA上密碼子配對(duì)。(4)帶有tRNA、mRNA和三個(gè)翻譯起始因子的小亞基起始復(fù)合物與50s的大亞基結(jié)合,GTP水解釋放翻譯起始因子。5、以大腸桿菌為例簡(jiǎn)述蛋白質(zhì)合成的過(guò)程從以下四個(gè)方面詳細(xì)論述(1)氨基酸的活化:(2)肽鏈合成的起始:(3)肽鏈的延生:(4)肽鏈合成的終止:第六章乳糖操縱子模型內(nèi)容(1)Z、Y、A基因產(chǎn)物由同一條多順?lè)醋觤RNA分子所編碼。(2)乳糖操縱子mRNA分子的啟動(dòng)區(qū)(P)位于阻遏基因(I)與操縱區(qū)(O)之間

23、,不能單獨(dú)起始半乳糖苷酶和透過(guò)酶基因的高效表達(dá)。(3)乳糖操縱子的操縱區(qū)是DNA上的一小段序列(僅為26bp),是阻遏物的結(jié)合位點(diǎn)。(4)當(dāng)阻遏物與操縱區(qū)相結(jié)合時(shí),lacmRNA的轉(zhuǎn)錄起始受到抑制。(5)誘導(dǎo)物通過(guò)與阻遏物結(jié)合,改變其三維構(gòu)象,使之不能與操縱區(qū)相結(jié)合,誘發(fā)lac mRNA的合成。乳糖操縱子(lac operon)的結(jié)構(gòu)1、結(jié)構(gòu)基因(1)lacZ:編碼b 半乳糖苷酶 (使乳糖水解)(2)lacY:編碼b 半乳糖苷透過(guò)酶 (使b 半乳糖苷透過(guò)細(xì)胞壁、質(zhì)膜進(jìn)入細(xì)胞內(nèi))(3)lacA:編碼b 半乳糖苷乙酰轉(zhuǎn)移酶(將乙?;D(zhuǎn)移到b 半乳糖苷上)2、調(diào)節(jié)基因(regulatory gene

24、)(1)概念: 其產(chǎn)物參與調(diào)控其他結(jié)構(gòu)基因表達(dá)的基因(2)特點(diǎn): a、可在結(jié)構(gòu)基因群附近、也可遠(yuǎn)離結(jié)構(gòu)基因 b、不僅對(duì)同一條DNA鏈上的結(jié)構(gòu)基因起作用,而且能對(duì)不同DNA鏈上的結(jié)構(gòu)基因起作用(3)調(diào)控蛋白:類型:a、阻遏蛋白(repressive protein)與操縱元件結(jié)合后能減弱或阻止所調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)控蛋白 b、激活蛋白(activating protein):與操縱元件結(jié)合后能增強(qiáng)或啟動(dòng)所調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)控蛋白3、操縱元件(operator)(1)與啟動(dòng)子鄰近或與啟動(dòng)子部分序列重疊(2)具有回文結(jié)構(gòu),能形成十字形結(jié)構(gòu)。(3)與不同構(gòu)像的蛋白質(zhì)結(jié)合,可以分別起阻遏或激活基因表達(dá)的作用

25、4、啟動(dòng)子(promoter)是指能被RNA聚合酶識(shí)別、結(jié)合并啟動(dòng)基因轉(zhuǎn)錄的一段DNA序列。(1)-10序列- Pribnow盒:TATAAT;(2)-35bp序列:TTGACA操縱子至少有一個(gè)啟動(dòng)子,一般在第一個(gè)結(jié)構(gòu)基因5上游,控制整個(gè)結(jié)構(gòu)基因群的轉(zhuǎn)錄5、終止子(terminator)是給予RNA聚合酶轉(zhuǎn)錄終止信號(hào)的DNA序列(1)不依賴因子的終止子 (2)依賴因子的終止子在一個(gè)操縱元中至少在結(jié)構(gòu)基因群最后一個(gè)基因的后面有一個(gè)終止子 大腸桿菌乳糖操縱子(lactose operon)包括3個(gè)結(jié)構(gòu)基因:Z、Y和A,以及啟動(dòng)子、控制子和阻遏子等。轉(zhuǎn)錄的調(diào)控是在啟動(dòng)區(qū)和操縱區(qū)進(jìn)行的。LacI阻抑蛋

26、白, LacZ-糖苷酶,LacY透性酶,LacA轉(zhuǎn)乙?;?。三種酶的功能: . -半乳糖酶:將乳糖分解成半乳糖和葡萄糖 . 滲透酶:增加糖的滲透,易于攝取乳糖和半乳糖 . 轉(zhuǎn)乙酰酶:-半乳糖轉(zhuǎn)變成乙酰半乳糖lac 操縱子小結(jié)通常情況(葡萄糖供應(yīng)正常)阻遏蛋白與操縱序列結(jié)合,基因不轉(zhuǎn)錄。細(xì)胞外的乳糖通過(guò)透性酶吸收到細(xì)胞內(nèi);細(xì)胞內(nèi)的-半乳糖苷酶將乳糖轉(zhuǎn)變?yōu)楫惾樘恰.惾樘墙Y(jié)合到乳糖阻抑物上使之從操縱序列上脫離,聚合酶迅速開(kāi)始lacZYA基因的轉(zhuǎn)錄。這就是負(fù)控誘導(dǎo)。然而,還需要細(xì)菌生長(zhǎng)系統(tǒng)中缺少葡萄糖,使cAMP含量增加,才有足夠量的cAMP與CRP結(jié)合形成CRP-cAMP復(fù)合物結(jié)合于Plac上游。使

27、DNA雙螺旋發(fā)生彎曲,轉(zhuǎn)錄才可以有效地進(jìn)行。組氨酸操縱子:與His降解代謝有關(guān)的兩組酶類被稱為hut酶(histidine utilizing enzyme),控制這些酶合成的操縱子被稱為hut operon。由一個(gè)多重調(diào)節(jié)的操縱子控制,有兩個(gè)啟動(dòng)子,兩個(gè)操縱區(qū)及兩個(gè)正調(diào)控蛋白。轉(zhuǎn)錄后調(diào)控一、 翻譯起始的調(diào)控 遺傳信息的翻譯起始于mRNA上的核糖體結(jié)合位點(diǎn)(RBS)起始密子AUG上游的一段非翻譯區(qū)。在RBS中有SD序列,與核糖體16S rRNA的3端互補(bǔ)配對(duì),促使核糖體與mRNA相結(jié)合。RBS的結(jié)合強(qiáng)度取決于SD序列的結(jié)構(gòu)及與AUG的距離。SD與AUG相距一般以410核苷酸為佳,9核苷酸最佳。

28、二、mRNA穩(wěn)定性對(duì)轉(zhuǎn)錄水平的影響所有細(xì)胞都有一系列核酸酶,用來(lái)清除無(wú)用的mRNA。一個(gè)典型的mRNA半衰期為2-3min。mRNA分子被降解的可能性取決于其二級(jí)結(jié)構(gòu)。SD序列的微小變化,往往會(huì)導(dǎo)致表達(dá)效率成百上千倍的差異,這是由于核苷酸的變化改變了形成mRNA 5端二級(jí)結(jié)構(gòu)的自由能,影響了30S亞基與mRNA的結(jié)合,從而造成了蛋白質(zhì)合成效率上的差異。三、蛋白質(zhì)的調(diào)控作用細(xì)菌中有些mRNA結(jié)合蛋白可激活靶基因的翻譯。相反,mRNA特異性抑制蛋白則通過(guò)與核糖體競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合mRNA分子來(lái)抑制翻譯的起始。大腸桿菌中的核糖體蛋白就存在翻譯抑制現(xiàn)象。四、反義RNA的調(diào)節(jié)作用RNA調(diào)節(jié)是原核基因表達(dá)轉(zhuǎn)錄后調(diào)

29、節(jié)的另一種重要機(jī)制。細(xì)菌相應(yīng)環(huán)境壓力的改變,會(huì)產(chǎn)生一些非編碼小RNA分子,能與mRNA中的特定序列配對(duì)并改變其構(gòu)象,導(dǎo)致翻譯過(guò)程的開(kāi)啟或關(guān)閉等作用。第七八章操縱子(operon):是指數(shù)個(gè)功能上相關(guān)的結(jié)構(gòu)基因串聯(lián)在一起,構(gòu)成信息區(qū),連同其上游的調(diào)控區(qū)(包括啟動(dòng)子和操縱基因)以及下游的轉(zhuǎn)錄終止信號(hào)所構(gòu)成的基因表達(dá)單位,所轉(zhuǎn)錄的RNA為多順?lè)醋印T谠松镏?,若干結(jié)構(gòu)基因可串聯(lián)在一起,其表達(dá)受到同一調(diào)控系統(tǒng)的調(diào)控,這種基因的組織形式稱為操縱子。反式作用因子(trans-acting factor):能直接或間接地識(shí)別或結(jié)合在各類順式作用元件核心序列上,參與調(diào)控靶基因轉(zhuǎn)錄效率的蛋白質(zhì)。弱化子:在tr

30、p mRNA 5端有一個(gè)長(zhǎng)162bp的mRNA片段被稱為前導(dǎo)區(qū),其中123150位堿基序列如果缺失,trp基因表達(dá)可提高6-10倍。mRNA合成起始以后,除非培養(yǎng)基中完全沒(méi)有色氨酸,轉(zhuǎn)錄總是在這個(gè)區(qū)域終止,產(chǎn)生一個(gè)僅有140個(gè)核苷酸的RNA分子,終止trp基因轉(zhuǎn)錄。這個(gè)區(qū)域被稱為弱化子,該區(qū)mRNA可通過(guò)自我配對(duì)形成莖-環(huán)結(jié)構(gòu)。順式作用元件(cis-acting element)影響自身基因表達(dá)活性的非編碼DNA序列。斷裂基因(splite gene):真核生物結(jié)構(gòu)基因,由若干個(gè)編碼區(qū)和非編碼區(qū)互相間隔開(kāi)但又連續(xù)鑲嵌而成,去除非編碼區(qū)再連接后,可翻譯出由連續(xù)氨基酸組成的完整蛋白質(zhì),這些基因稱為

31、斷裂基因?;虻姆肿由飳W(xué)定義:產(chǎn)生一條多肽鏈或功能RNA所必需的全部核苷酸序列?;虮磉_(dá)的時(shí)間特異性:基因表達(dá)的空間特異性:填空題1、真核生物中反式作用因子的DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域有:螺旋轉(zhuǎn)角螺旋,堿性螺旋-環(huán)-螺旋,鋅指,堿性亮氨酸拉鏈,同源域蛋白。2、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子按功能可以分為:基本轉(zhuǎn)錄因子和特異轉(zhuǎn)錄因子。3、真核生物有3類RNA聚合酶,負(fù)責(zé)轉(zhuǎn)錄rRNA基因的RNA聚合酶是:RNA聚合酶I4、典型的原核啟動(dòng)子的四個(gè)特征是:轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn),原核基因轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)通常是嘌呤,-10區(qū),-35區(qū)。5、乳糖操縱子的結(jié)構(gòu)結(jié)構(gòu)基因有:lacZ,lacY,lacA。問(wèn)答題1、乳糖操縱子的作用機(jī)制。答:(1)乳糖操縱子的組成:大腸桿菌乳糖操縱子含Z,Y,A三個(gè)結(jié)構(gòu)基因,分別編碼半乳糖苷酶,透酶和半乳糖苷乙酰轉(zhuǎn)移酶,此外還有一個(gè)操縱序列O,一個(gè)啟動(dòng)子P和一個(gè)調(diào)節(jié)基因I。(2)阻遏蛋白的負(fù)性調(diào)節(jié):沒(méi)有乳糖存在時(shí),I基因編碼的阻遏蛋白結(jié)合于操縱序列O處,乳糖操縱子處于阻遏狀態(tài),不能合成分解乳糖的三種酶;有乳糖存在時(shí),乳糖作為誘導(dǎo)物誘導(dǎo)阻遏蛋白變構(gòu),不能結(jié)合于操縱序列,乳糖操縱子被誘導(dǎo)開(kāi)放合成分解乳糖

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