化學信息學第一講FGQ.ppt

1、2021/3/8,1,化學與生物信息學,化學學院農(nóng)藥與化學生物學教育部重點實驗室,馮國強,2,中國科學院化學研究所博士，先后在英國謝菲爾德大學、劍橋大學、利茲大學從事過博士后研究，現(xiàn)任華師化學學院教授、博導,馮國強,個人介紹,辦公室：化學樓540 實驗室：化學樓530-532,3,21世紀是信息的時代,如果我們把“檢索工具”比作知識的寶庫，那么“文獻檢索”就是打開知識寶庫的一把鑰匙,科技改變了我們獲取信息的方式,4,據(jù)美國科學基金會統(tǒng)計，一個科學研究人員花費在查找和消化學術資料上的時間需占全部科研時間的51%，計劃思考占8%，實驗研究占32%，書面總結占9%。 -美國科學基金會 NSF(Nat

2、ional Science Foundation,總結寫報告 9,5,科研工作中與信息相關的問題,如何在海量的信息中快速檢索到相關的、高質量的信息？ 如何有效地分析目前的研究進展并確定新的研究方向？ 如何及時跟蹤某研究方向的最新進展？ 如何有序管理所檢索到的大量文獻？ 如何迅速提高論文寫作的效率？ 如何全面了解所發(fā)表論文及其期刊的影響力 確定投稿方向,信息檢索貫串整個科研過程,6,如何獲取我們所需要的信息,Are these enough? NO,7,這門課你將學到,化學文獻基礎知識 如何檢索文獻 （重點,Chemical informatics,歡 迎 步 入 化 學 信 息 學,8,是一門

3、應用信息學方法解決化學問題的學科！ Cheminformatics, Chemical Informatics,The mixing of information resources to transform data into information, and information into knowledgeBrown 1998,A generic term that encompasses the design, creation, organization, management, retrieval, analysis, dissemination, visualisation,

4、and use of chemical information into knowledge Paris 2000,以化學、化工、計算機與信息技術為基礎的邊緣學科，它涉及化學化工信息的獲取、管理、處理與控制、計算推演與模擬和圖形表示的技術與方法,什么是化學信息學,9,化學、化工文獻學 文獻信息檢索 個人資料管理,化學知識體系的計算機表示、管理與網(wǎng)絡傳輸 化學結構、化學反應的計算機表示、化學數(shù)據(jù)庫技術 化學信息的網(wǎng)際通訊語言,化學圖形 化學信息可視化和虛擬技術，化工制圖,涵蓋六個方面的內(nèi)容,化學信息學領域范圍,10,化學信息學領域范圍,化學信息的解析與處理 化學實驗設計，實驗數(shù)據(jù)處理，圖譜分辨與

5、解析 生物分子的信息解析，多元分析和數(shù)據(jù)挖掘技術,化學知識的計算機推演 結構與性質關系，分子及其聚集體系的計算機計算與模擬， 分子與材料設計，化學反應分析與設計，化工過程計算與模仿,化學教育與教學的現(xiàn)代技術與遠程信息資源,11,課程目的,熟練使用檢索工具,快速檢索信息資源,充分利用信息資源,有效識別信息資源,課程安排（9周,課堂講授與討論 上機實踐與練習,12,考核,教材,參考書,13,第一章 科技文獻基礎知識,科技文獻的基本常識,繼承功能、傳遞交流功能,文獻的屬性,知識性、記錄性、物質性,文獻的級別,一次文獻、二次文獻、三次文獻,文獻的功能,文獻是記錄知識內(nèi)容的信息集合體，是人類進步和發(fā)展的

6、經(jīng)驗總結，是科技情報的源泉,14,書目、題錄 索引、文摘,詞典、名錄 指南、手冊、年鑒,評述、論文叢集 百科全書,二次文獻,原始文獻 (一次文獻,三次文獻,文獻整理,重組、濃縮,檢索工具,參考性文獻,文獻結構示意圖,15,文獻的分類,科技期刊 科技圖書 專利文獻 科技報告 會議文獻,學位論文 技術標準 產(chǎn)品資料 電子出版物,16,文獻數(shù)量迅猛增加,現(xiàn)代化學文獻特點,17,文獻種類繁多，形式多樣 類型：圖書、期刊雜志、科技報告、學位論文、會議資料 文獻載體：印刷型、縮微型、機讀型 文獻性質：一次文獻、二次文獻、三次文獻,電子文獻與網(wǎng)絡檢索普及 化學數(shù)據(jù)庫 （Scifinder、Reaxys、IS

7、I Web of Knowledge等） 全文數(shù)據(jù)庫（ACS、RSC、Elsevier、Wiley InterScience數(shù)據(jù)庫,18,科技文獻的檢索方法,科技文獻的檢索途徑,著者途徑 序號途徑 分類途徑 其它途徑,如著作目錄、作者索引等,如標準號索引、登記號索引等,如分類目錄、分類索引等,如分子式索引、書名索引等,19,查閱科技文獻的基本原則,科技文獻的檢索方法,1）掌握部分文獻檢索工具,目錄、題錄與摘要 索引、述評與文摘指南 幾種重要的數(shù)據(jù)庫 幾種檢索性期刊 利用www與計算機文獻檢索系統(tǒng) 參考工具書,20,科技文獻的檢索方法,2）確定跟蹤瀏覽的重要期刊,權威性刊物，如J. Am. Ch

8、em. Soc. 有關專業(yè)刊物，如J. Org. Chem. 消息性刊物，如C&E News, Science News 科普性刊物，如Scientific American,3）閱讀文獻時注意參考文獻的引證,21,Top 化學雜志,Nature IF = 36.28 Science IF = 31.201 Nature Chem. IF = 20.524 Angew. Chem. Int. Ed. IF = 13.455 J. Am. Chem. Soc. IF = 9.907 Chem. Comm. IF = 6.169 Chem. Sci. IF = 7.525,Chem. Rev. I

9、F = 40.197 Accounts Chem. Res. IF = 21.64 Chem. Soc. Rev. IF = 28.76,2011年影響因子,22,文獻的檢索方法,1）直接法：從瀏覽原始文獻中直接查出與 課題相關的文獻線索，依據(jù)文獻線索查原始文獻,2）追溯法：依據(jù)文獻所附的參考文獻為線索 查找文獻的方法,3）工具法：利用文摘和索引等檢索工具進行檢索,23,2012,Cited References,2000,1998,2001,1993,2010,Times Cited,Related Records,2004,1999,2002,1994,2009,Citing,2011,從

10、一篇高質量的文獻出發(fā) 沿著科學研究的發(fā)展道路,Times Cited 越查越新,Cited References 越查越舊,Related Records 相同參考文獻或同時被引用的文獻，越查越深,24,第二章 科學研究方法和科技論文寫作,一、科學研究的方法,1.科研課題的選題,要具有創(chuàng)新性和先進性 要注意實際性 要考慮科學上的可行性 要抓住關鍵性的時機,1）選題原則,25,歷史和現(xiàn)狀的調查 實地考察 文獻調查 資料的整理 研究方案的制定,2）調查研究,26,科研實驗中的基本步驟,1）理論準備 （2）實驗方案的設計與制定 （3）實驗器材與原料的準備 （4）實驗過程中的觀察與記錄 （5）實驗結果的整理與數(shù)據(jù)的分析評價 （6）實驗報告,二、科技論文的寫作與參考文獻的引證,摘要,標題,作者,引言,參考文獻,結果,28,討論,結論,致謝,附加材料,實驗方法,29,1.科技論文的寫作,1）標題 （2）摘要 （3）引言 （4）實驗方法 （5）結果與討論,6）結論 （7）致謝 （8）參考文獻 （9）附加信息材料,1）引證原則（及時性；珍貴性；準確、相關性） （2）引用格式（不同雜志要求不同，關注每種雜志的投稿須知,2.參考文獻的引證,30,1.請