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1、。NCBI 序列提交方法NCBI 提交序列有兩大類方式,一個(gè)是批量提交一個(gè)是單個(gè)序列提交。下面說(shuō)的就是單個(gè)序列提交方式, 這是最新的提交方式 ,由于 NCBI 更新很快,也許過(guò)段時(shí)間又不一樣了,主要是按鈕位置可能會(huì)變。首先要注冊(cè)一個(gè)自己的NCBI 賬號(hào):點(diǎn)擊此處注冊(cè)然后登陸賬號(hào):在已登陸狀態(tài)下點(diǎn)擊Submit:點(diǎn)擊圖中標(biāo)記處選擇GengBank:。1。點(diǎn)擊 GO:選擇: Banklt :。2。建議認(rèn)真閱讀填寫要求等:點(diǎn)擊Sign in to use Banklt點(diǎn)擊 New Sub, 下面是你提交的記錄,即使你提交過(guò)程中中斷了,也可以Continue!。3。以下是具體提交過(guò)程:一 . 填寫基本
2、信息二1.圖中 1 是作者名字,可以添加作者名, First 和 Last Name ,填了就可以,其他可以不填。2. 圖中 2 是填是否出版,有三個(gè)選項(xiàng):未出版,正在出版,已經(jīng)出版。需要注意的是,如果選則未出版, 需要在 Title 中注明,否則無(wú)法提交 。3. 可以添加作者,然后 Continue 即可。4。三. 這是選擇是用生么測(cè)序方法后的的序列1. 現(xiàn)在我們用的一次只能測(cè)一條序列的都是 Sanger 測(cè)序,下面的 454 等都代表儀器型號(hào),是我們現(xiàn)在說(shuō)的高通量測(cè)序,簡(jiǎn)單的書不同型號(hào)靈敏度不同。2. 這是選擇你測(cè)序是一個(gè)反應(yīng)還是幾個(gè)反應(yīng),就是你這條序列是一個(gè)測(cè)序結(jié)果就出來(lái)了,還是幾個(gè)測(cè)序
3、結(jié)果拼在一起得到的結(jié)果,一代測(cè)序一個(gè)反應(yīng)最可信的測(cè)序范圍是 50-750bp, 根據(jù)實(shí)際選擇,然后繼續(xù)。四填寫序列信息:1. 選擇什么時(shí)候公布你的序列信息, 你可以選怎立刻, 也可以選擇在以后的某一時(shí)間, 如果你選擇了時(shí)間, 那么即使你已經(jīng)上傳序列, 有了序列號(hào),在時(shí)間未到的時(shí)候你也是找不到的。2. 選擇你的序列是不是 16SrRNA基因是細(xì)菌上編碼 rRNA相對(duì)應(yīng)的 DNA序列 , 可能有一個(gè)專門的庫(kù),所以一般選擇 NO3. 選擇你的序列類型, 1. 我選了 cDNA , 然后選擇是什么類型:是線性,我們一般的都是線狀的,還是環(huán)狀一般想線粒體,葉綠體或者各種質(zhì)粒都是現(xiàn)狀的。5。4. 然后填寫
4、你上傳了多少個(gè)序列,黏貼序列, 注意序列一定要是FASTA格式。 你也可以選擇上傳文檔,這個(gè)自己學(xué)。然后繼續(xù)兩次繼續(xù)。五填寫你上傳序列所屬物種。然后即使繼續(xù)。6。六選擇你要你的序列式原始序列,就是你自己測(cè)序的序列,還是為已有序列做注釋。然后繼續(xù)。七序列信息1. 填寫你基因所屬細(xì)胞器2. 填寫你對(duì)基因的注釋,可以添加選項(xiàng),根據(jù)自己實(shí)際情況添加。3. 最下面可以添加你的 PCR引物,然后繼續(xù),會(huì)讓你檢查,你檢查后繼續(xù)即可。7。八信息補(bǔ)充1. 填加序列信息,可以上傳文件,也可以選項(xiàng)填寫,建議用選項(xiàng)。2. 選擇你的信息,可以添加,然后繼續(xù)在上圖中選擇添加選項(xiàng),會(huì)讓你填寫模板是正鏈還是負(fù)鏈,如果是部分序列,是哪一端,產(chǎn)物是指你把序列通過(guò) BlastP 比對(duì)后的到的序列號(hào)( qualifiers )和相似度 (Value), 然后 Accept 。跳轉(zhuǎn)后然后繼續(xù)。8。九最后會(huì)讓你最終檢查你的信息和再次確認(rèn)你有沒(méi)有要求,如果沒(méi)有問(wèn)題,就Finish 。我是隨便找的序列,不能提交的所以沒(méi)法顯
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