生物化學(xué):酶學(xué)_第1頁(yè)
生物化學(xué):酶學(xué)_第2頁(yè)
生物化學(xué):酶學(xué)_第3頁(yè)
生物化學(xué):酶學(xué)_第4頁(yè)
生物化學(xué):酶學(xué)_第5頁(yè)
已閱讀5頁(yè),還剩242頁(yè)未讀 繼續(xù)免費(fèi)閱讀

下載本文檔

版權(quán)說(shuō)明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請(qǐng)進(jìn)行舉報(bào)或認(rèn)領(lǐng)

文檔簡(jiǎn)介

1、酶酶 Enzyme 正常人體形態(tài)與功能學(xué)概論正常人體形態(tài)與功能學(xué)概論-生理、生化生理、生化 生物催化劑生物催化劑 蛋白質(zhì):催化體內(nèi)99%以上的反應(yīng) 核酸:ribozyme,小于1% 酶學(xué)歷史酶學(xué)歷史 1833年: 麥芽抽提液 Payen 和 Persoz 用酒精沉淀 物質(zhì)(對(duì)熱不穩(wěn)定) 淀粉 單糖 淀粉糖化酶淀粉糖化酶 183537年:Berzelius提出: 催化作用催化作用 catalysis 催化劑 酶 Sumner 獲諾貝爾獎(jiǎng) 1926年 提純脲酶 酶的提純(性質(zhì)) 酶的功能(結(jié)構(gòu)) 應(yīng)用、工具酶 分子酶學(xué) 酶的概念酶的概念 目前將生物催化劑分為兩類目前將生物催化劑分為兩類 酶酶 、

2、核酶(脫氧核酶)核酶(脫氧核酶) n酶是一類由活細(xì)胞產(chǎn)生的,對(duì)其特異底物酶是一類由活細(xì)胞產(chǎn)生的,對(duì)其特異底物 具有高效催化作用的蛋白質(zhì)。具有高效催化作用的蛋白質(zhì)。 酶學(xué)與諾貝爾獎(jiǎng) 1907 無(wú)細(xì)胞發(fā)酵 1929 發(fā)酵機(jī)理研究 1946 酶是蛋白質(zhì) 1975 逆轉(zhuǎn)錄酶的發(fā)現(xiàn) 1978 限制性內(nèi)切酶 1989 非蛋白質(zhì)酶 1997 ATP合成酶的作用機(jī)制 2009 端粒酶 細(xì)胞中有種酶負(fù)責(zé)端粒的延長(zhǎng),其名為端粒酶。端粒酶可以把DNA復(fù)制的缺 陷填補(bǔ)起來(lái),藉由把端粒修復(fù)延長(zhǎng),可以讓端粒不會(huì)因細(xì)胞分裂而有所損耗, 使得細(xì)胞分裂的次數(shù)增加。 端粒酶(Telomerase),在細(xì)胞中負(fù)責(zé)端粒的延長(zhǎng)的一種酶

3、,是基本的核蛋 白逆轉(zhuǎn)錄酶,可將端粒DNA加至真核細(xì)胞染色體末端。端粒在不同物種細(xì)胞 中對(duì)于保持染色體穩(wěn)定性和細(xì)胞活性有重要作用,端粒酶能延長(zhǎng)縮短的端粒 (縮短的端粒其細(xì)胞復(fù)制能力受限),從而增強(qiáng)體外細(xì)胞的增殖能力。端粒酶 在正常人體組織中的活性被抑制,在腫瘤中被重新激活,端粒酶可能參與惡性 轉(zhuǎn)化。端粒酶在保持端粒穩(wěn)定、基因組完整、細(xì)胞長(zhǎng)期的活性和潛在的繼續(xù)增 殖能力等方面有重要作用。端粒酶的存在,就是把 DNA 復(fù)制的缺陷填補(bǔ)起來(lái), 即由把端粒修復(fù)延長(zhǎng),可以讓端粒不會(huì)因細(xì)胞分裂而有所損耗,使得細(xì)胞分裂 的次數(shù)增加。 但是,在正常人體細(xì)胞中,端粒酶的活性受到相當(dāng)嚴(yán)密的調(diào)控,只有在造血細(xì) 胞、干

4、細(xì)胞和生殖細(xì)胞,這些必須不斷分裂的細(xì)胞之中,才可以偵測(cè)到具有活 性的端粒酶。當(dāng)細(xì)胞分化成熟后,必須負(fù)責(zé)身體中各種不同組織的需求,各司 其職,于是,端粒酶的活性就會(huì)漸漸的消失。對(duì)細(xì)胞來(lái)說(shuō),本身是否能持續(xù)分 裂下去并不重要,而是分化成熟的細(xì)胞將背負(fù)更重大的使命,就是讓組織器官 運(yùn)作,使生命延續(xù)。 端粒酶是一種由催化蛋白和RNA模板組成的酶,可合成染色體末端的DNA,賦 予細(xì)胞復(fù)制的永生性。 1990年起Calvin Harley把端粒與人體衰老掛上了鉤。 第一、細(xì)胞愈老,其端粒長(zhǎng)度愈短;細(xì)胞愈年輕,端粒愈長(zhǎng),端粒與 細(xì)胞老化有關(guān)系。衰老細(xì)胞中的一些端粒丟失了大部分端粒重復(fù)序列。 當(dāng)細(xì)胞端粒的功能受

5、損時(shí),出現(xiàn)衰老。而當(dāng)端??s短至關(guān)鍵長(zhǎng)度后, 衰老加速,臨近死亡。 第二、正常細(xì)胞端粒較短。細(xì)胞分裂會(huì)使端粒變短,分裂一次,縮短 一點(diǎn),就像磨損鐵桿一樣,如果磨損得只剩下一個(gè)殘根時(shí),細(xì)胞就接 近衰老。細(xì)胞分裂一次其端粒的DNA丟失約30-200bp(堿基對(duì)), 鼠和人的一些細(xì)胞一般有大約10000bp。 第三、研究發(fā)現(xiàn),細(xì)胞中存在一種酶,它合成端粒。端粒的長(zhǎng)短,是 由酶決定的。細(xì)胞內(nèi)酶多酶少可預(yù)測(cè)端粒的長(zhǎng)短。正常人體細(xì)胞中檢 測(cè)不到端粒酶。一些良性病變細(xì)胞,體外培養(yǎng)的成纖維細(xì)胞中也測(cè)不 到端粒酶活性。但在生殖細(xì)胞睪丸、卵巢、胎盤及胎兒細(xì)胞中此酶為 陽(yáng)性。令人注目的發(fā)現(xiàn)是,惡性腫瘤細(xì)胞具有高活性的

6、端粒酶,端粒 酶陽(yáng)性的腫瘤有卵巢癌、淋巴瘤、急性白血病、乳腺癌、結(jié)腸癌、肺 癌等等。人類腫瘤中廣泛地存在著較高的端粒酶活性。這樣一來(lái),我 們又發(fā)現(xiàn)了一種腫瘤細(xì)胞的特異物質(zhì)。 telomerase Aging Cancer Genomic instability DNA repair Human have telomerase repressed, short telomere, replicate senescence. 25% die from cancer 裸鼴鼠裸鼴鼠 heterocephalus glaber (naked mole-rat) 挖掘類挖掘類嚙齒目嚙齒目裸鼴鼠屬下唯一物種

7、;僅有的兩種裸鼴鼠屬下唯一物種;僅有的兩種真社會(huì)性真社會(huì)性哺乳動(dòng)物之一;哺乳動(dòng)物之一; 裸鼴鼠(裸鼴鼠(HGHG)與生俱來(lái)長(zhǎng)壽和抗癌的能力與生俱來(lái)長(zhǎng)壽和抗癌的能力 3030年壽命,比同體型嚙齒目動(dòng)物如家鼠長(zhǎng)年壽命,比同體型嚙齒目動(dòng)物如家鼠長(zhǎng)1010倍;倍; 多年群體數(shù)據(jù)觀察,未發(fā)現(xiàn)一例腫瘤發(fā)病多年群體數(shù)據(jù)觀察,未發(fā)現(xiàn)一例腫瘤發(fā)??; 身體機(jī)能幾乎不會(huì)退化,到死前都可以繁殖后代; 皮膚痛覺(jué)的缺失; 代謝率很低; 對(duì)高低溫度耐受能力強(qiáng); 不怕吃到有毒植物。 成體裸鼴鼠的成纖維細(xì)胞培養(yǎng)基粘度高,成體裸鼴鼠的成纖維細(xì)胞培養(yǎng)基粘度高, 富含高分子量的透明質(zhì)酸(富含高分子量的透明質(zhì)酸(HAHA) 水水 空培

8、養(yǎng)基空培養(yǎng)基 人細(xì)胞培養(yǎng)基人細(xì)胞培養(yǎng)基 小鼠培養(yǎng)基小鼠培養(yǎng)基 裸鼴鼠培養(yǎng)基裸鼴鼠培養(yǎng)基 質(zhì)酸降解酶質(zhì)酸降解酶 裸鼴鼠培養(yǎng)基裸鼴鼠培養(yǎng)基+ + 粘稠度粘稠度 質(zhì)酸凝膠電泳質(zhì)酸凝膠電泳 人細(xì)胞人細(xì)胞 小鼠細(xì)胞小鼠細(xì)胞 成體裸鼴鼠細(xì)胞成體裸鼴鼠細(xì)胞 胚胎裸鼴鼠細(xì)胞胚胎裸鼴鼠細(xì)胞 (Tian X, et al, 2014) (Tian X, et al, 2014) 裸鼴鼠皮膚、心臟、腦和腎組織中透明質(zhì)裸鼴鼠皮膚、心臟、腦和腎組織中透明質(zhì) 酸含量高于其他哺乳動(dòng)物(荷蘭豬和小鼠)酸含量高于其他哺乳動(dòng)物(荷蘭豬和小鼠) 阿辛藍(lán)染色: 藍(lán)色標(biāo)記軟 骨和結(jié)締組 織中的透明 質(zhì)酸 透明質(zhì)酸合成酶基因透明質(zhì)酸合成

9、酶基因HAS2HAS2的高表達(dá)是成的高表達(dá)是成 體裸鼴鼠透明質(zhì)酸含量高的原因體裸鼴鼠透明質(zhì)酸含量高的原因 成體裸鼴鼠成體裸鼴鼠 胚胎裸鼴鼠胚胎裸鼴鼠人人小鼠小鼠 (Tian X, et al, 2014) 推測(cè)推測(cè):透明質(zhì)酸透明質(zhì)酸 的高表達(dá)維持成的高表達(dá)維持成 體結(jié)締組織的彈體結(jié)締組織的彈 性,并增強(qiáng)成體性,并增強(qiáng)成體 細(xì)胞的接觸抑制,細(xì)胞的接觸抑制, 起到抗衰老和抗起到抗衰老和抗 腫瘤的作用。腫瘤的作用。 裸鼴鼠裸鼴鼠HAS2HAS2具有兩個(gè)獨(dú)特的保守氨基酸突變具有兩個(gè)獨(dú)特的保守氨基酸突變 (Tian X, et al, 2014) 第一節(jié) 酶的分子結(jié)構(gòu)與功能 一. 酶的作用特點(diǎn) 二. 酶

10、的化學(xué)結(jié)構(gòu) 三. 酶的活性中心與催化活性 四. 同工酶 一. 酶的作用特點(diǎn) 1. 高度催化效率 一. 酶的作用特點(diǎn) 2. 高度專一性 一種酶僅作用于一種或一類化合物(一種酶僅作用于一種或一類化合物(底物,底物,substrate),), 或一定的化學(xué)鍵,催化一定的化學(xué)反應(yīng)并生成一定的產(chǎn)物?;蛞欢ǖ幕瘜W(xué)鍵,催化一定的化學(xué)反應(yīng)并生成一定的產(chǎn)物。 酶的這種特性稱為酶的特異性或?qū)R恍裕傅倪@種特性稱為酶的特異性或?qū)R恍裕╯pecificity)。 根據(jù)酶對(duì)其底物結(jié)構(gòu)選擇的嚴(yán)格程度不同,根據(jù)酶對(duì)其底物結(jié)構(gòu)選擇的嚴(yán)格程度不同, 酶的特異性可大致分為以下酶的特異性可大致分為以下3 3種類型:種類型: 絕對(duì)特

11、異性絕對(duì)特異性(absolute specificity):只能作只能作 用于特定結(jié)構(gòu)的底物,進(jìn)行一種專一的反應(yīng),用于特定結(jié)構(gòu)的底物,進(jìn)行一種專一的反應(yīng), 生成一種特定結(jié)構(gòu)的產(chǎn)物生成一種特定結(jié)構(gòu)的產(chǎn)物 。 相對(duì)特異性相對(duì)特異性(relative specificity):作用于一作用于一 類化合物或一種化學(xué)鍵。類化合物或一種化學(xué)鍵。 立體結(jié)構(gòu)特異性立體結(jié)構(gòu)特異性(stereo specificity):作用于作用于 立體異構(gòu)體中的一種。立體異構(gòu)體中的一種。 1. 1.有的酶對(duì)其底物具有極其嚴(yán)格的絕對(duì)專一性有的酶對(duì)其底物具有極其嚴(yán)格的絕對(duì)專一性 有的酶僅對(duì)一種特定結(jié)構(gòu)的底物起催化作有的酶僅對(duì)一種

12、特定結(jié)構(gòu)的底物起催化作 用,產(chǎn)生具有特定結(jié)構(gòu)的產(chǎn)物。酶對(duì)底物的這用,產(chǎn)生具有特定結(jié)構(gòu)的產(chǎn)物。酶對(duì)底物的這 種極其嚴(yán)格的選擇性稱為絕對(duì)特異性(種極其嚴(yán)格的選擇性稱為絕對(duì)特異性(absolute specificity)。)。 脲酶僅水解尿素,對(duì)甲基尿素則無(wú)反應(yīng)。脲酶僅水解尿素,對(duì)甲基尿素則無(wú)反應(yīng)。 絕對(duì)特異性絕對(duì)特異性 脲酶、脲酶、L-精氨酸酶:精氨酸酶: L-精氨酸精氨酸 L-鳥氨酸鳥氨酸 + 尿素尿素 NH2 C = O + H2O CO2 + 2NH3 NH2 NH2 C=O NH CH3 2. 2.多數(shù)酶對(duì)其底物具有相對(duì)特異性多數(shù)酶對(duì)其底物具有相對(duì)特異性 多數(shù)酶可對(duì)一類化合物或一種化學(xué)鍵

13、起催多數(shù)酶可對(duì)一類化合物或一種化學(xué)鍵起催 化作用,這種對(duì)底物分子不太嚴(yán)格的選擇性稱化作用,這種對(duì)底物分子不太嚴(yán)格的選擇性稱 為為相對(duì)特異性相對(duì)特異性(relative specificity)。)。 脂肪酶不僅水解脂肪,也可水解簡(jiǎn)單的酯。脂肪酶不僅水解脂肪,也可水解簡(jiǎn)單的酯。 胰蛋白酶水解由堿性氨基酸(精氨酸和賴胰蛋白酶水解由堿性氨基酸(精氨酸和賴 氨酸)的羧基所形成的肽鍵。氨酸)的羧基所形成的肽鍵。 人體內(nèi)有多種蛋白激酶,它們均催化底物蛋白質(zhì)人體內(nèi)有多種蛋白激酶,它們均催化底物蛋白質(zhì) 絲氨酸(或蘇氨酸)殘基上羥基的磷酸化絲氨酸(或蘇氨酸)殘基上羥基的磷酸化 蛋白激酶蛋白激酶共有序列共有序列

14、蛋白激酶蛋白激酶A-X-R-(R/K)-X-(S/T)-X- 蛋白激酶蛋白激酶C -X-(R/K1-3,X0-2)-(S/T)-(X0- 2,R/K1-3)-X 蛋白激酶蛋白激酶G-X-(R/K)2-3-X-(S/T)-X- Ca2+/鈣調(diào)素蛋白激酶鈣調(diào)素蛋白激酶H-X-R-X-X-(S/T)-X- 各種蛋白酶對(duì)肽鍵的專一性各種蛋白酶對(duì)肽鍵的專一性 (三)有些酶僅對(duì)底物分子的某種構(gòu)型起(三)有些酶僅對(duì)底物分子的某種構(gòu)型起 催化作用催化作用 酶對(duì)空間構(gòu)型所具有的特異性要求稱為酶對(duì)空間構(gòu)型所具有的特異性要求稱為 立體異構(gòu)特異性立體異構(gòu)特異性(stereo specificity) 延胡索酸酶僅對(duì)延

15、胡索酸延胡索酸酶僅對(duì)延胡索酸( (反丁烯二酸反丁烯二酸) )起起 催化作用,將其加水生成蘋果酸,對(duì)順丁烯催化作用,將其加水生成蘋果酸,對(duì)順丁烯 二酸則無(wú)作用二酸則無(wú)作用 (三)有些酶僅對(duì)底物分子的某種構(gòu)型起(三)有些酶僅對(duì)底物分子的某種構(gòu)型起 催化作用催化作用 酶對(duì)空間構(gòu)型所具有的特異性要求稱為酶對(duì)空間構(gòu)型所具有的特異性要求稱為 立體異構(gòu)特異性立體異構(gòu)特異性(stereo specificity) L-L-乳酸脫氫酶只能催化乳酸脫氫酶只能催化L-L-乳酸脫氫,而對(duì)乳酸脫氫,而對(duì) D-D-乳酸無(wú)催化作用;乳酸無(wú)催化作用; 淀粉酶只能水解淀粉,而不能水解纖維淀粉酶只能水解淀粉,而不能水解纖維 素。

16、素。 HOOCCH HOOCCH + H2O HOOCCH HCCOOH + H2O CH2COOH CH COOH OH L-Mal 延胡索酸酶延胡索酸酶 延胡索酸延胡索酸 一. 酶的作用特點(diǎn) 3. 高度不穩(wěn)定性 絕對(duì)多數(shù)酶的化學(xué)本質(zhì)是蛋白質(zhì) 大多數(shù)酶要在常溫常壓和接近中性的條 件下進(jìn)行。 蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)破壞而引起變性蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)破壞而引起變性 在某些物理和化學(xué)因素作用下,其特定的在某些物理和化學(xué)因素作用下,其特定的 空間構(gòu)象被破壞,也即有序的空間結(jié)構(gòu)變成無(wú)空間構(gòu)象被破壞,也即有序的空間結(jié)構(gòu)變成無(wú) 序的空間結(jié)構(gòu),從而導(dǎo)致其理化性質(zhì)改變和生序的空間結(jié)構(gòu),從而導(dǎo)致其理化性質(zhì)改變和生 物活性的喪

17、失。物活性的喪失。 n蛋白質(zhì)的變性蛋白質(zhì)的變性(denaturation) Protein denaturation Can be denatured depending on chemical environment Heat Chemical denaturant pH High pressure n造成變性的因素造成變性的因素: : 如如加熱、乙醇等有機(jī)溶劑、強(qiáng)酸、強(qiáng)堿、加熱、乙醇等有機(jī)溶劑、強(qiáng)酸、強(qiáng)堿、 重金屬離子及生物堿試劑等重金屬離子及生物堿試劑等 。 n變性的本質(zhì)變性的本質(zhì): : 破壞非共價(jià)鍵和二硫鍵,不改變蛋白破壞非共價(jià)鍵和二硫鍵,不改變蛋白 質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)。質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)。 一.

18、 酶的作用特點(diǎn) 4. 可調(diào)節(jié)性 1)酶活性的調(diào)節(jié) 2)酶量的調(diào)節(jié) 酶的調(diào)節(jié)酶的調(diào)節(jié) 酶含量調(diào)節(jié):酶含量調(diào)節(jié): 酶活性調(diào)節(jié):酶活性調(diào)節(jié): Stimulate appetite Leptin lepr lepr POMC neuronsAgRP neurons ARC PVN MC4R a-MSH NPY AgRP Decrease food intake Ro273225 melanocortin MC4 receptor agonist激動(dòng)劑 SHU9119 melanocortin MC4 receptor antagonist拮抗劑 Acetyl-Nle4, Asp5, D-2-Nal7,

19、 Lys10-cyclo-Melanocyte Stimulating Hormone Amide Fragment 4-10 二.酶的化學(xué)結(jié)構(gòu) 1. 酶的化學(xué)組成 2. 酶的輔因子 有些酶僅含一條多肽鏈,而另一些酶有些酶僅含一條多肽鏈,而另一些酶 由多個(gè)亞基組成由多個(gè)亞基組成 單體酶單體酶(monomeric enzyme) 由一條多肽鏈組成,只具有三級(jí)結(jié)構(gòu)的酶。由一條多肽鏈組成,只具有三級(jí)結(jié)構(gòu)的酶。 如核糖核酸酶、一些腸道蛋白水解酶、溶菌酶。如核糖核酸酶、一些腸道蛋白水解酶、溶菌酶。 寡聚酶寡聚酶(oligomeric enzyme) 由多條相同或不同的亞基組成的酶。由多條相同或不同的亞基

20、組成的酶。 多酶復(fù)合物多酶復(fù)合物(multienzyme complex),), 或稱或稱多酶體系多酶體系(multienzyme system) 由催化不同化學(xué)反應(yīng)的多種酶組成的寡聚酶。由催化不同化學(xué)反應(yīng)的多種酶組成的寡聚酶。 如:丙酮酸脫氫酶復(fù)合物如:丙酮酸脫氫酶復(fù)合物 同工酶同工酶(isoenzyme,isozyme) 催化相同化學(xué)反應(yīng)但亞基種類不盡相同的一組酶。催化相同化學(xué)反應(yīng)但亞基種類不盡相同的一組酶。 多功能酶多功能酶(multifunctional enzyme) 或稱或稱串聯(lián)酶串聯(lián)酶(tandem enzyme) 多種催化功能融合于一條多肽鏈的酶多種催化功能融合于一條多肽鏈的酶

21、 如:哺乳動(dòng)物脂肪酸如:哺乳動(dòng)物脂肪酸 二.酶的化學(xué)結(jié)構(gòu) 1. 酶的化學(xué)組成 1)單純酶 2)結(jié)合酶 (一)結(jié)構(gòu)組成僅含氨基酸組分的酶稱為單純酶(一)結(jié)構(gòu)組成僅含氨基酸組分的酶稱為單純酶 有些酶其分子結(jié)構(gòu)僅由蛋白質(zhì)組成,沒(méi)有輔有些酶其分子結(jié)構(gòu)僅由蛋白質(zhì)組成,沒(méi)有輔 助因子。這類酶稱為助因子。這類酶稱為單純酶單純酶(simple enzyme)。)。 如脲酶、一些蛋白酶、淀粉酶、酯酶和核糖如脲酶、一些蛋白酶、淀粉酶、酯酶和核糖 核酸酶等。核酸酶等。 (二)結(jié)構(gòu)組成中既含蛋白質(zhì)組分又含非蛋(二)結(jié)構(gòu)組成中既含蛋白質(zhì)組分又含非蛋 白質(zhì)組分的酶稱為結(jié)合酶白質(zhì)組分的酶稱為結(jié)合酶 結(jié)合酶結(jié)合酶(conju

22、gated enzyme)是除了在其組)是除了在其組 成中含有由氨基酸組成的蛋白質(zhì)部分外,還含有成中含有由氨基酸組成的蛋白質(zhì)部分外,還含有 非蛋白質(zhì)部分非蛋白質(zhì)部分 蛋白質(zhì)部分:酶蛋白蛋白質(zhì)部分:酶蛋白 ( (apoenzyme) 輔助因子輔助因子 (cofactor) 金屬離子金屬離子 小分子有機(jī)化合物小分子有機(jī)化合物 全酶全酶 (holoenzyme) 決定反應(yīng)的特異性及其催化機(jī)制決定反應(yīng)的特異性及其催化機(jī)制 決定反應(yīng)的性決定反應(yīng)的性 質(zhì)和反應(yīng)類型質(zhì)和反應(yīng)類型 二.酶的化學(xué)結(jié)構(gòu) 2. 酶的輔因子 1)金屬離子對(duì)酶的作用 2)維生素與輔酶的關(guān)系 輔助因子分類輔助因子分類 (按其與酶蛋白結(jié)合的

23、緊密程度與作用特點(diǎn))(按其與酶蛋白結(jié)合的緊密程度與作用特點(diǎn)) 輔酶輔酶 (coenzyme): 與酶蛋白結(jié)合疏松,可用透析或超濾的與酶蛋白結(jié)合疏松,可用透析或超濾的 方法除去。方法除去。 輔基輔基 (prosthetic group): 與酶蛋白結(jié)合緊密,不能用透析或超與酶蛋白結(jié)合緊密,不能用透析或超 濾的方法除去濾的方法除去。 二.酶的化學(xué)結(jié)構(gòu) 2. 酶的輔因子 1)金屬離子對(duì)酶的作用 金屬離子是最常見(jiàn)的輔因子,約2/3的酶含 有金屬離子 金屬酶金屬酶(metalloenzyme) 金屬離子與酶結(jié)合緊密,提取過(guò)程中不易丟失。金屬離子與酶結(jié)合緊密,提取過(guò)程中不易丟失。 金屬激活酶金屬激活酶(m

24、etal-activated enzyme) 金屬離子為酶的活性所必需,但與酶的結(jié)合不甚金屬離子為酶的活性所必需,但與酶的結(jié)合不甚 緊密。緊密。 金屬酶金屬酶金屬離子金屬離子 金屬激活酶金屬激活酶金屬離子金屬離子 過(guò)氧化氫酶過(guò)氧化氫酶Fe2+丙酮酸激酶丙酮酸激酶K+,Mg2+ 過(guò)氧化物酶過(guò)氧化物酶Fe2+丙酮酸羧化酶丙酮酸羧化酶Mn2+,Zn2+ 谷胱苷肽過(guò)氧化物酶谷胱苷肽過(guò)氧化物酶 Se蛋白激酶蛋白激酶Mg2+,Mn2+ 己糖激酶己糖激酶Mg2+精氨酸酶精氨酸酶Mn2+ 固氮酶固氮酶Mo2+磷脂酶磷脂酶C CCa2+ 核糖核苷酸還原酶核糖核苷酸還原酶Mn2+細(xì)胞色素氧化酶細(xì)胞色素氧化酶 Cu

25、2+ 羧基肽酶羧基肽酶Zn2+脲酶脲酶Ni2+ 碳酸酐酶碳酸酐酶Zn2+檸檬酸合酶檸檬酸合酶K+ 金屬酶和金屬激活酶金屬酶和金屬激活酶 金屬離子的作用金屬離子的作用 維持并穩(wěn)定酶的構(gòu)象;維持并穩(wěn)定酶的構(gòu)象; 參與酶活性中心組成,形成正確的空間排列;參與酶活性中心組成,形成正確的空間排列; 在酶與底物間起橋梁連接作用,三元復(fù)合體;在酶與底物間起橋梁連接作用,三元復(fù)合體; 通過(guò)自身的氧化還原在酶分子間傳遞電子;通過(guò)自身的氧化還原在酶分子間傳遞電子; 中和陰離子,降低反應(yīng)中的靜電斥力等。中和陰離子,降低反應(yīng)中的靜電斥力等。 二.酶的化學(xué)結(jié)構(gòu) 2. 酶的輔因子 2)維生素對(duì)酶的作用 作為酶輔因子的小分

26、子有機(jī)化合物多為維生素作為酶輔因子的小分子有機(jī)化合物多為維生素 結(jié)構(gòu),在酶促反應(yīng)中起運(yùn)載體的作用,傳遞電結(jié)構(gòu),在酶促反應(yīng)中起運(yùn)載體的作用,傳遞電 子、質(zhì)子或其它基團(tuán)子、質(zhì)子或其它基團(tuán)。 小分子有機(jī)化合物在催化中的作用小分子有機(jī)化合物在催化中的作用 尼克酰胺(維生素尼克酰胺(維生素PP之一)之一) 尼克酰胺(維生素尼克酰胺(維生素PP之一)之一) 維生素維生素B2(核黃素)(核黃素) 維生素維生素B2(核黃素)(核黃素) 維生素維生素B1(硫胺素)(硫胺素) 泛酸泛酸 硫辛酸硫辛酸 維生素維生素B12 生物素生物素 吡哆醛(維生素吡哆醛(維生素B6之一)之一) 葉酸葉酸 NAD+(尼克酰胺腺嘌呤

27、二核(尼克酰胺腺嘌呤二核 苷酸,輔酶苷酸,輔酶I) NADP+(尼克酰胺腺嘌呤二核(尼克酰胺腺嘌呤二核 苷酸磷酸,輔酶苷酸磷酸,輔酶II) FMN (黃素單核苷酸)(黃素單核苷酸) FAD(黃素腺嘌呤二核苷酸)(黃素腺嘌呤二核苷酸) TPP(焦磷酸硫胺素)(焦磷酸硫胺素) 輔酶輔酶A(CoA) 硫辛酸硫辛酸 鈷胺素輔酶類鈷胺素輔酶類 生物素生物素 磷酸吡哆醛磷酸吡哆醛 四氫葉酸四氫葉酸 氫原子(質(zhì)子)氫原子(質(zhì)子) 醛基醛基 酰基?;?烷基烷基 二氧化碳二氧化碳 氨基氨基 甲基、甲烯基、甲基、甲烯基、 甲炔基、甲?;兹不?、甲酰基 等一碳單位等一碳單位 所含的維生素所含的維生素名名稱稱 小分子

28、有機(jī)化合物小分子有機(jī)化合物(輔輔 酶酶 或或 輔輔 基基) 轉(zhuǎn)移的基團(tuán)轉(zhuǎn)移的基團(tuán) 尼克酰胺(維生素尼克酰胺(維生素PP之一)之一) 尼克酰胺(維生素尼克酰胺(維生素PP之一)之一) 維生素維生素B2(核黃素)(核黃素) 維生素維生素B2(核黃素)(核黃素) 維生素維生素B1(硫胺素)(硫胺素) 泛酸泛酸 硫辛酸硫辛酸 維生素維生素B12 生物素生物素 吡哆醛(維生素吡哆醛(維生素B6之一)之一) 葉酸葉酸 NAD+(尼克酰胺腺嘌呤二核(尼克酰胺腺嘌呤二核 苷酸,輔酶苷酸,輔酶I) NADP+(尼克酰胺腺嘌呤二核(尼克酰胺腺嘌呤二核 苷酸磷酸,輔酶苷酸磷酸,輔酶II) FMN (黃素單核苷酸)(

29、黃素單核苷酸) FAD(黃素腺嘌呤二核苷酸)(黃素腺嘌呤二核苷酸) TPP(焦磷酸硫胺素)(焦磷酸硫胺素) 輔酶輔酶A(CoA) 硫辛酸硫辛酸 鈷胺素輔酶類鈷胺素輔酶類 生物素生物素 磷酸吡哆醛磷酸吡哆醛 四氫葉酸四氫葉酸 氫原子(質(zhì)子)氫原子(質(zhì)子) 醛基醛基 ?;;?烷基烷基 二氧化碳二氧化碳 氨基氨基 甲基、甲烯基、甲基、甲烯基、 甲炔基、甲?;兹不⒓柞;?等一碳單位等一碳單位 所含的維生素所含的維生素名名稱稱 小分子有機(jī)化合物小分子有機(jī)化合物(輔輔 酶酶 或或 輔輔 基基) 轉(zhuǎn)移的基團(tuán)轉(zhuǎn)移的基團(tuán) 維生素與輔酶維生素與輔酶 過(guò)去的過(guò)去的50 50 年中已經(jīng)發(fā)現(xiàn)年中已經(jīng)發(fā)現(xiàn)1313種

30、維生素是種維生素是 人類所必需的。人類所必需的。 這些維生素是體內(nèi)許多酶的輔酶成分。這些維生素是體內(nèi)許多酶的輔酶成分。 因此維生素具有高效的營(yíng)養(yǎng)。因此維生素具有高效的營(yíng)養(yǎng)。 是維持正常細(xì)胞功能所必需的是維持正常細(xì)胞功能所必需的, ,許多動(dòng)許多動(dòng) 物不能合成物不能合成, ,必須由食物供給。必須由食物供給。 維生素與輔酶維生素與輔酶 維生素種類:維生素種類: 脂溶性:脂溶性: A、D、E、K 水溶性:水溶性: Vit C Vit B 族族 在體內(nèi)大多數(shù)轉(zhuǎn)化為輔酶在體內(nèi)大多數(shù)轉(zhuǎn)化為輔酶, ,有些直接參有些直接參 與催化與催化 都含有氮原子都含有氮原子 Vit B1(硫胺素硫胺素,thiamine)

31、硫胺素焦磷酸硫胺素焦磷酸, , thiamine pyrophosphate, TPP 作用作用: :轉(zhuǎn)酮基轉(zhuǎn)酮基 舉例舉例: -酮戊二酸脫氫酶酮戊二酸脫氫酶, , 丙酮酸脫羧酶丙酮酸脫羧酶 Vit B2 (核黃素核黃素,riboflavin) 主要以主要以FAD和和FMN形式存在:形式存在: 黃素腺嘌呤二核苷酸,黃素腺嘌呤二核苷酸,flavin adenine dinucleotide, FAD :琥珀酸脫氫酶琥珀酸脫氫酶 黃素單核苷酸,黃素單核苷酸, flavin mononucleotide , FMN :NADH 脫氫酶脫氫酶 作用:參與氧化還原反應(yīng),遞氫作用:參與氧化還原反應(yīng),遞氫

32、Vit PP(煙酰胺,尼克酰胺煙酰胺,尼克酰胺) 煙酰胺嘌呤二核苷酸煙酰胺嘌呤二核苷酸 :蘋果酸脫氫酶:蘋果酸脫氫酶 煙酰胺嘌呤二核苷酸磷酸煙酰胺嘌呤二核苷酸磷酸 :蘋果酸酶:蘋果酸酶 作用:參與氧化還原反應(yīng),遞氫、遞電子作用:參與氧化還原反應(yīng),遞氫、遞電子 維生素維生素 B6(吡哆醛,吡哆胺吡哆醛,吡哆胺) 輔酶形式:磷酸吡哆醛,磷酸吡哆胺輔酶形式:磷酸吡哆醛,磷酸吡哆胺 舉例:所有的舉例:所有的 轉(zhuǎn)氨酶轉(zhuǎn)氨酶 氨基酸脫羧酶:氨基酸脫羧酶: L-谷氨酸脫羧酶谷氨酸脫羧酶 絲氨酸羥甲基轉(zhuǎn)移酶絲氨酸羥甲基轉(zhuǎn)移酶 作用:轉(zhuǎn)氨基作用、脫羧作用作用:轉(zhuǎn)氨基作用、脫羧作用 目目 錄錄 泛酸泛酸(pant

33、othenic acid) 輔酶形式輔酶形式: : 輔酶輔酶A HSCoA:脂酰輔酶脂酰輔酶A合成酶合成酶 作用作用: : 轉(zhuǎn)?;饔棉D(zhuǎn)酰基作用 生物素生物素biotin 輔基形式輔基形式: : 與酶蛋白賴氨酸殘基側(cè)鏈上的與酶蛋白賴氨酸殘基側(cè)鏈上的 氨基共價(jià)結(jié)氨基共價(jià)結(jié) 合合 舉例舉例: : 丙酮酸羧化酶丙酮酸羧化酶 作用作用: : 羧基載體羧基載體 葉酸葉酸(folic acid) 輔酶形式輔酶形式: : 四氫葉酸:四氫葉酸: tetrahydrofolic acidtetrahydrofolic acid , FH4 ,THFA 舉例舉例: : TMP合成酶合成酶 作用作用: : 一碳單位

34、載體一碳單位載體 維生素維生素B12 (鈷胺素鈷胺素,coholamine) 谷胺酰和甲基谷氨是谷胺酰和甲基谷氨是B12 的兩種輔酶形式的兩種輔酶形式 作用作用: : 甲基載體甲基載體 舉例舉例:已知已知B12是幾種變位酶的是幾種變位酶的 輔酶,如催化輔酶,如催化Glu轉(zhuǎn)變?yōu)榧谆D(zhuǎn)變?yōu)榧谆?Asp的甲基天冬氨酸變位酶、催的甲基天冬氨酸變位酶、催 化甲基丙二?;谆oA轉(zhuǎn)變?yōu)殓贽D(zhuǎn)變?yōu)殓?酰酰CoA的的甲基丙二酰的的甲基丙二酰CoA變變 位酶。位酶。B12輔酶也參與甲基及其輔酶也參與甲基及其 他一碳單位的轉(zhuǎn)移反應(yīng)。他一碳單位的轉(zhuǎn)移反應(yīng)。 維生素B12是唯一含金屬元素的維生素,含有3價(jià)鈷

35、的多環(huán)系化合物。 三.酶的活性中心與催化活性 1. 酶的活性中心和必需基團(tuán) 酶活性中心是酶與底物結(jié)合并將底物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物的部位酶活性中心是酶與底物結(jié)合并將底物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物的部位 或稱活性部位或稱活性部位(active site),指酶分子中指酶分子中 與底物特異結(jié)合并催化底物轉(zhuǎn)變?yōu)楫a(chǎn)物的區(qū)與底物特異結(jié)合并催化底物轉(zhuǎn)變?yōu)楫a(chǎn)物的區(qū) 域;其中一些與酶的活性密切相關(guān)的化學(xué)基域;其中一些與酶的活性密切相關(guān)的化學(xué)基 團(tuán)稱作酶的必需基團(tuán)。團(tuán)稱作酶的必需基團(tuán)。 酶的活性中心酶的活性中心( (active center) ) 酶的活性中心由許多必需基團(tuán)組成酶的活性中心由許多必需基團(tuán)組成 必需基團(tuán)必需基團(tuán)(essen

36、tial group) 酶分子中氨基酸殘基側(cè)鏈的化學(xué)基團(tuán)中酶分子中氨基酸殘基側(cè)鏈的化學(xué)基團(tuán)中, 與酶活性密切相關(guān)的化學(xué)基團(tuán)與酶活性密切相關(guān)的化學(xué)基團(tuán)。 常見(jiàn)的必需基團(tuán)常見(jiàn)的必需基團(tuán) 絲氨酸殘基的絲氨酸殘基的羥基羥基 組氨酸殘基的組氨酸殘基的咪唑基咪唑基 半胱氨酸殘基的半胱氨酸殘基的巰基巰基 酸性氨基酸殘基的酸性氨基酸殘基的羧基羧基 底底 物物 活性中心以外活性中心以外 的必需基團(tuán)的必需基團(tuán) 結(jié)合基團(tuán)結(jié)合基團(tuán) 催化基團(tuán)催化基團(tuán) 活性中心活性中心 目目 錄錄 酶的活性中心是酶分子中具有三維結(jié)構(gòu)的很小區(qū)域酶的活性中心是酶分子中具有三維結(jié)構(gòu)的很小區(qū)域 組成酶活性中組成酶活性中 心的必需基團(tuán)在心的必需基

37、團(tuán)在一一 級(jí)結(jié)構(gòu)上可能相距級(jí)結(jié)構(gòu)上可能相距 很遠(yuǎn)很遠(yuǎn),但在形成,但在形成三三 級(jí)結(jié)構(gòu)時(shí)相互接近級(jí)結(jié)構(gòu)時(shí)相互接近, 形成具有三維結(jié)構(gòu)形成具有三維結(jié)構(gòu) 的區(qū)域,且多是酶的區(qū)域,且多是酶 分子中的裂隙或凹分子中的裂隙或凹 陷所形成的疏水口陷所形成的疏水口 袋。袋。 溶菌酶的活性中心溶菌酶的活性中心 結(jié)合基團(tuán)結(jié)合基團(tuán) binding group 催化基團(tuán)催化基團(tuán) (catalytic group) 催化底物轉(zhuǎn)變成產(chǎn)物催化底物轉(zhuǎn)變成產(chǎn)物 位于活性中心以外,維持酶活性中心應(yīng)有位于活性中心以外,維持酶活性中心應(yīng)有 的空間構(gòu)象所必需。的空間構(gòu)象所必需。 三.酶的活性中心與催化活性 2. 酶的活性中心與其催化作

38、用 相似催化作用的酶具有結(jié)構(gòu)相似的活性中心 許多蛋白酶的活性中心均含有絲氨酸和組氨酸殘基,其附 近的氨基酸序列也相似 三.酶的活性中心與催化活性 3. 酶的活性中心與酶的專一性 胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶和彈性蛋白酶活性中心胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶和彈性蛋白酶活性中心“口袋口袋” 催化堿性氨基酸(賴氨酸、精氨酸)的羧基所形成的肽鍵水解 催化芳香族氨基酸(苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸)的羧基所形成的肽鍵水解 鹽鍵 疏水鍵 酶的活性中心與整個(gè)酶分子密不可分酶的活性中心與整個(gè)酶分子密不可分 多功能酶多功能酶(multifunctional enzyme) 或稱或稱串聯(lián)酶串聯(lián)酶(tandem enzyme) 多

39、種催化功能融合于一條多肽鏈的酶多種催化功能融合于一條多肽鏈的酶 如:哺乳動(dòng)物脂肪酸如:哺乳動(dòng)物脂肪酸 四.同工酶 * * 定義定義 同工酶同工酶(isoenzyme)是指催化相同的是指催化相同的 化學(xué)反應(yīng),而酶蛋白的分子結(jié)構(gòu)理化性化學(xué)反應(yīng),而酶蛋白的分子結(jié)構(gòu)理化性 質(zhì)乃至免疫學(xué)性質(zhì)不同的一組酶。質(zhì)乃至免疫學(xué)性質(zhì)不同的一組酶。 乳酸脫氫酶的同工酶乳酸脫氫酶的同工酶 LDH催化乳酸與丙酮酸之間的氧化還原反應(yīng),分型 骨骼肌型,對(duì)NAD+親和力較小,心肌型,對(duì)NAD+親和力較大 同工酶在生物體中的表達(dá)分布具有時(shí)同工酶在生物體中的表達(dá)分布具有時(shí) 空特異性空特異性 同工酶同工酶存在于同一種屬的不同個(gè)體,同

40、一個(gè)體存在于同一種屬的不同個(gè)體,同一個(gè)體 的不同組織、同一細(xì)胞的不同亞細(xì)胞結(jié)構(gòu),以及同的不同組織、同一細(xì)胞的不同亞細(xì)胞結(jié)構(gòu),以及同 一組織、細(xì)胞的不同發(fā)育階段。一組織、細(xì)胞的不同發(fā)育階段。 LDHLDH同工酶同工酶紅細(xì)胞紅細(xì)胞白細(xì)胞白細(xì)胞血清血清骨骼肌骨骼肌心肌心肌肺肺腎腎肝肝脾脾 LDHLDH1 1 (H H4 4)4343121227.127.10 07373141443432 21010 LDHLDH2 2 (H H3 3MM)4444494934.734.70 02424343444444 42525 LDHLDH3 3(H H2 2MM2 2)1212333320.920.95 53

41、 33535121211111010 LDHLDH4 4 (HMHM3 3)1 16 611.711.716160 05 51 127272020 LDHLDH5 5 (MM4 4)0 00 05.75.779790 012120 056565 5 人體各組織器官人體各組織器官LDHLDH同工酶譜(活性同工酶譜(活性%) 檢測(cè)組織器官同工酶譜的變化有重要檢測(cè)組織器官同工酶譜的變化有重要 的臨床意義的臨床意義 在代謝調(diào)節(jié)上起著在代謝調(diào)節(jié)上起著 重要的作用;重要的作用; 用于解釋發(fā)育過(guò)程用于解釋發(fā)育過(guò)程 中階段特有的代謝特征;中階段特有的代謝特征; 同工酶譜的改變有同工酶譜的改變有 助于對(duì)疾病的診

42、斷;助于對(duì)疾病的診斷; 同工酶可以作為遺同工酶可以作為遺 傳標(biāo)志,用于遺傳分析傳標(biāo)志,用于遺傳分析 研究。研究。 心肌梗死和肝病病人血清心肌梗死和肝病病人血清LDHLDH同工酶譜的變化同工酶譜的變化 1 1 酶酶 活活 性性 心肌梗死酶譜心肌梗死酶譜 正常酶譜正常酶譜 肝病酶譜肝病酶譜 2 23 34 45 5 第二節(jié) 酶的分類與命名 一. 酶的分類 二. 酶的命名 一. 酶的分類 酶可按其所催化的反應(yīng)類型進(jìn)行分類酶可按其所催化的反應(yīng)類型進(jìn)行分類 (一)催化氧化還原反應(yīng)的酶屬于氧化還原酶類(一)催化氧化還原反應(yīng)的酶屬于氧化還原酶類 氧化還原酶氧化還原酶類(類(oxidoreductases)包

43、括催化)包括催化 傳遞電子和氫、以及需氧參加反應(yīng)的酶。例如,傳遞電子和氫、以及需氧參加反應(yīng)的酶。例如, 脫氫酶類、加氧酶類、過(guò)氧化物酶和過(guò)氧化氫酶脫氫酶類、加氧酶類、過(guò)氧化物酶和過(guò)氧化氫酶 等。等。 (二)催化分子間基團(tuán)轉(zhuǎn)移的酶屬于轉(zhuǎn)移酶類(二)催化分子間基團(tuán)轉(zhuǎn)移的酶屬于轉(zhuǎn)移酶類 轉(zhuǎn)移酶轉(zhuǎn)移酶類(類(transferases)包括將磷酸基從)包括將磷酸基從 ATPATP轉(zhuǎn)到另外底物的激酶、加無(wú)機(jī)磷酸使化學(xué)轉(zhuǎn)到另外底物的激酶、加無(wú)機(jī)磷酸使化學(xué) 鍵斷裂的磷酸化酶,以及糖基轉(zhuǎn)移酶、轉(zhuǎn)氨酶鍵斷裂的磷酸化酶,以及糖基轉(zhuǎn)移酶、轉(zhuǎn)氨酶 等。等。 (三)水解酶類催化加水分解化學(xué)鍵(三)水解酶類催化加水分解化學(xué)

44、鍵 水解酶水解酶類類(hydrolases) 按其所水解的底物不同按其所水解的底物不同根據(jù)它們的作用部位根據(jù)它們的作用部位 蛋白酶、酯酶、蛋白酶、酯酶、 磷酸酶、糖苷酶、磷酸酶、糖苷酶、 核酸酶核酸酶 外切酶、內(nèi)切酶外切酶、內(nèi)切酶 (四)裂合酶催化移出化學(xué)基團(tuán)并形成雙鍵(四)裂合酶催化移出化學(xué)基團(tuán)并形成雙鍵 或相反的過(guò)程或相反的過(guò)程 裂合酶或裂解酶類裂合酶或裂解酶類(lyases)是指催化一分子非水)是指催化一分子非水 解地分裂成兩個(gè)分子并留有雙鍵,或相反的酶。解地分裂成兩個(gè)分子并留有雙鍵,或相反的酶。 如:脫水酶、脫羧酶、醛縮酶如:脫水酶、脫羧酶、醛縮酶 COOH CH CH HOOC +

45、NH (CH 2)3 CH COOH NH 2 NH 2 CNH NH (CH 2)3 CH COOH NH 2 NH 2 CN COOH CH CH 2 COOH NH (CH 2)3 CH COOH NH 2 NH 2 CN COOH CH CH 2 COOH 精氨酸代琥精氨酸代琥 珀酸裂解酶珀酸裂解酶 精氨酸代琥珀酸精氨酸代琥珀酸 精氨酸精氨酸 延胡索酸延胡索酸 合酶合酶(synthases)屬于裂解酶)屬于裂解酶 催化反應(yīng)方向相反,一個(gè)底物去掉雙鍵,并與催化反應(yīng)方向相反,一個(gè)底物去掉雙鍵,并與 另一底物結(jié)合形成一個(gè)分子另一底物結(jié)合形成一個(gè)分子 (五)催化分子異構(gòu)體互變的酶類屬于異構(gòu)酶類

46、(五)催化分子異構(gòu)體互變的酶類屬于異構(gòu)酶類 異構(gòu)酶異構(gòu)酶類類(isomerases):催化分子內(nèi)部基團(tuán)):催化分子內(nèi)部基團(tuán) 的位置互變、幾何或光學(xué)異構(gòu)體互變、以及醛酮互的位置互變、幾何或光學(xué)異構(gòu)體互變、以及醛酮互 變的酶類。變的酶類。 如:變位酶、表構(gòu)酶、異構(gòu)酶。如:變位酶、表構(gòu)酶、異構(gòu)酶。 (六)催化兩分子結(jié)合成一分子并偶聯(lián)有高(六)催化兩分子結(jié)合成一分子并偶聯(lián)有高 能鍵的水解供能的酶類屬于連接酶或能鍵的水解供能的酶類屬于連接酶或 合成酶類合成酶類 DNADNA連接酶、氨基酰連接酶、氨基酰-rRNA-rRNA合成酶、谷合成酶、谷 氨酰胺合成酶屬于氨酰胺合成酶屬于連接酶或連接酶或合成酶合成酶類

47、類(liases 或或synthetases)。)。 一. 酶的分類 酶的編號(hào) 酶的系統(tǒng)名稱和推薦名稱 酶可按其所催化的反應(yīng)類型予以命名酶可按其所催化的反應(yīng)類型予以命名 (一)系統(tǒng)名稱給出酶促反應(yīng)的各種信息,(一)系統(tǒng)名稱給出酶促反應(yīng)的各種信息, 但較繁瑣但較繁瑣 習(xí)慣命名法習(xí)慣命名法,一般是按酶所催化的底物命名,在,一般是按酶所催化的底物命名,在 其底物英文名詞上加后綴其底物英文名詞上加后綴“ase” ase” 作為酶的名稱。作為酶的名稱。 如:蛋白酶(如:蛋白酶(protease)、磷酸酶()、磷酸酶(phosphatase) 系統(tǒng)命名法系統(tǒng)命名法根據(jù)酶所催化的整體反應(yīng),按酶的分根據(jù)酶所催

48、化的整體反應(yīng),按酶的分 類對(duì)酶命名類對(duì)酶命名每個(gè)酶都有一個(gè)名稱和一個(gè)每個(gè)酶都有一個(gè)名稱和一個(gè)編號(hào)編號(hào) 編號(hào)中編號(hào)中4 4個(gè)數(shù)字中第個(gè)數(shù)字中第1 1個(gè)數(shù)字是酶的分類號(hào),第個(gè)數(shù)字是酶的分類號(hào),第2 2個(gè)數(shù)字代表個(gè)數(shù)字代表 在此類中的亞類,第在此類中的亞類,第3 3個(gè)數(shù)字表示亞個(gè)數(shù)字表示亞- -亞類,第亞類,第4 4個(gè)數(shù)字表示該酶?jìng)€(gè)數(shù)字表示該酶 在亞在亞- -亞類中的序號(hào)。亞類中的序號(hào)。 酶的分類酶的分類系統(tǒng)名稱系統(tǒng)名稱編號(hào)編號(hào)催化的反應(yīng)催化的反應(yīng)推薦名稱推薦名稱 1. 1.氧化還原氧化還原 酶類酶類 (S)-(S)-乳酸:乳酸: NADNAD+ +- -氧化還原氧化還原 酶酶 EC1.1.1.27

49、EC1.1.1.27(S)-(S)-乳酸乳酸+NAD+NAD+ + 丙酮酸丙酮酸 +NADH+H+NADH+H+ + L-L-乳酸脫乳酸脫 氫酶氫酶 2. 2.轉(zhuǎn)移酶類轉(zhuǎn)移酶類 L-L-丙氨酸:丙氨酸: - -酮酮 戊二酸氨基轉(zhuǎn)移戊二酸氨基轉(zhuǎn)移 酶酶 EC2.6.1.2EC2.6.1.2L-L-丙氨酸丙氨酸+ + - -酮戊二酸酮戊二酸 丙酮酸丙酮酸+L-+L-谷氨酸谷氨酸 丙氨酸轉(zhuǎn)丙氨酸轉(zhuǎn) 氨酶氨酶 3. 3.水解酶類水解酶類 1,4-1,4- -D-D-葡聚糖葡聚糖- - 聚糖水解酶聚糖水解酶 EC3.2.1.1EC3.2.1.1水解有水解有3 3個(gè)以上個(gè)以上1,4-1,4- -D-D-葡

50、萄糖葡萄糖 基的多糖中基的多糖中1,4-1,4- -D-D-葡糖苷鍵葡糖苷鍵 - -淀粉酶淀粉酶 4. 4.裂合酶類裂合酶類 D-D-果糖果糖-1,6-1,6-二磷二磷 酸酸D-D-甘油醛甘油醛-3-3- 磷酸裂合酶磷酸裂合酶 EC4.1.2.13EC4.1.2.13D-D-果糖果糖-1,6-1,6-二磷酸二磷酸 磷磷 酸二羥丙酮酸二羥丙酮+D-+D-甘油醛甘油醛-3-3-磷酸磷酸 果糖二磷果糖二磷 酸醛縮酶酸醛縮酶 5. 5.異構(gòu)酶類異構(gòu)酶類 D-D-甘油醛甘油醛-3-3-磷磷 酸醛酸醛- -酮酮- -異構(gòu)酶異構(gòu)酶 EC5.3.1.1EC5.3.1.1D-D-甘油醛甘油醛-3-3-磷酸磷酸

51、磷酸二羥丙酮磷酸二羥丙酮 丙糖磷酸丙糖磷酸 異構(gòu)酶異構(gòu)酶 6. 6.連接酶類連接酶類 L-L-谷氨酸:氨連谷氨酸:氨連 接酶(生成接酶(生成ADPADP) EC6.3.1.2EC6.3.1.2ATP+L-ATP+L-谷氨酸谷氨酸+NH+NH3 3 ADP+PADP+Pi i+L-+L-谷氨酰胺谷氨酰胺 谷氨酸谷氨酸- - 氨連接酶氨連接酶 酶的分類與命名舉例酶的分類與命名舉例 (二)推薦名稱簡(jiǎn)便而常用(二)推薦名稱簡(jiǎn)便而常用 由于系統(tǒng)名稱較煩瑣,國(guó)際酶學(xué)委員會(huì)還由于系統(tǒng)名稱較煩瑣,國(guó)際酶學(xué)委員會(huì)還 同時(shí)為每一個(gè)酶從常用的習(xí)慣名稱中挑選出一同時(shí)為每一個(gè)酶從常用的習(xí)慣名稱中挑選出一 個(gè)推薦名稱(個(gè)

52、推薦名稱(recommended name) 系統(tǒng)名稱:系統(tǒng)名稱:L-乳酸:乳酸:NAD+氧化還原酶氧化還原酶 推薦名稱:乳酸脫氫酶推薦名稱:乳酸脫氫酶 第三節(jié) 酶的工作原理 一. 酶促反應(yīng)活化能 二. 酶高效催化作用的機(jī)制 u 酶與一般催化劑的共同點(diǎn)酶與一般催化劑的共同點(diǎn) 在反應(yīng)前后沒(méi)有質(zhì)和量的變化;在反應(yīng)前后沒(méi)有質(zhì)和量的變化; 只能催化熱力學(xué)允許的化學(xué)反應(yīng);只能催化熱力學(xué)允許的化學(xué)反應(yīng); 只能加速可逆反應(yīng)的進(jìn)程,而不改變只能加速可逆反應(yīng)的進(jìn)程,而不改變 反應(yīng)的平衡點(diǎn)。反應(yīng)的平衡點(diǎn)。 反應(yīng)總能量改變反應(yīng)總能量改變 非催化反應(yīng)活化能非催化反應(yīng)活化能 酶促反應(yīng)酶促反應(yīng) 活化能活化能 一般催化劑催

53、一般催化劑催 化反應(yīng)的活化能化反應(yīng)的活化能 能能 量量 反反 應(yīng)應(yīng) 過(guò)過(guò) 程程 底物底物 產(chǎn)物產(chǎn)物 酶促反應(yīng)活化能的改變酶促反應(yīng)活化能的改變 活化能活化能activation energy: 底物分子從初態(tài)轉(zhuǎn)變到活化態(tài)所需的能量底物分子從初態(tài)轉(zhuǎn)變到活化態(tài)所需的能量。 過(guò)渡態(tài) transition state 活化能是化學(xué)反應(yīng)的能障 energy barrier 二. 酶高效催化作用的機(jī)制 1.酶與底物的結(jié)合 2. 酶的催化機(jī)制呈多元化 二. 酶高效催化作用的機(jī)制 1.酶與底物的結(jié)合 誘導(dǎo)契合作用 臨近效應(yīng)與定向排列 表面效應(yīng) 誘導(dǎo)契合作用誘導(dǎo)契合作用 酶酶-底物中間產(chǎn)物的形成(底物中間產(chǎn)物的形

54、成(intermediate theory) ES的形成過(guò)程是釋能反應(yīng),釋放的結(jié)合能是降低反應(yīng)活化能的主要能量來(lái)源 *誘導(dǎo)契合假說(shuō)誘導(dǎo)契合假說(shuō)(induced-fit hypothesis) 酶底物復(fù)合物酶底物復(fù)合物 E + S E + P ES 酶與底物相互接近時(shí),其結(jié)構(gòu)相互誘導(dǎo)、酶與底物相互接近時(shí),其結(jié)構(gòu)相互誘導(dǎo)、 相互變形和相互適應(yīng),進(jìn)而相互結(jié)合形成酶底相互變形和相互適應(yīng),進(jìn)而相互結(jié)合形成酶底 物復(fù)合物,催化底物轉(zhuǎn)變?yōu)椴秽哦ǖ倪^(guò)渡態(tài)。物復(fù)合物,催化底物轉(zhuǎn)變?yōu)椴秽哦ǖ倪^(guò)渡態(tài)。 這一過(guò)程稱為酶這一過(guò)程稱為酶- -底物結(jié)合的誘導(dǎo)契合假說(shuō)底物結(jié)合的誘導(dǎo)契合假說(shuō) 誘導(dǎo)契合作用誘導(dǎo)契合作用 形成酶形

55、成酶- -底物過(guò)渡態(tài)復(fù)合物過(guò)程中釋放結(jié)合能底物過(guò)渡態(tài)復(fù)合物過(guò)程中釋放結(jié)合能 底物與酶的活性中心相互誘導(dǎo)契合形成過(guò)渡態(tài)底物與酶的活性中心相互誘導(dǎo)契合形成過(guò)渡態(tài) 化合物,過(guò)渡態(tài)與酶的活性中心以次級(jí)鍵化合物,過(guò)渡態(tài)與酶的活性中心以次級(jí)鍵( (氫鍵、離氫鍵、離 子鍵、疏水鍵子鍵、疏水鍵) )相結(jié)合,這一過(guò)程是釋能反應(yīng),所釋相結(jié)合,這一過(guò)程是釋能反應(yīng),所釋 放的能量稱為放的能量稱為結(jié)合能結(jié)合能( (binding energy) )。 結(jié)合能可以抵消一部分活化能,是酶反應(yīng)降低結(jié)合能可以抵消一部分活化能,是酶反應(yīng)降低 活化能的主要能量來(lái)源。活化能的主要能量來(lái)源。 酶不能使底物形成過(guò)渡態(tài),則沒(méi)有結(jié)合能的釋酶

56、不能使底物形成過(guò)渡態(tài),則沒(méi)有結(jié)合能的釋 放,也就不能催化反應(yīng)的進(jìn)行。放,也就不能催化反應(yīng)的進(jìn)行。 羧肽酶的誘導(dǎo)契合模式羧肽酶的誘導(dǎo)契合模式 底物底物 Arg145胍基 Tyr248-OH Glu270- COO- 鄰近效應(yīng)鄰近效應(yīng)(proximity effect) 與定向排列與定向排列(orientation arrange ) 鄰近效應(yīng)鄰近效應(yīng)(proximity effect)和)和定向排列定向排列 (orientation arrange)將分子間的反應(yīng)變成類)將分子間的反應(yīng)變成類 似分子內(nèi)的反應(yīng),使反應(yīng)速率顯著提高。似分子內(nèi)的反應(yīng),使反應(yīng)速率顯著提高。 趨近和定向效應(yīng)趨近和定向效應(yīng)

57、指底物和酶的活性中心“ 靠近”和“ 定向” 酶與底物之間的親和力使底物與酶靠近,局部 微環(huán)境濃度 酶與底物結(jié)合后,酶的構(gòu)象會(huì)發(fā)生微小的變化, 使底物反應(yīng)基團(tuán)或部位正確定向于酶活性中心 雙底物也能正確定位與酶的活性中心 靠近的反應(yīng)基團(tuán)和正確的定向使反應(yīng)速度 趨近和定向效應(yīng)趨近和定向效應(yīng) 在酶反應(yīng)體系中:底物與酶隨機(jī)碰撞 底物底物 A 酶活性中心酶活性中心 底物底物 A 酶活性中心酶活性中心 底物底物 A 酶活性中心酶活性中心 不正確定向 正確定向 酶與底物間的親和力 使二者靠近,并選擇 最佳定向 趨近和定向效應(yīng)趨近和定向效應(yīng) A B 趨近,局部濃度 酶活性中心 A、B分子間反應(yīng)分子內(nèi)反應(yīng) 分子間

58、反應(yīng):要求底物濃度103108M 分子內(nèi)反應(yīng):與底物濃度無(wú)關(guān) 親和力 趨近和定向效應(yīng)趨近和定向效應(yīng) 酶與底物結(jié)合后,酶的構(gòu)象會(huì)發(fā)生變化, 使底物的反應(yīng)基團(tuán)互相有一個(gè)最易起反 應(yīng)的方向,與此同時(shí),E、S達(dá)到最大互 補(bǔ)。 自由度 E、S靠近 最適取向,反應(yīng)速度 鄰近效應(yīng)和定向排列有利于底物形成過(guò)渡態(tài)鄰近效應(yīng)和定向排列有利于底物形成過(guò)渡態(tài) 鄰近效應(yīng)鄰近效應(yīng)(proximity effect)和)和定向排列定向排列 (orientation arrange)將分子間的反應(yīng)變成類)將分子間的反應(yīng)變成類 似分子內(nèi)的反應(yīng),使反應(yīng)速率顯著提高。似分子內(nèi)的反應(yīng),使反應(yīng)速率顯著提高。 底物底物B B 底物底物A

59、A 酶酶酶酶- -底物復(fù)合物底物復(fù)合物 在疏水環(huán)境中進(jìn)行酶反應(yīng)有很大的優(yōu)越性,此在疏水環(huán)境中進(jìn)行酶反應(yīng)有很大的優(yōu)越性,此 現(xiàn)象稱為現(xiàn)象稱為表面效應(yīng)表面效應(yīng)(surface effect)。)。 酶的活性中心多位于其分子內(nèi)部的疏水酶的活性中心多位于其分子內(nèi)部的疏水“口袋口袋” 中,酶反應(yīng)在酶分子內(nèi)部的疏水環(huán)境中進(jìn)行。疏水中,酶反應(yīng)在酶分子內(nèi)部的疏水環(huán)境中進(jìn)行。疏水 環(huán)境可使底物分子脫溶劑化(環(huán)境可使底物分子脫溶劑化(desolvation),排除),排除 周圍大量水分子對(duì)酶和底物分子中功能基團(tuán)的干擾周圍大量水分子對(duì)酶和底物分子中功能基團(tuán)的干擾 性吸引或排斥,防止二者之間形成水化膜,利于底性吸引或

60、排斥,防止二者之間形成水化膜,利于底 物和酶分子之間的直接密切接觸和相互結(jié)合。物和酶分子之間的直接密切接觸和相互結(jié)合。 表面效應(yīng)有利于底物和酶的接觸與結(jié)合表面效應(yīng)有利于底物和酶的接觸與結(jié)合 胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶和彈性蛋白酶活性中心胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶和彈性蛋白酶活性中心“口袋口袋” 催化堿性氨基酸(賴氨酸、精氨酸)的羧基所形成的肽鍵水解 催化芳香族氨基酸(苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸)的羧基所形成的肽鍵水解 鹽鍵 疏水鍵 酶的活性中心多位于其分子內(nèi)部的疏水酶的活性中心多位于其分子內(nèi)部的疏水“口袋口袋”中中 二. 酶高效催化作用的機(jī)制 2.酶的催化機(jī)制呈多元化 酸堿催化 親核催化、親電子催化和共

溫馨提示

  • 1. 本站所有資源如無(wú)特殊說(shuō)明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請(qǐng)下載最新的WinRAR軟件解壓。
  • 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請(qǐng)聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
  • 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁(yè)內(nèi)容里面會(huì)有圖紙預(yù)覽,若沒(méi)有圖紙預(yù)覽就沒(méi)有圖紙。
  • 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
  • 5. 人人文庫(kù)網(wǎng)僅提供信息存儲(chǔ)空間,僅對(duì)用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護(hù)處理,對(duì)用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對(duì)任何下載內(nèi)容負(fù)責(zé)。
  • 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當(dāng)內(nèi)容,請(qǐng)與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
  • 7. 本站不保證下載資源的準(zhǔn)確性、安全性和完整性, 同時(shí)也不承擔(dān)用戶因使用這些下載資源對(duì)自己和他人造成任何形式的傷害或損失。

最新文檔

評(píng)論

0/150

提交評(píng)論