差異表達分析課件_第1頁
差異表達分析課件_第2頁
差異表達分析課件_第3頁
差異表達分析課件_第4頁
差異表達分析課件_第5頁
已閱讀5頁，還剩57頁未讀， 繼續(xù)免費閱讀

下載本文檔

版權(quán)說明：本文檔由用戶提供并上傳，收益歸屬內(nèi)容提供方，若內(nèi)容存在侵權(quán)，請進行舉報或認領(lǐng)

文檔簡介

1、BeforeAfterQuantile normalizationAffymetrix，illumina芯片由于有探針重復，可以利用統(tǒng)計方法計算出一個統(tǒng)計性的P值或者score值，篩選差異表達基因單通道單通道Oligo芯芯片，尤其是片，尤其是affymetrix芯片芯片數(shù)據(jù)分析用得數(shù)據(jù)分析用得較多較多雙通道雙通道cDNA芯片數(shù)據(jù)分析用得較多芯片數(shù)據(jù)分析用得較多基因表達數(shù)據(jù)矩陣基因表達數(shù)據(jù)矩陣 (Affymetrix GeneChip oligonucleotide arrays)sam/ref基因表達數(shù)據(jù)矩陣基因表達數(shù)據(jù)矩陣 (glass slides)數(shù)據(jù)矩陣數(shù)據(jù)矩陣, ,基因數(shù)遠大于樣品數(shù)

2、基因數(shù)遠大于樣品數(shù) 對任意一個基因來說對任意一個基因來說,樣本值是特征值樣本值是特征值,數(shù)據(jù)的維數(shù)是數(shù)據(jù)的維數(shù)是M對任意一個樣本來說對任意一個樣本來說,基因值是特征值基因值是特征值,數(shù)據(jù)的維數(shù)是數(shù)據(jù)的維數(shù)是N聚類時考慮基因之間的相似性，從數(shù)學上講聚類時考慮基因之間的相似性，從數(shù)學上講就是看對應的就是看對應的M維數(shù)據(jù)之間的相似性維數(shù)據(jù)之間的相似性新算法新算法新角度新角度合并多種方法合并多種方法降維是指將樣降維是指將樣本從輸入空間本從輸入空間通過線性或非通過線性或非線性映射到一線性映射到一個低維空間。個低維空間。 降維可以減少無用信息和冗余信息，將高維數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換降維可以減少無用信息和冗余信息，將高維數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為易于處理的低維數(shù)據(jù)，減少了后續(xù)步驟處理的計算量為易于處理的低維數(shù)據(jù)，減少了后續(xù)步驟處理的計算量，當降至三維以下時還可用于可視化技術(shù)，當降至三維以下時還可用于可視化技術(shù)，從而發(fā)揮人從而發(fā)揮人在低維空間感知上的優(yōu)點，發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)集的空間分布、聚在低維

溫馨提示

  • 1. 本站所有資源如無特殊說明，都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
  • 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等，如果需要附件，請聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
  • 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙，網(wǎng)頁內(nèi)容里面會有圖紙預覽，若沒有圖紙預覽就沒有圖紙。
  • 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
  • 5. 人人文庫網(wǎng)僅提供信息存儲空間，僅對用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護處理，對用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯，并不能對任何下載內(nèi)容負責。
  • 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當內(nèi)容，請與我們聯(lián)系，我們立即糾正。
  • 7. 本站不保證下載資源的準確性、安全性和完整性, 同時也不承擔用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。

評論

0/150

提交評論