rMATs可變剪切專有名詞

1、SE 事件AS IDGene IDGene nameAS typeNovel ASChrStrandIncLevelDiff(CTRL/PRPF8_1, APSI)P Value JunctionCountOnlyFDR JunctionCountOnlyExonStart(0base)ExonEndUpstreamESUpstreamEE DownstreamES DownstreamEEIJC CTRLSJC CTRLIJC PRPF8_1SJC PRPF8_1IncFormLenSkipFormLenAS 事件編號AS 事件所在基因ID基因名稱可變剪切類型是否為新發(fā)現可變剪切事件AS 事

2、件所在染色體編號事件位于正鏈還是負鏈該事件在兩組中發(fā)生的差值該事件在比較組中差異顯著性的P 值多重檢驗矯正后的Pvalue值發(fā)生SE事件的起始位置（被跳躍exon起始前一堿基位置）發(fā)生SE事件的終止位置（被跳躍exon終止位置）發(fā)生SE 事件上游exon起始位置發(fā)生SE 事件上游exon終止位置發(fā)生SE 事件下游exon起始位置發(fā)生SE 事件下游exon終止位置AS 事件在SAMPLE_1 中的表達量，生物學重復之間用逗號分隔，表達量的計算使用inclusion countsAS 事件在SAMPLE_1 中的表達量，表達量的計算使用skipping countsAS 事件在SAMPLE_2 中

3、的表達量，生物學重復之間用逗號分隔，表達量的計算使用inclusion countsAS 事件在SAMPLE_2 中的表達量，表達量的計算使用skipping countsInclusion isoform 對應的標準化后的長度Skipping isoform 對應的標準化后的長度IncLevel1(PSI 1)IncLevel2(PSI 2)Average IncLevel1(averagePSI 1)Inclusion level for SAMPLE_1, 生物學重復之間用逗號分隔Inclusion level for SAMPLE_2, 生物學重復之間用逗號分隔Average Incl

4、usion level 1for SAMPLE_1Average IncLevel2(averagePSI 2)Average Inclusion level 2 for SAMPLE_1Increase InclusionCTRL。PSI>0)Increase ExclusionCTRL。PSI< 0)Increase InclusionPRPF8_1。PS0)Increase ExclusionPRPF8_1。PS>0)該事件在SAMPLE_1中發(fā)生Inclusion 事件的概率大于該事件在SAMPLE_1中發(fā)生Exclusion 事件的概率大于Inclusion 事件的

5、概率小于SAMPLE_2)該事件在SAMPLE_1中發(fā)生Inclusion 事件的概率大于該事件在SAMPLE_1中發(fā)生Exclusion 事件的概率大于Inclusion 事件的概率小于SAMPLE_2)SAMPLE_2SAMPLE_2 (即,SAMPLE_2SAMPLE_2 (即,該事件在SAMPLE_1 中發(fā)生該事件在SAMPLE_1 中發(fā)生RI 事件AS IDGene IDGene nameAS typeNovel ASChrStrandriExonStart (0base)AS 事件編號AS 事件所在基因ID基因名稱可變剪切類型是否為新發(fā)現可變剪切事件AS 事件所在染色體編號事件位于

6、正鏈還是負鏈RI 事件的起始位置(被滯留exon 起始前一堿基位置)riExonEndIJC CTRLSJC CTRLIJC PRPF8_1SJC PRPF8_1IncFormLenSkipFormLenIncLevel1(PSI 1)IncLevel2(PSI 2)Average IncLevel1(averagePSI 1)Average IncLevel2(averagePSI 2)Increase InclusionCTRL。PSI>0)Increase ExclusionCTRL。PSI< 0)Increase InclusionPRPF8_1。PS0)Increase

7、ExclusionPRPF8_1。PS>0)A'5SS/A'3SS 事件SAMPLE_2SAMPLE_2 （即，該事件在SAMPLE中發(fā)生SAMPLE_2SAMPLE_2 （即，該事件在SAMPLE中發(fā)生RI 事件的起始位置（被滯留exon 終止位置）AS 事件在SAMPLE_1 中的表達量，生物學重復之間用逗號分隔，表達量的計算使用inclusion countsAS 事件在SAMPLE_1 中的表達量，表達量的計算使用skipping countsAS 事件在SAMPLE_2 中的表達量，生物學重復之間用逗號分隔，表達量的計算使用inclusion countsAS

8、事件在SAMPLE_2 中的表達量，表達量的計算使用skipping countsInclusion isoform 對應的標準化后的長度Skipping isoform 對應的標準化后的長度Inclusion level for SAMPLE_1, 生物學重復之間用逗號分隔Inclusion level for SAMPLE_2, 生物學重復之間用逗號分隔Average Inclusion level 1for SAMPLE_1Average Inclusion level 2 for SAMPLE_1該事件在SAMPLE_1中發(fā)生Inclusion事件的概率大于該事件在SAMPLE_1中發(fā)

9、生Exclusion事件的概率大于Inclusion 事件的概率小于SAMPLE_2）該事件在SAMPLE_1中發(fā)生Inclusion事件的概率大于該事件在SAMPLE_1中發(fā)生Exclusion事件的概率大于Inclusion 事件的概率小于SAMPLE_2）AS IDGene IDGene nameAS typeNovel ASChrStrandlongExonStart (0base)longExonEndshortESshortEEflankingESflankingEEIJC CTRLSJC CTRLIJC PRPF8_1SJC PRPF8_1IncFormLenSkipFormLe

10、nIncLevel1(PSI 1)IncLevel2(PSI 2)Average IncLevel1(averagePSI 1)Average IncLevel2(averageinclusion countsinclusion countsAS 事件編號AS 事件所在基因ID基因名稱可變剪切類型是否為新發(fā)現可變剪切事件AS 事件所在染色體編號事件位于正鏈還是負鏈AS 事件起始位置（被剪切的長外顯子起始前一堿基位置）AS 事件終止位置（被剪切的長外顯子終止位置）AS 事件后，短外顯子起始前一堿基位置AS 事件后，短外顯子終止位置AS 事件中與剪切端相接的exon 起始前一堿基位置AS 事件中與

11、剪切端相接的exon 終止位置AS 事件在SAMPLE_1 中的表達量，生物學重復之間用逗號分隔，表達量的計算使用AS 事件在SAMPLE_1 中的表達量，表達量的計算使用skipping countsAS 事件在SAMPLE_2 中的表達量，生物學重復之間用逗號分隔，表達量的計算使用AS 事件在SAMPLE_2 中的表達量，表達量的計算使用skipping countsInclusion isoform 對應的標準化后的長度Skipping isoform 對應的標準化后的長度Inclusion level for SAMPLE_1, 生物學重復之間用逗號分隔Inclusion level

12、for SAMPLE_2, 生物學重復之間用逗號分隔Average Inclusion level 1for SAMPLE_1Average Inclusion level 2 for SAMPLE_1PSI 2)Increase InclusionCTRL。PSI>0)Increase ExclusionCTRL。PSI< 0)Increase InclusionPRPF8_1。PS0)Increase ExclusionPRPF8_1。PS>0)MSE 事件AS IDGene IDGene nameAS typeNovel ASChrStrand1stExonStart

13、(0base)1stExonEnd2ndExonStart (0base)2ndExonEndIJC CTRL該事件在SAMPLE_1 中發(fā)生 Inclusion 事件的概率大于SAMPLE_2該事件在SAMPLE中發(fā)生Exclusion事件的概率大于SAMPLE_2 （即，該事件在SAMPLE中發(fā)生Inclusion 事件的概率小于SAMPLE_2）該事件在SAMPLE_1 中發(fā)生 Inclusion 事件的概率大于SAMPLE_2該事件在SAMPLE中發(fā)生Exclusion事件的概率大于SAMPLE_2 （即，該事件在SAMPLE中發(fā)生Inclusion 事件的概率小于SAMPLE_2）A

14、S 事件編號AS 事件所在基因ID基因名稱可變剪切類型是否為新發(fā)現可變剪切事件AS 事件所在染色體編號事件位于正鏈還是負鏈MSE事件的起始位置（被跳躍exon起始前一堿基位置，被跳躍的外顯子為前一個）MSE事件的終止位置（被跳躍exon終止位置，被跳躍的外顯子為前一個）MSE 發(fā)生SE 事件的起始位置（被跳躍exon 起始前一堿基位置，被跳躍的外顯子為后一個）MSE 發(fā)生SE 事件的起始位置（被跳躍exon 終止位置，被跳躍的外顯子為后一個）AS 事件在 SAMPLE_1 中的表達量，生物學重復之間用逗號分隔，表達量的計算使用inclusion countsSJC CTRLIJC PRPF8_

15、1SJC PRPF8_1IncFormLenSkipFormLenIncLevel1(PSI 1)IncLevel2(PSI 2)Average IncLevel1(averagePSI 1)Average IncLevel2(averagePSI 2)Increase InclusionCTRL。PSI>0)Increase ExclusionCTRL(A PSK0)Increase InclusionPRPF8_1。PSk0)Increase ExclusionPRPF8_1。PSj>0)AS 事件在SAMPLE_1 中的表達量，表達量的計算使用skipping countsA

16、S 事件在 SAMPLE_2 中的表達量，生物學重復之間用逗號分隔，表達量的計算使用inclusion countsAS 事件在SAMPLE_2 中的表達量，表達量的計算使用skipping countsInclusion isoform 對應的標準化后的長度Skipping isoform 對應的標準化后的長度Inclusion level for SAMPLE_1, 生物學重復之間用逗號分隔Inclusion level for SAMPLE_2, 生物學重復之間用逗號分隔Average Inclusion level 1for SAMPLE_1Average Inclusion level 2 fo