序列提交軟件sequin使用方法

1、1.填寫作者、聯(lián)系方式等，可以將這一部分存為模板，以后修改時(shí)可以省去大量時(shí)間。Submitting Authors2.選擇序列準(zhǔn)備方法”use the normal submission dialog”3.選擇序列格式Submission type： single sequence （單條序列）Batch submission （批量提交，適用于相似的多條序列）Sequence Format4.載入DNA序列：將DNA序列保存為FASTA格式（注意序列不要有“一”，尤其是多條序列時(shí)，較短的序 列末端可能會(huì)用“一”補(bǔ)齊，可以用記事本打開文件，刪除）。序列名稱不要超過32個(gè)字 符，可以用簡單的編號(hào)

2、。5.選擇測序、拼接方法Organism and Sequences6.添加物種名稱Organism and SequencesFile Edit| OrganisTftPxoteiMs AnnotationSequences TC376, TC740z TC407z TC?46Z TC747, and TC748 have no organisia naiaes.1StatusModifierOrganismAll jaissing (6 sequences)moltypeAll pxesent, one unique valuelocationAll pxesent , one uniqu

3、e valuetopologyAll pxesent, on unique valueqenetic codeAll pxesent , one unique valueaLLAdd Organi sms, Locations, and Genetic Codes7.補(bǔ)充蛋白信息（如果序列是編碼序列，則要提交蛋白序列信息）若為ITS序列見后用MEGA或BioEdit將DNA序列翻譯成蛋白序列，如果有含子，則先要找出含子并切除， 否則不能翻譯成功。（確定含子位置方法：先從GenBank上下載一條該基因已經(jīng)提交并注釋 好的序列，跟自己的序列比對一下，然后根據(jù)下載序列的注釋確定自己序列的含子位置）O

4、rganism and SequencesFile Edit8.注釋,頁腳.Organism and Sequences.File Edit9.添加分類地位10. mRNA添加“Name =基因全稱CDS添加“ product =基因全稱3 nnRNA口Coding Region11 .更改序列標(biāo)題（編號(hào)）；Source添加“strain =: Modifiers organism3 Organism Information12 .保存若點(diǎn)擊Done之后可以保存，則說明序列修改成功，可以提交了；若有錯(cuò)誤則會(huì)提示, 修改好之后再保存。 TC376File Edit Search Mise Ann

5、otateTarget Sequence |lC376DoneFornat I Ge 而皿k_三| Mode |sequin jJ Style社 1Double click cn an item to launch tha appropriate editor.ITS序列7.以下信息無需填寫File EditAr thosG equGnc(e):I f*- r4Y sequence rc&ds (not assenillel)&ssenbled sequences8.File EditLD.conplteLncoa(jlete ct C02K e&d全不選! Organise | Ftcins

6、 11 Annotat icn ：。Create initial nRXX vith CDS intrviLsPlease enter inf ornation about the protein ciuenoee m th spaces above. Then click on ,Inport Protein PASTA to【uod o FASTfile thot. contains the sequences. The FSTA definition Lines should te ot ths iolloving forx:ID gene=symtol protein-nane titlevhere the ond brackets ore actualLy in the text.9 .此時(shí)進(jìn)入預(yù)覽頁面會(huì)有錯(cuò)誤提示，可以忽略。10 .添加 miscRNA AnnotateGenes and Named Regions cHing Rag；cnc anH T廠欠ncr廠ipt Structural RNAsSites and BondsBibliographic an