牡丹論文牡丹 16S rDNA基因文庫 細菌種群多樣性 植物促生菌 菌株篩選_第1頁
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文檔簡介

1、牡丹論文:基于非培養(yǎng)方法的牡丹根部細菌種群多樣性研究【中文摘要】本文采用構(gòu)建16S rDNA基因克隆文庫的非培養(yǎng)方法研究了不同地區(qū)(上海、洛陽)、不同品種(鳳丹、藍芙蓉)和不同季節(jié)(冬、夏)牡丹根部細菌種群多樣性。采用五種不同DNA提取方法提取牡丹根部土壤總DNA,通過DNA濃度和純度測定以及PCR擴增電泳比較,確定Mobio土壤DNA提取試劑盒最適合牡丹根部土壤總DNA的提取。通過對16S rDNA基因克隆文庫的ARDRA分析方法,對不同地區(qū)牡丹根部細菌種群多樣性進行研究,試驗表明不同地區(qū)牡丹根部細菌種群多樣性非常豐富,其中牡丹根面樣品細菌種群多樣性低于散土和根際。另外,不同地區(qū)牡丹根部細菌

2、優(yōu)勢菌群都是變形菌門。對不同品種牡丹根部細菌種群多樣性研究表明,不同品種牡丹根部細菌種群多樣性不同,其中根際樣品的細菌種群多樣性相差最大。上海藍芙蓉根部的細菌種群多樣性高于上海鳳丹根部細菌多樣性,而洛陽地區(qū)鳳丹根部細菌多樣性高于洛陽藍芙蓉根部細菌多樣性。對不同季節(jié)牡丹根部細菌種群多樣性進行研究,試驗結(jié)果表明不同季節(jié)之間牡丹根部細菌種群多樣性有很大差異,表現(xiàn)為夏季牡丹根部細菌種群多樣性高于冬季牡丹根部細菌種群多樣性。其中,冬、夏兩季牡丹根際樣品之間的細菌.【英文摘要】Bacterial community diversity of root domains of tree peony in tw

3、o areas ( Shanghai and Luoyang ) in two varieties (FengdanandLan Furong) in two seasons ( Summer and Winter ) was studied by the cultured-independent method of constructing 16S rDNA clone libraries.The soil total DNA of tree peony root domains was extracted by five methods. Comparing to the DNA conc

4、entration and purity and PCR amplification, the DNA extraction method of Mobios kit was determined to extract soil DNA of tree peony root .【關(guān)鍵詞】牡丹 16S rDNA基因文庫 細菌種群多樣性 植物促生菌 菌株篩選【英文關(guān)鍵詞】Tree peony 16S rDNA gene library bacteria community diver-sity plant-growth promoting bacteria strain screening【索購全

5、文】聯(lián)系Q1:138113721 Q2:139938848【目錄】基于非培養(yǎng)方法的牡丹根部細菌種群多樣性研究摘要2-3ABSTRACT3-4第一章 緒論8-191.1 植物根際促生細菌研究8-111.1.1 植物根際和根際促生細菌概念8-91.1.2 植物根際促生細菌的生物多樣性91.1.3 植物根際促生細菌的功能多樣性9-111.1.3.1 對植物的直接促生作用9-101.1.3.2 對植物的間接促生作用10-111.2 植物根際促生細菌的研究方法11-161.2.1 分離培養(yǎng)(Culture-dependent)方法111.2.2 非培養(yǎng)(Culture-independent)方法11-

6、161.2.2.1 基于生理學(xué)方法(BIOLOG 微量分析)121.2.2.2 基于生物化學(xué)方法(PLFA 圖譜分析)12-131.2.2.3 基于雜交技術(shù)方法(熒光原位雜交)13-141.2.2.4 基于PCR 的分子生物學(xué)方法14-161.3 園林植物根際細菌研究16-181.3.1 園林植物根際細菌多樣性研究16-171.3.2 園林植物根際細菌功能研究17-181.4 選題依據(jù)及思路18-19第二章 牡丹根部非培養(yǎng)細菌種群多樣性19-902.1 材料和方法19-232.1.1 植物材料192.1.2 牡丹根部土壤樣品采集19-202.1.2.1 牡丹根部散土取樣192.1.2.2 牡丹

7、根際土取樣192.1.2.3 牡丹根面土取樣19-202.1.3 土壤總DNA 提取202.1.4 牡丹根部細菌16S rDNA 基因克隆文庫的構(gòu)建20-222.1.4.1 牡丹根部細菌16S rDNA 片段擴增202.1.4.2 連接反應(yīng)20-212.1.4.3 感受態(tài)細菌轉(zhuǎn)化212.1.4.4 單克隆挑取和陽性克隆鑒定21-222.1.5 ARDRA 分型222.1.6 克隆文庫評價222.1.7 序列測定和系統(tǒng)發(fā)育分析22-232.1.8 核酸序列提交232.2 實驗結(jié)果23-872.2.1 土壤總DNA 提取方法確定23-242.2.2 16S rDNA 克隆文庫的構(gòu)建及檢測242.2

8、.3 16S rDNA 克隆文庫的ARDRA 分型24-252.2.4 克隆文庫的評價25-282.2.5 核酸序列收錄號28-292.2.6 牡丹根部細菌種群多樣性特征29-782.2.6.1 夏季上海藍芙蓉根部細菌種群多樣性特征29-372.2.6.2 夏季洛陽藍芙蓉根部細菌種群多樣性特征37-442.2.6.3 夏季上海鳳丹根部細菌種群多樣性特征44-512.2.6.4 夏季洛陽鳳丹根部細菌種群多樣性特征51-602.2.6.5 冬季洛陽鳳丹根部細菌種群多樣性特征60-672.2.6.6 冬季洛陽藍芙蓉根部細菌種群多樣性特征67-732.2.6.7 冬季上海鳳丹根部細菌種群多樣性特征73-782.2.7 地區(qū)因素對牡丹根部細菌種群多樣性的影響78-812.2.8 品種因素對牡丹根部細菌種群多樣性的影響81-842.2.9 季節(jié)因素對牡丹根部細菌種群多樣性的影響84-872.3 討論87-90第三章 牡丹根部細菌功能菌株的初步篩選90-933.1 試驗材料903.1.1 供試菌株903.1.2 主要試劑903.1.3 培養(yǎng)基903.2 試驗方法90-

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