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1、歡迎各位同學(xué)參加2019年清北學(xué)堂生物學(xué)奧林匹克培訓(xùn)! 關(guān)于我的一點(diǎn)自我介紹n姓名:楊榮武 n性別:男n職稱:教授n工作單位:南京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院n電子信箱:askmenowwhoevern主講課程:生物化學(xué)n主要成績(jī):發(fā)了幾篇論文,出了幾本書奧賽動(dòng)向分析與預(yù)測(cè)與高中生物學(xué)內(nèi)容結(jié)合的越來越密切與生活的實(shí)際結(jié)合的越來越密切關(guān)心和追蹤最新進(jìn)展生化、分子與細(xì)胞這三門見真功夫!身邊的生物化學(xué)身邊的生物化學(xué)4肉堿能否減肥?4“皮革奶”4“瘦肉精”2-腎上腺素激動(dòng)劑,能加強(qiáng)脂肪的分解,促進(jìn)蛋白質(zhì)的合成,化學(xué)性質(zhì)十分穩(wěn)定,主要經(jīng)尿和膽汁以原型排出,會(huì)在臟器中殘留,有毒副作用。 瘦肉精的化學(xué)結(jié)構(gòu)去年兩大生化發(fā)
2、現(xiàn)與諾貝爾醫(yī)學(xué)及生理學(xué)獎(jiǎng)JSynthia辛西婭)JGFAJ-1J試管嬰兒誰是誰是Craig Venter?NASA發(fā)現(xiàn)生命新可能-砷元素或能形成生命體 J 以劇毒砷生長(zhǎng)的菌株GFAJ-1,將改寫生物教科書,使地球外尋找生命的范圍得以拓展 J 美國(guó)宇航局天體生物學(xué)家費(fèi)麗莎烏爾夫-西蒙(Felisa Wolfe-Simon),將從加利福尼亞州莫納湖湖底收集而來的微生物,置于實(shí)驗(yàn)室含有砷的混合試劑內(nèi)培殖了數(shù)月,結(jié)果發(fā)現(xiàn)微生物體內(nèi)的磷原子被砷原子置換出來了。J 烏爾夫-西蒙表示,每天去實(shí)驗(yàn)室的時(shí)候都會(huì)摒住呼吸,生怕這些微生物會(huì)死去,但它們沒有。如果這一結(jié)果被確認(rèn),那么“生命及生命存在于何處的定義將被擴(kuò)
3、大。J 碳、氫、氮、氧、磷和硫是地球所有已知生命形式的六大基本構(gòu)建元素。磷是攜帶生命基因的DNA和RNA的化學(xué)成分之一,被認(rèn)為是所有活細(xì)胞的必需元素。J 砷在化學(xué)元素周期表的位置正好位于磷的下方,正是由于兩者化學(xué)習(xí)性相近,所以砷很容易被細(xì)胞吸收導(dǎo)致中毒。記憶必需氨基酸J 人體八種必需氨基酸,外加二種半必需氨基酸,此為諧音記憶,非常有效:笨苯丙氨酸蛋蛋氨酸精精氨酸來賴氨酸宿蘇氨酸舍色氨酸住組氨酸亮亮氨酸涼異亮氨酸鞋纈氨酸)。無處不在的生物化學(xué)無處不在的生物化學(xué)為什么多吃西瓜,特別是西瓜皮有利于心血管的健康?近朱者赤,近墨者黑!反式脂肪與-3脂肪酸為什么狗急了跳墻,人急中生智?為什么喝咖啡或綠茶能
4、減肥?農(nóng)夫與蛇的故事肉堿能減肥嗎?騙人的珍奧核酸甲醇中毒了怎么辦?為什么過夜的韭菜不能吃?太陽的好處與壞處為什么路邊的野蘑菇不要采?我們?nèi)擞卸嗌賯€(gè)基因?先有DNA,還是先有蛋白質(zhì)?世界上有不怕艾滋病毒的人嗎?J西瓜里面有瓜氨酸J瓜氨酸在體內(nèi)可以轉(zhuǎn)變?yōu)榫彼酛精氨酸是合成NO的原料JNO能夠擴(kuò)張血管小心近墨者黑!PrPc與與PrPsc在構(gòu)象上的主要差別:(在構(gòu)象上的主要差別:(1PrPc;(;(2PrPsc 氨基酸考點(diǎn)分析4蛋白質(zhì)氨基酸 vs 非蛋白質(zhì)氨基酸4D型氨基酸 vs L型氨基酸4必需氨基酸 vs 非必需氨基酸:聯(lián)想到必需脂肪酸和非必需脂肪酸以及維生素4疏水氨基酸和親水氨基酸4氨基酸的性
5、質(zhì):兩性解離與等電點(diǎn)如何計(jì)算);茚三酮反應(yīng);脯氨酸的特殊性蛋白質(zhì)考點(diǎn)分析4蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)的定義及表示方法:聯(lián)想到核酸的一級(jí)結(jié)構(gòu)及其表示方法4蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)與主鏈上的氫鍵4模體與結(jié)構(gòu)域4三級(jí)結(jié)構(gòu)與氫鍵、疏水鍵、范德華力、離子鍵、二硫鍵4四級(jí)結(jié)構(gòu)與氫鍵、疏水鍵、范德華力、離子鍵、4纖維狀蛋白、球狀蛋白與膜蛋白4蛋白質(zhì)的性質(zhì):紫外吸收、兩性解離、變性與復(fù)性、顏色反應(yīng);聯(lián)想到核酸的相應(yīng)的性質(zhì)核酸考點(diǎn)分析4DNA與RNA三大差別及其原因和生物學(xué)意義4幾種比較重要的RNA4核酸的二級(jí)結(jié)構(gòu):三種雙螺旋ABZ的異同4核酸的三級(jí)結(jié)構(gòu)4核酸的性質(zhì)?DNA 一種類型,一種功能 ?RNA 多種類型,多種功能? 編碼
6、RNA和非編碼 (NcRNA)性質(zhì)RNADNA戊糖D-核糖2-D-脫氧核糖堿基A、G、C、UA、G、C、T多聚核苷酸鏈的數(shù)目多為單鏈多為雙鏈雙螺旋A型B型和Z型種類多種只有一種功能功能多樣一種功能:充當(dāng)遺傳物質(zhì)堿溶液下的穩(wěn)定性不穩(wěn)定,很容易水解穩(wěn)定 DNA和和RNA的結(jié)構(gòu)異同的結(jié)構(gòu)異同英文縮寫全稱功能存在mRNA信使RNA翻譯模板所有的細(xì)胞tRNA轉(zhuǎn)移RNA攜帶氨基酸,參與翻譯同上rRNA核糖體RNA核糖體組分,參與翻譯同上SnRNA核小RNA參與真核mRNA前體的剪接真核細(xì)胞SnoRNA核仁小RNA參與真核rRNA前體的后加工真核細(xì)胞7SLRNA7S長(zhǎng)RNA參與蛋白質(zhì)的定向和分泌真核細(xì)胞tm
7、RNA轉(zhuǎn)移信使RNA兼有mRNA和tRNA的功能原核細(xì)胞gRNA指導(dǎo)RNA參與真核mRNA的編輯某些真核細(xì)胞RNAi(microRNA和siRNA)干擾RNA調(diào)節(jié)基因的表達(dá)真核細(xì)胞Ribozyme核酶催化特定的生化反應(yīng)原核細(xì)胞、真核細(xì)胞和某些RNA病毒Xist RNA調(diào)節(jié)雌性哺乳動(dòng)物一條X染色體轉(zhuǎn)變成巴氏小體哺乳動(dòng)物為什么DNA含有T? C自發(fā)脫氨基變成U修復(fù)酶能夠識(shí)別這些突變,以用C取代這些U。如何區(qū)分正常的U和突變而來的U? 使用T就很容易解決以上問題。為什么DNA 2-脫氧,RNA不是? RNA臨近的-OH使其更容易DNA缺乏2-OH更加穩(wěn)定 遺傳物質(zhì)必須更加穩(wěn)定RNA需要的時(shí)候合成,不
8、需要的時(shí)候需要迅速降解。為什么DNA通常是雙鏈的,RNA通常是單鏈的?n互補(bǔ)的雙鏈結(jié)構(gòu)使DNA很容易進(jìn)行復(fù)制、修復(fù)和重組n單鏈的結(jié)構(gòu)使得RNA能夠形成豐富多彩的三維結(jié)構(gòu)AT和和GC堿基對(duì)的配對(duì)性質(zhì)堿基對(duì)的配對(duì)性質(zhì)B-型型DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的主要特征雙螺旋結(jié)構(gòu)的主要特征雙螺旋穩(wěn)定的因素(1氫鍵 氫鍵固然重要,但它們主要決定堿基配對(duì)的特異性,而對(duì)雙螺旋穩(wěn)定的貢獻(xiàn)不是最重要的。對(duì)雙螺旋穩(wěn)定起決定性作用的是堿基的堆集力。(2堿基堆集力 這是堿基對(duì)之間在垂直方向上的相互作用所產(chǎn)生的力。它包括疏水作用和范德華力。堿基間相互作用的強(qiáng)度與相鄰堿基之間環(huán)重疊的面積成正比??偟内厔?shì)是嘌呤與嘌呤之間嘌呤與嘧啶之間嘧啶
9、與嘧啶之間。另外堿基的甲基化能提高堿基的堆積力。(3陽離子或帶正電荷的化合物對(duì)磷酸基團(tuán)的中和。核酸的理化性質(zhì)n紫外吸收n酸堿解離n變性n復(fù)性和雜交DNA的變性和復(fù)性的變性和復(fù)性酶學(xué)考點(diǎn)4酶的化學(xué)本質(zhì):主要是蛋白質(zhì),少數(shù)是RNA;區(qū)分核酸酶和核酶;為什么DNA不能充當(dāng)酶?4細(xì)胞里有哪些反應(yīng)由核酶催化?4酶的性質(zhì):與非酶催化劑的共同性質(zhì);酶的特有性質(zhì)4米氏酶與別構(gòu)酶4米氏常數(shù)Km)、最大反應(yīng)速度Vm與kcat及kcat/Km4酶活性的調(diào)節(jié)代謝考點(diǎn)4真核細(xì)胞代謝的分室化4NADH、FADH2、NADPH、ATP4幾種重要的代謝途徑:糖酵解、三羧酸循環(huán)、糖異生、磷酸戊糖途徑、卡爾文循環(huán)、尿素循環(huán)、核苷
10、酸代謝4如何計(jì)算ATP的得與失?代謝途徑的分室化代謝途徑的分室化代謝途徑發(fā)生區(qū)域三羧酸循環(huán)、氧化磷酸化,脂肪酸氧化,氨基酸分解線粒體糖酵解、脂肪酸合成、磷酸戊糖途徑、細(xì)胞液DNA復(fù)制、轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)錄后加工細(xì)胞核、線粒體、葉綠體膜蛋白和分泌蛋白的合成粗面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脂和膽固醇的合成光面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)翻譯后加工(糖基化)高爾基體尿素循環(huán)肝細(xì)胞線粒體和細(xì)胞液分解代謝和合成代謝分解代謝和合成代謝細(xì)胞需要持續(xù)不斷的能量供應(yīng)細(xì)胞需要持續(xù)不斷的能量供應(yīng)NADH, NADPHNADH, NADPH和和 ATP ATPATP ATP 通用的能量貨幣通用的能量貨幣NADPH NADPH 生物還原劑生物還原劑糖酵解糖酵解發(fā)生在所有的
11、活細(xì)胞發(fā)生在所有的活細(xì)胞位于細(xì)胞液位于細(xì)胞液 共有十步反應(yīng)組成共有十步反應(yīng)組成在所有的細(xì)在所有的細(xì)胞都相同,但速率不同。胞都相同,但速率不同。兩個(gè)階段:兩個(gè)階段: 第一個(gè)階段第一個(gè)階段投資階段或引發(fā)階投資階段或引發(fā)階段段: 葡萄糖葡萄糖 F-1,6-2P 2G-3-P第二個(gè)階段第二個(gè)階段獲利階段:產(chǎn)生獲利階段:產(chǎn)生2丙丙酮酸酮酸+2ATP丙酮酸的三種命運(yùn)丙酮酸的三種命運(yùn)糖酵解的兩階段反應(yīng)糖酵解的兩階段反應(yīng)糖酵解第一階段的反應(yīng)糖酵解第一階段的反應(yīng)第一步反應(yīng)第一步反應(yīng)葡萄糖的磷酸化葡萄糖的磷酸化己糖激酶或葡萄糖激酶己糖激酶或葡萄糖激酶引發(fā)反應(yīng)引發(fā)反應(yīng)ATP被消耗,以便后面得到更多的被消耗,以便后面
12、得到更多的ATP葡萄糖的磷酸化至少有兩個(gè)意義:首先葡萄糖因葡萄糖的磷酸化至少有兩個(gè)意義:首先葡萄糖因此帶上負(fù)電荷,極性猛增,很難再?gòu)募?xì)胞中此帶上負(fù)電荷,極性猛增,很難再?gòu)募?xì)胞中“逃逸出去;其次葡萄糖由此變得不穩(wěn)定,逃逸出去;其次葡萄糖由此變得不穩(wěn)定,有利于它在細(xì)胞內(nèi)的進(jìn)一步代謝。有利于它在細(xì)胞內(nèi)的進(jìn)一步代謝。葡萄糖在細(xì)胞內(nèi)磷酸化以后不能再離開細(xì)胞葡萄糖在細(xì)胞內(nèi)磷酸化以后不能再離開細(xì)胞反應(yīng)反應(yīng)3: 磷酸果糖激酶磷酸果糖激酶是糖酵解的限速步驟是糖酵解的限速步驟! ! 糖酵解第二次引發(fā)反應(yīng)糖酵解第二次引發(fā)反應(yīng)有大的自由能降低,受到高度的調(diào)控有大的自由能降低,受到高度的調(diào)控糖酵解糖酵解- -第二個(gè)階段
13、的反應(yīng)第二個(gè)階段的反應(yīng)產(chǎn)生產(chǎn)生4 ATP 導(dǎo)致糖酵解凈產(chǎn)生導(dǎo)致糖酵解凈產(chǎn)生2ATP 涉及兩個(gè)高能磷酸化合物涉及兩個(gè)高能磷酸化合物.1,3 BPG PEP 甘油醛甘油醛-3-3-磷酸被氧化成甘油酸磷酸被氧化成甘油酸-1,3-1,3-二磷酸二磷酸 這是整個(gè)糖酵解途徑唯一的一步氧化還原反應(yīng)這是整個(gè)糖酵解途徑唯一的一步氧化還原反應(yīng) 產(chǎn)生產(chǎn)生1,3-BPG1,3-BPG和和NADH NADH 為巰基酶,使用共價(jià)催化,碘代乙酸和有機(jī)汞能夠?yàn)閹€基酶,使用共價(jià)催化,碘代乙酸和有機(jī)汞能夠抑制此酶活性。抑制此酶活性。砷酸在化學(xué)結(jié)構(gòu)和化學(xué)性質(zhì)與砷酸在化學(xué)結(jié)構(gòu)和化學(xué)性質(zhì)與PiPi極為相似,因此可極為相似,因此可以代替
14、無機(jī)磷酸參加反應(yīng),形成甘油酸以代替無機(jī)磷酸參加反應(yīng),形成甘油酸-1-1-砷酸砷酸- -3-3-磷酸,但這樣的產(chǎn)物很不穩(wěn)定,很快就自發(fā)地磷酸,但這樣的產(chǎn)物很不穩(wěn)定,很快就自發(fā)地水解成為甘油酸水解成為甘油酸-3-3-磷酸并產(chǎn)生熱,無法進(jìn)入下磷酸并產(chǎn)生熱,無法進(jìn)入下一步底物水平磷酸化反應(yīng)。由于甘油酸一步底物水平磷酸化反應(yīng)。由于甘油酸-1-1-砷酸砷酸- -3-3-磷酸的自發(fā)水解,將導(dǎo)致磷酸的自發(fā)水解,將導(dǎo)致ATPATP合成受阻,影響合成受阻,影響細(xì)胞的正常代謝,這就是砷酸有毒性的原因。細(xì)胞的正常代謝,這就是砷酸有毒性的原因。反應(yīng)反應(yīng)10: 10: 丙酮酸激酶丙酮酸激酶PEP轉(zhuǎn)化成丙酮酸,同時(shí)產(chǎn)生轉(zhuǎn)化
15、成丙酮酸,同時(shí)產(chǎn)生 ATP 產(chǎn)生兩個(gè)產(chǎn)生兩個(gè)ATP,可被視為糖酵解途徑最后的能,可被視為糖酵解途徑最后的能量回報(bào)。量回報(bào)。G為大的負(fù)值為大的負(fù)值受到調(diào)控受到調(diào)控! NADH和丙酮酸的去向和丙酮酸的去向有氧還是無氧?有氧還是無氧? 在有氧狀態(tài)下在有氧狀態(tài)下NADH和丙酮酸的命運(yùn)和丙酮酸的命運(yùn) (1NADH的命運(yùn)的命運(yùn) NADH在呼吸鏈被徹底氧化成在呼吸鏈被徹底氧化成H2O并產(chǎn)生更多的并產(chǎn)生更多的ATP。 (2丙酮酸的命運(yùn)丙酮酸的命運(yùn) 丙酮酸經(jīng)過線粒體內(nèi)膜上丙酮酸運(yùn)輸體與質(zhì)子一起進(jìn)丙酮酸經(jīng)過線粒體內(nèi)膜上丙酮酸運(yùn)輸體與質(zhì)子一起進(jìn)入線粒體基質(zhì),被基質(zhì)內(nèi)的丙酮酸脫氫酶系氧化成乙酰入線粒體基質(zhì),被基質(zhì)內(nèi)的
16、丙酮酸脫氫酶系氧化成乙酰-CoA 在缺氧狀態(tài)或無氧狀態(tài)下在缺氧狀態(tài)或無氧狀態(tài)下NADH和丙酮酸的命運(yùn)和丙酮酸的命運(yùn) (1乳酸發(fā)酵乳酸發(fā)酵 (2酒精發(fā)酵酒精發(fā)酵線粒體內(nèi)膜上的甘油線粒體內(nèi)膜上的甘油-3-3-磷酸和蘋果酸磷酸和蘋果酸- -天冬氨酸穿梭系統(tǒng)天冬氨酸穿梭系統(tǒng) 產(chǎn)生ATP提供生物合成的原料糖酵解與腫瘤 缺氧與缺氧誘導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄因子糖異生糖異生泛指細(xì)胞內(nèi)由乳酸或其它非糖物質(zhì)凈合成葡萄糖的過程。它主要發(fā)生在動(dòng)物的肝臟80)和腎臟20),是動(dòng)物細(xì)胞自身合成葡萄糖的唯一手段。植物和某些微生物也可以進(jìn)行糖異生。糖異生與糖酵解途徑的比較糖異生與糖酵解途徑的比較 糖異生的底物糖異生的底物( (動(dòng)物動(dòng)物)
17、) 丙酮酸丙酮酸, 乳酸乳酸, 甘油甘油, 生糖氨基酸,所生糖氨基酸,所有有TCA循環(huán)的中間物循環(huán)的中間物偶數(shù)脂肪酸不行偶數(shù)脂肪酸不行!因?yàn)榕紨?shù)脂肪酸氧化只能產(chǎn)生乙酰因?yàn)榕紨?shù)脂肪酸氧化只能產(chǎn)生乙酰CoA,而乙酰,而乙酰CoA不能提供葡萄糖的不能提供葡萄糖的凈合成凈合成丙酮酸羧化酶丙酮酸羧化酶糖異生的第一步反應(yīng)存在于線粒體基質(zhì),需要生物素輔基由ATP驅(qū)動(dòng)羧化反應(yīng)果糖果糖-1,6-二磷酸酶二磷酸酶 將將 F-1,6-P水解成水解成F-6-P 葡糖葡糖-6-6-磷酸酶磷酸酶 催化葡糖催化葡糖-6-磷酸水解成葡萄糖磷酸水解成葡萄糖 存在于肝、腎細(xì)胞內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜上。存在于肝、腎細(xì)胞內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜上。肌肉和腦細(xì)胞沒
18、有這種酶,故不能進(jìn)行糖異肌肉和腦細(xì)胞沒有這種酶,故不能進(jìn)行糖異生生 G-6-P需要進(jìn)入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔才能水解需要進(jìn)入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔才能水解也稱為檸檬酸循環(huán)和也稱為檸檬酸循環(huán)和Krebs循環(huán)循環(huán) 糖酵解產(chǎn)生的丙酮酸實(shí)際上是乙酸被糖酵解產(chǎn)生的丙酮酸實(shí)際上是乙酸被降解成降解成CO2 產(chǎn)生一些產(chǎn)生一些ATP產(chǎn)生更多的產(chǎn)生更多的NADH NADH進(jìn)入呼吸鏈,通過氧化磷酸化產(chǎn)生進(jìn)入呼吸鏈,通過氧化磷酸化產(chǎn)生更多的更多的ATP。完整的三羧酸循環(huán)完整的三羧酸循環(huán)乙酰乙酰CoA的形成的形成脂肪酸的氧化氨基酸的氧化分解丙酮酸的氧化脫羧由丙酮酸脫氫酶系催化 砒霜的毒性機(jī)理砒霜的毒性機(jī)理TCA 循環(huán)總結(jié)循環(huán)總結(jié)總反應(yīng):乙酰-Co
19、A+3NAD+FAD+GDP+Pi+2H2O2CO2+3NADH+FADH2+GTP+2H+CoA1個(gè)乙酰-CoA通過三羧酸循環(huán)產(chǎn)生2CO2, 1 ATP, 3NADH,1FADH22H2O被使用作為底物絕對(duì)需要O2吵, 您順意吵,(吵得銅壺呼鹽瓶!$產(chǎn)生更多的ATP$提供生物合成的原料$ 是糖、氨基酸和脂肪酸最后的共同分解途徑$某些代謝中間我作為其他代謝途徑的別構(gòu)效應(yīng)物$產(chǎn)生CO2一分子葡萄糖徹底氧化過程中的一分子葡萄糖徹底氧化過程中的ATP ATP 收支情況收支情況與ATP合成相關(guān)的反應(yīng)合成ATP的方式合成ATP的量糖酵解(包括氧化磷酸化)己糖激酶PFK-1磷酸甘油酸激酶丙酮酸激酶甘油醛-3-磷酸脫氫酶(NADH)消耗ATP消耗ATP底物水平磷酸化底物水平磷酸化氧化磷酸化5或6或711223或4或5(取決于NADH通過何種途徑進(jìn)入呼吸鏈)丙酮酸脫氫酶系氧化磷氧化磷酸化酸化22.55三羧酸循環(huán)異檸
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