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文檔簡介
1、.技術(shù)交底書模板 - 生物類1. 發(fā)明創(chuàng)造名稱:應(yīng)簡單明確地描述發(fā)明的實質(zhì)內(nèi)容,可按其技術(shù)特點、用途或技術(shù)和用途雙重命名,發(fā)明創(chuàng)造名稱不得超過25 個字,避免使用宣傳性、廣告性詞匯。一種快速鑒定結(jié)核分枝桿菌與非結(jié)核分枝桿菌的方法2背景技術(shù)及現(xiàn)有技術(shù)的缺陷和不足:背景技術(shù):是對最接近的現(xiàn)有技術(shù)的說明,可分為大的背景技術(shù)和小的背景技術(shù)兩個方面進(jìn)行介紹,大的背景技術(shù)主要指該技術(shù)領(lǐng)域的總體狀況,小的背景技術(shù)指與本發(fā)明改進(jìn)的具體技術(shù)密切相關(guān)的技術(shù)狀況;背景技術(shù)的詳細(xì)程度,以不需要再去看文獻(xiàn)即可理解該技術(shù)密切相關(guān)的技術(shù)狀況,如果現(xiàn)有技術(shù)出自專利文獻(xiàn)、期刊、書籍,則提供出處?,F(xiàn)有技術(shù)的缺陷和不足:1. 客觀
2、評價現(xiàn)有技術(shù)的缺點,會帶來哪些問題,這些缺點是針對本發(fā)明的優(yōu)點來說的,本發(fā)明正是要解決這些問題和缺點;本發(fā)明無法解決的技術(shù)問題不必描述,本發(fā)明不能解決的缺點也不必寫;2. 如果找不出對比技術(shù)方案及其缺點,可用反推法,根據(jù)本發(fā)明的優(yōu)點來找出由對應(yīng)的缺點,還可以從結(jié)構(gòu)角度推導(dǎo)出現(xiàn)有先進(jìn)產(chǎn)品的缺點;3. 缺點可以是代謝產(chǎn)物性能差、產(chǎn)量低、菌種穩(wěn)定性不高等類似問題;針對前面現(xiàn)有技術(shù)的所有缺點,逐一正面描述本發(fā)明所要解決的技術(shù)問題。近年來, 非結(jié)核分枝桿菌感染明顯增加,結(jié)核與非結(jié)核分枝桿菌在臨床上引起的疾病難以區(qū)別,最具代表性的結(jié)核分枝桿菌引起的結(jié)核病酷似非結(jié)核分枝桿菌肺病,但兩者對抗結(jié)核藥物敏感性不同
3、,故正確鑒定分枝桿菌在疾病診斷及治療中至關(guān)重要。傳統(tǒng)的生物學(xué)鑒定方法主要依據(jù)細(xì)菌生長速度、色素產(chǎn)生、對藥物耐受性、生化反應(yīng)等,方法復(fù)雜、費(fèi)時,在得到分離培養(yǎng)物后仍需24 周方能獲得結(jié)果,因此有必要建立一種快速診斷結(jié)核分枝桿菌與非結(jié)核分枝桿菌的方法,對結(jié)核病確證及臨床用藥具有重要的指導(dǎo)意義。目前鑒別結(jié)核分枝桿菌的分子生物方法有PCR, ELISA 、免疫;.膠體金等方法,以上各種方法雖然可能在臨床上提供較好的價值,但因需要昂貴的儀器設(shè)備、繁瑣的操作過程、靈敏度低等不同的原因未能在臨床上大規(guī)模推廣使用。環(huán)介導(dǎo)等溫基因擴(kuò)增技術(shù)(Loop-Mediated Isothermal Amplificati
4、on ,以下簡稱 LAMP 法)是日本榮研化學(xué)株式會社于2000 年前后開發(fā)出的基因擴(kuò)增技術(shù),其具有快速簡便、操作準(zhǔn)確、容易普及、安全可靠的優(yōu)點,目前尚未有將LAMP 法應(yīng)用于快速鑒定結(jié)核分枝桿菌與非結(jié)核分枝桿菌。3具體的技術(shù)方案描述:本部分所提供的內(nèi)容涉及專利申請文件中最重要的部分,越詳細(xì)越好。對于發(fā)明專利要求保護(hù)的主題是一個技術(shù)方案,因而在這部分應(yīng)當(dāng)闡述本發(fā)明要解決的技術(shù)問題(即發(fā)明目的)是通過什么樣的技術(shù)方案來實現(xiàn)的,不能只有原理和功能介紹,應(yīng)當(dāng)詳細(xì)描述本發(fā)明的各個發(fā)明改進(jìn)點及相應(yīng)的技術(shù)方案。技術(shù)方案應(yīng)當(dāng)通過清楚、完整地描述本發(fā)明的技術(shù)特征(如菌種名稱、微生物生物學(xué)特性、應(yīng)用效果試驗方法
5、及證明數(shù)據(jù)等),使本專業(yè)技術(shù)領(lǐng)域中的普通技術(shù)人員不需通過創(chuàng)造性勞動能夠?qū)嵤┍景l(fā)明為準(zhǔn)。對于不同類型的發(fā)明,需要采用不同的描述方式來說明其技術(shù)方案。例如:()涉及“微生物”發(fā)明的要求應(yīng)當(dāng)包含微生物名稱的描述:對于新菌株的情況,微生物的分類學(xué)名稱相應(yīng)為種名+菌株名,種名采用國際標(biāo)準(zhǔn)命名法命名,菌株名由申請人自己命名,例如:啤酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)Y-1 ;生物保藏情況體現(xiàn):對于新的微生物,應(yīng)當(dāng)注明“菌株名+保藏單位簡稱+保藏號”,例如:啤酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) Y-1 ,已于 1993 年 9 月 8 日保藏在中國典型培養(yǎng)物保
6、藏中心,其簡稱為CCTCC,保藏編號為No.M93049;微生物的生物學(xué)特性的記載:包括形態(tài)學(xué)特性、培養(yǎng)特性、生理特性和代謝特性等;制造微生物的方法:描述應(yīng)當(dāng)以本領(lǐng)域普通技術(shù)人員能夠制造為準(zhǔn),通常包括篩選、誘變、DNA 重組技術(shù)等;記載一種微生物的應(yīng)用效果:必須在說明書中提供試驗證據(jù)來證實微生物的用途和實用效果。()涉及重組DNA技術(shù)發(fā)明的要求涉及 DNA分子本身的發(fā)明 DNA分子的詳細(xì)結(jié)構(gòu)(可以是堿基序列表示)、分子類型及來源等;制備過程,包括工藝及條件、收集純化步驟、鑒定方法等;功能和用途,證實這種功能和用途的生物學(xué)實驗。涉及載體的發(fā)明制備過程,包括起始載體、制備重組的方法步驟、所用酶、處
7、理條件等;最好描繪構(gòu)建重組載;.體的過程的示意圖。涉及多肽本身的發(fā)明對多肽或蛋白質(zhì)的名稱、結(jié)構(gòu)、制備方法和蛋白質(zhì)的功能進(jìn)行描述。涉及轉(zhuǎn)化體及其制備方法的發(fā)明描述導(dǎo)入的基因或重組載體、宿主、導(dǎo)入方法、收集轉(zhuǎn)化體的方法及鑒定方法等。本發(fā)明的目的在于提供一組用于快速鑒定結(jié)核分枝桿菌與非結(jié)核分枝桿菌的特異性引物,及一種用環(huán)介導(dǎo)等溫基因擴(kuò)增技術(shù)( LAMP 技術(shù))快速鑒定結(jié)核分枝桿菌與非結(jié)核分枝桿菌的方法。本鑒定方法方便快捷、價格低廉,適于推廣應(yīng)用。為達(dá)到上述目的,本發(fā)明所采用的技術(shù)方案如下:本發(fā)明根據(jù)結(jié)核分枝桿菌與非結(jié)核分枝桿菌 16S RNA 的特異性設(shè)計 4 條特異性引物, 利用環(huán)介導(dǎo)等溫擴(kuò)增技術(shù)
8、,在 60 65,等溫擴(kuò)增 6090 分鐘,根據(jù)顯色劑顯示的顏色來區(qū)分結(jié)核分枝桿菌與非結(jié)核分枝桿菌。用于快速鑒定結(jié)核分枝桿菌與非結(jié)核分枝桿菌的特異性引物,包括:內(nèi)引物 1: 5-TGGTCGTAGTAGGTCGATGGGGAGTCGA TCTGCACACAGCT -3( SEQ ID No.1 );內(nèi)引物 2: 5- TGCGCGATGGCGAACTCAAGGCACCGTAAACACCGTAG -3( SEQ ID No.2 );外引物 1: 5-TCATCGCCGATCATCAGG -3( SEQ ID No.3 );外引物 2: 5-CGAGTTTGGTCA TCAGCCG- 3( SEQ
9、 ID No.4 )。一種快速鑒定結(jié)核分枝桿菌與非結(jié)核分枝桿菌的方法,具體包括如下步驟:( 1)模板 DNA 的提取: 提取待檢樣品的 DNA ,所述待檢樣品是已鑒定為含有分枝桿菌的樣品或分離的分枝桿菌;( 2)環(huán)介導(dǎo)等溫基因擴(kuò)增反應(yīng):在 200l PCR 管配制反應(yīng)體系: 引物混合液1l,反應(yīng)液 12.5 l,DNA 聚合酶 0.51 l,模板 DNA 25 l ,用滅菌去離子水補(bǔ)齊到25l,然后加入20l 的密封液,將上述反應(yīng)管于6365反應(yīng) 6090min ;所述引物混合液含有上述的4 條特異性引物(SEQ ID No.14 ),其中,內(nèi)引物1 的濃度為48 pmol/l、內(nèi)引物2 的濃
10、度為48 pmol/l、外引物1 的濃度為1 pmol/l、外引物2 的濃度為1 pmol/l;所述反應(yīng)液含有10mM dNTP 、10×ThermoPol 反應(yīng)緩沖液、 150mM MgSO4 、 5mM Betaine ,四者的體積比為79: 5: 24: 911;;.( 3)結(jié)果判斷:在上述反應(yīng)管中加入 12l 顯色劑 SYBR GREEN ,混勻后觀察反應(yīng)液的顏色,若呈現(xiàn)綠色則為結(jié)核分枝桿菌,橙色則為非結(jié)核分枝桿菌。所述反應(yīng)液中, 10mM dNTP :10×ThermoPol 反應(yīng)緩沖液: 150mM MgSO4 :5mM Betaine (體積比) =8 : 5
11、: 3: 10。所述 DNA 聚合酶為Bst DNA 聚合酶,濃度為8U/ l。4本發(fā)明創(chuàng)造的優(yōu)點:針對上述“現(xiàn)有技術(shù)的缺陷和不足”并結(jié)合技術(shù)方案中的各個發(fā)明改進(jìn)點作出具體說明,即以推理方式具體分析各個改進(jìn)點如何帶來這些優(yōu)點,使得對優(yōu)點的說明做到有理有據(jù);通過對發(fā)明的分析和理論說明相結(jié)合,或?qū)嶒灁?shù)據(jù)說明,它可以是產(chǎn)率或療效的提高、能耗、原材料、工序的節(jié)省,操作、控制、使用的簡便,降低毒副作用,減少環(huán)境污染、代謝產(chǎn)物有藥用價值、產(chǎn)量高、菌種存活使用時間長等。本發(fā)明方法方便快捷,能在較短的時間內(nèi)鑒別結(jié)核分枝桿菌與非結(jié)核分枝桿菌,且不需要昂貴的儀器設(shè)備;靈敏度高,最低可檢測出100 個菌 /ml;特
12、異性好,本發(fā)明根據(jù)16S RNA 基因序列設(shè)計 4 對引物,與目的基因的 6 個區(qū)域結(jié)合,具有較高的特異性。本發(fā)明對于結(jié)核分枝桿菌或非結(jié)核分枝桿菌感染的診斷與臨床用藥具有較高的參考價值,適于推廣應(yīng)用。5具體實施方式及附圖:具體實施方式:( 1)微生物:應(yīng)給出微生物的獲取方式、篩選過程、生物學(xué)實驗方法、用途和效果的證明方法等;( 2) DNA重組:源基因的獲取方法、重組制備方式、工藝條件、純化步驟、鑒定方法等。具體實施方式應(yīng)與技術(shù)方案相一致,并且應(yīng)當(dāng)對權(quán)利要求書的技術(shù)特征給予詳細(xì)說明,以支持權(quán)利要求書(有多種實施方式時,提供多個實施例);還應(yīng)給出相關(guān)性能、效果表征的數(shù)據(jù)等。附圖:基因工程圖譜(包
13、括 HPLC圖譜、實驗曲線、基因重組、電泳圖譜等) ,并針對附圖進(jìn)行說明。實施例環(huán)介導(dǎo)等溫基因擴(kuò)增反應(yīng)體系的準(zhǔn)備:( 1)反應(yīng)液: 10mM dNTP 、10×ThermoPol 反應(yīng)緩沖液、 150mM MgSO4 、 5mM Betaine ,四者的體積比為 8: 5: 3: 10;;.( 2)引物液:包括 4pmol/ l 內(nèi)引物 1、 4pmol/ l 內(nèi)引物 2、 1 pmol/ l外引物 1、1 pmol/ l外引物2,四條引物分別為:內(nèi)引物 1:5 -TGGTCGTAGTAGGTCGATGGGGAGTCGATCTGCACACAGCT-3(SEQ IDNo.1 );內(nèi)引物
14、 2:5 -TGCGCGATGGCGAACTCAAGGCACCGTAAACACCGTAG-3(SEQ IDNo.2 );外引物 1:5 -TCATCGCCGATCATCAGG-3(SEQ IDNo.3 );外引物 2:5 -CGAGTTTGGTCATCAGCCG(-3SEQ IDNo.4);( 3)DNA聚合酶: Bst DNA聚合酶,濃度為 8U/l ;( 4)顯色劑:熒光染料1× SYBR GreenI 。用上述反應(yīng)體系按以下方法對結(jié)核分枝桿菌與非結(jié)核分枝桿菌進(jìn)行鑒定。本實施例的待檢樣品為已鑒定為分枝桿菌患者的痰液,當(dāng)然,也可以為已鑒定為分枝桿菌患者的支氣管灌洗液及其它樣品,或者分離的分枝桿菌。1、模板 DNA提?。?)將 3ml 的痰標(biāo)本置于室溫;2)在痰樣標(biāo)本中加入2 倍痰樣體積的4%的 NaOH;3)每隔 2min 渦旋振蕩15s ,處理 15min,然后吸取1ml 加入帶旋蓋的離心管中;4)12000r/min離心 15min ,去上清液;5)加入 0.9%的 NaCl1ml ,洗滌, 12000r/min離心 15min,去上清液;6)加入 100l的純化水;7)100煮 20min,然后冰浴10min ;8)離心取上清液轉(zhuǎn)移至另一支離心管中作為模板DNA。2、環(huán)介導(dǎo)等溫基因擴(kuò)增反應(yīng)
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