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1、感受態(tài)細(xì)胞制備制備感受態(tài)常用的方法是電擊法和CaCl2制備法,以下介紹CaCl2制備法:1、可以從-80冰柜中,取出一支凍存菌株,于事先照過(guò)紫外的超凈臺(tái)中,用無(wú)菌的接種環(huán)輕輕蘸取菌種后,在無(wú)抗平板(由于Rocetta含有氯霉素抗性,需要涂布在氯霉素抗性的平板,后面的都是如此)上劃線,并將菌種快速放回-80保存,在劃線板上做好相應(yīng)標(biāo)記,于37培育過(guò)夜。2、從37培育過(guò)夜的新穎平板上挑取一個(gè)單克隆,接種于2mlEP管中,37,220rpm震蕩培育約6個(gè)小時(shí)至對(duì)數(shù)生長(zhǎng)中后期;將該菌懸液以1:100的比例接種于50ml LB液體培育基(2瓶)中,37振蕩培育2.5小時(shí)至OD600=0.5。留意:接種比
2、例不得大于1:10。3、在無(wú)菌條件下將細(xì)菌轉(zhuǎn)移到一個(gè)無(wú)菌、預(yù)冷的離心管(50ml)中,在冰上放置510min;留意:劃板、接種為了防止意外發(fā)生最好多劃一塊平板和多接一根試管,劃板、接種、轉(zhuǎn)接均要嚴(yán)格依據(jù)無(wú)菌操作。4、4 5000g離心5分鐘。用預(yù)冷的去離子水洗滌沉淀,4 5000g離心5分鐘;Note:此步主要是為了洗去培育基中的鹽等5、沉淀加入2ml預(yù)冷的0.05mol/L CaCl2-15%甘油混合溶液,輕吹散,冰浴5分鐘,45000g離心5分鐘;6、沉淀加入2ml預(yù)冷的0.05mol/L CaCl2-15%甘油混合溶液,輕吹散,即成為感受態(tài)細(xì)胞懸液。分裝成50100l的小份,貯存于-70
3、可保存半年。含15%甘油的0.05mol/L CaCl2制備方法:稱(chēng)取0.28g CaCl2(無(wú)水,分析純),溶于50ml重蒸水中,加入15ml甘油,定容至100ml,高壓滅菌。感受態(tài)細(xì)胞的特征感受態(tài):通過(guò)特殊處理使細(xì)胞處于能夠吸取外源DNA的狀態(tài)。感受態(tài)細(xì)胞的特征:(1)細(xì)胞表面暴露出一些可接受外來(lái)DNA的位點(diǎn)(以溶菌酶處理,可促使受體細(xì)胞的接受位點(diǎn)充分暴露)。(2)細(xì)胞膜通透性增加(用鈣離子處理,可使膜通透性增加,使DNA直接穿過(guò)質(zhì)膜進(jìn)入細(xì)胞)。(3)受體細(xì)胞的修飾酶活性最高,而限制酶活性最低,使轉(zhuǎn)入的DNA分子不易被切除或破壞。試驗(yàn)室常用的感受態(tài)細(xì)胞1.DH5菌株克隆菌株:DH5是一種常
4、用于質(zhì)粒克隆和高拷貝質(zhì)粒的穩(wěn)定復(fù)制的菌株。E.coli DH5在使用pUC系列質(zhì)粒載體轉(zhuǎn)化時(shí),其80lacZM15基因產(chǎn)物可與載體編碼的半乳糖苷酶氨基端實(shí)現(xiàn)互補(bǔ),可用于藍(lán)白斑篩選鑒別重組菌株。Rec A1和end A1的突變有利于克隆DNA的穩(wěn)定和高純度質(zhì)粒DNA的提取。基因型:F-、80dlacZM15、(lacZYA-argF)U169、deoR、recA1、endA1、hsdR17(rk-,mk+)、phoA、supE44、-、thi-1、gyrA96、relA12.TOP10菌株克隆菌株:該菌株適用于高效的DNA克隆和質(zhì)粒擴(kuò)增,能保證高拷貝質(zhì)粒的穩(wěn)定遺傳?;蛐停篎-、mcrA(mrr
5、-hsd RMS-mcrBC)、 80 、lacZM15、lac74、 recA1、ara139(ara-leu)7697、 galU 、galK 、rps、 (Strr) endA1、 nupG3.BL21(DE3) 菌株:蛋白表達(dá)菌株:該菌株用于高效表達(dá)克隆于含有噬菌體T7啟動(dòng)子的表達(dá)載體(如pET系列)的基因。該菌株用于T7 RNA聚合酶為表達(dá)系統(tǒng)的高效外源基因的蛋白表達(dá)宿主,T7噬菌體RNA聚合酶基因的表達(dá)受控于 噬菌體DE3區(qū)的acUV5啟動(dòng)子,該區(qū)整合于BL21的染色體上。該菌株適合于非毒性蛋白的表達(dá)?;蛐停篎-、ompT、 hsdS(rB-mB-)、gal、 dcm(DE3)4
6、.BL21(DE3) pLysS菌株蛋白表達(dá)菌株:該菌株含有質(zhì)粒pLysS,因此具有氯霉素抗性。PLysS含有表達(dá)T7溶菌酶的基因,能夠降低目的基因的背景表達(dá)水平,但不干擾目的蛋白的表達(dá)。該菌適合表達(dá)毒性蛋白和非毒性蛋白?;蛐停篎-、ompT 、hsdS(rB-mB-)、gal、 dcm(DE3)、pLysS 、Camr5.Rocetta感受態(tài)特征:蛋白表達(dá)菌株Rosetta系列菌株來(lái)源于BL21系列宿主菌,該系列菌株含有原本在大腸桿菌中稀有的真核細(xì)胞密碼子,增加了真核細(xì)胞的蛋白表達(dá)水平。(1) Rocetta (DE3) 該菌株通過(guò)一個(gè)相容性氯霉素抗性質(zhì)粒補(bǔ)充大腸桿菌缺
7、乏的6種稀有密碼子(AUA、AGG、AGA、CUA、CCC、GGA)對(duì)應(yīng)的tRNA,這樣Rocetta菌株供應(yīng)了“萬(wàn)能”的翻譯,從而避開(kāi)因大腸桿菌密碼子使用頻率導(dǎo)致的表達(dá)限制,提高外源基因尤其是真核基因在原核系統(tǒng)中的表達(dá)水平。tRNA基因由它們的自然啟動(dòng)子驅(qū)動(dòng)?;蛐停?#160;F- 、ompT、hsdSB (rB - mB - )、gal、dcm、lacY1(DE3)、pRARE(argU,argW,ileX,glyT,leuW,proL)(Cmr ) 補(bǔ)充:稀有密碼子對(duì)蛋白表達(dá)的影響:數(shù)氨基酸都有一個(gè)以上的密
8、碼子,對(duì)E.coli密碼子應(yīng)用狀況分析表明一些密碼子很少使用,尤其是精氨酸密碼子AGA , AGG , CGG , CGA;異亮氨酸的密碼子AUA;亮氨酸的密碼子CUA和甘氨酸的密碼子GGA和脯氨酸的密碼子CCC很少被用到。 目的基因中含有過(guò)多的稀有密碼子被認(rèn)為是低表達(dá)水平和產(chǎn)生不完全產(chǎn)物的一個(gè)緣由。當(dāng)在氨基端四周消滅多個(gè)稀有密碼子的時(shí)候,狀況更為嚴(yán)峻,很多爭(zhēng)辯表明,精氨酸的密碼子AGA 和AGG的高頻消滅可能大大影響蛋白的產(chǎn)量。當(dāng)這些密碼子消滅在N-端四周時(shí)候,這種影響將達(dá)到最大。 多個(gè)試驗(yàn)室報(bào)道,在宿主菌中增加同類(lèi)tRNA時(shí)那些含有稀有密碼子基因的蛋白產(chǎn)量將大大提高。
9、RosettaTM菌株可以增加精氨酸稀有密碼子AGG 和AGA,異亮氨酸的密碼子AUA;亮氨酸的密碼子CUA和甘氨酸的密碼子GGA和脯氨酸的密碼子CCC。因此,很適合用于表達(dá)那些含E.coli稀有密碼子基因的目的蛋白.(引用自網(wǎng)址 (2)Rosetta 2 (DE3) pLySs來(lái)源于Rosetta(DE3),本菌株含有pRARE2質(zhì)粒,除了能夠供應(yīng)原Rosetta(DE3)宿主菌含有AUA, AGG, AGA, CUA, CCC, 和GGA六個(gè)稀有密碼子的tRNA外,還供應(yīng)了第七個(gè)稀有密碼子CGG的tRNA。同時(shí),pRARE2質(zhì)粒具有氯霉素抗性。Rosetta2(DE3)pLySs載體通過(guò)供
10、應(yīng)稀有密碼子,使得該宿主菌相對(duì)于其他大腸桿菌,能夠供應(yīng)更加“通用”的蛋白質(zhì)表達(dá),從而提升目的蛋白表達(dá)水平。DE3是溶源性的 DE3, 所以帶有T7 RNA聚合酶的染色體拷貝。該菌株適用于pET系列載體,及其他T7啟動(dòng)子系列載體。含有pLSs質(zhì)粒,pLySs質(zhì)粒能夠產(chǎn)生T7溶菌酶,可以有效降低目的基因的基礎(chǔ)表達(dá)水平。pLySs質(zhì)粒使得該菌株具有氯霉素抗性。pLySs質(zhì)粒的起始復(fù)制位點(diǎn)是p15 Origin, 這使得該質(zhì)粒能夠和pUC-及pBR322-衍生的質(zhì)粒相互共存。轉(zhuǎn)化1、 轉(zhuǎn)化的原理:溶液中的Ca離子和細(xì)菌細(xì)胞膜結(jié)合,在低溫下形成液晶結(jié)構(gòu),在42,90s熱激下,這種液晶結(jié)構(gòu)收縮,將細(xì)胞膜扯
11、開(kāi)孔道,使DNA進(jìn)入細(xì)菌細(xì)胞中。2、 轉(zhuǎn)化的步驟:(1)取感受態(tài)細(xì)胞置于冰浴中,如需分裝可將剛?cè)芑募?xì)胞懸液分裝到無(wú)菌預(yù)冷的離心管中,置于冰浴中。(2) 向感受態(tài)細(xì)胞中加入目的DNA(50ul感受態(tài)細(xì)胞能夠被1ng超螺旋DNA所飽和),輕彈混勻,在冰浴中靜置30min;留意:一次轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞的建議用量為50ul,可以依據(jù)實(shí)際狀況分裝使用,應(yīng)留意所用DNA體積不能超過(guò)感受態(tài)細(xì)胞懸液體積的格外之一,也有說(shuō)法是不能超過(guò)5%。不能加入太多DNA,會(huì)影響轉(zhuǎn)化效率,體積不能超過(guò)10ul,所以連接時(shí)做10ul連接體系可用一半做轉(zhuǎn)化,剩下的放在4°C。(3)將離心管置于42度水浴中放置90s,然后快速轉(zhuǎn)移到冰浴中,使細(xì)胞冷卻2-3min(一般2min),該過(guò)程不要搖動(dòng)離心管;(4)向每個(gè)離心管中加入500ul無(wú)菌的LB培育基(不含抗生素),混勻后置于37度搖床震蕩培育45min(150rpm),目的是使質(zhì)粒上相關(guān)的抗性標(biāo)記基因表達(dá),使菌體復(fù)蘇。(5)將離心管內(nèi)容物混勻,可吸取適量(可吸取200-300ul,也可據(jù)狀況而定)轉(zhuǎn)化產(chǎn)物涂布平板,而假如估計(jì)的克隆較少,可通過(guò)離心(4000rpm,2min)后,吸掉部分上清,懸浮菌體后將其涂布于一個(gè)平板中。留意:涂布
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