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1、Western blot 原理 分類 主要試劑 操作步驟 常見(jiàn)問(wèn)題原理 Western Blot(蛋白免疫印跡)采用的是聚丙烯酰胺凝膠電泳(PAGE),被檢測(cè)物是蛋白質(zhì),“探針”是抗體,“顯色”用標(biāo)記的二抗。經(jīng)過(guò)PAGE分離的蛋白質(zhì)樣品,轉(zhuǎn)移到固相載體(例如硝酸纖維素薄膜)上,固相載體以非共價(jià)鍵形式吸附蛋白質(zhì),且能保持電泳分離的多肽類型及其生物學(xué)活性不變。以固相載體上的蛋白質(zhì)或多肽作為抗原,與對(duì)應(yīng)的抗體起免疫反應(yīng),再與酶或同位素標(biāo)記的第二抗體起反應(yīng),經(jīng)過(guò)底物顯色或放射自顯影以檢測(cè)電泳分離的特異性目的基因表達(dá)的蛋白成分。該技術(shù)也廣泛應(yīng)用于檢測(cè)蛋白水平的表達(dá)??乖豢股锼貥?biāo)記的二抗ECL發(fā)光試劑
2、分類 SDS-PAGE(十二烷基磺酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳) native-PAGE(非變性聚丙烯酰胺凝膠) 區(qū)別在于加不加變性劑(比如SDS)使蛋白質(zhì)變性,SDS-PAGE是最常用的定性分析蛋白質(zhì)的電泳方式特別是用于蛋白質(zhì)純度檢測(cè)和測(cè)定蛋白質(zhì)分子量主要試劑1.ddH2O2.30% 丙烯酰胺混合液 丙烯酰胺(arc)29g和N,N-亞甲雙丙烯酰胺(bis)1g加H2O至100ml。儲(chǔ)于棕色瓶,4避光保存。嚴(yán)格核實(shí)PH不得超過(guò)7.0,因可以發(fā)生脫氨基反應(yīng)是光催化或堿催化的。使用期不得超過(guò)兩個(gè)月,隔幾個(gè)月須重新配制。如有沉淀,可以過(guò)濾。 為蛋白質(zhì)電泳提供載體,其凝固的好壞直接關(guān)系到電泳成功與否。主
3、要試劑3. 配膠緩沖液系統(tǒng) 分離膠緩沖液:1.5mol/L Tris-HCL(pH 8.8) ; 濃縮膠緩沖液:1.0mol/L Tris-HCL (pH 6.8); 電泳緩沖液: 5XTris甘氨酸緩沖系統(tǒng), 4保存 5電泳緩沖液(貯存液)的配制: 0.125 M Tris 15.1 g 1.25 M Glycine 94 g 0.5 % SDS 5 g 三蒸水定容至 1000 mL 主要試劑 在SDSPAGE不連續(xù)電泳中,濃縮膠其pH環(huán)境呈弱酸性,因此甘氨酸解離很少,其在電場(chǎng)的作用下,泳動(dòng)效率低;而Cl離子卻很高,兩者之間形成導(dǎo)電性較低的區(qū)帶,蛋白分子就介于二者之間泳動(dòng)。由于導(dǎo)電性與電場(chǎng)強(qiáng)
4、度成反比,這一區(qū)帶便形成了較高的電壓梯度,壓著蛋白質(zhì)分子聚集到一起,濃縮為一狹窄的區(qū)帶。當(dāng)樣品進(jìn)入分離膠后,由于膠中pH的增加,呈堿性,甘氨酸大量解離,泳動(dòng)速率增加,直接緊隨氯離子之后,同時(shí)由于分離膠孔徑的縮小,在電場(chǎng)的作用下,蛋白分子根據(jù)其固有的帶電性和分子大小進(jìn)行分離。主要試劑4. 10% 十二烷基硫酸鈉SDS溶液 是陰離子去污劑,作為變性劑和助溶試劑 去蛋白質(zhì)電荷; 斷裂分子內(nèi)和分子間的氫鍵,取消蛋白分子內(nèi)的疏水作用;使分子去折疊,破壞蛋白分子的二、三級(jí)結(jié)構(gòu),常溫保存。主要試劑5. 10% 過(guò)硫酸銨(AP) 催化劑,催化單丙和雙丙聚合成聚丙烯酰胺,4保存,一周內(nèi)使用 0.1g過(guò)硫酸銨溶于
5、1mlddH2O中主要試劑6.四甲基乙二胺TEMED 催凝劑,加速AP催化作用,在聚合過(guò)程中,TEMED催化過(guò)硫酸銨產(chǎn)生自由基,后者引發(fā)丙烯酰胺單體聚合,同時(shí)甲叉雙丙烯酰胺與丙烯酰胺鏈間產(chǎn)生甲叉鍵交聯(lián),從而形成三維網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)主要試劑7. 8SDS-PAGE Loading Buffer溶液(上樣緩沖液) loading buffer的功能主要有兩個(gè): 第一,里邊的指示劑溴酚藍(lán)起到指示的作用,它是一個(gè)較小的分子,可以自由通過(guò)凝膠孔徑,所以它顯示著電泳的前沿位置,以便我們適時(shí)終止電泳; 第二,里邊的成分甘油可以加大樣品密度,使其沉降到點(diǎn)樣孔中,防止樣品飄出點(diǎn)樣孔。 SDS主要是促使聚合酶變性,因?yàn)闆](méi)
6、有除盡的聚合酶會(huì)結(jié)合在DNA雙鏈上影響它的遷移速率。細(xì)胞裂解后的裂解液,加loading 100加熱,也是為了中止酶促反應(yīng),防止提取的蛋白質(zhì)降解。主要試劑8.10轉(zhuǎn)印Buffer(貯存液) 4保存 10轉(zhuǎn)印Buffer(貯存液)的配制: 0.25 M Tris 30.28 g 1.92 M Glycine 144.13 g 三蒸水定容至 1000 mL 1Transfer Buffer(工作液): 10Transfer Buffer 100 mL 三蒸水 700 mL 20 % 甲醇 200 mL主要試劑9.甲醇 轉(zhuǎn)膜液中主要是降低電導(dǎo)的作用,防止轉(zhuǎn)膜溶液過(guò)熱。10.聚偏二氟乙烯(Polyvi
7、nylidene fluoride, PVDF)膜 PVDF膜靈敏度、分辨率和蛋白親和力比常規(guī)的膜要高,非常適合于低分子量蛋白的檢測(cè),用前需在甲醇中浸泡,以活化膜上 的正電基團(tuán),使其更容易與帶負(fù)電荷蛋白結(jié)合。主要試劑11.三羥甲基氨基甲烷緩沖鹽溶液Tris buffer saline(1TBS) 洗去Tween,因?yàn)門(mén)ween會(huì)影響發(fā)光 10 mM Tris-HCl (pH=8.0)1 M 10 mL 150 mM NaCl 5 M 30 mL 三蒸水定容至 1000 mL12. Tris buffer saline Tween( TBST)緩沖液 洗去未結(jié)合的抗體 1TBS 1000 mL
8、0.05 % Tween-20 0.5 mL主要試劑13.封閉緩沖液 封閉膜上的非特異性蛋白結(jié)合位點(diǎn),防止一抗、二抗的非特異性反應(yīng) TBST Buffer 100 mL 5 % Nonfat Milk 5 g14.一抗15.二抗:羊抗兔IgG/HRP(辣根過(guò)氧化酶) 使試劑中的發(fā)光物氧化并發(fā)光16. ECL檢測(cè)試劑操作步驟提取總蛋白蛋白濃度測(cè)定SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳ECL檢測(cè)封閉二抗一抗洗滌洗滌掃描分析轉(zhuǎn)膜操作步驟1.細(xì)胞總蛋白提取及定量2.配膠3.制膠 先用1ml槍頭小心鋪12%分離膠,上加少許ddH2O,待分離膠干凝后,倒去ddH2O ,用濾紙吸干。再鋪8%濃縮膠,注意不要產(chǎn)生氣泡,斜
9、插上梳子,待膠干后備用,拔去梳子。4.上樣 所有上樣孔均加樣,沒(méi)有樣本,用上樣緩沖液代替。5.電泳 取40 g蛋白經(jīng)8%濃縮膠電泳80V 30min,12%分離膠電泳110V 90min。6.轉(zhuǎn)膜 電泳結(jié)束后,切除濃縮膠,按照負(fù)極-3張濾紙-分離膠-PVDF濾膜-3張濾紙-正極的順序,組裝電轉(zhuǎn)膜體系,100V 轉(zhuǎn)膜25min。操作步驟7.PVDF膜的免疫學(xué)檢測(cè) PVDF膜經(jīng)5%脫脂奶室溫封閉1 h一抗4溫和震蕩過(guò)夜TBST洗滌三次HRP標(biāo)記二抗室溫溫育1 hTBST洗滌三次后,應(yīng)用化學(xué)發(fā)光底物檢測(cè)試劑盒進(jìn)行檢測(cè)8.結(jié)果分析 以GAPDH為內(nèi)參照,以靶蛋白/內(nèi)參照灰度的比值作為蛋白的相對(duì)表達(dá)含量
10、,進(jìn)行半定量檢測(cè)常見(jiàn)問(wèn)題1.分離膠濃度 根據(jù)目的蛋白分子量選擇膠的濃度 蛋白分子量蛋白分子量 (kDa) 凝膠濃度凝膠濃度 (%) 4-40 20 12-45 15 10-70 12.5 15-100 10 25-200 8常見(jiàn)問(wèn)題2. 在濃縮膠與分離膠之間有pH的不連續(xù)性,這是為了控制慢離子的解離度,從而控制其有效遷移率.要求在樣品膠和濃縮膠中,慢離子較所有被分離樣品的有效遷移率低,以使樣品夾在快、慢離子界面之間,使樣品濃縮.而在分離膠中慢離子的有效遷移率比所有樣品的有效遷移率高,使樣品不再受離子界面的影響.常見(jiàn)問(wèn)題3. 加入分離膠后,立即覆一層雙蒸水,一是為了使分離膠界面保持水平,用水就可以把它壓平,使蛋白質(zhì)分子跑時(shí)在同一水平線上;二是阻止空氣中的氧氣對(duì)凝膠聚合的抑制作用。也可以覆蓋一層無(wú)水乙醇。常見(jiàn)問(wèn)題4. 從轉(zhuǎn)膜完畢后所有的步驟,一定要注意膜保濕,避免膜的干燥,否則極易產(chǎn)生較高的背景。膜兩邊的濾紙不能相互接觸,接觸后會(huì)發(fā)生短路6.電轉(zhuǎn)移時(shí)會(huì)產(chǎn)熱,在槽的一邊放一塊冰來(lái)降溫7.切濾紙和膜時(shí),一定要戴手套,因?yàn)槭稚系牡鞍讜?huì)污染膜常見(jiàn)問(wèn)題8.二抗的選擇根據(jù)一抗的種屬來(lái)源,如:一抗是兔抗大鼠目的蛋白的抗體,則二抗應(yīng)選擇山羊或其他來(lái)源抗兔的抗體,而且二抗要標(biāo)記有同位素或酶。9.條帶兩邊擴(kuò)散:加樣量
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