《生物化學》第1章蛋白質化學

1、膜膜蛋蛋白白膜蛋白起運輸作用膜蛋白起運輸作用抗體AntibodyAb 8、控制細胞生長、分化：、控制細胞生長、分化： 生長因子、阻遏蛋白生長因子、阻遏蛋白9、毒蛋白、毒蛋白： 植物、微生物、昆蟲所分泌植物、微生物、昆蟲所分泌10、許多蛋白在凝血作用、通透作用、許多蛋白在凝血作用、通透作用、 營養(yǎng)作用、記憶活動等方面起重要作用。營養(yǎng)作用、記憶活動等方面起重要作用。中文名稱英文名稱符號與縮寫 分子量側鏈結構類型丙氨酸 AlanineA 或 Ala 89.079CH3-脂肪族類精氨酸 ArginineR 或 Arg 174.188HN=C(NH2)-NH-(CH2)3- 堿性氨基酸類天冬酰胺 Asp

2、aragineN 或 Asn 132.104H2N-CO-CH2-酰胺類天冬氨酸 Aspartic acidD 或 Asp 133.089HOOC-CH2-酸性氨基酸類半胱氨酸 CysteineC 或 Cys 121.145HS-CH2-含硫類谷氨酰胺 GlutamineQ 或 Gln 146.131H2N-CO-(CH2)2-酰胺類谷氨酸 Glutamic acid E 或 Glu 147.116HOOC-(CH2)2-酸性氨基酸類甘氨酸 GlycineG 或 Gly 75.052H-脂肪族類組氨酸 HistidineH 或 His 155.141N=CH-NH-CH=C-CH2-|_|堿性

3、氨基酸類異亮氨酸 IsoleucineI 或 Ile 131.160CH3-CH2-CH(CH3)-脂肪族類亮氨酸 LeucineL 或 Leu 131.160(CH3)2-CH-CH2-脂肪族類賴氨酸 LysineK 或 Lys 146.17H2N-(CH2)4-堿性氨基酸類 蛋氨酸 MethionineM 或 Met 149.199 CH3-S-(CH2)2-含硫類苯丙氨酸 PhenylalanineF 或 Phe 165.177Phenyl-CH2-芳香族類脯氨酸 ProlineP 或 Pro 115.117-N-(CH2)3-CH-|_|亞氨基酸絲氨酸 SerineS 或 Ser 10

4、5.078HO-CH2-羥基類蘇氨酸 ThreonineT 或 Thr 119.105CH3-CH(OH)-羥基類色氨酸 TryptophanW 或 Trp 204.213Phenyl-NH-CH=C-CH2-|_|芳香族類酪氨酸TyrosineY 或 Tyr 181.1764-OH-Phenyl-CH2-芳香族類纈氨酸 ValineV 或 Val 117.133CH3-CH(CH2)-脂肪族類甘氨酸 丙氨酸 纈氨酸 亮氨酸 異亮氨酸 絲氨酸脯氨酸蘇氨酸半胱氨酸甲硫氨酸類別類別氨基酸氨基酸非極性氨基酸非極性氨基酸甘氨酸、丙氨酸、纈氨酸、亮氨酸、異甘氨酸、丙氨酸、纈氨酸、亮氨酸、異亮氨酸、苯丙氨

5、酸、脯氨酸亮氨酸、苯丙氨酸、脯氨酸極性氨基酸極性氨基酸極性中性氨基酸極性中性氨基酸色氨酸、酪氨酸、絲氨酸、半胱氨酸、色氨酸、酪氨酸、絲氨酸、半胱氨酸、蛋氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、蘇氨酸蛋氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、蘇氨酸酸性氨基酸酸性氨基酸天冬氨酸、谷氨酸天冬氨酸、谷氨酸堿性氨基酸堿性氨基酸賴氨酸、精氨酸、組氨酸賴氨酸、精氨酸、組氨酸Gly, GAla, AVal, VLeu, LMet, MIle, IPhe, F; Tyr, Y; Trp, WSer, SThr, TCys, CPro, PAsn, NGln, QLys, K; Arg, R; His, HAsp, D; Glu, E類別氨

6、基酸親水性氨基酸D, E, H, K, Q, R, S, T, 羥脯氨酸, 焦谷氨酸疏水性氨基酸A, F, I, L, M, P, V, W, Y, -氨基丁酸, -氨基丙氨酸, 正亮氨酸未定類C和G3 按其親水性、疏水性可分為：按其親水性、疏水性可分為：羥脯氨酸（膠原蛋白）鳥氨酸（甲狀腺蛋白）pH1pH 11pH6pH1pH 11pH6An acidic amino acid pI=(pK1+pKR)/2A basic amino acid pI=(pKR+pK2)/2R-R+R K1=RH+ R+K2=R+R-H+ K1 K2 =R+=RH+ R K2K1R-=H+ RH+ K1=R K2

7、H+ H+ 2570nm570nm440nmPro(Hy-Pro) 鑒定多肽或蛋白質的鑒定多肽或蛋白質的N-末端氨基酸末端氨基酸弱堿性弱堿性NCSNHCHCOR2NCHCOR1HHNHS:CCHCOR1HNNHCHCOR2SNHCNHOCR1CHNH2CHCOR2NCOCHNHSCR1 CCNCCNCCNCCNCC H2C HC H2C H2C H2C O O-O HC O2HC H2C O N H2O HC H3H3N+OOOOHHHHHHHHHSerValTyrAspGlnC H3N-端C-端肽鍵NHCOCH2NHCOCHNHCOCH3CHCHOHCH2OHCHHNCNHCHCNHCH2C

8、COCHNHHOCH2NHNHCHCHCH3CH2CH3COOOOCH2CH2SOOH鵝膏覃堿的化學結構 +H3N-Tyr-Gly-Gly-Phe-Met-COO- +H3N-Tyr-Gly-Gly-Phe-Leu-COO- Met-腦啡肽腦啡肽 Leu-腦啡肽腦啡肽CysTyrILeGlnAsnCysProLeuGlyNH2SS牛催產素CysTyrGlnAsnCysProSSPheArgGlyNH2牛加壓素活性肽活性肽SerGlyTyrAlaLeuH2NCHCROHNCHCROORnCCHHNOHn-1N-端氨基酸 C-端氨基酸ORnCCHH2NOHH2NCHCRONHNH2+H+NH2NH

9、2氨基酸酰肼C-端氨基酸血紅蛋白四級結構蛋白質結構有不同的組織層次： a鹽鍵（離子鍵鹽鍵（離子鍵 ） b氫鍵氫鍵 c疏水相互作用力疏水相互作用力 d 范德華力范德華力 e二硫鍵二硫鍵 f 酯鍵酯鍵氫鍵、范德華力、疏水相互作用力、鹽鍵，均為氫鍵、范德華力、疏水相互作用力、鹽鍵，均為次級鍵次級鍵氫鍵、范德華力雖然鍵能小，但數(shù)量大氫鍵、范德華力雖然鍵能小，但數(shù)量大疏水相互作用力對維持三級結構特別重要疏水相互作用力對維持三級結構特別重要鹽鍵數(shù)量小鹽鍵數(shù)量小二硫鍵對穩(wěn)定蛋白質構象很重要，二硫鍵越多，二硫鍵對穩(wěn)定蛋白質構象很重要，二硫鍵越多，蛋白質分子構象越穩(wěn)定蛋白質分子構象越穩(wěn)定離子鍵離子鍵氫鍵氫鍵范德

10、華力范德華力疏水相互作用力疏水相互作用力左手和右手螺旋左手和右手螺旋n蛋白質分子多為右手蛋白質分子多為右手 -螺旋。螺旋。 穩(wěn)定性與氨基酸組穩(wěn)定性與氨基酸組成有關成有關 在有在有pro處斷處斷裂裂 同種電荷的氨同種電荷的氨基酸處斷裂基酸處斷裂Four models of the helix, showing different aspectsof its structure.肌紅蛋白三級結構甘油醛3-P脫氫酶結構域蚯蚓血紅蛋白的結構域四個螺旋。免疫球蛋白VL的結構域丙糖異構酶血紅蛋白:2個亞基和2個亞基。一級結構與分子進化一級結構與分子進化 （依據(jù)細胞色素（依據(jù)細胞色素c建立的系統(tǒng)發(fā)生樹）建立的系統(tǒng)發(fā)生樹）超濾透析l 不同的蛋白質分子，由于其分子表面的極不同的蛋白質分子，由于其分子表面的極性基團的種類、數(shù)目以及排布的不同，其水性基團的種類、數(shù)目以及排布的不同，其水化層厚度不同，故鹽析