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文檔簡介

1、基因工程原理與應(yīng)用期末復(fù)習(xí)資料 提供者:友哥第一章 緒論1、基因工程的核心內(nèi)容是基因體外重組(DNA體外重組) 。2、基因工程的四大要素(或基本條件):目的基因、載體、工具酶、受體。3、基因工程誕生技術(shù)基礎(chǔ):限制性核酸內(nèi)切酶的發(fā)現(xiàn)與DNA的切割; DNA連接酶的發(fā)現(xiàn)與DNA片段的連接;基因工程載體的構(gòu)建與應(yīng)用。 4、1973年,斯坦福大學(xué)的S.Cohen研究小組的DNA體外重組和大腸桿菌轉(zhuǎn)化實驗。這一實驗的成功標(biāo)志著基因工程的誕生,因此,1973年被定為基因工程誕生的元年。 5、1982年首次通過顯微注射培育出世界上第一個轉(zhuǎn)基因動物轉(zhuǎn)基因小鼠。 1983年采用農(nóng)桿菌介導(dǎo)法培育出世界上第一例轉(zhuǎn)基

2、因植物轉(zhuǎn)基因煙草。 6、基因工程的基本操作程序(基本操作內(nèi)容):分離獲得帶有目的基因的DNA片段及載體選擇與構(gòu)建。限制性核酸內(nèi)切酶分別切割外源DNA和載體。通過DNA連接酶將外源基因DNA片段連接到載體上,形成重組DNA分子。將重組 DNA分子引入到受體細胞(轉(zhuǎn)化)。帶有重組體細胞(轉(zhuǎn)化體)的擴增及選擇培養(yǎng)。轉(zhuǎn)化體的鑒定,獲得外源基因高效穩(wěn)定表達的基因工程菌或細胞。目的基因的進一步研究分析,并設(shè)法使之實現(xiàn)功能蛋白的表達(基因功能研究或基因改造研究)。 7、轉(zhuǎn)化與轉(zhuǎn)化體的定義第二章 基因工程的工具酶1、工具酶是指基因工程操作中所使用的核酸酶類。根據(jù)其用途分為四類:限制性內(nèi)切酶、連接酶、聚合酶、修

3、飾酶。2、限制作用(restriction):指一定類型的細菌可以通過限制酶的作用,破壞入侵的噬菌體DNA,導(dǎo)致噬菌體的寄主幅度受到限制。這是維護宿主遺傳穩(wěn)定的保護機制。 修飾作用(modification):指寄主本身的DNA,由于在合成后通過甲基化酶的作用得以甲基化,使DNA得以修飾,從而免遭自身限制性酶的破壞。這是宿主細胞識別自身遺傳物質(zhì)和外來遺傳物質(zhì)的作用機制。3、限制性核酸內(nèi)切酶的命名:限制性核酸內(nèi)切酶第一個字母(大寫,斜體)代表該酶的宿主菌屬名(genus)第一個字母;第二、三個字母(小寫,斜體)代表宿主菌種名(species)前兩個字母。第四個字母代表宿主菌的菌株名的第一個字母(

4、小寫,正體)或染色體外成分(質(zhì)?;蚴删w,大寫,正體)。若從一種菌株中發(fā)現(xiàn)了幾種限制性核酸內(nèi)切酶,即根據(jù)發(fā)現(xiàn)和分離的先后順序用羅馬字母表示(正體)。 Haemophilus influenzae d 流感嗜血桿菌d株 Hind Hind 4、II型限制性內(nèi)切酶的識別序列:一般為46bp的回文序列。也有6bp以上的,如NotI,稱為稀有切割限制酶。有些為反向重復(fù)序列(間斷回文序列),如SfiI。有些II型限制酶的識別序列中,某一位或二位堿基并非嚴(yán)格專一,如Hind II可識別4種核苷酸序列。 酶識別序列酶識別序列BamH IGGATCCPst ICTGCA GBgl II A GATCTSal

5、IG TCGACEcoR IG AATTCSau3A IGATCHind IIGTPy PuACSfi IGGCCNNNN NGGCCHind IIIA AGCTTSma ICCC GGGKpn IGGTAC CXba IT CTAGANot IGC GGCCGCXho IC TCGAG5、II型限制性核酸內(nèi)切酶的切割方式:大多數(shù)II型限制性核酸內(nèi)切酶均在其識別位點內(nèi)部切割雙鏈DNA,水解磷酸二酯鍵中3位的酯鍵,產(chǎn)生3端為羥基、5端為磷酸基團的片段。有三種切割方式:在識別序列的對稱軸的5末端切割,產(chǎn)生5黏性末端,如 EcoRI。在識別序列的對稱軸的3端切割,則產(chǎn)生3黏性末端, 如PstI。在識

6、別序列的對稱軸上切割,產(chǎn)生平頭末端,如 PvuII。有些識別序列為間斷型回文序列的II限制酶,其切點位于不確定核苷酸中,如:Bgl I :GCCNNNNNGGC Sfi I :GGCCN NNNNNGGCC Xmn I :GAANNNNTTC 有極少數(shù)II型限制性核酸內(nèi)切酶的切割位點遠離識別序列,如 Mbo II識別 GAAGA序列,切割位點則是:5 GAAGANNNNNNNN N 3 3 CT TC TNNNNNNNN N56、同裂酶是指識別序列相同、切割方式相同或不同、來源不同的II限制性核酸內(nèi)切酶。同尾酶是指來源各異、識別序列不同,但產(chǎn)生相同的黏性末端的II限制性核酸內(nèi)切酶。7、II型限

7、制性核酸內(nèi)切酶的酶切反應(yīng)(1)標(biāo)準(zhǔn)酶解體系的建立:反應(yīng)體積一般為20l(根據(jù)DNA量可適當(dāng)擴大)。 10酶切緩沖液 2l(大部分酶反應(yīng)緩沖液基本相似:50mmol/LTris-HCl pH7.07.5、0100mmol/L NaCl、 10mmol/L MgCl2、 1mmol/L DTT);酶(根據(jù)酶活力大小及工作性質(zhì)確定酶量,不超過反應(yīng)總體積10 ;DNA樣品( gmg);無菌水。 限制性核酸內(nèi)切酶的一個活力單位(U)為:在合適的溫度和緩沖液中,在 20 L反應(yīng)體系中,1h完全降解 1ug 標(biāo)準(zhǔn)DNA所需要的酶量。 (2)限制性核酸內(nèi)切酶對DNA的不完全酶解(應(yīng)用在哪些方面):不完全酶解對

8、于構(gòu)建物理圖譜和基因組文庫是非常必要的。其方法有減少酶量、增加反應(yīng)體積、縮短反應(yīng)時間和降低反應(yīng)溫度等。 8、星號活性是指在極端非標(biāo)準(zhǔn)反應(yīng)條件下,限制性核酸內(nèi)切酶能切割與特異識別序列相似的序列的特性。引起星號活性的原因有:高甘油含量,大于5%;酶用量過大,大于100U/微克DNA;低離子強度,小于25mmol/L; 高pH,大于8.0;含有機劑,如乙醇、二甲基亞砜、二甲基乙酰胺等;Mn2+、Cu2+、Co2+、Zn2+等非Mg2+的二價陽離子的存在。常發(fā)生星活性的內(nèi)切酶有:EcoRI、Hind、KpnI、PstI、SalI、HinfI等。 9、DNA連接酶是指能催化雙鏈DNA分子內(nèi)或分子間的5-

9、磷酸基和3-羥基生成磷酸二酯鍵而使DNA鏈連接的一類酶。DNA連接酶的種類:(1)T4 噬菌體DNA 連接酶(T4 DNA 連接酶)(重點) 平頭末端的Km比黏性末端的Km高約1000倍。提高平頭末端連接效率的方法:加大酶濃度(10100倍于粘性末端); 加大底物濃度; 加入適量的一價陽離子(150-200 mmol/L NaCl); 加入低濃度的PEG(10%PEG8000)。ATP的最適終濃度為 0.5 mmol/L。(2)大腸桿菌DNA連接酶(3)T4噬菌體RNA連接酶 10、DNA連接酶的反應(yīng)體系:10L或20L,DNA片段,連接酶,Buffer,溫度(1216或30),時間(416h

10、) Buffer:50mmol/LTris-HCl pH7.6,10mmol/L MgCl2, 0.5mmol/L ATP,5mmol/L DTT11、影響連接反應(yīng)的因素:DNA末端的濃度 連接產(chǎn)物的分子構(gòu)型(線形或環(huán)狀)與DNA濃度及DNA分子長度存在密切關(guān)系。在一定濃度下,小分子DNA片段進行分子內(nèi)連接,有利于形成環(huán)化分子。對于長度一定的DNA分子,其濃度增加有利于分子間連接。此外,分子間連接還與兩種片段的末端濃度的比例有關(guān)。原則上一種片段的濃度大于另一一種片段的濃,如:在克隆中,插入片段:載體片段=2:1。12、切口平移作用(P26) 主要用途:切口平移法制備DNA探針13、對天然的T7

11、DNA聚合酶進行修飾,使之降低或完全失去35的外切酶活性,而聚合酶活性增加了3倍。因此,修飾的T7 DNA聚合酶主要用于雙脫氧測序,又稱作為測序酶。14、Taq DNA聚合酶 Taq DNA聚合酶具有53聚合酶活性和53 外切酶活性,缺少35外切酶活性。其最大特點是熱穩(wěn)定(95以上高溫半小時不失活),最適反應(yīng)溫度高(70 75)。因此,其主要用途是PCR及DNA測序(具有二級結(jié)構(gòu)的DNA)。 保真的PCR 酶有Tma DNA聚合酶(Thermotoa maritima 海棲熱袍菌)、Tli DNA聚合酶(Thermococcus litoralis 海棲熱球菌)、Pfu DNA聚合酶(Pyro

12、coccus furiosus 激烈火球菌)、 Pwo DNA聚合酶(Pyrococcus woesi 沃氏火球菌)。 15、商品化的逆轉(zhuǎn)錄酶主要是鳥類骨髓母細胞瘤病毒(avian myeloblastosis virus,AMV)逆轉(zhuǎn)錄酶和Moloney鼠白血病病毒(Moloney murine leukemia virus,Mo-MLV) 逆轉(zhuǎn)錄酶。其用途有:合成cDNA第一鏈,構(gòu)建cDNA文庫;RT-PCR;以RNA為模板制備DNA探針;補平和標(biāo)記5-末端突出的DNA片段;代替Klenow酶用于DNA序列分析。16、末端脫氧核苷酸轉(zhuǎn)移酶(末端轉(zhuǎn)移酶) 用途:給載體和外源DNA (如cDN

13、A或隨機切割DNA)接上同聚物尾,以便連接;末端標(biāo)記17、核糖核酸酶H(作用底物) RNase H特異地降解DNA/RNA雜交雙鏈中的RNA鏈,產(chǎn)生具有3-OH和5-磷酸末端的寡核苷酸和單核苷酸,不能降解單鏈或雙鏈的DNA或RNA。其用途是產(chǎn)生cDNA第二鏈合成的引物。18、S1核酸酶的作用底物(P32)19、堿性磷酸酶的用途5末端標(biāo)記前的處理 ;去除載體片段的5磷酸基因,防止載體自身連接。 第三章 基因工程載體1、載體(vector)是指基因工程中攜帶外源基因進入受體細胞的“運載工具”,其本質(zhì)是DNA復(fù)制子。必備基本條件:能在宿主細胞內(nèi)進行獨立和穩(wěn)定的自主復(fù)制;具有合適的限制性內(nèi)切酶位點;

14、具有合適的選擇標(biāo)記基因。2、質(zhì)粒載體的3個共同組分(P41)3、質(zhì)粒的復(fù)制類型 嚴(yán)緊型:嚴(yán)格受宿主控制,13拷貝 ;松弛型:不嚴(yán)格受宿主控制,10200拷貝 (P42) 4、理想質(zhì)粒載體的必備條件:具有較小的分子量和較高的拷貝數(shù) ;具有若干限制性酶的單一酶切位點(多克隆位點,multiple cloning sites,MCS);具有兩種以上的選擇標(biāo)記基因; 缺失mob基因或nic位點; 插入外源基因的重組質(zhì)粒較易導(dǎo)入宿主細胞并復(fù)制和表達。 5、多克隆位點(多接頭,polylinker,或限制性酶切位點庫)是指載體上人工合成的含有緊密排列的多種限制性核酸內(nèi)切酶的酶切位點的DNA片段。6、載體構(gòu)

15、建的基本原則:根據(jù)基因操作的工作需要;符合理想載體的必備條件; 選擇適合的親本質(zhì)粒提供載體元件;盡量簡化構(gòu)建程序7、pBR322的構(gòu)建的3個親本質(zhì)粒(P45)8、pUC系列載體(P48)、T載體9、分泌型表達載體與非分泌型表達載體的差異(P50)10、穿梭質(zhì)粒載體是指一類由人工構(gòu)建的具有兩種不同復(fù)制起點和選擇標(biāo)記、可在兩種不同的宿主細胞中存活和復(fù)制的質(zhì)粒載體。11、插入型載體:只具有一個克隆位點可供外源DNA插入的噬菌體載體。克隆容量較小,一般在10kb以內(nèi),用于cDNA及小片段DNA的克隆。 取代型載體:具有成對的克隆位點以使兩個位點之間的 DNA區(qū)段可以被外源DNA片段取代的噬菌體載體???/p>

16、隆容量較大,20kb左右,常用來構(gòu)建高等真核生物的基因組文庫。 12、野生型噬菌體不能在在P2噬菌體的溶源菌中生長,即為Spi+表型。當(dāng)其缺失red、gam基因,就能在P2溶源菌中能生長并形成噬菌斑,便獲得Spi-表型。 這類載體的中間填充片段上都具有red、gam基因,當(dāng)中間填充片段被外源DNA取代后,重組體便能在P2溶源菌中生長并形成噬菌斑,而非重組體則不能在P2溶源菌中生長,這種篩選重組體的方法稱為Spi-選擇。13、M13噬菌體載體的主要用途:DNA 測序;基因定點突變;探針制備。14、噬菌粒載體是一類含有單鏈?zhǔn)删w(M13)復(fù)制起點的質(zhì)粒載體。15、黏粒載體是一類含有噬菌體cos序列

17、的質(zhì)粒載體。又稱柯斯質(zhì)粒載體。黏粒載體的最大克隆容量為48kb(如pHS262),最低為14kb(如pJC720)。 16、黏??寺〈嬖诘膯栴}及解決方案在連接反應(yīng)中,黏粒載體片段彼此首尾相連形成多聚體分子。解決方案:一是用堿性磷酸酶處理,可阻止載體分子自身連接;二是使用Ish-Horowicz-Burke黏粒克隆方案(見下圖);三是使用Bates-Swift黏粒克隆方案(雙cos序列的黏粒載體,見下圖)。 在連接反應(yīng)中,酶切的基因組DNA片段(特別是較小的DNA 片段)往往會出現(xiàn)兩個或數(shù)個片段隨機再連接,串聯(lián)地插入到載體上,其連接順序并不符合基因組中排列順序。因此,DNA序列分析結(jié)果往往會出現(xiàn)

18、錯誤。解決方案是將局部消化產(chǎn)物通過凝膠電泳分級分離,獲得長度為3145kbDNA片段。 17、酵母人工染色體(YAC) 酵母自主復(fù)制序列;酵母著絲粒;四膜蟲端粒;酵母選擇性標(biāo)記(Trp1、Ura3、Sup4抑制宿主細胞ade2的琥珀突變)。克隆容量:1002000kb 細菌人工染色體 (BAC) 來源于F質(zhì)粒。克隆容量:300kb;優(yōu)點:拷貝數(shù)低,穩(wěn)定,比YAC易分離。 18、表達載體構(gòu)建的一般原則:(1)閱讀框架與外源基因高效表達 表達載體一般都有三種變體,以適用于具不同閱讀框架酶切位點的基因表達。用人工接頭可以調(diào)節(jié)閱讀框架。(2)啟動子與外源基因高效表達 轉(zhuǎn)錄起始的速率是基因表達的主要的限

19、速步驟。選擇強啟動子增強子是構(gòu)建高效表達載體的首要問題。(3)轉(zhuǎn)錄的有效延伸和終止與外源基因高效表達 除去衰減子;插入抗轉(zhuǎn)錄終止序列; 強轉(zhuǎn)錄終止序列;原核生物一般用rrnB。真核生物poly(A) 位點。(4)有效的翻譯起始與外源基因高效表達(5)終止密碼與外源基因高效表達 原核生物表達載體:UAA,或幾個終止密碼串聯(lián)。(6)密碼子選擇與外源基因高效表達 消除基因中的限制密碼,以其他同義密碼替代。(7)外源蛋白的穩(wěn)定性與外源基因高效表達 構(gòu)建融合表達載體,表達融合蛋白;構(gòu)建分泌表達載體,表達分泌蛋白。(8)減輕細胞的代謝負荷 特別是毒性蛋白。使用誘導(dǎo)啟動子合理地調(diào)節(jié)好宿主細胞的代謝負荷與外源

20、基因高效表達的關(guān)系。 19、常用的組成型啟動子 花椰菜花葉病毒(CaMV)35S啟動子、胭脂堿合成酶基因(Nos)啟動子、章魚堿合成酶基因(Ocs)啟動子20、報告基因是指用于檢測與其組裝在一起的外源基因在導(dǎo)入細胞后是否表達的一種指示基因。常用的有:冠癭堿合成酶基因;-葡萄糖苷酸酶基因(GUS)熒光素酶基因或GFP基因 第四章 核酸操作的基本技術(shù)1、核酸提取純化的基本程序:細胞破碎; 抽提(除去蛋白質(zhì)、多糖、脂、其他核酸等雜質(zhì)); 核酸沉淀(乙醇、異丙醇);核酸溶解與保存。 2、核酸的凝膠電泳原理:在一定條件下,核酸分子的磷酸基團呈離子化狀態(tài),當(dāng)被放在電場中,它們就會向正極方向遷移。在無反應(yīng)活

21、性的穩(wěn)定的支持介質(zhì)中,其遷移速度與電場強度成正比,與該分子所攜帶的凈電荷數(shù)成正比,與分子的磨擦系數(shù)成反比(分子大小、介質(zhì)粘度系數(shù))。因此,在同一凝膠中、一定電場強度下,核酸分子的遷移速度取決于核酸分子大小和構(gòu)型。3、染色(P102、103)4、將具有核酸印跡的膜與帶有放射性標(biāo)記或其它標(biāo)記的DNA或RNA探針雜交。故也稱印跡雜交。5、探針(probe)是指分子雜交中經(jīng)放射性或非放射性等物質(zhì)標(biāo)記的已知或特定的DNA或RNA片段。探針:(1)DNA探針 雙鏈DNA探針,單鏈DNA探針(2)RNA探針 單鏈RNA探針 或放射性標(biāo)記探針(同位素標(biāo)記探針)和非放射性標(biāo)記探針(非同位素標(biāo)記探針)6、同位素標(biāo)

22、記探針 酶促標(biāo)記法:切口平移標(biāo)記法;制備雙鏈DNA探針。隨機引物標(biāo)記法;制備雙鏈DNA、單鏈DNA、RNA探針。操作簡單方便,標(biāo)記活性高,可達108cpm/gDNA。PCR標(biāo)記法。探針純化:乙醇沉淀法、葡聚糖凝膠柱層析法。雜交檢測:放射自顯影。 7、核酸分子雜交的類型:Southern DNA 印跡雜交(Southern 印跡雜交、Southern blotting);Northern RNA印跡雜交(Northern 印跡雜交,Northern blotting);斑點印跡雜交(dot blotting);原位雜交(hybridization in situ)。8、SouthernDNA 印

23、跡雜交操作步驟:DNA樣品的瓊脂糖凝膠電泳分離;凝膠預(yù)處理;包括酸脫嘌呤、堿變性等;凝膠中DNA印跡到雜交膜上;毛細管虹吸印跡法、電印跡法、真空印跡法。DNA固定;80烤膜、紫外交聯(lián)。 雜交;包括預(yù)雜交(封閉劑)、探針雜交、洗脫。雜交信號檢測;放射自顯影(2ng DNA/帶)或顯色反應(yīng)。結(jié)果分析。 第五章 聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)1、PCR原理:遵循DNA體內(nèi)復(fù)制原理,半保留式擴增;擴增序列取決于設(shè)計一對引物(正向引物、反向引物),有效擴增長度為2kb左右;擴增循環(huán)包含變性、退火、延伸3個階段;3035個循環(huán)后,目標(biāo)序列呈指數(shù)級擴增(2n-2)。2、平臺效應(yīng)是指PCR反應(yīng)后期擴增產(chǎn)物不再隨循環(huán)次數(shù)而明顯

24、上升、反應(yīng)曲線變得平坦的現(xiàn)象。引起平臺效應(yīng)的因素:dNTP或引物等消耗殆盡; 酶活性逐漸降低; 最終產(chǎn)物的阻化作用(焦磷酸鹽、雙鏈DNA); 非特異性產(chǎn)物與模板的競爭作用; 在高產(chǎn)物濃度下產(chǎn)物變性不完全; 低濃度的非特異產(chǎn)物開始大量擴增。3、引物設(shè)計的一般原則(P116)4、逆轉(zhuǎn)錄PCR( RT-PCR)是指先以mRNA,以oligo(dT)n為引物在逆轉(zhuǎn)錄酶作用下合成cDNA第一鏈,然后用已知一對引物擴增cDNA片段的技術(shù)。5、快速擴增cDNA末端(RACE,錨定PCR)(P121)6、反向PCR的定義、鍋柄PCR的原理(P123) 7、熒光定量PCR (實時定量PCR) 熒光染料(EB):

25、結(jié)合雙鏈DNA會使熒光增強,但結(jié)合無特異性。 熒光標(biāo)記探針(見圖):利用Taq酶的外切酶活性,擴增時切斷探針釋放出熒光基團,使熒光增強。特異性強。用途:檢測病原菌、基因表達。 第六章 基因文庫的構(gòu)建與目的基因的獲得1、基因組文庫構(gòu)建的程序:(1)基因組DNA克隆片段的制備 高分子量基因組DNA的提??;DNA克隆片段的制備 (2)載體DNA片段的制備 酶切;一般用BamHI,產(chǎn)生與基因組DNA克隆片段相匹配的黏性末端。堿性磷酸酶處理; 載體DNA片段純化。有機溶劑抽提乙醇沉淀法、蔗糖密度梯度離心法。(3)基因組DNA片段與載體的連接(重組DNA分子的構(gòu)建) 連接效率主要受插入片段與載體的摩爾數(shù)比

26、以及DNA片段總濃度的影響。因此,應(yīng)通過連接預(yù)試驗確定連接反應(yīng)中載體臂和插入片段的用量。(4)重組DNA分子導(dǎo)入受體細胞。 對于噬菌體載體、黏粒載體,重組DNA分子在體外包裝成噬菌體顆粒,以噬菌體感染的方式將重組的DNA分子導(dǎo)入到大腸桿菌中。效率高,達1.8108pfu/g DNA。對于YAC載體,采用電激法導(dǎo)入重組DNA分子。(5)轉(zhuǎn)化體的篩選培養(yǎng)及基因組文庫的獲得。(6)基因組文庫的擴增、分裝及保存。2、cDNA 文庫的構(gòu)建:cDNA文庫是指某生物、組織或細胞所有cDNA的的克隆群體。包括組織特異性cDNA文庫、區(qū)域特異性cDNA文庫。(1)用于構(gòu)建cDNA文庫的載體及載體片段制備;(2)

27、mRNA的提取及其完整性的確定;(3)cDNA克隆片段的制備;(4)cDNA克隆片段與載體片段的連接及檢測;(5)重組cDNA分子導(dǎo)入受體細胞;(6)轉(zhuǎn)化體篩選培養(yǎng)及cDNA文庫生成;(7)cDNA文庫的擴增、分裝及保存。值得注意的是:在構(gòu)建cDNA文庫時,如果用人工接頭法,在酶切之前要用甲基化酶保護cDNA中的相應(yīng)酶切位點。一般情況下無需構(gòu)建原核細菌的cDNA文庫。 3、獲得目的基因的主要途徑:序列已知的基因篩選基因組文庫;篩選cDNA文庫;PCR擴增目的基因;人工合成法;未知序列的基因差異克隆法;圖位克隆法;轉(zhuǎn)座子標(biāo)簽法;T-DNA標(biāo)簽法;基因組計劃。第七章 DNA 體外重組與重組分子導(dǎo)入

28、受體細胞1、連接子(linker):人工合成的含有一種或幾種限制內(nèi)切酶位點的平頭末端雙鏈DNA片段,812bp長。2、外源基因片段與載體的連接方式:(1)黏性末端連接法(黏性末端法);(2)平頭末端連接法(平頭末端法);(3)同聚物加尾連接法(同聚物加尾法、同聚物接尾法);(4)人工接頭連接法(人工接頭法)。第八章 重組子(轉(zhuǎn)化子或克隆)的篩選與鑒定 1、重組子是指目的DNA片段與載體連接形成重組DNA分子。 轉(zhuǎn)化子(轉(zhuǎn)化體、克隆)是指導(dǎo)入外源DNA后獲得了新的遺傳標(biāo)志的受體細胞或由此而來的組織、生物體。 第九章 外源基因的表達1、真核基因在大腸桿菌中正確表達的基本條件: 外源基因必須是其cD

29、NA;置于原核細胞的強啟動子和SD序列控制之下;外源基因與表達載體連接后,必須形成正確的閱讀框架;修飾密碼子為大腸桿菌偏愛密碼子;聯(lián)同分子伴侶一起表達或以細菌融合蛋白的形式進行表達。2、真核細胞表達系統(tǒng)表達外源基因的特點:真核細胞具有RNA剪接功能,可以直接使用從基因組中分離克隆的基因;真核細胞的翻譯起始不同于原核生物,不需要在表達載體的克隆位點上游設(shè)置SD序列;真核細胞具有翻譯后修飾加工,表達的外源蛋白具有生物活性;外源基因?qū)胝婧思毎男瘦^低,其在染色體DNA上的整合是隨機的和自發(fā)的,目前還無法控制整合的位置和適當(dāng)?shù)目截悢?shù);真核細胞的培養(yǎng)要求較高,大量生產(chǎn)比較困難,成本也高。 第十章 植

30、物基因工程1、T-DNA是指農(nóng)桿菌質(zhì)粒上一段能轉(zhuǎn)移并整合到植物染色體上的DNA片段。 2、邊界序列:25bp,TGACACGATATATTGGCGGGTAAAC 右邊界序列是完全保守的,對T-DNA轉(zhuǎn)移是必須的。3、T-DNA轉(zhuǎn)移至植物細胞的機理(農(nóng)桿菌介導(dǎo)轉(zhuǎn)化的機理) 植物創(chuàng)傷反應(yīng)與農(nóng)桿菌對植物細胞的識別和附著;信號分子的釋放積累與VirA蛋白的感應(yīng); VirG蛋白激活與vir基因的誘導(dǎo)表達; T-鏈復(fù)合體的形成;T-鏈復(fù)合體的跨膜轉(zhuǎn)運;T-DNA整合到植物染色體上。 4、T-鏈?zhǔn)侵竩ir基因被誘導(dǎo)表達后加工T-DNA而產(chǎn)生的單鏈T-DNA。 T-鏈復(fù)合體是指結(jié)合了VirD2、VirE2蛋白的T-鏈。 5、三親交配法中的三親指含有中間載體質(zhì)粒的大腸桿菌、含有遷移質(zhì)粒的大腸桿菌、含有Ti質(zhì)粒的農(nóng)桿菌 6、植物轉(zhuǎn)化載體系統(tǒng),主要有共整合載體系統(tǒng)(由卸甲Ti質(zhì)粒載體、中間表達載體組成)、雙元載體系統(tǒng)(由微型質(zhì)粒、輔助 Ti質(zhì)粒組成)、隔端載體系統(tǒng)(由卸甲Ti質(zhì)粒載體和中間表達載體通過同源重組共整合成轉(zhuǎn)化載體,但與基因轉(zhuǎn)移相關(guān)的T-DNA左右邊界序列分別位于兩個載體上)。7、植物基因轉(zhuǎn)移的方法 農(nóng)桿菌介導(dǎo)法一般程序:制備工程農(nóng)桿菌侵染液 農(nóng)

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