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1、專題5 DNA和蛋白質(zhì)技術(shù)課題1 DNA的粗提取與鑒定課題目標(biāo) 目標(biāo):1本課題通過(guò)嘗試對(duì)植物或動(dòng)物組織中的DNA進(jìn)行粗提取,了解DNA的物理化學(xué)性質(zhì),2理解DNA粗提取以及DNA鑒定的原理。課題重點(diǎn):DNA的粗提取和鑒定方法。 知識(shí)要點(diǎn): 1. DNA的物理化學(xué)性質(zhì),尤其是DNA的溶解性2. 二苯胺法鑒定DNA的方法和原理。 基礎(chǔ)知識(shí)1、提取大分子的基本思路是什么? 選用一定的物理、化學(xué)方法分離具有不同物理或化學(xué)性質(zhì)的大分子。2、提取DNA分子的基本思路又是什么? 利用DNA與RNA、蛋白質(zhì)和脂質(zhì)等在物理和化學(xué)性質(zhì)上的差異,提取DNA,去除其他成分。3、提取和鑒定DNA的具體的依據(jù)有哪些方面?
2、(原理)1)、DNA的溶解性 DNA和蛋白質(zhì)等其它成分在不同濃度的NaCl溶液中溶解度不同。 1、在什么濃度下,DNA的溶解度最???DNA在Nacl 溶液中的溶解度是如何變化的?在NaCl溶液濃度低于0.14 mol/L時(shí),DNA的溶解度隨NaCl溶液濃度的增加而逐漸降低;在0.14 mol/L時(shí),DNA溶解度最小;當(dāng)NaCl溶液濃度繼續(xù)增加時(shí),DNA的溶解度又逐漸增大。 2、如何通過(guò)控制NaCl溶液的濃度使DNA在鹽溶液中溶解或析出? 當(dāng)氯化鈉的物質(zhì)的量濃度為 2 molL時(shí),DNA的溶解度最大,濃度為 014 molL時(shí),DNA的溶解度最低。利用這一原理,可以使DNA在鹽溶液中溶解或析出3
3、、提取和鑒定DNA的具體的依據(jù)有哪些方面?1)DNA的溶解性 DNA和蛋白質(zhì)等其它成分在不同濃度的NaCl溶液中溶解度不同。 DNA不溶于酒精溶液,但是細(xì)胞中的某些蛋白質(zhì)則溶于酒精2)、DNA對(duì)酶、高溫和洗滌劑的耐受性蛋白酶只能使蛋白質(zhì)水解大多數(shù)蛋白質(zhì)不能忍受6080的高溫而變性,但DNA在80 以上才變性。洗滌劑能瓦解細(xì)胞膜,但對(duì)DNA沒(méi)有影響。3、DNA的鑒定沸水浴下,DNA遇二苯胺被染成藍(lán)色;二苯胺鑒定DNA的化學(xué)原理: DNA中嘌呤核苷酸上的脫氧核糖遇酸生成-羥基-酮基戊醛,它再和二苯胺作用而呈現(xiàn)藍(lán)色(溶液呈淺藍(lán)色)。鑒定時(shí)溶液藍(lán)色的深淺,與溶液中DNA含量的多少有關(guān)。紫外燈照射法:
4、紫外燈照射法用蒸餾水配制質(zhì)量分?jǐn)?shù)為0.05%的溴化乙錠(EB)溶液,將玻璃棒上纏繞的白色絮狀物抹到蠟紙上,再滴1滴EB溶液染色。將蠟紙放在紫外燈(260 nm)下照射(暗室中),可呈現(xiàn)橙紅色的螢光(DNA的紫外吸收高峰在260 nm處)。甲基綠 (藍(lán)綠色)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)(一)實(shí)驗(yàn)材料的選?。ǘ┢扑榧?xì)胞,獲取含DNA的濾液(三)去除濾液中的雜質(zhì)(四)DNA的析出與鑒定實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)(一)實(shí)驗(yàn)材料的選取 含有DNA的組織且DNA含量較多的組織。比較下列材料哪些DNA含量高、適于提取DNA?為什么?哺乳動(dòng)物紅細(xì)胞:大腸桿菌: 雞血細(xì)胞:沒(méi)有細(xì)胞核,沒(méi)有DNA。原核生物,DNA含量少。DNA含量豐富,材料易得,
5、易吸水脹破。DNA含量相對(duì)較高的生物組織。 較好的實(shí)驗(yàn)材料應(yīng)該滿足以下幾個(gè)條件 :1組織中DNA的含量比較豐富,能夠適合大量提取。 2該組織中所含化合物種類應(yīng)比較單純,避免由于其他 物質(zhì)化學(xué)性質(zhì)與DNA相近,從而對(duì)實(shí)驗(yàn)現(xiàn)象產(chǎn)生某 些干擾。 3實(shí)驗(yàn)材料的價(jià)格適宜,從而能相對(duì)的降低實(shí)驗(yàn)成本。 4實(shí)驗(yàn)材料在實(shí)驗(yàn)過(guò)程中的可操作性較強(qiáng),在相對(duì)簡(jiǎn)單 的條件下能大量提取出DNA,便于學(xué)生實(shí)驗(yàn)操作(二)破碎細(xì)胞,獲取含DNA的濾液1、動(dòng)物細(xì)胞:蒸餾水 攪拌1、為什么加入蒸餾水能使雞血細(xì)胞破裂? 蒸餾水對(duì)于雞血細(xì)胞來(lái)說(shuō)是一種低滲液體,水分可以大量進(jìn)入血細(xì)胞內(nèi),使血細(xì)胞脹裂,再加上攪拌的機(jī)械作用,就加速了雞血細(xì)胞
6、的破裂(細(xì)胞膜和核膜的破裂),從而釋放出DNA。 旁欄問(wèn)題(二)破碎細(xì)胞,獲取含DNA的濾液1、動(dòng)物細(xì)胞:蒸餾水 攪拌2、植物細(xì)胞:洗滌劑和食鹽 攪拌和研磨若探究提取效果,可設(shè)置對(duì)照實(shí)驗(yàn)。2、加入洗滌劑和食鹽的作用分別是什么? 洗滌劑是一些離子去污劑,能溶解細(xì)胞膜,有利于DNA的釋放;食鹽的主要成分是NaCl,有利于DNA的溶解。 旁欄問(wèn)題3如果研磨不充分,會(huì)對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果產(chǎn)生怎樣的影響? 研磨不充分會(huì)使細(xì)胞核內(nèi)的DNA釋放不完全,提取的DNA量變少,影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果,導(dǎo)致看不到絲狀沉淀物、用二苯胺鑒定不顯示藍(lán)色等。 旁欄問(wèn)題4此步驟獲得的濾液中可能含有哪些細(xì)胞成分? 可能含有核蛋白、多糖和RNA等雜
7、質(zhì)。 (三)去除濾液中的雜質(zhì)方案一: DNA在不同濃度NaCl中溶解度不同;實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)旁欄問(wèn)題5為什么反復(fù)地溶解與析出DNA,能夠去除雜質(zhì)? 用高鹽濃度的溶液溶解DNA,能除去在高鹽中不能溶解的雜質(zhì);用低鹽濃度使DNA析出,能除去溶解在低鹽溶液中的雜質(zhì)。因此,通過(guò)反復(fù)溶解與析出DNA,就能夠除去與DNA溶解度不同的多種雜質(zhì)。(三)去除濾液中的雜質(zhì)方案一: DNA在不同濃度NaCl中溶解度不同;方案二: 加入嫩肉粉(含木瓜蛋白酶)方案三: 6075恒溫水浴保溫1015min實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)旁欄問(wèn)題6方案二與方案三的原理有什么不同?方案二是利用蛋白酶分解雜質(zhì)蛋白,從而使提取的DNA與蛋白質(zhì)分開(kāi);方案三利用的
8、是DNA和蛋白質(zhì)對(duì)高溫耐受性的不同,從而使蛋白質(zhì)變性,與DNA分離。 (四)DNA的析出與鑒定:95%的冷酒精靜置23min,出現(xiàn)白色絲狀物玻璃棒卷起加入2mol/L氯化鈉溶解,加入4mL二苯胺試劑,搖勻,沸水浴5min,觀察顏色變化。 (注意設(shè)置空白對(duì)照)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)使用冷的乙醇溶液具哪些優(yōu)點(diǎn)?一、抑制核酸水解酶活性,防止DNA降解;二、降低分子運(yùn)動(dòng),易于形成沉淀析出;三、低溫有利于增加DNA分子柔韌性,減少斷裂。 P56操作提示1、血液應(yīng)加入檸檬酸鈉(抗凝劑)防止血液凝固;2、加洗滌劑,動(dòng)作要輕緩,防止產(chǎn)生大量氣泡; 加酒精、玻棒攪拌,動(dòng)作要輕緩,以免加劇DNA分子的斷裂。3、二苯胺試劑現(xiàn)配現(xiàn)
9、用。結(jié)果分析與評(píng)價(jià)(一)是否提取出了DNA 觀察你提取的DNA顏色,如果不是白色絲狀物,說(shuō)明DNA中的雜質(zhì)較多;二苯胺鑒定出現(xiàn)藍(lán)色說(shuō)明實(shí)驗(yàn)基本成功,如果不呈現(xiàn)藍(lán)色,可能所提取的DNA含量低,或是實(shí)驗(yàn)操作中出現(xiàn)錯(cuò)誤,需要重新制備。結(jié)果分析與評(píng)價(jià)(二)分析DNA中的雜質(zhì) 本實(shí)驗(yàn)提取的DNA粗制品有可能仍然含有核蛋白、多糖等雜質(zhì)。(三)不同實(shí)驗(yàn)方法的比較 對(duì)于不同的實(shí)驗(yàn)方法,本課題可以采用分組的方法進(jìn)行研究。首先選取不同的實(shí)驗(yàn)材料,其次同種材料還可以采用不同方法,從多方面比較實(shí)驗(yàn)結(jié)果,如DNA的純度、DNA的顏色、二苯胺顯色的深淺等,看看哪種實(shí)驗(yàn)材料、哪種提取方法的效果更好。練習(xí) 提取DNA的第一步
10、是材料的選取,其目的是一定要選取DNA含量較高的生物材料,否則會(huì)由于實(shí)驗(yàn)過(guò)程中或多或少的損失而造成檢測(cè)的困難;第二步是DNA的釋放和溶解,這一步是實(shí)驗(yàn)成功與否的關(guān)鍵,要盡可能使細(xì)胞內(nèi)的DNA全部溶解;第三步是DNA的純化,即根據(jù)DNA的溶解特性、對(duì)酶及高溫的耐受性的不同等特性,最大限度地將DNA與雜質(zhì)分開(kāi);最后一步是對(duì)DNA進(jìn)行鑒定,這是對(duì)整個(gè)實(shí)驗(yàn)的結(jié)果的檢測(cè)。 1、請(qǐng)解釋提取DNA的實(shí)驗(yàn)操作中主要 步驟的目的。練習(xí) 提取蛋白質(zhì)比提取DNA的難度大。這是因?yàn)?,與DNA相比,蛋白質(zhì)對(duì)溫度、鹽濃度、pH等條件要敏感得多,很容易失活;并且蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)多種多樣,理化性質(zhì)各不相同,使得蛋白質(zhì)的提取沒(méi)
11、有一種統(tǒng)一的方法,只能根據(jù)特定蛋白質(zhì)的特性摸索提取的條件,設(shè)計(jì)特定的方法。 2、你認(rèn)為從細(xì)胞中提取某種特定的蛋白質(zhì)與提取DNA一樣容易嗎?為什么?案例一:以雞血為實(shí)驗(yàn)材料進(jìn)行DNA的粗提取實(shí)驗(yàn)案例雞血細(xì)胞極易吸水脹破,而用動(dòng)物肝臟細(xì)胞作實(shí)驗(yàn)材料常常需要?jiǎng)驖{和離心,對(duì)設(shè)備要求較高,操作繁瑣,歷時(shí)較長(zhǎng)1、雞血細(xì)胞做實(shí)驗(yàn)材料的原因雞血細(xì)胞核的DNA含量豐富,材料易得2、實(shí)驗(yàn)原理 DNA在NaCl溶液中的溶解度,是隨著NaCl的濃度的變化而改變的。當(dāng)NaCl的物質(zhì)的量濃度為0.14 molL時(shí),DNA的溶解度最低。利用這一原理,可以使溶解在NaCl溶液中的DNA析出。 DNA不溶于酒精溶液,但是細(xì)胞中
12、的某些蛋白質(zhì)可以溶于酒精溶液。利用這一原理,可以進(jìn)一步提取出含雜質(zhì)較少的DNA。 DNA遇二苯胺(沸水浴)會(huì)染成藍(lán)色,因此,二苯胺可以作為鑒定DNA的試劑。4、課前準(zhǔn)備雞血細(xì)胞液取質(zhì)量濃度為01g/ml的檸檬酸納溶液(抗凝劑)100ml,置于500ml燒杯中。注入新鮮的雞血(約180ml),同時(shí)用玻璃棒攪拌,使血液與檸檬酸納溶液充分混合,以免凝血。將燒杯中的血液置于冰箱內(nèi),精置一天,使血細(xì)胞自行沉淀。(也可以將血液倒入離心管內(nèi),用1000r/min(轉(zhuǎn)每分)的離心機(jī)離心2min,血細(xì)胞沉淀于離心管底部。實(shí)驗(yàn)時(shí)。用吸管除去離心管上部的澄清液,就可以得到雞血細(xì)胞液。)過(guò)程檸檬酸鈉作用防止血液凝固作
13、用機(jī)理檸檬酸鈉能與血漿中的Ca2+發(fā)生反應(yīng),生成檸檬酸鈣絡(luò)合物,血漿中游離的Ca2+大大減少,血液就不會(huì)凝固雞血細(xì)胞破碎以后釋放出的DNA,容易被玻璃容器吸附,所以在提取過(guò)程中為了減少DNA的損失,最好使用塑料的燒杯和試管盛放雞血細(xì)胞液注意事項(xiàng)討論:提取雞血中的DNA時(shí),為什么除去血液中的上清液?答:血液分為兩部分,一部分是血漿,一部分是血細(xì)胞,離心后除去的上清液是血漿5、方法步驟 將制備好的雞血細(xì)胞液5 mL10mL,注入到50 mL燒杯中。向燒杯中加入蒸餾水20 mL,同時(shí)用玻璃棒充分?jǐn)嚢? min,使血細(xì)胞加速破裂。然后,用放有紗布的漏斗將血細(xì)胞液過(guò)濾至500mL。取其濾液。提取雞血細(xì)胞
14、的細(xì)胞核物質(zhì)討論:答:讓細(xì)胞內(nèi)濃度大于周圍溶液的濃度,細(xì)胞會(huì)吸水以至脹破(1)為什么要加入蒸餾水?加入蒸餾水后細(xì)胞會(huì)有什么變化?(2)用玻璃棒攪拌有什么意義?答:用玻璃棒攪拌可以加速血細(xì)胞和細(xì)胞核的破裂。注意應(yīng)沿一個(gè)方向快速攪拌,但也不能太快太猛,防止打碎DNA(3)濾去的是什么物質(zhì)?得到的是什么?答:過(guò)濾將濾去的是細(xì)胞膜和核膜等物質(zhì);得到的是與蛋白質(zhì)等物質(zhì)結(jié)合在一起的DNA溶解細(xì)胞核內(nèi)的DNA將氯化鈉的物質(zhì)的量濃度為 2 mol的溶40mL加入到濾液中,并用玻璃棒沿一個(gè)方向攪拌1min,使其混合均勻,這時(shí)DNA在溶液中呈溶解狀態(tài)沿?zé)瓋?nèi)壁緩緩加入蒸餾水,同時(shí)用玻璃棒不停地輕輕攪拌,這時(shí)燒杯中
15、有絲狀物出現(xiàn),注意觀察絲狀物呈什么顏色。繼續(xù)加入蒸餾水,溶液中出現(xiàn)的粘稠物會(huì)越來(lái)越多。當(dāng)粘稠物不再增加時(shí)停止加入蒸餾水(這時(shí)溶液中氯化鈉的物質(zhì)的量濃度相當(dāng)于0.14 molL)析出含DNA的粘稠物討論:加入蒸餾水的目的?降低NaCl溶液濃度到使DNA溶解度最低點(diǎn),使DNA從NaCl溶液中析出將溶液中的DNA與其他雜質(zhì)分離,這一步驟是實(shí)驗(yàn)成敗的關(guān)鍵。實(shí)驗(yàn)中應(yīng)該緩慢貼壁加入蒸餾水,并輕輕地沿一個(gè)方向不停地均勻攪拌,以利于DNA分子的附著和纏繞注意事項(xiàng):濾取含DNA的粘稠物用放有多層紗布的漏斗,過(guò)濾步驟3中的溶液至 500mL的燒杯中,含 DNA的粘稠物被留在紗布上將DNA的粘稠物再溶解取 1個(gè) 5
16、0 mL燒杯,向燒杯內(nèi)注入氯化鈉的物質(zhì)的量濃度為 2 molL的溶液 20mL。用鈍頭鑷子將紗布上的粘稠物夾至氯化鈉溶液中,用玻璃擇不停地?cái)嚢?,使粘稠物盡可能多地溶解于溶液中過(guò)濾含有DNA的氯化鈉溶液取1個(gè)100 mL燒杯,用放有兩層紗布的漏斗過(guò)濾步驟5中的溶液。取其濾液,DNA溶于濾液中提取含雜質(zhì)較少的DNA在上述濾過(guò)的溶液中,加入冷卻的、酒精的體積分?jǐn)?shù)為 95的溶液 50mL(使用冷卻的酒精,對(duì)DNA的凝集效果較佳),并用玻璃棒攪拌,溶液中會(huì)出現(xiàn)含雜質(zhì)較少的絲狀物。用玻璃棒將絲狀物卷起,并用濾紙吸取上面的水分。這種絲狀物的主要成分就是DNA答:因?yàn)镈NA不溶于冷酒精,而其他物質(zhì)可以溶解在酒
17、精中,使含雜質(zhì)較少的DNA絲狀物可以析出,懸浮于溶液中討論:(2)觀察絲狀物呈什么顏色?答:白色(1)為什么要加50mL的冷酒精?取兩支20 mL的試管,各加入氯化鈉的物質(zhì)的量濃度為0015 molL的溶液5 mL,將絲狀物放入其中一支試管中,用玻璃棒攪拌,使絲狀物溶解。然后,向兩支試管中各加入4mlL的二苯胺試劑?;旌暇鶆蚝?,將試管置于沸水中加熱 5 min,待試管冷卻后,觀察并且比較兩支試管中溶液顏色的變化 DNA的鑒定討論:答:有絲狀物的試管變成藍(lán)色,另一試管還是原來(lái)顏色(2)這一鑒定結(jié)果說(shuō)明什么問(wèn)題?(1)比較兩個(gè)試管中溶液的顏色有什么不同?答:提取出的絲狀物是DNA(3) DNA的直
18、徑約為2010-10 m,實(shí)驗(yàn)中出現(xiàn)的絲狀物的粗細(xì)是否表示1個(gè)DNA分子直徑的大小?答: DNA分子直徑只有2 nm。絲狀物是多個(gè)DNA子聚在一起形成的 答:整個(gè)實(shí)驗(yàn)共“兩次蒸餾水,三次過(guò)濾,兩次析出,六次攪拌”6、討論:兩次蒸餾水第一次:細(xì)胞吸水脹破 第一步第二次:使 DNA黏稠物析出 第三步(1)此實(shí)驗(yàn)過(guò)程中有幾次使用蒸餾水?幾次過(guò)濾,幾次析出,幾次攪拌?分別在哪一步? 過(guò)濾時(shí)使用的紗布層數(shù)與需用濾液或黏稠物有關(guān),第二次要用其濾出的黏稠物有關(guān),所以要使用多層紗布,第一次和第三次均要用其濾液,使用的紗布為12層三次過(guò)濾第一次: DNA存在于濾液里 第一步第二次: DNA被留在紗布上 第四步第
19、三次: DNA存在于濾液里 第六步兩次析出第一次:用0.14 molL 的NaCI溶液含雜質(zhì)多第三步第二次:用冷卻的95的酒精第七步六次攪拌:第一、二、三、五、七步 其中除第八步外,其余均要朝一個(gè)方向攪拌,在第三、五步攪動(dòng)還要輕緩,玻璃棒不要直插燒杯底部,這樣才能保證得到完整的DNA(2)為什么反復(fù)地溶解與析出DNA,能夠去除雜質(zhì)?答:用高鹽濃度的溶液溶解DNA,能除去在高鹽中不能溶解的雜質(zhì);用低鹽濃度使DNA析出,能除去溶解在低鹽溶液中的雜質(zhì)。因此,通過(guò)反復(fù)溶解與析出DNA,就能夠除去與DNA溶解度不同的多種雜質(zhì)方法步驟 加入物質(zhì) 目的 1.制備雞血細(xì)胞液 檸檬酸鈉溶液 2.提取雞血細(xì)胞細(xì)胞核物質(zhì) 20 m1蒸餾水 3.溶解細(xì)胞核內(nèi)的DNA 2 m1L的NaCI溶液40mL 4.析出含DNA的黏稠物 蒸餾水 5.濾取含DNA的黏稠物 6.將DNA的黏稠物再溶解 2 molL的NaCl溶液20 mL 7.過(guò)濾含DNA的NaCl溶液 8.提取含有雜質(zhì)較少的DNA 冷卻的95的酒精50 mL A:(1)向試管中加入0.015 molL的NaCl溶液5mL (2)加入DNA (3)4 mL二苯胺試劑 9.DNA的鑒定 B:(1)向試管中加入0.015molL 的NaCl溶液5mL (2)4 mL二苯胺試劑
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