科技報告模板

1、附件1:科技報告格式模板科技報告編號科技報告編號公開范圍延遲期限科技報告報告名稱:支持渠道:編制單位:編制時間:承諾書本人完全了解國家科技報告的有關(guān)規(guī)定，同意國家按照規(guī)定收藏使用科技報 告，并承諾本科技報告中所有的研究內(nèi)容和數(shù)據(jù)信息真實可靠。如有失實，本人 承當(dāng)相關(guān)責(zé)任。課題負(fù)責(zé)人：報告編制人：年 月 日10科技報告案例報告編號：717815901-2009ZX10004206-01科技報告報告名稱：呼吸道病毒件傳染病病原譜流行規(guī)律及變異研究支持渠道：國家科技重大專項編制單位：中國醫(yī)學(xué)院病原生物學(xué)研究所編制時間：2010年12月11科技報告基本信息表L報告名稱呼吸道病毒性傳染病病原譜流行規(guī)律及

2、變異研究2 .報告作者及單位XXX,中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院病原生物學(xué)研究所3 .公開范圍4 .編制時間公開2010125.報告編號717815901-2009ZX10004206-016洛注無7.摘要本研究通過對呼吸道樣本病毒譜的分析，首次系統(tǒng)揭示了以北京、ft東地區(qū)為代表的華 北地區(qū)急性呼吸道感染中常見呼吸道病毒的流行地域、季節(jié)和年齡分布特征；系統(tǒng)揭示 包括流感病毒、偏肺病毒、腺病毒、腸道病毒和冠狀病毒等的基因變異及規(guī)律；首次發(fā) 現(xiàn)一批國外已報道、但國內(nèi)流行情況不明的病毒包括C組鼻病毒，Wu、KI多瘤病毒和博 卡病毒3型和一些新的腸道病毒基因型等。這些基線數(shù)據(jù)為呼吸道突發(fā)疫情排查、鑒定， 開展病原監(jiān)

3、測及未來診斷提供依據(jù)和基礎(chǔ)，并為呼吸道傳染病的異常流行的預(yù)警提供依 據(jù)。創(chuàng)新性的將國際前沿病原組合檢測鑒定技術(shù)引入監(jiān)測技術(shù)體系，實現(xiàn)從致病病 原的檢測到條件致病病原的發(fā)現(xiàn)和泛病原體檢測的跨越，為我國呼吸道病毒監(jiān)測技術(shù)體 系的升級、換代并與國際先進(jìn)水平接軌打下基礎(chǔ)。應(yīng)用已建立技術(shù)平臺承當(dāng)并圓滿完成 國家應(yīng)急檢測任務(wù)，并打造了一支熟悉國情、技術(shù)過硬同時又具有國際視野的隊伍。8.關(guān)鍵詞：呼吸道病毒，病毒譜，病原學(xué)，變異，進(jìn)化9.支持渠道工程（課題）名稱呼吸道病毒性傳染病病原譜流行規(guī)律及變異研究主管部門衛(wèi)生部計劃名稱國家科技重大專項工程（課題）編號2009ZX10004206科技領(lǐng)域生物醫(yī)藥承相單位中

4、國醫(yī)學(xué)科學(xué)院病原牛物學(xué)研究所合作單位（不超過5家）北京市疾病預(yù)防控制中心；中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī) 院；首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京兒童醫(yī)院；首都醫(yī)科大學(xué)附屬 北京朝陽醫(yī)院：北樂大學(xué)人民醫(yī)院總經(jīng)費X X萬元國撥經(jīng)費X X萬元負(fù)責(zé)人XXX起止日期2009-1 至 2010-1210.聯(lián)系人姓名XXX由話 XXXE-MailXXX單位中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院病原生物學(xué)研究所12 TOC o 1-5 h z 引言1.呼吸道病毒感染病原譜的研究（華北地區(qū)）3研究背景3技術(shù)方案3技術(shù)路線流程圖3病例定義4樣本的采集和前處理4檢測內(nèi)容及方法4研究結(jié)果8.常見重要呼吸道病毒在我國流行特征的系統(tǒng)研究9冠狀病毒10腺病毒12副流

5、感病毒15偏肺病毒16呼吸道合胞病毒19.新發(fā)現(xiàn)呼吸道病毒在我國流行情況的研究20C組鼻病毒20新型多瘤病毒24博卡病毒26腸道病毒EV68和CA21型28.重要呼吸道病毒的變異變遷特征的初步揭示31偏月市病毒31博卡病毒34流感病毒35.呼吸道病毒抗體人群血清流行率的研究376,泛病原體監(jiān)測技術(shù)在呼吸道傳染病監(jiān)測中的建立和應(yīng)用38.樣本資源庫的建設(shè)398.結(jié)論和建議4113插圖清單 TOC o 1-5 h z 圖1.冠狀病毒流行季節(jié)性分布12圖2.腺病毒基因進(jìn)化分析14圖3,腺病毒流行季節(jié)性分布14圖4.副流感病毒的季節(jié)性分布16圖5. 偏肺病毒的季節(jié)性分布18圖6,呼吸道合胞病毒各基因型的

6、季節(jié)流行特點19圖7.HRV-C抗原基因進(jìn)化分析21圖8.C種鼻病毒（BCH019）抗原蛋白VP1空間模擬圖22圖9.鼻病毒在成人（a）和兒童（b）急性呼吸道感染病例中的季節(jié)性分布特點.24圖10.博卡病毒抗原基因VP1/2的進(jìn)化分析28圖11.成人急性呼吸道感染呼吸道樣本中EV的血清型分布29圖12. EV68和CA21的季節(jié)分布30圖13 .偏肺病毒各亞型流行情況33圖14 .偏肺病毒分子進(jìn)化分析33圖15.偏肺病毒群體動力學(xué)分析34圖16 .偏肺病毒地理傳播模式分析34圖17. 3型博卡病毒的基因變異重組分析35圖18.流感病毒各亞型的季節(jié)性流行情況36圖19,2009甲型H1N1流感病

7、毒流行期間各亞型的季節(jié)性流行情況36圖20.流感病毒各亞型和其他呼吸道病毒的季節(jié)性流行情況37圖21.偏肺病毒和呼吸道合胞病毒抗體血清流行病學(xué)分析38圖22.呼吸道樣本宏基因組分析39圖23.入組病例臨床信息表及存量記錄表4014附表清單 TOC o 1-5 h z 表1,呼吸道病毒核酸檢測引物信息及擴(kuò)增條件6表2.冠狀病毒陽性病例的各年檢出情況10表3.冠狀病毒陽性病例在不同年齡人群中的檢出情況11表4.冠狀病毒陽性者臨床表現(xiàn)和特點11表5.腺病毒驗證引物序列13表6.副流感病毒感染的臨床表現(xiàn)特點15表7,副流感病毒的共檢出16表8.偏肺病毒在呼吸道感染病例中的臨床特點18表9.鼻病毒感染臨

8、床表現(xiàn)23表10.急性呼吸道感染病例WU/KI多瘤病毒陽性病例臨床表現(xiàn)25表11.博卡病毒在急性胃腸炎病例糞便樣本中的檢出情況27表12 .博卡病毒在呼吸道感染病例中的臨床特點28表13.成人急性呼吸道感染樣本中腸道病毒CA21與EV68的檢出情況30表14.CA21與EV68陽性病例的臨床表現(xiàn)30表15.2007-2009年甲型H1N1流感病毒回顧性篩查結(jié)果4215呼吸道病毒性傳染病病原譜流行規(guī)律及變異研究引言傳染病一直是人類健康的重大威脅，病毒是人類傳染病的重要病原體，而呼 吸道傳染病相關(guān)病毒因其傳播快、流行廣等特點對社會生活的危害尤其巨大，如歷 史上流感病毒曾引起三次全球流感大流行，20

9、03年SARS冠狀病毒突發(fā)流行，高 致病性禽流感病毒的肆虐以及腸道病毒EV71的影響等。每一次新發(fā)、突發(fā)傳染 病的出現(xiàn)都對人們的健康、生活秩序和經(jīng)濟(jì)開展造成不同程度的影響。特別是當(dāng)短 時間內(nèi)不能明確病原時，常引起社會的不安和恐慌，甚至危及國家平安。隨著我國 參與全球性活動的日益頻繁，對傳染病的防控能力提出了更高的要求。因此，如何 在傳染病發(fā)生的早期，在最短的時間內(nèi)確定病原體的種類，對傳染病的預(yù)防控制至 關(guān)重要，更是國家公共衛(wèi)生水平和綜合科技能力的表達(dá)。我國目前在呼吸道病毒的監(jiān)測方面已經(jīng)有了一定的積累，但是尚缺乏系統(tǒng)、 全面的人群呼吸道病毒本底情況的檢測數(shù)據(jù)，缺少對新發(fā)現(xiàn)病毒流行情況的本底 調(diào)查

10、，不利于及時發(fā)現(xiàn)傳染病的新流行態(tài)勢。因此，開展全人群的常見呼吸道病毒 的篩查，充分了解常見呼吸道病毒的流行特點和變異規(guī)律，通過對呼吸道病毒的變 異監(jiān)測，說明相關(guān)病原的流行優(yōu)勢型別、病原基因變異和重要位點的變異及其意義, 結(jié)合流行病學(xué)和臨床分析病原變遷有助于及時發(fā)現(xiàn)傳染病新的流行態(tài)勢。我國目前 在應(yīng)對突發(fā)和不明原因傳染病的技術(shù)體系已經(jīng)建立，但尚不系統(tǒng)。因此，開展突發(fā) 和不明原因傳染病監(jiān)測研究，說明新發(fā)突發(fā)傳染病的相關(guān)病原，并對其流行進(jìn) 行預(yù)測和預(yù)警，以探索建立有效的突發(fā)和不明原因傳染病的監(jiān)測、防控和研究策 略，鍛煉和提升突發(fā)傳染病事件中病因快速鑒定和應(yīng)急反響的能力。本研究作為傳染病防治重大專項“

11、傳染病監(jiān)測技術(shù)平臺”的一局部，根據(jù)總 體部署重點加強(qiáng)呼吸道病毒檢測技術(shù)能力的建設(shè)。通過集成現(xiàn)有的先進(jìn)技術(shù)，對 患呼吸道感染的廣泛人群（成人和兒童）開展常見呼吸道病原譜的篩查，建立和 完善呼吸道病毒檢測體系；通過對呼吸道感染樣本中常見呼吸道病毒的檢測，明 確各種呼吸道病原的季節(jié)流行情況，提供本底數(shù)據(jù)和了解常見呼吸道病原的疾病 負(fù)擔(dān)，為我國呼吸道病毒感染的預(yù)防控制提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)，為呼吸道傳染病的監(jiān)測 預(yù)警提供依據(jù)；通過大規(guī)模重點基因和全長基因組序列測定，對重要呼吸道病毒 基因的生物信息學(xué)分析，明確研究期間病毒基因的變異情況；通過對重要呼吸道（以下局部略去）16A呼吸道癥候群監(jiān)測數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析報告17參

12、考文獻(xiàn)11J. Coiras MT, Perez-Brena P, Garcia ML, Casas I. Simultaneous detection of influenza A,B, and C viruses, respiratory syncytial virus, and adenoviruses in clinical samples by multiplex reverse transcription nested- PCR assay. J Med Virol. 2003, 69: 132-144. Coiras MT, Aguilar JC, Garci a ML, Cas

13、as I, Pe rez-Brena P. Simultaneous detection of fourteen respiratory viruses in clinical specimens by two multiplex reverse transcription nested- PCR assays. J Med Virol. 2004, 72: 484-495.3J. Woo PC, Lau SK, Chu CM, et al. Characterization and complete genome sequence of a novel coronavirus, corona

14、virus HKU1, from patients with pneumonia. J Virol. 2005, 79: 884- 895. Allard AK, Girones R, Juto P, Wadell G. Polymerase chain reaction for detection of adenoviruses in stools. J Clin Microbiol. 1990, 28: 2659-2667. Human Bocaviruses Are Highly Diverse, Dispersed Recombination Prone, and Prevalent

15、in Enteric Infections. J Infect Dis. 2010, 201: 1633-1643. Ren L, Gonzalez R, Xu J, Xiao Y, Li Y, Zhou H, Li J, Yang Q, Zhang J, Chen L, Wang W, Vernet G, Paranhos-BaccalaG, Wang Z, Wang J. Prevalence of human coronaviruses in adults with acute respiratory tract infections in Beijing, China. J Med V

16、irol. 2011, 83: 291-297. Metzgar D, Osuna M, Kajon AE, Hawksworth AW, Irvine M, Russell KL. Abrupt emergence of diverse species B adenoviruses at US military recruit training centers. J Infect Dis. 2007, 196:1465-1473. Ren L, Gonzalez R, Xie Z, Xiong Z, Liu C, Xiang Z, Xiao Y,Li Y,Zhou H, Li J, Yang

17、 Q, Zhang J, Chen L, Wang W, Vernet G, Paranhos-Baccala G, Shen K, Wang J. Human parainfluenza virus type 4 infection in Chinese children with lower respiratory tract infections: A comparison study. J Clin Virol. 2011, 51: 209-212. Li J, Wang Z, Gonzalez R, Xiao Y, Zhou H, Zhang J, Paranhos-Baccala

18、G, Vernet QJin Q, Wang J, Hung T. Prevalence of human metapneumovirus in adults with acute respiratory tract infection in Beijing, China.J Infect. 2012, 64: 96-103. Xiang Z, Gonzalez R, Ren L, Xiao Y, Chen L, Zhang J, Wang W, Yang Q, Li J, Zhou H, Vernet G, Paranhos-Baccala G, Wang Z, Wang J. Preval

19、ence and clinical characteristics of human respiratory syncytial virus in Chinese adults with acute respiratory tract infection. J Med ViroL 2013, 85:348-353. McErlean P, Shackelton LA, Lambert SB, Nissen MD, Sloots TP, Mackay IM. Characterization of a newly identified human rhinovirus, HRV-QPM, dis

20、covered in infants with bronchiolitis. J Clin Virol. 2007, 39: 67-75. Kistler A, Avila PC, Rouskin S, Wang D, Ward T, Yagi S, et al. Panviral screening of respiratory tract infections in adults with and without asthma reveals unexpected human coronavirus and human rhinovirus diversity. J Infect Dis.

21、 2007, 196: 817-825. Lau SKP, Yip CC, TsoiHW, Lee RA, So LY, Lau YL, et aL Clinical features and complete genome characterization of a distinct human rhinovirus (HRV) genetic cluster, probably representing a previously undetected HRV species, HRV-C, associated with acute respiratory illness in child

22、ren. J ClinMicrobiol. 2007, 45: 3655-3664. Huang T, Wang W, Bessaud M, Ren P, Sheng J, Yan H, et al. Evidence of recombination and genetic diversity in human rhinoviruses in children with acute respiratory infection. PLoS ONE. 2009,4:e6355.18承諾書本人完全了解國家科技報告的有關(guān)規(guī)定，同意國家按照規(guī)定收藏使用科技報 告，并承諾本科技報告中所有的研究內(nèi)容和數(shù)據(jù)信息真實可靠。如有失實，本人 承當(dāng)相關(guān)責(zé)任。課題負(fù)責(zé)人：XXX報告編制人：XXXX義年X月X日19編寫說明課題負(fù)責(zé)人負(fù)責(zé)組織研究人員編寫科技報告，