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文檔簡介
1、.:.;Chapter 8 Metabolism: Energy,Enzymes, and Regulation1.Describe in general terms how energy from sunlight is spread throughout the biosphere. What sources of energy, other than sunlight, do microorgainisms use? 概括描畫來自陽光的能量怎樣在整個生物圈傳播。除了陽光以外,什麼能量來源,可以供微生物運用?第169頁、第2題、第一組、郭清琇Ans:1光反應(yīng):以高等植物而言,植物光反應(yīng)的進
2、行是藉葉綠餅中的葉綠素a、葉綠素b及蘿蔔素類等色素吸光後所引起的結(jié)果。光反應(yīng)可依其反應(yīng) 順序歸納為如下三個階段: (一)吸收光能:葉綠素a及b能夠吸收可見光(紅、橙、黃、綠、藍、紫)中的 紅色及藍色光,而胡蘿蔔素類則僅能吸收藍色光。紅色光的波長範(fàn)圍為640-740nm,藍色光為420-490nm。葉綠素吸光所得的能量與其所吸 收的光波波長呈反比,即波長愈長,能量愈小;波長愈短,能量愈大。(二)光水解作用:葉綠素吸收光能才干進行光水解作用,其反應(yīng)式為 2H204H+4e-+O2。因為有氧氣的釋放,地球上的生物才干生存。Joseph Priestley(1733-1804)早已實驗證明於密閉的容器
3、內(nèi),動物及燃燒的 蠟燭可把 空氣變成污濁,而使動物死亡,蠟燭停頓燃燒。相對的,綠色植物可清潔這些污濁的空氣。目前我們都知,其所 謂污濁的空氣,就是指空氣中二氧化碳濃度添加,而氧氣減少。 綠色植物清潔空氣就是吸收二氧化碳,釋放氧氣的結(jié)果。(三)電子的傳遞及產(chǎn)生能量:光水解作用除了釋放氧氣之外,就是把由水 分子中,氫釋放出來的電子的進行一連串的電子傳遞。電子傳遞是由 高能量往低能量的傳遞現(xiàn)象,所以它係一種放熱(能)反應(yīng),所釋放出來的能量,就可以合成生物能(ATP)及還原劑(NADPH+H+)。有了此兩種有機物質(zhì)的構(gòu)成,二氧化碳才干轉(zhuǎn)換成碳水化合物。2還有一些有機和無機化合物可供微生物運用。2.Wh
4、at is thermodynamics?Summarize the first and second laws of thermodynamics.何謂熱力學(xué)?請簡單敘述熱力學(xué)第一和第二定律?第171頁、第1題、第二組、劉彥辰Ans:1何謂熱力學(xué)?是專門討論各種方式的能相互轉(zhuǎn)換的學(xué)問.何謂熱力學(xué)第一定律?就是能量守恆定律,能量可以由一種方式變?yōu)榱硪环N方式,但其總量既不能添加也不會減少2何謂熱力學(xué)第二定律?a.是描畫熱量的傳遞方向-分子有規(guī)則運動的機械能可以完全轉(zhuǎn)化為分子無規(guī)則運動的熱能:熱能卻不能完全轉(zhuǎn)化為機械能b.每一個自發(fā)的物理或化學(xué)過程總是向著熵entropy增高的方向發(fā)展。熵是一種不
5、能轉(zhuǎn)化為功的熱能。c.熵的改變量等於熱量的改變量除以絕對溫度-當(dāng)高低溫度各自集中時,熵值很低;當(dāng)溫度均勻擴散時,熵值增高。當(dāng)物體有次序時,嫡值低:當(dāng)物體無序時,嫡值便增高。3.Describe the energy cycle and ATPs role in it.What characteristics of ATP make it suiltable for this role?Why is ATP called a high-energy molecule?第171頁、第5題、第三組、韓成志Ans:1為什麼ATP是高能量分子?因為ATP是由一個線酸adenosine部分和三個磷酸鹽ph
6、osphate小組所構(gòu)成。當(dāng)1莫耳mole的 ATP被分解 的時候,就能夠產(chǎn)生 7到12千卡Kcal的能量。1 千卡,是相當(dāng)於把 1 千克kg水升高攝氏 1 度C所需的熱能。而ATP之所以是高能量分子的緣由,可以從我們的肌肉細(xì)胞來解釋。我們隨時隨地幾乎都是要用到肌肉的,而雞肉中的ATP分子的含量卻是有限的,全身肌肉內(nèi)ATP的儲存量約為 120至180微莫耳,也就是相當(dāng)於1.2 至1.8千卡的能量。因此肌肉細(xì)胞必須不斷製造出最能攜帶大量能量以及最結(jié)勝時間空間性的分子,那就是ATP。2而ATP終究有哪些適合的作用?以下是補充資料 : 1997 年諾貝爾化學(xué)獎頒給三位生化學(xué)家,獎金的一半給丹麥科學(xué)家
7、斯寇 (Jens C. Skon) 教授,另外一半給英國科學(xué)家瓦克 (John E. Walker) 教授及美國科學(xué)家波亦爾 (Paul D. Boyer) 教授,這三位生化學(xué)家的貢獻是首先研討並闡明參與生物高能分子 ATP (adenosine 5- triphospate, 腺甘三磷酸) 合成轉(zhuǎn)換的酵素。在 1929 年,德國化學(xué)家羅曼 (K. Lohmann) 首先發(fā)現(xiàn) ATP化學(xué)分子。幾年之後,ATP 的化學(xué)結(jié)構(gòu)被決定。1948 年,英國科學(xué)家托德 (Alexander Todd) 化學(xué)合成 ATP托德是 1957 年諾貝爾獎化學(xué)獎得主。在 1939 至 1941 年期間,利普曼 (F
8、ritz Lipmann) 證實 ATP 是細(xì)胞內(nèi)一切生物化學(xué)能量的運儲者利普曼是 1953 年諾貝爾獎得主,並且證實其能量是儲藏於高能磷酸化學(xué)鍵 (energy-rich phosphate bonds)。在一切的生物中,從細(xì)菌、黴菌不斷到高等動、植物,包括人類在內(nèi),ATP 都是扮演能量的運儲者,ATP 的構(gòu)成是藉著生物細(xì)胞內(nèi)養(yǎng)分的燃燒所構(gòu)成,而後 ATP 被生物體用於合成細(xì)胞物質(zhì)、肌肉收縮、神經(jīng)信息傳遞及其他多種生理反應(yīng),所以 ATP 被稱為細(xì)胞的能量貨幣 (energy currency) ,也就是說凡是需求能量,就必須運用 ATP。 在 1929 年,德國化學(xué)家羅曼 (K. Lohma
9、nn) 首先發(fā)現(xiàn) ATP化學(xué)分子。幾年之後,ATP 的化學(xué)結(jié)構(gòu)被決定。1948 年,英國科學(xué)家托德 (Alexander Todd) 化學(xué)合成 ATP托德是 1957 年諾貝爾獎化學(xué)獎得主。在 1939 至 1941 年期間,利普曼 (Fritz Lipmann) 證實 ATP 是細(xì)胞內(nèi)一切生物化學(xué)能量的運儲者利普曼是 1953 年諾貝爾獎得主,並且證實其能量是儲藏於高能磷酸化學(xué)鍵 (energy-rich phosphate bonds)。在一切的生物中,從細(xì)菌、黴菌不斷到高等動、植物,包括人類在內(nèi),ATP 都是扮演能量的運儲者,ATP 的構(gòu)成是藉著生物細(xì)胞內(nèi)養(yǎng)分的燃燒所構(gòu)成,而後 ATP
10、被生物體用於合成細(xì)胞物質(zhì)、肌肉收縮、神經(jīng)信息傳遞及其他多種生理反應(yīng),所以 ATP 被稱為細(xì)胞的能量貨幣 (energy currency) ,也就是說凡是需求能量,就必須運用 ATP。 丹麥籍的學(xué)者斯寇教授生於 1918 年,在哥本哈根大學(xué)接受醫(yī)學(xué)訓(xùn)練,1954 年在丹麥的阿霍斯 (Arahus) 大學(xué)得到博士學(xué)位,1963 年在該校擔(dān)任生理學(xué)教授,1977 年擔(dān)任生物物理教授,他也是丹麥國家科學(xué)院的院士。他在 1957 年,初次在神經(jīng)細(xì)胞膜上尋找分解 ATP 的酵素,而且證明這個分解 ATP 酵素與鈉離子、鉀離子進出細(xì)胞的功能有親密關(guān)係。早在 1920 年代,科學(xué)家就知道細(xì)胞內(nèi)的離子成分與細(xì)
11、胞外週圍環(huán)境的離子濃度與成分很不一樣,在細(xì)胞內(nèi)鈉離子濃度比細(xì)胞外低,而鉀離子濃度則相反。在神經(jīng)細(xì)胞傳遞信息時,神經(jīng)細(xì)胞遭到刺激,鈉離子由細(xì)胞外進入細(xì)胞內(nèi),鉀離子則由細(xì)胞內(nèi)出細(xì)胞外,而等神經(jīng)傳導(dǎo)完成後,則又恢復(fù)原先細(xì)胞內(nèi)外的鈉離子及鉀離子濃度,這個過程須要 ATP 的參與。由於斯寇教授的發(fā)現(xiàn),開啟了細(xì)胞膜上離子幫浦 (ion pump) 的研討。其他離子,例如鈣離子 (Ca+2) 的進出也經(jīng)過類似的過程,而 ATP 也參與其中,所以由此為基礎(chǔ),可以解釋 Ca+2-ATPase (ATP ase, 腺三磷酸) 在肌肉收縮中的功能及 H+-K+ ATPase 如何使胃中產(chǎn)生高濃度的 HCl 作為消化
12、之用。不僅在高等生物中有一樣之 ATPase 參與各種生理作用,而且在低等生物中亦有一樣的現(xiàn)象,例如酵母菌細(xì)胞膜上的 H+-ATPase 在醱酵的過程中分泌 H+,這個酵素在今日被稱為 P- 型 ATPase,因為在反應(yīng)過程中該酵素產(chǎn)生磷酸化 (phosphorylation) 現(xiàn)象。4.How is the direction of electron flow between redox couples related to the standard reduction potential and the release of free energy?第174頁、第2題、第四組、杜欣儒有電子
13、轉(zhuǎn)移的化學(xué)反應(yīng),稱為氧化還原反應(yīng),即為氧化半反應(yīng)與還原半反應(yīng)組合而成,而且兩半反應(yīng)必須同時發(fā)生而且同時結(jié)束。失去電子的半反應(yīng)稱為氧化半反應(yīng);而得到電子的半反應(yīng)則稱為還原半反應(yīng),兩個半反應(yīng)中電子的得失數(shù)目相等,所以整個反應(yīng)系統(tǒng)維持電性守恆的狀態(tài)。5.Draw a diagram showing how enzymes catalyze reaction by altering the activation energy. What is a transition state complex? Use the diagram to explain why enzymes do not change
14、 the equilibria of the reaction they catalyze.第179頁、第2題、第五組、楊勝湧Ans:1 2過渡狀態(tài)是一個從反應(yīng)物至產(chǎn)物過程中,需求活化能所得之高能量不穩(wěn)定的狀態(tài)。A+BC+D此反應(yīng)是個可逆反應(yīng),但正反應(yīng)比逆反應(yīng)還要容易進行,因 為正反應(yīng)的活化能比逆反應(yīng)低,所以易往右邊進行反應(yīng)。3酵素只是加速細(xì)胞的反應(yīng)速率及降低活化能,就好像圖示上所畫的紅色虛線,它並不會改變化學(xué)平衡。6.What special properties might an enzyme isolated from a psychrophilic bacterium have? 從嗜
15、冷性細(xì)菌可以分離出甚麼特別的特性才干的酵素?第179頁、第5題、第6組、許守成嗜冷性顧名思義就是比較不怕冷的酵素,而他的不怕冷也就是他的特性,因為普通的酵素在低溫下會減緩其生長或發(fā)酵,所已將東西放入冰箱能延長一小段時間食物的腐敗,所以這種特性能拿來用作低溫實驗時也能使實驗速度不會減緩。Will enzymes need to lower the activation energy more or less in thermophiles than in psychrophilics?在嗜熱(放在嗜冷)或是嗜冷(放在嗜熱)的酵素需求較低的活化能是多或少?嗜熱、嗜冷就其字面的意思就是喜歡熱喜歡冷,
16、所以放到與他們相反的環(huán)境中會呵斥反應(yīng)不易,故其活化能都會很高也就是需求的活化能很多7.How can regulatory enzymes be influences by reversible covalent modification? What group is used for this purpose with glutamine synthetase,and which form of this enzyme is active?如何由可逆的共價修飾來影響管理酵素?那一個基團是用在此目的和glutamine synthetase一同?且那一個酵素是活潑的?第184頁、第2題、第7組
17、、梁恩道ANS:再整理成共價及非共價修飾兩大類。是針對酵素分子所進行蛋白質(zhì)層次的修飾調(diào)控,與上述之基因調(diào)控方式不同。 HYPERLINK .tw/BCbasics/Enzyme56.htm l 6.3 非共價修飾:運用 HYPERLINK .tw/BCbasics/Enzyme56.htm l 6.3.1 cAMP 或正負(fù)迴饋的 HYPERLINK .tw/BCbasics/Enzyme56.htm l 6.4.1f 效應(yīng)物 等方式,以非共價方式修飾酵素活性,此多為可逆性的調(diào)控。勿把異位脢與上
18、述操縱子的調(diào)控方式混為一談,兩者都可被基質(zhì)活化,但前者是修飾酵素本身,而後者是影響基因的表現(xiàn)。 HYPERLINK .tw/BCbasics/Enzyme56.htm l 6.2 共價修飾:以磷酸化或蛋白質(zhì)水解的方式,來增強或降低酵素活性。 多為 HYPERLINK .tw/BCbasics/Enzyme56.htm l 6.3.3 cascade (梯瀑) 式的連鎖代謝反應(yīng),cascade 連鎖反應(yīng)會放大 (amplify) 某條代謝路徑的活性。除了正向的以生合成添加酵素量之外,蛋白質(zhì)的降解也是一項重要的調(diào)控方式,並以蛋白脢
19、或 HYPERLINK .tw/BCbasics/Enzyme56.htm l 6.1.3 ubiquitin 配合 HYPERLINK .tw/BCbasics/Enzyme56.htm l 6.1.3 proteasome 進行降解,以除去此酵素。Ubiquitin (泛素):廣泛分布在動植物細(xì)胞中,同質(zhì)性高而分子量小,可以連到目標(biāo)蛋白質(zhì)分子的 Lys 胺基,作為被降解的標(biāo)記 (ubiquitination)。目標(biāo)蛋白質(zhì)的胺基酸序列上,通常在近 N-端有一定 信號序列 (destruction box)。Proteasome (蛋白脢體):是由很多較小單位分子所組成的宏大分子,主體看來像是四個甜甜圈疊在一同,中央的孔洞可以容納目標(biāo)蛋白質(zhì),並將其分解成勝肽片段;目標(biāo)蛋白質(zhì)都要先標(biāo)有 ubiquitin,水解後 ubiquitin 可以回收再次運用。
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