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1、核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)為什么要做核酸檢測(cè)?核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)2為什么要做核酸檢測(cè)?核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)2 核酸檢測(cè)(基因檢測(cè)) 現(xiàn)知人類的疾病都與基因有直接或間接的關(guān)系。醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室所要檢測(cè)和分析的核酸既包括人體本身的基因(DNA ) 以及反映基因轉(zhuǎn)錄水平的mRNA , 也包括侵入人體的致病微生物等所攜帶的外源性基因(DNA/RNA )。 核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)3 核酸檢測(cè)(基因檢測(cè))核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)3傳統(tǒng)檢測(cè)試劑(酶免ELISA)技術(shù)特點(diǎn): 檢測(cè)目標(biāo)為蛋白, 所檢測(cè)的主要是疾病所引發(fā)的人體抗體而不是病原體本身,是一種間接、滯后的檢測(cè)方式。易操作,成本低。 固有不足:不能夠消除對(duì)“窗口期”標(biāo)本(抗
2、體陰性,核酸陽(yáng)性)的漏檢難于檢測(cè)病原體的不同亞型及突變型不典型血清陽(yáng)轉(zhuǎn)對(duì)免疫逃避或免疫沉寂的標(biāo)本產(chǎn)生漏檢核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)4傳統(tǒng)檢測(cè)試劑(酶免ELISA)技術(shù)特點(diǎn):核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)4核酸檢測(cè)顯著縮短窗口期:HIV窗口期縮短45%,HCV縮 短89%,HBV縮短50%。提 高 靈 敏 度:理論上擴(kuò)增體系中單拷貝的模板 也能被檢測(cè)出。特 異 性 好:使用熒光探針技術(shù)的PCR檢測(cè), 幾乎沒(méi)有方法學(xué)的假陽(yáng)性。直接揭示病原體的存在 對(duì)操作者及檢測(cè)環(huán)境的要求較高檢測(cè)成本相對(duì)較高核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)5核酸檢測(cè)顯著縮短窗口期:HIV窗口期縮短45%,HCV縮核酸輸血中可傳染病原體的“窗口期”病毒種類ELISA檢測(cè)項(xiàng)
3、目窗口期HCV抗-HCV 2.0/3.0 EIA 8-10周HIV抗-HIV-1/2 EIA and HIV-1 抗原 EIA 2-4周HBVHBVsAg EIA and HBVcAg EIA 6-8周HTLV抗-HTLV I/II EIA 8-10周CMV抗-CMV EIA 3-5 周核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)6輸血中可傳染病原體的“窗口期”病毒種類ELISA檢測(cè)項(xiàng)目窗口窗口期檢測(cè)率國(guó)家或地區(qū)HBVHCVHIV加拿大1:153000(1/15萬(wàn))1:2300000(1/230萬(wàn))1:7800000(1/780萬(wàn))法國(guó)1:640000(1/64萬(wàn))1:10000000(1/1000萬(wàn))1:3150000
4、(1/315萬(wàn))德國(guó)1:230000(1/23萬(wàn))1:670000(1/67萬(wàn))1:2770000(1/277萬(wàn))日本(50混)1:51988(1/5.2萬(wàn))1:348091(1/35萬(wàn))1:2668696(1/267萬(wàn))美國(guó)(24混)1:180000(1/18萬(wàn))1:230000(1/23萬(wàn))12:37164054(1/309萬(wàn))香港1:32786(1/3.3萬(wàn))1:5456(1/0.5萬(wàn))1:222(1/0.02萬(wàn))核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)7窗口期檢測(cè)率國(guó)家或地區(qū)HBVHCVHIV加拿大1:15300核酸檢測(cè)在臨床診斷中的應(yīng)用定性診斷 血液篩查 病原體篩查診斷 SNP和耐藥突變?cè)\斷 基因型分型 遺
5、傳病診斷 個(gè)體用藥診斷 基因鑒定和配型 定量檢測(cè) 病情的評(píng)估和預(yù)后判斷 抗病毒藥物療效的觀察 新藥驗(yàn)證 癌基因表達(dá)差異 核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)8核酸檢測(cè)在臨床診斷中的應(yīng)用定性診斷定量檢測(cè)核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)8核 酸 是 什 么? 核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)9核 酸 是 什 么? 核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)9核酸(Nucleic Acid)是一種主要位于細(xì)胞核內(nèi)的生物大分子,其充當(dāng)著生物體遺傳信息的攜帶和傳遞。核酸廣泛存在于所有動(dòng)物、植物細(xì)胞、微生物內(nèi)。 現(xiàn)已發(fā)現(xiàn)近2000種遺傳性疾病都和DNA結(jié)構(gòu)有關(guān)。腫瘤的發(fā)生、病毒的感染、射線對(duì)機(jī)體的作用等都與核酸有關(guān)。 核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)10核酸(Nucleic Acid)是一種主要位
6、于細(xì)胞核內(nèi)的生物核酸分類:DNA、RNA;DNA:dATP(A)、dTTP(T)、 dCTP(C)、dGTP(G);RNA:ATP、UTP、CTP、GTP;35磷酸鍵核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)11核酸分類:DNA、RNA;核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)11DNA結(jié)構(gòu)單鏈DNA形成雙鏈的原則 堿基互補(bǔ)配對(duì): G-C T-A外部為磷酸和戊糖形成的骨架內(nèi)部為堿基互補(bǔ)形成的共價(jià)結(jié)合區(qū)域螺旋結(jié)構(gòu)核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)12DNA結(jié)構(gòu)單鏈DNA形成雙鏈的原則外部為磷酸和戊糖形成核酸核酸在體內(nèi)的復(fù)制核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)13核酸在體內(nèi)的復(fù)制核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)13DNA的熱變性DNA受熱,會(huì)解開雙鏈互補(bǔ)狀態(tài),形成單鏈;降溫會(huì)恢復(fù)雙鏈狀態(tài)核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)
7、知識(shí)14DNA的熱變性DNA受熱,會(huì)解開雙鏈互補(bǔ)狀態(tài),形成單鏈;降溫怎樣進(jìn)行核酸檢測(cè)?核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)15怎樣進(jìn)行核酸檢測(cè)?核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)15核酸檢測(cè)的一般流程核酸樣品的制備: 從血液、體液、組織中提取或PCR擴(kuò)增樣品的檢測(cè): 核酸雜交、PCR、熒光定量PCR、PCR-ELISA等 結(jié)果判讀: 電泳、膜、熒光定量PCR儀等核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)16核酸檢測(cè)的一般流程核酸樣品的制備:核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)16核 酸 雜 交 核酸雜交是從核酸分子混合液中檢測(cè)特定大小的核酸分子的傳統(tǒng)方法。其原理是核酸變性和復(fù)性理論。即雙鏈的核酸分子在某些理化因素作用下雙鏈解開,而在條件恢復(fù)后又可依堿基配對(duì)規(guī)律形成雙邊結(jié)構(gòu)。雜
8、交通常在一支持膜上進(jìn)行,因此又稱為核酸印跡雜交。根據(jù)檢測(cè)樣品的不同又被分為DNA印跡交(Southern blot hybridization )和RNA印跡雜交(Northern blot hybridization)。核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)17核 酸 雜 交 核酸雜交是從核酸分子混合液中檢測(cè)特定大小核酸提取PCR擴(kuò)增探針點(diǎn)膜交聯(lián)雜交顯色結(jié)果判讀核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)18核酸提取PCR擴(kuò)增探針點(diǎn)膜交聯(lián)雜交顯色結(jié)果判讀核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知PCR聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Polymerase Chain Reaction),簡(jiǎn)稱PCR,是一種分子生物學(xué)技術(shù),用于放大特定的DNA片段??煽醋魃矬w外的特殊DNA復(fù)制。DNA的
9、復(fù)制是生物進(jìn)化和傳代的重要途徑。雙鏈DNA在多種酶的作用下可以變性解鏈成單鏈,在DNA聚合酶的參與下,根據(jù)堿基互補(bǔ)配對(duì)原則復(fù)制成同樣的兩分子挎貝。在實(shí)驗(yàn)中發(fā)現(xiàn),DNA在高溫時(shí)也可以發(fā)生變性解鏈,當(dāng)溫度降低后又可以復(fù)性成為雙鏈。因此,通過(guò)溫度變化控制DNA的變性和復(fù)性,加入設(shè)計(jì)引物,DNA聚合酶、dNTP就可以完成特定基因的體外復(fù)制。 核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)19PCR聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Polymerase Chain RePCR的產(chǎn)生核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)20PCR的產(chǎn)生核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)20實(shí)時(shí)熒光PCR 在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團(tuán),利用熒光信號(hào)累積實(shí)現(xiàn)了實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)整個(gè)PCR進(jìn)程,對(duì)起始模板進(jìn)行分析的方法,
10、可以進(jìn)行定量和定性檢測(cè)。核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)21實(shí)時(shí)熒光PCR 在PCR反應(yīng)體系中加入核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)22核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)22核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)23核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)23核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)培訓(xùn)課件核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)25核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)25熒光定量PCR標(biāo)記方法內(nèi)摻式染料SYBR Green I序列特異性探針Taqman Molecular Beacons Dual Probes(FRET)引物特異性探針 Amplifluor (Intergen)核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)26熒光定量PCR標(biāo)記方法內(nèi)摻式染料核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)26SYBRGREEN 雙探針雜交分子信標(biāo) Taqman 引物特異探針 性質(zhì) 可逆熒光 積累熒
11、光 熔點(diǎn)分析 能不能特異性 引物(非特異性擴(kuò)增或引物二聚體有影響) 引物2探針 引物探針 引物探針 引物(非特異性擴(kuò)增或引物二聚體有影響) 探針無(wú)有有有無(wú)通用性通用專用專用專用專用探針特點(diǎn)核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)27SYBR雙探針?lè)肿覶aqman 引物特異性質(zhì) 可逆熒光 積SYBR Green 融解曲線分析核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)28SYBR Green 融解曲線分析核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)28SYBR Green法優(yōu)缺點(diǎn)優(yōu)點(diǎn):對(duì)DNA模板沒(méi)有選擇性適用于任何DNA使用方便-不必設(shè)計(jì)復(fù)雜探針?lè)浅l`敏便宜核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)29SYBR Green法優(yōu)缺點(diǎn)核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)29TaqMan探針?lè)ê怂釞z測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)30TaqMa
12、n探針?lè)ê怂釞z測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)30TaqMan法優(yōu)缺點(diǎn)核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)31TaqMan法優(yōu)缺點(diǎn)核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)31核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)32核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)32市 場(chǎng) 狀 況核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)33市 場(chǎng) 狀 況核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)33生產(chǎn)廠家檢測(cè)項(xiàng)目使用技術(shù)使用儀器達(dá)安基因HBV、HIV、HCV、HPV 、TB、HCMV、淋球菌、解脲脲原體、肺炎支原體、沙眼衣原體、單純皰疹病毒型、地中海貧血、缺失型-地中海貧血、淋球菌、血篩試劑PCR熒光探針?lè)≒CR-反向點(diǎn)雜交法熒光定量PCR儀PCR儀上??迫AHBV、HCV、新型冠狀病毒、血篩試劑PCR熒光探針?lè)≒CR-酶免熒光定量PCR儀酶免相關(guān)儀器匹基HBV、HIV、HP
13、V、TB、HCV、沙眼衣原體、新型冠狀病毒PCR熒光探針?lè)晒舛縋CR儀上海華美HBV、HCV、TB、沙眼衣原體、新型冠狀病毒PCR熒光探針?lè)晒舛縋CR儀上海克隆HBV、TB、HPVPCR熒光探針?lè)晒舛縋CR儀凱普、港龍以HPV檢測(cè)為主。浩源血篩試劑已進(jìn)入審批階段。羅氏、生物梅里埃公司有HIV檢測(cè)試劑盒,均以各自公司的專利技術(shù)為主研發(fā)。核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)34生產(chǎn)廠家檢測(cè)項(xiàng)目使用技術(shù)使用儀器達(dá)安基因HBV、HIV、HC現(xiàn)狀和趨勢(shì)1、現(xiàn)狀:公司多、競(jìng)爭(zhēng)激烈、同質(zhì)化;手工操作為主;缺乏規(guī)范;核心技術(shù)少;2、趨勢(shì):管理部門逐漸加強(qiáng)管理,相關(guān)標(biāo)準(zhǔn)制訂中;進(jìn)口試劑以全自動(dòng)診斷平臺(tái)為主在國(guó)內(nèi)推廣,國(guó)內(nèi)廠家漸進(jìn)推出自動(dòng)化核酸提取儀器進(jìn)入市場(chǎng);核酸檢測(cè)醫(yī)學(xué)知識(shí)35現(xiàn)狀和趨勢(shì)1、現(xiàn)狀:公司多、競(jìng)爭(zhēng)激烈、同質(zhì)化;手工操作為主;實(shí)時(shí)熒光PCR檢測(cè)的難點(diǎn)1、大規(guī)模適合自動(dòng)化核酸提取的樣品制備技術(shù)2、適合篩查應(yīng)用的多重PCR技術(shù)3、高通量全自動(dòng)的核
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