張桂香全國(guó)畜牧獸醫(yī)總站畜草中心課件

1、 張桂香 全國(guó)畜牧獸醫(yī)總站畜草中心 2005.11.15我國(guó)地方豬種遺傳距離測(cè)定分析1主 要 內(nèi) 容 項(xiàng)目簡(jiǎn)介 項(xiàng)目立項(xiàng)背景 技術(shù)方案與實(shí)施 項(xiàng)目主要研究成果1 項(xiàng) 目 簡(jiǎn) 介1 簡(jiǎn) 介農(nóng)業(yè)部農(nóng)牧漁業(yè)種質(zhì)資源保存利用項(xiàng)目樣品采集涉及全國(guó)21個(gè)?。ㄊ?、自治區(qū)）80多個(gè)鄉(xiāng)、鎮(zhèn)的保種場(chǎng)和保護(hù)區(qū)，參加品種資料收集、調(diào)查工作的單位達(dá)25個(gè)，參加人員近200人1 立 項(xiàng) 背 景生物多樣性的保護(hù)和利用是當(dāng)今人類環(huán)境與發(fā)展領(lǐng)域的中心議題，而遺傳多樣性又是生物多樣性中與人類關(guān)系最密切的組成部分 我國(guó)擁有豐富的地方豬種遺傳資源，但與發(fā)達(dá)國(guó)家相比對(duì)地方豬種的遺傳特性研究得不夠深入，而且近年來地方豬種遺傳多樣性呈現(xiàn)出

2、日益貧乏的不良跡象 我國(guó)地方豬品種間普遍存在著同種異名、同名異種等問題，造成保種效率低，保種進(jìn)程緩慢1 立 項(xiàng) 目 的保種工作的發(fā)展，主要依靠對(duì)品種遺傳特性的深入研究。沒有研究，就不能發(fā)掘潛在的寶貴遺傳特性，保種工作就是消極的，沒有意義的借助現(xiàn)代分子生物學(xué)技術(shù)，研究地方豬品種的遺傳特性和彼此間的親緣關(guān)系，從保護(hù)遺傳多樣性的角度來保護(hù)和利用地方品種，為國(guó)家制訂有效的種質(zhì)資源保護(hù)利用策略提供科學(xué)依據(jù) 1 技 術(shù) 方 案遺傳距離用基因頻率的函數(shù)表示的群體間遺傳差異分析群體之間的遺傳結(jié)構(gòu)、確定品種（群體）間親緣關(guān)系遠(yuǎn)近所用基因座位通常都是不受自然和人工選擇壓力的座位(May, 1990)為畜禽品種資源

3、的保存利用提供了客觀標(biāo)準(zhǔn)1 技 術(shù) 方 案研究群體以中國(guó)豬品種志(1986)中收錄的地方豬種作為研究的主要對(duì)象，這些品種具備中國(guó)豬種的典型特征，可較全面地包含中國(guó)地方豬種的遺傳特性1 技 術(shù) 方 案品種選擇依據(jù)中國(guó)豬品種志所列品種，部分名稱已經(jīng)合并的品種按照合并前的名稱采集，同時(shí)收集3個(gè)外源品種作為對(duì)照采樣原則隨機(jī)抽樣與典型群抽樣相結(jié)合，每品種數(shù)量60頭，公豬不少于10%1全國(guó)21個(gè)?。ㄊ?、自治區(qū)、直轄市）樣品采集地點(diǎn)分布示意圖表示地方豬種的采樣地點(diǎn)表示外源豬種的采樣地點(diǎn)1 技 術(shù) 方 案微衛(wèi)星和血液蛋白多態(tài)性研究在探討品種遺傳變異及親緣關(guān)系等方面具有重要的應(yīng)用價(jià)值微衛(wèi)星標(biāo)記研究，采用FAO-

4、ISAG推薦的27對(duì)微衛(wèi)星DNA引物，使研究結(jié)果具有全球通用性和可比性選用多態(tài)性較為豐富的8個(gè)血液蛋白基因座位，作為微衛(wèi)星DNA多態(tài)性研究的補(bǔ)充1 技 術(shù) 方 案 微衛(wèi)星簡(jiǎn)介也叫做簡(jiǎn)單重復(fù)序列呈共顯性遺傳由核心序列和側(cè)翼序列構(gòu)成FAO-ISAG將其推薦為評(píng)估畜禽遺傳多樣性的首選分子標(biāo)記127個(gè)豬微衛(wèi)星座位名稱(FAO-ISAG)及所在染色體位置1蛋白質(zhì)多態(tài)性檢測(cè)座位1主要研究成果1 主要研究成果完成26個(gè)微衛(wèi)星和8個(gè)血液蛋白基因座位的多態(tài)性研究，建立了一套完善的分子標(biāo)記檢測(cè)技術(shù)通過對(duì)品種內(nèi)和品種間遺傳變異的分析，初步建立了60個(gè)豬品種的微衛(wèi)星DNA標(biāo)記和血液蛋白多態(tài)性的資料數(shù)據(jù)庫1 主要研究成

5、果血清蛋白多態(tài)性的遺傳變異中國(guó)地方豬種的 8個(gè)血清蛋白座位均具有多態(tài)性，分別受27個(gè)等位基因調(diào)控，并且具有一定的品種特征1 部分血液蛋白基因座的電泳模擬圖1 主要研究成果微衛(wèi)星多態(tài)性的遺傳變異 地方豬種的等位基因數(shù)量非常豐富 3個(gè)引進(jìn)豬種與地方豬種的遺傳距離很大 海南豬和五指山豬有著最小的遺傳距離。最大的遺傳距離出現(xiàn)于濱湖豬與小梅山豬之間。江蘇的7個(gè)豬種之間和湖南的5個(gè)豬種之間的遺傳距離較小1部分微衛(wèi)星座位的電泳分型圖譜IGF1 玉山黑豬1部分微衛(wèi)星座位的電泳分型圖譜1部分微衛(wèi)星座位的電泳分型圖譜1微衛(wèi)星標(biāo)記的DA/NJ聚類圖1 主要研究成果57個(gè)地方豬種在所研究的微衛(wèi)星座位上具有61個(gè)特有等

6、位基因和258個(gè)優(yōu)勢(shì)等位基因以及一部分血液蛋白座位的優(yōu)勢(shì)等位基因，根據(jù)這些等位基因及其組合，結(jié)合生物統(tǒng)計(jì)學(xué)方法可以開展地方豬種的種質(zhì)鑒別工作1 主要研究成果具有特有等位基因和/或優(yōu)勢(shì)等位基因的典型品種是(括號(hào)里的數(shù)字分別是等位基因及頻率)：民豬的SW24(91:0.08)、SW240(110:0.81)、SW72(100:0.54)東山豬的S0228(276:0.06)、SW951(125:0.97)、S0002(198:0.50)萊蕪豬的S0227(272:0.14)、Hpx3(0.5508)河套大耳豬的SW632(187:0.06)、Hpx1(0.8113)、 Hpx4(0.1038)陽新

7、豬的Hpx2(0.9677)馬身豬的Hpx1F(0.6949)、Hpx2(0.2373)金華豬的Hpx2F(0.0648)等品種1 主要研究成果本研究結(jié)果與其他研究結(jié)果的相同點(diǎn)：中梅山豬、小梅山豬之間，米豬與二花臉豬、沙烏頭豬之間的親緣關(guān)系很近，這與歷史記載相吻合江西省的地方豬種間差別很大，本研究支持2001年江西畜禽品種志的觀點(diǎn)，認(rèn)為東鄉(xiāng)豬與樂平豬的親緣關(guān)系較遠(yuǎn)1 主要研究成果本研究結(jié)果與其他研究結(jié)果的相同點(diǎn)通城豬、清平豬之間的親緣關(guān)系較近，同為江海型的陽新豬和二花臉豬相距甚遠(yuǎn)，這與樊彬等（1999）的結(jié)論基本一致在豬品種志中，云南的富源大河豬和貴州的柯樂豬被劃為一個(gè)品種烏金豬，在本研究中，二者的親緣關(guān)系也非常近湖南省的5個(gè)豬品種之間的親緣關(guān)系較近，這與陶鈞（1992）等研究結(jié)果基本相同1 主 要 建 議對(duì)比品種志的結(jié)論，本項(xiàng)目提出了存在同名異種、同種異名的品種，確定的依據(jù)是Bootstrap抽樣檢驗(yàn)的可靠程度以及品種表現(xiàn)特性的差異 這些豬品種是：嘉興黑豬應(yīng)從太湖豬中劃分出來東鄉(xiāng)豬與樂平豬是不同品種鄂西黑