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文檔簡(jiǎn)介
常用分子生物學(xué)技術(shù)的原理及應(yīng)用ThePopularTechnologyinMolecularBiology:PrincipleandApplication常用分子生物學(xué)技術(shù)的第一節(jié)
分子雜交與印跡技術(shù)
MolecularHybridization&BlottingTechnology第一節(jié)
分子雜交與印跡技術(shù)
MolecularH核酸分子雜交(nucleicacidhybridization)在DNA復(fù)性過(guò)程中,如果把不同DNA單鏈分子放在同一溶液中,或把DNA與RNA放在一起,只要在DNA或RNA的單鏈分子之間有一定的堿基配對(duì)關(guān)系,就可以在不同的分子之間形成雜化雙鏈(heteroduplex)
。一、分子雜交與印跡技術(shù)的原理核酸分子雜交(nucleicacidhybridiza復(fù)性RNADNA復(fù)性RNADNA(一)印漬技術(shù)
Blotting
首先由EdwenSouthern在1975年提出。Blotting即“印漬”,指將存在于凝膠中的生物大分子轉(zhuǎn)移(印漬)到固定化介質(zhì)是病加以檢測(cè)分析的技術(shù),目前廣泛應(yīng)用于DNA、RNA、和蛋白質(zhì)的檢測(cè)
(一)印漬技術(shù)
Blotting首先由EdwenSou探針技術(shù)
probe將一小段已知序列的核酸片段用放射性同位素、生物素或熒光染料對(duì)它的末端或全鏈進(jìn)行進(jìn)行標(biāo)記,稱(chēng)為“探針”然后用于分子雜交,雜交后通過(guò)放射自顯影、熒光檢測(cè)或顯色技術(shù),使雜交區(qū)帶顯現(xiàn)出來(lái)
探針技術(shù)
probe將一小段已知序列的核酸片段用放射性同位二、印漬技術(shù)的類(lèi)別及應(yīng)用DNA印跡技術(shù)SouthernblottingRNA印跡技術(shù)Northernblotting蛋白質(zhì)印跡技術(shù)Westernblotting斑點(diǎn)印跡Dotblotting原位雜交insituhybridizationDNA點(diǎn)陣DNAarrayDNA芯片技術(shù)DNAchip二、印漬技術(shù)的類(lèi)別及應(yīng)用DNA印跡技術(shù)Sout(一)DNA印跡技術(shù)
Southernblotting
又稱(chēng)為Southern雜交,即DNA-DNA雜交分析。是研究DNA圖譜的基本技術(shù),主要用于基因組DNA的分析,如在基因組中特異基因的定位及檢測(cè)等,亦可用于分析重組質(zhì)粒和噬菌體。在遺傳診斷DNA圖譜分析及PCR產(chǎn)物分析等方面有重要價(jià)值。(一)DNA印跡技術(shù)
Southernblotting基本方法將DNA標(biāo)本用限制性?xún)?nèi)切酶消化后,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳分離各酶解片段;經(jīng)堿變性,Tris緩沖液中和,高鹽下通過(guò)毛吸作用將DNA從凝膠中轉(zhuǎn)印至硝酸纖維素濾膜上,烘干固定,凝膠中DNA片段的相對(duì)位置在DNA片段轉(zhuǎn)移到濾膜的過(guò)程中繼續(xù)保持著。附著在濾膜上的DNA與32P標(biāo)記的探針雜交,利用放射自顯影術(shù)確定探針互補(bǔ)的每條DNA帶的位置,確定在眾多酶解產(chǎn)物中含某一特定序列的DNA片段的位置和大小?;痉椒▽NA標(biāo)本用限制性?xún)?nèi)切酶消化后,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳分PaperTowelsSouthernBlottingtissueSDS蛋白酶K酚/氯仿無(wú)水乙醇離心PaperTowelsSouthernBlottingt(二)RNA印漬技術(shù)
Northernblotting又稱(chēng)為Northern雜交,即RNA-DNA雜交分析。是一種將RNA從瓊脂糖凝膠中轉(zhuǎn)印到硝酸纖維素膜上的方法。主要用于檢測(cè)某一組織或細(xì)胞中已知的特異mRNA的表達(dá)水平以及比較不同組織和細(xì)胞的同一基因的表達(dá)情況。(二)RNA印漬技術(shù)
Northernblotting又(三)蛋白質(zhì)印漬技術(shù)
Westernblotting又稱(chēng)為Western雜交,或免疫印漬技術(shù),即利用抗原-抗體反應(yīng),檢測(cè)轉(zhuǎn)移到硝酸纖維素膜上的特異性蛋白質(zhì)。應(yīng)用:用于檢測(cè)樣品中特異性蛋白質(zhì)的存在、細(xì)胞中特異蛋白質(zhì)的半定量分析以及蛋白質(zhì)分子的相互作用研究等。
(三)蛋白質(zhì)印漬技術(shù)
Westernblotting又稱(chēng)為三種印跡技術(shù)的比較三種印跡技術(shù)的比較(一)DNA印跡技術(shù)(Southernblotting)
用于基因組DNA、重組質(zhì)粒和噬菌體的分析。(二)RNA印跡技術(shù)(Northernblotting)
用于RNA的定性定量分析。(三)蛋白質(zhì)的印跡分析(Westernblotting)
用于蛋白質(zhì)定性定量及相互作用研究。(一)DNA印跡技術(shù)(Southernblotting)斑點(diǎn)印跡
Dotblotting斑點(diǎn)雜交法是不經(jīng)過(guò)電泳,而將被檢標(biāo)本直接點(diǎn)到膜上,烘烤固定,用于雜交。這種方法耗時(shí)短,可做半定量分析,一張膜上可同時(shí)檢測(cè)多個(gè)樣品。斑點(diǎn)印跡
Dotblotting斑點(diǎn)雜交法是不經(jīng)過(guò)電泳,而原位雜交
insituhybridization即組織原位雜交,指組織切片或細(xì)胞涂片直接用于雜交分析。先經(jīng)適當(dāng)處理,使細(xì)胞通透性增加,讓探針進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)與DNA或RNA雜交。因此原位雜交可以確定探針的互補(bǔ)序列在胞內(nèi)的空間位置,這一點(diǎn)具有重要的生物學(xué)和病理學(xué)意義。原位雜交
insituhybridization即組織原第二節(jié)
聚合酶鏈反應(yīng)
PolymeraseChainReaction第二節(jié)
聚合酶鏈反應(yīng)
PolymerasePCR技術(shù)
polymerasechainreactionPCR即聚合酶鏈反應(yīng)技術(shù),是指利用耐熱DNA聚合酶的反復(fù)作用,通過(guò)變性-延伸-復(fù)性的循環(huán)操作,在體外迅速將DNA模板擴(kuò)增數(shù)百萬(wàn)倍的一種操作技術(shù)。理論上可在2小時(shí)內(nèi)將一個(gè)DNA分子擴(kuò)增到106-109倍,從而大大提高對(duì)其進(jìn)行分析研究的速度。PCR技術(shù)
polymerasechainreacti5Primer15Primer2Cycle2Cycle155
55
5
5TemplateDNA55
555
5
55一、基本工作原理5Primer15Primer2Cycle2CycCycle355
555
5
555
5
55
555
525~30次循環(huán)后,模板DNA的含量可以擴(kuò)大100萬(wàn)倍以上。Cycle35555555555模板DNA
特異性引物耐熱DNA聚合酶
dNTPsMg2+
二、PCR體系基本組成成分模板DNA二、PCR體系基本組成成分三、PCR的基本反應(yīng)步驟變性95?C延伸72?C退火Tm-5?C三、PCR的基本反應(yīng)步驟變性延伸退火四、PCR的主要用途(一)目的基因的克隆
PCR技術(shù)是迅速獲得一定量的目的基因以用于基因克隆的有效方法之一。主要采用的方法有:與反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)相結(jié)合,直接從組織和細(xì)胞的mRNA獲得已知目的基因片段;利用特異性引物以cDNA或基因組DNA為模板,獲得已知的目的基因;利用簡(jiǎn)并引物從cDNA文庫(kù)或基因組文庫(kù)中獲得具有同源性的DNA片段;利用隨機(jī)引物從cDNA文庫(kù)或基因組文庫(kù)中隨機(jī)獲得目的基因。
四、PCR的主要用途(一)目的基因的克隆(二)基因的體外突變
采用隨意設(shè)計(jì)的引物,在體外對(duì)基因進(jìn)行嵌合、缺失、點(diǎn)突變等改造。(三)DNA和RNA的微量分析
由于PCR技術(shù)具有高度敏感性,故可用于微量DNA和RNA的分析檢測(cè)。
(四)DNA序列測(cè)定(五)基因突變分析(二)基因的體外突變?nèi)追N重要的PCR衍生技術(shù)(一)反轉(zhuǎn)錄PCR技術(shù)(二)原位PCR技術(shù)(三)實(shí)時(shí)PCR技術(shù)三、幾種重要的PCR衍生技術(shù)(一)反轉(zhuǎn)錄PCR技術(shù)實(shí)時(shí)PCR技術(shù)原理實(shí)時(shí)PCR技術(shù)原理第三節(jié)
核酸序列分析
NucleicAcidSequenceAnalysis第三節(jié)
核酸序列分析
Nucleic核酸序列分析的基本原理化學(xué)裂解法(Maxam-Gillbert法)DNA鏈的末端合成終止法(sanger法)核酸序列分析的基本原理化學(xué)裂解法(Maxam-Gillbe一、化學(xué)裂解法(Maxam-Gilbert法)基本原理基于某些化學(xué)試劑可以使DNA鏈在1個(gè)或2個(gè)堿基處發(fā)生專(zhuān)一性斷裂的特性,精確地控制反應(yīng)強(qiáng)度,使一個(gè)斷裂點(diǎn)僅存在于少數(shù)分子中,不同分子在不同位點(diǎn)斷裂,從而獲得一系列大小不同的DNA片段,將這些片段經(jīng)電泳分離。分析前,用同位素標(biāo)記DNA的5′末端,經(jīng)放射自顯影即可在X膠片上讀出DNA鏈的序列。一、化學(xué)裂解法(Maxam-Gilbert法)基本原理基于某
化學(xué)裂解法的示意圖化學(xué)裂解法的示意圖二、DNA鏈末端合成終止法二、DNA鏈末端合成終止法目錄目錄三、DNA自動(dòng)測(cè)序采用熒光替代放射性核素標(biāo)記是實(shí)現(xiàn)DNA序列分析自動(dòng)化的基礎(chǔ)。用不同熒光分子標(biāo)記四種雙脫氧核苷酸,然后進(jìn)行Sanger測(cè)序反應(yīng),反應(yīng)產(chǎn)物經(jīng)電泳(平板電泳或毛細(xì)管電泳)分離后,通過(guò)四種激光激發(fā)不同大小DNA片段上的熒光分子使之發(fā)射出四種不同波長(zhǎng)熒光,檢測(cè)器采集熒光信號(hào),并依此確定DNA堿基的排列順序。三、DNA自動(dòng)測(cè)序采用熒光替代放射性核素標(biāo)記是實(shí)現(xiàn)DNA序列DNA自動(dòng)測(cè)序結(jié)果舉例目錄DNA自動(dòng)測(cè)序結(jié)果舉例目錄基因文庫(kù)
GeneLibrary第四節(jié)基因文庫(kù)
GeneLibrary第四節(jié)基因組DNA文庫(kù)(genomicDNAlibrary)cDNA文庫(kù)(cDNAlibrary)
基因文庫(kù)(genelibrary)是指一個(gè)包含了某一生物體全部DNA序列的克隆群體?;蚪MDNA文庫(kù)(genomicDNAlibrary)基因組DNA文庫(kù)cDNA文庫(kù)基因組DNA文庫(kù)cDNA文庫(kù)第一輪篩選第二輪篩選第三輪篩選基因組文庫(kù)篩選結(jié)果舉例第一輪篩選第二輪篩選第三輪篩選基因組文庫(kù)篩選結(jié)果舉例疾病相關(guān)基因的克隆與鑒定
CloningandIdentificationofDiseaseRelativeGenes第五節(jié)疾病相關(guān)基因的克隆與鑒定
CloningandIdent克隆疾病相關(guān)基因的策略(一)功能性克隆(functionalcloning)(二)定位克隆(positionalcloning)(三)非定位候選基因克隆策略(position-independentcandidategeneapproaches)(四)定位候選基因克隆策略(positionalcandidategeneapproaches)克隆疾病相關(guān)基因的策略(一)功能性克隆(functional定義從對(duì)一種致病基因的功能的了解出發(fā),克隆該致病基因。(一)功能性克隆應(yīng)用生化機(jī)制已明確、基因表達(dá)產(chǎn)物較易得到部分純化的遺傳性疾病。定義(一)功能性克隆應(yīng)用克隆方式
①利用特異性抗體篩選表達(dá)型cDNA文庫(kù);②根據(jù)已知的部分氨基酸序列合成寡核苷酸作探針,篩選cDNA文庫(kù)。
功能互補(bǔ)試驗(yàn)(functionalcomplementationassay)利用酵母系統(tǒng)從功能學(xué)角度鑒定致病基因。
克隆方式功能互補(bǔ)試驗(yàn)(functionalcomple(二)定位克隆定義從一種致病基因的染色體定位出發(fā)逐步縮小范圍,最后克隆該基因。系統(tǒng)的定位克隆工作①遺傳學(xué)分析(確定致病基因染色體定位)交換分析、連鎖不平衡分析②分子生物學(xué)分析染色體異常(缺失、易位等)分析、基因文庫(kù)的篩選與基因克?。ǘ┒ㄎ豢寺《x系統(tǒng)的定位克隆工作(三)非定位候選基因克隆策略由于基因組作圖的完成和分子病理學(xué)的發(fā)展,人們可以不依靠染色體定位,直接根據(jù)病理學(xué)變化和對(duì)各種基因產(chǎn)物功能的了解,預(yù)測(cè)出候選致病基因。(三)非定位候選基因克隆策略由于基因組作圖的完成和分子病理(四)定位候選基因克隆策略當(dāng)致病基因的染色體定位確認(rèn)后,人們可以利用因特網(wǎng)上的基因網(wǎng)站所提供基因序列數(shù)據(jù),鑒定出候選致病基因。(四)定位候選基因克隆策略當(dāng)致病基因的染色體定位確認(rèn)后,人們第六節(jié)
遺傳修飾動(dòng)物模型的建立及應(yīng)用TheEstablishmentandApplicationofHeredity-ModifiedAnimalModel第六節(jié)
遺傳修飾動(dòng)物模型的建立及應(yīng)用TheEstab轉(zhuǎn)基因技術(shù)采用基因轉(zhuǎn)移技術(shù)使目的基因整合入受精卵細(xì)胞或胚胎干細(xì)胞,然后將細(xì)胞導(dǎo)入動(dòng)物子宮,使之發(fā)育成個(gè)體。
轉(zhuǎn)基因——被導(dǎo)入的目的基因轉(zhuǎn)基因動(dòng)物(transgenicanimal)——目的基因的受體動(dòng)物一、轉(zhuǎn)基因技術(shù)轉(zhuǎn)基因技術(shù)轉(zhuǎn)基因——被導(dǎo)入的目的基因一、轉(zhuǎn)基因技術(shù)常用分子生物學(xué)技術(shù)的原理及應(yīng)用課件常用分子生物學(xué)技術(shù)的原理及應(yīng)用課件常用分子生物學(xué)技術(shù)的原理及應(yīng)用課件核轉(zhuǎn)移技術(shù)
即動(dòng)物整體克隆技術(shù),將動(dòng)物體細(xì)胞核全部導(dǎo)入另一個(gè)體的去胞核的受精卵內(nèi),使之發(fā)育成個(gè)體,即克隆(clone)。二、核轉(zhuǎn)移技術(shù)核轉(zhuǎn)移技術(shù)二、核轉(zhuǎn)移技術(shù)基因剔除技術(shù)也稱(chēng)基因靶向(genetargeting)滅活,有目的去除動(dòng)物體內(nèi)某種基因的技術(shù)。三、基因剔除技術(shù)基因剔除技術(shù)三、基因剔除技術(shù)四、基因轉(zhuǎn)移和基因剔除技術(shù)在醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用建立動(dòng)物模型①單基因決定疾病模型
基因剔除獲得性突變(gain-of-functionmutation)②多基因決定疾病模型四、基因轉(zhuǎn)移和基因剔除技術(shù)在醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用建立動(dòng)物模型第七節(jié)
生物芯片技術(shù)BiologicalChipTechnology第七節(jié)
BiologicalChipTechnoDNA芯片(DNAchip)cDNA芯片(cDNAchip)是指將許多特定的DNA片段或cDNA片段作為探針,有規(guī)律地緊密排列固定于單位面積的支持物上
。一、基因芯片基因芯片(genechip)DNA芯片(DNAchip)一、基因芯片基因芯片(gen常用分子生物學(xué)技術(shù)的原理及應(yīng)用課件DNA微陣列DNA是將高度密集排列的蛋白分子作為探針點(diǎn)陣固定在固相支持物上,當(dāng)與待測(cè)蛋白樣品反應(yīng)時(shí),可捕獲樣品中的靶蛋白,再經(jīng)檢測(cè)系統(tǒng)對(duì)靶蛋白進(jìn)行定性和定量分析的一種技術(shù)。二、蛋白質(zhì)芯片蛋白質(zhì)芯片(proteinchip)是將高度密集排列的蛋白分子作為探針點(diǎn)陣固定在固相支持物上,當(dāng)?shù)诎斯?jié)蛋白質(zhì)相互作用研究技術(shù)
ResearchTechnologyofInteractionofProtein第八節(jié)ResearchTechnologyofIn蛋白質(zhì)之間相互作用以及通過(guò)相互作用而形成的蛋白復(fù)合物是細(xì)胞各種基本功能的主要完成者。幾乎所有的重要生命活動(dòng),包括DNA的復(fù)制與轉(zhuǎn)錄、蛋白質(zhì)的合成與分泌、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和代謝等等,都離不開(kāi)蛋白質(zhì)之間的相互作用。蛋白質(zhì)之間相互作用研究的重要性蛋白質(zhì)之間相互作用以及通過(guò)相互作用而形成的蛋白復(fù)合物是細(xì)胞各酵母雙雜交各種親和分析(親和色譜、免疫共沉淀等)熒光共振能量轉(zhuǎn)換效應(yīng)分析噬菌體顯示系統(tǒng)篩選等等常用蛋白質(zhì)相互作用的研究技術(shù)酵母雙雜交常用蛋白質(zhì)相互作用的研究技術(shù)一、酵母雙雜交技術(shù)的基本原理一、酵母雙雜交技術(shù)的基本原理
二、酵母雙雜交系統(tǒng)的應(yīng)用(一)分析已知蛋白之間的相互作用(二)對(duì)蛋白質(zhì)功能域的分析(三)分析未知蛋白相互作用(四)繪制蛋白質(zhì)相互作用系統(tǒng)圖譜(五)在藥物設(shè)計(jì)中的應(yīng)用
二、酵母雙雜交系統(tǒng)的應(yīng)用(一)分析已知蛋白之間的相互作用常用分子生物學(xué)技術(shù)的原理及應(yīng)用ThePopularTechnologyinMolecularBiology:PrincipleandApplication常用分子生物學(xué)技術(shù)的第一節(jié)
分子雜交與印跡技術(shù)
MolecularHybridization&BlottingTechnology第一節(jié)
分子雜交與印跡技術(shù)
MolecularH核酸分子雜交(nucleicacidhybridization)在DNA復(fù)性過(guò)程中,如果把不同DNA單鏈分子放在同一溶液中,或把DNA與RNA放在一起,只要在DNA或RNA的單鏈分子之間有一定的堿基配對(duì)關(guān)系,就可以在不同的分子之間形成雜化雙鏈(heteroduplex)
。一、分子雜交與印跡技術(shù)的原理核酸分子雜交(nucleicacidhybridiza復(fù)性RNADNA復(fù)性RNADNA(一)印漬技術(shù)
Blotting
首先由EdwenSouthern在1975年提出。Blotting即“印漬”,指將存在于凝膠中的生物大分子轉(zhuǎn)移(印漬)到固定化介質(zhì)是病加以檢測(cè)分析的技術(shù),目前廣泛應(yīng)用于DNA、RNA、和蛋白質(zhì)的檢測(cè)
(一)印漬技術(shù)
Blotting首先由EdwenSou探針技術(shù)
probe將一小段已知序列的核酸片段用放射性同位素、生物素或熒光染料對(duì)它的末端或全鏈進(jìn)行進(jìn)行標(biāo)記,稱(chēng)為“探針”然后用于分子雜交,雜交后通過(guò)放射自顯影、熒光檢測(cè)或顯色技術(shù),使雜交區(qū)帶顯現(xiàn)出來(lái)
探針技術(shù)
probe將一小段已知序列的核酸片段用放射性同位二、印漬技術(shù)的類(lèi)別及應(yīng)用DNA印跡技術(shù)SouthernblottingRNA印跡技術(shù)Northernblotting蛋白質(zhì)印跡技術(shù)Westernblotting斑點(diǎn)印跡Dotblotting原位雜交insituhybridizationDNA點(diǎn)陣DNAarrayDNA芯片技術(shù)DNAchip二、印漬技術(shù)的類(lèi)別及應(yīng)用DNA印跡技術(shù)Sout(一)DNA印跡技術(shù)
Southernblotting
又稱(chēng)為Southern雜交,即DNA-DNA雜交分析。是研究DNA圖譜的基本技術(shù),主要用于基因組DNA的分析,如在基因組中特異基因的定位及檢測(cè)等,亦可用于分析重組質(zhì)粒和噬菌體。在遺傳診斷DNA圖譜分析及PCR產(chǎn)物分析等方面有重要價(jià)值。(一)DNA印跡技術(shù)
Southernblotting基本方法將DNA標(biāo)本用限制性?xún)?nèi)切酶消化后,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳分離各酶解片段;經(jīng)堿變性,Tris緩沖液中和,高鹽下通過(guò)毛吸作用將DNA從凝膠中轉(zhuǎn)印至硝酸纖維素濾膜上,烘干固定,凝膠中DNA片段的相對(duì)位置在DNA片段轉(zhuǎn)移到濾膜的過(guò)程中繼續(xù)保持著。附著在濾膜上的DNA與32P標(biāo)記的探針雜交,利用放射自顯影術(shù)確定探針互補(bǔ)的每條DNA帶的位置,確定在眾多酶解產(chǎn)物中含某一特定序列的DNA片段的位置和大小?;痉椒▽NA標(biāo)本用限制性?xún)?nèi)切酶消化后,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳分PaperTowelsSouthernBlottingtissueSDS蛋白酶K酚/氯仿無(wú)水乙醇離心PaperTowelsSouthernBlottingt(二)RNA印漬技術(shù)
Northernblotting又稱(chēng)為Northern雜交,即RNA-DNA雜交分析。是一種將RNA從瓊脂糖凝膠中轉(zhuǎn)印到硝酸纖維素膜上的方法。主要用于檢測(cè)某一組織或細(xì)胞中已知的特異mRNA的表達(dá)水平以及比較不同組織和細(xì)胞的同一基因的表達(dá)情況。(二)RNA印漬技術(shù)
Northernblotting又(三)蛋白質(zhì)印漬技術(shù)
Westernblotting又稱(chēng)為Western雜交,或免疫印漬技術(shù),即利用抗原-抗體反應(yīng),檢測(cè)轉(zhuǎn)移到硝酸纖維素膜上的特異性蛋白質(zhì)。應(yīng)用:用于檢測(cè)樣品中特異性蛋白質(zhì)的存在、細(xì)胞中特異蛋白質(zhì)的半定量分析以及蛋白質(zhì)分子的相互作用研究等。
(三)蛋白質(zhì)印漬技術(shù)
Westernblotting又稱(chēng)為三種印跡技術(shù)的比較三種印跡技術(shù)的比較(一)DNA印跡技術(shù)(Southernblotting)
用于基因組DNA、重組質(zhì)粒和噬菌體的分析。(二)RNA印跡技術(shù)(Northernblotting)
用于RNA的定性定量分析。(三)蛋白質(zhì)的印跡分析(Westernblotting)
用于蛋白質(zhì)定性定量及相互作用研究。(一)DNA印跡技術(shù)(Southernblotting)斑點(diǎn)印跡
Dotblotting斑點(diǎn)雜交法是不經(jīng)過(guò)電泳,而將被檢標(biāo)本直接點(diǎn)到膜上,烘烤固定,用于雜交。這種方法耗時(shí)短,可做半定量分析,一張膜上可同時(shí)檢測(cè)多個(gè)樣品。斑點(diǎn)印跡
Dotblotting斑點(diǎn)雜交法是不經(jīng)過(guò)電泳,而原位雜交
insituhybridization即組織原位雜交,指組織切片或細(xì)胞涂片直接用于雜交分析。先經(jīng)適當(dāng)處理,使細(xì)胞通透性增加,讓探針進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)與DNA或RNA雜交。因此原位雜交可以確定探針的互補(bǔ)序列在胞內(nèi)的空間位置,這一點(diǎn)具有重要的生物學(xué)和病理學(xué)意義。原位雜交
insituhybridization即組織原第二節(jié)
聚合酶鏈反應(yīng)
PolymeraseChainReaction第二節(jié)
聚合酶鏈反應(yīng)
PolymerasePCR技術(shù)
polymerasechainreactionPCR即聚合酶鏈反應(yīng)技術(shù),是指利用耐熱DNA聚合酶的反復(fù)作用,通過(guò)變性-延伸-復(fù)性的循環(huán)操作,在體外迅速將DNA模板擴(kuò)增數(shù)百萬(wàn)倍的一種操作技術(shù)。理論上可在2小時(shí)內(nèi)將一個(gè)DNA分子擴(kuò)增到106-109倍,從而大大提高對(duì)其進(jìn)行分析研究的速度。PCR技術(shù)
polymerasechainreacti5Primer15Primer2Cycle2Cycle155
55
5
5TemplateDNA55
555
5
55一、基本工作原理5Primer15Primer2Cycle2CycCycle355
555
5
555
5
55
555
525~30次循環(huán)后,模板DNA的含量可以擴(kuò)大100萬(wàn)倍以上。Cycle35555555555模板DNA
特異性引物耐熱DNA聚合酶
dNTPsMg2+
二、PCR體系基本組成成分模板DNA二、PCR體系基本組成成分三、PCR的基本反應(yīng)步驟變性95?C延伸72?C退火Tm-5?C三、PCR的基本反應(yīng)步驟變性延伸退火四、PCR的主要用途(一)目的基因的克隆
PCR技術(shù)是迅速獲得一定量的目的基因以用于基因克隆的有效方法之一。主要采用的方法有:與反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)相結(jié)合,直接從組織和細(xì)胞的mRNA獲得已知目的基因片段;利用特異性引物以cDNA或基因組DNA為模板,獲得已知的目的基因;利用簡(jiǎn)并引物從cDNA文庫(kù)或基因組文庫(kù)中獲得具有同源性的DNA片段;利用隨機(jī)引物從cDNA文庫(kù)或基因組文庫(kù)中隨機(jī)獲得目的基因。
四、PCR的主要用途(一)目的基因的克?。ǘ┗虻捏w外突變
采用隨意設(shè)計(jì)的引物,在體外對(duì)基因進(jìn)行嵌合、缺失、點(diǎn)突變等改造。(三)DNA和RNA的微量分析
由于PCR技術(shù)具有高度敏感性,故可用于微量DNA和RNA的分析檢測(cè)。
(四)DNA序列測(cè)定(五)基因突變分析(二)基因的體外突變?nèi)?、幾種重要的PCR衍生技術(shù)(一)反轉(zhuǎn)錄PCR技術(shù)(二)原位PCR技術(shù)(三)實(shí)時(shí)PCR技術(shù)三、幾種重要的PCR衍生技術(shù)(一)反轉(zhuǎn)錄PCR技術(shù)實(shí)時(shí)PCR技術(shù)原理實(shí)時(shí)PCR技術(shù)原理第三節(jié)
核酸序列分析
NucleicAcidSequenceAnalysis第三節(jié)
核酸序列分析
Nucleic核酸序列分析的基本原理化學(xué)裂解法(Maxam-Gillbert法)DNA鏈的末端合成終止法(sanger法)核酸序列分析的基本原理化學(xué)裂解法(Maxam-Gillbe一、化學(xué)裂解法(Maxam-Gilbert法)基本原理基于某些化學(xué)試劑可以使DNA鏈在1個(gè)或2個(gè)堿基處發(fā)生專(zhuān)一性斷裂的特性,精確地控制反應(yīng)強(qiáng)度,使一個(gè)斷裂點(diǎn)僅存在于少數(shù)分子中,不同分子在不同位點(diǎn)斷裂,從而獲得一系列大小不同的DNA片段,將這些片段經(jīng)電泳分離。分析前,用同位素標(biāo)記DNA的5′末端,經(jīng)放射自顯影即可在X膠片上讀出DNA鏈的序列。一、化學(xué)裂解法(Maxam-Gilbert法)基本原理基于某
化學(xué)裂解法的示意圖化學(xué)裂解法的示意圖二、DNA鏈末端合成終止法二、DNA鏈末端合成終止法目錄目錄三、DNA自動(dòng)測(cè)序采用熒光替代放射性核素標(biāo)記是實(shí)現(xiàn)DNA序列分析自動(dòng)化的基礎(chǔ)。用不同熒光分子標(biāo)記四種雙脫氧核苷酸,然后進(jìn)行Sanger測(cè)序反應(yīng),反應(yīng)產(chǎn)物經(jīng)電泳(平板電泳或毛細(xì)管電泳)分離后,通過(guò)四種激光激發(fā)不同大小DNA片段上的熒光分子使之發(fā)射出四種不同波長(zhǎng)熒光,檢測(cè)器采集熒光信號(hào),并依此確定DNA堿基的排列順序。三、DNA自動(dòng)測(cè)序采用熒光替代放射性核素標(biāo)記是實(shí)現(xiàn)DNA序列DNA自動(dòng)測(cè)序結(jié)果舉例目錄DNA自動(dòng)測(cè)序結(jié)果舉例目錄基因文庫(kù)
GeneLibrary第四節(jié)基因文庫(kù)
GeneLibrary第四節(jié)基因組DNA文庫(kù)(genomicDNAlibrary)cDNA文庫(kù)(cDNAlibrary)
基因文庫(kù)(genelibrary)是指一個(gè)包含了某一生物體全部DNA序列的克隆群體?;蚪MDNA文庫(kù)(genomicDNAlibrary)基因組DNA文庫(kù)cDNA文庫(kù)基因組DNA文庫(kù)cDNA文庫(kù)第一輪篩選第二輪篩選第三輪篩選基因組文庫(kù)篩選結(jié)果舉例第一輪篩選第二輪篩選第三輪篩選基因組文庫(kù)篩選結(jié)果舉例疾病相關(guān)基因的克隆與鑒定
CloningandIdentificationofDiseaseRelativeGenes第五節(jié)疾病相關(guān)基因的克隆與鑒定
CloningandIdent克隆疾病相關(guān)基因的策略(一)功能性克隆(functionalcloning)(二)定位克隆(positionalcloning)(三)非定位候選基因克隆策略(position-independentcandidategeneapproaches)(四)定位候選基因克隆策略(positionalcandidategeneapproaches)克隆疾病相關(guān)基因的策略(一)功能性克隆(functional定義從對(duì)一種致病基因的功能的了解出發(fā),克隆該致病基因。(一)功能性克隆應(yīng)用生化機(jī)制已明確、基因表達(dá)產(chǎn)物較易得到部分純化的遺傳性疾病。定義(一)功能性克隆應(yīng)用克隆方式
①利用特異性抗體篩選表達(dá)型cDNA文庫(kù);②根據(jù)已知的部分氨基酸序列合成寡核苷酸作探針,篩選cDNA文庫(kù)。
功能互補(bǔ)試驗(yàn)(functionalcomplementationassay)利用酵母系統(tǒng)從功能學(xué)角度鑒定致病基因。
克隆方式功能互補(bǔ)試驗(yàn)(functionalcomple(二)定位克隆定義從一種致病基因的染色體定位出發(fā)逐步縮小范圍,最后克隆該基因。系統(tǒng)的定位克隆工作①遺傳學(xué)分析(確定致病基因染色體定位)交換分析、連鎖不平衡分析②分子生物學(xué)分析染色體異常(缺失、易位等)分析、基因文庫(kù)的篩選與基因克?。ǘ┒ㄎ豢寺《x系統(tǒng)的定位克隆工作(三)非定位候選基因克隆策略由于基因組作圖的完成和分子病理學(xué)的發(fā)展,人們可以不依靠染色體定位,直接根據(jù)病理學(xué)變化和對(duì)各種基因產(chǎn)物功能的了解,預(yù)測(cè)出候選致病基因。(三)非定位候選基因克隆策略由于基因組作圖的完成和分子病理(四)定位候選基因克隆策略當(dāng)致病基因的染色體定位確認(rèn)后,人們可以利用因特網(wǎng)上的基因網(wǎng)站所提供基因序列數(shù)據(jù),鑒定出候選致病基因。(四)定位候選基因克隆策略當(dāng)致病基因的染色體定位確認(rèn)后,人們第六節(jié)
遺傳修飾動(dòng)物模型的建立及應(yīng)用TheEstablishmentandApplicationofHeredity-ModifiedA
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