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基因診斷和基因治療南通大學(xué)醫(yī)學(xué)院生化教研室沈勤基因診斷和基因治療南通大學(xué)醫(yī)學(xué)院生化教研室沈勤1概念:
基因是攜帶生物遺傳信息的基本功能單位,是位于染色體上的一段特定DNA序列。基因的改變,會(huì)導(dǎo)致各種表型的改變,進(jìn)而引起疾病的發(fā)生。將基因或其組成部分發(fā)生異常的疾病統(tǒng)稱為基因病。概念:基因是攜帶生物遺傳信息的基本功能單位,是位2基因病分為三大類:一、單基因?。河蓡蝹€(gè)基因突變引起的一類疾病。如:血友病、地中海貧血等。二、多基因?。河啥鄠€(gè)基因突變綜合作用引起的疾病。如:惡性腫瘤、高血壓、動(dòng)脈硬化、糖尿病、先天畸形等、三、獲得性基因?。褐竿庠椿颍―NA)侵入,在機(jī)體產(chǎn)生疾病,一旦將其清除便可痊愈。如:艾滋病及各種微生物感染病。基因病分為三大類:一、單基因?。河蓡蝹€(gè)基因突變引起的一類疾3第一節(jié)基因診斷(DNAdiagnosis)一、基因診斷的概念和基本概況臨床診斷生化學(xué)診斷免疫學(xué)診斷臨床疾病診斷四種方式:以疾病表型改變?yōu)橐罁?jù)。(細(xì)胞形態(tài)結(jié)構(gòu)變化、代謝產(chǎn)物異常、特定蛋白分子識(shí)別差異等)基因診斷對(duì)患者基因直接分析第一節(jié)基因診斷一、基因診斷的概念和基本概況臨床診4基因診斷定義(概念):
基因診斷是利用現(xiàn)代分子生物學(xué)和分子遺傳學(xué)的技術(shù)方法,直接檢測(cè)患者體內(nèi)基因結(jié)構(gòu)及其表達(dá)水平是否正常,從而對(duì)疾病作出診斷或輔助診斷?;蛟\斷是在DNA/RNA水平檢測(cè)分析基因的存在、結(jié)構(gòu)變異和表達(dá)狀態(tài),與傳統(tǒng)診斷方法比較有其特點(diǎn):基因診斷定義(概念):基因診斷是利用現(xiàn)代分子生物5基因診斷的特點(diǎn):1、病因診斷:直接瞄準(zhǔn)病理基因,不僅對(duì)表型出現(xiàn)的疾病作出診斷,還可能發(fā)現(xiàn)潛在的致病因素,如:確定有遺傳家族史的人攜帶致病基因。2、特異性強(qiáng)、靈敏度高:選用特定基因序列作為探針,單拷貝基因采用高度擴(kuò)增PCR技術(shù)。3、穩(wěn)定性高4、診斷范圍廣,適應(yīng)性強(qiáng)目的基因是否處于活化狀態(tài)均可。樣品可長(zhǎng)期保存。可檢測(cè)正在生長(zhǎng)的病原體或潛在病原體。(與以疾病表型改變?yōu)橐罁?jù)的診斷技術(shù)相比)基因診斷的特點(diǎn):1、病因診斷:直接瞄準(zhǔn)病理基因,不僅對(duì)表型出6基因診斷的基本概況:伴隨分子生物學(xué)理論技術(shù)的發(fā)展而建立和發(fā)展。DNA雙螺旋遺傳密碼破譯DNA重組癌基因與抑癌基因研究地中海貧血病基因治療和逆轉(zhuǎn)錄病毒載體開(kāi)發(fā)PCR、分子雜交等一系列技術(shù)發(fā)展基因診斷的基本概況:伴隨分子生物學(xué)理論技術(shù)的發(fā)展而建立和發(fā)展7二、基因診斷的對(duì)象1、病原生物的侵入病原體:病毒、支原體、細(xì)菌、寄生蟲(chóng)檢查診斷方法:顯微鏡、免疫學(xué)方法、基因診斷等。尤其是當(dāng)無(wú)抗體時(shí),基因診斷成為唯一手段。2、先天遺傳性疾病遺傳性疾病:發(fā)病的原因?yàn)樘囟ɑ虻耐蛔儭6?、基因診斷的對(duì)象1、病原生物的侵入病原體:病毒、支原體、細(xì)8腫瘤的發(fā)生:發(fā)病機(jī)理尚不請(qǐng)。
初步認(rèn)為是個(gè)別細(xì)胞基因突變而引起的細(xì)胞無(wú)限增殖.(包括抑癌基因和癌基因)3、后天基因突變引起的疾病二、基因診斷的對(duì)象腫瘤的發(fā)生:發(fā)病機(jī)理尚不請(qǐng)。3、后天基因突變引起9(1)用核心順序的串聯(lián)重復(fù)序列組成探針進(jìn)行雜交研究,可同時(shí)檢出具有高度多態(tài)性位點(diǎn)。(2)用southern雜交得到DNA指紋圖譜個(gè)體識(shí)別、親子鑒定、法醫(yī)物證4、其他二、基因診斷的對(duì)象遺傳穩(wěn)定,個(gè)體特異,因而用于法醫(yī)和親子鑒定。(1)用核心順序的串聯(lián)重復(fù)序列組成探針進(jìn)行雜交研個(gè)體識(shí)10基因診斷的基本策略:1、檢測(cè)已知的能產(chǎn)生某種特定功能蛋白的基因這些基因根據(jù)其特定功能已被克隆,并被定位在染色體上,基因序列亦被測(cè)定,致病時(shí)的基因改變亦較清楚。如:已被克隆的病毒、細(xì)菌、霉菌和寄生蟲(chóng)的基因、與致病有關(guān)的癌基因、抗癌基因、
地中海貧血、苯丙酮尿癥等遺傳病基因?;蛟\斷的基本策略:1、檢測(cè)已知的能產(chǎn)生某種特定功能蛋白的基112、檢測(cè)與某種遺傳標(biāo)志連鎖的致病基因遺傳連鎖--同一染色體相鄰的二個(gè)或二個(gè)以上的基因或限制性酶切位點(diǎn),由于位置十分靠近,在遺傳時(shí)分離幾率很低,常一起遺傳稱連鎖。染色體遺傳連鎖圖--用限制性內(nèi)切酶酶切位點(diǎn)作遺傳標(biāo)志,定位與之相連鎖的正?;蚺c致病基因,建立相應(yīng)的遺傳連鎖圖譜。定位性克?。鶕?jù)遺傳連鎖圖進(jìn)行定位性克隆。比較正常和異常基因的差別,可找出導(dǎo)致遺傳病的分子缺陷。定位性克隆策略是當(dāng)前基因診斷的重要基礎(chǔ)。2、檢測(cè)與某種遺傳標(biāo)志連鎖的致病基因遺傳連鎖--同一染色體相123、檢測(cè)表型克隆基因針對(duì)多基因?。ㄈ纾褐囟确逝帧⑾?、高血壓、癲癇、精神病、多種自身免疫性疾?。?。表型克隆技術(shù)--是將有關(guān)表型與基因結(jié)構(gòu)結(jié)合,直接分離該表型的相關(guān)基因,并對(duì)疾病相關(guān)的一組基因進(jìn)行克隆,然后用作多種探針,來(lái)診斷多基因遺傳病。該策略既不需預(yù)先知道基因的生化功能或圖譜定位,也不受基因數(shù)目及其相互作用方式的影響。方法:1、DD-RT-PCR:分析正常和異常基因組尋找兩者之間的差異序列2、基因組錯(cuò)配篩選技術(shù):尋找兩者的全同序列,分離、鑒定與疾病相關(guān)的基因,確定導(dǎo)致疾病的分子缺陷3、檢測(cè)表型克隆基因針對(duì)多基因?。ㄈ纾褐囟确逝?、哮喘、高血壓13基因診斷的基本步驟:1、獲得待檢樣品:提取核酸(PCR提高靈敏度)2、制備和標(biāo)記核酸探針3、基因檢測(cè)分析基因診斷的基本步驟:1、獲得待檢樣品:提取核酸(PCR提高14三、基因診斷的常用技術(shù)核酸分子雜交聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(RELP)擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性(AFLP)等位基因特異的寡核苷酸(ASO)單鏈構(gòu)象多態(tài)性(SSCP)基因芯片三、基因診斷的常用技術(shù)核酸分子雜交151、核酸分子雜交原理:利用核酸的變性、復(fù)性及堿基互補(bǔ)的性質(zhì),用已知基因的核酸序列作探針,與變性后的單鏈基因組DNA/RNA雜交,檢測(cè)核酸樣品中是否存在與探針互補(bǔ)的同源核酸序列,進(jìn)行DNA或RNA定性定量分析?;驒z驗(yàn)的兩個(gè)必要條件:1、必需的特異探針(標(biāo)記的)2、必需的基因組DNA1、核酸分子雜交原理:基因檢驗(yàn)的兩個(gè)必要條件:1、必需的特異16核酸分子雜交--核酸印跡雜交DNA印跡雜交(Southernblot)RNA印跡雜交(Nouthernblot)斑點(diǎn)印跡雜交(Dot-blot)原位雜交(situhybridization)核酸分子雜交--核酸印跡雜交DNA印跡雜交(Souther17核酸印跡雜交基本過(guò)程:提取DNA或RNA→酶切→凝膠電泳→膠變
性處理(DNA)→轉(zhuǎn)印核酸片段到NC膜上。
(RNA可直接用變性膠電泳,轉(zhuǎn)膜)1、制備樣品:核酸印跡雜交基本過(guò)程:提取DNA或RNA→酶切→凝膠18核酸印跡雜交基本過(guò)程:(2)制備探針:探針:一段能和待檢測(cè)核酸分子按堿基互補(bǔ)配對(duì)原則而結(jié)合的核酸分子片段。探針需要標(biāo)記可直接檢測(cè)的元素或分子。
如:同位素、熒光、生物素等核酸印跡雜交基本過(guò)程:(2)制備探針:探針:一段能和待檢測(cè)核19核酸印跡雜交基本過(guò)程:核酸印跡雜交可檢測(cè)pg水平的靶分子(4)檢測(cè):方法依標(biāo)記的探針而不同*放射性同位素*生物素*地高辛*熒光素(3)雜交:預(yù)雜交--封閉非特異性結(jié)合位點(diǎn)雜交--探針與核酸分子結(jié)合核酸印跡雜交基本過(guò)程:核酸印跡雜交可檢測(cè)pg水平的靶分子(420核酸印跡雜交基本過(guò)程:核酸印跡雜交基本過(guò)程:212、聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)原理:以待擴(kuò)增DNA為模板,在互補(bǔ)模板兩端序列的寡核苷酸引物介導(dǎo)下,通過(guò)耐高溫DNA聚合酶催化下,按半保留復(fù)制機(jī)制延模板鏈延伸,快速、特異地?cái)U(kuò)增特定的DNA。一種體外模擬自然DNA復(fù)制過(guò)程的核酸擴(kuò)增技術(shù)。(無(wú)細(xì)胞分子克隆技術(shù))。2、聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)原理:以待擴(kuò)增DNA為模板,在互補(bǔ)22耐高溫DNA聚合酶---Taq酶寡核苷酸引物:設(shè)計(jì)引物和確定退火溫度是PCR成功的關(guān)鍵。PCR的基本過(guò)程:(循環(huán)程序)變性(95℃)→退火(55℃-65℃)→延伸(72℃)3~5分40’’~1分100bp/1分源自水棲高溫菌,最適反應(yīng)溫度為72℃,且經(jīng)90℃以上加溫后仍可在溫度恢復(fù)后復(fù)性。耐高溫DNA聚合酶---Taq酶寡核苷酸引物:設(shè)計(jì)引物和確定23(呈2n擴(kuò)增速度)PCR基本過(guò)程和原理特點(diǎn):特異性強(qiáng)靈敏度高樣品可以是:毛發(fā)、血痕單細(xì)胞、病原體、腫瘤殘留物、犯罪現(xiàn)場(chǎng)遺留物(呈2n擴(kuò)增速度)PCR基本過(guò)程和原理特點(diǎn):特異性強(qiáng)24基因診斷中常用的PCR技術(shù):(1)、DNAPCR:(2)、RT-PCR:以DNA為模板,擴(kuò)增特定核苷酸序列。用于檢測(cè)特定基因片段的存在,分析鑒定基因突變。以總RNA或mRNA為模板,逆轉(zhuǎn)錄為cDNA后擴(kuò)增。用于檢測(cè)特定基因表達(dá)水平的主要方法之一。(3)、PCR-SSCP:檢測(cè)基因未知突變的常用技術(shù)。簡(jiǎn)單、快捷、靈敏。基因診斷中常用的PCR技術(shù):(1)、DNAPCR:(2)、25(4)、多重PCR:指在一次PCR反應(yīng)中加入多對(duì)引物,同時(shí)擴(kuò)增DNA序列上不同序列片段的一種PCR技術(shù)。用于一些“超大”基因中大片段缺失分析。(5)、原位PCR:直接用組織切片和細(xì)胞進(jìn)行PCR或RT-PCR,在組織、細(xì)胞原位檢測(cè)單拷貝或低拷貝的特點(diǎn)基因序列。(6)、實(shí)時(shí)定量PCR:借助特異性結(jié)合DNA的熒光染料,實(shí)時(shí)動(dòng)態(tài)檢測(cè)PCR擴(kuò)增的DNA量的變化。(4)、多重PCR:指在一次PCR反應(yīng)中加入多對(duì)引物,同時(shí)26其他重要的PCR衍生技術(shù)反向PCR(IPCR)標(biāo)記引物PCR(labelledprimersPCR)錨定PCR(anchoredPCR)差異展示PCR(DD-PCR)(見(jiàn)書(shū)“分子生物學(xué)技術(shù)”章節(jié))其他重要的PCR衍生技術(shù)反向PCR(IPCR)(見(jiàn)書(shū)“分子生273、限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(RFLP)檢出方法:Southern印跡概念:用同一限制性內(nèi)切酶完全切割同一物種的不同個(gè)體的基因組DNA,出現(xiàn)分子質(zhì)量不同的同源片段,這種由限制性內(nèi)切酶酶切位點(diǎn)變化導(dǎo)致的DNA片段差異,稱限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(RFLP)。人類基因組中由中性突變導(dǎo)致個(gè)體間核苷酸的差異稱--DNA多態(tài)性3、限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(RFLP)檢出方法:Southe28RFLP類型:2、由于鏈內(nèi)發(fā)生較大片段的缺失、重復(fù)、插入和重排導(dǎo)致DNA順序的變化,因而酶切片段改變---序列多態(tài)性。1、單個(gè)堿基的突變引起酶切位點(diǎn)的變化---點(diǎn)多態(tài)性致病基因附近或內(nèi)部一般存在RFLP,可用于連鎖分析的基因診斷。RFLP類型:2、由于鏈內(nèi)發(fā)生較大片段的缺失、重復(fù)、插入和重29(四)擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性(AFLP)應(yīng)用于基因突變性質(zhì)不明的連鎖分析。AFLP--串聯(lián)重復(fù)的短片段的長(zhǎng)度多態(tài)性通過(guò)PCR擴(kuò)增,經(jīng)限制性內(nèi)切酶酶切后電泳,產(chǎn)生顯示擴(kuò)增片段多態(tài)性。(四)擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性(AFLP)應(yīng)用于基因突30AFLP原理:首先利用可產(chǎn)生粘性末端的限制性內(nèi)切酶酶切研究對(duì)象的基因組序列,產(chǎn)生不同長(zhǎng)度的酶切片段。然后,將這些酶切片段與含有與其有共同粘性末段的人工接頭連接,形成模板。為達(dá)到選擇性擴(kuò)增的目的,再在模板末端添加具有選擇性核苷酸(1~3個(gè))的不同引物,然后PCR擴(kuò)增,結(jié)果只有那些兩端序列與選擇性核苷酸配對(duì)的酶切片段被擴(kuò)增。最后將被擴(kuò)增的片段在高分辨率的測(cè)序凝膠上電泳,這樣其多態(tài)性即根據(jù)擴(kuò)增片段的長(zhǎng)度與數(shù)量的不同而被分開(kāi)。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物即等位片段之間差別只有幾個(gè)bp。AFLP原理:首先利用可產(chǎn)生粘性末端的限315、等位基因特異的寡核苷酸(ASO)方法:1、合成兩種探針:①已知突變位點(diǎn)的核苷酸序列(M)
②正?;驂A基序列(N)2、雜交實(shí)驗(yàn)結(jié)果:M+N-受檢者是突變基因的純合子M-N+受檢者是不存在突變基因M-N-受檢者的缺陷基因可能是一種新的突變類型M+N+受檢者是突變基因的雜合子原理:
已知基因突變部位和性質(zhì),合成基因特異的核苷酸探針(20bp),標(biāo)記后與受檢者DNA雜交診斷。(可與PCR聯(lián)用:PCR-ASO)5、等位基因特異的寡核苷酸(ASO)方法:1、合成兩種探針:326、單鏈構(gòu)象多態(tài)性(SSCP)日本Orita等研究發(fā)現(xiàn),單鏈DNA片段呈復(fù)雜的空間折疊構(gòu)象,當(dāng)有一個(gè)堿基發(fā)生改變時(shí),會(huì)或多或少地影響其空間構(gòu)象,使構(gòu)象發(fā)生改變,空間構(gòu)象有差異的單鏈DNA分子在聚丙烯酰胺凝膠中受排阻大小不同.因此,通過(guò)非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳(PAGE),可以非常敏銳地將構(gòu)象上有差異的分子分離開(kāi).PCR-SSCP6、單鏈構(gòu)象多態(tài)性(SSCP)日本Orita等研究發(fā)現(xiàn),單鏈33PCR-SSCP基本過(guò)程①PCR擴(kuò)增靶DNA②將特異的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物變性后快速?gòu)?fù)性;③將單鏈DNA進(jìn)行非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳;④通過(guò)放射性自顯影、銀染或溴化乙錠顯色分析結(jié)果.若發(fā)現(xiàn)單鏈DNA帶遷移率與正常對(duì)照的相比發(fā)生改變,就可以判定該鏈構(gòu)象發(fā)生改變,進(jìn)而推斷該DNA片段中有堿基突變.PCR-SSCP基本過(guò)程①PCR擴(kuò)增靶DNA347、基因芯片將指大量寡核苷酸分子固定于支持物上,然后與標(biāo)記的樣品進(jìn)行雜交,通過(guò)檢測(cè)根據(jù)雜交分子和未雜交分子信號(hào)的強(qiáng)弱進(jìn)而判斷樣品中靶分子的數(shù)量?;驹恚海ㄉ锛赡FNA陣列、或寡核苷酸微芯片)7、基因芯片將指大量寡核苷酸分子固定于支持物上,然35基因芯片技術(shù):基因芯片技術(shù):36目的:檢測(cè)外源性基因的侵入目標(biāo):1、微生物2、病毒如:HIV(致艾滋病AIDS)3、寄生蟲(chóng)、4、不易體外培養(yǎng)的病原體(毒性大腸桿菌、麻風(fēng)分枝桿菌)5、實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)的病原體(克立氏體)四、基因診斷的臨床應(yīng)用:1、在感染性疾病檢測(cè)中應(yīng)用目的:檢測(cè)外源性基因的侵入目標(biāo):1、微生物四、基因診斷的臨37艾滋病與HIV病毒艾滋病由HIV通過(guò)接觸、血液、血制品及母嬰傳播感染所致。HIV特異地侵犯輔助性T細(xì)胞(CD4),引起人體細(xì)胞免疫嚴(yán)重缺陷,導(dǎo)致頑固的機(jī)會(huì)性感染,惡性腫瘤和神經(jīng)系統(tǒng)損傷。HIV感染后,95%感染者5個(gè)月可檢出抗體(也有3-4年仍不能檢出抗體)。有必要進(jìn)行PCR技術(shù)檢測(cè)。艾滋病與HIV病毒艾滋病由HIV通過(guò)接觸、血液、血制品及母嬰38艾滋病與HIV病毒檢測(cè)技術(shù):巢式-PCR、Southern、DNA序列分析引物的設(shè)計(jì):應(yīng)在保守區(qū)(基因:pol,env,gag,tat)病毒特點(diǎn):HIV病毒由兩條單鏈RNA組成,9.7k/RNA,主要基因結(jié)構(gòu)和組成形成與其他逆轉(zhuǎn)錄病毒相同,但較之復(fù)雜,故稱復(fù)雜反轉(zhuǎn)錄病毒HIV屬反轉(zhuǎn)錄病毒---即單鏈RNA反轉(zhuǎn)錄成雙鏈DNA,進(jìn)入宿主細(xì)胞染色體。艾滋病與HIV病毒檢測(cè)技術(shù):巢式-PCR、Southern、39非典型性肺炎(SARS)由一種新型冠狀病毒(SARS-CoV)引起,多種途徑傳播,傳染性強(qiáng)、高致死率的急性疾病。診斷依靠:流行病學(xué)、臨床表現(xiàn)、放射診斷、血清學(xué)(熒光免疫、ELISA)PCR作為一種靈敏的早期病原學(xué)診斷必不可少(關(guān)鍵是引物的合成)非典型性肺炎(SARS)由一種新型冠狀病毒(SARS-CoV402、在遺傳病檢測(cè)中的應(yīng)用產(chǎn)前診斷檢測(cè)妊娠8-12周的絨毛DNA或羊水細(xì)胞PCR診斷一系列遺傳疾病鐮刀狀細(xì)胞貧血的診斷方法:-RFLP診斷
MstⅡ酶切識(shí)別序列:CCTNAGG切割正常β鏈序列:CCTGAGG不切割突變序列:CCTGTGG
-ASO探針診斷2、在遺傳病檢測(cè)中的應(yīng)用產(chǎn)前診斷鐮刀狀細(xì)胞貧血的診斷413、在腫瘤檢測(cè)中的應(yīng)用原癌基因生物正常細(xì)胞基因中編碼關(guān)鍵性調(diào)控蛋白的癌基因抑癌基因一類抑制細(xì)胞增殖的基因,其失活可引起細(xì)胞轉(zhuǎn)化。兩類基因協(xié)同調(diào)控,使細(xì)胞生長(zhǎng)處于平衡狀態(tài)。3、在腫瘤檢測(cè)中的應(yīng)用原癌基因抑癌基因兩類基因協(xié)同調(diào)控,使細(xì)42癌基因激活變化及檢測(cè):1、基因擴(kuò)增:即染色體某區(qū)段基因拷貝數(shù)增加,或癌基因的擴(kuò)增。檢測(cè)方法:Southern雜交定量PCR2、基因的過(guò)量表達(dá):包括基因擴(kuò)增基礎(chǔ)上的過(guò)量表達(dá)及非DNA水平的過(guò)量表達(dá)。檢測(cè)方法:Northern雜交RT-PCR3、點(diǎn)突變:檢測(cè)方法為各種基于PCR的方法。癌基因激活變化及檢測(cè):1、基因擴(kuò)增:即染色體某區(qū)段基因拷貝數(shù)43抑癌基因的檢測(cè):SouthernPCR大片段的缺失、和點(diǎn)突變*兩個(gè)等位抑癌基因突變才能引起腫瘤,需檢出兩個(gè)等位抑癌基因。方法:RFLP結(jié)合PCR,進(jìn)行缺失檢測(cè)
點(diǎn)突變主要采用PCR抑癌基因的檢測(cè):SouthernPCR大片段的缺失44腫瘤標(biāo)志物:指特征性存在于惡性腫瘤或由惡性腫瘤細(xì)胞異常產(chǎn)生的物質(zhì)或宿主對(duì)腫瘤反應(yīng)而產(chǎn)生的物質(zhì)。(1)酶類腫瘤標(biāo)志物(2)激素類標(biāo)志物(3)胚胎抗原(4)特殊蛋白標(biāo)志物(5)糖蛋白類抗原(6)血中癌基因蛋白(7)唾液酸和唾液酸?;D(zhuǎn)移酶(8)多胺免疫組化篩選提高檢出率腫瘤標(biāo)志物:指特征性存在于惡性腫瘤或由惡性腫瘤細(xì)(1)酶類腫45法醫(yī)學(xué)鑒定針對(duì)人類DNA遺傳差異進(jìn)行的個(gè)體識(shí)別和親子鑒定。常用技術(shù):DNA指紋分析(VNTR)短串聯(lián)重復(fù)序列(STR)遺傳特征分析PCR-擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性(AmP-FLP)PCR-mtDNA技術(shù)根據(jù)可變串聯(lián)重復(fù)序列(小衛(wèi)星DNA)多態(tài)性
高度的個(gè)體特異性法醫(yī)學(xué)鑒定針對(duì)人類DNA遺傳差異進(jìn)行的個(gè)體識(shí)別和親子鑒定。46DNA指紋(圖譜)分析:⑴、選擇核心序列作探針,選在核心序列上無(wú)切割位點(diǎn)的限制性內(nèi)切酶,酶解樣品,Southernblot得到DNA指紋圖譜。針對(duì)可變串聯(lián)重復(fù)序列(VNTR)(VNTR是判斷個(gè)體的遺傳標(biāo)志)⑵、針對(duì)VNTR側(cè)翼保守區(qū)序列設(shè)計(jì)探針,用PCR對(duì)該區(qū)擴(kuò)增,電泳得到個(gè)體之間長(zhǎng)度不同的條帶圖譜。(VNTR片段較長(zhǎng)PCR不易擴(kuò)增)。DNA指紋(圖譜)分析:⑴、選擇核心序列作探針,選在核心序列47第二節(jié)基因治療(genetherapuy)概念:將外源正?;?qū)氚屑?xì)胞,以糾正或補(bǔ)償因缺陷和異?;蛞鸬募膊。_(dá)到治療目的。導(dǎo)入的基因可以與缺陷基因?qū)?yīng)、在體內(nèi)表達(dá)具有特異功能的同源基因、也可以是與缺陷基因無(wú)關(guān)的治療基因。概念的擴(kuò)展:凡是采用分子生物學(xué)方法原理,將某種遺傳物質(zhì)轉(zhuǎn)移到患者細(xì)胞內(nèi),使其在體內(nèi)發(fā)揮作用,達(dá)到治療目的的方法,都可稱為基因治療。第二節(jié)基因治療(genetherapuy)概念:48基因治療策略:總原則:--直接補(bǔ)替缺陷基因--抑制非正?;虍a(chǎn)物表達(dá)--間接調(diào)節(jié)機(jī)體本身免疫系統(tǒng)的抗病能力。--利用外源基因?qū)Σ∽兗?xì)胞造成特異性殺傷基因治療策略:總原則:--直接補(bǔ)替缺陷基因491、基因矯正--將致病基因的堿基進(jìn)行糾正,而正常部分予以保留。2、基因置換--用正?;蛲ㄟ^(guò)體內(nèi)基因同源重組,原位置換病變細(xì)胞內(nèi)的致病基因,使細(xì)胞內(nèi)的DNA完全恢復(fù)正常3、基因增補(bǔ)--將目的基因?qū)氩∽兗?xì)胞或其它細(xì)胞,不去除異?;?,而是通過(guò)目的基因的非定點(diǎn)整合,使其表達(dá)產(chǎn)物補(bǔ)償缺陷基因的功能或使原有功能得以加強(qiáng)。4、基因失活--利用反義技術(shù)特異封閉基因表達(dá),抑制有害基因的表達(dá)。5、免疫調(diào)節(jié)--將抗體、抗原或細(xì)胞因子的基因?qū)氩∪梭w內(nèi),改變病人免疫狀態(tài),達(dá)到預(yù)防和治療的目的?;蛑委煹牟呗裕?、基因矯正--將致病基因的堿基進(jìn)行糾正,而正常部分予以保留506、調(diào)節(jié)性基因治療:導(dǎo)入編碼調(diào)控蛋白的基因,治療基因表答異常的疾病7、化療保護(hù)性基因治療:導(dǎo)入單相或多相細(xì)胞毒性藥物的抗性基因,使正常細(xì)胞耐受化療藥物的能力大大提高。8、特異性細(xì)胞殺傷性基因治療:利用DNA重組技術(shù)構(gòu)建特異性殺傷靶細(xì)胞為目標(biāo)的“奇異彈頭”,“彈頭”部分是分子重組的各種生物細(xì)胞毒素,它們以酶催化方式發(fā)揮抑制蛋白合成作用,造成細(xì)胞殺傷。9、生殖細(xì)胞基因治療:生殖細(xì)胞或胚胎干細(xì)胞補(bǔ)償性治療6、調(diào)節(jié)性基因治療:導(dǎo)入編碼調(diào)控蛋白的基因,治療7、化療保51基因治療基本程序;方法:1、體外法(exvivo):2、體內(nèi)法(invivo):將受體細(xì)胞在體外培養(yǎng),轉(zhuǎn)入外源基因,經(jīng)適當(dāng)選擇系統(tǒng),將重組的受體細(xì)胞回輸患者體內(nèi),以改善癥狀。(普遍采用)直接將外源基因?qū)塍w內(nèi)有關(guān)的組織器官,使其進(jìn)入相應(yīng)的細(xì)胞并轉(zhuǎn)錄、表達(dá)而發(fā)揮治療作用?;境绦颍哼x擇目的基因選擇基因載體選擇靶細(xì)胞基因轉(zhuǎn)移外源基因表達(dá)及檢測(cè)回輸體內(nèi)基因治療基本程序;方法:1、體外法2、體內(nèi)法將受體細(xì)胞在體外52治療基因的來(lái)源:1、野生型基因:?jiǎn)位蛉毕葸z傳病基因反義核酸封閉活化的原癌基因轉(zhuǎn)入相關(guān)的抑癌基因,抑制腫瘤2、重組DNA和分子克隆技術(shù),人工合成特異基因。1、選擇治療的目的基因治療基因的來(lái)源:1、野生型基因:2、重組DNA和分子克隆技53用于基因治療的基因應(yīng)滿足以下條件:(1)體內(nèi)僅少量表達(dá)就可顯著改善癥狀。(2)該基因的過(guò)量表達(dá)不會(huì)對(duì)機(jī)體造成危害、(3)在抗病毒和抗病原體的基因治療中,所選擇的靶基因應(yīng)在病毒和病原體的生活史中起重要作用,并且該序列是特異的。用于基因治療的基因應(yīng)滿足以下條件:(1)體內(nèi)僅少量表達(dá)就可顯54理想的載體具有以下特征:1、容易生產(chǎn)商業(yè)化生產(chǎn),廣泛應(yīng)用,易運(yùn)輸,易保存2、持續(xù)表達(dá)一旦轉(zhuǎn)入體內(nèi),應(yīng)能在一定時(shí)間內(nèi)持續(xù)表達(dá)基因產(chǎn)物,或能通過(guò)某種方法精細(xì)調(diào)節(jié)其表達(dá)。3、弱免疫源轉(zhuǎn)入后不應(yīng)引起免疫反應(yīng)。4、組織靶向性定向輸入某種細(xì)胞。5、包裝容量載體對(duì)轉(zhuǎn)染基因的大小應(yīng)沒(méi)有限制。6、復(fù)制、分裂和整合能力:特異性定位整合,或以游離基因形式存在于細(xì)胞核內(nèi)。7、能感染分裂期細(xì)胞和未分裂期細(xì)胞2、選擇基因載體:理想的載體具有以下特征:1、容易生產(chǎn)商業(yè)化生產(chǎn),廣泛55基因載體:非病毒載體(裸DNA、脂質(zhì)體)
病毒載體
(反轉(zhuǎn)錄病毒、腺病毒、腺相關(guān)病毒)分類:優(yōu)點(diǎn):大量生產(chǎn),毒性小,低免疫性缺點(diǎn):效率低。優(yōu)點(diǎn):多數(shù)病毒可感染特異細(xì)胞,不易降解,RNA病毒能整合到宿主染色體,表達(dá)水平高等?;蜉d體:非病毒載體(裸DNA、脂質(zhì)體)病毒載體56病毒介導(dǎo)的基因轉(zhuǎn)移1、逆轉(zhuǎn)錄病毒:正鏈RNA病毒病毒介導(dǎo)的基因轉(zhuǎn)移1、逆轉(zhuǎn)錄病毒:正鏈RNA病毒57逆轉(zhuǎn)錄病毒結(jié)構(gòu):基因組組成:(1)5’-帽子;3’-尾巴;(2)每個(gè)單鏈RNA含6個(gè)區(qū):5’-LTR(長(zhǎng)末端重復(fù)序列)
Ψ+(組裝所需的非編碼序列)gag(編碼衣殼結(jié)構(gòu)蛋白基因)pol(編碼反轉(zhuǎn)錄酶基因)env(編碼外殼蛋白基因)3’-LTR逆轉(zhuǎn)錄病毒結(jié)構(gòu):基因組組成:(1)5’-帽子;3’-尾巴;(58逆轉(zhuǎn)錄病毒生活周期:1、感染靶細(xì)胞2、利用自身編碼的逆反轉(zhuǎn)錄酶,以RNA為模板合成DNA。3、將病毒DNA轉(zhuǎn)運(yùn)至宿主細(xì)胞核4、病毒DNA整合到宿主染色體5、以病毒DNA為模板轉(zhuǎn)錄RNA6、在細(xì)胞中翻譯Gag、Pol和Env蛋白7、形成衣殼,RNA單鏈和反轉(zhuǎn)錄酶一起包裝進(jìn)衣殼。8、形成病毒顆粒并分泌到胞外。逆轉(zhuǎn)錄病毒生活周期:1、感染靶細(xì)胞2、利用自身編碼的逆反轉(zhuǎn)錄59逆轉(zhuǎn)錄病毒病毒RNA宿主細(xì)胞RTRT逆轉(zhuǎn)錄酶cDNA雙鏈插入基因組DNA逆轉(zhuǎn)錄病毒感染過(guò)程病毒RNA逆轉(zhuǎn)錄病毒病毒RNA宿主細(xì)胞RTRT逆轉(zhuǎn)錄酶cDNA雙鏈插入60構(gòu)建逆轉(zhuǎn)錄病毒載體:(1)構(gòu)建重組野生性病毒:插入相關(guān)外源基因,改造成DNA載體(包括插入選擇性標(biāo)記),替代病毒的編碼基因。(2)制備輔助細(xì)胞(293T細(xì)胞),為載體DNA提供其喪失的功能。(3)載體DNA導(dǎo)入輔助細(xì)胞,產(chǎn)生病毒載體。(4)用病毒載體感染細(xì)胞,外源基因在宿主細(xì)胞中表達(dá)。構(gòu)建逆轉(zhuǎn)錄病毒載體:(1)構(gòu)建重組野生性病毒:插入相關(guān)外源基61逆轉(zhuǎn)錄病毒載體的缺陷:1、只能轉(zhuǎn)染處于增殖狀態(tài)的細(xì)胞2、所攜帶的外源基因不能太大。3、感染依賴靶細(xì)胞表面受體的限制4、理論上不擴(kuò)散其它細(xì)胞,但某些情況會(huì)造成野生型病毒爆發(fā)。5、有致細(xì)胞癌變的可能。6、逆轉(zhuǎn)錄病毒不能耐受純化和濃縮過(guò)程。逆轉(zhuǎn)錄病毒載體的缺陷:1、只能轉(zhuǎn)染處于增殖狀態(tài)的細(xì)胞2、所攜62腺相關(guān)病毒(AVV)一種小的、非致病的、單鏈DNA病毒。是從屬病毒,需要其他基因才能復(fù)制。結(jié)構(gòu):rep基因--編碼病毒的復(fù)制、整合功能所需蛋白cap基因--編碼病毒結(jié)構(gòu)組分ITRs序列--反向末端重復(fù),定義基因的開(kāi)始和結(jié)束,制約DNA序列大小,包裹入衣殼。細(xì)胞對(duì)AVV病毒的親和力高,AVV載體適用范圍廣泛。腺相關(guān)病毒(AVV)一種小的、非致病的、單鏈DNA病毒。是63骨髓細(xì)胞、皮膚成纖維細(xì)胞、肝細(xì)胞、血管內(nèi)皮細(xì)胞、肌細(xì)胞選擇原則:1、較堅(jiān)固,耐受處理,易于由人體分離,便于輸回體內(nèi)。2、具有增殖優(yōu)勢(shì),生命周期長(zhǎng),能存活幾個(gè)月或幾年,至病人的整個(gè)生命。3、易于受外源遺傳物質(zhì)的轉(zhuǎn)化。4、在選用病毒載體時(shí),目的基因具表達(dá)最好具有組織特異性的細(xì)胞3、選擇靶細(xì)胞(禁止使用生殖細(xì)胞,只能用體細(xì)胞)骨髓細(xì)胞、皮膚成纖維細(xì)胞、肝細(xì)胞、血管內(nèi)皮細(xì)胞、肌細(xì)胞選擇原641、骨髓細(xì)胞:最被重視和常用的靶細(xì)胞。常用細(xì)胞:優(yōu)點(diǎn):⑴易接受各種處理、⑵已積累豐富經(jīng)驗(yàn),⑶多數(shù)遺傳疾病涉及骨髓細(xì)胞、⑷源自骨髓的細(xì)胞遍布全身。缺點(diǎn):-骨髓干細(xì)胞含量少(占骨髓細(xì)胞0.1%)-治療基因在核骨髓細(xì)胞表達(dá)時(shí)間短(幾個(gè)月)。-只有部分干細(xì)胞有活性-造血干細(xì)胞分化可能導(dǎo)致基因失活。-有些遺傳疾病與骨髓干細(xì)胞無(wú)關(guān)。2、肝細(xì)胞:是許多遺傳代謝缺陷的靶細(xì)胞。3、皮膚細(xì)胞:易于繁殖及轉(zhuǎn)化。4、淋巴細(xì)胞:易采集、分離,大量繁殖,連續(xù)多次輸入5、癌細(xì)胞:腫瘤治療常用細(xì)胞。1、骨髓細(xì)胞:最被重視和常用的靶細(xì)胞。常用細(xì)胞:優(yōu)點(diǎn):⑴易接65方法:1、物理法:顯微注射法電穿孔法基因槍技術(shù)2、化學(xué)法:磷酸鈣沉淀法DEAE-葡萄糖法脂質(zhì)體法3、融合法4、病毒感染法4、基因的轉(zhuǎn)移方法:1、物理法:顯微注射法2、化學(xué)法:磷酸鈣沉淀法3、融合66轉(zhuǎn)染細(xì)胞后的篩選:方法:1、標(biāo)記基因篩選法:2、基因缺陷型受體細(xì)胞的選擇性3、基因共轉(zhuǎn)染技術(shù)4、分子生物學(xué)方法:原位雜交Southern雜交斑點(diǎn)雜交目的基因或標(biāo)記基因作為探針。轉(zhuǎn)染細(xì)胞后的篩選:方法:1、標(biāo)記基因篩選法:原位雜交目的基因67方法:(目的基因和標(biāo)記基因的表達(dá))原位雜交、Nouthern雜交、RNA點(diǎn)雜交(檢測(cè)mRNA的轉(zhuǎn)錄)免疫組化染色(檢測(cè)基因翻譯出的蛋白質(zhì))5、外源基因表達(dá)的檢測(cè):方法:(目的基因和標(biāo)記基因的表達(dá))原位雜交、Nout686、回輸體內(nèi)將治療性基因修飾的細(xì)胞通過(guò)不同方式回輸入體內(nèi),以發(fā)揮治療效果。如:-淋巴細(xì)胞經(jīng)靜脈回輸入血-造血細(xì)胞經(jīng)自體骨髓移植-皮膚成纖維細(xì)胞經(jīng)膠原包裹后埋入皮下組織
6、回輸體內(nèi)將治療性基因修飾的細(xì)胞通過(guò)不同方式回輸如:-淋691、肝專一性表達(dá):磷酸烯醇式丙酮酸羧基酶啟動(dòng)子2、肌肉專一性表達(dá):肌苷激酶的調(diào)控片段3、乳腺專一性表達(dá):β酪蛋白,乳清酸蛋白4、黑色素專一性表達(dá):酪氨酸和酪氨酸相關(guān)蛋白(TRP)5、膠質(zhì)瘤專一性表達(dá):鞘磷酸堿性蛋白基因上游片段6、肺癌專一性表達(dá):人表面活性蛋白A與目的基因一起重組入反轉(zhuǎn)錄病毒,用于基因靶向表達(dá)。組織專一性表達(dá)的調(diào)節(jié)片段:1、肝專一性表達(dá):磷酸烯醇式丙酮酸羧基酶啟動(dòng)子2、肌肉專70基因治療的應(yīng)用及展望應(yīng)用治療:
遺傳?。▽W(xué)友病、囊性纖維病、家族性高血壓惡性腫瘤心血管疾病感染性疾病(AIDS、類風(fēng)濕等)基因治療的應(yīng)用及展望應(yīng)用治療:遺傳?。▽W(xué)友病、囊性纖維病、71呈待解決的問(wèn)題:外源基因表達(dá)效率外源基因表達(dá)調(diào)控遺傳性疾病面臨的免疫問(wèn)題反轉(zhuǎn)錄病毒載體隨機(jī)插入的外源基因,若插入不當(dāng),可能破壞另一個(gè)基因的表達(dá)或激活其它基因(潛在的危險(xiǎn))。呈待解決的問(wèn)題:外源基因表達(dá)效率72使用巢式引物進(jìn)行連續(xù)多輪擴(kuò)增可以提高特異性和靈敏度。第一輪是15到20個(gè)循環(huán)的標(biāo)準(zhǔn)擴(kuò)增。將一小部分起始擴(kuò)增產(chǎn)物稀釋100到1000倍加入到第二輪擴(kuò)增中進(jìn)行15到20個(gè)循環(huán)。或者,也可以通過(guò)凝膠純化將起始擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行大小選擇。在第二輪擴(kuò)增中使用一套巢式引物,其可以同第一套引物內(nèi)側(cè)的靶序列結(jié)合。巢式PCR的使用降低了擴(kuò)增多個(gè)靶位點(diǎn)的可能性,因?yàn)橥瑑商滓锒蓟パa(bǔ)的靶序列很少。而使用同樣的引物對(duì)進(jìn)行總數(shù)相同的循環(huán)(30到40)會(huì)擴(kuò)增非特異性靶位點(diǎn)。巢式PCR可以增加有限量靶序列(如稀有mRNA)的靈敏度,并且提高了困難PCR(如5'RACE)的特異性。巢式PCR使用巢式引物進(jìn)行連續(xù)多輪擴(kuò)增可以提高特異性和靈敏度。73基因診斷和基因治療南通大學(xué)醫(yī)學(xué)院生化教研室沈勤基因診斷和基因治療南通大學(xué)醫(yī)學(xué)院生化教研室沈勤74概念:
基因是攜帶生物遺傳信息的基本功能單位,是位于染色體上的一段特定DNA序列。基因的改變,會(huì)導(dǎo)致各種表型的改變,進(jìn)而引起疾病的發(fā)生。將基因或其組成部分發(fā)生異常的疾病統(tǒng)稱為基因病。概念:基因是攜帶生物遺傳信息的基本功能單位,是位75基因病分為三大類:一、單基因?。河蓡蝹€(gè)基因突變引起的一類疾病。如:血友病、地中海貧血等。二、多基因病:由多個(gè)基因突變綜合作用引起的疾病。如:惡性腫瘤、高血壓、動(dòng)脈硬化、糖尿病、先天畸形等、三、獲得性基因?。褐竿庠椿颍―NA)侵入,在機(jī)體產(chǎn)生疾病,一旦將其清除便可痊愈。如:艾滋病及各種微生物感染病?;虿》譃槿箢悾阂?、單基因?。河蓡蝹€(gè)基因突變引起的一類疾76第一節(jié)基因診斷(DNAdiagnosis)一、基因診斷的概念和基本概況臨床診斷生化學(xué)診斷免疫學(xué)診斷臨床疾病診斷四種方式:以疾病表型改變?yōu)橐罁?jù)。(細(xì)胞形態(tài)結(jié)構(gòu)變化、代謝產(chǎn)物異常、特定蛋白分子識(shí)別差異等)基因診斷對(duì)患者基因直接分析第一節(jié)基因診斷一、基因診斷的概念和基本概況臨床診77基因診斷定義(概念):
基因診斷是利用現(xiàn)代分子生物學(xué)和分子遺傳學(xué)的技術(shù)方法,直接檢測(cè)患者體內(nèi)基因結(jié)構(gòu)及其表達(dá)水平是否正常,從而對(duì)疾病作出診斷或輔助診斷?;蛟\斷是在DNA/RNA水平檢測(cè)分析基因的存在、結(jié)構(gòu)變異和表達(dá)狀態(tài),與傳統(tǒng)診斷方法比較有其特點(diǎn):基因診斷定義(概念):基因診斷是利用現(xiàn)代分子生物78基因診斷的特點(diǎn):1、病因診斷:直接瞄準(zhǔn)病理基因,不僅對(duì)表型出現(xiàn)的疾病作出診斷,還可能發(fā)現(xiàn)潛在的致病因素,如:確定有遺傳家族史的人攜帶致病基因。2、特異性強(qiáng)、靈敏度高:選用特定基因序列作為探針,單拷貝基因采用高度擴(kuò)增PCR技術(shù)。3、穩(wěn)定性高4、診斷范圍廣,適應(yīng)性強(qiáng)目的基因是否處于活化狀態(tài)均可。樣品可長(zhǎng)期保存??蓹z測(cè)正在生長(zhǎng)的病原體或潛在病原體。(與以疾病表型改變?yōu)橐罁?jù)的診斷技術(shù)相比)基因診斷的特點(diǎn):1、病因診斷:直接瞄準(zhǔn)病理基因,不僅對(duì)表型出79基因診斷的基本概況:伴隨分子生物學(xué)理論技術(shù)的發(fā)展而建立和發(fā)展。DNA雙螺旋遺傳密碼破譯DNA重組癌基因與抑癌基因研究地中海貧血病基因治療和逆轉(zhuǎn)錄病毒載體開(kāi)發(fā)PCR、分子雜交等一系列技術(shù)發(fā)展基因診斷的基本概況:伴隨分子生物學(xué)理論技術(shù)的發(fā)展而建立和發(fā)展80二、基因診斷的對(duì)象1、病原生物的侵入病原體:病毒、支原體、細(xì)菌、寄生蟲(chóng)檢查診斷方法:顯微鏡、免疫學(xué)方法、基因診斷等。尤其是當(dāng)無(wú)抗體時(shí),基因診斷成為唯一手段。2、先天遺傳性疾病遺傳性疾病:發(fā)病的原因?yàn)樘囟ɑ虻耐蛔?。二、基因診斷的對(duì)象1、病原生物的侵入病原體:病毒、支原體、細(xì)81腫瘤的發(fā)生:發(fā)病機(jī)理尚不請(qǐng)。
初步認(rèn)為是個(gè)別細(xì)胞基因突變而引起的細(xì)胞無(wú)限增殖.(包括抑癌基因和癌基因)3、后天基因突變引起的疾病二、基因診斷的對(duì)象腫瘤的發(fā)生:發(fā)病機(jī)理尚不請(qǐng)。3、后天基因突變引起82(1)用核心順序的串聯(lián)重復(fù)序列組成探針進(jìn)行雜交研究,可同時(shí)檢出具有高度多態(tài)性位點(diǎn)。(2)用southern雜交得到DNA指紋圖譜個(gè)體識(shí)別、親子鑒定、法醫(yī)物證4、其他二、基因診斷的對(duì)象遺傳穩(wěn)定,個(gè)體特異,因而用于法醫(yī)和親子鑒定。(1)用核心順序的串聯(lián)重復(fù)序列組成探針進(jìn)行雜交研個(gè)體識(shí)83基因診斷的基本策略:1、檢測(cè)已知的能產(chǎn)生某種特定功能蛋白的基因這些基因根據(jù)其特定功能已被克隆,并被定位在染色體上,基因序列亦被測(cè)定,致病時(shí)的基因改變亦較清楚。如:已被克隆的病毒、細(xì)菌、霉菌和寄生蟲(chóng)的基因、與致病有關(guān)的癌基因、抗癌基因、
地中海貧血、苯丙酮尿癥等遺傳病基因。基因診斷的基本策略:1、檢測(cè)已知的能產(chǎn)生某種特定功能蛋白的基842、檢測(cè)與某種遺傳標(biāo)志連鎖的致病基因遺傳連鎖--同一染色體相鄰的二個(gè)或二個(gè)以上的基因或限制性酶切位點(diǎn),由于位置十分靠近,在遺傳時(shí)分離幾率很低,常一起遺傳稱連鎖。染色體遺傳連鎖圖--用限制性內(nèi)切酶酶切位點(diǎn)作遺傳標(biāo)志,定位與之相連鎖的正?;蚺c致病基因,建立相應(yīng)的遺傳連鎖圖譜。定位性克?。鶕?jù)遺傳連鎖圖進(jìn)行定位性克隆。比較正常和異常基因的差別,可找出導(dǎo)致遺傳病的分子缺陷。定位性克隆策略是當(dāng)前基因診斷的重要基礎(chǔ)。2、檢測(cè)與某種遺傳標(biāo)志連鎖的致病基因遺傳連鎖--同一染色體相853、檢測(cè)表型克隆基因針對(duì)多基因?。ㄈ纾褐囟确逝?、哮喘、高血壓、癲癇、精神病、多種自身免疫性疾病)。表型克隆技術(shù)--是將有關(guān)表型與基因結(jié)構(gòu)結(jié)合,直接分離該表型的相關(guān)基因,并對(duì)疾病相關(guān)的一組基因進(jìn)行克隆,然后用作多種探針,來(lái)診斷多基因遺傳病。該策略既不需預(yù)先知道基因的生化功能或圖譜定位,也不受基因數(shù)目及其相互作用方式的影響。方法:1、DD-RT-PCR:分析正常和異常基因組尋找兩者之間的差異序列2、基因組錯(cuò)配篩選技術(shù):尋找兩者的全同序列,分離、鑒定與疾病相關(guān)的基因,確定導(dǎo)致疾病的分子缺陷3、檢測(cè)表型克隆基因針對(duì)多基因病(如:重度肥胖、哮喘、高血壓86基因診斷的基本步驟:1、獲得待檢樣品:提取核酸(PCR提高靈敏度)2、制備和標(biāo)記核酸探針3、基因檢測(cè)分析基因診斷的基本步驟:1、獲得待檢樣品:提取核酸(PCR提高87三、基因診斷的常用技術(shù)核酸分子雜交聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(RELP)擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性(AFLP)等位基因特異的寡核苷酸(ASO)單鏈構(gòu)象多態(tài)性(SSCP)基因芯片三、基因診斷的常用技術(shù)核酸分子雜交881、核酸分子雜交原理:利用核酸的變性、復(fù)性及堿基互補(bǔ)的性質(zhì),用已知基因的核酸序列作探針,與變性后的單鏈基因組DNA/RNA雜交,檢測(cè)核酸樣品中是否存在與探針互補(bǔ)的同源核酸序列,進(jìn)行DNA或RNA定性定量分析?;驒z驗(yàn)的兩個(gè)必要條件:1、必需的特異探針(標(biāo)記的)2、必需的基因組DNA1、核酸分子雜交原理:基因檢驗(yàn)的兩個(gè)必要條件:1、必需的特異89核酸分子雜交--核酸印跡雜交DNA印跡雜交(Southernblot)RNA印跡雜交(Nouthernblot)斑點(diǎn)印跡雜交(Dot-blot)原位雜交(situhybridization)核酸分子雜交--核酸印跡雜交DNA印跡雜交(Souther90核酸印跡雜交基本過(guò)程:提取DNA或RNA→酶切→凝膠電泳→膠變
性處理(DNA)→轉(zhuǎn)印核酸片段到NC膜上。
(RNA可直接用變性膠電泳,轉(zhuǎn)膜)1、制備樣品:核酸印跡雜交基本過(guò)程:提取DNA或RNA→酶切→凝膠91核酸印跡雜交基本過(guò)程:(2)制備探針:探針:一段能和待檢測(cè)核酸分子按堿基互補(bǔ)配對(duì)原則而結(jié)合的核酸分子片段。探針需要標(biāo)記可直接檢測(cè)的元素或分子。
如:同位素、熒光、生物素等核酸印跡雜交基本過(guò)程:(2)制備探針:探針:一段能和待檢測(cè)核92核酸印跡雜交基本過(guò)程:核酸印跡雜交可檢測(cè)pg水平的靶分子(4)檢測(cè):方法依標(biāo)記的探針而不同*放射性同位素*生物素*地高辛*熒光素(3)雜交:預(yù)雜交--封閉非特異性結(jié)合位點(diǎn)雜交--探針與核酸分子結(jié)合核酸印跡雜交基本過(guò)程:核酸印跡雜交可檢測(cè)pg水平的靶分子(493核酸印跡雜交基本過(guò)程:核酸印跡雜交基本過(guò)程:942、聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)原理:以待擴(kuò)增DNA為模板,在互補(bǔ)模板兩端序列的寡核苷酸引物介導(dǎo)下,通過(guò)耐高溫DNA聚合酶催化下,按半保留復(fù)制機(jī)制延模板鏈延伸,快速、特異地?cái)U(kuò)增特定的DNA。一種體外模擬自然DNA復(fù)制過(guò)程的核酸擴(kuò)增技術(shù)。(無(wú)細(xì)胞分子克隆技術(shù))。2、聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)原理:以待擴(kuò)增DNA為模板,在互補(bǔ)95耐高溫DNA聚合酶---Taq酶寡核苷酸引物:設(shè)計(jì)引物和確定退火溫度是PCR成功的關(guān)鍵。PCR的基本過(guò)程:(循環(huán)程序)變性(95℃)→退火(55℃-65℃)→延伸(72℃)3~5分40’’~1分100bp/1分源自水棲高溫菌,最適反應(yīng)溫度為72℃,且經(jīng)90℃以上加溫后仍可在溫度恢復(fù)后復(fù)性。耐高溫DNA聚合酶---Taq酶寡核苷酸引物:設(shè)計(jì)引物和確定96(呈2n擴(kuò)增速度)PCR基本過(guò)程和原理特點(diǎn):特異性強(qiáng)靈敏度高樣品可以是:毛發(fā)、血痕單細(xì)胞、病原體、腫瘤殘留物、犯罪現(xiàn)場(chǎng)遺留物(呈2n擴(kuò)增速度)PCR基本過(guò)程和原理特點(diǎn):特異性強(qiáng)97基因診斷中常用的PCR技術(shù):(1)、DNAPCR:(2)、RT-PCR:以DNA為模板,擴(kuò)增特定核苷酸序列。用于檢測(cè)特定基因片段的存在,分析鑒定基因突變。以總RNA或mRNA為模板,逆轉(zhuǎn)錄為cDNA后擴(kuò)增。用于檢測(cè)特定基因表達(dá)水平的主要方法之一。(3)、PCR-SSCP:檢測(cè)基因未知突變的常用技術(shù)。簡(jiǎn)單、快捷、靈敏?;蛟\斷中常用的PCR技術(shù):(1)、DNAPCR:(2)、98(4)、多重PCR:指在一次PCR反應(yīng)中加入多對(duì)引物,同時(shí)擴(kuò)增DNA序列上不同序列片段的一種PCR技術(shù)。用于一些“超大”基因中大片段缺失分析。(5)、原位PCR:直接用組織切片和細(xì)胞進(jìn)行PCR或RT-PCR,在組織、細(xì)胞原位檢測(cè)單拷貝或低拷貝的特點(diǎn)基因序列。(6)、實(shí)時(shí)定量PCR:借助特異性結(jié)合DNA的熒光染料,實(shí)時(shí)動(dòng)態(tài)檢測(cè)PCR擴(kuò)增的DNA量的變化。(4)、多重PCR:指在一次PCR反應(yīng)中加入多對(duì)引物,同時(shí)99其他重要的PCR衍生技術(shù)反向PCR(IPCR)標(biāo)記引物PCR(labelledprimersPCR)錨定PCR(anchoredPCR)差異展示PCR(DD-PCR)(見(jiàn)書(shū)“分子生物學(xué)技術(shù)”章節(jié))其他重要的PCR衍生技術(shù)反向PCR(IPCR)(見(jiàn)書(shū)“分子生1003、限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(RFLP)檢出方法:Southern印跡概念:用同一限制性內(nèi)切酶完全切割同一物種的不同個(gè)體的基因組DNA,出現(xiàn)分子質(zhì)量不同的同源片段,這種由限制性內(nèi)切酶酶切位點(diǎn)變化導(dǎo)致的DNA片段差異,稱限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(RFLP)。人類基因組中由中性突變導(dǎo)致個(gè)體間核苷酸的差異稱--DNA多態(tài)性3、限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(RFLP)檢出方法:Southe101RFLP類型:2、由于鏈內(nèi)發(fā)生較大片段的缺失、重復(fù)、插入和重排導(dǎo)致DNA順序的變化,因而酶切片段改變---序列多態(tài)性。1、單個(gè)堿基的突變引起酶切位點(diǎn)的變化---點(diǎn)多態(tài)性致病基因附近或內(nèi)部一般存在RFLP,可用于連鎖分析的基因診斷。RFLP類型:2、由于鏈內(nèi)發(fā)生較大片段的缺失、重復(fù)、插入和重102(四)擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性(AFLP)應(yīng)用于基因突變性質(zhì)不明的連鎖分析。AFLP--串聯(lián)重復(fù)的短片段的長(zhǎng)度多態(tài)性通過(guò)PCR擴(kuò)增,經(jīng)限制性內(nèi)切酶酶切后電泳,產(chǎn)生顯示擴(kuò)增片段多態(tài)性。(四)擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性(AFLP)應(yīng)用于基因突103AFLP原理:首先利用可產(chǎn)生粘性末端的限制性內(nèi)切酶酶切研究對(duì)象的基因組序列,產(chǎn)生不同長(zhǎng)度的酶切片段。然后,將這些酶切片段與含有與其有共同粘性末段的人工接頭連接,形成模板。為達(dá)到選擇性擴(kuò)增的目的,再在模板末端添加具有選擇性核苷酸(1~3個(gè))的不同引物,然后PCR擴(kuò)增,結(jié)果只有那些兩端序列與選擇性核苷酸配對(duì)的酶切片段被擴(kuò)增。最后將被擴(kuò)增的片段在高分辨率的測(cè)序凝膠上電泳,這樣其多態(tài)性即根據(jù)擴(kuò)增片段的長(zhǎng)度與數(shù)量的不同而被分開(kāi)。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物即等位片段之間差別只有幾個(gè)bp。AFLP原理:首先利用可產(chǎn)生粘性末端的限1045、等位基因特異的寡核苷酸(ASO)方法:1、合成兩種探針:①已知突變位點(diǎn)的核苷酸序列(M)
②正?;驂A基序列(N)2、雜交實(shí)驗(yàn)結(jié)果:M+N-受檢者是突變基因的純合子M-N+受檢者是不存在突變基因M-N-受檢者的缺陷基因可能是一種新的突變類型M+N+受檢者是突變基因的雜合子原理:
已知基因突變部位和性質(zhì),合成基因特異的核苷酸探針(20bp),標(biāo)記后與受檢者DNA雜交診斷。(可與PCR聯(lián)用:PCR-ASO)5、等位基因特異的寡核苷酸(ASO)方法:1、合成兩種探針:1056、單鏈構(gòu)象多態(tài)性(SSCP)日本Orita等研究發(fā)現(xiàn),單鏈DNA片段呈復(fù)雜的空間折疊構(gòu)象,當(dāng)有一個(gè)堿基發(fā)生改變時(shí),會(huì)或多或少地影響其空間構(gòu)象,使構(gòu)象發(fā)生改變,空間構(gòu)象有差異的單鏈DNA分子在聚丙烯酰胺凝膠中受排阻大小不同.因此,通過(guò)非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳(PAGE),可以非常敏銳地將構(gòu)象上有差異的分子分離開(kāi).PCR-SSCP6、單鏈構(gòu)象多態(tài)性(SSCP)日本Orita等研究發(fā)現(xiàn),單鏈106PCR-SSCP基本過(guò)程①PCR擴(kuò)增靶DNA②將特異的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物變性后快速?gòu)?fù)性;③將單鏈DNA進(jìn)行非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳;④通過(guò)放射性自顯影、銀染或溴化乙錠顯色分析結(jié)果.若發(fā)現(xiàn)單鏈DNA帶遷移率與正常對(duì)照的相比發(fā)生改變,就可以判定該鏈構(gòu)象發(fā)生改變,進(jìn)而推斷該DNA片段中有堿基突變.PCR-SSCP基本過(guò)程①PCR擴(kuò)增靶DNA1077、基因芯片將指大量寡核苷酸分子固定于支持物上,然后與標(biāo)記的樣品進(jìn)行雜交,通過(guò)檢測(cè)根據(jù)雜交分子和未雜交分子信號(hào)的強(qiáng)弱進(jìn)而判斷樣品中靶分子的數(shù)量?;驹恚海ㄉ锛赡F?、DNA陣列、或寡核苷酸微芯片)7、基因芯片將指大量寡核苷酸分子固定于支持物上,然108基因芯片技術(shù):基因芯片技術(shù):109目的:檢測(cè)外源性基因的侵入目標(biāo):1、微生物2、病毒如:HIV(致艾滋病AIDS)3、寄生蟲(chóng)、4、不易體外培養(yǎng)的病原體(毒性大腸桿菌、麻風(fēng)分枝桿菌)5、實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)的病原體(克立氏體)四、基因診斷的臨床應(yīng)用:1、在感染性疾病檢測(cè)中應(yīng)用目的:檢測(cè)外源性基因的侵入目標(biāo):1、微生物四、基因診斷的臨110艾滋病與HIV病毒艾滋病由HIV通過(guò)接觸、血液、血制品及母嬰傳播感染所致。HIV特異地侵犯輔助性T細(xì)胞(CD4),引起人體細(xì)胞免疫嚴(yán)重缺陷,導(dǎo)致頑固的機(jī)會(huì)性感染,惡性腫瘤和神經(jīng)系統(tǒng)損傷。HIV感染后,95%感染者5個(gè)月可檢出抗體(也有3-4年仍不能檢出抗體)。有必要進(jìn)行PCR技術(shù)檢測(cè)。艾滋病與HIV病毒艾滋病由HIV通過(guò)接觸、血液、血制品及母嬰111艾滋病與HIV病毒檢測(cè)技術(shù):巢式-PCR、Southern、DNA序列分析引物的設(shè)計(jì):應(yīng)在保守區(qū)(基因:pol,env,gag,tat)病毒特點(diǎn):HIV病毒由兩條單鏈RNA組成,9.7k/RNA,主要基因結(jié)構(gòu)和組成形成與其他逆轉(zhuǎn)錄病毒相同,但較之復(fù)雜,故稱復(fù)雜反轉(zhuǎn)錄病毒HIV屬反轉(zhuǎn)錄病毒---即單鏈RNA反轉(zhuǎn)錄成雙鏈DNA,進(jìn)入宿主細(xì)胞染色體。艾滋病與HIV病毒檢測(cè)技術(shù):巢式-PCR、Southern、112非典型性肺炎(SARS)由一種新型冠狀病毒(SARS-CoV)引起,多種途徑傳播,傳染性強(qiáng)、高致死率的急性疾病。診斷依靠:流行病學(xué)、臨床表現(xiàn)、放射診斷、血清學(xué)(熒光免疫、ELISA)PCR作為一種靈敏的早期病原學(xué)診斷必不可少(關(guān)鍵是引物的合成)非典型性肺炎(SARS)由一種新型冠狀病毒(SARS-CoV1132、在遺傳病檢測(cè)中的應(yīng)用產(chǎn)前診斷檢測(cè)妊娠8-12周的絨毛DNA或羊水細(xì)胞PCR診斷一系列遺傳疾病鐮刀狀細(xì)胞貧血的診斷方法:-RFLP診斷
MstⅡ酶切識(shí)別序列:CCTNAGG切割正常β鏈序列:CCTGAGG不切割突變序列:CCTGTGG
-ASO探針診斷2、在遺傳病檢測(cè)中的應(yīng)用產(chǎn)前診斷鐮刀狀細(xì)胞貧血的診斷1143、在腫瘤檢測(cè)中的應(yīng)用原癌基因生物正常細(xì)胞基因中編碼關(guān)鍵性調(diào)控蛋白的癌基因抑癌基因一類抑制細(xì)胞增殖的基因,其失活可引起細(xì)胞轉(zhuǎn)化。兩類基因協(xié)同調(diào)控,使細(xì)胞生長(zhǎng)處于平衡狀態(tài)。3、在腫瘤檢測(cè)中的應(yīng)用原癌基因抑癌基因兩類基因協(xié)同調(diào)控,使細(xì)115癌基因激活變化及檢測(cè):1、基因擴(kuò)增:即染色體某區(qū)段基因拷貝數(shù)增加,或癌基因的擴(kuò)增。檢測(cè)方法:Southern雜交定量PCR2、基因的過(guò)量表達(dá):包括基因擴(kuò)增基礎(chǔ)上的過(guò)量表達(dá)及非DNA水平的過(guò)量表達(dá)。檢測(cè)方法:Northern雜交RT-PCR3、點(diǎn)突變:檢測(cè)方法為各種基于PCR的方法。癌基因激活變化及檢測(cè):1、基因擴(kuò)增:即染色體某區(qū)段基因拷貝數(shù)116抑癌基因的檢測(cè):SouthernPCR大片段的缺失、和點(diǎn)突變*兩個(gè)等位抑癌基因突變才能引起腫瘤,需檢出兩個(gè)等位抑癌基因。方法:RFLP結(jié)合PCR,進(jìn)行缺失檢測(cè)
點(diǎn)突變主要采用PCR抑癌基因的檢測(cè):SouthernPCR大片段的缺失117腫瘤標(biāo)志物:指特征性存在于惡性腫瘤或由惡性腫瘤細(xì)胞異常產(chǎn)生的物質(zhì)或宿主對(duì)腫瘤反應(yīng)而產(chǎn)生的物質(zhì)。(1)酶類腫瘤標(biāo)志物(2)激素類標(biāo)志物(3)胚胎抗原(4)特殊蛋白標(biāo)志物(5)糖蛋白類抗原(6)血中癌基因蛋白(7)唾液酸和唾液酸?;D(zhuǎn)移酶(8)多胺免疫組化篩選提高檢出率腫瘤標(biāo)志物:指特征性存在于惡性腫瘤或由惡性腫瘤細(xì)(1)酶類腫118法醫(yī)學(xué)鑒定針對(duì)人類DNA遺傳差異進(jìn)行的個(gè)體識(shí)別和親子鑒定。常用技術(shù):DNA指紋分析(VNTR)短串聯(lián)重復(fù)序列(STR)遺傳特征分析PCR-擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性(AmP-FLP)PCR-mtDNA技術(shù)根據(jù)可變串聯(lián)重復(fù)序列(小衛(wèi)星DNA)多態(tài)性
高度的個(gè)體特異性法醫(yī)學(xué)鑒定針對(duì)人類DNA遺傳差異進(jìn)行的個(gè)體識(shí)別和親子鑒定。119DNA指紋(圖譜)分析:⑴、選擇核心序列作探針,選在核心序列上無(wú)切割位點(diǎn)的限制性內(nèi)切酶,酶解樣品,Southernblot得到DNA指紋圖譜。針對(duì)可變串聯(lián)重復(fù)序列(VNTR)(VNTR是判斷個(gè)體的遺傳標(biāo)志)⑵、針對(duì)VNTR側(cè)翼保守區(qū)序列設(shè)計(jì)探針,用PCR對(duì)該區(qū)擴(kuò)增,電泳得到個(gè)體之間長(zhǎng)度不同的條帶圖譜。(VNTR片段較長(zhǎng)PCR不易擴(kuò)增)。DNA指紋(圖譜)分析:⑴、選擇核心序列作探針,選在核心序列120第二節(jié)基因治療(genetherapuy)概念:將外源正?;?qū)氚屑?xì)胞,以糾正或補(bǔ)償因缺陷和異?;蛞鸬募膊。_(dá)到治療目的。導(dǎo)入的基因可以與缺陷基因?qū)?yīng)、在體內(nèi)表達(dá)具有特異功能的同源基因、也可以是與缺陷基因無(wú)關(guān)的治療基因。概念的擴(kuò)展:凡是采用分子生物學(xué)方法原理,將某種遺傳物質(zhì)轉(zhuǎn)移到患者細(xì)胞內(nèi),使其在體內(nèi)發(fā)揮作用,達(dá)到治療目的的方法,都可稱為基因治療。第二節(jié)基因治療(genetherapuy)概念:121基因治療策略:總原則:--直接補(bǔ)替缺陷基因--抑制非正?;虍a(chǎn)物表達(dá)--間接調(diào)節(jié)機(jī)體本身免疫系統(tǒng)的抗病能力。--利用外源基因?qū)Σ∽兗?xì)胞造成特異性殺傷基因治療策略:總原則:--直接補(bǔ)替缺陷基因1221、基因矯正--將致病基因的堿基進(jìn)行糾正,而正常部分予以保留。2、基因置換--用正?;蛲ㄟ^(guò)體內(nèi)基因同源重組,原位置換病變細(xì)胞內(nèi)的致病基因,使細(xì)胞內(nèi)的DNA完全恢復(fù)正常3、基因增補(bǔ)--將目的基因?qū)氩∽兗?xì)胞或其它細(xì)胞,不去除異常基因,而是通過(guò)目的基因的非定點(diǎn)整合,使其表達(dá)產(chǎn)物補(bǔ)償缺陷基因的功能或使原有功能得以加強(qiáng)。4、基因失活--利用反義技術(shù)特異封閉基因表達(dá),抑制有害基因的表達(dá)。5、免疫調(diào)節(jié)--將抗體、抗原或細(xì)胞因子的基因?qū)氩∪梭w內(nèi),改變病人免疫狀態(tài),達(dá)到預(yù)防和治療的目的。基因治療的策略:1、基因矯正--將致病基因的堿基進(jìn)行糾正,而正常部分予以保留1236、調(diào)節(jié)性基因治療:導(dǎo)入編碼調(diào)控蛋白的基因,治療基因表答異常的疾病7、化療保護(hù)性基因治療:導(dǎo)入單相或多相細(xì)胞毒性藥物的抗性基因,使正常細(xì)胞耐受化療藥物的能力大大提高。8、特異性細(xì)胞殺傷性基因治療:利用DNA重組技術(shù)構(gòu)建特異性殺傷靶細(xì)胞為目標(biāo)的“奇異彈頭”,“彈頭”部分是分子重組的各種生物細(xì)胞毒素,它們以酶催化方式發(fā)揮抑制蛋白合成作用,造成細(xì)胞殺傷。9、生殖細(xì)胞基因治療:生殖細(xì)胞或胚胎干細(xì)胞補(bǔ)償性治療6、調(diào)節(jié)性基因治療:導(dǎo)入編碼調(diào)控蛋白的基因,治療7、化療保124基因治療基本程序;方法:1、體外法(exvivo):2、體內(nèi)法(invivo):將受體細(xì)胞在體外培養(yǎng),轉(zhuǎn)入外源基因,經(jīng)適當(dāng)選擇系統(tǒng),將重組的受體細(xì)胞回輸患者體內(nèi),以改善癥狀。(普遍采用)直接將外源基因?qū)塍w內(nèi)有關(guān)的組織器官,使其進(jìn)入相應(yīng)的細(xì)胞并轉(zhuǎn)錄、表達(dá)而發(fā)揮治療作用?;境绦颍哼x擇目的基因選擇基因載體選擇靶細(xì)胞基因轉(zhuǎn)移外源基因表達(dá)及檢測(cè)回輸體內(nèi)基因治療基本程序;方法:1、體外法2、體內(nèi)法將受體細(xì)胞在體外125治療基因的來(lái)源:1、野生型基因:?jiǎn)位蛉毕葸z傳病基因反義核酸封閉活化的原癌基因轉(zhuǎn)入相關(guān)的抑癌基因,抑制腫瘤2、重組DNA和分子克隆技術(shù),人工合成特異基因。1、選擇治療的目的基因治療基因的來(lái)源:1、野生型基因:2、重組DNA和分子克隆技126用于基因治療的基因應(yīng)滿足以下條件:(1)體內(nèi)僅少量表達(dá)就可顯著改善癥狀。(2)該基因的過(guò)量表達(dá)不會(huì)對(duì)機(jī)體造成危害、(3)在抗病毒和抗病原體的基因治療中,所選擇的靶基因應(yīng)在病毒和病原體的生活史中起重要作用,并且該序列是特異的。用于基因治療的基因應(yīng)滿足以下條件:(1)體內(nèi)僅少量表達(dá)就可顯127理想的載體具有以下特征:1、容易生產(chǎn)商業(yè)化生產(chǎn),廣泛應(yīng)用,易運(yùn)輸,易保存2、持續(xù)表達(dá)一旦轉(zhuǎn)入體內(nèi),應(yīng)能在一定時(shí)間內(nèi)持續(xù)表達(dá)基因產(chǎn)物,或能通過(guò)某種方法精細(xì)調(diào)節(jié)其表達(dá)。3、弱免疫源轉(zhuǎn)入后不應(yīng)引起免疫反應(yīng)。4、組織靶向性定向輸入某種細(xì)胞。5、包裝容量載體對(duì)轉(zhuǎn)染基因的大小應(yīng)沒(méi)有限制。6、復(fù)制、分裂和整合能力:特異性定位整合,或以游離基因形式存在于細(xì)胞核內(nèi)。7、能感染分裂期細(xì)胞和未分裂期細(xì)胞2、選擇基因載體:理想的載體具有以下特征:1、容易生產(chǎn)商業(yè)化生產(chǎn),廣泛128基因載體:非病毒載體(裸DNA、脂質(zhì)體)
病毒載體
(反轉(zhuǎn)錄病毒、腺病毒、腺相關(guān)病毒)分類:優(yōu)點(diǎn):大量生產(chǎn),毒性小,低免疫性缺點(diǎn):效率低。優(yōu)點(diǎn):多數(shù)病毒可感染特異細(xì)胞,不易降解,RNA病毒能整合到宿主染色體,表達(dá)水平高等。基因載體:非病毒載體(裸DNA、脂質(zhì)體)病毒載體129病毒介導(dǎo)的基因轉(zhuǎn)移1、逆轉(zhuǎn)錄病毒:正鏈RNA病毒病毒介導(dǎo)的基因轉(zhuǎn)移1、逆轉(zhuǎn)錄病毒:正鏈RNA病毒130逆轉(zhuǎn)錄病毒結(jié)構(gòu):基因組組成:(1)5’-帽子;3’-尾巴;(2)每個(gè)單鏈RNA含6個(gè)區(qū):5’-LTR(長(zhǎng)末端重復(fù)序列)
Ψ+(組裝所需的非編碼序列)gag(編碼衣殼結(jié)構(gòu)蛋白基因)pol(編碼反轉(zhuǎn)錄酶基因)env(編碼外殼蛋白基因)3’-LTR逆轉(zhuǎn)錄病毒結(jié)構(gòu):基因組組成:(1)5’-帽子;3’-尾巴;(131逆轉(zhuǎn)錄病毒生活周期:1、感染靶細(xì)胞2、利用自身編碼的逆反轉(zhuǎn)錄酶,以RNA為模板合成DNA。3、將病毒DNA轉(zhuǎn)運(yùn)至宿主細(xì)胞核4、病毒DNA整合到
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