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文檔簡介
定量PCR技術(shù)原理定量PCR的數(shù)學(xué)原理
定量PCR的化學(xué)原理
儀器的維護(hù)內(nèi)容提要定量PCR的數(shù)學(xué)原理
定量PCR的化學(xué)原理
儀器的維護(hù)內(nèi)容提要平臺期線性增長期基線期指數(shù)增長期平臺期線性增長期基線期指數(shù)增長期PCR動力學(xué)曲線和四個階段線性圖譜對數(shù)圖譜基線閾值CT值[DNA]0基線就是擴(kuò)增曲線的水平部分對數(shù)圖譜線性圖譜什么是基線?默認(rèn)閾值=基線(背景)信號標(biāo)準(zhǔn)偏差x10
什么是閾值?擴(kuò)增產(chǎn)物遵循理論方程:Y=X(1+E)nY=擴(kuò)增產(chǎn)物,X=起始濃度,E=擴(kuò)增效率,n=循環(huán)數(shù)
指數(shù)增長期PCR擴(kuò)增的數(shù)學(xué)模型Ct值lg[起始濃度的]CT=-klgX0+b標(biāo)準(zhǔn)曲線與目標(biāo)序列互補(bǔ)TaqMan---水解型雜交探針
5′端標(biāo)記有報告基團(tuán)(Reporter,R),如FAM、VIC等
3′端標(biāo)記有熒光淬滅基團(tuán)(Quencher,Q)
探針完整,R所發(fā)射的熒光能量被Q基團(tuán)吸收,無熒光,R與Q分開,發(fā)熒光探針法TaqMan作用機(jī)理SYBRGreenI作用機(jī)理染料法SYBRGreenI作用機(jī)理SYBRGreenI作用機(jī)理Tm值:50%DNA變成單鏈時的溫度,此溫度與雙鏈DNA的長度、GC含量有關(guān),可部分代表序列的特異性
PCR過程中,控制溫度緩慢升高,雙鏈DNA解鏈成為單鏈DNA,SYBRGreen被釋放,熒光信號減弱
對熔解曲線求一階導(dǎo)數(shù),峰值代表斜率改變最大值,即Tm.熔解曲線只有染料法才需要做融解曲線,探針法沒必要熔解曲線儀器的日常維護(hù)
每周
檢查計(jì)算機(jī)磁盤空間,歸檔或備份實(shí)驗(yàn)文件關(guān)閉控制計(jì)算機(jī),30秒后再次打開計(jì)算機(jī)電源用不脫毛布塊清潔儀器表面整理計(jì)算機(jī)硬盤驅(qū)動器碎片
每月
執(zhí)行背景校準(zhǔn)
1.5年
執(zhí)行空間校準(zhǔn)執(zhí)行染料校準(zhǔn)儀器的日常維護(hù)-背景校準(zhǔn)操作步驟將背景反應(yīng)板放入儀器中,在軟件界面,依次選擇Instrument
→InstrumentMaintenanceManager
在彈出的新窗口,點(diǎn)擊Background,再選擇StartCalibration
勾選Thebackgroundplateisloadedintotheinstrument,選擇
STARTRUN
,儀器開始進(jìn)行背景校正
數(shù)據(jù)分析,Passed代表通過校準(zhǔn),F(xiàn)ailed代表失敗。點(diǎn)擊“Finish”完成校準(zhǔn)。如果Failed,需要清除污染。儀器的日常維護(hù)-清楚污染操作步驟儀器的日常維護(hù)-空間校準(zhǔn)操作步驟將空間校準(zhǔn)板放入儀器中,在軟件界面,依次選擇Instrument
→InstrumentMaintenanceManager
在彈出的新窗口,點(diǎn)擊Spatial,再選擇StartCalibration
勾選Thebackgroundplateisloadedintotheinstrument,選擇
STARTRUN
,儀器開始進(jìn)行空間校準(zhǔn)
數(shù)據(jù)分析,Passed代表通過校準(zhǔn),F(xiàn)ailed代表失敗。點(diǎn)擊“Finish”完成校準(zhǔn),并進(jìn)行保存儀器的日常維護(hù)-空間校準(zhǔn)儀器的日常維護(hù)-染料校準(zhǔn)儀器的日常維護(hù)-染料校準(zhǔn)儀器的日常維護(hù)-染料校準(zhǔn)儀器的日常維護(hù)-染
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