醫(yī)學(xué)科研與文獻檢索課件

仇曉春2012.10.26醫(yī)學(xué)科研與文獻檢索提綱醫(yī)學(xué)科研與文獻檢索醫(yī)學(xué)信息資源的類型與利用全文型、文摘型、事實(循證)型醫(yī)學(xué)信息資源的評價醫(yī)學(xué)文獻的管理醫(yī)學(xué)科研與文獻的關(guān)系

涉及人體的醫(yī)學(xué)研究必須遵從普遍接受的科學(xué)原則，應(yīng)對科學(xué)文獻和相關(guān)資料全面了解，并有充分的實驗和動物試驗（如有必要）的基礎(chǔ)上進行。

---世界醫(yī)學(xué)協(xié)會赫爾辛基宣言11/30

科學(xué)性：論文的靈魂與生命科學(xué)的態(tài)度、科學(xué)的方法

創(chuàng)造性：衡量和評價論文質(zhì)量的重要標(biāo)準(zhǔn)

實用性：理論聯(lián)系實際，解決疾病防治的實際問題

規(guī)范性：溫哥華格式

可讀性：術(shù)語規(guī)范、表達準(zhǔn)確醫(yī)學(xué)科研論文的基本要求把握科研課題的現(xiàn)狀與動態(tài)，啟發(fā)選題靈感評價課題的創(chuàng)新性、可行性、實用性啟發(fā)和充實自己的研究思路與方法獲得相關(guān)理論依據(jù)收集循證研究原始材料文獻回顧的作用醫(yī)學(xué)文獻檢索與科研選題Lookforclues—unexplainedfindings,controversiesAttendinternationalmeetings

Readtheliterature,includingrelatedfieldsAttendinternationalmeetings全文型數(shù)據(jù)庫(一次文獻)

Elsevier、BMJ、EBSCOhost、Springer、Wiley、BMC、PLoSCHKD、萬方數(shù)據(jù)、維普…文摘型數(shù)據(jù)庫(二次文獻)

Medline(Pubmed)、Embase、Lilacs、SCI

Sinomed、CBA…事實型數(shù)據(jù)庫(三次文獻)Cochrane、ClinicalEvidence、EBMR、Uptodate…常用醫(yī)學(xué)文獻數(shù)據(jù)庫的類型

Pubmed

PubMed是美國國家醫(yī)學(xué)圖書館(NLM)下屬的國家生物技術(shù)信息中心(NCBI)開發(fā)的、基于WWW的醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫查詢系統(tǒng)。網(wǎng)址：.

PubMed基本檢索自由詞檢索renalstone主題詞檢索kidneycalculi布爾邏輯檢索and,or,not字段限制檢索inTi,.Ti著者檢索刊名檢索日期或日期范圍檢索

……截詞檢索renal*強制檢索“singalcell”智能信息資源整合系統(tǒng)

對于自然醫(yī)學(xué)語匯中同義詞、近義詞學(xué)名與俗名的處理例：Cancer，Tumor*Neoplasms(近義詞)GermanMeasles*Rubella(同義詞)VitaminC*AscorbicAcid(學(xué)、俗名)Apoplexy*CerebrovascularDisorders(同義詞)DeoxyribonucleicAcid*DNA(繁、簡稱)非典*嚴(yán)重急性呼吸道綜合癥乙酰水楊酸，阿斯匹林*阿司匹林

MeSH作用1：規(guī)范自由詞MeSH作用2，擴展下位詞（范疇表）等級關(guān)系:Diseases………CNeoplasms…………………C4NeoplasmsbySite(NONMeSH)…………C4.588DigestiveSystemNeoplasms……………C4.588.274GastrointestinalNeoplasms……………C4.588.274.476IntestinalNeoplasms….C4.588.274.476.411ColonicNeoplasms……C4.588.274.476.411.306ColorectalNeoplasms………………C4.588.274.476.411.306.416HereditaryNonpolyposis………….C4.588.274.476.411.306.416.250

C6.240.476按照學(xué)科性質(zhì)，詞義范圍的上下類屬和派生關(guān)系，將字順表中的主題詞分別劃分為15個大類，依次用A-N及Z代表。代表疾病類Diseases腫瘤消化系統(tǒng)疾病Ovarycancer例:卵巢癌放療文獻的主題詞檢索主題詞的轉(zhuǎn)換與副主題詞的選擇MeSH樹形結(jié)構(gòu)表檢索結(jié)果與過濾(Limit)文獻過濾器檢索結(jié)果高級檢索:布爾邏輯運算#22and#18例:環(huán)磷酰胺聯(lián)合放射治療卵巢癌GoPubMGoPubMed統(tǒng)計分析功能具有對所有檢索結(jié)果或單獨對分類類目中的術(shù)語在PubMed中檢索得到的文獻進行的統(tǒng)計分析，包括對檢索到文獻從年代、主題、核心著者、核心期刊、地區(qū)分布可視化地圖。WhatWhoWhereWhenE()Lilacs（）實驗室指南(Protocols)SpringerP是全球最大的經(jīng)同行評議的在線實驗室指南庫，同時它也是全球引用量最高的在線實驗室指南庫。該數(shù)據(jù)庫包含超過18,000條分子生物學(xué)及生物醫(yī)學(xué)的可在線檢索的實驗室指南。SpringerProtocols數(shù)據(jù)庫收集大量原創(chuàng)、可靠、標(biāo)準(zhǔn)化的實驗室指南，擁有165,000余頁的內(nèi)容，可供用戶檢索、閱覽和下載，其杰出的實用性和省時性優(yōu)勢，讓科研人員大大受益。SpringerP內(nèi)容來自以下著名叢書：MethodsinMolecularBiology分子生物學(xué)方法MethodsinMolecularMedicine分子醫(yī)學(xué)方法MethodsinBiotechnology生物技術(shù)方法MethodsinPharmacologyandToxicology藥理學(xué)與毒物學(xué)方法Neuromethods神經(jīng)方法SpringerP

TAYLOR&FRANCISSPRINGERWILEYELSEVIERCABiAnnualReviewsLAWRENCEERLBAUMSIAMNATUREPALGRAVEKargerTHIEMEACS;RSCKLUWERBLACKWELLAIP;APSIOPIEEECSIEEE;ASCE;ASME;PEPAAASSPIEMITCORNELL(EUCLID)ROCKEFELLEROUPPROJECTMUSEBIGFIVEMediumsUniversityPressSocietiesFASEBSWETSOViDEBSCOProQuestDatabases西文全文型數(shù)據(jù)庫：檢索結(jié)果與全文庫的鏈結(jié)IPscells[title]Publisher

FreeUseManuscriptOnlythosewhocanaffordexpensivesubscriptionsorlicenceshaveaccessResult:Authortransferscopyrightorexclusivepublishingrights?傳統(tǒng)期刊的出版模式PublisherEveryonehasaccessAlluseisfairuse

Result:$Authorpayssmallamountofmoneyorrather,institutionpaysonauthor’sbehalfManuscript開放存取期刊的出版模式OAJournalSuccesses:PLoSBiologyfeaturesworksofexceptionalsignificanceinallareasofbiologicalscience,frommoleculestoecosystems,includingworksattheinterfacewithotherdisciplines,suchaschemistry,medicine,andmathematicsPublicLibraryofScienceimpactfactor:14.7網(wǎng)上免費醫(yī)學(xué)全文

BioMedCentral(BMC)中文全文型檢索工具

中國醫(yī)院知識倉庫（CHKD）萬方全文期刊數(shù)據(jù)庫維普全文期刊數(shù)據(jù)庫本位詞檢索：不包括下位詞的檢索主題詞循證醫(yī)學(xué)與醫(yī)學(xué)文獻有益處可能有益處利弊相當(dāng)可能無益處未知有效性可能無效或有害循證文獻按資源內(nèi)容分：Studies、Syntheses、Synopses、SystemsCochrane系統(tǒng)評價：Cochrane系統(tǒng)評價是以某一具體臨床問題（如疾病的治療、診斷）為基礎(chǔ)，系統(tǒng)、全面地收集全世界所有已發(fā)表或未發(fā)表的臨床研究結(jié)果，采用臨床流行病學(xué)嚴(yán)格評價文獻的原則和方法，篩選出符合質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)的文獻，進行定性或定量合成（Meta-analysis），去粗取精，去偽存真，得出綜合可靠的結(jié)論。Cochrane系統(tǒng)評價是對多個同類獨立研究的結(jié)果（采用同一種設(shè)計、針對同一個問題所得到的研究結(jié)果）進行匯總和合并分析，以達到增大樣本含量，減少了各種偏倚和隨機誤差，提高檢驗效能，得出真實可靠的結(jié)論。Cochranelibrary()Cochrane圖書館由六個主數(shù)據(jù)庫組成。

包括：Cochrane系統(tǒng)評價數(shù)據(jù)庫(CDSR)Cochrane療效評價數(shù)據(jù)庫(DARE)Cochrane臨床對照實驗登記數(shù)據(jù)庫(CENTRAL)Cochrane系統(tǒng)評價方法綜述數(shù)據(jù)庫(CDMR)衛(wèi)生技術(shù)評估信息數(shù)據(jù)庫(HTA)英國國家衛(wèi)生服務(wù)系統(tǒng)經(jīng)濟評價數(shù)據(jù)庫。(NHSEED)()CochranelibraryCochranelibrary()UpToDate()DynaMedMDConsult(FirstConsult)電子病歷與循證文獻系統(tǒng)醫(yī)學(xué)文獻資源的評價（SCI、F1000)2004CitedReferences20001998200119932003TimesCitedRelatedRecords200320041999200219942004

Citing從一篇高質(zhì)量的文獻出發(fā)沿著科學(xué)研究的發(fā)展道路……CitedReferences

越查越舊

TimesCited

越查越新RelatedRecords

越查越深2002期刊影響因子期刊影響因子（ImpactFactor,IF）指期刊近兩年的平均被引用率，最早是由美國情報學(xué)家SCI創(chuàng)始人尤金加菲爾德(EugeneGarfield)博士在1972年提出來的。

IF=(C2+C3)/(A2+A3)

以1996年《Science》雜志為例：A2＝1995年出版的文獻數(shù)＝1037（篇），A3＝1994年出版的文獻數(shù)＝1054(篇)，C2＝1995年出版的文獻在1996年被引用的次數(shù)＝24189(次)，C3＝1994年出版的文獻在1996年被引用的次數(shù)＝25170(次)。IF＝23.605(次／篇)。

WebofScience檢索IPsCellsWebofScience檢索

F1000:醫(yī)學(xué)科研中新的學(xué)術(shù)評價指標(biāo)包括兩個數(shù)據(jù)庫，“Facultyof1000Biology”和“Facultyof1000Medicine”F1000B：根據(jù)1400多位專家學(xué)者的建議，提供目前世界上最重要的生物學(xué)論文信息及研究趨勢

F1000M（2006年推出）：由來自全球的（包括美國哈佛大學(xué)和英國劍橋大學(xué)等著名學(xué)府）約2500名頂級醫(yī)學(xué)專家組成顧問團，每日將最近1個月可能改變醫(yī)學(xué)實踐的極少數(shù)優(yōu)秀論文F1000推薦等級與評分:“推薦”:3分，指論文本身專業(yè)性比較強，可能僅對某一學(xué)科或主題感興趣的研究者有用；“必須閱讀”:6分，是對一般讀者均有益的論文“杰