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文檔簡介
癌癥分子解析preMiD技術(shù)在腫瘤早期篩查中的應(yīng)用案例分享總結(jié)主要內(nèi)容目前一頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)惡性腫瘤現(xiàn)狀惡性腫瘤已成為人類的“頭號殺手”。全球每年新發(fā)腫瘤>1400萬人,死亡約820萬人。預(yù)計(jì)2025年,因人口增加和老齡化等因素,每年新增超2000萬病例。“2012年中國腫瘤登記年報(bào)”數(shù)據(jù)表明,中國每年新發(fā)腫瘤約310萬人,死亡270萬人(右上圖)。近60年來癌癥致死率沒有明顯下降(右下圖)。目前二頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)世衛(wèi)組織(WHO):早發(fā)現(xiàn)早診斷早治療“三早”是關(guān)鍵,“早發(fā)現(xiàn)”是根本!
目前還無法攻克癌癥(尤其是中晚期);
癌癥可防、可治:
癌前階段:可實(shí)現(xiàn)近100%預(yù)防
早期癌癥:可以實(shí)現(xiàn)80%治愈率晚期癌癥:僅30%人活過5年。按照平均壽命74歲計(jì)算,人一生中患癌幾率是22%。從年齡看,45歲以后發(fā)病率上升明顯,應(yīng)在40歲開始重視針對腫瘤的專項(xiàng)檢查。2014世界癌癥報(bào)告“抗擊癌癥,重在預(yù)防”目前三頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)癌癥的分子解析目前四頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)ICGC:癌癥基因組學(xué)研究國際癌癥基因組聯(lián)盟(InternationalCancerGenomeConsortium,ICGC)2014年2月4日公布超過1萬個(gè)癌癥基因組的數(shù)據(jù)。
2013年12月5日ICGC宣布:在原來白血病、膀胱癌、胃癌的基礎(chǔ)上,中國又發(fā)起針對腸癌、食道癌、肝癌的驅(qū)動(dòng)基因檢測項(xiàng)目。
“眼下癌癥診治急需新的途徑。如果能更好地從基因組來了解癌癥,那么將更有利于癌癥的預(yù)防和控制。"
——TomHudson安大略癌癥研究所(OICR)所長、ICGC創(chuàng)始人之一目前五頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)致癌突變(oncogenicmutations)到腫瘤形成需要10-20年;期間,涉及多基因的異常發(fā)生,具有早期性和特異性:(早期性:分子異常是癌癥發(fā)生的早期事件;特異性:分子異常是癌癥發(fā)生的特有標(biāo)記)癌變的分子事件AlfredG.Knudson,NatureRev.Cancer,
1,157-162(2001)CarloM.Croce,N.Engl.J.Med.
358,502-511(2008)目前六頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)目前七頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)原癌基因(Proto-oncogene)原癌基因是是細(xì)胞內(nèi)與細(xì)胞增殖相關(guān)的高度保守的基因。原癌基因的結(jié)構(gòu)或調(diào)控區(qū)發(fā)生變異,基因產(chǎn)物增多或活性增強(qiáng)時(shí)(此時(shí)轉(zhuǎn)化為癌基因),使細(xì)胞過度增殖。目前八頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)抑癌基因(TumorSuppressor)抑癌基因一般調(diào)控DNA的修復(fù)和細(xì)胞凋亡。在被激活情況下它們具有抑制細(xì)胞增殖作用。抑癌基因突變能導(dǎo)致活性降低或消失,從而減弱甚至消除抑癌作用。目前九頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)Sanger研究所:Cosmic數(shù)據(jù)庫EmerginglandscapeofoncogenicsignaturesacrosshumancancersNatureGenetics45,1127–1133(2013)腸癌中基因異常發(fā)生率GaoH.etal,CancerRes.,54,4342-4346(1994)MorganC.etal,Br.J.Cancer,89,,1314-1319(2003)目前十頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)
preMiD技術(shù)在腫瘤早期篩查中的應(yīng)用目前十一頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)傳統(tǒng)檢測突變檢測癌癥的“冰山學(xué)說”早期癌癥幾乎沒有癥狀,極其容易被傳統(tǒng)檢測所忽視,一旦檢出,則大部分為中晚期。preMiD超早期防癌檢測,提前約3年預(yù)防發(fā)現(xiàn)潛伏體內(nèi)的癌癥或癌前病變。preMiD?超早期防癌檢測,提前臨床癥狀3-5年預(yù)警!目前十二頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)突變preMiD?技術(shù)檢測的是來自于腫瘤相關(guān)的原癌基因和抑癌基因的異常突變。目前十三頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)基因突變類型如下:目前十四頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)血液循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA)來源NatRevCancer.2011Jun;11(6):426-37ctDNA由癌變細(xì)胞死亡、凋亡或主動(dòng)分泌進(jìn)入循環(huán)系統(tǒng)cfDNA的長度一般為100-500堿基,攜帶有癌癥細(xì)胞內(nèi)部所含異常信息,如突變、copy數(shù)變化、甲基化、融合基因及染色體異常等。血液中含有驅(qū)動(dòng)突變或致癌突變分子,意味身體內(nèi)有癌變細(xì)胞。
“ctDNA是最有希望發(fā)現(xiàn)早期癌癥”
——美國約翰霍普金斯大學(xué)LuisDiaz博士Free-floatingDNAfromtumorcouldprovideearlywarning!——USAtoday目前十五頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)分子癌變階段(8-10年)細(xì)胞癌變階段(3-5年)細(xì)胞簇形成組織形成早癌(1-3年)中晚期癌(?)1.不死2.無限增殖3.表型正常1.逃避免疫監(jiān)視2.形成新血管3.異性增生常規(guī)手段可以檢測preMiD可以目前十六頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)血漿突變檢測技術(shù)-preMiD挑戰(zhàn)血漿游離DNA含量極低突變DNA占比低于0.1%血漿成分復(fù)雜某些屏障存在………………應(yīng)對preMiD檢測基于PCR,擴(kuò)增DNA融合Blocker、偏向擴(kuò)增及熔點(diǎn)分析,極大提高靈敏度納米技術(shù)提高核酸萃取效率新技術(shù)平臺的融入目前十七頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)preMiD?
=Blocker+ASA+MCA突變偏向擴(kuò)增系統(tǒng)(ASA)PCR引物的3'端位必須和突變擴(kuò)增子匹配,而野生不匹配采用特異探針,實(shí)時(shí)PCR反應(yīng)熔解曲線分析(MeltingCurveAnalysis)熒光vs溫度作圖得到DNA熔解曲線DNA溶解曲線是DNA序列的“指紋”核酸blocker阻滯野生擴(kuò)增設(shè)計(jì)野生匹配blocker(含PNA修飾)阻滯對野生片段擴(kuò)增三種已有技術(shù)的有機(jī)結(jié)合成preMiD,靈敏度達(dá)到0.01%,特異性近100%。目前十八頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)美國斯坦福癌癥研究院近30年調(diào)查研究發(fā)現(xiàn):癌前階段,癌癥是可逆性“工程”。消除突變,抑制癌變目前十九頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)正常DNADNA突變(腫瘤驅(qū)動(dòng)基因)DNA修復(fù)抑癌基因誘導(dǎo)凋亡免疫監(jiān)視失敗癌
干預(yù)(突變逆轉(zhuǎn))目前二十頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)早發(fā)現(xiàn)與早預(yù)防突變篩查免疫力遠(yuǎn)離致癌物干預(yù)目前二十一頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)突變定量分析1.對于有基因突變的受檢者,同時(shí)加做突變定量值,便于后期干預(yù)有效性的對比;2.隨著樣本量的增加,跟蹤后續(xù)發(fā)展變化,將給出突變風(fēng)險(xiǎn)提示。突變值目前二十二頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)QRAM-qPCR相對定量檢測腫瘤特異突變位點(diǎn)在血漿中含量在干預(yù)前后的變化,判斷效果。干預(yù)有效性判斷
主要用途:
1.直觀反應(yīng)干預(yù)或治療方案的有效性,避免無效治療。 2.評估手術(shù)后患者基本狀態(tài),如體內(nèi)有無殘留或轉(zhuǎn)移。 3.判斷有無復(fù)發(fā)。目前二十三頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)目前二十四頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)目前二十五頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)目前二十六頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)目前二十七頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)目前二十八頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)preMiD專業(yè)性
preMiD?德國標(biāo)準(zhǔn)生產(chǎn)質(zhì)控體系國際公認(rèn)檢測內(nèi)容COSMIC數(shù)據(jù)庫,包含突變基因及位點(diǎn)信息,屬于國際最權(quán)威機(jī)構(gòu)最新研究成果。國家批準(zhǔn)專有檢測試劑美國Roche檢測儀器注冊號:(進(jìn))字2009第3402689號目前二十九頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)preMiD?血漿突變技術(shù)驗(yàn)證:
NSCLC組織和血漿中EGFR突變一致性研究試驗(yàn)單位:北京協(xié)和醫(yī)院、浙江大學(xué)附屬第一醫(yī)院、江蘇省腫瘤醫(yī)院、青島大學(xué)附屬醫(yī)院
Sanger測序1212例非小細(xì)胞肺癌患者腫瘤組織EGFR突變;
preMiD?法檢測對應(yīng)1212例血漿EGFR突變??傮w結(jié)果:陽性符合率為80.49%,陰性符合率為94.66%,總符合率為90.35%
(唯一完成臨床試驗(yàn)研究,血漿-組織突變一致性最高的結(jié)果)(已完成CFDA批準(zhǔn)臨床實(shí)驗(yàn),2011年12月28號-2013年12月28號)目前三十頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)中國唯一入選國際腫瘤學(xué)術(shù)大會ASCO會議的主講報(bào)告目前三十一頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)中國醫(yī)師協(xié)會preMiD項(xiàng)目專家論證會目前三十二頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)ctDNA在國際上的應(yīng)用NDRG4,BMP3NDRG4,BMP3,KRAS總靈敏度:92%sensitivity早期腸癌靈敏度:94%特異性:87%ColonGuard(EXACT)目前三十三頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)ColonVantage(QUEST)ColoVantage檢測血漿中SEPTIN9的甲基化狀態(tài),達(dá)到檢測和預(yù)警結(jié)直腸癌的目的。ColoVantage是一種無創(chuàng)的檢測方法靈敏度達(dá)到70%特異性達(dá)到89%適用于各個(gè)分期的結(jié)直腸癌目前三十四頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)ctDNA在甲狀腺癌檢測中的應(yīng)用基因檢測對甲狀腺腫瘤診斷的準(zhǔn)確率在80%以上突變檢測能夠應(yīng)對病理檢測不能確定的情況NikiforovYEetal,JClinEndocrinolMetab.2011Nov;96(11):3390-7目前三十五頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)案例分享目前三十六頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)preMiD檢測:FLT3突變案例一:FLT3基因突變,2年半后診斷大腸癌中晚期個(gè)人不相信,不愿面對,沒有采取必要干預(yù)措施目前三十七頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)案例二:KRAS突變檢測者:男性,35歲,重慶人家族史:其父患肺癌進(jìn)行preMiD檢測:KRAS基因突變目前三十八頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)KRAS突變報(bào)告解讀:結(jié)合健康問卷及專家咨詢其父患肺癌作息紊亂干咳、胸悶近期沒有體檢資料結(jié)合該情況給出建議:進(jìn)行胸部增強(qiáng)CT檢查,判斷突變在哪個(gè)階段(臨床前期或臨床階段)目前三十九頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)KRAS突變2014年5月8日右肺下葉斜裂旁小結(jié)節(jié)影肝左葉多發(fā)小囊腫目前四十頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)KRAS突變—干預(yù)方案匹多莫德口服液服用方法:1支(10ml)/次,2次/日(早晚空腹服用)3個(gè)月為一周期目前四十一頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)KRAS突變--跟蹤隨訪2014年9月9日胸部CT增強(qiáng)未發(fā)現(xiàn)腫瘤目前四十二頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)干預(yù)后4個(gè)月進(jìn)行突變復(fù)查及突變定量分析:復(fù)查結(jié)果,基因仍有突變,并對再次突變情況進(jìn)行與第一次的定量值分析,突變較之前下降。KRAS突變--復(fù)查及定量目前四十三頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)案例三:THR-α基因突變檢測者:男性,41歲,南京人進(jìn)行preMiD檢測:THR-α基因突變目前四十四頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)THR-α基因突變報(bào)告解讀:結(jié)合健康專家咨詢作息紊亂20年吸煙史,每日1包近期沒有體檢資料目前四十五頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)THR-α基因突變右頸部、頜下多發(fā)小淋巴結(jié),部分淋巴結(jié)FDG代謝增高;甲狀腺瘤可能目前四十六頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)THR-α基因突變--干預(yù)方案胸腺肽a1方法:1支(1.6mg)/次,1次/周,皮下注射3個(gè)月為一周期目前四十七頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)干預(yù)后3個(gè)月進(jìn)行突變復(fù)查及突變定量分析:復(fù)查結(jié)果:突變消失。THR-α基因突變--干預(yù)方案目前四十八頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)病理:肺腺癌案例四:EGFR突變確診6mm早癌檢測者男性,62歲,無錫人士,某醫(yī)院院長,體檢發(fā)現(xiàn)肺內(nèi)有6mm孤立影,不能確定其性質(zhì),經(jīng)preMiD?檢測發(fā)現(xiàn)EGFR突變。該檢測者在上海肺科醫(yī)院行胸腔鏡手術(shù),取出病理為肺腺癌。目前四十九頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)案例五:FHIT突變確診胃癌晚期檢測者男性,62歲,機(jī)關(guān)干部,既往慢性胃病史,平時(shí)喜食蒜泥等刺激食物。經(jīng)preMiD?檢測:FHIT突變,后追加蛋白標(biāo)志物FMD1值異常升高。建議進(jìn)一步胃鏡檢查,結(jié)果為低分化腺癌晚期,對化療均不敏感。病理:低分化腺癌目前五十頁\總數(shù)五十五頁\編于十八點(diǎn)案例六:宮頸癌復(fù)發(fā)監(jiān)控案例檢測者女性,29歲,2012年12月確診宮頸癌,術(shù)后、放、化療后。2013
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