人體正常菌群與常見致病菌

人體正常菌群與常見致病菌首都醫(yī)科大學(xué)宣武醫(yī)院檢驗(yàn)科閔嶸編輯ppt一、人體正常菌群編輯ppt

(一）正常菌群

1.概念：

寄居在正常人體開放性部位的微生物群，正常時(shí)對人體有益無害，并與宿主保持動態(tài)平衡的生態(tài)體系與外界接觸和相通的腔道---體表、口腔、鼻咽、眼結(jié)膜、腸道、泌尿生殖道等編輯ppt2.分布：

凡與外界接觸和相通的部位均有其寄居，尤以腸道、口腔、陰道和皮膚量最多，稱為四大“菌庫”。編輯ppt3.特點(diǎn)：①不同組織部位其種類不同②同一部位不同層次其種類不同

A.深層——原籍菌（常住菌）是有益的

如：結(jié)腸中的大腸桿菌、雙歧桿菌

B.表層——外籍菌（暫住菌）可能是

有害的

如：大腸埃希菌侵入到泌尿道、膽道、腹腔及血液中，會引起化膿性炎癥或敗血癥編輯ppt結(jié)腸腔內(nèi)正常菌群（電鏡掃描圖）編輯ppt4.生理作用：

①生物拮抗(antagonism)

②營養(yǎng)作用

③免疫作用

④抗衰老作用

⑤抑癌作用編輯ppt①生物拮抗(antagonism)

生物拮抗機(jī)制A.競爭黏附（占位性保護(hù)）作用競爭上皮細(xì)胞表面受體，形成生物膜，使外來菌不能定植而入侵機(jī)體，發(fā)揮屏障和占位性保護(hù)作用B.產(chǎn)生有害代謝產(chǎn)物：酸類、H2O2

C.競爭營養(yǎng)物質(zhì)通過競爭營養(yǎng)，大量繁殖，處于優(yōu)勢地位編輯ppt②營養(yǎng)作用正常菌群參與機(jī)體的物質(zhì)代謝、營養(yǎng)物質(zhì)轉(zhuǎn)化及合成如：氮的利用糖代謝維生素的合成編輯ppt③免疫作用正常菌群作為抗原：腸道菌群會刺激人體腸道免疫系統(tǒng)的發(fā)育，并且不斷“訓(xùn)練”它，讓它增加“分辨敵我”的能力。正常菌群釋放的內(nèi)毒素等物質(zhì)可刺激機(jī)體免疫系統(tǒng)保持活躍狀態(tài)，是機(jī)體非特異免疫功能的重要組成部分。——促進(jìn)機(jī)體免疫器官發(fā)育——刺激免疫系統(tǒng)產(chǎn)生免疫應(yīng)答，產(chǎn)生免疫效應(yīng)物質(zhì)編輯ppt④抗衰老作用科學(xué)家通過對30位長壽老人的取樣分析發(fā)現(xiàn)，這些老人體內(nèi)的厭氧菌群所占的比例特別大，尤其是厭氧菌群中的雙歧桿菌遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于一般人體內(nèi)雙歧桿菌的含量。有人將體內(nèi)雙歧桿菌的數(shù)量作為健康長壽的標(biāo)志之一。通過產(chǎn)生SOD，清除O2-，保護(hù)組織細(xì)胞如：雙歧桿菌、乳桿菌、腸球菌等編輯ppt⑤抑癌作用——自身產(chǎn)生的多種酶類，使致癌物轉(zhuǎn)化為無害物質(zhì)——激活巨噬細(xì)胞等發(fā)揮免疫功能，抑制腫瘤編輯ppt5.影響正常菌群組成的因素飲食結(jié)構(gòu)年齡環(huán)境（衛(wèi)生條件）藥物（抗菌藥物）疾病（消化道疾?。夂钌盍?xí)慣精神狀態(tài)編輯ppt飲食結(jié)構(gòu)的影響飲食結(jié)構(gòu)是決定腸道菌群組成的最重要的因素。多食蛋白質(zhì)的人，大腸埃希氏菌生長旺盛；以吃淀粉為主的人，乳桿菌較多。吃什么飯，養(yǎng)什么菌。動物實(shí)驗(yàn)表明：長期食用大量高脂飼料，動物腸道中的有益菌如雙歧桿菌數(shù)量會下降，一些病菌如硫酸鹽還原菌的數(shù)量會增加。編輯ppt飲食結(jié)構(gòu)的影響新幾內(nèi)亞人食物的96.4％是白薯，他們的腸道中有固氮菌，且是腸道菌群的恒定成員。使得足夠的氮素被固定下來，通過腸壁進(jìn)入血液。因此，新幾內(nèi)亞人就能依賴營養(yǎng)成分不全的食物為生。日本人的大腸里存在消化海藻的細(xì)菌。原因日本人日常飲食中每天要攝入一定量的海藻。這使得腸道細(xì)菌具有了消化海藻的能力。編輯ppt年齡的影響新生兒出生時(shí)，腸道是無菌的。出生2小時(shí)內(nèi)，在胎便內(nèi)就可找到雙歧桿菌，約4天后成為優(yōu)勢菌。中年，有益菌雙歧桿菌與有害菌在正常情況下保持一個(gè)衡定水平。老年，腸道中雙歧桿菌明顯減少，有害菌梭狀芽孢桿菌相對增加。編輯ppt肥胖癥也和腸道細(xì)菌有關(guān)

在“人體腸道菌群元基因組研究”選中的124個(gè)樣品提供者中，就有患有腸炎和肥胖癥的病人。通過第一階段的研究，已經(jīng)發(fā)現(xiàn)病人腸道菌群的基因組成和正常人有很大不同2009年《自然》題為“導(dǎo)致肥胖的細(xì)菌群”的論文：研究者從肥胖的老鼠體內(nèi)取出其腸內(nèi)細(xì)菌群，然后移植到瘦小的無菌老鼠體內(nèi)。結(jié)果，在生活和飲食維持原狀的情況下，無菌老鼠居然也發(fā)福了。編輯ppt腸道細(xì)菌與代謝綜合征研究發(fā)現(xiàn)，缺乏先天性免疫因子TLR5的突變小鼠會產(chǎn)生代謝綜合癥的標(biāo)志性特征，如伴有腸道微生物系變化的脂肪積聚的增加及胰島素抵抗。這些突變的小鼠還會比它們的對應(yīng)正常小鼠進(jìn)食更多的食物。將這些突變小鼠的腸道內(nèi)微生物轉(zhuǎn)移到無菌小鼠的腸道之中，則無菌小鼠出現(xiàn)代謝綜合征的特征，這提示：腸道微生物系的變化可能是代謝綜合癥的一個(gè)原因，而不是其后果編輯ppt編輯ppt（三）人體各部位的正常菌群編輯ppt編輯ppt正常菌群在人體中的分布部位常見菌皮膚表皮葡萄球菌、類白喉?xiàng)U菌、綠膿桿菌、痤瘡丙酸桿菌、白色念珠菌、粉刺棒狀桿菌、白色葡萄球菌等口腔表皮葡萄球菌、甲型和丙型鏈球菌、類桿菌、梭桿菌等鼻咽腔甲型鏈球菌、卡他球菌、肺炎球菌、流感桿菌、乙型鏈球菌、葡萄球菌、綠膿桿菌、大腸桿菌、變形桿菌等眼結(jié)膜皮表葡萄球菌、結(jié)膜干燥桿菌、類白喉?xiàng)U菌等胃正常一般無菌腸道類桿菌、雙歧桿菌、大腸桿菌、厭氧性鏈球菌、糞鏈球菌、葡萄球菌、白色念球菌、乳酸桿菌、變形桿菌、破傷風(fēng)桿菌、產(chǎn)氣莢膜桿菌等陰道乳酸桿菌、白色念球菌、類白喉?xiàng)U菌、大腸桿菌等尿道表皮葡萄球菌、類白喉?xiàng)U菌、恥垢桿菌等編輯ppt1、皮膚皮膚上的細(xì)菌以汗液、皮脂、角質(zhì)(皮屑)為營養(yǎng)來源，容易在潮濕的部位滋生。另外皮膚面積大，暴露在外，正常菌群數(shù)量多。《科學(xué)》（2009年5月29日）一項(xiàng)研究表明：采集了l0名研究對象全身20處不同部位皮膚上的細(xì)菌樣本，對細(xì)菌種類和數(shù)量進(jìn)行調(diào)查。細(xì)菌種類最多的部位是手腕(44種)，最少的部位是耳后(15種)。編輯ppt（1）皮膚的正常菌群來源

羊膜破水后、生產(chǎn)中產(chǎn)道菌群生產(chǎn)后皮膚接觸外環(huán)境編輯ppt（2）皮膚的正常菌群種類

[1]凝固酶陰性葡萄球菌表皮葡萄球菌頭狀葡萄球菌瓦氏葡萄球菌溶血性葡萄球菌耳葡萄球菌中間葡萄球菌模仿葡萄球菌編輯ppt[2]滕黃微球菌：多見于婦女、兒童；[3]不動桿菌屬：25%皮膚帶有該菌，多見于腳趾間、腋窩、腹股溝、肘前窩；[4]其它革蘭氏陰性菌：包括變形桿菌、綠膿桿菌、克雷伯氏菌、腸桿菌，較少見。[5]丙酸桿菌：性成熟后1-3年數(shù)量逐漸增加編輯ppt皮膚，表面正常棲居的微生物對外來微生物具有排斥作用，可以防止外來微生物和病原微生物的侵染，有保護(hù)作用痤瘡丙酸桿菌、粉刺棒狀桿菌、白色葡萄球菌暫居在皮脂腺分泌較活躍的皮膚上，給步入青春期的男女面部和胸背部留下痤瘡。編輯ppt內(nèi)分泌失調(diào)→皮脂腺分泌旺盛→油脂過多→毛孔粗大/堵塞→角質(zhì)層增厚→細(xì)菌在毛孔里和油脂攪和在一起→痤瘡丙酸桿菌在缺氧情況下大量繁殖→導(dǎo)致炎癥細(xì)菌侵入，整個(gè)毛囊變紅、發(fā)炎→細(xì)菌擴(kuò)散到附近的皮膚組織，變得更大，進(jìn)而形成痤瘡。痤瘡丙酸桿菌：專性厭氧菌編輯ppt編輯ppt(3)表皮的正常菌群對檢驗(yàn)結(jié)果的干擾血培養(yǎng)

凝固酶陰性葡萄球菌檢出率在血培養(yǎng)陽性結(jié)果中占第一位采血前皮膚充分消毒和多套血培養(yǎng)采集可排除部分污染干擾體表傷口分泌物或膿液培養(yǎng)

送檢膿腫表面標(biāo)本會培養(yǎng)出非感染性的定植細(xì)菌。應(yīng)盡量采集傷口深部分泌物，用拭子深入損傷部位并旋轉(zhuǎn)抹取膿腫壁，損傷基底部和膿腫壁最有培養(yǎng)價(jià)值。編輯ppt

2、呼吸道正常菌群人出生大致12—15h后，鼻、咽、喉部（即上呼吸道）出現(xiàn)正常菌群。先是需氧菌如表皮葡萄球菌和金黃色葡萄球菌、鏈球菌和漢森氏球菌、韋榮球菌、嗜血桿菌等，繼而也出現(xiàn)厭氧菌如普氏桿菌、卟啉單胞菌和韋榮球菌。（1）來源：正常呼吸過程中定植于上呼吸道（2）種類：細(xì)菌、真菌鼻咽腔—短暫定植，不能長期共生主要細(xì)菌種類：葡萄球菌甲、丙型鏈球菌肺炎鏈球菌奈瑟氏菌流感嗜血桿菌編輯ppt（3）對檢驗(yàn)結(jié)果的影響口腔正常菌群對痰培養(yǎng)標(biāo)本的污染培養(yǎng)結(jié)果干擾醫(yī)生對病情的判斷編輯ppt3、消化道正常菌群出生后口腔即有細(xì)菌定植6-10小時(shí)后細(xì)菌數(shù)量快速增加(1)口腔—表皮葡萄球菌;甲、丙型鏈球菌;肺炎鏈球菌;奈瑟氏菌;流感嗜血桿菌;類白喉?xiàng)U菌;螺旋體;白色念珠菌;放線菌。(2)食管—研究較少,不能確定短暫定植或微生態(tài)。常見有嗜鹽菌如葡萄球菌。編輯ppt(3)胃-胃酸pH1.8~2.5,細(xì)菌通常極少(<103CFU/ml)。由于胃內(nèi)酸度高、含大量消化酶,不適合細(xì)菌生長,胃內(nèi)菌量很少,<1000個(gè),主要是需氧抗酸的革蘭陽性菌,如鏈球菌、葡萄球菌、乳酸桿菌和念珠菌,另外還有幽門螺桿菌；編輯ppt(4)腸道-菌群組成差異較大。人體中共生菌最多的部位是大腸。以厭氧菌為主(人的糞便中，約有60%的干重是細(xì)菌。）①空腸:含大量消化酶、蠕動強(qiáng)烈、腸液流量大,足以將細(xì)菌在繁殖前沖洗到遠(yuǎn)端回腸和結(jié)腸，細(xì)菌數(shù)量約105個(gè),仍以革蘭陽性需氧菌為主；②回腸:在遠(yuǎn)端回腸，腸液流量少、蠕動減慢，細(xì)菌數(shù)逐漸增加，G-菌開始超過G+菌,總數(shù)103-107個(gè),以厭氧菌為主,如乳酸桿菌、類桿菌、大腸桿菌等；③結(jié)腸:結(jié)腸內(nèi)菌量多達(dá)1011-1012個(gè),厭氧菌占絕對優(yōu)勢,>98％,菌種達(dá)400多種,主要菌種為類桿菌、乳酸桿菌、雙歧桿菌及厭氧的G+球菌,糞便重量的40%由細(xì)菌組成。編輯ppt正常菌群和防止人體過敏有關(guān)，經(jīng)過腸道菌群合理“訓(xùn)練”的人體免疫系統(tǒng)不易讓人“過敏”。瑞典50%的人患有過敏癥；而離瑞典不遠(yuǎn)的愛沙尼亞卻只有10%的人患有過敏癥，原因是腸道內(nèi)正常菌群構(gòu)成不同。后者的社會經(jīng)濟(jì)發(fā)達(dá)程度遠(yuǎn)不如前者。這或許說明衛(wèi)生條件（太好）和過敏癥有關(guān)。不干不凈，吃了沒??？編輯ppt4、陰道正常菌群

女性生殖器從幼稚到成熟過程中就有微生物棲居和定植，大致上包括產(chǎn)黑色素類桿菌、卟啉單胞菌、普氏桿菌、類桿菌、乳桿菌、金黃色葡萄球菌、鏈球菌等十幾種細(xì)菌為正常菌群。乳桿菌大腸埃希氏菌擬桿菌屬腸球菌屬奈瑟氏菌屬厭氧球菌編輯ppt

5、前尿道正常菌群表皮葡萄球菌JK群棒狀桿菌腸球菌奈瑟菌編輯ppt二.不同系統(tǒng)的常見致病菌編輯ppt（一）呼吸系統(tǒng)常見病原菌編輯ppt常見呼吸道重要致病菌鏈球菌苛養(yǎng)革蘭陰性菌革蘭陰性雙球菌革蘭陰性桿菌葡萄球菌革蘭陽性桿菌編輯ppt鏈球菌Beta-溶血、觸酶陰性呈鏈狀或成對排列的球菌化膿鏈球菌（PYR+）任何數(shù)量都要報(bào)告患兒標(biāo)本檢查有小溶血環(huán)并鑒定B群-溶血鏈球菌，任何數(shù)量都要報(bào)告優(yōu)勢菌時(shí)，有意義數(shù)量的Beta-溶血鏈球菌不要報(bào)告小菌落的beta-溶血鏈球菌或F群鏈球菌，因?yàn)檫@些菌是上呼吸道正常菌群編輯ppt鏈球菌Alpha-溶血鏈球菌Optochin敏感實(shí)驗(yàn)?zāi)懼芫鷮?shí)驗(yàn)（聯(lián)合上述兩個(gè)實(shí)驗(yàn)進(jìn)行鑒定）藥敏實(shí)驗(yàn)，貼OP紙片確認(rèn)純度以檢查藥敏結(jié)果是否有污染編輯ppt苛養(yǎng)革蘭陰性桿菌流感嗜血桿菌，衛(wèi)星現(xiàn)象，ALA實(shí)驗(yàn)確認(rèn)鑒定并作beta-內(nèi)酰胺酶試驗(yàn)。百日咳博德特菌觸酶和尿素酶陽性，培養(yǎng)48h出現(xiàn)肉眼可見菌落巴斯德菌吲哚和氧化酶陽性，動物口腔正常菌群侵蝕艾肯菌上呼吸道正常菌群，無需鑒定編輯ppt革蘭陰性雙球菌卡他莫拉菌

G-雙球菌，氧化酶陽性，血平板上可推動，丁酸鹽試驗(yàn)陽性淋病奈瑟菌和腦膜炎奈瑟菌？

需檢驗(yàn)并報(bào)告，不需做藥敏試驗(yàn)當(dāng)培養(yǎng)達(dá)到有意義數(shù)量時(shí)，即使不是優(yōu)勢菌，也報(bào)告編輯ppt在麥康凱或伊紅美蘭平板生長良好的革蘭陰性桿菌革蘭陰性桿菌鑒定和藥敏試驗(yàn)對于住院患者，不管是否有其他病原菌，檢查有意義數(shù)量的銅綠假單胞菌、不動桿菌、伯克霍爾德菌和嗜麥芽菌編輯ppt腸球菌不要報(bào)告腸球菌，除非達(dá)到90%純培養(yǎng)很多革蘭陽性球菌都是呼吸道正常菌群編輯ppt革蘭陽性桿菌排除任何數(shù)量來自免疫抑制患者的奴卡菌和馬紅球菌（粘液樣并尿素酶陽性）

馬、豬等動物致病菌，可條件致病，可以導(dǎo)致免疫抑制患者的肺炎大芽孢革蘭陽性菌，則需排除炭疽芽孢桿菌和臘樣芽孢桿菌快速尿素酶陽性（假白喉棒狀桿菌），或標(biāo)本來自ICU插管患者時(shí)，鑒定大量優(yōu)勢的棒狀桿菌其他革蘭陽性桿菌不會引起肺炎，無需鑒定編輯ppt霉菌念珠菌不能引起肺炎，除非腫瘤患者、肺移植患者或新生兒。酵母菌是口腔正常菌群。編輯ppt如果涂片時(shí)見到細(xì)菌但培養(yǎng)不生長，擴(kuò)大培養(yǎng)，可能存在軍團(tuán)菌、百日咳博德特菌和分枝桿菌。編輯ppt局限性常規(guī)培養(yǎng)方法不生長假陰性培養(yǎng)可能由正常菌群污染或事先使用了抗生素假陽性結(jié)果可能會對培養(yǎng)結(jié)果過度解釋編輯ppt（二）泌尿系統(tǒng)常見的病原菌編輯ppt表１尿路感染的原因及常見病原菌

感染原因

主要致病菌 感染特點(diǎn)

上行感染大腸埃希菌、克雷伯菌、變形桿菌、淋病奈瑟菌主要為腸道菌群或會陰部細(xì)菌逆行感染，多見于女性，多為單一細(xì)菌感染，以大腸埃希菌感染最常見泌尿系統(tǒng)解剖結(jié)構(gòu)和生理功能改變引起的感染大腸埃希菌、克雷伯菌、變形桿菌、腸桿菌、普羅威登菌、沙雷菌、不動桿菌、假單胞菌、葡萄球菌、腸球菌多見于留置導(dǎo)尿管、腎盂造瘺術(shù)、尿路結(jié)石、尿路重建、前列腺肥大、膀胱排空能力受損的患者，容易發(fā)生多種微生物的混合感染，易被誤認(rèn)為標(biāo)本污染發(fā)生于菌血癥的患者，血液中的細(xì)菌通過血流進(jìn)入腎臟引起感染，比較少見血行感染葡萄球菌、結(jié)核分枝桿菌、沙門菌直接感染大腸埃希菌、葡萄球菌、鏈球菌、腸桿菌外傷或腎周圍器官發(fā)生感染時(shí)，細(xì)菌直接侵入腎臟引起感染，非常少見編輯ppt表２不同方法采集的尿標(biāo)本培養(yǎng)結(jié)果評價(jià)

標(biāo)本來源

菌落數(shù)CFU/ml 結(jié)果評價(jià)

清潔中段尿＜5×104無意義，僅報(bào)告菌落數(shù)及革蘭染色特征，并注明是純培養(yǎng)或是混合菌生長純培養(yǎng)有意義，報(bào)告菌落計(jì)數(shù)和菌種鑒定及藥敏試驗(yàn)結(jié)果；混合菌生長無意義，僅做革蘭染色鏡檢，并報(bào)告鏡檢結(jié)果(5～10)×104純培養(yǎng)或混合菌生長，其中某種細(xì)菌數(shù)≥105者有意義，需進(jìn)行細(xì)菌鑒定及藥敏試驗(yàn)；4種及以上細(xì)菌生長無意義，報(bào)告標(biāo)本污染＞1053種以內(nèi)細(xì)菌生長都有意義，對2種主要生長菌需進(jìn)行菌種鑒定及藥敏試驗(yàn)；4種及以上細(xì)菌生長無意義，報(bào)告標(biāo)本污染＞103導(dǎo)尿都有意義，所有細(xì)菌均需做菌種鑒定及藥敏試驗(yàn)任意數(shù)目恥骨上膀胱穿刺編輯ppt（三）消化系統(tǒng)常見的病原菌編輯ppt1.感染性腹瀉的主要病原體種類種類 主要病原體 所致疾病細(xì)菌 弧菌屬 O1群和O139群霍亂弧菌 霍亂 其他致瀉性弧菌（如其他非O1群霍亂弧菌，副溶血性弧菌 弧菌性腸炎 擬態(tài)弧菌，河弧菌，霍利斯弧菌，弗尼斯弧菌等） 志賀菌屬 痢疾志賀菌，福氏志賀菌，鮑氏志賀菌，宋內(nèi)志賀菌 細(xì)菌性痢疾 沙門菌屬 鼠傷寒沙門菌，腸炎沙門菌，豬霍亂沙門菌等 沙門菌腸炎 埃希菌屬(如大腸埃希菌，即大腸桿菌) 腸產(chǎn)毒性大腸桿菌(ETEC) 旅行者腹瀉，嬰幼兒腹瀉 腸侵襲性大腸桿菌(EIEC) 痢疾樣腹瀉 腸致病性大腸桿菌(EPEC) 嬰兒腹瀉 腸出血性大腸桿菌(EHEC) 出血性腸炎 彎曲菌屬(如空腸彎曲菌，結(jié)腸彎曲菌等) 彎曲菌腸炎 葡萄球菌屬(如金黃色葡萄球菌) 急性胃腸炎、假膜炎腸炎 厭氧芽孢梭菌屬(如產(chǎn)氣莢膜梭菌，艱難梭菌等) 腹瀉、偽膜性腸炎等 耶爾森菌屬(如小腸結(jié)腸炎耶氏桿菌等) 小腸結(jié)腸炎 芽孢桿菌屬(如蠟樣芽孢桿菌等) 感染性腹瀉 其他菌屬(如變形桿菌，土拉弗氏菌，親水氣單胞菌 感染性腹瀉 類志賀毗鄰單胞菌等)病毒 輪狀病毒，諾瓦克病毒，星狀病毒，杯狀病毒，冠狀病毒 病毒性腹瀉 腸腺病毒，小圓病毒等，諾如病毒寄生蟲 溶組織阿米巴原蟲 阿米巴痢疾 隱孢子蟲，蘭氏賈第鞭毛蟲，類圓線蟲，結(jié)腸小袋蟲等 感染性腹瀉編輯ppt霍亂弧菌(Viobrio

cholerae)志賀菌(Shigella)或痢疾桿菌(dysenterybacteria)沙門菌(Salmonella)埃希菌(Escherichia)彎曲菌(Campylobacter)

2.主要病原菌特征第一節(jié)病原學(xué)編輯ppt1～5噬菌體型，且為a～f生物型的菌株稱為流行株按霍亂病原菌第一節(jié)病原學(xué)霍亂弧菌霍亂的病原菌Ｏ139血清群Ｏ1血清群古典生物型埃爾托生物型小川型稻葉型彥島型小川型稻葉型彥島型血清學(xué)分型生物學(xué)分型Ｏ1群菌株32個(gè)噬菌