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文檔簡(jiǎn)介
廣義線性混合效應(yīng)模型在臨床療效評(píng)價(jià)中的應(yīng)用【摘要】目的:探討臨床療效評(píng)價(jià)中分類重復(fù)測(cè)量資料的廣義線性混合效應(yīng)模型(GLMMs)及的GLIMMIX宏實(shí)現(xiàn)。方法:利用GLIMMIX宏ERROR和LINK語(yǔ)句來(lái)指示療效指標(biāo)的分布及連接函數(shù),通過(guò)REPEATED和RANDOM語(yǔ)句的TYPE選項(xiàng)選擇合適方差協(xié)方差結(jié)構(gòu)矩陣來(lái)模擬不同時(shí)間療效指標(biāo)的相關(guān)性,采用基于線性的偽似然函數(shù)進(jìn)行模型參數(shù)估計(jì)。結(jié)果:廣義線性混合效應(yīng)模型允許臨床療效評(píng)價(jià)指標(biāo)是指數(shù)家族中任意分布,可以通過(guò)連接函數(shù)將療效指標(biāo)的均數(shù)向量與模型參數(shù)建立線性關(guān)系,簡(jiǎn)化運(yùn)算過(guò)程。結(jié)論:廣義線性混合效應(yīng)模型建模靈活,可為臨床療效評(píng)價(jià)提供更豐富的信息。
【關(guān)鍵詞】廣義線性混合效應(yīng)模型臨床療效評(píng)價(jià)分類重復(fù)測(cè)量資料GLIMMIX宏
ApllicationsofGeneralizedLinearMixedModelsinClinicalCurativeEffectsEvaluationLuoTiane,etal
AbstractObjective:Todiscussgeneralizedlinearmixedmodels(GLMMs)ofcategoricalrepeatedmeasurementdatasinclinicalcurativeeffectevaluation,implementingwithGLIMMIXmacroinsoft.Methods:UsingtheERRORandLINKsentencesofGLIMMXmacrotosignthedistributionandlinkfunctionoftheindex,adoptingtheTYPEoptionofREPEATEDandRANDOMsentencestoselecttheappropriatevariancecovariancematrixsformodelingtherelations,makinguseofpseudolikelihoodfunctionbasedonlineartoestimatethemodelparameters.Results:GLMMsallowtheindexmaybeoneoftheexponentialfamily(ContimuumdistributionsincludingNomal,betadistribution,chisquareddistributionetc;DispersedistributionsincludingBinomal,PoissonandinverseBinomaletc),thevecorofexpectedmeansoftheindexislinkedtothemodelparametersbyalinkfunctionandmodelthelinearequation,simplethecalculatorprocedure.Conclusion:GLMMscaneasilyfitstatisticalmodels,theresultsareobjectiveandreality,canstronglyprovidetheabundantinformationforclinicalcurativeeffectevaluation.
Keywordsgeneralizedlinearmixedmodels;clinicalcurativeeffectsevaluation;categoricalrepeatedmeasurementdatas;GLIMMIXmacro
臨床療效評(píng)價(jià)中常常需要對(duì)同一患者在不同時(shí)點(diǎn)進(jìn)行多次觀測(cè)并記錄其療效指標(biāo),當(dāng)療效指標(biāo)為屬性特征或類別時(shí),稱其為分類重復(fù)測(cè)量資料,如在治療前、療后4周、8周、12周等連續(xù)檢測(cè)乙肝患者核心抗體,其結(jié)果有陰性、陽(yáng)性兩個(gè)水平;連續(xù)監(jiān)測(cè)病人的治療效果,反應(yīng)變量為治愈、顯效、好轉(zhuǎn)、無(wú)效等。如同定量變量重復(fù)測(cè)量資料,數(shù)據(jù)間不滿足獨(dú)立性要求,存在自相關(guān)性和異方差性。經(jīng)典統(tǒng)計(jì)分析方法要求數(shù)據(jù)滿足獨(dú)立性和常量方差。為拓寬醫(yī)學(xué)研究需要,本研究主要介紹不滿足獨(dú)立性要求的分類重復(fù)測(cè)量資料廣義線性混合效應(yīng)模型與的GLIMMIX宏實(shí)現(xiàn)。
1資料與方法
資料
某醫(yī)師擬探討乳腺治療儀合用乳塊康貼治療乳腺增生療效的臨床試驗(yàn),采用隨機(jī)、雙盲設(shè)計(jì),收集符合乳腺增生癥西醫(yī)診斷及中醫(yī)辨證氣滯血瘀證標(biāo)準(zhǔn)的女性患者93例,隨機(jī)分為A、B、C3組,分別采用3種治療方案。方案A:乳腺治療儀合用乳塊康貼,每日一次,每次照射半小時(shí),藥貼每日一貼,貼于疼痛明顯或增生部位;方案B:乳塊康貼,每日一貼,外用;方案C:乳腺治療儀,每日一次,每次照射半小時(shí)。15天為一療程,在每個(gè)療程末記錄病人是否有乳腺結(jié)節(jié)、乳腺疼痛及經(jīng)行腹痛等指標(biāo),連續(xù)收集兩個(gè)療程,分析指標(biāo)若為二分類反應(yīng)變量,變量賦值為有=1,無(wú)=0。
方法
廣義線性混合效應(yīng)模型[1~6]
取分類變量的療效指標(biāo)Y為反應(yīng)變量,對(duì)每個(gè)個(gè)體進(jìn)行重復(fù)觀測(cè),為說(shuō)明不同用藥方案療效是否有差別及隨時(shí)間療效的變化情況,可采用廣義線性混合效應(yīng)模型,記作:Y=μ+εg(μ)=Xβ+Zγ(1)
式中Y:n×1維觀測(cè)向量,μ:觀測(cè)的均數(shù)向量,通過(guò)連接函數(shù)g(.)將其與模型參數(shù)建立恒等方程;X和Z分別是固定效應(yīng)和隨機(jī)效應(yīng)的設(shè)計(jì)矩陣,β和γ分別是模型的固定效應(yīng)和隨機(jī)效應(yīng)參數(shù)向量,當(dāng)隨機(jī)效應(yīng)γ滿足均數(shù)為0,方差矩陣為G的正態(tài)分布,γ~N(0,G),var(γ)=G;殘差ε滿足正態(tài)分布ε~N(0,R),var(ε)=R,R:殘差協(xié)方差矩陣。
模型也可記作:E(Y|γ)=g-1(Xβ+Zγ)(2)
g-1(.)表示可微單調(diào)連接函數(shù)g(.)轉(zhuǎn)置。
廣義線性混合效應(yīng)模型的反應(yīng)變量可以是指數(shù)家族的任一分布,相應(yīng)的連接函數(shù)及誤差分布見表1。表1反應(yīng)變量的分布類型及對(duì)應(yīng)的誤差分布和連接函數(shù)
參數(shù)估計(jì):采用Wolfinger和O’connell(1993)提出的偽似然函數(shù)進(jìn)行參數(shù)估計(jì),可用SAS/STAT里GLIMMIX宏實(shí)現(xiàn),偽似然函數(shù)采用加權(quán)正態(tài)混合模型,通過(guò)迭代使準(zhǔn)似然函數(shù)即線性化偽變量達(dá)到最大化。因?yàn)槊看蔚畲蠡乃迫缓瘮?shù)是偽變量而不是原始數(shù)據(jù),故將此方法稱為“偽似然”,偽變量是基于一階泰勒系列擴(kuò)展獲得:
偽變量z=g(μ)+(y-μ)B-1=Xβ+Zγ(y-μ)B-1(3)
z的方差Vz=var(Xβ+Zγ)+B-1var(y-μ)B-1=ZGZ+B-1RB-1
相關(guān)殘差矩陣R是線性尺度P和AB-1的產(chǎn)物,Vz=ZGZ+A1/2B-1/2PA-1/2B1/2。
軟件實(shí)現(xiàn)
利用的GLIMMIX宏過(guò)程[4,5,7]來(lái)實(shí)現(xiàn)分類重復(fù)測(cè)量資料廣義線性混合效應(yīng)模型擬合與參數(shù)估計(jì),若id表示觀測(cè)個(gè)體編碼,group表示分組,time表示不同重測(cè)時(shí)間點(diǎn),以經(jīng)行腹痛y為反應(yīng)變量說(shuō)明模型的模擬過(guò)程,以下是SAS程序的數(shù)據(jù)步和必需的宏語(yǔ)句,詳細(xì)用法請(qǐng)參考SAS軟件的幫助內(nèi)容。
2結(jié)果
擬合優(yōu)度檢驗(yàn)
利用模型提供多種方差協(xié)方差結(jié)構(gòu),根據(jù)擬合優(yōu)度檢驗(yàn)AIC和BIC準(zhǔn)則越小越好的判定標(biāo)準(zhǔn)來(lái)選擇最佳模型,無(wú)結(jié)構(gòu)矩陣模型1的AIC和BIC值均明顯低于其它模型,所得結(jié)果擬合更優(yōu),見表2。表2擬合優(yōu)度AIC和BIC準(zhǔn)則進(jìn)行模型選擇表3Ⅲ型固定效應(yīng)
結(jié)果分析比較
不同用藥組療效指標(biāo)差別有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;不同療程差別有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;組別和療程的交互作用存在,見表3。不同用藥方案的主效應(yīng)比較,以單用乳腺治療儀為基線,乳腺治療儀合用乳塊康貼組優(yōu)于C組,單用乳塊康貼與C組療效差別尚不能認(rèn)為有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;不同療程主效應(yīng)分析,療程2優(yōu)于療程1(time=1);由交互效應(yīng)分析可見,以C組為基線,A組的療程2優(yōu)于療程1,B組的療程2優(yōu)于療程1,但差別尚不能認(rèn)為有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;兩法合用比單用療效好,見表4。表4模型固定效應(yīng)解
3討論
循證醫(yī)學(xué)是遵循科學(xué)依據(jù)的醫(yī)學(xué),近年來(lái)在國(guó)際臨床醫(yī)學(xué)領(lǐng)域迅速發(fā)展。進(jìn)行方法學(xué)與研究思路的創(chuàng)新與突破是促進(jìn)醫(yī)學(xué)發(fā)展,提高臨床研究質(zhì)量的關(guān)鍵。在進(jìn)行醫(yī)學(xué)臨床研究時(shí),運(yùn)用科學(xué)的設(shè)計(jì)方案,敏感性高、特異性強(qiáng)評(píng)價(jià)試驗(yàn)療效指標(biāo),正確選用統(tǒng)計(jì)方法可提高臨床研究質(zhì)量,而且也是保證科研結(jié)果準(zhǔn)確可靠的一個(gè)重要環(huán)節(jié)。分類變量重復(fù)測(cè)量資料其反應(yīng)變量不滿足正態(tài)分布,存在非獨(dú)立性及異方差性,即不能應(yīng)用常規(guī)統(tǒng)計(jì)方法來(lái)分析。
廣義估計(jì)方程可用來(lái)分析分類重復(fù)測(cè)量資料,反應(yīng)變量可以是指數(shù)家族的任一分布,有多種協(xié)方差結(jié)構(gòu)可供選擇。但是GEE是固定效應(yīng)模型,對(duì)于等級(jí)分類重復(fù)測(cè)量資料,只能分析具有獨(dú)立協(xié)方差結(jié)構(gòu)的數(shù)據(jù)[8],不能分析具有相關(guān)性的等級(jí)變量,而且GEE模型不能包括隨機(jī)效應(yīng)項(xiàng),這些均限制了該模型的應(yīng)用范圍。
廣義線性混合效應(yīng)模型是廣義線性模型[7~10]的推廣,模型在固定效應(yīng)的基礎(chǔ)上加入了隨機(jī)效應(yīng)部分;在正態(tài)隨機(jī)效應(yīng)基礎(chǔ)上,反應(yīng)變量可以是指數(shù)家族中任一分布,包括常用的二項(xiàng)式分布和Poisson分布等離散分布及正態(tài)分布,beta分布和卡方分布等連續(xù)分布,本研究以反應(yīng)變量為二項(xiàng)分布;此模型提供多種R矩陣和G矩陣的方差協(xié)方差結(jié)構(gòu),可以很好擬合多種分布類型的重復(fù)測(cè)量數(shù)據(jù),即便個(gè)體間存在相關(guān)性的數(shù)據(jù),仍可靈活建模,解決具有相關(guān)性和異方差的資料。在臨床療效評(píng)價(jià)中,隨著計(jì)算機(jī)軟件的開發(fā)與應(yīng)用,可較方便地解決模型擬合與療效評(píng)價(jià)中的方法學(xué)問題。它不僅可解決常規(guī)方法不易解決的復(fù)雜問題,而且所得結(jié)果解釋更為客觀,應(yīng)用范圍更廣,在SAS軟件宏語(yǔ)句編程中易于按分析要求實(shí)現(xiàn),具有很好的應(yīng)用前景。
【參考文獻(xiàn)】
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8Lumleyest
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