設計引物前的基因序列比對和合適基因序列查找例pigm課件_第1頁
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以稻瘟病pigm為例選擇合適的基因序列進行引物設計文獻查找pigm的精細定位大概70kb左右打開網(wǎng)頁gramene點擊blast然后再利用gramen找到C0428得物理位置打開網(wǎng)頁打開blast選rice選則好以后進行比對blast查看序列找到合適的基因序列然后在復制有差異的一段序列在gramene上查看物理位置是否符合要求如不符合繼續(xù)尋找找到合適位置后點擊Sequence出現(xiàn)該序列的前后250bp的堿基序列復制序列后用primer進行引物設計Primer設計引物的具體過程網(wǎng)上很多

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