第6章原核生物的基因表達(dá)調(diào)控課件_第1頁
第6章原核生物的基因表達(dá)調(diào)控課件_第2頁
第6章原核生物的基因表達(dá)調(diào)控課件_第3頁
第6章原核生物的基因表達(dá)調(diào)控課件_第4頁
第6章原核生物的基因表達(dá)調(diào)控課件_第5頁
已閱讀5頁,還剩146頁未讀, 繼續(xù)免費(fèi)閱讀

下載本文檔

版權(quán)說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請進(jìn)行舉報(bào)或認(rèn)領(lǐng)

文檔簡介

第六章原核生物的基因表達(dá)調(diào)控第六章原核生物的基因表達(dá)調(diào)控16.1原核生物基因表達(dá)調(diào)控概6.2操縱子學(xué)說6.3色氨酸操縱子的表達(dá)調(diào)控6.4其他操縱子6.5轉(zhuǎn)錄后水平上的調(diào)控6.6細(xì)菌的應(yīng)急反應(yīng)6.1原核生物基因表達(dá)調(diào)控概26.1原核生物基因表達(dá)調(diào)控概述6.1原核生物基因表達(dá)調(diào)控概述3

基因表達(dá)(geneexpression)是指儲(chǔ)存遺傳信息的基因經(jīng)過一系列步驟表現(xiàn)出其生物功能的整個(gè)過程。典型的基因表達(dá)是基因經(jīng)過轉(zhuǎn)錄、翻譯,產(chǎn)生有生物活性的蛋白質(zhì)的過程。

既然從DNA到蛋白質(zhì)的過程稱為基因表達(dá),對(duì)這個(gè)過程的調(diào)節(jié)就稱為基因表達(dá)調(diào)控(generegulation或genecontrol)?;虮磉_(dá)調(diào)控是現(xiàn)階段分子生物學(xué)研究的中心課題?;虮磉_(dá)(geneexpression)是指儲(chǔ)存遺46.1.1基因表達(dá)調(diào)控的意義基因組(genome)是指含有一個(gè)生物體生存、發(fā)育、活動(dòng)和繁殖所需要的全部遺傳信息的整套核酸。

但生物基因組的遺傳信息并不是同時(shí)全部都表達(dá)出來的,大腸桿菌基因組含有約4000個(gè)基因,一般情況下只有5-10%在高水平轉(zhuǎn)錄狀態(tài),其它基因有的處于較低水平的表達(dá),有的就暫時(shí)不表達(dá)。

6.1.1基因表達(dá)調(diào)控的意義基因組(genome)是指含有5改變基因表達(dá)的情況以適應(yīng)環(huán)境,在原核生物、單細(xì)胞生物中尤其顯得突出和重要,因?yàn)榧?xì)胞的生存環(huán)境經(jīng)常會(huì)有劇烈的變化。原核生物中,營養(yǎng)狀況(nutritionalstatus)和環(huán)境因素(environmentalfactor)對(duì)基因表達(dá)起著舉足輕重的影響。調(diào)控是為了適應(yīng)環(huán)境獲取營養(yǎng)達(dá)到生存即分裂繁殖的最優(yōu)化(原核既無充足的能源貯備,又無高等植物制造有機(jī)物的本領(lǐng))。所以調(diào)控體現(xiàn)1個(gè)“快”字,快速適應(yīng)環(huán)境,獲取營養(yǎng),合成必需蛋白質(zhì)、降解不必要成分。這是長期進(jìn)化,獲得的適應(yīng)應(yīng)變能力。

例如:周圍有充足的葡萄糖,細(xì)菌就可以利用葡萄糖作能源和碳源,不必更多去合成利用其它糖類的酶類,當(dāng)外界沒有葡萄糖時(shí),細(xì)菌就要適應(yīng)環(huán)境中存在的其它糖類(如乳糖、半乳糖、阿拉伯糖等),開放能利用這些糖的酶類基因,以滿足生長的需要。即使是內(nèi)環(huán)境保持穩(wěn)定的高等哺乳類,也經(jīng)常要變動(dòng)基因的表達(dá)來適應(yīng)環(huán)境,例如與適宜溫度下生活相比較,在冷或熱環(huán)境下適應(yīng)生活的動(dòng)物,其肝臟合成的蛋白質(zhì)圖譜就有明顯的不同。所以,基因表達(dá)調(diào)控是生物適應(yīng)環(huán)境生存的必需。改變基因表達(dá)的情況以適應(yīng)環(huán)境,在原核生物、單細(xì)胞生物中尤其顯6不同組織細(xì)胞中不僅表達(dá)的基因數(shù)量不相同,而且基因表達(dá)的強(qiáng)度和種類也各不相同,這就是基因表達(dá)的組織特異性(tissuespecificity)。例如肝細(xì)胞中涉及編碼鳥氨酸循環(huán)酶類的基因表達(dá)水平高于其它組織細(xì)胞,合成的某些酶(如精氨酸酶)為肝臟所特有;胰島β細(xì)胞合成胰島素;甲狀腺濾泡旁細(xì)胞(C細(xì)胞)專一分泌降血鈣素等。不同組織細(xì)胞中不僅表達(dá)的基因數(shù)量不相同,而且基因表達(dá)的強(qiáng)度和7細(xì)胞分化發(fā)育的不同時(shí)期,基因表達(dá)的情況是不相同的,這就是基因表達(dá)的階段特異性(stagespecificity)。真核生物尤其是高等真核生物中,激素水平(hormonelevel)和發(fā)育階段(developmentalstage)是基因表達(dá)調(diào)控的最主要手段,營養(yǎng)和環(huán)境因素的影響力大為下降。

細(xì)胞分化發(fā)育的不同時(shí)期,基因表達(dá)的情況是不相同的,這就是基因8一個(gè)受精卵含有發(fā)育成一個(gè)成熟個(gè)體的全部遺傳信息,在個(gè)體發(fā)育分化的各個(gè)階段,各種基因極為有序地表達(dá),一般在胚胎時(shí)期基因開放的數(shù)量最多,隨著分化發(fā)展,細(xì)胞中某些基因關(guān)閉(turnoff)、某些基因轉(zhuǎn)向開放(turnon),胚胎發(fā)育不同階段、不同部位的細(xì)胞中開放的基因及其開放的程度不一樣,合成蛋白質(zhì)的種類和數(shù)量都不相同,顯示出基因表達(dá)調(diào)控在空間和時(shí)間上極高的有序性,從而逐步生成形態(tài)與功能各不相同、極為協(xié)調(diào)、巧妙有序的組織臟器。遺傳程序調(diào)控,該遺傳程序是構(gòu)成胚胎發(fā)育和組織分化的基礎(chǔ)。僅極少基因間接或直接受環(huán)境因素的影響。這一特點(diǎn)使真核在千變?nèi)f化的環(huán)境下,主要組織或器官仍能維持正常功能(“處世不驚”)。一個(gè)受精卵含有發(fā)育成一個(gè)成熟個(gè)體的全部遺傳信息,在個(gè)體發(fā)育分9從上所述,不難看出:生物的基因表達(dá)不是雜亂無章的,而是受著嚴(yán)密、精確調(diào)控的,不僅生命的遺傳信息是生物生存所必需的,而且遺傳信息的表達(dá)調(diào)控也是生命本質(zhì)所在。

第6章原核生物的基因表達(dá)調(diào)控課件10基因表達(dá)的模式生物體內(nèi)的基因調(diào)控各不相同,基因表達(dá)隨環(huán)境變化的情況,可以大致把基因表達(dá)分成兩類:①組成性表達(dá)(constitutiveexpression)指不大受環(huán)境變動(dòng)而變化的一類基因表達(dá)。其中某些基因表達(dá)產(chǎn)物是細(xì)胞或生物體整個(gè)生命過程中都持續(xù)需要而必不可少的,這類基因可稱為看家基因(housekeepinggene),這些基因中不少是在生物個(gè)體其它組織細(xì)胞、甚至在同一物種的細(xì)胞中都是持續(xù)表達(dá)的,可以看成是細(xì)胞基本的基因表達(dá)。組成性基因表達(dá)也不是一成不變的,其表達(dá)強(qiáng)弱也是受一定機(jī)制調(diào)控的?;虮磉_(dá)的模式生物體內(nèi)的基因調(diào)控各不相同,基因表達(dá)隨環(huán)境變化11②適應(yīng)性表達(dá)(adaptiveexpression)指環(huán)境的變化容易使其表達(dá)水平變動(dòng)的一類基因表達(dá)。應(yīng)環(huán)境條件變化基因表達(dá)水平增高的現(xiàn)象稱為誘導(dǎo)(induction),這類基因被稱為可誘導(dǎo)的基因(induciblegene);相反,隨環(huán)境條件變化而基因表達(dá)水平降低的現(xiàn)象稱為阻遏(repression),相應(yīng)的基因被稱為可阻遏的基因(repressiblegene)。

②適應(yīng)性表達(dá)(adaptiveexpression)指環(huán)境12第6章原核生物的基因表達(dá)調(diào)控課件13第6章原核生物的基因表達(dá)調(diào)控課件146.1.2原核基因表達(dá)調(diào)控的特點(diǎn)與方式基因表達(dá)調(diào)控主要表現(xiàn)在以下兩方面:1.轉(zhuǎn)錄水平上的調(diào)控(transcriptionalregulation);2.轉(zhuǎn)錄后水平上的調(diào)控(post-transcriptionalregulation),包括①

mRNA加工成熟水平上的調(diào)控(differentialprocessingofRNAtranscript);②

翻譯水平上的調(diào)控(differentialtranslationofmRNA)。6.1.2原核基因表達(dá)調(diào)控的特點(diǎn)與方式基因表達(dá)調(diào)控主要表現(xiàn)15真原核調(diào)控的主要水平(主調(diào))都在轉(zhuǎn)錄水平。因?yàn)椋?.任何連鎖反應(yīng)控制第一步是最經(jīng)濟(jì)和最有效的(既不需要,何必轉(zhuǎn)錄)。2.RNApol沒有糾錯(cuò)功能(DNApol有)微調(diào)DNA水平轉(zhuǎn)錄后水平原核調(diào)控余步不大,因其轉(zhuǎn)錄翻譯同一個(gè)compt進(jìn)行。翻譯水平是原核次要調(diào)控水平。翻譯后水平真原核調(diào)控的主要水平(主調(diào))都在轉(zhuǎn)錄水平。因?yàn)椋?6調(diào)控的基本方式真原核調(diào)控的基本方式都是通過調(diào)控因子:1.蛋白質(zhì)(主)2.核酸和3.小分子化合物之間的識(shí)別和相互作用對(duì)基因表達(dá)實(shí)現(xiàn)正控制或負(fù)控制(也稱正調(diào)控和負(fù)調(diào)控)調(diào)控物質(zhì)的化學(xué)本質(zhì)

蛋白質(zhì)、核酸、小分子化合物。在轉(zhuǎn)錄水平上對(duì)基因表達(dá)的調(diào)控決定于DNA的結(jié)構(gòu)、RNA聚合酶的功能、蛋白因子及其他小分子配基的相互作用。調(diào)控的基本方式17

因?yàn)榧?xì)菌mRNA在形成過程中與核糖體混合在一起,所以,細(xì)菌的轉(zhuǎn)錄與翻譯過程幾乎發(fā)生在同一時(shí)間間隔內(nèi),轉(zhuǎn)錄與翻譯相耦聯(lián)(coupledtranscriptionandtranslation)。

真核生物中,轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物(primarytranscript)只有從核內(nèi)運(yùn)轉(zhuǎn)到核外,才能被核糖體翻譯成蛋白質(zhì)。因?yàn)榧?xì)菌mRNA在形成過程中與核糖體混合在一起,所以186.1.3原核基因表達(dá)調(diào)控的幾個(gè)重要概念1.細(xì)菌細(xì)胞對(duì)營養(yǎng)的適應(yīng)2.順式作用元件和反式作用因子3.結(jié)構(gòu)基因和調(diào)節(jié)基因4.操縱基因和阻遏蛋白5.組成蛋白和調(diào)節(jié)蛋白6.1.3原核基因表達(dá)調(diào)控的幾個(gè)重要概念1.細(xì)菌細(xì)胞對(duì)營養(yǎng)19第6章原核生物的基因表達(dá)調(diào)控課件206.2操縱子學(xué)說

法國巴斯德研究院的FrancoisJacob與JacquesMonod于1960年在法國科學(xué)院院報(bào)(ProceedingoftheFrenchAcademyofSciences)上發(fā)表了一篇論文,提出乳糖代謝中的兩個(gè)基因被一靠近它們的遺傳因子所調(diào)節(jié)。這二個(gè)基因?yàn)棣?半乳糖苷酶(β-galactosidase)和半乳糖苷透過酶(galactosidepermease)。

在此文中他們首先提出了操縱子(operon)和操縱基因(operator)的概念,他們的操縱子學(xué)說(theoryofoperon)使我們得以從分子水平認(rèn)識(shí)基因表達(dá)的調(diào)控,是一個(gè)劃時(shí)代的突破,因此他們二人于1965年榮獲諾貝爾生理學(xué)獎(jiǎng)。6.2操縱子學(xué)說法國巴斯德研究院的Fr21一、操縱子(operon)

細(xì)菌能隨環(huán)境的變化,迅速改變某些基因表達(dá)的狀態(tài),這就是很好的基因表達(dá)調(diào)控的實(shí)驗(yàn)?zāi)P?。人們就是從研究這種現(xiàn)象開始,打開認(rèn)識(shí)基因表達(dá)調(diào)控分子機(jī)理的窗口的。一、操縱子(operon)細(xì)菌能隨環(huán)境的變化221.操縱子的提出

大腸桿菌可以利用葡萄糖、乳糖、麥芽糖、阿拉伯糖等作為碳源而生長繁殖,當(dāng)培養(yǎng)基中含有葡萄糖和乳糖時(shí),細(xì)菌優(yōu)先利用葡萄糖,當(dāng)葡萄糖耗盡,細(xì)菌停止生長,經(jīng)過短時(shí)間的適應(yīng),就能利用乳糖,細(xì)菌繼續(xù)呈指數(shù)式繁殖增長。1.操縱子的提出大腸桿菌可以利用葡萄糖、乳23

大腸桿菌利用乳糖至少需要兩個(gè)酶:促使乳糖進(jìn)入細(xì)菌的半乳糖透過酶(lactosepermease)和催化乳糖分解第一步的

-半乳糖苷酶(

-galactosidase)。大腸桿菌利用乳糖至少需要兩個(gè)酶:促使乳糖進(jìn)24

在環(huán)境中沒有乳糖或其他

-半乳糖苷時(shí),大腸桿菌合成

-半乳糖苷酶量極少,加入乳糖2-3分鐘后,細(xì)菌大量合成

-半乳糖苷酶,其量可提高千倍以上,在以乳糖作為唯一碳源時(shí),菌體內(nèi)的

-半乳糖苷酶量可占到細(xì)菌總蛋白量的3%。

在上述二階段生長細(xì)菌利用乳糖再次繁殖前,也能測出細(xì)菌中

-半乳糖苷酶活性顯著增高的過程。在環(huán)境中沒有乳糖或其他-半乳糖苷時(shí),大25這種典型的誘導(dǎo)現(xiàn)象,是研究基因表達(dá)調(diào)控極好的模型。針對(duì)大腸桿菌利用乳糖的適應(yīng)現(xiàn)象,法國的Jocob和Monod等人做了一系列遺傳學(xué)和生化學(xué)研究實(shí)驗(yàn),于1961年提出乳糖操縱子(lacoperon)學(xué)說。這種典型的誘導(dǎo)現(xiàn)象,是研究基因表達(dá)調(diào)控極好的模型。針對(duì)大腸桿262.操縱子的基本組成

乳糖操縱子模型已被許多研究實(shí)驗(yàn)所證實(shí),對(duì)其有了更深入的認(rèn)識(shí),并且發(fā)現(xiàn)其他原核生物基因調(diào)控也有類似的操縱子組織,操縱子是原核基因表達(dá)調(diào)控的一種重要的組織形式,大腸桿菌的基因多數(shù)以操縱子的形式組成基因表達(dá)調(diào)控的單元。下面就以乳糖操縱子為例子說明操縱子的最基本的組成元件(elements)。2.操縱子的基本組成乳糖操縱子模型已被許27(1)結(jié)構(gòu)基因群

操縱子中被調(diào)控的編碼蛋白質(zhì)的基因可稱為結(jié)構(gòu)基因(structuralgene,SG)。一個(gè)操縱子中含有2個(gè)以上的結(jié)構(gòu)基因,多的可達(dá)十幾個(gè)。每個(gè)結(jié)構(gòu)基因是一個(gè)連續(xù)的開放閱讀框(openreadingframe),5’端有起始密碼ATG,3’端有終止密碼TAA、TGA或TAG。各結(jié)構(gòu)基因頭尾銜接、串連排列,組成結(jié)構(gòu)基因群。(1)結(jié)構(gòu)基因群操縱子中被調(diào)控的編碼蛋白質(zhì)28

至少在第一個(gè)結(jié)構(gòu)基因5’側(cè)具有核糖體結(jié)合位點(diǎn)(ribosomebindingsite,RBS),因而當(dāng)這段含多個(gè)結(jié)構(gòu)基因的DNA被轉(zhuǎn)錄成多順反子mRNA,就能被核糖體所識(shí)別結(jié)合、并起始翻譯。核糖體沿mRNA移動(dòng),在合成完第一個(gè)編碼的多肽后,核糖體可以不脫離mRNA而繼續(xù)翻譯合成下一個(gè)基因編碼的多肽,直至合成完這條多順反子mRNA所編碼的全部多肽。至少在第一個(gè)結(jié)構(gòu)基因5’側(cè)具有核糖體結(jié)合位點(diǎn)29

乳糖操縱子含有z、y和a3個(gè)結(jié)構(gòu)基因。

z基因長3510bp,編碼含1170個(gè)氨基酸、分子量為135,000的多肽,以四聚體形式組成有活性的β-半乳糖苷酶,催化乳糖轉(zhuǎn)變?yōu)榘肴樘?allolactose),再分解為半乳糖和葡萄糖;

乳糖操縱子含有z、y和a3個(gè)結(jié)構(gòu)基因。30

y基因長780bp,編碼有260個(gè)氨基酸、分子量為30,000的半乳糖透過酶,促使環(huán)境中的乳糖進(jìn)入細(xì)菌;

a基因長825bp,編碼275氨基酸、分子量為32,000的轉(zhuǎn)乙?;?,以二聚體活性形式催化半乳糖的乙酰化。y基因長780bp,編碼有260個(gè)氨基酸、分子量為30,031

z基因5’側(cè)具有大腸桿菌核糖體識(shí)別結(jié)合位點(diǎn)(RBS)特征的Shine-Dalgarno(SD)序列,因而當(dāng)乳糖操縱子開放時(shí),核糖體能結(jié)合在轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生的mRNA上。

由于z、y、a三個(gè)基因頭尾相接,上一個(gè)基因的翻譯終止密碼靠近下一個(gè)基因的z基因5’側(cè)具有大腸桿菌核糖體識(shí)別結(jié)合位點(diǎn)(R32

翻譯起始密碼,因而同一個(gè)核糖體能沿此轉(zhuǎn)錄生成的多順反子(polycistron)mRNA移動(dòng),在翻譯合成了上一個(gè)基因編碼的蛋白質(zhì)后,不從mRNA上掉下來而繼續(xù)沿mRNA移動(dòng)合成下一個(gè)基因編碼的蛋白質(zhì),一氣依次合成這基因群所編碼所有的蛋白質(zhì)。翻譯起始密碼,因而同一個(gè)核糖體能沿此轉(zhuǎn)錄生成的多順反子(p33第6章原核生物的基因表達(dá)調(diào)控課件34(2)啟動(dòng)子

啟動(dòng)子是指能被RNA聚合酶識(shí)別、結(jié)合并啟動(dòng)基因轉(zhuǎn)錄的一段DNA序列。操縱子至少有一個(gè)啟動(dòng)子,一般在第一個(gè)結(jié)構(gòu)基因5'側(cè)上游,控制整個(gè)結(jié)構(gòu)基因群的轉(zhuǎn)錄。用RNA聚合酶與分離的一段DNA雙鏈混合,再加入外切核酸酶去水解DNA,結(jié)果只有被RNA聚合酶識(shí)別結(jié)合而被保護(hù)的那段DNA不被水解,由此可以測出啟動(dòng)子的范圍及其序列。(2)啟動(dòng)子啟動(dòng)子是指能被RNA聚合酶識(shí)別35

雖然不同的啟動(dòng)子序列有所不同,但比較已經(jīng)研究過的上百種原核生物的啟動(dòng)子的序列,發(fā)現(xiàn)有一些共同的規(guī)律,它們一般長40-60bp,含A-Tbp較多,某些段落很相似的,有保守性,稱為共有性序列(consensussequences)。

啟動(dòng)子一般可分為識(shí)別(R,recognition)、結(jié)合(B,binding)和起始(I,initiation)三個(gè)區(qū)段。

雖然不同的啟動(dòng)子序列有所不同,但比較已經(jīng)研究過的上百種原36

轉(zhuǎn)錄起始第一個(gè)堿基(通常標(biāo)記位置為+1)最常見的是A;在-10bp附近有TATAAT一組共有序列,因?yàn)檫@段共有序列是Pribnow首先發(fā)現(xiàn)的,稱為Pribnow盒(Pribnowbox);在-35bp處又有TTGACA一組共有序列。轉(zhuǎn)錄起始第一個(gè)堿基(通常標(biāo)記位置為+1)最常見的是A;在-37第6章原核生物的基因表達(dá)調(diào)控課件38

不同的啟動(dòng)子序列不同,與RNA聚合酶的親和力不同、啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄的頻率高低不同,即不同的啟動(dòng)子起動(dòng)基因轉(zhuǎn)錄的強(qiáng)弱不同,例如:PL、PR、PT7屬強(qiáng)啟動(dòng)子,而Plac則是較弱的啟動(dòng)子。不同的啟動(dòng)子序列不同,與RNA聚合酶的親和力不同、啟動(dòng)轉(zhuǎn)39(3)操縱區(qū)

操縱區(qū)(operator)是指能被調(diào)控蛋白特異性結(jié)合的一段DNA序列,常與啟動(dòng)子鄰近或與啟動(dòng)子序列重疊,當(dāng)調(diào)控蛋白結(jié)合在操縱子序列上,會(huì)影響其下游基因轉(zhuǎn)錄的強(qiáng)弱。(3)操縱區(qū)操縱區(qū)(operator)是指40

以前將操縱區(qū)稱為操縱基因(operatorgene)。但現(xiàn)在基因定義是為蛋白質(zhì)或RNA編碼的核酸序列,而操縱序列并不是編碼蛋白質(zhì)的基因,卻是起著調(diào)控基因表達(dá)強(qiáng)弱的作用,正如啟動(dòng)序列不叫啟動(dòng)基因而稱為啟動(dòng)子一樣,操縱序列就可稱為操縱區(qū)。operon譯為操縱子,即基因表達(dá)操縱的單元之意。以前將操縱區(qū)稱為操縱基因(operator41

以乳糖操縱子中的操縱區(qū)為例,其操縱區(qū)(o)序列位于啟動(dòng)子(p)與被調(diào)控的基因之間,部分序列與啟動(dòng)子序列重疊。

仔細(xì)分析操縱區(qū)序列,可見這段雙鏈DNA具有回文(palindrome)樣的對(duì)稱性一級(jí)結(jié)構(gòu),能形成十字形的莖環(huán)(stemloop)構(gòu)造。不少操縱區(qū)都具有類似的對(duì)稱性序列,可能與特定蛋白質(zhì)的結(jié)合相關(guān)。以乳糖操縱子中的操縱區(qū)為例,其操縱區(qū)(o)序列位于啟動(dòng)子42

阻遏蛋白與操縱區(qū)結(jié)合,就妨礙了RNA聚合酶與啟動(dòng)子的結(jié)合及其后?-半乳糖苷酶等基因的轉(zhuǎn)錄起始,從而阻遏了這群基因的表達(dá)。

最早只把與阻遏蛋白結(jié)合、起阻遏作用的序列稱為操縱區(qū),但其后發(fā)現(xiàn)有的操縱子中阻遏蛋白與操縱區(qū)結(jié)合,就妨礙了RNA聚合酶與啟動(dòng)子的結(jié)合及43

同一操縱序列與不同構(gòu)像的蛋白質(zhì)結(jié)合,可以分別起阻遏或激活基因表達(dá)的作用,阿拉伯糖操縱子中的操縱序列就是典型的例子。因而凡能與調(diào)控蛋白特異性結(jié)合、從而影響基因轉(zhuǎn)錄強(qiáng)弱的序列,不論其對(duì)基因轉(zhuǎn)錄的作用是減弱、阻止或增強(qiáng)、開放,都可稱為操縱區(qū)。同一操縱序列與不同構(gòu)像的蛋白質(zhì)結(jié)合,可以分別起阻遏或激活基44(4)調(diào)控基因

調(diào)控基因(regulatorygene)是編碼能與操縱序列結(jié)合的調(diào)控蛋白的基因。調(diào)控蛋白有:阻遏蛋白(repressiveprotein):與操縱區(qū)結(jié)合后能減弱或阻止其調(diào)控的基因轉(zhuǎn)錄,其介導(dǎo)的調(diào)控方式為負(fù)調(diào)控(negativeregulation);

(4)調(diào)控基因調(diào)控基因(regulator45

激活蛋白(activatingprotein):與操縱區(qū)結(jié)合后能增強(qiáng)或起動(dòng)其調(diào)控的基因轉(zhuǎn)錄,所介導(dǎo)的調(diào)控方式為正調(diào)控(positiveregulation)。激活蛋白(activatingprotein):與操縱區(qū)46

某些特定的物質(zhì)能與調(diào)控蛋白結(jié)合,使調(diào)控蛋白的空間構(gòu)像發(fā)生變化,從而改變其對(duì)基因轉(zhuǎn)錄的影響,這些特定物質(zhì)可稱為效應(yīng)物(effector)。有兩種:誘導(dǎo)劑(inducer):能引起誘導(dǎo)發(fā)生的分子;阻遏劑或輔助阻遏劑(corepressor):能導(dǎo)致阻遏發(fā)生的分子。某些特定的物質(zhì)能與調(diào)控蛋白結(jié)合,使調(diào)控蛋白的空間構(gòu)像發(fā)生47

例如在乳糖操縱子中,調(diào)控基因lacI位于Plac鄰近,有其自身的啟動(dòng)子和終止子,轉(zhuǎn)錄方向和結(jié)構(gòu)基因群的轉(zhuǎn)錄方向一致,編碼產(chǎn)生由347個(gè)氨基酸組成的調(diào)控蛋白R(shí)。

在環(huán)境沒有乳糖存在的情況下,R形成分子量為152,000的活性四聚體,能特異性與操縱區(qū)o緊密結(jié)合,從而阻止利用乳糖的酶類基因的轉(zhuǎn)錄,所以R是乳糖操縱子的阻遏蛋白;例如在乳糖操縱子中,調(diào)控基因lacI位于Plac鄰近,48

當(dāng)環(huán)境中有足夠的乳糖時(shí),乳糖與R結(jié)合,使R的空間構(gòu)像變化,四聚體解聚成單體,失去與操縱區(qū)特異性緊密結(jié)合的能力,從而解除了阻遏蛋白的作用,使其后的基因得以轉(zhuǎn)錄合成利用乳糖的酶類。在這過程中乳糖就是誘導(dǎo)劑,與R結(jié)合起到去阻遏作用(derepression),誘導(dǎo)了利用乳糖的酶類基因轉(zhuǎn)錄開放。當(dāng)環(huán)境中有足夠的乳糖時(shí),乳糖與R結(jié)合,使R的空49

許多調(diào)控蛋白都是變構(gòu)蛋白(allostericprotein),通過與上述類似的方式與效應(yīng)物結(jié)合改變空間構(gòu)像,從而改變活性,起到調(diào)節(jié)基因轉(zhuǎn)錄表達(dá)的作用。許多調(diào)控蛋白都是變構(gòu)蛋白(allosteri50二、乳糖操縱子的表達(dá)調(diào)控

二、乳糖操縱子的表達(dá)調(diào)控51第6章原核生物的基因表達(dá)調(diào)控課件52第6章原核生物的基因表達(dá)調(diào)控課件53大腸桿菌能以乳糖為唯一碳源生長,這是由于它能產(chǎn)生一套利用乳糖的酶。

這些酶受乳糖操縱子的控制。大腸桿菌乳糖操縱子是大腸桿菌DNA的一個(gè)特定區(qū)段,由調(diào)節(jié)基因I,啟動(dòng)基因P,操縱基因O和結(jié)構(gòu)基因Z、Y、A組成。

P區(qū)是轉(zhuǎn)錄起始時(shí)RNA聚合酶的結(jié)合部位。O區(qū)是阻遏蛋白的結(jié)合部位,其功能是控制結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄。

平時(shí)I基因經(jīng)常進(jìn)行轉(zhuǎn)錄和翻譯,產(chǎn)生有活性的阻遏蛋白。大腸桿菌能以乳糖為唯一碳源生長,這是由于它能產(chǎn)生一套利用乳糖54

Z編碼β-半乳糖苷酶;Y編碼β-半乳糖苷透過酶;A編碼β-半乳糖苷乙酰基轉(zhuǎn)移酶。β-半乳糖苷酶是一種β-半乳糖苷鍵的專一性酶,除能將乳糖水解成葡萄糖和半乳糖。β-半乳糖苷透過酶的作用是使外界的β-半乳糖苷(如乳糖)能透過大腸桿菌細(xì)胞壁和原生質(zhì)膜進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)。β-半乳糖苷乙?;D(zhuǎn)移酶的作用是把乙酰輔酶A上的乙?;D(zhuǎn)到β-半乳糖苷上,形成乙酰半乳糖。

Z編碼β-半乳糖苷酶;Y編碼β-半乳糖苷透過酶;A55第6章原核生物的基因表達(dá)調(diào)控課件56RNA聚合酶結(jié)合部位阻遏物結(jié)合部位RNA聚合酶結(jié)合部位阻遏物結(jié)合部位571.阻遏蛋白的負(fù)調(diào)控

當(dāng)大腸桿菌在沒有乳糖的環(huán)境中生存時(shí),lac操縱子處于阻遏狀態(tài)。此i基因在其自身的啟動(dòng)子Pi控制下,低水平、組成性表達(dá)產(chǎn)生阻遏蛋白R(shí),每個(gè)細(xì)胞中僅維持約10個(gè)分子的阻遏蛋白。R以四聚體形式與操縱子o結(jié)合,阻礙了RNA聚合酶與啟動(dòng)子Plac的結(jié)合,阻止了基因的轉(zhuǎn)錄起動(dòng)。R的阻遏作用不是絕對(duì)的,R與o1.阻遏蛋白的負(fù)調(diào)控當(dāng)大腸桿菌在沒有乳糖的58偶爾解離,使細(xì)胞中還有極低水平的

-半乳糖苷酶及透過酶的生成。

當(dāng)有乳糖存在時(shí),乳糖受

-半乳糖苷酶的催化轉(zhuǎn)變?yōu)閯e乳糖,與R結(jié)合,使R構(gòu)象變化,R四聚體解聚成單體,失去與o的親和力,與o解離,基因轉(zhuǎn)錄開放,使

-半乳糖苷酶在細(xì)胞內(nèi)的含量可增加1000倍。這就是乳糖對(duì)lac操縱子的誘導(dǎo)作用。偶爾解離,使細(xì)胞中還有極低水平的-半乳糖苷酶及透過酶的生成59第6章原核生物的基因表達(dá)調(diào)控課件60乳糖操縱子的控制模型,其主要內(nèi)容如下:

①Z、Y、A基因的產(chǎn)物由同一條多順反子的mRNA分子所編碼。

②這個(gè)mRNA分子的啟動(dòng)子緊接著O區(qū),而位于I與O之間的啟動(dòng)子區(qū)(P),不能單獨(dú)起動(dòng)合成β-半乳糖苷酶和透過酶的生理過程。

③操縱基因是DNA上的一小段序列(僅為26bp),是阻遏物的結(jié)合位點(diǎn)。

④當(dāng)阻遏物與操縱基因結(jié)合時(shí),lacmRNA的轉(zhuǎn)錄起始受到抑制。

⑤誘導(dǎo)物通過與阻遏物結(jié)合,改變它的三維構(gòu)象,使之不能與操縱基因結(jié)合,從而激發(fā)lacmRNA的合成。當(dāng)有誘導(dǎo)物存在時(shí),操縱基因區(qū)沒有被阻遏物占據(jù),所以啟動(dòng)子能夠順利起始mRNA的合成。乳糖操縱子的控制模型,其主要內(nèi)容如下:61

62

63

64第6章原核生物的基因表達(dá)調(diào)控課件65第6章原核生物的基因表達(dá)調(diào)控課件66

67

68

當(dāng)一個(gè)mRNA含有編碼一個(gè)以上蛋白質(zhì)的編碼信息,而且這些蛋白質(zhì)都是以獨(dú)立的多肽被翻譯時(shí),這樣的mRNA稱之多順反子mRNA。多順反子mRNA在細(xì)菌中是很普遍的。

多順反子lacmRNA中的lacZ,lacY,lacA經(jīng)翻譯生成的產(chǎn)物分別為LacZ(β-半乳糖苷酶(β-galactosidase))、LacY(β-半乳糖苷通透酶(β-galactosidepermease))和LacA(β-半乳糖苷轉(zhuǎn)乙?;福╰hiogalactosidetransacetylase))。當(dāng)一個(gè)mRNA含有編碼一個(gè)以上蛋白質(zhì)的編碼信息69

半乳糖是lac操縱子轉(zhuǎn)錄的活性誘導(dǎo)物,人們發(fā)現(xiàn)一個(gè)合成的、結(jié)構(gòu)上類似于別乳糖、不能被β-半乳糖苷酶水解的β-半乳糖苷異丙基硫代半乳糖苷(isopropylthiogalactoside:IPTG)起著lac操縱子的一個(gè)誘導(dǎo)物的作用,所以IPTG常用于誘導(dǎo)含有使用了lac啟動(dòng)子的質(zhì)粒載體的細(xì)菌中的重組蛋白的表達(dá)。(安慰誘導(dǎo)物)

半乳糖是lac操縱子轉(zhuǎn)錄的活性誘導(dǎo)物,人們發(fā)現(xiàn)70

一些化學(xué)合成的乳糖類似物,不受

-半乳糖苷酶的催化分解,卻也能與R特異性結(jié)合使R構(gòu)象變化,誘導(dǎo)lac操縱子的開放。例如異丙基硫代半乳糖苷(isopropylthiog-alactoside,IPTG)就是很強(qiáng)的誘導(dǎo)劑;不被細(xì)菌代謝而十分穩(wěn)定。X-gal(5-溴-4-氯-3-吲哚-β-半乳糖苷)也是一種人工化學(xué)合成的半乳糖苷,可被

-半乳糖苷酶水解產(chǎn)生蘭色化合物,因此可以用作

-半乳糖苷酶活性的指示劑。IPTG和X-gal都被廣泛應(yīng)用在分子生物學(xué)和基因工程的工作中。一些化學(xué)合成的乳糖類似物,不受-半乳糖苷酶的71第6章原核生物的基因表達(dá)調(diào)控課件72第6章原核生物的基因表達(dá)調(diào)控課件73

lac操縱子受LacI阻遏蛋白調(diào)控。在沒有誘導(dǎo)劑(乳糖或IPTG)存在時(shí),LacI阻遏蛋白與lac操縱子DNA序列結(jié)合得非常緊密,lac基因不能進(jìn)行轉(zhuǎn)錄。當(dāng)IPTG存在時(shí),IPTG與LacI阻遏蛋白相互作用,形成LacI阻遏蛋白-IPTG復(fù)合物,體外研究表明,該復(fù)合物對(duì)lac操縱基因的親和性為單獨(dú)LacI阻遏蛋白的親和性的千分之一。所以IPTG作為lac基因表達(dá)的一個(gè)誘導(dǎo)劑,起著轉(zhuǎn)錄去阻遏作用。就象(下圖)表示的那樣,RNA聚合酶的結(jié)合部位(lac操縱基因)也是LacI阻遏蛋白的結(jié)合部位,實(shí)驗(yàn)表明RNA聚合酶和LacI阻遏蛋白對(duì)操縱基因序列的結(jié)合是相互排斥的。

lac操縱子受LacI阻遏蛋白調(diào)控。在沒有誘導(dǎo)劑74第6章原核生物的基因表達(dá)調(diào)控課件75原核生物基因表達(dá)的調(diào)控乳糖代謝基因表達(dá)調(diào)控圖解:(沒有乳糖時(shí))

lacZlacY

lacA調(diào)節(jié)基因啟動(dòng)子操縱基因結(jié)構(gòu)基因RNA聚合酶信使RNA轉(zhuǎn)錄翻譯阻抑物與操縱基因結(jié)合,結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄受阻.阻抑物原核生物基因表達(dá)的調(diào)控乳糖代謝基因表達(dá)調(diào)控圖解:(沒有乳糖時(shí)76原核生物基因表達(dá)的調(diào)控乳糖代謝基因表達(dá)調(diào)控圖解:(有乳糖時(shí))

lacZlacY

lacA調(diào)節(jié)基因啟動(dòng)子操縱基因結(jié)構(gòu)基因RNA聚合酶信使RNA轉(zhuǎn)錄翻譯阻抑物與乳糖結(jié)合后構(gòu)象發(fā)生了改變,因而不能與操縱基因結(jié)合,使得結(jié)構(gòu)基因進(jìn)行轉(zhuǎn)錄。阻抑物乳糖轉(zhuǎn)錄半乳糖苷酶酶酶乳糖分解代謝調(diào)控過程是一個(gè)自我調(diào)控過程原核生物基因表達(dá)的調(diào)控乳糖代謝基因表達(dá)調(diào)控圖解:(有乳糖時(shí))772.CAP的正調(diào)控

細(xì)菌中的cAMP含量與葡萄糖的分解代謝有關(guān),當(dāng)細(xì)菌利用葡萄糖分解產(chǎn)生能量時(shí),cAMP生成少而分解多,cAMP含量低;相反,當(dāng)環(huán)境中無葡萄糖可供利用時(shí),cAMP含量就升高。細(xì)菌中有一種能與cAMP特異結(jié)合的cAMP受體蛋白CRP(cAMPreceptorprotein),當(dāng)CRP未與cAMP結(jié)合時(shí)它是沒有活性的,當(dāng)cAMP濃度升高時(shí),CRP與cAMP結(jié)合并發(fā)生空間構(gòu)象的變化而活化,稱為CAP(CRP-cAMPactivatedprotein),能以二聚體的方式與特定的DNA序列結(jié)合。2.CAP的正調(diào)控細(xì)菌中的cAMP含量與葡78

在lac操縱子的啟動(dòng)子Plac上游端有一段序列與Plac部分重疊的序列,能與CAP特異結(jié)合,稱為CAP結(jié)合位點(diǎn)(CAPbindingsite)。CAP與這段序列結(jié)合時(shí),可增強(qiáng)RNA聚合酶的轉(zhuǎn)錄活性,使轉(zhuǎn)錄提高50倍。相反,當(dāng)有葡萄糖可供分解利用時(shí),cAMP濃度降低,CRP不能被活化,lac操縱子的結(jié)構(gòu)基因表達(dá)下降。在lac操縱子的啟動(dòng)子Plac上游端有一段序列與Plac79第6章原核生物的基因表達(dá)調(diào)控課件80第6章原核生物的基因表達(dá)調(diào)控課件81第6章原核生物的基因表達(dá)調(diào)控課件82

由于Plac是弱啟動(dòng)子,單純因乳糖的存在發(fā)生去阻遏使lac操縱子轉(zhuǎn)錄開放,還不能使細(xì)菌很好利用乳糖,必需同時(shí)有CAP來加強(qiáng)轉(zhuǎn)錄活性,細(xì)菌才能合成足夠的酶來利用乳糖。lac操縱子的強(qiáng)誘導(dǎo)既需要有乳糖的存在又需要沒有葡萄糖可供利用。通過這機(jī)制,細(xì)菌是優(yōu)先利用環(huán)境中的葡萄糖,只有無葡萄糖而又有乳糖時(shí),細(xì)菌才去充分利用乳糖。由于Plac是弱啟動(dòng)子,單純因乳糖的存在發(fā)生去阻遏使la83

細(xì)菌對(duì)葡萄糖以外的其他糖(如阿拉伯糖、半乳糖、麥芽糖等)的利用上也有類似對(duì)乳糖利用的情況,在含有編碼利用阿拉伯糖的酶類基因群的阿拉伯糖操縱子(araoperon)、半乳糖操縱子(galoperon)中也有CAP結(jié)合位點(diǎn),CAP也起類似的正性調(diào)控作用。所以CAP的通用名稱是分解代謝基因激活蛋白(catabolicgeneactivatorprotein)。細(xì)菌對(duì)葡萄糖以外的其他糖(如阿拉伯糖、半乳糖、麥芽糖等)84

不難看出:CAP結(jié)合位點(diǎn)就是一種起正性調(diào)控作用的操縱子,CAP則是對(duì)轉(zhuǎn)錄起正性作用的調(diào)控蛋白──激活蛋白,編碼CRP的基因也是一個(gè)調(diào)控基因,不過它并不在lac操縱子的附近,CAP可以對(duì)幾個(gè)操縱子都起作用。從上所述,乳糖操縱子屬于可誘導(dǎo)操縱子(inducibleoperon),這類操縱子通常使是關(guān)閉的,當(dāng)受效應(yīng)物作用后誘導(dǎo)開放轉(zhuǎn)錄。這類操縱子使細(xì)菌能適應(yīng)環(huán)境的變化,最有效地利用環(huán)境能提供的能源底物。不難看出:CAP結(jié)合位點(diǎn)就是一種起正性調(diào)控作用的操縱子,85乳糖操縱子的誘導(dǎo)

乳糖操縱子的誘導(dǎo)866.3色氨酸操縱子的表達(dá)調(diào)控

6.3色氨酸操縱子的表達(dá)調(diào)控87

色氨酸是構(gòu)成蛋白質(zhì)的組分,一般的環(huán)境難以給細(xì)菌提供足夠的色氨酸,細(xì)菌要生存繁殖通常需要自己經(jīng)過許多步驟合成色氨酸,但是一旦環(huán)境能夠提供色氨酸時(shí),細(xì)菌就會(huì)充分利用外界的色氨酸、減少或停止合成色氨酸,以減輕自己的負(fù)擔(dān)。細(xì)菌所以能做到這點(diǎn)是因?yàn)橛猩彼岵倏v子(trpoperon)的調(diào)控。色氨酸是構(gòu)成蛋白質(zhì)的組分,一般的環(huán)境難以給細(xì)88trp操縱子的結(jié)構(gòu)trp操縱子的結(jié)構(gòu)見下圖:五個(gè)結(jié)構(gòu)基因(E、D、C、B、A)分別編碼從分支氨酸起始合成色氨酸途徑的酶或酶亞基。在結(jié)構(gòu)基因之前為調(diào)控區(qū)域,包括啟動(dòng)子區(qū)(P)、操縱區(qū)(O)、前導(dǎo)肽編碼區(qū)(L)和弱化子區(qū)(a)。弱化子(衰減子):在trpE與操縱基因之間有一段前導(dǎo)序列L(162bp),它能編碼出一個(gè)內(nèi)含兩個(gè)并連的trp的14肽,由于這兩個(gè)trp的合成速度能控制核糖體在mRNA上的移動(dòng),使得前導(dǎo)序列的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物mRNA可形成特殊的結(jié)構(gòu),類似轉(zhuǎn)錄終止信號(hào),因此編碼該結(jié)構(gòu)區(qū)域的基因被稱為弱化子(衰減子)。在trpA之后有兩個(gè)終止信號(hào)t和t′,其中t′為因子所識(shí)別,因此因子也參與了調(diào)控。Trp操縱子的調(diào)節(jié)基因(trpR)產(chǎn)生輔阻遏蛋白,遠(yuǎn)離trp操縱子。trp操縱子的結(jié)構(gòu)trp操縱子的結(jié)構(gòu)見下圖:五個(gè)結(jié)構(gòu)基因(E891.色氨酸操縱子的結(jié)構(gòu)

1.色氨酸操縱子的結(jié)構(gòu)90第6章原核生物的基因表達(dá)調(diào)控課件91trp操縱子的調(diào)控:啟動(dòng)子調(diào)控——阻遏系統(tǒng)弱化子(衰減子)調(diào)控trp操縱子的調(diào)控:922.

阻遏蛋白的負(fù)調(diào)控

合成色氨酸所需要酶類的基因E、D、C、B、A等頭尾相接串連排列組成結(jié)構(gòu)基因群,受其上游的啟動(dòng)子Ptrp和操縱子o的調(diào)控,調(diào)控基因trpR的位置遠(yuǎn)離P-o-結(jié)構(gòu)基因群,在其自身的啟動(dòng)子作用下,以組成性方式低水平表達(dá)其編碼分子量為47000的調(diào)控蛋白R(shí),R并沒有與o結(jié)合的活性,當(dāng)環(huán)境能提供足夠濃度的色氨酸時(shí),R與色氨酸結(jié)合后構(gòu)象變化而活化,就能夠與o特異性親和結(jié)合,阻遏結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄。2.阻遏蛋白的負(fù)調(diào)控合成色氨酸所需要酶類的93色氨酸操縱子的可阻遏調(diào)控色氨酸操縱子的可阻遏調(diào)控94

因此色氨酸操縱子屬于一種負(fù)性調(diào)控的、可阻遏的操縱子(repressibleoperon),即這操縱子通常是開放轉(zhuǎn)錄的,有效應(yīng)物(色氨酸為阻遏劑)作用時(shí)則阻遏關(guān)閉轉(zhuǎn)錄。細(xì)菌不少生物合成系統(tǒng)的操縱子都屬于這種類型,其調(diào)控可使細(xì)菌處在生存繁殖最經(jīng)濟(jì)最節(jié)省的狀態(tài)。

因此色氨酸操縱子屬于一種負(fù)性調(diào)控的、可阻遏的953.弱化子及其作用

實(shí)驗(yàn)觀察表明:當(dāng)色氨酸達(dá)到一定濃度、但還沒有高到能夠活化R使其起阻遏作用的程度時(shí),產(chǎn)生色氨酸合成酶類的量已經(jīng)明顯降低,而且產(chǎn)生的酶量與色氨酸濃度呈負(fù)相關(guān)。仔細(xì)研究發(fā)現(xiàn)這種調(diào)控現(xiàn)象與色氨酸操縱子特殊的結(jié)構(gòu)有關(guān)。3.弱化子及其作用實(shí)驗(yàn)觀察表明:當(dāng)色氨酸達(dá)96

在色氨酸操縱子Ptrp-o與第一個(gè)結(jié)構(gòu)基因trpE之間有162bp的一段先導(dǎo)序列(leadingsequence,L),實(shí)驗(yàn)證明當(dāng)色氨酸有一定濃度時(shí),RNA聚合酶的轉(zhuǎn)錄會(huì)終止在這里。這段序列中含有編碼由14個(gè)氨基酸組成的短肽的開放閱讀框,其序列中有2個(gè)色氨酸相連,在此開放閱讀框前有核糖體識(shí)別結(jié)合位點(diǎn)(RBS)序列,提示這段短開放閱讀框在轉(zhuǎn)錄后是能被翻譯的。在色氨酸操縱子Ptrp-o與第一個(gè)結(jié)構(gòu)基因trpE之間有197

mRNA前導(dǎo)區(qū)序列分析

trp前導(dǎo)區(qū)的堿基序列已經(jīng)全部測定,發(fā)現(xiàn)完整的前導(dǎo)序列可分為1、2、3、4區(qū)域,這四個(gè)區(qū)域的片段能以兩種不同的方式進(jìn)行堿基配對(duì)(圖9-10),mRNA前導(dǎo)區(qū)序列分析98

色氨酸操縱子的轉(zhuǎn)錄與翻譯調(diào)控色氨酸操縱子的轉(zhuǎn)錄與翻譯調(diào)控99有時(shí)以1-2和3-4配對(duì),有時(shí)只以2-3方式互補(bǔ)配對(duì)。核糖體經(jīng)過前導(dǎo)區(qū)繼續(xù)翻譯的能力控制著這兩種結(jié)構(gòu)的轉(zhuǎn)換,它決定mRNA是否形成終止所需的結(jié)構(gòu)。前導(dǎo)序列的終止區(qū)與一般的轉(zhuǎn)錄有時(shí)以1-2和3-4配對(duì),有時(shí)只以2-3方式互補(bǔ)配對(duì)。核糖體100

終止位點(diǎn)特點(diǎn)相同,具有成串的U和潛在的能形成莖環(huán)的二重對(duì)稱結(jié)構(gòu)。通過RNaseT1降解實(shí)驗(yàn)(此酶不水解配對(duì)的RNA)表明純化的trp前導(dǎo)序列中只有1-2和3-4的配對(duì)方式。由此定位的3-4配對(duì)區(qū)正好位于終止密碼子識(shí)別區(qū),當(dāng)這個(gè)區(qū)域發(fā)生破壞自我堿基突變,有利于轉(zhuǎn)錄的繼續(xù)進(jìn)行。

終止位點(diǎn)特點(diǎn)相同,具有成串的U和潛在的能形成莖環(huán)的二101

轉(zhuǎn)錄的弱化理論認(rèn)為,mRNA轉(zhuǎn)錄的終止是通過前導(dǎo)肽基因的翻譯來調(diào)節(jié)的,在前導(dǎo)肽基因中有兩個(gè)相鄰的色氨酸密碼子,在翻譯時(shí)對(duì)tRNATrp的濃度十分敏感。當(dāng)培養(yǎng)基中色氨酸的濃度很低時(shí),負(fù)載有色氨酸的tRNATrp也少,由此推斷,翻譯通過兩個(gè)相鄰色氨酸密碼子的速度就會(huì)很慢,當(dāng)4區(qū)被轉(zhuǎn)錄完成時(shí),核糖體才進(jìn)行到1區(qū)(或停留在兩個(gè)相鄰的色轉(zhuǎn)錄的弱化理論認(rèn)為,mRNA轉(zhuǎn)錄的終止是通過前導(dǎo)肽基因的翻102氨酸密碼子處),這時(shí)的前導(dǎo)區(qū)結(jié)構(gòu)是2-3配對(duì),不形成3-4配對(duì)的終止結(jié)構(gòu),所以轉(zhuǎn)錄可繼續(xù)進(jìn)行,直到將色氨酸操縱子中的結(jié)構(gòu)基因全部轉(zhuǎn)錄完畢為止。測定結(jié)果發(fā)現(xiàn),在缺乏色氨酸時(shí)所有的RNA聚合酶都能經(jīng)過弱化子繼續(xù)參與轉(zhuǎn)錄。加上取消阻遏增加的約70倍的表達(dá),總表達(dá)量可增加約700倍。

氨酸密碼子處),這時(shí)的前導(dǎo)區(qū)結(jié)構(gòu)是2-3配對(duì),不形成3-4配103當(dāng)培養(yǎng)基中色氨酸濃度高時(shí),核糖體可順利通過兩個(gè)相鄰的色氨酸密碼子,在4區(qū)被轉(zhuǎn)錄之前,核糖體就到達(dá)2區(qū),這樣使2-3不能配對(duì),3-4區(qū)可以自由配對(duì)形成莖-環(huán)式的終止子結(jié)構(gòu),使得只有約10%的RNA聚合酶能繼續(xù)參與色氨酸操縱子結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄(圖9-10)。由此可見,弱化子對(duì)RNA聚合酶轉(zhuǎn)錄的終止依賴于前導(dǎo)肽翻譯中核糖體所處的位置,而細(xì)胞中色氨

當(dāng)培養(yǎng)基中色氨酸濃度高時(shí),核糖體可順利通過兩個(gè)相鄰的色氨酸密104

酸存在與否,決定了mRNA轉(zhuǎn)錄的弱化子結(jié)構(gòu),使弱化子中1、2、3、4區(qū)域呈現(xiàn)競爭性配對(duì),從而產(chǎn)生弱化效應(yīng),這是色氨酸操縱子第二水平調(diào)控的機(jī)制。應(yīng)該指出,色氨酸含量變化對(duì)阻遏過程和弱化過程的作用方向是相同的。前者主要控制操縱子基因表達(dá)的啟動(dòng),而后者主要決定轉(zhuǎn)錄和翻譯是否能繼續(xù)進(jìn)行下去。酸存在與否,決定了mRNA轉(zhuǎn)錄的弱化子結(jié)構(gòu),使弱化子中105弱化子作用第6章原核生物的基因表達(dá)調(diào)控課件106第6章原核生物的基因表達(dá)調(diào)控課件107第6章原核生物的基因表達(dá)調(diào)控課件108前導(dǎo)區(qū)的轉(zhuǎn)錄無色氨酸時(shí),轉(zhuǎn)錄可持續(xù)進(jìn)行有色氨酸存在時(shí),轉(zhuǎn)錄在弱化子區(qū)域終止Trp操縱子的弱化子調(diào)控前導(dǎo)區(qū)的轉(zhuǎn)錄無色氨酸時(shí),轉(zhuǎn)錄可持續(xù)進(jìn)行有色氨酸存在時(shí),轉(zhuǎn)錄在109有色氨酸時(shí),核糖體的移動(dòng)阻止了2、3莖環(huán)的形成,但3、4莖環(huán)形成,終止轉(zhuǎn)錄無色氨酸時(shí),核糖體在trp密碼子處停留,形成2、3莖環(huán),阻止了3、4莖環(huán)的形成,轉(zhuǎn)錄繼續(xù)有色氨酸時(shí),核糖體的移動(dòng)阻止了2、3莖環(huán)的形成,但3、4莖1106.4其他操縱子一、半乳糖操縱子(galactoseoperon)異構(gòu)酶(galE)乳糖-磷酸尿嘧啶核苷轉(zhuǎn)移酶(galT)

半乳糖激酶(galk)。6.4其他操縱子一、半乳糖操縱子(galactoseop111gal操縱子的特點(diǎn):①它有兩個(gè)啟動(dòng)子,其mRNA可從兩個(gè)不同的起始點(diǎn)開始轉(zhuǎn)錄;②它有兩個(gè)O區(qū),一個(gè)在P區(qū)上游,另一個(gè)在結(jié)構(gòu)基因galE內(nèi)部。gal操縱子的特點(diǎn):112二、阿拉伯糖操縱子(arabinoseoperon)araB基因、araA基因和araD,形成一個(gè)基因簇,簡寫為araBAD三個(gè)基因的表達(dá)受到ara操縱子中araC基因產(chǎn)物AraC蛋白的調(diào)控。

二、阿拉伯糖操縱子(arabinoseoperon)ara113ara操縱子的調(diào)控有兩個(gè)特點(diǎn):第一,araC表達(dá)受到AraC的自身調(diào)控。第二,AraC既是ara操縱子的正調(diào)節(jié)蛋白(需cAMP-CRP的共同參與,起始轉(zhuǎn)錄),又是其負(fù)調(diào)節(jié)蛋白。這種雙重功能是通過AraC蛋白的兩種異構(gòu)體來實(shí)現(xiàn)的(Pi和Pr)。ara操縱子的調(diào)控有兩個(gè)特點(diǎn):114第6章原核生物的基因表達(dá)調(diào)控課件115第6章原核生物的基因表達(dá)調(diào)控課件116第6章原核生物的基因表達(dá)調(diào)控課件117三、阻遏蛋白LexA的降解與細(xì)菌中的SOS應(yīng)答SOS反應(yīng)的機(jī)理:由RecA蛋白和LexA阻遏物的相互作用引起的。LexA阻遏物:是SOSDNA修復(fù)系統(tǒng)所有基因的阻遏物RecA蛋白:是SOS反應(yīng)的最初的發(fā)動(dòng)因子。在單鏈DNA和ATP存在時(shí),RecA蛋白被激活,表現(xiàn)出水解酶活性,分解LexA阻遏物。當(dāng)RecA水解LexA阻遏物后,導(dǎo)致SOS體系(包括recA基因)高效表達(dá),DNA得到修復(fù)三、阻遏蛋白LexA的降解與細(xì)菌中的SOS應(yīng)答SOS反應(yīng)的機(jī)1186.5轉(zhuǎn)錄后水平上的調(diào)控6.5轉(zhuǎn)錄后水平上的調(diào)控119第6章原核生物的基因表達(dá)調(diào)控課件120第6章原核生物的基因表達(dá)調(diào)控課件121第6章原核生物的基因表達(dá)調(diào)控課件122DNAamrCLmRNA前導(dǎo)肽SD1123SD24紅霉素甲基化酶前導(dǎo)肽DNAamrCLmRNA前導(dǎo)肽SD1123SD24紅霉素甲123第6章原核生物的基因表達(dá)調(diào)控課件124第6章原核生物的基因表達(dá)調(diào)控課件125(三)翻譯產(chǎn)物對(duì)翻譯的調(diào)控(蛋白質(zhì)合成的自體調(diào)控)有些mRNA編碼的蛋白質(zhì)(pr.),本身就是pr翻譯過程中發(fā)揮調(diào)節(jié)作用的因子,這些因子對(duì)自身翻譯也起調(diào)控制作用。

1.核糖體蛋白

(1)核糖體是1座合成pr.流動(dòng)工廠,沿mRNA移動(dòng)快速合成pr.核糖體以rRNA為骨架加核糖體pr構(gòu)成。Ecoli核糖體pr55種,(大亞基34,小亞基21),核糖體是細(xì)菌細(xì)胞重要成份之一。

(2)細(xì)菌中50余種核糖體pr.基因分布在不同的操縱子中,合成這些pr.,速率是與細(xì)胞增殖適應(yīng)的,受生長條件營養(yǎng)環(huán)境影響。

(3)實(shí)驗(yàn)證明,這些操縱子轉(zhuǎn)錄水平是可調(diào)控的,但核糖體pr.合成的控制主要在翻譯水平。因?yàn)榧尤腩~外操縱子于細(xì)菌,mRNA↑核糖體pr.并不增加。

(4)每1個(gè)operon轉(zhuǎn)錄的mRNA編碼蛋白中的一種(或2種pr復(fù)合體)可以結(jié)合到多順反子上游的1個(gè)特定部位,阻止核糖體結(jié)合和起始翻譯。(三)翻譯產(chǎn)物對(duì)翻譯的調(diào)控(蛋白質(zhì)合成的自體調(diào)控)1262.翻譯終止子RF2合成的自體調(diào)控(1)終止密碼和釋放因子(終止子)無論原核、真核都有3種終止碼:UAG、UGA和UAA

沒有1種tRNA與終止碼作用,而是由特殊的pr.因子促成終止作用,這類pr.因子稱做釋放因子,也有稱翻譯終止子。

原核有3種釋放因子

RF1

識(shí)別UAA、UAGRF2識(shí)別UAA、UGARF3

能刺激RF、RF2的活性。

真核只有1種,即eIF。2.翻譯終止子RF2合成的自體調(diào)控127(2)RF2mRNA的移框窗口及其附近結(jié)構(gòu)相關(guān)知識(shí)鏈接閱讀框(reading-frame)——也稱讀碼。mRNA核苷酸序列中,3個(gè)核苷酸為1組(稱為密碼子),由核糖體進(jìn)行翻譯。每個(gè)密碼子代表Pr.合成中單個(gè)氨基酸,閱讀框規(guī)定了哪3個(gè)核苷酸成為1組讀作1個(gè)密碼子,這是由起始密碼子AuG決定的。例如AuGCCAAAAuuuccc可以讀成AuG/GCA/AAA/UUU/CCC,而不會(huì)讀A/UGG/CAA/AAU/UUC/CC。

開放閱讀框(openreading-frame)——沒有終止密碼子打斷的閱讀,通常是從DNA(不是RNA)順序推論出開放閱讀框的存在。

基因密碼閱讀的3個(gè)特點(diǎn)

①每個(gè)基因都有特定的閱讀框(如組Pr.),閱讀必須從第1個(gè)密碼子開始到最后1個(gè)密碼子結(jié)束。

②閱讀是不停頓的,停頓只能合成肽而不是Pr。(學(xué)理發(fā))

③閱讀(mRNA)方向5’→3’,合成肽鏈方向N—C,而不能反之。(2)RF2mRNA的移框窗口及其附近結(jié)構(gòu)128mRNA5’···AUG···GGGUAUCUUUGACUACGAC···3’合成肽鏈方向NH2–Gly–Tyr–Leu–Asp--Tyr--Asp---COOH

前面25個(gè)氨基酸后面315個(gè)氨基酸(AA)

①RF2是由340氨基酸組成的Pr.它的密碼子并不處于同1個(gè)閱讀框中,前25個(gè)AA處于AUG所在閱讀框中,后315AA處于(+1)另1閱讀框中。

RF2整個(gè)閱讀框分成2個(gè)閱讀框,中間多了1個(gè)U,U與第26個(gè)AA(ASP)密碼子的前2個(gè)核苷酸構(gòu)成了RF2識(shí)別的終止碼UGA,而且是前框(25個(gè)AA)同框終止密碼子。

②移框窗口至少含15個(gè)核苷酸。RF2mRNA移框窗口及其結(jié)構(gòu)移框窗口(轉(zhuǎn)換區(qū))——至少15個(gè)核苷酸才能發(fā)生移框232425262728mRNA5’···AUG···GGGUAUCU129RF2合成的自體調(diào)控細(xì)胞內(nèi)RF2供應(yīng)充足時(shí)↑→當(dāng)核糖體A位到達(dá)第25個(gè)密碼子后面的UGA時(shí)→RF2就促成了肽鏈合成終止。

RF2↑→RF2mRNA譯至第25個(gè)AA→在其后UGA處將不成熟的肽釋放。

胞內(nèi)缺乏RF2↓→核糖體向前滑動(dòng)1個(gè)核苷酸(U)→即移框作用→繼續(xù)合成第25個(gè)AA→直到最后的終止碼UAG→UAG由另1個(gè)釋放因子RF1識(shí)別并促使RF2肽鏈的釋放。

移框作用如此精細(xì)的自體調(diào)控機(jī)制目前仍不清楚,可能與前面25肽的結(jié)構(gòu)有關(guān)。RF2合成的自體調(diào)控130(四)反義RNA的調(diào)控作用1.反義RNA對(duì)E.coli滲透壓Pr.(外膜Pr.)的調(diào)控作用細(xì)菌環(huán)境omPRDNAomPRPr.omPCDNA高滲低滲正控變構(gòu)micFRNA反義RNA(174個(gè)核苷酸)ompcmRNA翻譯OmpcPr.結(jié)合雜交雙鏈omPRPr.正控轉(zhuǎn)錄DNAomPFomPFDNA轉(zhuǎn)錄omPFmRNAmicFmRNA翻譯omPFmRNAomPFPr.(四)反義RNA的調(diào)控作用細(xì)菌環(huán)境omPRDNAomPRPr131(1)低滲→omPRPr.omPF。omPC基因關(guān)閉。(2)高滲—變構(gòu)OmPRPr.OmpcompcmRNAompcPr.micF(3)micF能與ompFmRNA前導(dǎo)序列(L)中的44個(gè)核苷酸(包括SDs)及編碼區(qū)(包括起始碼AUG)形成雜合雙鏈,從而抑制了ompFmRNA翻譯。(4)2種Pr.(ompF.ompc)隨滲透壓變化而變化此消彼長,總量不變。(5)反義RNA—與mRNA反義,通過互補(bǔ)堿基與特定的mRNA結(jié)合,抑制mRNA的翻譯,有稱干擾mRNA的互補(bǔ)RNA,簡稱micRNA(mRNA-interferingcomplementaryRNA)。正控正控轉(zhuǎn)錄翻譯同時(shí)轉(zhuǎn)錄(1)低滲→omPRPr.o1322.反義RNA對(duì)Tn10轉(zhuǎn)位酶的調(diào)控作用(1)Tn10帶有terr,轉(zhuǎn)座最大的特點(diǎn)是原位轉(zhuǎn)座不動(dòng),僅將1個(gè)新的合成復(fù)本插到另1個(gè)新的位點(diǎn)上上去。(2)Tn10的基本結(jié)構(gòu)ISStructralgene3’反義(阻遏)RNA5’(RNA-out)5’Pin(啟動(dòng)子)3’5’Pin啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄Tn10轉(zhuǎn)位酶(RNA-in)Pout啟動(dòng)子(RNA-out)阻遏RNA3’5’3’5’互補(bǔ)Tn10轉(zhuǎn)位酶mRNA2.反義RNA對(duì)Tn10轉(zhuǎn)位酶的調(diào)控作用ISStructra133(3)調(diào)控機(jī)理

①Tn10轉(zhuǎn)位酶由pin控制,反義RNA基因由Pout控制。2啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄方向相反,在轉(zhuǎn)錄區(qū)有35(40)bp重疊,導(dǎo)致2條RNA互補(bǔ)。

②2啟動(dòng)子交叉轉(zhuǎn)錄,產(chǎn)物RNA互補(bǔ)重疊成雙股鏈→核糖體不能接觸—轉(zhuǎn)位酶不能譯出→無酶無法轉(zhuǎn)位。

③只有RNA-in擺脫了RNA-out配對(duì)才有機(jī)會(huì)翻譯。RNA-out活性較RNA-in大8倍,所以Tn10的份數(shù)越多,轉(zhuǎn)座機(jī)會(huì)就越少。

④生物學(xué)意義對(duì)于細(xì)菌來說,Tn是入侵者,除抗生素抗性基因?qū)?xì)菌有利外,過多Tn對(duì)細(xì)菌是一個(gè)況重負(fù)擔(dān)、甚至置細(xì)菌于死地(轉(zhuǎn)座引起插入突變等)Tn10用反義RNA約束自己不要過多繁殖以免與宿主同歸于盡。(3)調(diào)控機(jī)理1346.7

細(xì)菌的應(yīng)急反應(yīng)-嚴(yán)謹(jǐn)反應(yīng)

細(xì)菌有時(shí)會(huì)碰到緊急狀況,比如氨基酸饑餓時(shí),就不是缺少一二種氨基酸,而是氨基酸的全面匱乏。為了緊縮開支,渡過難關(guān),細(xì)菌將會(huì)產(chǎn)生一個(gè)應(yīng)急反應(yīng),包括生產(chǎn)各種RNA、糖、脂肪和蛋白質(zhì)在內(nèi)的幾乎全部生物化學(xué)反應(yīng)過程均被停止。實(shí)施這一應(yīng)急反應(yīng)的信號(hào)是鳥苷四磷酸(ppGpp)和鳥苷五磷酸(pppGpp)。產(chǎn)生這兩種物質(zhì)的誘

溫馨提示

  • 1. 本站所有資源如無特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
  • 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
  • 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁內(nèi)容里面會(huì)有圖紙預(yù)覽,若沒有圖紙預(yù)覽就沒有圖紙。
  • 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
  • 5. 人人文庫網(wǎng)僅提供信息存儲(chǔ)空間,僅對(duì)用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護(hù)處理,對(duì)用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對(duì)任何下載內(nèi)容負(fù)責(zé)。
  • 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當(dāng)內(nèi)容,請與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
  • 7. 本站不保證下載資源的準(zhǔn)確性、安全性和完整性, 同時(shí)也不承擔(dān)用戶因使用這些下載資源對(duì)自己和他人造成任何形式的傷害或損失。

最新文檔

評(píng)論

0/150

提交評(píng)論