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文檔簡介
轉(zhuǎn)錄后遺傳信息的擴(kuò)展第一節(jié)mRNA前體加工的分子基礎(chǔ)一、核不均一mRNA(hnRNA)真核基因是單順反子!平均每個(gè)基因8個(gè)內(nèi)含子;占比例高,有的基因內(nèi)含子達(dá)99%。第2頁,共25頁,2024年2月25日,星期天5‘-UTR3‘-UTR第3頁,共25頁,2024年2月25日,星期天RNA剪接的4種方式:類型I自我剪接、類型II自我剪接、hnmRNA的剪接和核tRNA的自我剪接。第4頁,共25頁,2024年2月25日,星期天剪接體內(nèi)含子主要內(nèi)含子剪接位點(diǎn)特征邊界序列:5-GU---AG-3
內(nèi)含子還有分支保守序列。分支位點(diǎn)?酵母:UACUAAC高等真核:YNCURAY(A代表分支形成點(diǎn),N任意堿基、R嘌呤、Y嘧啶)第5頁,共25頁,2024年2月25日,星期天
次要內(nèi)含子剪接特征:
邊界序列:5-AU----AC-3上述內(nèi)含子需要剪接蛋白和snRNA參與剪接2.自我剪接內(nèi)含子:細(xì)菌、真核生物細(xì)胞器、低等真核生物細(xì)胞核;I型內(nèi)含子:邊界序列5-U---G-3。II型內(nèi)含子:邊界序列5-GU----AG-3III型內(nèi)含子:第6頁,共25頁,2024年2月25日,星期天二、催化活性的小核RNA(snRNA)
是真核生物轉(zhuǎn)錄后加工過程中RNA剪接體(spliceosome)的主要成分,參與mRNA前體的加工過程。其長度在哺乳動(dòng)物中約為100-215個(gè)核苷酸,主要有6種,常與核蛋白結(jié)合,形成snRNP(小核核糖體蛋白顆粒)第7頁,共25頁,2024年2月25日,星期天三、剪接蛋白酵母中有30多種剪接蛋白1.SR蛋白含Ser和Arg二肽重復(fù)序列,在hnRNA剪接中起重要作用。廣泛存在于動(dòng)物、部分植物;分子量10-50KD.2.與多聚嘧啶串結(jié)合的蛋白現(xiàn)發(fā)現(xiàn)的有4種,2種U2輔助因子,多嘧啶串結(jié)合蛋白,串聯(lián)剪接因子。第8頁,共25頁,2024年2月25日,星期天3.snRNP聯(lián)結(jié)蛋白:小核核糖核蛋白顆粒(smallnuclearribonucleoproteinparticles)4.其他蛋白R(shí)NA解旋酶類剪接因子KH結(jié)合域剪接因子第9頁,共25頁,2024年2月25日,星期天四、剪接體Spliceosome,進(jìn)行RNA剪接時(shí)形成的多組分復(fù)合物,其大小為50-60S,主要是由hnRNA、snRNA和蛋白質(zhì)組成。snRNA主要有U1\U2\U3\U4\U5等剪接體的組裝是非常復(fù)雜的過程。第10頁,共25頁,2024年2月25日,星期天第11頁,共25頁,2024年2月25日,星期天第二節(jié)內(nèi)含子的剪接snRNP蛋白結(jié)合到pro-mRNA前體剪接位點(diǎn),促進(jìn)U2snRNP結(jié)合到分支序列,SR蛋白發(fā)揮跨內(nèi)含子識(shí)別功能。真核基因內(nèi)含子長度差異很大,剪接裝置需要在巨大的內(nèi)含子RNA中識(shí)別小小的外顯子。第12頁,共25頁,2024年2月25日,星期天一、剪接體參與的內(nèi)含子共有序列的識(shí)別和剪接復(fù)合體的組裝U1snRNP首先識(shí)別內(nèi)含子的5端剪接位點(diǎn),U2snRNP識(shí)別分支位點(diǎn),確定要被刪除的內(nèi)含子。隨后,U5snRNP取代U1snRNP,U6snRNP取代U2snRNP。形成活性60s剪接體。發(fā)生轉(zhuǎn)脂反應(yīng),切去RNA前體的內(nèi)含子,連接相鄰?fù)怙@子。第13頁,共25頁,2024年2月25日,星期天剪接過程第14頁,共25頁,2024年2月25日,星期天第15頁,共25頁,2024年2月25日,星期天第16頁,共25頁,2024年2月25日,星期天二、自我剪接機(jī)制I型內(nèi)含子剪接機(jī)制I型內(nèi)含子具有自我剪接的功能。在剪接反應(yīng)中,要有鳥嘌呤核苷的輔助。有9個(gè)由堿基配對(duì)形成的特定二級(jí)結(jié)構(gòu)。2.II型內(nèi)含子主要存在于線粒體中的一類自我剪接內(nèi)含子,遵從GT--AG規(guī)律。6個(gè)結(jié)構(gòu)域可形成發(fā)夾環(huán)。不需要鳥苷的輔助。第17頁,共25頁,2024年2月25日,星期天I型內(nèi)含子第18頁,共25頁,2024年2月25日,星期天I型內(nèi)含子第19頁,共25頁,2024年2月25日,星期天第3節(jié)變位剪接和反式剪接常規(guī)剪接形式:剪接體參與的主要剪接方式內(nèi)含子自我剪接非常規(guī)剪接形式:變位剪接(選擇性剪接)反式剪接第20頁,共25頁,2024年2月25日,星期天變位剪接(選擇性剪接):是指從一個(gè)hnmRNA通過不同的剪接方式產(chǎn)生不同的成熟mRNA,產(chǎn)生不同的蛋白質(zhì)表型。人類基因組約有35000個(gè)基因,其中有約40%一60%的基因存在變位剪接過程。反式剪接:指的是兩條不同的mRNA的外顯子連接到一起。與正常的順式剪接不同,“經(jīng)典”反式剪接見于錐蟲和線蟲,近期在人類身上也發(fā)現(xiàn)了反式剪接。第21頁,共25頁,2024年2月25日,星期天一、變位剪接(選擇性剪接)1.基本形式:改變常規(guī)剪接位點(diǎn),相同的hnmRNA產(chǎn)生多個(gè)成熟mRNA。存在多個(gè)潛在剪接位點(diǎn)。外顯子剪接位點(diǎn)選擇性剪接內(nèi)含子剪接位點(diǎn)選擇性剪接外顯子的選擇保留或切除多個(gè)外顯子的可變拼接內(nèi)含子的可變保留第22頁,共25頁,2024年2月25日,星期天2.剪接的發(fā)生方式組織特異性可變剪接誘導(dǎo)變位剪接3.變位剪接的調(diào)控多種順式作用元件:如,ESE(外顯子剪接增強(qiáng)子),ESS(外顯子剪接沉默子),ISE(內(nèi)含子剪接增強(qiáng)子),ISS。多種反式作用因子:SR蛋白等。二、反式剪接第23頁,共25頁,2024年2月25日,星期天第四節(jié)RNA編輯一、RNA編輯的概念:是指mRNA分子中,由于核苷酸的缺失,插入或置換,基因轉(zhuǎn)錄物的序列不與基因編碼序列互補(bǔ),使翻譯生成的蛋白質(zhì)的氨基酸組成,不同于基因序列中的編碼信息現(xiàn)象。最早在原生動(dòng)物椎蟲線粒體中發(fā)現(xiàn)。第24頁,共25頁,2024年2月25日,星期天二
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