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微生物的代謝調(diào)控(4)主講老師:陳健凱第二節(jié)、微生物的代謝調(diào)控
微生物通過對(duì)其代謝的調(diào)節(jié),經(jīng)濟(jì)地利用有限的養(yǎng)料、能量進(jìn)行著它所需要的酶促反應(yīng),從而使得它們的生命活動(dòng)得以正常進(jìn)行。在正常情況下,微生物是絕不會(huì)浪費(fèi)能量和原料去進(jìn)行它不需要的代謝反應(yīng)的。微生物正是依靠其代謝調(diào)節(jié)嚴(yán)格又靈活的調(diào)節(jié)系統(tǒng)才能有高效、經(jīng)濟(jì)的代謝,從而在復(fù)雜多變的環(huán)境條件下生存和發(fā)展的。有兩種主要的代謝調(diào)節(jié)方式:一種是酶合成的調(diào)節(jié),即調(diào)節(jié)酶的合成量,這是一種“粗調(diào)”另一種是酶活力調(diào)節(jié),即調(diào)節(jié)已有的酶的活力,這是一種“細(xì)調(diào)”微生物通過對(duì)其系統(tǒng)的“粗調(diào)”和“細(xì)調(diào)”從而達(dá)到最佳的調(diào)節(jié)效果兩種主要的代謝調(diào)節(jié)方式一、代謝速度的調(diào)控
1、酶量(粗調(diào)):通過酶量的變化來控制代謝的速率。(從本質(zhì)上看,酶合成的調(diào)節(jié)是在基因表達(dá)水平上起作用的)(1)酶合成的誘導(dǎo)協(xié)同誘導(dǎo):一種誘導(dǎo)劑可以同時(shí)誘導(dǎo)產(chǎn)生若干種酶的現(xiàn)象順序誘導(dǎo):一種誘導(dǎo)劑誘導(dǎo)產(chǎn)生的酶的反應(yīng)產(chǎn)物可繼續(xù)誘導(dǎo)產(chǎn)生下一個(gè)酶,這種連續(xù)誘導(dǎo)產(chǎn)生一系列酶的現(xiàn)象稱為順序誘導(dǎo)。一、代謝速度的調(diào)控終點(diǎn)產(chǎn)物反饋?zhàn)瓒簦汉铣纱x過程中,相關(guān)酶的合成被過量終點(diǎn)產(chǎn)物所阻遏01分解代謝物阻遏:可被組成酶快速利用的基質(zhì),阻遏了分解難利用基質(zhì)的酶的合成02酶合成的阻遏一、代謝速度的調(diào)控(3)酶合成調(diào)節(jié)的遺傳機(jī)制:操縱子學(xué)說
操縱子是指基因組DNA分子的一個(gè)片段,這個(gè)片斷由啟動(dòng)子、調(diào)節(jié)基因、操縱基因和結(jié)構(gòu)基因組成誘導(dǎo)型操縱子:效應(yīng)物存在導(dǎo)致基因表達(dá)阻遏型操縱子:效應(yīng)物存在導(dǎo)致基因表達(dá)的關(guān)閉一、代謝速度的調(diào)控
例如過量的精氨酸阻遏了參與生物合成精氨酸的許多酶的合成。終產(chǎn)物阻遏在代謝調(diào)節(jié)中的意義是顯而易見的。它有效地保證了微生物細(xì)胞內(nèi)氨基酸等重要物質(zhì)維持在適當(dāng)濃度,不會(huì)把有限的能量和養(yǎng)料用于合成那些暫時(shí)不需要的酶。一、代謝速度的調(diào)控
醬分解代謝產(chǎn)物阻遏導(dǎo)致所謂“二次生長(zhǎng)”,即先是利用葡萄糖生長(zhǎng),待葡萄糖耗盡后,再利用另一種底物生長(zhǎng),兩次生長(zhǎng)中間隔著一個(gè)短暫的停滯期。這是因?yàn)槠咸烟呛谋M后,它的分解代謝產(chǎn)物阻遏作用解除,經(jīng)過一個(gè)短暫的適應(yīng)期,β-半乳糖苷酶等分解利用乳糖的酶被誘導(dǎo)合成,這時(shí)細(xì)菌便利用乳糖進(jìn)行第二次生長(zhǎng)。葡萄糖對(duì)氨基酸的分解利用也有類似的阻遏作用。一、代謝速度的調(diào)控
1.一些主要術(shù)語(1)操縱子是指由啟動(dòng)基因(或稱啟動(dòng)子)、操縱基因和結(jié)構(gòu)基因組成的一個(gè)完整的基因表達(dá)單位,其功能是轉(zhuǎn)錄mRNA。操縱子是受調(diào)節(jié)基因調(diào)控的。啟動(dòng)基因是RNA聚合酶識(shí)別、結(jié)合并起始mRNA轉(zhuǎn)錄的一段DNA堿基序列。一、代謝速度的調(diào)控
操縱基因是位于啟動(dòng)基因和結(jié)構(gòu)基因之間的堿基序列,能與阻遏蛋白(一種調(diào)節(jié)蛋白)相結(jié)合。如操縱基因上結(jié)合有阻遏蛋白,轉(zhuǎn)錄就受阻;如操縱基因上沒有阻遏蛋白結(jié)合著,轉(zhuǎn)錄便順利進(jìn)行,所以操縱基因就像一個(gè)“開關(guān)”似的操縱著mRNA的轉(zhuǎn)錄。結(jié)構(gòu)基因是操縱子中編碼酶蛋白的堿基序列。一、代謝速度的調(diào)控
(1)乳糖操縱子的誘導(dǎo)機(jī)制E.coli乳糖操縱子由lac啟動(dòng)基因、lac操縱基因和3個(gè)結(jié)構(gòu)基因所組成。乳糖操縱子是負(fù)調(diào)節(jié)的代表。在缺乏乳糖等誘導(dǎo)物時(shí),其調(diào)節(jié)蛋白(即lac阻遏蛋白)一直結(jié)合在操縱基因上,抑制著結(jié)構(gòu)基因進(jìn)行轉(zhuǎn)錄。當(dāng)有誘導(dǎo)物乳糖存在時(shí),乳糖與lac阻遏蛋白相結(jié)合,后者發(fā)生構(gòu)象變化,結(jié)果降低了lac阻遏蛋白與操縱基因間的親和力,使它不能繼續(xù)結(jié)合在操縱子上。一、代謝速度的調(diào)控
其操縱子的“開關(guān)”被打開,轉(zhuǎn)錄和轉(zhuǎn)譯順利進(jìn)行。當(dāng)誘導(dǎo)物耗盡后,lac阻遏蛋白再次與操縱基因相結(jié)合,這時(shí)轉(zhuǎn)錄的“開關(guān)”被關(guān)閉,酶就無法合成,同時(shí),細(xì)胞內(nèi)已轉(zhuǎn)錄好的mRNA也迅速地被核酸內(nèi)切酶所水解,所以細(xì)胞內(nèi)酶的量急劇下降。如果通過誘變方法使之發(fā)生lac阻遏蛋白缺陷突變,就可獲得解除調(diào)節(jié)即在無誘導(dǎo)物時(shí)也能合成β-半乳糖苷誘導(dǎo)酶的突變株。一、代謝速度的調(diào)控
lac操縱子還受到另一種調(diào)節(jié)即正調(diào)節(jié)的控制。這就是當(dāng)?shù)诙N調(diào)節(jié)蛋白CRP(cAMP受體蛋白)或CAP(降解物激活蛋白)直接與啟動(dòng)基因結(jié)合時(shí),RNA多聚酶才能連接到DNA鏈上而開始轉(zhuǎn)錄。CRP與cAMP的相互作用,會(huì)提高CRP與啟動(dòng)基因的親和性。葡萄糖會(huì)抑制cAMP的形成,從而阻遏了lac操縱子的轉(zhuǎn)錄。一、代謝速度的調(diào)控
(2)色氨酸操縱子的末端產(chǎn)物阻遏機(jī)制色氨酸操縱子的阻遏是對(duì)合成代謝酶類進(jìn)行正調(diào)節(jié)的例子。在合成代謝中,催化氨基酸等小分子末端產(chǎn)物合成的酶應(yīng)隨時(shí)存在于細(xì)胞內(nèi),因此,在細(xì)胞內(nèi)這些酶的合成應(yīng)經(jīng)常處于消阻遏狀態(tài);相反,在分解代謝中的β-半乳糖苷酶等則經(jīng)常處于阻遏狀態(tài)。E.coli色氨酸操縱子也是由啟動(dòng)基因、操縱基因和結(jié)構(gòu)基因3部分組成的。
一、代謝速度的調(diào)控
啟動(dòng)基因位于操縱子的開始處;結(jié)構(gòu)基因上有5個(gè)基因,分別編碼“分支酸→鄰氨基苯甲酸→磷酸核糖鄰氨基苯甲酸→羧苯氨基脫氧核糖磷酸→吲哚甘油磷酸→色氨酸”途徑中的5種酶。其調(diào)節(jié)基因(trpR)遠(yuǎn)離操縱基因,編碼一種稱為阻遏蛋白原的調(diào)節(jié)蛋白。一、代謝速度的調(diào)控
在沒有末端產(chǎn)物色氨酸的情況下,阻遏蛋白原處于無活性狀態(tài),因此操縱基因的“開關(guān)”是打開的,這時(shí)結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄和轉(zhuǎn)譯可正常進(jìn)行,參與色氨酸合成的酶大量合成;反之,當(dāng)有色氨酸存在時(shí),阻遏蛋白原可與輔阻遏物色氨酸結(jié)合成一個(gè)有活性的完全阻遏蛋白,它與操縱基因相結(jié)合,使轉(zhuǎn)錄的“開關(guān)”關(guān)閉,從而無法進(jìn)行結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄和轉(zhuǎn)譯。一、代謝速度的調(diào)控二、酶活力的調(diào)節(jié)酶活調(diào)節(jié)的特點(diǎn)是反應(yīng)快速酶活調(diào)節(jié)的影響因素包括:底物和產(chǎn)物的性質(zhì)和濃度、壓力、pH、離子強(qiáng)度、輔助因子以及其他酶的存在等等一定數(shù)量的酶,通過其分子構(gòu)象或分子結(jié)構(gòu)的改變來調(diào)節(jié)其催化反應(yīng)的速率酶活(細(xì)調(diào)):(1)酶活性的激活02前體激活
代謝途徑中后面的酶促反應(yīng),可被該途徑中較前面的一個(gè)中間產(chǎn)物所促進(jìn)反饋激活代謝中間產(chǎn)物對(duì)該代謝途徑的前面的酶起激活作用01(2)酶活性的抑制
無分支代謝途徑的調(diào)節(jié):通常是在線形的代謝途徑中末端產(chǎn)物對(duì)催化第一步反應(yīng)的酶活性有抑制作用
有分支代謝途徑的調(diào)節(jié):酶的順序反饋抑制;同工酶的反饋抑制;協(xié)同反饋抑制;累積反饋抑制;超相加反饋抑制大多是反饋抑制(3)酶活性調(diào)節(jié)的分子機(jī)制A、別構(gòu)調(diào)節(jié)理論(酶分子構(gòu)象的改變)別構(gòu)酶除了具有與底物結(jié)合的催化中心外,還具有與調(diào)節(jié)劑結(jié)合的調(diào)節(jié)中心。當(dāng)酶與調(diào)節(jié)劑結(jié)合后,酶蛋白的構(gòu)象發(fā)生變化,引起催化中心改變,從而引起酶活性的變化
B、酶分子的化學(xué)修飾理論(酶分子結(jié)構(gòu)的改變)酶的共價(jià)修飾是酶蛋白在修飾酶催化下,可與某些物質(zhì)發(fā)生共價(jià)鍵的結(jié)合或解離,從而導(dǎo)致調(diào)節(jié)酶的活化或抑制,以控制代謝的速度和方向。如糖原合成酶的磷酸化(高活性)和去磷酸化(低活性)(3)酶活性調(diào)節(jié)的分子機(jī)制
酶活性調(diào)節(jié)是指一定數(shù)量的酶,通過其分子構(gòu)象或分子結(jié)構(gòu)的改變來調(diào)節(jié)其催化反應(yīng)的速率。這種調(diào)節(jié)方式可以使微生物細(xì)胞對(duì)環(huán)境變化作出迅速地反應(yīng)。1
酶活性調(diào)節(jié)受多種因素影響,底物的性質(zhì)和濃度,環(huán)境因子,以及其它酶的存在都有可能激活或控制酶的活性。2
酶活性調(diào)節(jié)的方式主要有兩種:變構(gòu)調(diào)節(jié)和酶分子的修飾調(diào)節(jié)。3A.變構(gòu)調(diào)節(jié)醬在某些重要的生化反應(yīng)中,反應(yīng)產(chǎn)物的積累往往會(huì)抑制催化這個(gè)反應(yīng)的酶的活性,這是由于反應(yīng)產(chǎn)物與酶的結(jié)合抑制了底物與酶活性中心的結(jié)合在一個(gè)由多步反應(yīng)組成的代謝途徑中,末端產(chǎn)物通常會(huì)反饋抑制該途徑的第一個(gè)酶,這種酶通常被稱為變構(gòu)酶(allostericenzyme)例如,合成異亮氨酸的第一個(gè)酶是蘇氨酸脫氨酶,這種酶被其末端產(chǎn)物異亮氨酸反饋抑制。變構(gòu)酶通常是某一代謝途徑的第一個(gè)酶或是催化某一關(guān)鍵反應(yīng)的酶。細(xì)菌細(xì)胞內(nèi)的酵解和三羧酸循環(huán)的調(diào)控也是通過反饋抑制進(jìn)行的。B.修飾調(diào)節(jié)
修飾調(diào)節(jié)是通過共價(jià)調(diào)節(jié)酶來實(shí)現(xiàn)的。共價(jià)調(diào)節(jié)酶通過修飾酶催化其多肽鏈上某些基團(tuán)進(jìn)行可逆的共價(jià)修飾,使之處于活性和非活性的互變狀態(tài),從而導(dǎo)致調(diào)節(jié)酶的活化或抑制,以控制代謝的速度和方向
目前已知有多種類型的可逆共價(jià)調(diào)節(jié)蛋白:磷酸化/去磷酸化;乙酰化/去乙?;?;腺苷酰化/去腺苷?;荒蜍挣;?去尿苷?;?;甲基化/去甲基化;S-S/SH相互轉(zhuǎn)變;ADPR化/去ADPR化等B.修飾調(diào)節(jié)
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