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可變剪切對基因進化模式和功能的影響,張亮生 ,動植物存在大量的可變剪切,人體不同組織中,95%的多外顯子基因存在可變剪切 水稻48%的基因存在可變剪切 可變剪切有組織特異性 How,what,and why?,Pan, et al Nature Genetics, 2009 Lu, et al Genome Res, 2010,已知可變剪切的功能,可變剪切調(diào)控基因的功能 基因的可變剪切導致疾病的發(fā)生 在基因進化過過程中可變剪切起著重要的作用 還有其他功能?,用新一代測序?qū)蜃⑨?新一代測序技術(shù)是發(fā)現(xiàn)可變剪切的有效手段 可變剪切注釋策略 1.全長基因和cDNA同時Mapping 2.設(shè)計算法? 參數(shù):Mismatch等等 數(shù)據(jù)庫?,基因復制(進化)與可變剪切,重復基因的可變剪切分析 (1).Segmental duplication (2).Tandem duplication (3).Retroposition 單拷貝基因可變剪切情況 外顯子化 基因可變剪切事件的起源和演化,可變剪切與基因家族,那些基因家族容易發(fā)生可變剪切,可變剪切在不同基因家族中有偏好性? 成員多的基因家族容易發(fā)生可變剪切? 那些功能基因容易發(fā)生可變剪切?,非常謝謝大家的聆聽,科學網(wǎng)博客:http:/www.scien
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