基因檢測(cè)行業(yè)調(diào)研_第1頁(yè)
基因檢測(cè)行業(yè)調(diào)研_第2頁(yè)
基因檢測(cè)行業(yè)調(diào)研_第3頁(yè)
基因檢測(cè)行業(yè)調(diào)研_第4頁(yè)
基因檢測(cè)行業(yè)調(diào)研_第5頁(yè)
已閱讀5頁(yè),還剩8頁(yè)未讀, 繼續(xù)免費(fèi)閱讀

下載本文檔

版權(quán)說(shuō)明:本文檔由用戶(hù)提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請(qǐng)進(jìn)行舉報(bào)或認(rèn)領(lǐng)

文檔簡(jiǎn)介

1、基 因 檢 測(cè) 行 業(yè) 調(diào) 研繼上次基因檢測(cè)產(chǎn)業(yè)調(diào)研之后,這兩周我們?cè)俅握{(diào)研了幾家基因檢測(cè)公司,并且拜訪了一些行業(yè)專(zhuān)家,現(xiàn)將調(diào)研的重點(diǎn)內(nèi)容整理如下,歡迎大家交流探討。一、基因檢測(cè)公司梳理目前全國(guó)涉及基因檢測(cè)概念的公司有200余家,按照業(yè)務(wù)范圍劃分,這些公司可以分為:最上游的基因檢測(cè)儀器開(kāi)發(fā)企業(yè)(測(cè)序儀、芯片掃描儀、PCR備),提供樣本處理試劑和耗材的中上游企業(yè)(建庫(kù)試劑盒、檢測(cè)試劑盒、工具酶、基因芯片),提供第三方基 因檢測(cè)服務(wù)的中游企業(yè),提供測(cè)序數(shù)據(jù)存儲(chǔ)、分析和出具報(bào)告的下游企業(yè),還有將這三 部分整合起來(lái)提供 CRO!務(wù)的商業(yè)公司,當(dāng)然如果公司研發(fā)實(shí)力和經(jīng)濟(jì)實(shí)力允許,大部分公司會(huì)選擇向上下游

2、產(chǎn)業(yè)鏈延伸,進(jìn)一步提升自己的盈利能力。按照基因檢測(cè)公司的服務(wù)內(nèi)容,主要可以分為四類(lèi):科研服務(wù)、第三方臨床基因檢測(cè)服務(wù)、 直接面向個(gè)人的檢測(cè)服務(wù)、非醫(yī)療基因檢測(cè)服務(wù)(例如食品、環(huán)境、刑偵等方面的應(yīng)用)。1科研中的基因檢測(cè)服務(wù)又分為兩種情況,第一種是純科研服務(wù), 檢測(cè)目的純粹是滿(mǎn)足科研需要,不作為醫(yī)學(xué)診斷的依據(jù);第二種是以科研的名義為患者提供醫(yī)學(xué)診斷服務(wù),醫(yī)生在其中起主導(dǎo)作用,推薦有需要的患者去做基因檢測(cè),醫(yī)生在其中所獲得的好處是得到用藥指導(dǎo)依據(jù)、科研數(shù)據(jù)、獲得銷(xiāo)售提成,這是當(dāng)前腫瘤基因測(cè)序普遍采用的手段,因?yàn)槟壳皣?guó)內(nèi) 還沒(méi)有一種獲批臨床的腫瘤高通量檢測(cè)試劑盒,只能以科研的形式變相的進(jìn)行醫(yī)學(xué)診斷從

3、而獲取收益。純科研基因檢測(cè)市場(chǎng)在百億級(jí)別。2第三方臨床檢測(cè)機(jī)構(gòu)是指批準(zhǔn)為醫(yī)院提供檢測(cè)外包服務(wù)的獨(dú)立醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室,大部分第三方臨檢機(jī)構(gòu)都能開(kāi)展分子診斷服務(wù)(需通過(guò)臨檢中心的PCR實(shí)驗(yàn)室認(rèn)證),例如 QPCRddPCR基因芯片等,但是高通量測(cè)序在臨床檢測(cè)上的應(yīng)用當(dāng)前受到限制,只有在試點(diǎn)名單 上的機(jī)構(gòu)才能出具正式的臨檢報(bào)告,目前出臺(tái)了第一批四個(gè)領(lǐng)域的試點(diǎn)名單,分別是遺傳 病診斷、產(chǎn)前篩查與診斷、植入前胚胎遺傳學(xué)診斷、腫瘤基因測(cè)序,試點(diǎn)單位名單由衛(wèi)計(jì)委 醫(yī)政醫(yī)管局和婦幼司共同制定。臨床基因檢測(cè)的市場(chǎng)空間在千億級(jí)別。3提供面向個(gè)人基因檢測(cè)服務(wù)的商業(yè)公司,提供的是非診斷性基因檢測(cè),例如23andMe是美

4、國(guó)本地唯一一家被 FDA批準(zhǔn)的能夠直接向個(gè)人提供基于基因檢測(cè)分析服務(wù)公司,業(yè)務(wù)范圍也僅僅提供祖源分析、遺傳病篩查、酒精耐受、基因?qū)びH這四類(lèi)遺傳分析服務(wù),23andMe此前的疾病風(fēng)險(xiǎn)篩查和藥物過(guò)敏分析被禁止,而我國(guó)有許多直接面向個(gè)人的基因檢測(cè)商業(yè)機(jī)構(gòu), 業(yè)務(wù)范圍甚至包括疾病風(fēng)險(xiǎn)、天賦基因、個(gè)性特征分析等一系列基因分析服務(wù),未來(lái)有加強(qiáng)監(jiān)管和整合的壓力。商業(yè)化B2c基因檢測(cè)的市場(chǎng)空間在十億級(jí)別。4非醫(yī)療基因檢測(cè)服務(wù)的應(yīng)用包括食品、環(huán)境微生物、刑偵檢測(cè)、檢驗(yàn)檢疫等方面,主要由非醫(yī)學(xué)的商業(yè)檢測(cè)中心來(lái)開(kāi)展,主要采用的技術(shù)是熒光定量PCR基因芯片,測(cè)序技術(shù)用得較少。例如中德美聯(lián)是法醫(yī) DNA檢測(cè)領(lǐng)域的龍頭,

5、主要采用熒光 PC敬術(shù),法醫(yī)DNA僉測(cè) 的市場(chǎng)空間在20億左右,但是全國(guó)共有 700多個(gè)司法檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室,有一定的整合難度。整體來(lái)看非醫(yī)療基因檢測(cè)服務(wù)是碎片化市場(chǎng),涉及領(lǐng)域多,空間在百億級(jí)別。當(dāng)然我們重點(diǎn)關(guān)注的還是基因檢測(cè)在醫(yī)學(xué)診斷上的運(yùn)用,這個(gè)領(lǐng)域受眾廣,附加值高,市 場(chǎng)空間大。二、基因檢測(cè)行業(yè)到底如何監(jiān)管?我國(guó)基因產(chǎn)業(yè)處在市場(chǎng)興起的初期階段,監(jiān)管制度還十分不完善,給人的感覺(jué)十分混亂。2014年以前,我國(guó)基因測(cè)序行業(yè)處于無(wú)監(jiān)管狀態(tài);2014年2月,CFDAA衛(wèi)計(jì)委叫停所有基因測(cè)序業(yè)務(wù),對(duì)行業(yè)進(jìn)行集中整頓;2014年3月,衛(wèi)計(jì)委發(fā)布關(guān)于開(kāi)展高通量基因檢測(cè)技術(shù)臨床應(yīng)用試點(diǎn)單位申報(bào)工作的通知,通知要

6、求已經(jīng)開(kāi)展高通量基因測(cè)序技術(shù),且符合申報(bào)規(guī)定條件的醫(yī)療機(jī)構(gòu)可以申請(qǐng)?jiān)圏c(diǎn),同時(shí)明確申請(qǐng)?jiān)圏c(diǎn)的基因測(cè)序項(xiàng)目。2014年12月,衛(wèi)計(jì)委醫(yī)政醫(yī)管局發(fā)布遺傳病診斷、產(chǎn)前篩查與診斷、植入前胚胎遺傳學(xué)診斷這三個(gè)專(zhuān)業(yè)的 第一批基因測(cè)序臨床試點(diǎn)名單;隨后2015年1月,衛(wèi)計(jì)委婦幼司正式批準(zhǔn)108家醫(yī)療服務(wù)機(jī)構(gòu)開(kāi)展NIPT高通量測(cè)序技術(shù)臨床試點(diǎn), 并審核通過(guò)13家機(jī)構(gòu)開(kāi)展植入前胚胎遺傳學(xué)診斷 臨床試點(diǎn);2015年3月,醫(yī)政醫(yī)管局發(fā)布了第一批腫瘤診斷與治療項(xiàng)目高通量測(cè)序臨床試 點(diǎn)名單。此后CFDA!準(zhǔn)了幾款用于高通量測(cè)序的儀器、檢測(cè)試劑等。那么基因檢測(cè)產(chǎn)業(yè)到底由誰(shuí)監(jiān)管,怎么監(jiān)管,監(jiān)管的范圍是什么?我們做了以下梳理。

7、監(jiān)管部門(mén):整個(gè)基因檢測(cè)行業(yè)涉及細(xì)分產(chǎn)業(yè)眾多,包括醫(yī)院、臨檢中心、儀器試劑、商業(yè)公 司、不同的技術(shù)平臺(tái)等,所以涉及的監(jiān)管部門(mén)也較多。發(fā)改委,從宏觀上制定基因檢測(cè)產(chǎn)業(yè)的發(fā)展規(guī)劃:2015年6月,發(fā)改委發(fā)布國(guó)家發(fā)展改革委關(guān)于實(shí)施新興產(chǎn)業(yè)重大工程 包的通知,其中提到要重點(diǎn)發(fā)展基因檢測(cè)等新型醫(yī)療技術(shù),并將在3年時(shí)間內(nèi)建設(shè)30個(gè)基因檢測(cè)技術(shù)應(yīng)用示范中心,快速推進(jìn)基因檢測(cè)臨床應(yīng)用以及基因檢測(cè)儀器試劑的國(guó)產(chǎn)化; 此外地方發(fā)改委還參與基因檢測(cè)項(xiàng)目的定價(jià),例如四川發(fā)改委定價(jià)無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前2400元/次。衛(wèi)計(jì)委主要是對(duì)開(kāi)展基因檢測(cè)機(jī)構(gòu)的資質(zhì)進(jìn)行審查和規(guī)范,具體由三個(gè)部分監(jiān)管,分別是 醫(yī)政醫(yī)改局、婦幼司、臨檢中心:醫(yī)政醫(yī)改

8、局先后發(fā)布遺傳病診斷、產(chǎn)前篩查與診斷、植入前胚胎遺傳學(xué)診斷、腫瘤診斷與治療這四個(gè)專(zhuān)業(yè)的第一批基因測(cè)序臨床試點(diǎn)名單,藥物代謝酶和藥物作用靶點(diǎn)基因檢測(cè)技術(shù)指南(試行),腫瘤個(gè)體化治療檢測(cè)技術(shù)指南(試行)等規(guī)范;婦幼司則針對(duì)產(chǎn)前檢測(cè)在醫(yī)政醫(yī)改局試點(diǎn)名單的基礎(chǔ)上增加了108家醫(yī)療服務(wù)機(jī)構(gòu)開(kāi)展NIPT高通量測(cè)序技術(shù)臨床試點(diǎn),并審核通過(guò)13家機(jī)構(gòu)開(kāi)展植入前胚胎遺傳學(xué)診 斷臨床試點(diǎn);臨檢中心的職責(zé)是承擔(dān)臨床檢驗(yàn)質(zhì)量管理與控制工作,運(yùn)行全國(guó)臨床檢驗(yàn)室間質(zhì)量評(píng)價(jià)計(jì)劃,建立、應(yīng)用臨床檢驗(yàn)參考系統(tǒng),對(duì)開(kāi)展基因檢測(cè)服務(wù)的醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行評(píng)估和驗(yàn)收,例如。CFDA對(duì)基因檢測(cè)鏈上的儀器、試劑、分析軟件進(jìn)行監(jiān)管,例如EGFR

9、KRAS BRAF C-KIT、CYP2C9 CYP2C14基因的檢測(cè)試劑盒、基因芯片等;在高通量測(cè)序方面,CFDAt后批準(zhǔn)了幾款應(yīng)用于 NIPT的測(cè)序儀和檢測(cè)試劑,但是在腫瘤的診斷方面,目 前還沒(méi)有高通量測(cè)序儀和高通量檢測(cè)試劑盒獲批,試點(diǎn)單位只能以自制試劑(LDTs)的形式開(kāi)展檢測(cè)。技術(shù)的監(jiān)管:基因檢測(cè)中的技術(shù)平臺(tái)主要有PCR(qPCR ddPCR、FISH (熒光原位雜交技術(shù))、基因芯片、測(cè)序(一代測(cè)序、高通量測(cè)序),目前除高通量測(cè)序臨床服務(wù)制訂了限制政策,只有試點(diǎn)單位才能出具臨檢報(bào)告,其他基因檢測(cè)技術(shù),如 PCR FISH、一代測(cè)序等 的使用沒(méi)有限制,臨檢單位只要通過(guò)了 PCR實(shí)驗(yàn)室、病

10、理學(xué)實(shí)驗(yàn)室認(rèn)證就可以應(yīng)用這些技術(shù)。機(jī)構(gòu)的監(jiān)管:什么樣的機(jī)構(gòu)能夠開(kāi)展高通量測(cè)序臨床服務(wù)?除了醫(yī)政醫(yī)改局和婦幼司發(fā)布的 試點(diǎn)高通量基因測(cè)序技術(shù)臨床試點(diǎn)單位名單外,還有衛(wèi)計(jì)委批準(zhǔn)的“個(gè)體化醫(yī)學(xué)檢測(cè)試點(diǎn)單位“(業(yè)內(nèi)常簡(jiǎn)稱(chēng)為L(zhǎng)DT試點(diǎn)),首批試點(diǎn)單位包括中南大學(xué)湘雅醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)所、北京博奧醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)所和中國(guó)醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院這3家機(jī)構(gòu),個(gè)體化醫(yī)學(xué)檢測(cè)試點(diǎn)的廣度和范疇,要高于高通量基因測(cè)序試點(diǎn);此外還有一些地方衛(wèi)生部門(mén)所批準(zhǔn)成立的檢驗(yàn)所,例如“南京高新精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)所”。但是即使沒(méi)有這些資質(zhì),測(cè)序服務(wù)機(jī)構(gòu)也能以科研報(bào)告的形式提供檢測(cè)服務(wù)(規(guī)避醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)的限制),或者與試點(diǎn)醫(yī)院成立聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室,享受利潤(rùn)分成。這些都折

11、射出當(dāng)前我國(guó)基因行業(yè)監(jiān)管的不成熟,美國(guó)臨檢機(jī)構(gòu)采取的是CLIA/CAP認(rèn)證的形式,很大可能我國(guó)未來(lái)也會(huì)采取類(lèi)似的認(rèn)證資質(zhì)。應(yīng)用領(lǐng)域的監(jiān)管:目前高通量測(cè)序臨床上的應(yīng)用還只能試點(diǎn)應(yīng)用于遺傳病診斷、產(chǎn)前篩查與診斷、植入前胚胎遺傳學(xué)診斷和腫瘤診斷與治療四個(gè)專(zhuān)業(yè)方向。但是在心血管領(lǐng)域、 感染性疾病、腸道微生物宏基因組學(xué)等領(lǐng)域,二代測(cè)序都有良好的應(yīng)用前景,當(dāng)前的臨床高通量測(cè)序試點(diǎn)只是LDT試點(diǎn)在某個(gè)專(zhuān)業(yè)方向的具體應(yīng)用,未來(lái)應(yīng)用領(lǐng)域會(huì)越來(lái)越廣。儀器試劑的監(jiān)管:由CFDAt行審批,高通量測(cè)序中需要申報(bào)的有測(cè)序儀(綁定上機(jī)試劑)、建庫(kù)試劑盒、檢測(cè)試劑盒、分析軟件等。NIPT方面,CFDAt后批準(zhǔn)了華大基因 (B

12、GISEQ-100 基于life 的Ion Torrent技術(shù)、BGISEQ-1000基于華大基因之前收購(gòu)的 Complete Genomics 的測(cè)序技術(shù))、達(dá)安基因( DA Proton基于life 的Ion Torrent 技術(shù))、博奧生物(BioelectronSeq 4000 基于 life 的 Ion Torrent 技術(shù))、貝瑞和康(與 Illumina 合作的 NextSeq CN500)的NIPT二代基因測(cè)序儀和配套試劑(13、18、21號(hào)染色體三體檢測(cè)試劑 盒、上機(jī)測(cè)序試劑);在腫瘤方面,目前目前還沒(méi)有高通量測(cè)序儀和高通量檢測(cè)試劑盒獲批, 試點(diǎn)單位只能以自制試劑(LDTs)

13、的形式開(kāi)展檢測(cè)服務(wù)。從長(zhǎng)遠(yuǎn)來(lái)看,多目標(biāo)基因panel(幾十上百個(gè)基因或靶點(diǎn))高通量檢測(cè)試劑盒基本沒(méi)有獲批的可能,因?yàn)槲稽c(diǎn)突變率很低,很難找到足夠的病人開(kāi)展臨床試驗(yàn),并且檢測(cè)結(jié)果也無(wú)法去驗(yàn)證,所以這類(lèi)試劑盒只能以 LTDs的形式在臨檢實(shí)驗(yàn)室使用,無(wú)法外售;而少量目標(biāo)基因(數(shù)個(gè)基因,少量突變位點(diǎn)) 的檢測(cè)試劑盒可能會(huì)被CFDAIT批,但是從檢測(cè)成本來(lái)說(shuō),少量目標(biāo)基因的檢測(cè)成本不會(huì)比多目標(biāo)基因檢測(cè)低,所以終端價(jià)格相差不大,當(dāng)與多目標(biāo)基因panel 一起進(jìn)行市場(chǎng)推廣的時(shí)候,并不具有優(yōu)勢(shì)??偨Y(jié):當(dāng)前國(guó)內(nèi)高通量測(cè)序在臨床上的應(yīng)用監(jiān)管還很不成熟,試點(diǎn)名單是名義上具有出具臨床檢驗(yàn)報(bào)告資質(zhì)的機(jī)構(gòu), 并不是其他機(jī)

14、構(gòu)開(kāi)展測(cè)序服務(wù)的限制條件(能以科研的形式開(kāi)展服務(wù)),儀器、試劑的審批也不具備限制性,市場(chǎng)處于洗牌階段,基因檢測(cè)公司需要積極進(jìn)行兩手準(zhǔn)備,一方面籌備臨檢資質(zhì)的申報(bào),積極布局醫(yī)院終端,一方面著手儀器、試劑的 審批。我國(guó)未來(lái)可能采取和美國(guó)類(lèi)似的CLIA/CAP審批,優(yōu)先布局醫(yī)院渠道的有望受益。案例(美國(guó) CLIA 認(rèn)證): 在美國(guó),只要通過(guò)了 CLIA ( Clinical Laboratory Improvement Amendments臨床實(shí)驗(yàn)室改進(jìn)法案)認(rèn)證,第三方實(shí)驗(yàn)室就可以根據(jù)市場(chǎng)需求,開(kāi)發(fā)出各種新的診斷試劑或服務(wù),即自建項(xiàng)目或者自制試劑(LDTs)。這種檢測(cè)只能在該實(shí)驗(yàn)室內(nèi)使用,不能外傳

15、或者出售給其他任何實(shí)驗(yàn)室或者醫(yī)療保健機(jī)構(gòu),從而將風(fēng)險(xiǎn)控制在有限的 范圍,因而不需要 FDA的批準(zhǔn)。同時(shí),由于CLIA認(rèn)證的是實(shí)驗(yàn)室,所以并不需要對(duì)每個(gè)新 服務(wù)或產(chǎn)品作出審批申請(qǐng)。醫(yī)院或者病人可以根據(jù)自己的需要,選擇相應(yīng)的診斷項(xiàng)目。這個(gè)政策給了第三方實(shí)驗(yàn)室極大的自由空間,也帶來(lái)了美國(guó)獨(dú)立實(shí)驗(yàn)室的繁榮發(fā)展。CLIA認(rèn)證最獨(dú)特的地方在于,實(shí)驗(yàn)室自建項(xiàng)目即使在沒(méi)有FDA批準(zhǔn)的情況下,也完全可以在其實(shí)驗(yàn)室范圍內(nèi)提供分子檢測(cè)業(yè)務(wù)來(lái)指導(dǎo)臨床。只要是有CLIA執(zhí)照的實(shí)驗(yàn)室,他們自己研發(fā)的制劑、技術(shù)等也可以合法地進(jìn)入臨床,合理收費(fèi) 。這樣做的好處就是:在巨大的醫(yī)療需求、 和日新月異的新技術(shù)面前,所有的CLIA實(shí)

16、驗(yàn)室可以跟據(jù)市場(chǎng)需求,快速地開(kāi)發(fā)出各種新的診斷應(yīng)用。同時(shí),美國(guó)政府不必對(duì)應(yīng)接不暇的每個(gè)新應(yīng)用做出回應(yīng)。而病人可以根據(jù)自己的需要,即時(shí)得到新的診斷服務(wù)。同時(shí)FDA可以選擇FDA認(rèn)為真正好的診斷方法做進(jìn)一步認(rèn)證, 并以FDA的名義發(fā)布認(rèn)證,以加速FDA認(rèn)為好的診斷方法在市場(chǎng)上的應(yīng)用。申報(bào)企業(yè)只要通過(guò)了 CLIA認(rèn)證,并能保證產(chǎn)品的質(zhì)量,那么就可以直接應(yīng)用于臨床上。三、基因測(cè)序重在服務(wù)基因測(cè)序重在服務(wù), 很難單獨(dú)依靠商品(檢測(cè)試劑盒、芯片)來(lái)建立優(yōu)勢(shì),這與免疫診斷、 化學(xué)發(fā)光有所不同,因?yàn)榛驒z測(cè)歸根結(jié)底都是DNA一級(jí)序列的檢測(cè),與二級(jí)、三級(jí)結(jié)構(gòu)無(wú)關(guān),檢測(cè)原理相對(duì)簡(jiǎn)單, 都是通過(guò)DNA引物靶定待測(cè)序

17、列, 然后通過(guò)引物延伸來(lái)實(shí)現(xiàn)序列的 測(cè)定;相反,樣品DNA的提取、建庫(kù)和捕獲的操作倒是比較繁瑣,需要專(zhuān)業(yè)的技術(shù)人員去操作。上游儀器已然被少數(shù)幾個(gè)公司所壟斷,中上游的試劑盒產(chǎn)品并不具有很高的技術(shù)壁壘(當(dāng)然如果能在建庫(kù)環(huán)節(jié)和捕獲環(huán)節(jié)形成明顯技術(shù)優(yōu)勢(shì),或者是開(kāi)發(fā)出效率更高的工具酶,也是很有發(fā)展前景的),而且高通量基因檢測(cè)試劑盒的審批存在較大的不確定性(未來(lái)可能參照美國(guó)CLIA認(rèn)證的方式,具有資質(zhì)的檢測(cè)機(jī)構(gòu)以 LTDs自制試劑的形式使用,但是不通過(guò)藥監(jiān) 局的審批就無(wú)法對(duì)外銷(xiāo)售),醫(yī)院樣本量有限,先進(jìn)入的肯定會(huì)占據(jù)諸多優(yōu)勢(shì),NIPT市場(chǎng)已經(jīng)接近飽和,腫瘤醫(yī)院的爭(zhēng)奪也日趨白熱化,所以率先通過(guò)服務(wù)來(lái)?yè)屨际袌?chǎng)

18、,這或許是較為穩(wěn)妥的選擇。醫(yī)院是否會(huì)自行購(gòu)置測(cè)序儀開(kāi)展高通量測(cè)序?如果醫(yī)院自己測(cè)序,那么臨檢測(cè)序機(jī)構(gòu)勢(shì)必難以競(jìng)爭(zhēng),所以思考這個(gè)因素是有必要的。這個(gè)問(wèn)題要分開(kāi)來(lái)看,一方面考慮用戶(hù)的數(shù)量和需求,一方面考慮測(cè)序成本。以當(dāng)前高通量測(cè)序用的最廣泛的是NIPT和腫瘤診治為例進(jìn)行分析:在無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前診斷領(lǐng)域,我國(guó)每年的新生兒在1500萬(wàn)人左右,潛在客戶(hù)基數(shù)大,NIPT能夠給出明確的診斷結(jié)果和對(duì)應(yīng)的防治措施,而且結(jié)果關(guān)系到下一代的健康,檢測(cè)價(jià)格在2400元左右,受眾廣泛;此外,NIPT對(duì)測(cè)序的精度要求不是特別高(目前主要是針對(duì)13、18、21號(hào)染色體的三體檢查),檢測(cè)是一個(gè)定量的過(guò)程,通常采用life ion t

19、orrent 平臺(tái)(目前獲批的5款儀器里面3家申報(bào)的是ion torrent ,而且美國(guó)已經(jīng)有機(jī)構(gòu)采用基因芯片來(lái)做 NIPT),很多大型醫(yī)院能夠自行開(kāi)展NIPT服務(wù),第三方測(cè)序機(jī)構(gòu)的目標(biāo)市場(chǎng)應(yīng)該在中小型醫(yī)院。但是高通量測(cè)序在腫瘤領(lǐng)域的應(yīng)用就不太一樣,我國(guó)每年新增腫瘤患者在450萬(wàn)人左右,腫瘤panel測(cè)序的價(jià)格在8千到2萬(wàn)之間,而且現(xiàn)在做腫瘤 panel測(cè)序的患者主要目的是 獲得靶向藥物用藥指導(dǎo),靶向藥物價(jià)格比較昂貴(每個(gè)月的用藥開(kāi)銷(xiāo)在5萬(wàn)左右),所以目標(biāo)人群就更加狹窄了;此外,腫瘤檢測(cè)對(duì)測(cè)序精度要求比較高,主要針對(duì)點(diǎn)突變或者微缺失微重復(fù),對(duì)技術(shù)平臺(tái)的要求高,通常采用Illumina Hise

20、q/next Seq測(cè)序儀,儀器設(shè)備昂貴,并且開(kāi)機(jī)試劑耗材的花費(fèi)高(一次開(kāi)機(jī)在15萬(wàn)左右),如果沒(méi)有足夠的樣本量,基本上每次開(kāi)機(jī)都是虧損;并且腫瘤數(shù)據(jù)的分析比較復(fù)雜,需要專(zhuān)門(mén)的生物信息學(xué)人才和數(shù)據(jù)庫(kù),所以在腫瘤領(lǐng)域(在其他病患更少的領(lǐng)域更是如此),我們認(rèn)為高通量測(cè)序還是以第三方臨 檢機(jī)構(gòu)為主,目標(biāo)市場(chǎng)在大型醫(yī)院。四、液態(tài)活檢技術(shù)(ctDNA、CTC外泌體)要弄清楚液態(tài)活檢(Liquid Biopsy )是什么,可以先了解一下什么是活檢。"活檢”即活 體組織檢查,是指從患者體內(nèi)切取、鉗取或穿刺等取出病變組織,進(jìn)行病理學(xué)檢查的技術(shù)。這是診斷病理學(xué)中最重要的部分,對(duì)絕大多數(shù)送檢病例都能做出

21、明確的組織病理學(xué)診斷,被作為臨床的最后診斷。普通的活檢通常要經(jīng)過(guò)手術(shù)或者穿刺來(lái)獲得組織樣本,而且有時(shí)候 需要反復(fù)多次的進(jìn)行取樣,不僅繁瑣,給患者增加痛苦,而且有時(shí)候取樣不準(zhǔn)確,例如穿 刺有時(shí)取到正常組織。而液態(tài)活檢是對(duì)患者血液中的游離的標(biāo)志物進(jìn)行檢查,不僅取樣更 加方便,而且能夠在疾病的更早期獲得檢測(cè)結(jié)果。液體活檢對(duì)于我們來(lái)說(shuō)其實(shí)并不陌生,例如目前已經(jīng)較為成熟的NIPT就是液體活檢技術(shù),以前要對(duì)胎兒進(jìn)行檢測(cè)要進(jìn)行“羊水穿刺”,這會(huì)造成一定的流產(chǎn)風(fēng)險(xiǎn),而NIPT就是對(duì)母體外周血中游離的胎兒 DNA進(jìn)行檢測(cè),從而實(shí)現(xiàn)了無(wú)創(chuàng)檢測(cè)。液態(tài)活檢的另外一大應(yīng)用是癌 癥領(lǐng)域,常規(guī)組織活檢在癌癥診治中有一定的局

22、限性:第一,癌癥有異質(zhì)性,對(duì)于已經(jīng)發(fā) 生轉(zhuǎn)移的癌癥患者而言,僅僅取某個(gè)部位的癌組織,并不能反映患者整體的情況,但是, 對(duì)所有的癌組織都取樣又不好操作;第二,有些患者自身的情況決定了他不適合組織活檢; 第三,有些腫瘤在受到手術(shù)的擾動(dòng)之后,有加速轉(zhuǎn)移的風(fēng)險(xiǎn);第四,即使所有的條件都適 宜,組織活檢的滯后性對(duì)患者的治療也是不利的。癌癥液態(tài)活檢的標(biāo)志物主要有三種:ctDNA、CTG外泌體。4.1 ?看好ctDNA檢測(cè)ctDNA(circulating tumor DNA腳循環(huán)腫瘤 DNA 是人體血漿中游離的 DNA(cell-free DNA cfDNA)的一種,ctDNA是癌細(xì)胞死亡時(shí)產(chǎn)生的DNA碎片

23、,攜帶了大量癌細(xì)胞的信息,因此通過(guò)分析血液ctDNA,可以了解患者癌細(xì)胞的突變情況。這些突變的信息能夠反映患者體內(nèi) 癌癥的進(jìn)展情況,以及為患者選擇合適的治療藥物。ctDNA檢測(cè)的技術(shù)平臺(tái):目前在ctDNA檢測(cè)領(lǐng)域潛力最大的技術(shù)平臺(tái)是第二代測(cè)序( NGS和數(shù)字PGR(ddPGR ,這兩個(gè)技術(shù)靈敏度較高,保證了檢出下限,ctDNA含量很低,大多低于cfDNA總量的1%其他技術(shù)很難從正常組織DNA中檢測(cè)出異常的ctDNA。雖然目前也有研究用qPG序口基因芯片(產(chǎn)前檢測(cè))檢測(cè)ctDNA的,但是靈敏度肯定還是大大低于NG序口 ddPGR而且隨著未來(lái)靶向藥物數(shù)量的增加,對(duì)檢測(cè)通量會(huì)有更高的要求,這或許會(huì)限

24、制低通量檢測(cè)技術(shù)的應(yīng)用。需要注意的是ddPGR qPGR基因芯片都只能檢測(cè)已知突變位點(diǎn)。ctDNA高通量測(cè)序中的主要技術(shù):1 cfDNA的提取,有慮柱法(以 Qiagen為主)和磁珠法兩種,如果是ctDNA檢測(cè)那么一般 采用Qiagen的慮柱法,因?yàn)樘崛⌒矢?,而且ctDNA測(cè)序所需的外周血量大,一般為5mL;磁珠法可以用于 NIPT的檢測(cè),因?yàn)槟阁w中胎兒游離的DNAS比較豐富,可以達(dá)到母體外周血中cfDNA總量的10%磁珠法的優(yōu)勢(shì)是簡(jiǎn)單快速,所需的外周血低至0.1mL。2在cfDNA中篩選ctDNA,有兩種方法:第一種是多重?cái)U(kuò)增子技術(shù),即針對(duì)要檢測(cè)的癌癥相關(guān)基因涉及相應(yīng)的引物,通過(guò)引物擴(kuò)增來(lái)

25、獲得目標(biāo)序列,這種方法的好處是能夠通過(guò)擴(kuò)增提高檢出下限,但是多重?cái)U(kuò)增涉及到反應(yīng)均一性的問(wèn)題,所以一般用于幾十個(gè)目標(biāo)基因的檢測(cè);第二種方法是捕獲技術(shù),設(shè)計(jì)探針直接從提取的 cfDNA中找到ctDNA,然后通過(guò)載體將探針與ctDNA復(fù)合物拉下來(lái),再進(jìn)行分離,當(dāng)前的捕獲效率一般在70%£右;捕獲技術(shù)的優(yōu)點(diǎn)是可以設(shè)計(jì)大量的探針,目標(biāo)基因可以達(dá)到上千個(gè)。3當(dāng)前測(cè)序公司 ctDNA的測(cè)序深度在2000x到20000x左右,所采用的技術(shù)平臺(tái)主要是 Illumina 的 Hiseq/NextSeq 以及 life 的 ion Proton ,據(jù)調(diào)研反饋,Illumina 技術(shù)平臺(tái)的 穩(wěn)定T比Life

26、的要好一些,有公司正在籌備拿Illumina 的NextSeq和life 的ion Proton向GFDA申請(qǐng)腫瘤測(cè)序?qū)徟?。ctDNA在腫瘤診治中的廣闊前景:1?腫瘤實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè),ctDNA的含量與腫瘤負(fù)荷及疾病進(jìn)展相關(guān),通過(guò)NGS寸ctDNA進(jìn)行定量分析,可以評(píng)估腫瘤大小變化,實(shí)現(xiàn)疾病實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)。2檢測(cè)腫瘤進(jìn)化(耐藥),通過(guò)高測(cè)序可以檢測(cè)腫瘤的主要突變位點(diǎn)變化,而定點(diǎn)檢測(cè)手段(如ddPCR qPCR ,在評(píng)估和監(jiān)測(cè)腫瘤克隆演化方面具有較大的局限性。3應(yīng)用于腫瘤早期篩查方面,多項(xiàng)研究證明ctDNA在腫瘤早期已經(jīng)存在于外周血中,若與高靈敏度檢測(cè)技術(shù)結(jié)合,將有非常好的腫瘤早期篩查和殘留微病灶(MRD檢測(cè)

27、潛力。4檢測(cè)腫瘤基因分型, 有研究表明ctDNA與組織樣本中得到的檢測(cè)結(jié)果總體吻合率在80%仝右,可以根據(jù)ctDNA的測(cè)序結(jié)果制定用藥策略,比如歐盟于2014年批準(zhǔn)了阿斯利康易瑞沙(Iressa )血液ctDNA伴隨診斷,用于篩查受益人群。國(guó)內(nèi)在ctDNA測(cè)序領(lǐng)域比較靠前的是:思路迪、世和基因、燃石生物、華大基因、貝瑞和 康等。隨著二代測(cè)序技術(shù)的快速發(fā)展,技術(shù)靈敏度和特異性不斷提高,最有希望在臨床得到廣泛應(yīng)用的也許會(huì)是 ctDNA。4.2 CTC檢測(cè)CTC即循環(huán)腫瘤細(xì)胞(Circulating tumor cell,CTC )是指從實(shí)體瘤中脫離出來(lái)并進(jìn)入外周血液循環(huán)的腫瘤細(xì)胞。CTC在患者的血

28、液中的含量實(shí)際上是極低的,大約每100萬(wàn)個(gè)血細(xì)胞(約1mL血液)中才混雜著1個(gè)腫瘤細(xì)胞,因此從血液中捕獲 CTC技術(shù)難度較高。主要的分離方法和免疫治療原理十分類(lèi)似,依靠具有癌細(xì)胞特異性的抗體識(shí)別癌細(xì)胞表面的抗原,從而達(dá)到捕獲癌細(xì)胞的目的。另外,CTC要比血細(xì)胞大,還可以根據(jù)體積大小用“慮篩”的方法分離。CTC的幾種分離方法:CTC的應(yīng)用:已經(jīng)完成及正在進(jìn)行的大量研究顯示,CTC在臨床上具有較大的應(yīng)用價(jià)值。目前,CTC在臨床上的應(yīng)用主要包括以下幾個(gè)方面:早期篩查:研究發(fā)現(xiàn),在早期腫瘤患者中, 利用影像學(xué)還未發(fā)現(xiàn)病灶時(shí)已經(jīng)可以在外周血中 檢測(cè)到CTC因此CTC可以用于腫瘤的早期診斷,2007年AS

29、C«將CTC納入了腫瘤標(biāo)志物。 在臨床上,也遇到過(guò)非常典型的案例,一受檢者利用CTC做腫瘤早期篩查,在外周血中檢出 1個(gè)CTC后又通過(guò)數(shù)字 PCFa術(shù)對(duì)ctDNA進(jìn)行了定量分析,結(jié)果提示該患者腫瘤與結(jié)直腸 相關(guān)性較大。在隨后進(jìn)行的腸鏡檢查中,在受檢者結(jié)直腸部位發(fā)現(xiàn)一個(gè)低分化腺瘤??焖侬熜гu(píng)估一一作為腫瘤生物動(dòng)力學(xué)標(biāo)志物:通過(guò)CTC在不同治療階段的數(shù)目變化,可輔助快速評(píng)估手術(shù)、放化療及其他治療手段的療效。輔助腫瘤患者分期分級(jí): 通過(guò)檢測(cè)CTC數(shù)目,輔助評(píng)估腫瘤患者的分期及分級(jí)。 血液系統(tǒng)是 腫瘤轉(zhuǎn)移的重要途徑,是否發(fā)生遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移是判斷臨床分期的標(biāo)準(zhǔn)之一。近年來(lái),CTC檢測(cè)在臨床上的應(yīng)用使

30、之成為了 TNM專(zhuān)統(tǒng)分期系統(tǒng)的有效補(bǔ)充,從而指導(dǎo)下一步的治療。判斷患者是否需要輔助化療:術(shù)后CTC數(shù)目大于閾值,建議強(qiáng)化術(shù)后輔助化療;CTCa目小于閾值,建議采用標(biāo)準(zhǔn)輔助化療。監(jiān)測(cè)癌癥轉(zhuǎn)移復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn):CTCa目上升,提示腫瘤進(jìn)展,轉(zhuǎn)移復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)增大;CTC數(shù)目下降,提示腫瘤緩解,轉(zhuǎn)移復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)降低。提供預(yù)后相關(guān)的分子生物學(xué)特征:目前研究已經(jīng)證實(shí)血液中檢測(cè)到的CTC可以作為乳腺癌、前列腺癌和結(jié)腸癌等腫瘤的獨(dú)立預(yù)后因素。CTC監(jiān)測(cè)數(shù)目越高,提示患者預(yù)后較差。在轉(zhuǎn)移性乳腺癌患者接受系統(tǒng)治療之前,每7.5 ml血液中CTC計(jì)數(shù)超過(guò)5個(gè),提示更短的無(wú)進(jìn)展生存時(shí)間和總生存時(shí)間。在轉(zhuǎn)移性結(jié)腸癌患者中, 每7.5m

31、l血液中CTC十?dāng)?shù)超過(guò)3個(gè),患者中位總存活期和無(wú)進(jìn)展存活期都明顯縮短。監(jiān)測(cè)耐藥情況一一基于獲得連續(xù)樣本的便利性:通過(guò)檢測(cè)CTCa目變化,實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)腫瘤藥物耐藥性的發(fā)生。CTC液態(tài)活檢應(yīng)用總結(jié): 當(dāng)前CTC的檢測(cè)還面臨一些挑戰(zhàn),主要體現(xiàn)在:提高CTC的檢出率(不依賴(lài)抗體的 CTC分離策略,CellCullector策略);準(zhǔn)確地判斷具有生物學(xué)活性 /功能的CTC ( EPISPOT,CA晦策略);CTC細(xì)胞分離,單細(xì)胞核酸 WG斕作等樣品制備的 SO環(huán)口 QC方案;CTC本身的異質(zhì)性等。目前CTC的檢測(cè)還主要圍繞數(shù)量指標(biāo),CTC的簡(jiǎn)單計(jì)數(shù)并不能反應(yīng)腫瘤細(xì)胞內(nèi)在的生物學(xué)特性,而正是這種特性是決定了不

32、同的腫瘤細(xì)胞對(duì)治療具有 不同的反應(yīng)。因此,對(duì) CTCffl胞的分子特性(例如單細(xì)胞測(cè)序,藥物靶向基因的表達(dá),藥 物耐受相關(guān)基因突變的檢測(cè))的精細(xì)刻畫(huà),將有利于充分發(fā)掘CTC在指導(dǎo)臨床治療的價(jià)值。4.3 ?外泌體檢測(cè)外泌體是細(xì)胞分泌出的小泡,這個(gè)小泡包含的內(nèi)容非常多,有蛋白質(zhì)、DNA信使RNA以及一些非編碼RNA是細(xì)胞之間溝通的載體。研究發(fā)現(xiàn)腫瘤細(xì)胞釋放的外泌體的量較大,這些 外泌體與腫瘤的發(fā)生、發(fā)展、轉(zhuǎn)移以及抗藥性具有一定的相關(guān)性。外泌體攜帶的信息多樣化,其中的蛋白質(zhì)和核酸,均可用于癌癥的早診、復(fù)發(fā)監(jiān)測(cè)、抗藥性監(jiān)測(cè)等相關(guān)方面的分析。而且外泌體在數(shù)量上多于 CTC更易富集;在形式上分泌小泡能夠有

33、效保護(hù)核酸類(lèi)物質(zhì),克服了 ctDNA在血液中容易降解的問(wèn)題,在臨床有較大的應(yīng)用前景。 但是到目前為止,仍沒(méi)有一種提取方法能同時(shí)保證外泌體的含量、純度以及生物活性。外泌體的幾種分離方法:離心法:這是目前外泌體提取最常用的方法,此種方法得到的外泌體量多,但是純度不足, 電鏡鑒定時(shí)發(fā)現(xiàn)外泌體聚集成塊,由于微泡和外泌體沒(méi)有非常統(tǒng)一的鑒定標(biāo)準(zhǔn),也有一些研究認(rèn)為此種方法得到的是微泡不是外泌體。過(guò)濾離心:過(guò)濾離心是利用不同截留相對(duì)分子質(zhì)量的超濾膜離心分離外泌體。截留相對(duì)分子質(zhì)量是指能自由通過(guò)某種有孔材料的分子中最大分子的相對(duì)分子質(zhì)量。這種操作簡(jiǎn)單、省時(shí),不影響外泌體的生物活性,但同樣存在純度不足的問(wèn)題。密度

34、梯度離心法:密度梯度離心是將樣本和梯度材料一起超速離心,樣品中的不同組分沉降到各自的等密度區(qū), 分為連續(xù)和不連續(xù)梯度離心法。用此種方法分離到的外泌體純度高,但是前期準(zhǔn)備工作繁雜,耗時(shí),量少。免疫磁珠法:泌體相關(guān)抗原的抗體(如CD9 CD63 Alix)與外泌體共同孵育, 然后分離純化。 這種方法可以保證外泌體形態(tài)的完整,特異性高、操作簡(jiǎn)單、不需要昂貴的儀器設(shè)備,但是非中性pH和非生理性鹽濃度會(huì)影響外泌體生物活性。色譜法:色譜法是利用根據(jù)凝膠孔隙的孔徑大小與樣品分子尺寸的相對(duì)關(guān)系而對(duì)溶質(zhì)進(jìn)行分 離的分析的方法。分離到的外泌體在電鏡下大小均一,但是需要特殊的設(shè)備,應(yīng)用不廣泛。外泌體在液體活檢中的應(yīng)

35、用總結(jié):目前有關(guān)外泌體的研究,主要集中在外泌體顆粒的提取、純化和內(nèi)容物分析上,在臨床檢測(cè)中的應(yīng)用還不成熟。對(duì)CTG外泌體的檢測(cè)分析最終還是要落實(shí)到標(biāo)志物數(shù)量、蛋白質(zhì)、DNA RNA±,蛋白和核酸的分析技術(shù)相對(duì)成熟,所以問(wèn)題的關(guān)鍵還是在于如何高效的分離并純化腫瘤GTG和外泌體。五、基因測(cè)序公司(NGS的發(fā)展方向:測(cè)序是起點(diǎn)而不是終點(diǎn)如果是基因測(cè)序產(chǎn)業(yè)上游的公司,產(chǎn)品銷(xiāo)售的目標(biāo)客戶(hù)廣泛,橫跨科研、醫(yī)療、商檢領(lǐng)域, 產(chǎn)品包括測(cè)序儀、DN屣取試劑盒、才t獲試劑盒 /多重子擴(kuò)增試劑盒、建庫(kù)試劑盒、上機(jī)測(cè) 序試劑盒,其中測(cè)序儀、上機(jī)測(cè)序試劑盒兩者是綁定的,DN砒取試劑盒、才t獲試劑盒 /多重子擴(kuò)

36、增試劑盒、建庫(kù)試劑盒是可以用第三方的產(chǎn)品,國(guó)內(nèi)企業(yè)可以從這三個(gè)方向切入,但是試劑盒中的最關(guān)鍵的工具酶以及分離材料等都還是以進(jìn)口產(chǎn)品為主,壁壘較高,如果能實(shí)現(xiàn)這兩個(gè)產(chǎn)品的進(jìn)口替代,說(shuō)明企業(yè)具有較強(qiáng)的技術(shù)實(shí)力。在科研和商檢領(lǐng)域, 試劑盒的審批門(mén)檻較低,但是需要提供定制化服務(wù);在醫(yī)療診斷領(lǐng)域,多基因的捕獲試劑盒/多重子擴(kuò)增試劑盒不大可能通過(guò) GFDA審批(前面已經(jīng)說(shuō)明原因),只有通過(guò)認(rèn)證的臨檢實(shí)驗(yàn)室才 能夠以自制試劑使用,因此這部分企業(yè)(思路迪、世和基因、燃石生物等)需要做兩手準(zhǔn) 備,籌備建設(shè)臨檢中心,向服務(wù)端布局。測(cè)序是起點(diǎn)而不是終點(diǎn), 做中游測(cè)序服務(wù)的機(jī)構(gòu),最大的市場(chǎng)還是在醫(yī)療診斷領(lǐng)域,除了通過(guò)

37、提供服務(wù)獲得收益外,測(cè)序機(jī)構(gòu)最大的潛在優(yōu)勢(shì)是能夠獲得特殊患者的組織樣本,并 且獲得基因數(shù)據(jù)的積累,這對(duì)于藥物開(kāi)發(fā)是十分便利的條件。比如說(shuō),腫瘤患者在使用某靶向藥物后出現(xiàn)耐藥性,測(cè)序機(jī)構(gòu)通過(guò)基因測(cè)序發(fā)現(xiàn)了新的耐藥位點(diǎn)(這是 PGR基因芯片 這種檢測(cè)已知突變位點(diǎn)的技術(shù)所不具備的優(yōu)勢(shì)),那么這個(gè)位點(diǎn)就是下一款靶向藥物的開(kāi)發(fā)方向,并且測(cè)序機(jī)構(gòu)還可以獲得患者的腫瘤組織,以此培養(yǎng)原代細(xì)胞株, 作為藥物開(kāi)發(fā)的細(xì)胞模型,這就比其他的藥物研發(fā)機(jī)構(gòu)擁有更多的先發(fā)優(yōu)勢(shì)。我個(gè)人看好思路迪的發(fā)展模式,以自己的測(cè)序服務(wù)為橋梁,打通患者、醫(yī)院、CROk業(yè),測(cè)序結(jié)果提供用藥指導(dǎo),同時(shí)反過(guò)來(lái)鏈接下游藥物開(kāi)發(fā)和臨床試驗(yàn),形成良好

38、的反饋機(jī)制。案例(美國(guó)腫瘤測(cè)序公司Foundation Medicine ) : Foundation Medicine是一家專(zhuān)注于腫瘤高通量測(cè)序的商業(yè)公司,該公司專(zhuān)有的平臺(tái)可產(chǎn)生對(duì)病人的個(gè)體癌癥可操作的基因組信 息,使醫(yī)生能夠在臨床實(shí)踐中優(yōu)化治療,使生物制藥公司制定有針對(duì)性的癌癥療法更加有效。該公司以二代基因測(cè)序技術(shù)為基礎(chǔ),根據(jù)癌癥基因測(cè)序結(jié)果給腫瘤患者提供精準(zhǔn)的用藥指 南。該公司的基因測(cè)序技術(shù)能夠發(fā)現(xiàn)導(dǎo)至患者罹患癌癥的基因突變,讓“個(gè)體化用藥”走進(jìn)了新領(lǐng)域,讓醫(yī)生能夠根據(jù)患者的遺傳信息進(jìn)行有針對(duì)性的癌癥治療。Foundation Medicine的服務(wù)需要醫(yī)生訂購(gòu),患者只需提供10余個(gè)病例

39、組織切片或者一管幾毫升的血液。從提取腫瘤細(xì)胞的DNAHU最終的報(bào)告,持續(xù)時(shí)間14-21天,其中包含了檢測(cè)出來(lái)的癌癥基因突變情況,以及針對(duì)每一種突變基因給出的用藥指導(dǎo)建議。Foundation Medicine提供兩種產(chǎn)品, FoundationOne 和 FoundationOne Heme。兩種產(chǎn)品均是以二代基因測(cè)序?yàn)榛A(chǔ),使用的測(cè)序儀包括Illumina HiSeq 2000 system 和LifeTechnologies' Ion Torrent 。 FoundationOne檢測(cè)適用于所有實(shí)體瘤,檢測(cè)315個(gè)癌癥相關(guān)基因的編碼區(qū)域以及 28個(gè)基因的內(nèi)含子重排,費(fèi)用為$5800

40、。FoundationOne Heme檢測(cè)針對(duì)血液惡性疾病、淋巴瘤、白血病等,檢測(cè)405個(gè)基因的編碼區(qū)序列和31個(gè)基因的內(nèi)含子重排,以及265個(gè)基因的RN際列來(lái)檢測(cè)基因鬲合,費(fèi)用為 $7200。FoundationOne檢測(cè) 的方法在 2013年10月時(shí)發(fā)表在了 Nature Biotechnology 上。進(jìn)行癌癥基因測(cè)序檢測(cè)需要癌癥基因的數(shù)據(jù)庫(kù),公司因而建立了數(shù)據(jù)庫(kù)FoundationCORE。公司在2014年12月推出了瀏覽器ICE 2,該瀏覽器的一大特點(diǎn)是“患者匹配”功能。臨床 醫(yī)生可以通過(guò)它在已有的知識(shí)庫(kù)FoundationCORE中搜索,尋找與患者腫瘤基因組類(lèi)似的其他患者的信息。I

41、CE 2的一個(gè)新的組成部分是PatientMatch ,是一種利用 FoundationCORE來(lái)增力口 FoundationOne和FoundationOne Hem咂用率的技術(shù)工具。通過(guò) PatientMatch ,使 用ICE 2網(wǎng)絡(luò)的醫(yī)生可以與在治療具有類(lèi)似基因資料病人的醫(yī)生相聯(lián)系,和他們分享診斷結(jié)果合治療方案。根據(jù)公司2015年第三季度的報(bào)告,F(xiàn)oundationCORE已包含6萬(wàn)個(gè)臨床病例信息。Foundation Medicine 一直在努力的一個(gè)領(lǐng)域是醫(yī)保問(wèn)題。2014年,密歇根州的大溪城重點(diǎn)衛(wèi)生部門(mén)宣布把 Foundation Medicine的癌癥基因組分析服務(wù)納入醫(yī)保范圍;Google表示谷歌公司將該公司的癌癥基因的DNA檢測(cè)服務(wù),作

溫馨提示

  • 1. 本站所有資源如無(wú)特殊說(shuō)明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請(qǐng)下載最新的WinRAR軟件解壓。
  • 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請(qǐng)聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶(hù)所有。
  • 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁(yè)內(nèi)容里面會(huì)有圖紙預(yù)覽,若沒(méi)有圖紙預(yù)覽就沒(méi)有圖紙。
  • 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
  • 5. 人人文庫(kù)網(wǎng)僅提供信息存儲(chǔ)空間,僅對(duì)用戶(hù)上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護(hù)處理,對(duì)用戶(hù)上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對(duì)任何下載內(nèi)容負(fù)責(zé)。
  • 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當(dāng)內(nèi)容,請(qǐng)與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
  • 7. 本站不保證下載資源的準(zhǔn)確性、安全性和完整性, 同時(shí)也不承擔(dān)用戶(hù)因使用這些下載資源對(duì)自己和他人造成任何形式的傷害或損失。

評(píng)論

0/150

提交評(píng)論