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文檔簡介

1、 Western印跡法這種技術(shù)是把電泳分離的組分從凝膠轉(zhuǎn)移到一種固相支持體,并以針對特定氨基酸序列的特異性試劑作為探針檢測之。Western使用的探針是抗體,它與附著于固相支持體的靶蛋白所呈現(xiàn)的抗原表位發(fā)生特異性反應(yīng)。這種技術(shù)的作用是對非放射性標(biāo)記蛋白組成的復(fù)雜混合物中的某些特異蛋白進(jìn)行鑒別和鑒定。 所有電泳的試劑,包括上樣buffer,SDS-PAGE配膠試劑盒,電泳buffer、蛋白Marker和蛋白染色試劑盒。第一步:根據(jù)目的蛋白的分子量大小選擇合適的凝膠濃度進(jìn)行凝膠的配制,可以使用SDSPAGE凝膠配制試劑盒。第二步:進(jìn)行蛋白變性,樣品先置95的水浴加熱5分鐘,接著置冰浴中5分鐘,10

2、000g離心20分鐘,取上清液(樣品可立即使用也可以分裝凍存,-20可穩(wěn)定保持?jǐn)?shù)月)。蛋白上樣緩沖液可以使用5SDS-PAGE蛋白上樣緩沖液。第三步依次加入預(yù)染蛋白分子量標(biāo)準(zhǔn)和待分析樣品。基本操作流程:提取細(xì)胞或組織蛋白、測定大致含量制備SDS-PAGE膠蛋白樣品變性、電泳電泳轉(zhuǎn)膜封閉(2小時)一抗(4度過夜) TBST洗滌(洗4遍)HRP標(biāo)記的二抗(1.5小時)TBST洗滌(洗四遍)ECL試劑作用X-光片曝光、顯影結(jié)果分析詳細(xì)操作流程1.試劑1.1 .SDS-PAGE蛋白上樣緩沖液1.2 SDS-PAGE凝膠配制1M Tris-HCl (pH6.8):稱取24.23g Tris,加dd H2

3、O充分溶解,用濃HCl調(diào)節(jié)pH值至6.8(約14ml),定容至200ml,121oC 20min滅菌,室溫保存。1M Tris-HCl (pH8.0):稱取24.23g Tris,加dd H2O充分溶解,用濃HCl調(diào)節(jié)pH值至8.0(約8.4ml),定容至200ml,12120min滅菌,室溫保存。1.5M Tris-HCl (pH8.8):稱取36.34g Tris,加dd H2O充分溶解,用濃HCl調(diào)節(jié)pH值至8.8(約5ml),定容至200ml,12120min滅菌,室溫保存。10%(W/V)SDS:稱取50gSDS,加400ml dd H2O,68加熱溶解。滴加濃HCl調(diào)節(jié)pH值至7.

4、2,定容至500ml,室溫保存。30%(W/V)Acrylamide:稱取29g Acrylamide,1g N,N-至甲雙丙烯酰胺(BIS),加dd H2O溶解,定容至100ml,用0.45m濾膜濾去雜質(zhì),4避光保存。20xPBS:稱取Na2HPO4 11.5g,KH2PO4 2g,KCL 2g ,NaCl 80g,定溶至500ml蒸餾水中。10%(W/V)過硫酸銨:稱取1g過硫酸銨,加10ml dd H2O 充分溶解,4保存(有效期約為兩周),分裝于1.5的離心管中,每管1mL,-20度長期保存。1.3 SDS-PAGE電泳液10Tris-Glycine Buffer (SDS-PAGE電

5、泳緩沖液):稱取15.1g Tris,94g Glycine,5gSDS,加ddH2O 充分溶解,定容至500L,室溫保存。注:Tris和Glycine難溶,可70度水浴加熱,并攪拌,室溫保存。SDS溶解易起氣泡,常用50mL 10%的SDS代替固體配制。1Tris-Glycine Buffer (SDS-PAGE電泳緩沖液):量取50ml 10Tris-Glycine Buffer,定溶至500mL,混勻,室溫保存。1.4 NC膜(硝酸纖維素膜)或PVDF膜1.5 Western轉(zhuǎn)膜液10X電轉(zhuǎn)液:稱取2.9g Glycine,5.8g Tris,0.37g SDS,加ddH2O 充分溶解,

6、定容至500ml,混勻,室溫保存。1X電轉(zhuǎn)液:25mL 10X電轉(zhuǎn)液,加100mL的甲醇,混勻,室溫保存。1.6 洗滌液PBST Buffer:量取25ml 20PBS,0.25ml Tween 20,加dd H2O定容至500mL,混勻,室溫保存。1.7 封閉液稱取1.25g脫脂奶粉,加入25ml TBST Buffer中,充分溶解,4 oC保存。1.8 一抗(可重復(fù)使用,置于4度冰箱)PBST 1mL 加一抗1ug ,配成1ug/mL,4度冰箱過夜。次日,PBST洗膜4次。二抗 (1:5000)5%的奶粉:取0.25g奶粉,加5mLPBST,加1ug的二抗,于50mL大離心管,室溫,1.5

7、小時。之后,PBST洗4次。1.9 EasySee Western Blot Kit1.10 預(yù)染marker1.11 BCA蛋白定量試劑盒2. 蛋白樣品制備2.1蛋白粗提在人體中IgG占總抗體80%,成人血清中含量為12.5%/ml左右,IgG粗純一般用飽和(NH4)2SO4(SAS)進(jìn)行,一般操作如下:1)8ml血清中加入8ml PBS(0.02 PH7.0),混勻后滴加4ml SAS,使其終濃度為20%(目的是除去纖維蛋白原)。2)4,1h后7000rpm離心10min。3)留上清,補(bǔ)加12ml SAS,邊振蕩另滴加。(終濃度為50%,可除去AIb)4)4,1h后,7000rmp離心10

8、min。5)留沉淀溶于10ml PBS中,滴加5ml SAS,然后4,1h后,7000rmp離心10min。6)棄上清,沉淀溶于10ml PBS,滴加5ml SAS。7) 5)至6)重復(fù)三次8)棄上清,沉淀溶于4ml PBS中,PBS透析過夜(400ml)結(jié)果:整個實驗需7h,注意在離心前離心機(jī)應(yīng)降溫。粗提的IgG抗體免疫反應(yīng)可達(dá)到70%-80%。此濃度只針對IgG抗體,若分子量不同使用SAS濃度也不同。操作中應(yīng)盡量讓蛋白少起泡,防止變性減少蛋白損失。2.2 試劑盒提?。≧IPA lysis buffer為例2.2.1 對于培養(yǎng)細(xì)胞樣品:1)融解RIPA裂解液,混勻。取適當(dāng)量的裂解液,在使用前

9、數(shù)分鐘內(nèi)加入PMSF,使PMSF的最終濃度為1mM。2)對于貼壁細(xì)胞:去除培養(yǎng)液,用PBS或無血清培養(yǎng)液洗一遍(如果血清中的蛋白沒有干擾,可以不洗)。按照6孔板每孔加入150-250微升裂解液的比例加入裂解液。用槍吹打數(shù)下,使裂解液和細(xì)胞充分接觸。通常裂解液接觸細(xì)胞1-2秒后,細(xì)胞就會被裂解。 對于懸浮細(xì)胞:離心收集細(xì)胞,用手指把細(xì)胞用力彈散。按照6孔板每孔細(xì)胞加入150-250微升裂解液的比例加入裂解液。再用手指輕彈以充分裂解細(xì)胞。充分裂解后應(yīng)沒有明顯的細(xì)胞沉淀。如果細(xì)胞量較多,必需分裝成50-100萬細(xì)胞/管,然后再裂解。3)充分裂解后,10000-14000g離心3-5分鐘,取上清,即可

10、進(jìn)行后續(xù)的PAGE、Western和免疫沉淀等操作。裂解液用量說明:通常6孔板每孔細(xì)胞加入150微升裂解液已經(jīng)足夠,但如果細(xì)胞密度非常高可以適當(dāng)加大裂解液的用量到200微升或250微升。2.2.2 對于組織樣品:1)把組織剪切成細(xì)小的碎片。2)融解RIPA裂解液,混勻。取適當(dāng)量的裂解液,在使用前數(shù)分鐘內(nèi)加入PMSF,使PMSF的最終濃度為1mM。3)按照每20毫克組織加入150-250微升裂解液的比例加入裂解液。如果裂解不充分可以適當(dāng)添加更多的裂解液,如果需要高濃度的蛋白樣品,可以適當(dāng)減少裂解液的用量。4)用玻璃勻漿器勻漿,直至充分裂解。5)充分裂解后,10000-14000g離心3-5分鐘,

11、取上清,即可進(jìn)行后續(xù)的PAGE、Western和免疫沉淀等操作。6)如果組織樣品本身非常細(xì)小,可以適當(dāng)剪切后直接加入裂解液裂解,通過強(qiáng)烈vortex使樣品裂解充分。然后同樣離心取上清,用于后續(xù)實驗。直接裂解的優(yōu)點是比較方便,不必使用勻漿器,缺點是不如使用勻漿器那樣裂解得比較充分。 注:RIPA裂解液的裂解產(chǎn)物中經(jīng)常會出現(xiàn)一小團(tuán)透明膠狀物,屬正?,F(xiàn)象。該透明膠狀物為含有基因組DNA等的復(fù)合物。在不檢測和基因組DNA結(jié)合特別緊密的蛋白的情況下,可以直接離心取上清用于后續(xù)實驗;如果需要檢測和基因組結(jié)合特別緊密的蛋白,則可以通過超聲處理打碎打散該透明膠狀物,隨后離心取上清用于后續(xù)實驗。如果檢測一些常見

12、的轉(zhuǎn)錄因子,例如NF-kappaB、p53等時,通常不必進(jìn)行超聲處理,就可以檢測到這些轉(zhuǎn)錄因子。 3 蛋白樣品的初步定量(詳細(xì)步驟見BCA試劑盒說明書) 蛋白質(zhì)定量的方法比較多,目前用得比較多的是 BCA 法,其基本原理為要分析的蛋白在堿性溶液里與 Cu2+反應(yīng)產(chǎn)生 Cu+,后者與 BCA 形成螯合物,形成紫色化合物,吸收峰在 562nm波長。此化合物與蛋白濃度的線性關(guān)系極強(qiáng),反應(yīng)后形成的化合物非常穩(wěn)定。通過標(biāo)準(zhǔn)曲線可以確定對應(yīng)樣品的蛋白濃度,具體的操作步驟可以參考試劑盒說明書。Western Blot 的對蛋白濃度的檢測要求通常1ug/ul,大部分培養(yǎng)的細(xì)胞或者組織都是可以滿足的,注意因為測

13、定的是總蛋白濃度,而非特異性蛋白的量,有時可能會出現(xiàn)測量總蛋白含量很高,做WB時卻求檢測到目的蛋白條帶,就是因為特異性蛋白質(zhì)表達(dá)很低。所以這步只具有參考意義。在后面的檢測中,都平行做內(nèi)參的檢測,以確定電泳系統(tǒng)的質(zhì)控。 4 SDS-PAGE電泳 (1)清洗玻璃板:一只手扣緊玻璃板,另一只手蘸點洗滌靈輕輕擦洗。兩面都擦洗過后用自來水沖,再用蒸餾水沖洗干凈后立在架子上晾干后,保證玻璃板上無污性方可使用。 (2)灌膠與上樣 玻璃板對齊后放入夾中卡緊。然后垂直卡在架子上準(zhǔn)備灌膠。(操作時要使兩玻璃對齊,以免漏膠,整個操作應(yīng)輕柔,夾子平行按下,以免玻璃板破碎) 制備分離膠(pH 8.8)(試劑配方詳見最后

14、附表)3. 灌膠時,可用1ml槍吸取1ml膠沿玻璃放出,溶液緩慢加入到裝配好的板中至凝膠高度為6 cm左右,預(yù)留1.5 cm高度配制濃縮膠。然后膠上加一層水,液封后的膠凝得更快。(灌膠時開始可快一些,膠面快到所需高度時要放慢速度。操作時膠一定要沿玻璃板流下,這樣膠中才不會有氣泡。加水液封時要很慢,否則膠會被沖變型。)室溫放置0.51小時左右至聚合完全。 當(dāng)水和膠之間有一條折射線時,說明膠已凝了。再等3min使膠充分凝固就可倒去膠上層水并用吸水紙將水吸干(注意吸水紙不可觸及分離膠)。 制備濃縮膠(PH6.8):將剩余空間灌滿濃縮膠然后將梳子插入濃縮膠中。灌膠時也要使膠沿玻璃板流下以免膠中有氣泡產(chǎn)

15、生。插梳子時要使梳子保持水平。由于膠凝固時體積會收縮減小,從而使加樣孔的上樣體積減小,所以在濃縮膠凝固的過程中要經(jīng)常在兩邊補(bǔ)膠。待到濃縮膠凝固后,兩手分別捏住梳子的兩邊豎直向上輕輕將其拔出。凝膠聚合約0.51小時左右。 將其放入電泳槽中,可用200ul槍吸取電泳液將膠里的各個孔輕輕吹吸幾下,可將孔內(nèi)氣泡及碎膠趕出。(小玻璃板面向內(nèi),大玻璃板面向外。若只跑一塊膠,槽另一邊要墊一塊WB專用玻璃板) 取提取好的蛋白,約1015ul與5SDS上樣緩沖液按5:1的比例混合,加到1.5ml離心管中,然后沸水中煮35min使蛋白完全變性。 電泳:電泳的電壓為100V較好,也可用120150V。電泳至溴酚蘭剛

16、跑出即可終止電泳,時間長短根據(jù)檢測蛋白質(zhì)大小確定,然后進(jìn)行轉(zhuǎn)膜。注意:1)10%APS需現(xiàn)用現(xiàn)配,或配好分裝后放入-20度以下凍存,一般4度保存的APS使用時間最好不好超過一個星期。否則易造成膠不凝。2)丙烯酰胺、TEMED均為毒性物質(zhì),使用時嚴(yán)禁與皮膚接觸。3)配制Tris-Cl時,嚴(yán)格控制好其PH值,這對于蛋白分離至關(guān)重要。5 轉(zhuǎn)膜 實驗前的準(zhǔn)備工作 1)、制備足夠轉(zhuǎn)移緩沖液以充滿轉(zhuǎn)移槽,另外準(zhǔn)備200 ml用于平衡凝膠和膜以及潤濕濾紙。 2)、從玻璃板上取下凝膠,去除所有濃縮膠。 3)、將凝膠浸入轉(zhuǎn)移緩沖液中15-30分鐘。 4)、濾紙在轉(zhuǎn)移緩沖液中至少浸泡30秒。 5)、準(zhǔn)備膜: a、

17、硝酸纖維素膜:將膜進(jìn)入轉(zhuǎn)移緩沖液中15-30分鐘 b、PVDF膜(PVDF膜具有更好的蛋白吸附、物理強(qiáng)度以及具有更好的化學(xué)兼容性,根據(jù)目的蛋白大小選擇膜孔徑大小,有0.45um和0.22um)在甲醇中潤濕膜15秒,保證膜由不透明變成半透明。 小心將膜放入雙蒸水水中浸泡 2 分鐘。 小心將膜放入轉(zhuǎn)移緩沖液中平衡至少 5 分鐘。 將夾子打開使黑的一面保持水平。在上面墊一張海綿墊,用玻棒單個方向(來回趕容易使膠破裂)趕幾遍以趕走里面的氣泡(一手趕另一手要壓住墊子使其不能隨便移動)。在墊子上墊三層濾紙(可邊的濾紙不能相互接觸,接觸后會發(fā)生短路。(轉(zhuǎn)移液含甲醇,操作時要戴手套, 實驗室要開門以使空氣流通

18、。) 要先將玻璃板撬掉才可剝膠,撬的時候動作要輕,要在兩個邊上輕輕的反復(fù)撬。撬一會兒玻璃板便開始松動,直到撬去玻板。(撬時一定要小心,玻板很易裂。)除去小玻璃板后,將濃縮膠輕輕刮去(濃縮膠影響操作),要避免把分離膠刮破,同時在膠的右上角做個記號。小心剝下分離膠蓋于濾紙上,用手調(diào)整使其與濾紙對齊,輕輕用玻棒搟去氣泡。將膜蓋于膠上,要蓋滿整個膠(膜蓋下后不可再移動)并除氣泡。在膜上蓋3張濾紙并除去氣泡。最后蓋上另一個海綿墊,搟幾下就可合起夾子。整個操作在轉(zhuǎn)移液中進(jìn)行,要不斷的搟去氣泡 將夾子放入轉(zhuǎn)移槽槽中,要使夾的黑面對槽的黑面,夾的紅面對槽的紅面。電轉(zhuǎn)移時會產(chǎn)熱,在槽的一邊放一塊冰來降溫。轉(zhuǎn)膜裝置置于冰水中,打開電源30 mA過夜或200mA 2小時。 轉(zhuǎn)完后在膜上做個記號,以判斷膜的正反面,轉(zhuǎn)膜結(jié)束后,若看見預(yù)染Marker條帶,說明轉(zhuǎn)膜成功。6免疫反應(yīng) (1)將膜用TBST從下向上浸濕后,移至含有封閉液的平皿中,室溫下,用封閉液在脫色搖床上搖動封閉2h或者度過夜,如果預(yù)實驗做完后,發(fā)現(xiàn)背景比較高,可以適當(dāng)延長封閉時間(2)將一抗用封閉液稀釋液(如回收,請用專用稀釋液稀釋)稀釋至適當(dāng)濃度;通常用自封袋裝溶液(在平皿中反應(yīng)也可以),溶液體積大概1-5ml,從封閉液中取出膜,用濾紙吸去殘留液后(不必洗滌),將膜蛋白面朝上放于抗體液面上,脫色搖床上37孵育3h 后,用TBS

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