細菌的分類及命名

1、一、細菌分類學一、細菌分類學對細菌進行對細菌進行分類，分類，命名與鑒定命名與鑒定的的 一門學科。一門學科。任務：任務：在全面了解在全面了解細菌生物學特征細菌生物學特征的基礎上，的基礎上，研究它們的研究它們的種類種類，探索其，探索其起源起源，演化演化以以及與及與其他類群之間的親緣關系其他類群之間的親緣關系，進而提，進而提出能反映出能反映自然發(fā)展的分類系自然發(fā)展的分類系統(tǒng)，并將細統(tǒng)，并將細菌加菌加以分門別類以分門別類。細菌分類學細菌分類學包括分類，命名和鑒定包括分類，命名和鑒定1、細菌分類：、細菌分類：根據(jù)細菌各自的特征，并根據(jù)細菌各自的特征，并按照按照親緣關系親緣關系分類，以不同等級分類，以不同

2、等級編排系編排系統(tǒng)統(tǒng)。分類有兩種：。分類有兩種： 細菌的生理生化分類法細菌的生理生化分類法，包括有傳，包括有傳統(tǒng)分類法和數(shù)值分類法。統(tǒng)分類法和數(shù)值分類法。 細菌核酸、蛋白質結構的同源程度細菌核酸、蛋白質結構的同源程度進行分類法進行分類法，稱種系分類或自然分類。，稱種系分類或自然分類。2、細菌命名、細菌命名：在分類基礎上，給每種：在分類基礎上，給每種細菌一個細菌一個科學名稱科學名稱，便于交流并保證所，便于交流并保證所有的科研工作者給予同樣名稱。有的科研工作者給予同樣名稱。3、細菌鑒定：、細菌鑒定：將未知細菌按分類原則，將未知細菌按分類原則，確定細菌的分類地位確定細菌的分類地位。 古菌古菌細菌細菌

3、3、細菌的分類單元、細菌的分類單元 細菌的分類單元與動植物一樣，依次為細菌的分類單元與動植物一樣，依次為科及科以上的劃分在細菌不太完善，且隨科及科以上的劃分在細菌不太完善，且隨著研究的深入科屬的劃分會發(fā)生變動著研究的深入科屬的劃分會發(fā)生變動Staphylococcus aureusStaphylococcus aureus RosenbachRosenbach 1884 1884屬名葡萄球菌屬名葡萄球菌種名金黃色種名金黃色命名人的姓命名人的姓命名年份命名年份金黃色葡萄球菌的學名為金黃色葡萄球菌的學名為Peptostreptococcus foetidusPeptostreptococcus f

4、oetidus （ VeillonVeillon ）SmithSmith屬名消化鏈球菌屬名消化鏈球菌種名惡臭種名惡臭原命名者原命名者改名者惡臭消化鏈球菌的學名惡臭消化鏈球菌的學名惡臭消化鏈球菌是由惡臭消化鏈球菌是由 Veillon 首先發(fā)現(xiàn)和定名的首先發(fā)現(xiàn)和定名的，后，后 Smith 重新定為現(xiàn)名。重新定為現(xiàn)名。 這些表型特征對細菌的鑒定和分類具有很重要的這些表型特征對細菌的鑒定和分類具有很重要的作用，尤其是在臨床微生物學的實中，至今仍有作用，尤其是在臨床微生物學的實中，至今仍有應用價值。應用價值。形態(tài)形態(tài)染色染色培養(yǎng)培養(yǎng)細胞壁結構細胞壁結構生理生化生理生化抗原特性抗原特性1）DNA堿基堿基G

5、+C%比例的測定比例的測定u親緣關系相近的種比也相近，親緣關系相近的種比也相近，比差別大親緣關系必然遠比差別大親緣關系必然遠（G+C）%=100% A+T+G+CG+C簡稱簡稱GC比比u種內差距種內差距2.54.0, 種間種間5%, 屬間屬間差距差距10% 2）核酸分子雜交法）核酸分子雜交法DNA-DNA DNA-rRNA rRNA-rRNA 方法方法: : u待測菌株待測菌株dsDNA-ssDNA u參照菌株，同位素標記的參照菌株，同位素標記的ssDNA檢測雜合檢測雜合DNA的放射性強度的放射性強度，參照菌株自，參照菌株自身為身為DNA復性的放射性強度復性的放射性強度100% uDNA-DN

6、A雜交同源性性雜交同源性性 60%為同種為同種 70%同一亞種同一亞種 2060%為同一屬為同一屬3）rRNA寡核苷酸編目分析寡核苷酸編目分析urRNA是細胞中的是細胞中的“活化石活化石”原核生物：原核生物：23s、16s、5s 真核生物：真核生物：28s、18s、5.8s u16s或或18s用作系統(tǒng)分類用作系統(tǒng)分類：（提出三域：（提出三域學說）學說）u生理功能重要又恒定、含量高易提取、生理功能重要又恒定、含量高易提取、核苷酸序列保守、分子質量適中、信息核苷酸序列保守、分子質量適中、信息量大易于分析量大易于分析球菌球菌桿菌桿菌絲狀或樹枝狀絲狀或樹枝狀葡萄球菌葡萄球菌鏈球菌鏈球菌糞腸球菌糞腸球菌

7、微球菌微球菌MZN染色陰性染色陰性MZN染色陽性染色陽性牛放線菌牛放線菌粘性放線菌粘性放線菌星形奴卡菌星形奴卡菌剛果嗜皮菌剛果嗜皮菌產芽胞產芽胞無芽胞無芽胞抗酸染色陽性抗酸染色陽性抗酸染色陰性抗酸染色陰性梭菌梭菌芽胞桿菌芽胞桿菌炭疽桿菌炭疽桿菌分支桿菌分支桿菌牛分支桿菌和禽分支桿菌牛分支桿菌和禽分支桿菌鼠麻風桿菌鼠麻風桿菌副結核分支菌副結核分支菌棒狀桿菌棒狀桿菌化膿放線菌化膿放線菌馬紅球菌馬紅球菌產單核李氏桿菌產單核李氏桿菌豬丹毒桿菌豬丹毒桿菌球菌球菌/球桿菌球桿菌桿菌桿菌MZN染色陰性染色陰性MZN染色陰性染色陰性弧狀桿菌弧狀桿菌中等大小桿菌中等大小桿菌螺旋狀菌螺旋狀菌絲狀菌絲狀菌彎曲菌彎曲菌弧菌弧菌耐瑟菌耐瑟菌生摩拉菌生摩拉菌不動桿菌不動桿菌腸桿菌科腸桿菌科