計(jì)算機(jī)輔助藥物分子設(shè)計(jì)

1、會計(jì)學(xué)1計(jì)算機(jī)輔助藥物分子設(shè)計(jì)計(jì)算機(jī)輔助藥物分子設(shè)計(jì)第1頁/共64頁第2頁/共64頁第3頁/共64頁第4頁/共64頁第5頁/共64頁第6頁/共64頁第7頁/共64頁第8頁/共64頁第9頁/共64頁第10頁/共64頁第11頁/共64頁第12頁/共64頁第13頁/共64頁第14頁/共64頁第15頁/共64頁第16頁/共64頁第17頁/共64頁白血病青光眼 第18頁/共64頁第19頁/共64頁藥物設(shè)計(jì)目標(biāo)：設(shè)計(jì)一個與受體結(jié)合能力強(qiáng)的化合物第20頁/共64頁第21頁/共64頁第22頁/共64頁第23頁/共64頁第24頁/共64頁第25頁/共64頁第26頁/共64頁0.51.0第27頁/共64頁第28頁

2、/共64頁第29頁/共64頁第30頁/共64頁第31頁/共64頁第32頁/共64頁第33頁/共64頁第34頁/共64頁第35頁/共64頁第36頁/共64頁第37頁/共64頁第38頁/共64頁第39頁/共64頁octwaterCPC第40頁/共64頁OH1-octanolOHHwater第41頁/共64頁第42頁/共64頁第43頁/共64頁Neuraminidases cleave host receptorshelp release of new virions 第44頁/共64頁第45頁/共64頁第46頁/共64頁第47頁/共64頁蛋白模型方法的應(yīng)用蛋白模型方法的應(yīng)用流感病毒抑制劑的設(shè)計(jì)流感

3、病毒抑制劑的設(shè)計(jì) 流感病毒的危害性：傳染性強(qiáng) ；威脅生命安全 ，例如H5N1、H1N1。 神經(jīng)氨酸酶流感藥物：扎那米韋(Zanamivir)、奧塞米韋(Oseltamivir) 。 新型流感病毒抑制劑的必要性：抗藥性的新變異病毒的出現(xiàn)；提高藥效。第48頁/共64頁蛋白質(zhì)三維晶體結(jié)構(gòu)（PDB:1FKG）受體蛋白質(zhì)模型（400個原子）DFT方法優(yōu)化各項(xiàng)構(gòu)型（蛋白質(zhì)模型，配體，蛋白質(zhì)-配體復(fù)合體）計(jì)算各項(xiàng)能量受體蛋白與配體的相互作用能判斷配體與受體的結(jié)合能力強(qiáng)弱配體設(shè)計(jì)配體設(shè)計(jì)蛋白質(zhì)三維晶體結(jié)構(gòu)（PDB code:1FKG）受體蛋白質(zhì)模型（400個原子）DFT方法優(yōu)化各項(xiàng)構(gòu)型（蛋白質(zhì)模型，配體，蛋白

4、質(zhì)-配體復(fù)合體）計(jì)算各項(xiàng)的能量受體蛋白與配體的相互作用能判斷配體與受體的結(jié)合能力強(qiáng)弱配體設(shè)計(jì)配體設(shè)計(jì)第49頁/共64頁the binding pocket of FKBP12第50頁/共64頁第51頁/共64頁第52頁/共64頁第53頁/共64頁ONHAcNH3+OOR2R1第54頁/共64頁磺酰脲除草劑氯嘧磺?。–E)與擬南芥乙酰乳酸合成酶復(fù)合物的晶體結(jié)構(gòu)配體分子配體分子CE第55頁/共64頁結(jié)論：結(jié)論：量子力學(xué)與模型蛋白相結(jié)合的方法可以作為除草劑設(shè)計(jì)的一種可靠方法，可以用來對配體-受體結(jié)合的好壞進(jìn)行排序，可用來預(yù)測抑制劑的生物活性。第56頁/共64頁第57頁/共64頁第58頁/共64頁第59頁/共64頁白血病青光眼 第60頁/共64頁第61頁/共64頁第