Pubmed數(shù)據(jù)庫檢索課件

1、美國(guó)醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫PubMed一 認(rèn)識(shí)Pubmed數(shù)據(jù)庫 Pubmed的基本檢索 1、初步檢索 2、檢索結(jié)果過濾器 3、結(jié)果顯示設(shè)置 4、結(jié)果輸出 5、更多信息 三 Pubmed的高極檢索（檢索歷史功能）四 期刊數(shù)據(jù)庫的檢索五 Mesh主題詞檢索六 單引文匹配器（題錄檢索）主要內(nèi)容一、數(shù)據(jù)庫概況NIH： National Institutes of Health （國(guó)立衛(wèi)生研究所） NLM： National Library of Medicine（國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書館） NCBI：National Center for Biotechnology Information（美國(guó)國(guó)立生物技術(shù)信息中心）

2、NCBI是目前國(guó)際上幾個(gè)重要分子生物信息網(wǎng)站之一，是NIH底下的NLM的部門之一。Pubmed是NCBI數(shù)據(jù)庫之一。（一）主辦單位：NLM創(chuàng)建的生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)書目型數(shù)據(jù)庫（二）收錄范圍：年限：1949-今文獻(xiàn)量： - 收錄全球80多個(gè)國(guó)家和地區(qū)的5200多種生物醫(yī)學(xué)期刊，大都經(jīng)美國(guó)衛(wèi)生健康研究院的文獻(xiàn)選擇技術(shù)評(píng)估委員會(huì)Literature Selection Technical Review Committee(LSTRC)評(píng)估挑選,由NLM和各專業(yè)協(xié)會(huì)的數(shù)據(jù)協(xié)作采集專家推薦。 - 累積了2200多萬篇文獻(xiàn)，年收錄文獻(xiàn)約40萬篇，涉及37個(gè)語種，回溯至1950年的數(shù)據(jù)涉及60個(gè)語種。數(shù)據(jù)庫47%

3、為美國(guó)本土出版的文獻(xiàn)，90%為英文文獻(xiàn)，79%的文獻(xiàn)有著者撰寫的英文摘要。 PubMed是一個(gè)免費(fèi)的生物醫(yī)學(xué)文摘數(shù)據(jù)庫，約10%論文提供全文（ PubMed Central, PMC），大部分論文提供指向全文提供者（付費(fèi)或免費(fèi)）的鏈接。學(xué)科范圍： - 主要收錄生物醫(yī)學(xué)和健康科學(xué)以及生命科學(xué)相關(guān)領(lǐng)域的文獻(xiàn)。 - 包括行為科學(xué)、健康專業(yè)所需要的化學(xué)、生物工藝學(xué)，基礎(chǔ)研究和臨床、護(hù)理、公共衛(wèi)生、衛(wèi)生政策發(fā)展或相關(guān)教育活動(dòng)的內(nèi)容。 - 2000年起增加了生物、環(huán)境科學(xué)、海洋生物、植物和動(dòng)物學(xué)、生物物理學(xué)和生物化學(xué)等生命科學(xué)方面的研究?jī)?nèi)容。（三）PubMed數(shù)據(jù)來源MEDLINE（完整的核心數(shù)據(jù)）是美國(guó)

4、國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書館最重要的書目文摘數(shù)據(jù)庫，PubMed主體部分，1966至今的MEDLINE已標(biāo)引數(shù)據(jù)，有MeSH字段和摘要，每條記錄標(biāo)有PubMed-indexed for MEDLINE OldMDENLINE（早期的舊數(shù)據(jù)）1949-1965年間的MEDLINE數(shù)據(jù)，沒有MeSH字段和摘要，每條記錄標(biāo)有PubMed-OLDMEDLINE （三） PubMed數(shù)據(jù)來源MEDLINE Inprocess（正在被標(biāo)引的數(shù)據(jù)）PubMed每天收錄由Medline的期刊出版商提供的尚未經(jīng)規(guī)范處理的數(shù)據(jù)，該庫中的記錄只有簡(jiǎn)單的書目信息和文摘，又稱PreMedline 。該庫中的數(shù)據(jù)每周一次轉(zhuǎn)入MEDLI

5、NE，同時(shí)從PreMedline中刪去。當(dāng)進(jìn)入MEDLINE時(shí)就會(huì)被標(biāo)引，每條記錄標(biāo)有PubMed-in process。Not MEDLINE（數(shù)據(jù)商提供的數(shù)據(jù)）出版商提供的電子文獻(xiàn)中MEDLINE不收錄的數(shù)據(jù)。出版商一般提供的是整本期刊的信息，一部分?jǐn)?shù)據(jù)每日將被添加到PreMedline中去,若有部分沒有被MEDLINE收錄，PubMed仍保存。每條記錄標(biāo)有PubMed-as supplied by publisher。Pre-MedlineNew DataPubMedProcessMedlineCollect Not MedlineOldMedlinePubMed數(shù)據(jù)收錄情況點(diǎn)擊數(shù)據(jù)庫名

6、稱基本檢索框高級(jí)檢索題錄檢索主題詞檢索期刊檢索輸入檢索式例1：檢索有關(guān)心瓣膜疾?。╤eart valve disease）診斷（diagnosis）方面的文獻(xiàn)。點(diǎn)擊“Search”文獻(xiàn)類型文獻(xiàn)可獲取內(nèi)容讀者評(píng)論出版時(shí)間物種語言性別主題期刊來源檢索字段年齡 例2：檢索近兩年有關(guān)細(xì)胞凋亡的綜述文獻(xiàn)，要求檢出免費(fèi)全文 內(nèi)容特征： apoptosis 外部特征： last 2 years review free full text 顯示設(shè)置輸出格式摘要文本格式摘要文摘文本格式文摘網(wǎng)頁格式排序時(shí)間相關(guān)度出版時(shí)間第一作者通訊作者期刊標(biāo)題結(jié)果輸出文本剪貼板郵箱文獻(xiàn)管理軟件標(biāo)題含有檢索詞文獻(xiàn) 按收入時(shí)間/相關(guān)

7、度排序切換 按年統(tǒng)計(jì)的文章圖表查找相關(guān)文獻(xiàn)詳細(xì)檢索過程最近檢索行為點(diǎn)擊See more點(diǎn)擊“URL”點(diǎn)擊“Create alert”點(diǎn)擊注冊(cè)帳戶點(diǎn)擊注冊(cè)輸入用戶名和密碼點(diǎn)擊登錄顯示用戶名點(diǎn)擊保存點(diǎn)擊“My NCBI”二、高級(jí)檢索1、檢索式編制(search builder)通過字段限定和索引選詞構(gòu)建復(fù)雜檢索式例3：研究更年期抑郁癥激素替代療法的非中文文獻(xiàn) 內(nèi)容特征 激素替代療法 Hormone Replacement 更年期抑郁癥 Involutional Depression 外部特征 非中文 NOT chinese輸入檢索詞：hormone replacement直接編輯檢索式執(zhí)行檢索執(zhí)行

8、檢索結(jié)果預(yù)覽例4：檢索2000年以來美國(guó)斯安那州Pennington Biomedical Center 的Smith SR在期刊Diabetes上發(fā)表了多少篇文獻(xiàn)。五、主題詞檢索（MeSH Database）確定規(guī)范化主題詞查看主題詞詞義注釋、樹狀結(jié)構(gòu)表選擇副主題詞、擴(kuò)展主題詞、主要主題詞例5：欲查近5年研究腎衰竭飲食療法并進(jìn)一步觀察其療效的相關(guān)文獻(xiàn)。 內(nèi)容特征： renal failure diet therapy treatment outcome 外部特征： last 5 years 輸入自由詞：renal failure點(diǎn)按規(guī)范詞可獲詳細(xì)注解主題詞注釋副主題詞選擇檢索式構(gòu)建盒加權(quán)擴(kuò)展

9、樹：不進(jìn)行下位詞擴(kuò)檢入口詞：該規(guī)范詞所代替的非規(guī)范詞主題詞樹形結(jié)構(gòu)表：顯示該詞的學(xué)科隸屬關(guān)系 一篇文獻(xiàn)的所有主題詞中，論述文獻(xiàn)中心的主題詞稱主要主題詞（major topic headings） ,如以下三篇文獻(xiàn)的所有主題詞中紅色框里帶星號(hào)的就是主要主題詞將組配檢索式放入檢索盒中輸入新主題詞：Treatment outcome進(jìn)一步檢索腎衰竭綜合療效觀察（treatment outcome）選擇邏輯組配符通過MeSH Database檢索的結(jié)果，共85篇檢索結(jié)果更為專指六、單引文匹配（ Single Citation Matcher)輸入文獻(xiàn)外部特征信息，查找特定文獻(xiàn)?？獪?zhǔn)確，縮寫要標(biāo)準(zhǔn)著者姓名大小寫不敏感例6：查找黃國(guó)俊2006年發(fā)表在中華腫瘤雜志上的文獻(xiàn)1、查找“