Pubmed數(shù)據(jù)庫檢索課件

1、美國醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫PubMed一 認(rèn)識Pubmed數(shù)據(jù)庫 Pubmed的基本檢索 1、初步檢索 2、檢索結(jié)果過濾器 3、結(jié)果顯示設(shè)置 4、結(jié)果輸出 5、更多信息 三 Pubmed的高極檢索（檢索歷史功能）四 期刊數(shù)據(jù)庫的檢索五 Mesh主題詞檢索六 單引文匹配器（題錄檢索）主要內(nèi)容一、數(shù)據(jù)庫概況NIH： National Institutes of Health （國立衛(wèi)生研究所） NLM： National Library of Medicine（國立醫(yī)學(xué)圖書館） NCBI：National Center for Biotechnology Information（美國國立生物技術(shù)信息中心）

2、NCBI是目前國際上幾個(gè)重要分子生物信息網(wǎng)站之一，是NIH底下的NLM的部門之一。Pubmed是NCBI數(shù)據(jù)庫之一。（一）主辦單位：NLM創(chuàng)建的生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)書目型數(shù)據(jù)庫（二）收錄范圍：年限：1949-今文獻(xiàn)量： - 收錄全球80多個(gè)國家和地區(qū)的5200多種生物醫(yī)學(xué)期刊，大都經(jīng)美國衛(wèi)生健康研究院的文獻(xiàn)選擇技術(shù)評估委員會Literature Selection Technical Review Committee(LSTRC)評估挑選,由NLM和各專業(yè)協(xié)會的數(shù)據(jù)協(xié)作采集專家推薦。 - 累積了2200多萬篇文獻(xiàn)，年收錄文獻(xiàn)約40萬篇，涉及37個(gè)語種，回溯至1950年的數(shù)據(jù)涉及60個(gè)語種。數(shù)據(jù)庫47%

3、為美國本土出版的文獻(xiàn)，90%為英文文獻(xiàn)，79%的文獻(xiàn)有著者撰寫的英文摘要。 PubMed是一個(gè)免費(fèi)的生物醫(yī)學(xué)文摘數(shù)據(jù)庫，約10%論文提供全文（ PubMed Central, PMC），大部分論文提供指向全文提供者（付費(fèi)或免費(fèi)）的鏈接。學(xué)科范圍： - 主要收錄生物醫(yī)學(xué)和健康科學(xué)以及生命科學(xué)相關(guān)領(lǐng)域的文獻(xiàn)。 - 包括行為科學(xué)、健康專業(yè)所需要的化學(xué)、生物工藝學(xué)，基礎(chǔ)研究和臨床、護(hù)理、公共衛(wèi)生、衛(wèi)生政策發(fā)展或相關(guān)教育活動的內(nèi)容。 - 2000年起增加了生物、環(huán)境科學(xué)、海洋生物、植物和動物學(xué)、生物物理學(xué)和生物化學(xué)等生命科學(xué)方面的研究內(nèi)容。（三）PubMed數(shù)據(jù)來源MEDLINE（完整的核心數(shù)據(jù)）是美國

4、國立醫(yī)學(xué)圖書館最重要的書目文摘數(shù)據(jù)庫，PubMed主體部分，1966至今的MEDLINE已標(biāo)引數(shù)據(jù)，有MeSH字段和摘要，每條記錄標(biāo)有PubMed-indexed for MEDLINE OldMDENLINE（早期的舊數(shù)據(jù)）1949-1965年間的MEDLINE數(shù)據(jù)，沒有MeSH字段和摘要，每條記錄標(biāo)有PubMed-OLDMEDLINE （三） PubMed數(shù)據(jù)來源MEDLINE Inprocess（正在被標(biāo)引的數(shù)據(jù)）PubMed每天收錄由Medline的期刊出版商提供的尚未經(jīng)規(guī)范處理的數(shù)據(jù)，該庫中的記錄只有簡單的書目信息和文摘，又稱PreMedline 。該庫中的數(shù)據(jù)每周一次轉(zhuǎn)入MEDLI

5、NE，同時(shí)從PreMedline中刪去。當(dāng)進(jìn)入MEDLINE時(shí)就會被標(biāo)引，每條記錄標(biāo)有PubMed-in process。Not MEDLINE（數(shù)據(jù)商提供的數(shù)據(jù)）出版商提供的電子文獻(xiàn)中MEDLINE不收錄的數(shù)據(jù)。出版商一般提供的是整本期刊的信息，一部分?jǐn)?shù)據(jù)每日將被添加到PreMedline中去,若有部分沒有被MEDLINE收錄，PubMed仍保存。每條記錄標(biāo)有PubMed-as supplied by publisher。Pre-MedlineNew DataPubMedProcessMedlineCollect Not MedlineOldMedlinePubMed數(shù)據(jù)收錄情況點(diǎn)擊數(shù)據(jù)庫名

6、稱基本檢索框高級檢索題錄檢索主題詞檢索期刊檢索輸入檢索式例1：檢索有關(guān)心瓣膜疾病（heart valve disease）診斷（diagnosis）方面的文獻(xiàn)。點(diǎn)擊“Search”文獻(xiàn)類型文獻(xiàn)可獲取內(nèi)容讀者評論出版時(shí)間物種語言性別主題期刊來源檢索字段年齡 例2：檢索近兩年有關(guān)細(xì)胞凋亡的綜述文獻(xiàn)，要求檢出免費(fèi)全文 內(nèi)容特征： apoptosis 外部特征： last 2 years review free full text 顯示設(shè)置輸出格式摘要文本格式摘要文摘文本格式文摘網(wǎng)頁格式排序時(shí)間相關(guān)度出版時(shí)間第一作者通訊作者期刊標(biāo)題結(jié)果輸出文本剪貼板郵箱文獻(xiàn)管理軟件標(biāo)題含有檢索詞文獻(xiàn) 按收入時(shí)間/相關(guān)

7、度排序切換 按年統(tǒng)計(jì)的文章圖表查找相關(guān)文獻(xiàn)詳細(xì)檢索過程最近檢索行為點(diǎn)擊See more點(diǎn)擊“URL”點(diǎn)擊“Create alert”點(diǎn)擊注冊帳戶點(diǎn)擊注冊輸入用戶名和密碼點(diǎn)擊登錄顯示用戶名點(diǎn)擊保存點(diǎn)擊“My NCBI”二、高級檢索1、檢索式編制(search builder)通過字段限定和索引選詞構(gòu)建復(fù)雜檢索式例3：研究更年期抑郁癥激素替代療法的非中文文獻(xiàn) 內(nèi)容特征 激素替代療法 Hormone Replacement 更年期抑郁癥 Involutional Depression 外部特征 非中文 NOT chinese輸入檢索詞：hormone replacement直接編輯檢索式執(zhí)行檢索執(zhí)行

8、檢索結(jié)果預(yù)覽例4：檢索2000年以來美國斯安那州Pennington Biomedical Center 的Smith SR在期刊Diabetes上發(fā)表了多少篇文獻(xiàn)。五、主題詞檢索（MeSH Database）確定規(guī)范化主題詞查看主題詞詞義注釋、樹狀結(jié)構(gòu)表選擇副主題詞、擴(kuò)展主題詞、主要主題詞例5：欲查近5年研究腎衰竭飲食療法并進(jìn)一步觀察其療效的相關(guān)文獻(xiàn)。 內(nèi)容特征： renal failure diet therapy treatment outcome 外部特征： last 5 years 輸入自由詞：renal failure點(diǎn)按規(guī)范詞可獲詳細(xì)注解主題詞注釋副主題詞選擇檢索式構(gòu)建盒加權(quán)擴(kuò)展

9、樹：不進(jìn)行下位詞擴(kuò)檢入口詞：該規(guī)范詞所代替的非規(guī)范詞主題詞樹形結(jié)構(gòu)表：顯示該詞的學(xué)科隸屬關(guān)系 一篇文獻(xiàn)的所有主題詞中，論述文獻(xiàn)中心的主題詞稱主要主題詞（major topic headings） ,如以下三篇文獻(xiàn)的所有主題詞中紅色框里帶星號的就是主要主題詞將組配檢索式放入檢索盒中輸入新主題詞：Treatment outcome進(jìn)一步檢索腎衰竭綜合療效觀察（treatment outcome）選擇邏輯組配符通過MeSH Database檢索的結(jié)果，共85篇檢索結(jié)果更為專指六、單引文匹配（ Single Citation Matcher)輸入文獻(xiàn)外部特征信息，查找特定文獻(xiàn)?？獪?zhǔn)確，縮寫要標(biāo)準(zhǔn)著者姓名大小寫不敏感例6：查找黃國俊2006年發(fā)表在中華腫瘤雜志上的文獻(xiàn)1、查找“