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文檔簡介
1、名詞解釋:第一章蛋白質(zhì)化學(xué)氨基酸:蛋白質(zhì)的基本結(jié)構(gòu)單位,是含有氨基的羧酸。必需氨基酸:人或動物機(jī)體自身不能合成,必須由食物提供的氨基酸。氨基酸等電點(diǎn)(isoelectric point, pI):在某一 pH的溶液中,氨基酸解離成陽離子和陰離子 的趨勢及程度相等,成為兼性離子,呈電中性。此時溶液的pH值稱為該氨基酸的等電點(diǎn)。肽鍵(peptide bond):是由一個氨基酸的a-羧基與另一個氨基酸的a-氨基脫水縮合而形成的 化學(xué)鍵。肽單位:肽鍵(-CONH-)中的4個原子和2個a碳原子被約束在一個剛性平面(即肽 平面)上,即構(gòu)成一個肽單位。肽:是由氨基酸通過肽鍵縮合而形成的化合物。氨基酸殘基:肽
2、鏈中的氨基酸分子因?yàn)槊撍s合而基團(tuán)不全,被稱為氨基酸殘基(residue)。蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu):指多肽鏈中氨基酸的排列順序,維持一級結(jié)構(gòu)的主要化學(xué)鍵是肽鍵。蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)(secondary structure):蛋白質(zhì)分子中某一段肽鏈的局部空間結(jié)構(gòu),即 該段肽鏈主鏈骨架原子的相對空間位置,并不涉及氨基酸殘基側(cè)鏈的構(gòu)象。維持二級結(jié)構(gòu) 穩(wěn)定的主要作用力是氫鍵。超二級結(jié)構(gòu):在蛋白質(zhì)分子中,特別是球狀蛋白質(zhì)中,由若干相鄰的二級結(jié)構(gòu)單元(即a 螺旋、p折疊片和p轉(zhuǎn)角等)彼此相互作用組合在一起,形成有規(guī)則、在空間上能 辨認(rèn)的二級結(jié)構(gòu)組合體,充當(dāng)三級結(jié)構(gòu)的構(gòu)件單元,稱超二級結(jié)構(gòu)。結(jié)構(gòu)域(structure
3、 domail):對于較大的蛋白質(zhì)分子或亞基,多肽鏈往往由兩個或兩個以 上相對獨(dú)立的三維實(shí)體締合而成三級結(jié)構(gòu),這種相對獨(dú)立的三維實(shí)體稱結(jié)構(gòu)域。現(xiàn)在,結(jié)構(gòu) 域的概念有三種不同而又相互聯(lián)系的涵義:即獨(dú)立的結(jié)構(gòu)單位、獨(dú)立的功能單位和獨(dú)立的折 疊單位。蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)(tertiary structure ):整條肽鏈中全部氨基酸殘基的相對空間位置。 即肽鏈中所有原子在三維空間的排布位置。維持三級結(jié)構(gòu)的主要作用力是疏水鍵、離子鍵、 氫鍵和 Van der Waals力等。蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu)(quarternary structure):有些蛋白質(zhì)分子含有二條或多條多肽鏈,每一條多肽鏈都有完整的三級結(jié)構(gòu),
4、稱為蛋白質(zhì)的亞基(subunit)。蛋白質(zhì)分子中各亞基的空間 排布及亞基接觸部位的布局和相互作用,稱為蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu)。亞基之間的結(jié)合力主要 是疏水作用,其次是氫鍵和離子鍵。蛋白質(zhì)的變性:天然蛋白質(zhì)受到某些理化因素的影響,氫鍵、離子鍵(又稱鹽鍵)等次級 鍵被破壞,引起天然構(gòu)象解體,從而使其失去活性,稱為變性。蛋白質(zhì)復(fù)性:當(dāng)變性蛋白質(zhì)除去變性因素后,可重新回復(fù)到天然構(gòu)象,這一現(xiàn)象成為蛋白 質(zhì)復(fù)性。鹽溶:低濃度的中性鹽可增加蛋白質(zhì)的溶解度,這種現(xiàn)象稱為鹽溶。鹽析:向蛋白質(zhì)溶液中加入大量中性鹽,使蛋白質(zhì)脫去水化層而聚集沉淀析出的現(xiàn)象稱為 鹽析。第二章核酸化學(xué)核昔:含氮堿與戊糖通過糖昔鍵縮合成的糖昔。
5、核苷酸:是核昔的磷酸酯,是核昔中的戊糖羥基被磷酸酯化而成的,分為核糖核昔酸與脫 氧核糖核苷酸。核酸:是由幾十個甚至幾千萬個核昔酸聚合而成的具有一定空間結(jié)構(gòu)的生物大分子。磷酸二酯鍵:一種化學(xué)基團(tuán),指一分子磷酸與兩個醇(羥基)酯化形成的兩個脂鍵,該脂 鍵成了兩個醇之間的橋梁。DNA的一級結(jié)構(gòu):由dAMP、dGMP、dCMP、dTMP核苷酸單體通過3,5-磷酸二酯 鍵相連而成的鏈狀聚合物。也可指DNA分子中堿基的順序。DNA雙螺旋結(jié)構(gòu):核小體:真核生物中DNA雙螺旋沿著組蛋白八聚體核心的短軸繞1.75圈,形成左手超螺 旋,稱核小體。是染色質(zhì)的基本結(jié)構(gòu)單位?;颍杭匆欢斡泄δ艿腄NA片段,生物細(xì)胞中D
6、NA分子的最小功能單位(交換單位)?;蚪M:一個細(xì)胞或生物體所含的全套基因。RNA的一級結(jié)構(gòu):RNA分子中各核苷之間的連接方式(3-5磷酸二酯鍵)和排列順序叫 做RNA的一級結(jié)構(gòu)。tRNA的結(jié)構(gòu):二級結(jié)構(gòu)特征:單鏈、三葉草葉形、四臂四環(huán);三級結(jié)構(gòu)特征:在二級結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)上進(jìn)一步折疊扭曲形成倒L型。rRNA的分子結(jié)構(gòu)特征:單鏈,螺旋化程度較tRNA低;與蛋白質(zhì)組成核糖體后方能發(fā)揮其 功能。mRNA的分子結(jié)構(gòu):原核生物mRNA特征:先導(dǎo)區(qū)+翻譯區(qū)(多順反子)+末端序列;真 核生物mRNA特征:“帽子”(m7G-5ppp5-N-3p) +單順反子+“尾巴”(Poly A)。DNA變性:在物理、化學(xué)因素影
7、響下,DNA堿基對間的氫鍵斷裂,雙螺旋解開,這是一 個是躍變過程,伴有A260增加(增色效應(yīng)),DNA的功能喪失。Tm (熔解溫度melting temperature) : DNA的變性發(fā)生在一個很窄的溫度范圍內(nèi),通常把 熱變性過程中A260達(dá)到最大值一半(即DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)失去一半)時的溫度稱為該DNA的 熔解溫度,用Tm表示。增色效應(yīng):由于核酸變性而引起對紫外線吸收增加的現(xiàn)象。DNA復(fù)性:在一定條件下,變性DNA單鏈間堿基重新配對恢復(fù)雙螺旋結(jié)構(gòu),伴有A260 減小(減色效應(yīng)),DNA的功能恢復(fù)。減色效應(yīng):DNA復(fù)性后,許多物化性質(zhì)又得到恢復(fù),復(fù)性后紫外吸收增加的現(xiàn)象成為減色 效應(yīng)。分子雜
8、交:將不同來源的DNA經(jīng)熱變性后,緩慢冷卻使其復(fù)性,若這些異源DNA之間在 某些區(qū)域具有相同的堿基序列,剛在復(fù)性時,兩種來源不同而具有互補(bǔ)堿基序列的多核昔 酸片段可形成雙螺旋,稱為雜交作用。這種雜交可以發(fā)生在DNA與DNA之間,也可發(fā)生 在DNA和RNA之間。第三章酶:是一類由活性細(xì)胞產(chǎn)生的具有生物催化作用和高度專一性的特殊蛋白質(zhì)或核酸。簡單 說,酶是一類由活性細(xì)胞產(chǎn)生的生物催化劑。全酶:酶蛋白與輔助因子結(jié)合成的完整分子稱為全酶。酶蛋白和輔助因子單獨(dú)存在均無催 化活性,只有二者結(jié)合為全酶才有催化活性。酶活力:又稱為酶活性,指酶催化一定化學(xué)反應(yīng)的能力。通常以在一定條件下酶所催化的化 學(xué)反應(yīng)(初)
9、速度來表示。因此酶活力可用單位時間內(nèi)底物的減少量或產(chǎn)物增加量表示,單位 為濃度/單位時間。酶活力單位U (Unit):是衡量酶活力大小的計(jì)量單位,又稱酶單位,規(guī)定條件(最適條件) 下一定時間內(nèi)催化完成一定化學(xué)反應(yīng)量所需的酶量。酶的比活力(比活性):每單位(一般是mg)蛋白質(zhì)中的酶活力單位數(shù)(酶單位mg蛋白)。酶的活性中心:酶分子中結(jié)合底物并起催化作用的少數(shù)氨基酸殘基形成的一定空間結(jié)構(gòu)。 包括底物結(jié)合部位和催化部位。米氏常數(shù)Km:酶促反應(yīng)速率達(dá)到最大速率一半時的底物濃度。酶原(zymogen):有些酶在細(xì)胞內(nèi)合成或初分泌時只是酶的無活性前體,此前體物質(zhì)稱為 酶原。酶原的激活:在一定條件下,酶原向
10、有活性酶轉(zhuǎn)化的過程。變構(gòu)調(diào)節(jié)(allosteric regulation):一些代謝物可與某些酶分子活性中心外的某部分可逆地 結(jié)合,使酶構(gòu)象改變,從而改變酶的催化活性,此種調(diào)節(jié)方式稱變構(gòu)調(diào)節(jié)。共價調(diào)節(jié)酶:酶分子被其他酶催化進(jìn)行可逆的共價修飾,從而引起酶活性的改變。同工酶(isoenzyme):是指催化相同的化學(xué)反應(yīng),而酶蛋白的分子結(jié)構(gòu)理化性質(zhì)乃至免疫學(xué) 性質(zhì)不同的一組酶。中間產(chǎn)物學(xué)說:鎖鑰學(xué)說:認(rèn)為整個酶分子的天然構(gòu)象是具有剛性結(jié)構(gòu)的,酶表面具有特定的形狀。酶與 底物的結(jié)合如同一把鑰匙對一把鎖一樣。誘導(dǎo)契合學(xué)說:該學(xué)說認(rèn)為酶表面并沒有一種與底物互補(bǔ)的固定形狀,而只是由于底物的 誘導(dǎo)才形成了互補(bǔ)形狀.酶的抑制劑(i nhibitor):凡能使酶的催化活性下降而不引起酶蛋白變性的物質(zhì)稱為酶的抑 制劑。酶的抑制作用:不可逆抑制作用:抑制劑與酶反應(yīng)中心的活性基團(tuán)以共價形式結(jié)合,引起酶的永久性失活。 如有機(jī)磷毒劑二異丙基氟磷酸酯。可逆抑制作用(reversible inhibition):抑制劑與酶蛋白以非共價方式結(jié)合,引起酶活性暫時 性喪失。抑制劑可以通過透析等方法被除去,并且能部分或全部恢復(fù)酶的活性。競爭性抑制作用:某些抑制劑的化學(xué)結(jié)構(gòu)與底物相似,因而能與底物競爭與酶活性中心結(jié) 合。當(dāng)抑制劑與活性中心結(jié)合后,底物被排斥在反應(yīng)中
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