口腔粘膜細(xì)胞基因組制備_第1頁
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文檔簡介

1、關(guān)于口腔粘膜細(xì)胞基因組制備第一張,PPT共十七頁,創(chuàng)作于2022年6月基因組DNA的提取通常用于構(gòu)建基因組文庫、Southern雜交(包括RFLP)及PCR分離基因等。是一般的基因工程實(shí)驗(yàn)中DNA操作的最初步驟。 一、基因組DNA的提取與純化目的:第二張,PPT共十七頁,創(chuàng)作于2022年6月核酸分離純化的總原則: 保證核酸一級結(jié)構(gòu)完整 排除其它分子的污染:細(xì)胞內(nèi):蛋白質(zhì)、脂類、糖、RNA等提取過程中:有機(jī)熔劑、金屬離子、外源DNA 第三張,PPT共十七頁,創(chuàng)作于2022年6月細(xì)胞樣品的核酸提取的主要步驟破碎細(xì)胞去除細(xì)胞內(nèi)的其它分子:蛋白質(zhì)多糖脂類去除鹽類、有機(jī)溶劑等雜質(zhì)第四張,PPT共十七頁,

2、創(chuàng)作于2022年6月核酸提取注意事項(xiàng)減少化學(xué)因素對核酸的降解如過量酸堿減少物理因素對核酸的降解機(jī)械剪切力:強(qiáng)烈震蕩、滲透壓急劇改變、反復(fù)凍融高溫防止核酸的生物降解核酸酶的預(yù)防 第五張,PPT共十七頁,創(chuàng)作于2022年6月二、人基因組DNA的制備 實(shí)驗(yàn)?zāi)康募耙饬x:從人口腔上皮細(xì)胞中提取純的基因組DNA掌握基因組DNA抽提的方法,理解核酸分離純化的基本原理第六張,PPT共十七頁,創(chuàng)作于2022年6月分離純化基因組DNA的常用方法: 不同生物(植物、動(dòng)物、微生物)的基因組DNA的提取方法有所不同,分離方法也有差異。主要根據(jù)不同細(xì)胞的特點(diǎn)而有區(qū)別,但原理相似,因此它們有共同的步驟: 裂解細(xì)胞:SDS裂

3、解細(xì)胞,EDTA抑制核酸酶 除去蛋白質(zhì):蛋白酶K水解蛋白質(zhì),酚和氯仿/異戊醇抽提、分離蛋白質(zhì);析出DNA:乙醇沉淀使DNA從溶液中析出。 第七張,PPT共十七頁,創(chuàng)作于2022年6月實(shí)驗(yàn)材料及試劑材料:人口腔上皮細(xì)胞試劑:抽提緩沖液:Tris-Cl pH8.0 ,EDTA,NaCl, RNAase, SDS,蛋白酶K水飽和酚氯仿/異戊醇(V/V=24:1)75%乙醇、95%乙醇TE緩沖液:Tris,EDTA第八張,PPT共十七頁,創(chuàng)作于2022年6月主要試劑的功能抽提緩沖液:由SDS、EDTA、蛋白酶K組成SDS的作用是裂解細(xì)胞EDTA 的作用是絡(luò)合掉鎂等二價(jià)金屬離子,防止DNA酶對DNA分子

4、的降解作用。蛋白酶K的作用是水解蛋白質(zhì)。酚和氯仿/異戊醇:抽提分離蛋白質(zhì)乙醇:沉淀DNATE:溶解DNA第九張,PPT共十七頁,創(chuàng)作于2022年6月取材:用生理鹽水漱口后,口含生理鹽水1015ml約23min,用15ml離心管(4000rpm 10min)收集細(xì)胞沉淀 (離心機(jī)的使用,平衡)加入0.5ml抽提緩沖液,重懸沉淀 ,轉(zhuǎn)移至1.5ml EP管 (微量移液器的正確使用)混勻,65 溫育30min加入等體積的飽和酚(0.5ml),充分顛倒混勻(不要震蕩!)P13實(shí)驗(yàn)步驟及注意事項(xiàng)(一人一組): 第十張,PPT共十七頁,創(chuàng)作于2022年6月12000rpm5min,上層水相轉(zhuǎn)移至新的EP管

5、 (高速離心機(jī)的使用與安全意識)加入等體積氯仿/異戊醇,顛倒混勻12000rpm5min,上層水相轉(zhuǎn)移到新的EP管 加入2倍體積95%的乙醇,顛倒混勻12000rpm10min 第十一張,PPT共十七頁,創(chuàng)作于2022年6月第十二張,PPT共十七頁,創(chuàng)作于2022年6月棄上清,沉淀中加入75%乙醇12000rpm2min 輕輕棄去上清,打開EP蓋,室溫靜置510min 加入30l0.1TE溶液,充分混勻后檢測結(jié)果第十三張,PPT共十七頁,創(chuàng)作于2022年6月分子醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)注意事項(xiàng)微量移液器的正確使用離心機(jī)的正確使用上課紀(jì)律撰寫實(shí)驗(yàn)報(bào)告的規(guī)范第十四張,PPT共十七頁,創(chuàng)作于2022年6月實(shí)驗(yàn)結(jié)果及其分析 定性分析:DNA瓊脂糖凝膠電泳 PCR-SSCP 多態(tài)性分析下次實(shí)驗(yàn)課進(jìn)行第十五張,PPT共十七頁,創(chuàng)作于2022年6月常見問題: 1、提取的DNA不純: 變性不充分;關(guān)鍵過程反應(yīng)時(shí)間過短; 離心時(shí)間或速度不夠。 2、提取的DNA成涂布狀: 操作過程中用力過猛,動(dòng)作粗暴; 操作系統(tǒng)有污

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