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文檔簡介

1、醫(yī)學(xué)信息資源中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)信息研究所本章學(xué)習(xí)目標(biāo)2了解內(nèi)容醫(yī)學(xué)信息資源的定義醫(yī)學(xué)信息資源的類型醫(yī)學(xué)信息資源應(yīng)用的分類循證醫(yī)學(xué)研究的證據(jù)分級(jí)掌握內(nèi)容循證醫(yī)學(xué)資源的檢索模型臨床類醫(yī)學(xué)信息資源常用類型及檢索步驟臨床類醫(yī)學(xué)信息資源常用數(shù)據(jù)庫及檢索步驟轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)類醫(yī)學(xué)信息資源常用類型及檢索步驟公共衛(wèi)生類醫(yī)學(xué)信息資源常用數(shù)據(jù)庫藥學(xué)領(lǐng)域醫(yī)學(xué)信息資源常用類型課程內(nèi)容 醫(yī)學(xué)信息資源應(yīng)用3.醫(yī)學(xué)信息資源類型2.醫(yī)學(xué)信息資源概述1.3本章小結(jié)4.1 醫(yī)學(xué)信息資源概述4臨床醫(yī)生學(xué)習(xí)醫(yī)學(xué)信息資源的重要性信息資源定義及特點(diǎn)醫(yī)學(xué)信息資源定義及特點(diǎn)臨床醫(yī)生學(xué)習(xí)信息資源重要性5網(wǎng)絡(luò)環(huán)境下臨床醫(yī)生對(duì)信息的需求更加迫切臨床醫(yī)生對(duì)

2、資源類型需求轉(zhuǎn)變從傳統(tǒng)期刊文獻(xiàn)向網(wǎng)絡(luò)、電子資源轉(zhuǎn)變需要掌握何種資源提供何種知識(shí)需要掌握不同數(shù)據(jù)庫資源的特定檢索技能醫(yī)學(xué)信息資源重要性分析6現(xiàn)代醫(yī)學(xué)科學(xué)技術(shù)的快速發(fā)展 ,知識(shí)更新速度加快臨床醫(yī)生需要快速更新自己的知識(shí)結(jié)構(gòu)如何快速更新自身的知識(shí)結(jié)構(gòu)?不斷學(xué)習(xí)吸收醫(yī)學(xué)領(lǐng)域中的新理論、新技術(shù)、新方法 ,使自己學(xué)到的醫(yī)學(xué)知識(shí)與醫(yī)學(xué)科學(xué)的發(fā)展同步合格的醫(yī)生能快速檢索、評(píng)價(jià)和獲得可靠的最新醫(yī)學(xué)資訊掌握醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)檢索方法和培養(yǎng)文獻(xiàn)信息資源的獲取興趣和能力信息資源定義及特征 信息資源定義 以文字、數(shù)據(jù)、編碼、圖形、圖像、動(dòng)畫和視頻等形式存儲(chǔ)在一定的載體上并能利用和交流、存儲(chǔ)的所有文獻(xiàn)的總和,包括以實(shí)體形式出版發(fā)行

3、的文獻(xiàn)和以虛擬形式傳播交流的網(wǎng)絡(luò)信息資源。 信息資源特點(diǎn)7知識(shí)性再加工性時(shí)效性可共享性目標(biāo)性8醫(yī)學(xué)信息資源定義 經(jīng)過人類組織、加工,可以存取并能夠滿足人類需求的各種醫(yī)學(xué)信息的集合。它首先是有關(guān)醫(yī)學(xué)信息的,其次是經(jīng)過組織、序化、可存取的信息集合,包括各種載體形式,如印刷型、縮微型、視聽型及網(wǎng)絡(luò)信息等。 醫(yī)學(xué)信息資源特點(diǎn)數(shù)量急劇增長,總量居各學(xué)科首位 類型多種多樣, 文種復(fù)雜學(xué)科交融滲透,內(nèi)容重復(fù)分散半衰期最短,信息更新速度加快醫(yī)學(xué)信息資源定義及特點(diǎn)2 醫(yī)學(xué)信息資源類型9醫(yī)學(xué)信息資源文獻(xiàn)型數(shù)字型圖書期刊縮微型文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫電子圖書網(wǎng)絡(luò)信息資源文摘數(shù)據(jù)庫全文數(shù)據(jù)庫引文數(shù)據(jù)庫網(wǎng)絡(luò)搜索引擎醫(yī)學(xué)專業(yè)網(wǎng)站文摘數(shù)

4、據(jù)庫10PubMed 由美國國立醫(yī)學(xué)圖書館的國立生物技術(shù)信息中心研制開發(fā)生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域最重要、最權(quán)威的數(shù)據(jù)庫之一截止2013年12月,共收錄文獻(xiàn)記錄22,376,811條Embase由荷蘭Elsevier公司于2003年研制開發(fā) 截止2013年12月,共收錄來自7,600多種期刊(其中有幾千種未被PubMed收錄的期刊)的文獻(xiàn)記錄2500萬條BIOSIS Previews由美國生物科學(xué)信息服務(wù)社編輯出版包含Biological Abstracts和Biological Abstracts/RRM目前,該數(shù)據(jù)庫整合在Web of Knowledge平臺(tái)和Ovid平臺(tái)上SciFinder由美國化學(xué)會(huì)

5、下屬的化學(xué)文摘服務(wù)社出版發(fā)行化學(xué)化工、藥學(xué)、生物化學(xué)等領(lǐng)域重要信息檢索工具11中國學(xué)術(shù)期刊網(wǎng)絡(luò)出版總庫 國家知識(shí)基礎(chǔ)設(shè)施眾多數(shù)據(jù)庫之一;內(nèi)容覆蓋自然科學(xué)、工程技術(shù)、農(nóng)業(yè)、哲學(xué)、醫(yī)學(xué)、人文社會(huì)科學(xué)等各個(gè)領(lǐng)域;截至2013年3月,收錄國內(nèi)期刊8 000余種,全文文獻(xiàn)總量3 690多萬篇。SpringerLink有Springer出版社于1996年推出 ;截止2013年12月,共收錄信息資源記錄828萬余條,其中文章類493萬余篇。Wiley Online Library由Wiley & Sons出版公司于1807年在美國創(chuàng)建;覆蓋生命科學(xué)、健康科學(xué)、自然科學(xué)、社會(huì)與人文科學(xué)等;檢索、瀏覽題錄信息和

6、開放信息全球免費(fèi),但閱讀全文需要權(quán)限。EBSCOhost由EBSCO研制推出的綜合性檢索平臺(tái);數(shù)據(jù)庫內(nèi)容涉及理、工、農(nóng)、醫(yī)等多個(gè)學(xué)科,有近60個(gè)數(shù)據(jù)庫,其中全文數(shù)據(jù)庫10余個(gè)。全文數(shù)據(jù)庫12 Thieme出版社是德國著名的科學(xué)和醫(yī)學(xué)出版社 2004年初推出電子圖書平臺(tái)E-BOOK Library,首批上網(wǎng)的是Thieme出版社享譽(yù)學(xué)術(shù)界的Color Atlas系列圖書。 E-BOOK Library主要領(lǐng)域 神經(jīng)外科學(xué)、醫(yī)學(xué)影像學(xué)、耳鼻咽喉科學(xué)、整形外科學(xué)、眼科學(xué)、聽力學(xué)、聽力與語言學(xué)、互補(bǔ)醫(yī)學(xué)和化學(xué)。Color Atlas系列圖書涵蓋了醫(yī)學(xué)院校開設(shè)的課程和多學(xué)科基礎(chǔ)科學(xué)學(xué)科的內(nèi)容Oxford

7、 University Press電子圖書Thiemehttp:/bookshelf13引文即引用文獻(xiàn),指論文作者在科學(xué)研究過程、撰寫論文過程中參考、繼承前人研究成果而特地注明的文獻(xiàn)信息。引文索引按文獻(xiàn)之間引證關(guān)系,收錄和報(bào)道來源文獻(xiàn)及其引文的檢索工具。引文數(shù)據(jù)庫作用作用提供查閱原文獻(xiàn)的可能性, 便于了解論著中引用內(nèi)容;為論著的審閱者、編者和讀者評(píng)估論著價(jià)值和水平提供客觀依據(jù);揭示科技文獻(xiàn)之間引證與被引證的關(guān)系展示科技文獻(xiàn)內(nèi)容之間聯(lián)系降低檢索結(jié)果的不相關(guān)性獲取更多相關(guān)文獻(xiàn)引文數(shù)據(jù)庫141997年,由美國科學(xué)情報(bào)研究所(ISI)編輯出版科學(xué)引文索引數(shù)據(jù)庫(SCI)的網(wǎng)絡(luò)版涵蓋自然科學(xué)、工程技術(shù)、

8、生物醫(yī)學(xué)、社會(huì)科學(xué)、藝術(shù)與人文等領(lǐng)域Web of Science由愛思唯爾(Elsevier)出版社研發(fā)涵蓋生命科學(xué)、自然科學(xué)、社會(huì)科學(xué)、醫(yī)學(xué)四大門類27個(gè)學(xué)科領(lǐng)域收錄生命科學(xué)(4,300余種)、社會(huì)科學(xué)與人文藝術(shù)(5,300余種)、自然科學(xué)(7,200余種)、醫(yī)學(xué)(6,800余種),全面覆蓋MedlineScopus1994年,解放軍醫(yī)學(xué)圖書館研制發(fā)行2008年,CMCI與中國生物醫(yī)學(xué)期刊文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫整合到一個(gè)檢索系統(tǒng)以局域網(wǎng)絡(luò)服務(wù),只能在訂購單位的局域網(wǎng)絡(luò)范圍內(nèi)使用每月更新,一年出版12期光盤中國生物醫(yī)學(xué)期刊引文數(shù)據(jù)庫網(wǎng)絡(luò)信息資源概述15定義 網(wǎng)絡(luò)信息資源(network informati

9、on resources)是指通過計(jì)算機(jī)網(wǎng)絡(luò)可以利用的各種信息資源的總和。 具體是指所有以電子數(shù)據(jù)形式把文字、圖像、聲音、動(dòng)畫等多種形式的信息存儲(chǔ)在光磁等非紙質(zhì)介質(zhì)的載體中,并通過網(wǎng)絡(luò)通信、計(jì)算機(jī)或終端等方式再現(xiàn)出來的資源。 1 羅愛靜.醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)信息檢索.第2版.北京:人民衛(wèi)生出版社,2010. 特點(diǎn)信息量大傳播廣泛信息層次多品種多樣信息傳播速度快變化頻繁自由發(fā)布交流直接檢索方便實(shí)用性強(qiáng)分散無序缺乏管理內(nèi)容龐雜良莠不齊共享程度高使用成本低網(wǎng)絡(luò)信息資源獲取工具網(wǎng)文快捕16主要功能 收集和整理網(wǎng)頁在各種瀏覽器內(nèi)保存正在瀏覽的網(wǎng)頁批量保存關(guān)心的網(wǎng)頁管理各種資料 例如:Office文檔(doc,xls

10、,ppt)、圖片、PDF文件、程序源代碼等網(wǎng)頁保存形式網(wǎng)頁(完整或選中部分)網(wǎng)頁文字(純文本,全部或選中部分)單獨(dú)保存圖片(單一圖片,選中圖片,或全部圖片)Flash動(dòng)畫(全部或部分)將網(wǎng)頁捕捉為圖片網(wǎng)絡(luò)信息資源獲取工具為知筆記17特點(diǎn) 網(wǎng)文快捕的升級(jí)版,采用云存儲(chǔ)所有采集的信息或記錄 采集的網(wǎng)頁以“筆記”形式同步保存在網(wǎng)絡(luò)上 建立不同的“文件夾”,實(shí)現(xiàn)文檔分類管理保存形式 完整網(wǎng)頁,分頁網(wǎng)頁 正文,文字,選中的文字 鏈接或選中部分的鏈接 圖片或作為圖片保存分享 在文檔的閱讀編輯頁面,可以對(duì)當(dāng)前文檔進(jìn)行快速的分享 分享:好友、郵件、博客為知筆記網(wǎng)頁采集對(duì)話框18網(wǎng)絡(luò)搜索引擎19學(xué)術(shù)搜索引擎Go

11、ogle學(xué)術(shù) Google提供的專門針對(duì)學(xué)術(shù)期刊網(wǎng)絡(luò)應(yīng)用SCIRUS Elsevier 開發(fā)的、專門面向科研人員的學(xué)術(shù)信息檢索工具圖像搜索一個(gè)電腦瀏覽的系統(tǒng),從一個(gè)大型的數(shù)字圖像數(shù)據(jù)庫去檢索圖像 醫(yī) 搜 學(xué) 索 專 引 業(yè) 擎HON http:/www.hon.ch OminMedicalSearch http:/Medical Matrix http:/學(xué)術(shù)搜索引擎Google學(xué)術(shù)20 Google提供的專門針對(duì)學(xué)術(shù)期刊網(wǎng)絡(luò)應(yīng)用 可檢索的學(xué)術(shù)期刊世界上絕大部分出版的學(xué)術(shù)期刊 學(xué)術(shù)著作出版商、專業(yè)性社團(tuán)、預(yù)印本、各大學(xué)及其他學(xué)術(shù)組織的經(jīng)同行評(píng)論的 文章、論文、圖書、文章摘要。 使用方法(與通用

12、google一樣,但其結(jié)果顯示略有差異)提供查找學(xué)術(shù)信息時(shí)常用的篩選限制和關(guān)聯(lián)鏈接可限定時(shí)間范圍、定制郵件通知、查詢參考文獻(xiàn)、被引用次數(shù)及具體文獻(xiàn)、相關(guān)文獻(xiàn)以及多個(gè)全文鏈接(全文鏈接包括收費(fèi)和免費(fèi),文件格式有PDF、HTML)Google學(xué)術(shù)查詢結(jié)果頁面21圖像搜索概述22定義 又稱圖像檢索系統(tǒng),是一個(gè)電腦瀏覽的系統(tǒng),從一個(gè)大型的數(shù)字圖像數(shù)據(jù)庫去檢索圖像。方式以文搜圖 基于上下文本的圖片檢索,輸入圖片的關(guān)鍵字直接搜索想要的圖片。 基本思路:先用文本注釋圖像信息,再利用基于文本的數(shù)據(jù)庫管理系統(tǒng)檢索文獻(xiàn)的信息。以圖搜圖 按照?qǐng)D片自身包含的圖像的色彩、形狀、紋理等原始信息內(nèi)容作為檢索信息,查找相似性

13、圖片。圖像搜索CNKI學(xué)術(shù)圖片知識(shí)庫23圖片來源: CNKI收錄的各類學(xué)術(shù)文獻(xiàn)提供功能: 根據(jù)圖片語義和視覺信息,提供相似圖表的檢索、對(duì)比和分析功能等。依照關(guān)鍵詞搜索出圖片給出某一圖片為核心的圖片知網(wǎng)節(jié)給出語義相似圖片、讀者推薦圖片、同文圖片肝炎病毒CNKI學(xué)術(shù)圖片知識(shí)庫相似性檢索24相似性檢索醫(yī)學(xué)專業(yè)搜索引擎HON 25成立 1996年,由瑞士日內(nèi)瓦的非盈利性組織“網(wǎng)絡(luò)健康基金會(huì)”(The Health on the Net Foundation)建立作用 專門診斷因特網(wǎng)所提供的信息的正確性和可靠性,并提倡網(wǎng)絡(luò)倫理提供服務(wù) HONtopicHONtoolHONsearchHONcode醫(yī)學(xué)專

14、業(yè)搜索引擎HONsearch 26 HON搜索引擎的主要服務(wù)提供服務(wù)經(jīng)過其認(rèn)證的信譽(yù)度高的醫(yī)學(xué)專業(yè)網(wǎng)站信息檢索服務(wù);其它醫(yī)學(xué)網(wǎng)站信息檢索服務(wù)。 檢索圖片、PubMed、罕見疾病數(shù)據(jù)庫、分子生物學(xué)、眼科疾病、臨床試驗(yàn)、醫(yī)學(xué)詞典縮略語http:/www.hon.ch醫(yī)學(xué)專業(yè)搜索引擎OmniMedicalSearch 27 被A和華盛頓報(bào)推薦為最好的醫(yī)療搜索引擎之一可搜索信息 網(wǎng)頁、圖片或論壇、醫(yī)學(xué)專業(yè)文獻(xiàn)、參考工具書等http:/醫(yī)學(xué)專業(yè)搜索引擎Medical Matrix 28美國醫(yī)學(xué)信息學(xué)會(huì)主辦一個(gè)以醫(yī)學(xué)主題詞為基礎(chǔ)的智能型搜索引擎分類目錄 疾病、臨床實(shí)踐、文獻(xiàn)、教育、衛(wèi)生保健人員和專家、計(jì)算

15、機(jī)技術(shù)應(yīng)用與網(wǎng)絡(luò)、醫(yī)藥市場常用醫(yī)學(xué)專業(yè)網(wǎng)站29醫(yī)學(xué)綜合網(wǎng)站NLM網(wǎng)站群 MedScapeOncolink美國疾病控制與 預(yù)防中心公眾健康類網(wǎng)站MedlinePlusWebMDMedicine NetGO ASK ALICE!其它醫(yī)學(xué)資源網(wǎng)站少見病、罕見病資源醫(yī)學(xué)圖譜、影像學(xué)資源臨床操作、診療常規(guī)、臨床指南醫(yī)生交流社區(qū)醫(yī)學(xué)綜合網(wǎng)站NLM網(wǎng)站群30醫(yī)學(xué)圖書館的楷模門戶網(wǎng)站:http:/提供信息:據(jù)庫檢索、研究探索、館藏資源獲取等指引信息News&EventsFindReadLearNLM for youDatabaseNLMExploreNLMReasearch at NLM醫(yī)學(xué)綜合網(wǎng)站NLM網(wǎng)站

16、群31Datebase:PubMedMeSH詞表一體化醫(yī)學(xué)語言系統(tǒng)臨床試驗(yàn)信息網(wǎng)站MedlinePlus毒性化合物數(shù)據(jù)中心醫(yī)學(xué)史圖片儲(chǔ)藏系統(tǒng)醫(yī)學(xué)綜合網(wǎng)站Medscape32提供資源 免費(fèi)網(wǎng)絡(luò)資源、臨床醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)全文、醫(yī)學(xué)繼續(xù)教育資源、繼續(xù)教育課程,專業(yè)網(wǎng)站和醫(yī)學(xué)新聞參考資料欄目提供多種數(shù)據(jù)庫檢索 Medline、疾病和癥狀知識(shí)庫、藥品使用說明、手術(shù)操作、解剖、圖片、MerriamWebsters醫(yī)學(xué)詞典等數(shù)據(jù)庫http:/參考資料欄目公眾健康網(wǎng)站MedlinePlus33美國國立醫(yī)學(xué)圖書館創(chuàng)建目標(biāo)用戶 病人、病人家屬以及其他個(gè)體提供資源 最新的治療方案和藥物信息、了解專業(yè)術(shù)語、查看視頻或圖譜欄目

17、健康主題(health topics)藥物(drugs&supplements)視頻與工具(videos & cool tools)http:/medlineplus/公眾健康網(wǎng)站W(wǎng)ebMD34美國最大的醫(yī)療健康服務(wù)網(wǎng)站擁有全球最豐富的健康醫(yī)療資訊全球醫(yī)師最愿意付費(fèi)上網(wǎng)的專業(yè)網(wǎng)站特點(diǎn)匯集全美醫(yī)師的臨床報(bào)告最新最完整的各種醫(yī)療資料庫欄目健康主題(health topics)藥物(drugs&supplements)視頻與工具(videos&cool tools)http:/少見病、罕見病資源35中國罕見疾病網(wǎng)遺傳與罕見病信息中心歐洲罕見疾病網(wǎng)醫(yī)學(xué)知識(shí)就醫(yī)指南患者之友論壇 美國國家罕見病組織網(wǎng)針對(duì)

18、罕見病家庭、罕見病患者、企業(yè)、醫(yī)學(xué)專業(yè)人士等不同對(duì)象的信息服務(wù)NIH建立和維護(hù)提供信息罕見疾病的常識(shí)問答有關(guān)罕見疾病的研究信息非政府組織歐洲罕見病聯(lián)盟建立維護(hù)“About Rare Diseases”欄目中設(shè)有許多國家和組織關(guān)于罕見病的網(wǎng)站聯(lián)機(jī)信息醫(yī)學(xué)圖譜、影像學(xué)資源36提供影像診斷、解剖、病理等基礎(chǔ)知識(shí);可視人數(shù)據(jù)庫人體斷層解剖瀏覽醫(yī)學(xué)影像園以讀片為特色 醫(yī)影在線提供北美放射學(xué)會(huì)主辦的放射學(xué)有關(guān)雜志,提供與放射有關(guān)的網(wǎng)絡(luò)資源 鏈接北美放射學(xué)會(huì)提供大量可下載人體可視人計(jì)劃的站點(diǎn)鏈接美國國家可視人計(jì)劃項(xiàng)目提供用于教育目的的2D和3D人體模型瀏覽密歇根大學(xué)可視人項(xiàng)目提供大量有關(guān)影像學(xué)操作的信息醫(yī)學(xué)

19、影像信息提供包括肌肉、血管、骨骼和多個(gè)器官的3D模型展示和熱點(diǎn)鏈接YAHOO人體虛擬解剖提供三維展示的男女解剖結(jié)構(gòu)和相應(yīng)部位的疾病常識(shí)、動(dòng)畫視頻等多媒體三維生物數(shù)字人平臺(tái)可檢索收藏的近7萬張醫(yī)學(xué)歷史圖片NLM醫(yī)學(xué)史圖片庫臨床操作、診療常規(guī)、臨床指南37Springer實(shí)驗(yàn)室指南優(yōu)酷臨床操作視頻專輯/v_playlist/f1496175o1p6.htmlWiley實(shí)驗(yàn)室指南/Medscape的臨床技能操作資源http:/a-to-z-guides/tests/default.htm/http:/clinical_proceduresWebMD的醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)和工具資源馬里蘭急診醫(yī)學(xué)服務(wù)指南http:

20、/home/EMSProviders/EMSProviderProtocols/tabid/106/Default.aspx醫(yī)生交流社區(qū)38國內(nèi)較早,也是目前國內(nèi)最大醫(yī)生交流社區(qū)丁香園醫(yī)緯達(dá)提供二維、三維解剖圖譜、醫(yī)學(xué)圖譜、臨床用藥參考、診療指引參考等生物醫(yī)學(xué)專家社區(qū)查找被PubMed收錄的文獻(xiàn),同時(shí)通過查找感興趣的研究機(jī)構(gòu)、研究人員、研究主題和會(huì)議信息,尋找合作者研究之門科學(xué)家可以分享研究成果、學(xué)術(shù)著作,以及參加一些科研論壇或興趣小組醫(yī)學(xué)論壇網(wǎng)源于中國醫(yī)學(xué)論壇報(bào)生物谷論壇生物360提供的有關(guān)生物醫(yī)學(xué)前沿信息擁有包括生物谷,生物在線,醫(yī)藥生物人才網(wǎng),制藥在線,中國生命科學(xué)論壇,生物匯展網(wǎng)等多個(gè)

21、平臺(tái)1234563 醫(yī)學(xué)信息資源應(yīng)用臨床醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)資源資源概述資源類型案例分析公共衛(wèi)生信息資源資源類型案例分析藥學(xué)信息資源資源類型案例分析生物信息學(xué)資源資源類型案例分析中醫(yī)藥學(xué)信息資源資源類型案例分析轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)信息資源資源類型案例分析臨床醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)資源40 臨床醫(yī)學(xué)信息資源概述 臨床醫(yī)學(xué)證據(jù)基本知識(shí) 循證醫(yī)學(xué)實(shí)踐步驟 循證醫(yī)學(xué)信息資源類型詢證醫(yī)學(xué)專業(yè)數(shù)據(jù)庫臨床實(shí)踐指南數(shù)據(jù)庫循證醫(yī)學(xué)期刊資源其它循證醫(yī)學(xué)網(wǎng)絡(luò)資源 案例分析 臨床醫(yī)學(xué)信息資源概述41循證醫(yī)學(xué)出現(xiàn)的背景傳統(tǒng)的臨床醫(yī)學(xué)以經(jīng)驗(yàn)醫(yī)學(xué)為主現(xiàn)代醫(yī)學(xué)模式是在經(jīng)驗(yàn)醫(yī)學(xué)的基礎(chǔ)上,同時(shí)強(qiáng)調(diào)循證醫(yī)學(xué)采集病史和體格檢查基礎(chǔ)上,要求臨床醫(yī)生進(jìn)行精確的文獻(xiàn)檢索運(yùn)用評(píng)

22、價(jià)臨床文獻(xiàn)的正規(guī)方法發(fā)現(xiàn)最有效地證據(jù)根據(jù)證據(jù)解決臨床問題,制定疾病的治療方案和預(yù)防措施。循證醫(yī)學(xué)信息資源的作用提供疾病在治療、預(yù)防、診斷、病因等多方面的研究證據(jù)幫助醫(yī)生更加精準(zhǔn)的找到解決臨床問題的證據(jù) 循證醫(yī)學(xué)證據(jù)基本知識(shí)42臨床研究證據(jù)的分類循證醫(yī)學(xué)證據(jù)級(jí)別循證醫(yī)學(xué)證據(jù)檢索5S模型臨床研究證據(jù)的分類43按研究方法按研究問題按用戶需要按獲得渠道原始臨床研究證據(jù) 隨機(jī)對(duì)照試驗(yàn) 隊(duì)列研究 病例 - 對(duì)照研究 無對(duì)照的研究 二次臨床研究證據(jù) 系統(tǒng)評(píng)價(jià) Meta分析 臨床實(shí)踐指南 衛(wèi)生技術(shù)評(píng)估病因臨床研究證據(jù)診斷臨床研究證據(jù)預(yù)防臨床研究證據(jù)治療臨床研究證據(jù)預(yù)后臨床研究證據(jù)系統(tǒng)評(píng)價(jià)臨床實(shí)踐指南臨床決策分

23、析臨床證據(jù)手冊(cè)衛(wèi)生技術(shù)評(píng)估健康教育資料公開發(fā)表的臨床研究證據(jù)灰色文獻(xiàn)在研的臨床研究證據(jù)網(wǎng)上信息循證醫(yī)學(xué)證據(jù)級(jí)別44推薦分級(jí)證據(jù)類別病因、治療、預(yù)防的證據(jù)A1aRCTs,系統(tǒng)評(píng)價(jià)1b單項(xiàng)RCT,95%可信區(qū)間1c全或無(傳統(tǒng)治療全部無效)B2a隊(duì)列研究的系統(tǒng)評(píng)價(jià)2b單項(xiàng)隊(duì)列研究及質(zhì)量差的RCT2c結(jié)局研究3a病例對(duì)照研究的系統(tǒng)評(píng)價(jià)3b單項(xiàng)病例對(duì)照研究C4病例分析或質(zhì)量差的病例對(duì)照研究D5沒有分析評(píng)價(jià)的專家意見循證醫(yī)學(xué)證據(jù)檢索5S模型45SystemsSummariesSynopsesSynthesesStudies系統(tǒng)總結(jié)摘要綜述研究例如:Computerized decision suppor

24、t計(jì)算機(jī)決策支持系統(tǒng)Evidence-based textbooks循證教科書Evidence-based Journal abstracts循證期刊摘要Systematic Reviews系統(tǒng)評(píng)價(jià)Original journal articles期刊原始研究1、確定擬弄清的問題人群/病人干預(yù)措施比較結(jié)局指標(biāo)檢索策略電子檢索手工檢索3、嚴(yán)格評(píng)價(jià)證據(jù)真實(shí)性重要性適應(yīng)性4、得出結(jié)論肯定的最佳證據(jù):推薦臨床應(yīng)用無效或有害:建議停止或廢棄臨床應(yīng)用尚無證據(jù):建議進(jìn)一步研究5、后效評(píng)價(jià)Evidence is never enough不斷更新終身教育2、全面查找證據(jù)循證醫(yī)學(xué)實(shí)踐步驟46收集證據(jù)證據(jù)評(píng)價(jià)提出問

25、題臨床決策后效評(píng)價(jià)循證醫(yī)學(xué)實(shí)踐步驟47針對(duì)所提出的臨床問題開始設(shè)計(jì)、收集相關(guān)證據(jù)收集證據(jù)的途徑 文獻(xiàn)檢索科學(xué)研究收集證據(jù)的來源 期刊專業(yè)數(shù)據(jù)庫醫(yī)學(xué)網(wǎng)站48收集證據(jù)循證醫(yī)學(xué)專業(yè)數(shù)據(jù)庫49 Cochrane Library http:/ 提供高質(zhì)量科學(xué)證據(jù)的數(shù)字化文獻(xiàn)庫 OVID循證醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫 匯集了主要的循證醫(yī)學(xué)資源Best Evidence: ACP Journal Club, Evidence Based Medicine, Cochrane CDSR, Cochrane DARE及Cochrane Controlled Trials Register BMJ Best Practice h

26、ttp:/bestpracticeClinical Evidence、患者教育和藥物數(shù)據(jù)庫三方面的資源 Uptodate /home提供實(shí)時(shí)循證醫(yī)學(xué)及臨床醫(yī)療信息的數(shù)據(jù)庫 Pier http:/ 為臨床醫(yī)師提供權(quán)威的臨床研究證據(jù)來提高醫(yī)療保健水平 Clin-eguide 為臨床醫(yī)師提供權(quán)威的臨床研究證據(jù)來提高醫(yī)療保健水平Cochrane Library 概述50 由國際Cochrane 協(xié)作網(wǎng)(Cochrane Collaboration)開發(fā),是一個(gè)提供高質(zhì)量科學(xué)證據(jù)的數(shù)字化文獻(xiàn)庫。 包括Cochrane各實(shí)體組織,如系統(tǒng)評(píng)價(jià)小組、各Cochrane中心的簡介和聯(lián)系信息等Cochrane 協(xié)

27、作網(wǎng)相關(guān)信息提供Cochrane協(xié)作網(wǎng)51個(gè)系統(tǒng)評(píng)價(jià)小組在統(tǒng)一工作手冊(cè)指導(dǎo)下完成的系統(tǒng)評(píng)價(jià)Cochrane 臨床試驗(yàn)注冊(cè)數(shù)據(jù)庫收錄了衛(wèi)生保健干預(yù)措施經(jīng)濟(jì)學(xué)評(píng)價(jià)研究的摘要NHS經(jīng)濟(jì)學(xué)評(píng)價(jià)數(shù)據(jù)庫提供Cochrane協(xié)作網(wǎng)51個(gè)系統(tǒng)評(píng)價(jià)小組在統(tǒng)一工作手冊(cè)指導(dǎo)下完成的系統(tǒng)評(píng)價(jià)Cochrane 系統(tǒng)評(píng)價(jià)數(shù)據(jù)庫目前唯一收錄經(jīng)過評(píng)選的系統(tǒng)評(píng)價(jià)摘要數(shù)據(jù)庫Cochrane 有效評(píng)價(jià)文摘庫目前收錄了60多萬項(xiàng)臨床試驗(yàn)數(shù)據(jù)文獻(xiàn)摘要Cochrane 方法學(xué)注冊(cè)數(shù)據(jù)庫收錄國際衛(wèi)生技術(shù)評(píng)估網(wǎng)絡(luò)成員單位和其他衛(wèi)生技術(shù)評(píng)估機(jī)構(gòu)提供的結(jié)構(gòu)式摘要衛(wèi)生技術(shù)評(píng)估數(shù)據(jù)庫 主要包括七個(gè)獨(dú)立數(shù)據(jù)庫51Cochrane Library 檢索

28、頁面http:/ 臨床實(shí)踐指南數(shù)據(jù)庫52國別指南庫名稱網(wǎng)址美國美國國立指南庫National Guideline Clearinghouse , NGC加拿大加拿大臨床實(shí)踐指南庫CMA Infobase: Clinical Practice Guidelineshttp:/mdm.ca/cpgsnew/cpgs英國英國國家衛(wèi)生圖書館指南庫National Library for Health, Search Guidancehttp:/www.library.nhs.uk/guidance新西蘭新西蘭指南庫New Zealand Guidelines Group.nz澳大利亞澳大利亞醫(yī)學(xué)臨床實(shí)

29、踐指南庫Australian National Health and Medical Research Council: Clinical Practice Guidelines.au循證醫(yī)學(xué)期刊資源53刊名ISSN出版商出版地ACP Journal Club1056-87511539-8560 (E)American College of Physicians-American Society of Internal MedicineUnited StatesClinical Evidence1752-8526 (E)*1462-3846BMJ Pub. GroupEnglandEviden

30、ce Based Library and Information Practice1715-720X(E)University of Alberta LibrariesCanadaEvidence Report/Technology Assessment1530-4396 Agency for Health Care Policy and ResearchUnited StatesEvidence Report/Technology Assessment (Summary)1530-440X U. S. Dept. of Health and Human Services, Public He

31、alth ServiceUnited StatesEvidence-Based Medicine1356-5524 1473-6810 (E)BMJ Publishing GroupEnglandEvidence-Based Nursing1367-6539 1468-9618 (E)RCN Pub. Co.EnglandJournal of Evidence-Based Social Work1543-37141543-3722 (E)Informa HealthcareEngland其它循證醫(yī)學(xué)網(wǎng)絡(luò)資源54搜索引擎: SUMSearch http:/提供多個(gè)國家臨床實(shí)踐指南一站式檢索功能

32、Trip Database 國內(nèi)外常用的臨床試驗(yàn)研究數(shù)據(jù)庫國家/區(qū)域數(shù)據(jù)庫名稱網(wǎng)址國際 WHO:International Clinical Trials Registry Platform (ICTRP)/trialsearchCochrane Library/cgi-bin/mrwhome/106568753中國中國臨床試驗(yàn)注冊(cè)中心(CHICTR)美國美國臨床試驗(yàn)數(shù)據(jù)庫ClincalT英國NHS:The National Research Registerhttps:/portal.nihr.ac.uk/Pages/NRRArchiveSearch.aspx日本UMIN Clinical

33、Trials Registryhttp:/www.umin.ac.jp/ctr案例分析55案例:一名內(nèi)科醫(yī)生在臨床實(shí)踐中提出問題:是否能夠?qū)⑷芩?lián)合冠狀動(dòng)脈介入治療急性心肌梗塞,目前有無充分的相關(guān)證據(jù)?檢索提示該醫(yī)生檢索文獻(xiàn)的目的并非廣泛收集信息,進(jìn)行科學(xué)研究,而是希望能夠獲取解決臨床問題的最佳證據(jù),因此屬于循證醫(yī)學(xué)實(shí)踐范疇。從查全率和查準(zhǔn)率的角度看,查準(zhǔn)更為重要在檢索時(shí)應(yīng)首先查看是否有相關(guān)的高質(zhì)量的臨床實(shí)踐指南、系統(tǒng)評(píng)價(jià)和Meta分析。若無,再查看其他等級(jí)證據(jù),如單個(gè)樣本量足夠的隨機(jī)對(duì)照實(shí)驗(yàn)、設(shè)對(duì)照組但未用隨機(jī)方法分組的研究等。56選詞 急性心肌梗塞(Acute myocardial inf

34、arction) 血栓溶解療法(Thrombolytic therapy) 急診冠狀動(dòng)脈介入治療(Primary coronary intervention) 經(jīng)皮經(jīng)腔冠狀動(dòng)脈血管成形術(shù)(Percutaneous coronary transluminal angioplasty)檢索提示57Sumsearch檢索步驟Sumsearch() 該系統(tǒng)可同時(shí)檢索PubMed、Cochrane系統(tǒng)評(píng)價(jià)摘要(DARE)、臨床實(shí)踐指南數(shù)據(jù)庫(NGC)等數(shù)據(jù)庫,并將檢索結(jié)果分別列出。 581.將檢索詞用邏輯運(yùn)算符連接,輸入檢索框中,點(diǎn)擊Search。在進(jìn)行其他檢索時(shí),可根據(jù)需要,對(duì)下列相應(yīng)選項(xiàng)進(jìn)行選擇。5

35、9檢索結(jié)果分類列出。然后對(duì)獲得的文獻(xiàn)進(jìn)行嚴(yán)格評(píng)價(jià),以解決其臨床問題,指導(dǎo)臨床實(shí)踐。602.點(diǎn)此進(jìn)入檢索界面Cochrane協(xié)作網(wǎng)HTA檢索步驟1./index5.htm61簡單檢索窗口3.點(diǎn)此進(jìn)入高級(jí)檢索界面624.輸入檢索詞5.選擇欲檢索數(shù)據(jù)庫6.點(diǎn)此進(jìn)行檢索63檢索結(jié)果界面64公共衛(wèi)生信息資源65公共衛(wèi)生專業(yè)數(shù)據(jù)庫GIDEON 公共衛(wèi)生數(shù)據(jù)和統(tǒng)計(jì)數(shù)字資源CDC Wonder 數(shù)據(jù)庫國家衛(wèi)生和計(jì)劃生育委員會(huì)統(tǒng)計(jì)信息中心統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)中國公共衛(wèi)生科學(xué)數(shù)據(jù)中心公共衛(wèi)生相關(guān)信息資源食品法典委員會(huì)標(biāo)準(zhǔn)信息國家農(nóng)業(yè)安全數(shù)據(jù)庫公共衛(wèi)生專業(yè)數(shù)據(jù)庫66衛(wèi)生管理信息合輯 目前為數(shù)不多的全球性衛(wèi)生管理專業(yè)檢索工具之一

36、GIDEON流行病及傳染病事實(shí)型及決策診斷數(shù)據(jù)庫 當(dāng)今較為完整的全球傳染病與流行病在線數(shù)據(jù)庫 ProQuest Public Health 公共衛(wèi)生全文資源 專注于提供公共衛(wèi)生領(lǐng)域的有針對(duì)性、關(guān)聯(lián)性的結(jié)果 Global Health 針對(duì)國際公共衛(wèi)生研究人員開發(fā)的專業(yè)性文摘型數(shù)據(jù)庫 國際公共事務(wù)信息數(shù)據(jù)庫主要收錄公共政策和公共事務(wù)有關(guān)的資源 HealthSTAR主要涉及衛(wèi)生保健服務(wù)的臨床與非臨床方面的文獻(xiàn) 人口及計(jì)劃生育文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫 關(guān)于人口、計(jì)劃生育和相關(guān)的衛(wèi)生保健、法律以及政策等相關(guān)文獻(xiàn) GIDEON流行病及傳染病事實(shí)型及決策診斷數(shù)據(jù)庫概述67 1992年由Mr. Uri Blackman與

37、Dr. Stephen Berger共同創(chuàng)立GIDEON Informatics, Inc,總部位于美國洛杉磯,成立初期目標(biāo)為收集全球公共衛(wèi)生與傳染病資源。 GIDEON為收費(fèi)數(shù)據(jù)庫。GIDEON收錄內(nèi)容不斷更新,截止目前該數(shù)據(jù)庫包含349種疾病、231個(gè)國家、1297種微生物與333種抗菌藥物與疫苗。另有14000條信息描述在各個(gè)國家的各傳染病狀況,超過45000張照片、圖表、電子圖與附錄。 GIDEON的數(shù)據(jù)遵循循證醫(yī)學(xué)的標(biāo)準(zhǔn)(Standards of Evidence-Based Medicine) 三大模塊Infectious Disease診斷、傳染病、旅游、藥物、疫苗等信息 Mic

38、robiology細(xì)菌、分枝桿菌、酵母菌等信息Toxicology診斷、疾病、辨識(shí)、媒介等信息GIDEON流行病及傳染病事實(shí)型及決策診斷數(shù)據(jù)庫檢索頁面68/PHMC健康與醫(yī)學(xué)大全概述69ProQuest健康與醫(yī)學(xué)大全(ProQuest Health & Medical Complete,PHMC)信息資源種類收錄了1 500多種重要的基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)及衛(wèi)生健康方面的專業(yè)期刊1 300余種期刊含有完整的全文和圖像900多種含有MEDLINE索引PHMC收錄的期刊許多來源于著名的出版商或協(xié)會(huì)Springer Ver-LagOxford University PressCambridge Univ

39、ersity PressPHMC健康與醫(yī)學(xué)大全檢索頁面70公共衛(wèi)生數(shù)據(jù)和統(tǒng)計(jì)數(shù)字資源71 WHO全球衛(wèi)生觀察站 http:/gho世衛(wèi)組織關(guān)于世界各地衛(wèi)生相關(guān)統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)的網(wǎng)站 世界銀行公開數(shù)據(jù)庫 http:/列出了世界銀行數(shù)據(jù)庫的八千多個(gè)指標(biāo),所有用戶都可以免費(fèi)使用和分享數(shù)據(jù)CDC Wonder 數(shù)據(jù)庫 http:/美國疾病預(yù)防控制中心(CDC)一個(gè)內(nèi)容廣泛的流行病學(xué)研究在線綜合數(shù)據(jù)庫美國猶他州基于指標(biāo)的公共衛(wèi)生信息系統(tǒng) /home美國猶他州衛(wèi)生局更新維護(hù)的基于互聯(lián)網(wǎng)的公共衛(wèi)生數(shù)據(jù)資源查詢系統(tǒng)國家衛(wèi)生和計(jì)劃生育委員會(huì)統(tǒng)計(jì)信息中心統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)提供了中國衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)提要 和中國衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)年鑒 中國公共衛(wèi)生科學(xué)

40、數(shù)據(jù)中心 國家人口健康科學(xué)數(shù)據(jù)共享平臺(tái)的主要數(shù)據(jù)中心之一 CDC Wonder 數(shù)據(jù)庫概述72 美國疾病預(yù)防控制中心的一個(gè)內(nèi)容廣泛的流行病學(xué)研究在線綜合數(shù)據(jù)庫。 覆蓋CDC網(wǎng)站數(shù)據(jù)與統(tǒng)計(jì)信息服務(wù)的全部內(nèi)容 Wonder 網(wǎng)絡(luò)在線數(shù)據(jù)庫(Online Database)艾滋病公共信息數(shù)據(jù)庫美國人口出生報(bào)告數(shù)據(jù)美國癌癥統(tǒng)計(jì)信息數(shù)據(jù)環(huán)境數(shù)據(jù)(每日空氣溫度熱指數(shù)、每日地表溫度、每日細(xì)顆粒物、每日陽光、日降水量)死亡數(shù)據(jù)(根本死因的死亡率、多因死亡數(shù)、嬰兒死亡數(shù))肺結(jié)核信息系統(tǒng)(OTIS)數(shù)據(jù)庫人口數(shù)據(jù)庫(美國人口普查數(shù)及美國疾控中心衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)中心的跨種族人口數(shù)據(jù))性傳播疾病發(fā)病率和疫苗不良反應(yīng)事件報(bào)告C

41、DC Wonder 數(shù)據(jù)庫檢索主頁73/國家衛(wèi)生和計(jì)劃生育委員會(huì)統(tǒng)計(jì)信息中心統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)概述74 提供中國衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)提要 和中國衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)年鑒 中國衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)提要按年度提供,可以下載文件中國衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)年鑒是一部反映中國衛(wèi)生事業(yè)發(fā)展情況和居民健康狀況的資料性年刊。 年鑒收錄了全國及31個(gè)省、自治區(qū)、直轄市衛(wèi)生事業(yè)發(fā)展情況和目前居民健康水平的統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù),以及歷史重要年份的全國統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)。國家衛(wèi)生和計(jì)劃生育委員會(huì)統(tǒng)計(jì)信息中心統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)檢索頁面75以獲取2010年全國疾控機(jī)構(gòu)數(shù)為例:http:/mohwsbwstjxxzx/s8208/list.shtml中國公共衛(wèi)生科學(xué)數(shù)據(jù)中心概述76國家人口健康科學(xué)數(shù)據(jù)共享平臺(tái)的主

42、要數(shù)據(jù)中心之一建設(shè)目標(biāo)集成分布在公共衛(wèi)生領(lǐng)域、高等院校、科研院所以及科學(xué)家個(gè)人手中的公共衛(wèi)生數(shù)據(jù)資源以及科研項(xiàng)目所產(chǎn)生的數(shù)據(jù),在此基礎(chǔ)上進(jìn)行數(shù)據(jù)整合、挖掘,并通過本項(xiàng)目建立的網(wǎng)絡(luò)平臺(tái)向社會(huì)發(fā)布,以推動(dòng)中國科學(xué)數(shù)據(jù)的共享,促進(jìn)科技進(jìn)步。1.傳染性疾病生命登記信息慢性非傳染性疾病2.3.健康危險(xiǎn)因素信息4.圖1 公共衛(wèi)生科學(xué)數(shù)據(jù)中心提供的數(shù)據(jù)77中國公共衛(wèi)生科學(xué)數(shù)據(jù)中心檢索頁面 78 食品法典委員會(huì)標(biāo)準(zhǔn)信息 食品法典委員會(huì)由糧農(nóng)組織和世衛(wèi)組織于1963年設(shè)立,負(fù)責(zé)制定統(tǒng)一協(xié)調(diào)的國際食品標(biāo)準(zhǔn)、準(zhǔn)則和行為守則,保護(hù)消費(fèi)者健康并確保食品貿(mào)易中的公平貿(mào)易實(shí)踐。食品添加劑通用法典標(biāo)準(zhǔn) (GSFA) 在線數(shù)據(jù)

43、庫 提供食品法典委員會(huì)采納的所有食品添加劑的規(guī)定食典食品獸藥殘留在線數(shù)據(jù)庫 獲取有關(guān)某種或某些獸藥對(duì)某物種或某生物組織的食典最高殘留限量(MRLs)的信息食典食品農(nóng)藥殘留在線數(shù)據(jù)庫 獲取某種或某些農(nóng)藥以及某種或某類商品的食典最高殘留限量(MRLs)和食典再殘留限量(EMRLs) 國家農(nóng)業(yè)安全數(shù)據(jù)庫 由美國職業(yè)安全與衛(wèi)生研究所(NIOSH)與佛羅里達(dá)大學(xué)合作的在線數(shù)據(jù)庫,提供農(nóng)業(yè)安全和健康出版物或資源的網(wǎng)絡(luò)參考指南,包括科普材料、培訓(xùn)材料、演示材料、視頻連接以及完整的在線視頻等。公共衛(wèi)生其他相關(guān)信息資源藥學(xué)信息資源79新藥研發(fā)事實(shí)數(shù)據(jù)庫Thomson Reuters Integrity Phar

44、mProjects 化學(xué)物質(zhì)及反應(yīng)事實(shí)數(shù)據(jù)庫Reaxys PubChem 專利數(shù)據(jù)庫Derwent Innovations IndexPATENTSCOPE 臨床藥學(xué)信息資源 Uptodate 國家食品藥品監(jiān)督管理總局網(wǎng)站 國家藥學(xué)科學(xué)數(shù)據(jù)中心 MICROMEDEX Healthcare 系列數(shù)據(jù)庫Thomson Reuters Integrity概述80Thomson Reuters公司出版的生物醫(yī)藥信息綜合數(shù)據(jù)庫資源特色:豐富的、精煉的藥理/毒理、藥代/藥動(dòng)、及臨床實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù);疾病相關(guān)的綜合性評(píng)述 全面介紹各種疾病的發(fā)現(xiàn)歷史、發(fā)病原理、流行病學(xué)調(diào)查數(shù)據(jù)、治療費(fèi)用、診斷方法、防治方法、涉及的靶

45、點(diǎn)、相關(guān)藥物、最新發(fā)布的相關(guān)重要文獻(xiàn)概要相關(guān)重要網(wǎng)站,相關(guān)學(xué)會(huì)指南等;靶點(diǎn)信號(hào)通路與通路圖 多媒體演示靶點(diǎn)參與信號(hào)通路的過程,掌握其中參與的每一個(gè)生物分子;不同靶點(diǎn)在通路圖中的相互作用。Thomson Reuters Integrity主要內(nèi)容 8130多萬種上市和在研藥物化學(xué)藥和生物藥,及其相關(guān)的結(jié)構(gòu)信息關(guān)于這些藥物的77多萬個(gè)實(shí)驗(yàn)藥理學(xué)和毒理學(xué)數(shù)據(jù)40多萬個(gè)藥物動(dòng)力學(xué)和藥物代謝數(shù)據(jù)9萬多個(gè)臨床實(shí)驗(yàn)記錄2000多個(gè)藥物靶標(biāo)分布以及這些靶點(diǎn)間的相互關(guān)系圖100多份疾病的相關(guān)綜合性評(píng)述疾病的流行病學(xué)調(diào)查數(shù)據(jù)疾病的所有可能的治療方法近2萬個(gè)藥物合成方法,并且區(qū)分出沒有專利保護(hù)的合成方法10多萬藥物

46、專利家族40多個(gè)藥物/疾病/臨床試驗(yàn)/診斷相關(guān)的生物標(biāo)記物8000多種藥物/疾病相關(guān)的基因組學(xué)信息PharmProjects概述82英國 Informa Healthcare 出版的智能型數(shù)據(jù)庫主要內(nèi)容 研究開發(fā)中的藥物信息 自1980年以來超過30,000個(gè)處于開發(fā)階段的藥物,數(shù)據(jù)每周更新 主要信息:藥物名稱、開發(fā)階段、各國上市情況。 開發(fā)廠商及科研項(xiàng)目信息 公司概況、該公司研究開發(fā)的藥物、業(yè)務(wù)活動(dòng)、主要子公司及其附屬機(jī)構(gòu)、與其他子公司、學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)的重要合同、協(xié)議、最近的財(cái)經(jīng)狀況、與產(chǎn)品許可轉(zhuǎn)讓負(fù)責(zé)人聯(lián)系的途徑、廠商的地址、電話、傳真等。 治療領(lǐng)域藥品信息 研究開發(fā)中的藥物信息 廣泛上市或中止

47、開發(fā)的藥品及許可轉(zhuǎn)讓信息 被中止研究開發(fā)、撤銷或長久未見研究開發(fā)報(bào)道的藥物或化合物的信息,提供中止開發(fā)的藥物曾經(jīng)達(dá)到的階段以及新藥許可轉(zhuǎn)讓機(jī)會(huì)。 化學(xué)結(jié)構(gòu)及化合物的藥理活性信息 化合物結(jié)構(gòu)圖,分子式、分子質(zhì)量、美國化學(xué)文摘化學(xué)物質(zhì)登記號(hào)及創(chuàng)制者。 PharmProjects檢索頁面83Derwent Innovations Index概述84Thomson Derwent與Thomson ISI公司共同推出的基于ISI Web of Knowledge(SCI)平臺(tái)的專利信息數(shù)據(jù)庫收錄來自全球40多個(gè)專利機(jī)構(gòu)(涵蓋100多個(gè)國家)的1300萬條基本發(fā)明專利,3000萬項(xiàng)專利每周增加2萬5千多個(gè)

48、專利,數(shù)據(jù)可回溯至1963年。圖 Derwent Innovations Index主要特點(diǎn)重新編寫及標(biāo)引的描述性專利信息特點(diǎn)可查找專利引用情況建立專利與相關(guān)文獻(xiàn)之間的鏈接可查找專利引用情況Derwent Innovations Index檢索界面85國際專利分類號(hào)德溫特分類號(hào)德溫特手工代碼德溫特分類代碼主題專利權(quán)人發(fā)明人專利號(hào)Uptodate概述86 Uptodate創(chuàng)建于1992年,是一個(gè)提供實(shí)時(shí)循證醫(yī)學(xué)及臨床醫(yī)療信息的數(shù)據(jù)庫,為醫(yī)生及臨床藥師日常遇見的問題提供基于循證基礎(chǔ)的診療方案以及藥物治療方案。該庫由4000多名國際著名的臨床醫(yī)學(xué)專家合作,以科學(xué)方法對(duì)7700個(gè)臨床研究主題進(jìn)行系統(tǒng)綜

49、述。系統(tǒng)綜述文獻(xiàn)中附有圖片、圖表、X光片、影像文件以及參考文獻(xiàn)摘要等,并提供Lexi-Comp的藥物信息及藥物交互作用信息。該庫為商業(yè)型數(shù)據(jù)庫,目前在國內(nèi)可免費(fèi)使用其病患教育信息。Uptodate檢索頁面87Uptodate應(yīng)用實(shí)例88長期使用華法林(Warfarin)對(duì)預(yù)防肺栓塞的復(fù)發(fā)有無療效? Warfarin and pe鼠標(biāo)觸碰專題名稱,右側(cè)出現(xiàn)該篇專題提綱Uptodate檢索結(jié)果89長期使用華法林(Warfarin)對(duì)預(yù)防肺栓塞的復(fù)發(fā)有無療效? “Anticoagulation in acute pulmonary embolism” 專題綜述全文綠色高亮部分:1、藥物名稱Drug

50、Informaition 點(diǎn)擊后顯示Lexi-comp藥物資訊中該藥品的詳細(xì)介紹2、相關(guān)主題Related Topic 點(diǎn)擊后顯示該部分內(nèi)容的相關(guān)主題綜述3、圖表Graphics 點(diǎn)擊后,另打開一窗口,顯示圖表4、證據(jù)等級(jí)Evidence Grading 在文章RECOMMENDATIONS部分,推薦的治療方法附有證據(jù)等級(jí)。Uptodate進(jìn)入Lexi-Comp藥物相互作用查詢頁面90UpToDate可以幫助醫(yī)生、臨床藥師查詢藥物間是否產(chǎn)生相互作用。 點(diǎn)擊 “藥物相互作用”,進(jìn)入Lexi-Comp藥物相互作用查詢頁面UptodateLexi-Comp藥物相互作用查詢頁面91UpToDate可以

51、幫助醫(yī)生、臨床藥師查詢藥物間是否產(chǎn)生相互作用。 輸入兩種以上的欲查詢藥品,以Aspirin、Grape Seed、Lasix、Orlistat為例,輸入后點(diǎn)擊“Analyze”按鈕,頁面右邊出現(xiàn)分析結(jié)果點(diǎn)擊超鏈接“risk rating”顯示相互作用的等級(jí)說明,分成5個(gè)等級(jí),分別是A、B、C、D、XUptodateLexi-Comp藥物相互作用查詢結(jié)果92生物信息學(xué)資源93生物信息學(xué)資源概述生物信息學(xué)資源類型 核酸序列數(shù)據(jù)庫 單核苷酸多態(tài)性數(shù)據(jù)庫 PDB OMIM 生物信息學(xué)資源應(yīng)用基因、RNA和蛋白質(zhì)序列信息搜集生物信息學(xué)資源概述94 涵蓋生命科學(xué)的各類數(shù)據(jù) 包括核苷酸序列、基因變異、基因表

52、達(dá)譜、微小RNA、 蛋白質(zhì)序列、蛋白質(zhì)三維空間結(jié)構(gòu)等 生物信息學(xué)資源的分類根據(jù)訪問權(quán)限公開訪問數(shù)據(jù)庫(open accessible database)訂閱數(shù)據(jù)庫(subscription database)根據(jù)收錄內(nèi)容特定內(nèi)容數(shù)據(jù)庫(specific database)整合數(shù)據(jù)庫(integrated database)生物信息學(xué)資源類型95核酸序列數(shù)據(jù)庫 GenBank /genbank ENA (European Nucleotide Archive) www.ebi.ac.uk/ena/ DDBJ (DNA Data Bank of Japan) http:/www.ddbj.nig.

53、ac.jp/ 單核苷酸多態(tài)性數(shù)據(jù)庫 http:/SNP/ 基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫GEO http:/geo/ 疾病基因數(shù)據(jù)庫OMIM / 蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫 UniProt PDB / 生物分子網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫 Pathway Commons http:/ KEGG http:/www.kegg.jp/ 96INSDC的數(shù)據(jù)規(guī)模核酸序列數(shù)據(jù)庫世界三大核酸序列數(shù)據(jù)庫美國的GenBank /genbank歐洲的ENA(European Nucleotide Archive) www.ebi.ac.uk/ena/日本的DDBJ(DNA Data Bank of Japan) http:/www.ddbj.nig.ac.

54、jp/共同構(gòu)成國際核酸序列數(shù)據(jù)庫聯(lián)盟 (International Nucleotide Sequence Database Collaboration,INSDC)每日同步更新、數(shù)據(jù)共享97單核苷酸多態(tài)性數(shù)據(jù)庫 (dbSNP)概述NCBI創(chuàng)建并維護(hù)創(chuàng)建于1998年 包括大規(guī)模人類基因組計(jì)劃測得的SNP數(shù)據(jù)、不同物種在不同實(shí)驗(yàn)條件下的基因變異信息 數(shù)據(jù)獲取方式限定SNP所屬物種、所在染色體、所在染色體位置范圍、功能分類、標(biāo)注信息,批量查詢通過關(guān)鍵詞或SNP唯一標(biāo)識(shí)符查詢FTP下載dbSNP中記錄的SNP基本信息98Sherry, S.T., Ward, M.H., Kholodov, M.,

55、et al., dbSNP: the NCBI database of genetic variation. Nucleic Acids Res, 2001. 29(1): p. 308-311.該SNP所屬物種、參考文獻(xiàn)、等位(allele)信息及其臨床顯著性(clinical significance)、人類基因組變異研究協(xié)會(huì)(HGVS,Human Genome Variation Society)對(duì)該SNP的命名以人類APOE基因相關(guān)的SNP(rs769452)為例:dbSNP提供SNP在基因上分布的可視化99Bhagwat, M., Searching NCBIs dbSNP data

56、base. Curr Protoc Bioinformatics, 2010. Chapter 1: p. Unit 1 19.包括該SNP所參照的基因序列,所在基因序列的位置及其鄰近SNPs,所產(chǎn)生mRNA堿基變化和蛋白質(zhì)殘基變化提供從該SNP記錄到NCBI其它數(shù)據(jù)庫的鏈接PDB(Protein Data Bank)概述100存儲(chǔ)生物大分子三維結(jié)構(gòu)的數(shù)據(jù)庫1971年創(chuàng)建,由美國Brookhaven國家實(shí)驗(yàn)室(Brookhaven National Laboratory)負(fù)責(zé)運(yùn)維 1998年,美國結(jié)構(gòu)生物信息合作研究組織RCSB (Research Collaboratory for Stru

57、ctural Bioinformatics)成立,負(fù)責(zé)PDB的開發(fā)和管理 1998年,美國結(jié)構(gòu)生物信息合作研究組織RCSB (Research Collaboratory for Structural Bioinformatics)成立,負(fù)責(zé)PDB的開發(fā)和管理成員組織:美國的RCSB PDB、歐洲的PDBe、日本的PDBj、美國的BMRB成員之間同步更新、共享數(shù)據(jù) 數(shù)據(jù)免費(fèi)對(duì)外開放,PDB數(shù)據(jù)每周更新一次101PDB(Protein Data Bank)數(shù)據(jù)記錄 PDB數(shù)據(jù)記錄:生物大分子所屬物種名稱測量結(jié)構(gòu)的實(shí)驗(yàn)手段原子坐標(biāo)分辨率結(jié)構(gòu)因子溫度系數(shù)蛋白質(zhì)主鏈數(shù)目配體分子式金屬離子二級(jí)結(jié)構(gòu)等信息

58、OMIM概述102 關(guān)于人類基因和表現(xiàn)型的在線知識(shí)庫 內(nèi)容源于Victor A. McKusick博士于1966年編寫發(fā)行發(fā)表的Mendelian Inheritance in Man一書。 內(nèi)容源于Victor A. McKusick博士于1966年編寫發(fā)行發(fā)表的Mendelian Inheritance in Man一書檢索方式:基因的系統(tǒng)綜述在數(shù)據(jù)庫的編號(hào)以“*”開始表現(xiàn)型系統(tǒng)綜述的編號(hào)以“#”開始基因和表現(xiàn)型綜合描述的編號(hào)以“+”開始未知分子機(jī)制的表現(xiàn)型或者位點(diǎn)描述的編號(hào)以“%”開始103OMIM查詢阿爾茲海默癥相關(guān)的基因輸入疾病名稱:Alzheimers DiseaseOMIM關(guān)于阿

59、爾茲海默癥的記錄104涵蓋內(nèi)容臨床特點(diǎn)、生化特點(diǎn)、病理、遺傳、診斷、分子遺傳學(xué)、人口遺傳學(xué)、動(dòng)物模型等角度提供了疾病的標(biāo)準(zhǔn)分類編碼ICD(International Classification of Diseases)和SNOMED CT(Systematized Nomenclature of Medicine Clinical Terms)內(nèi)容導(dǎo)航疾病名稱的臨床編碼疾病相關(guān)基因列表OMIM關(guān)于阿爾茲海默癥基因APP的記錄105關(guān)聯(lián)至外部基因數(shù)據(jù)庫涵蓋克隆、基因結(jié)構(gòu)、基因功能、發(fā)病機(jī)理、分子遺傳學(xué)、動(dòng)物模型等角度與核酸、基因變異、蛋白質(zhì)、生物分子網(wǎng)絡(luò)、生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)、臨床等50多個(gè)數(shù)據(jù)庫建立

60、了關(guān)聯(lián)鏈接基因相關(guān)表現(xiàn)型內(nèi)容導(dǎo)航106生物信息學(xué)資源應(yīng)用基因、RNA和蛋白質(zhì)序列信息搜集方法1:關(guān)鍵詞檢索核酸序列數(shù)據(jù)庫 訪問NCBI的基因數(shù)據(jù)庫輸入基因名字并限定物種 “APP AND Homo sapiensporgn”查詢得到人類APP基因/gene/351方法 2:借助數(shù)據(jù)庫之間的互相鏈接,獲取基因序列信息在OMIM基因的頁面右側(cè),點(diǎn)擊Gene Info導(dǎo)航條,展開一組基因數(shù)據(jù)庫選擇其中的NCBI Gene直接鏈接到人類APP基因頁面/gene/351阿爾茲海默癥相關(guān)人類APP基因信息頁面107基因基本信息(NCBI, Gene ID:351) 包括名字、所屬物種、基因功能描述等內(nèi)容基

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