腫瘤基因檢測及病例分析

1、腫瘤基因檢測及病例分析前言基因檢測是一種通過血液、其他體液或細(xì)胞來檢測DNA的技術(shù)。先從被檢測者提取其外周血或組織細(xì)胞，然后將里面的基因信息擴(kuò)增，再通過專業(yè)設(shè)備檢測其中的DNA分子信息，分析基因類型和存在的基因缺陷，也可判斷其表達(dá)功能是否完整。隨著個體化醫(yī)學(xué)的發(fā)展和精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)概念的提出，腫瘤基因檢測技術(shù)發(fā)展迅速。傳統(tǒng)的基因突變檢測方法如 Sanger 測序、焦磷酸測序和實時熒光 PCR 等僅能對單個基因，或者單個基因的部分外顯子突變進(jìn)行檢測，采用上述傳統(tǒng)基因突變檢測方法同時檢測多個基因，一則需要的樣本量大，其次需要更長的檢測時間和更大的工作量。高通量測序即下一代測序（NGS），能夠同時對上百萬甚

2、至數(shù)十億個 DNA 片段進(jìn)行測序，可實現(xiàn)在較低的成本下，一次對多至上百個腫瘤相關(guān)基因、全外顯子以及全基因組進(jìn)行檢測，而且需要的樣本量并不增加。因其在通量、成本和效率方面的優(yōu)勢，NGS 在實體腫瘤體細(xì)胞基因突變中展現(xiàn)了其廣闊的應(yīng)用前景。腫瘤基因檢測的意義何在？比起“冷酷無情”的放/化療療法，靶向藥治療更加可靠、貼心。然而腫瘤靶向藥并不適用于所有患者，也絕非任何癌種皆可，臨床端需要從患者的基因構(gòu)成，即從根源上找到癌癥的發(fā)病原因，才能知道哪一款靶向藥更適合患者，從而達(dá)到滿足最佳療效的同時將藥物帶來的副作用降到最低。而基因檢測就是幫助患者排查個體發(fā)病原因的關(guān)鍵手段。所有腫瘤患者都要做基因檢測嗎？理論上

3、，所有腫瘤患者都可以根據(jù)自身情況，如：不同癌種、不同分期、不同經(jīng)濟(jì)條件，接受不同種類的基因檢測。但并不是一定要做。有哪些靶向藥適用于基因檢測后選擇？隨著國內(nèi)外靶向藥隊伍的不斷擴(kuò)充升級，幾乎所有的癌癥都有靶向藥可選。“世界第一”癌種肺癌，因為其發(fā)病率及死亡率都高居世界癌癥排行榜第一位，給全球健康帶來了嚴(yán)重的負(fù)擔(dān)。因此，其獲批的靶向藥相對來說也是最多的，研究發(fā)現(xiàn)的對應(yīng)靶點也最多。除此之外，其他常見癌癥如乳腺癌、胃癌、卵巢癌等也有很多靶向藥可用。癌癥基因檢測做一次就可以了嗎？理論上，在患者沒有發(fā)生癌癥復(fù)發(fā)、轉(zhuǎn)移和耐藥的情況下，基因檢測只需要做一次即可。但如果出現(xiàn)復(fù)發(fā)、轉(zhuǎn)移和耐藥，則意味著可能發(fā)生了新

4、的突變。因此，在條件允許的情況下，臨床會建議進(jìn)行二次檢測或重復(fù)多次檢測，以便及時明確其機(jī)制，為后續(xù)治療及判斷預(yù)后提供依據(jù)。目前，腫瘤基因檢測在臨床上主要用于癌癥風(fēng)險篩查以及指導(dǎo)癌癥治療。據(jù)報道，安吉麗娜朱莉通過基因檢測得知有87%的可能性得乳腺癌、50%可能性得卵巢癌，因此她選擇了預(yù)防性切除雙乳術(shù)，使乳腺癌患病風(fēng)險從87%降到了5%。同樣的，喬布斯的醫(yī)生團(tuán)隊根據(jù)他的基因檢測結(jié)果為其選擇了特定治療藥物，使他在確診胰腺癌后，活了八年之久，堪稱奇跡?，F(xiàn)有的腫瘤檢測方法目前市場上腫瘤基因檢測產(chǎn)品主要分為“治療指導(dǎo)”與“癌癥風(fēng)險篩查”兩類，通常以基因檢測目的或者基因檢測個數(shù)命名。一般檢測基因數(shù)目越多，可

5、以提供的信息越多，相應(yīng)的檢測成本也越高，但并不是所有患者都需要選擇大panel檢測，建議腫瘤患者咨詢醫(yī)生根據(jù)自身的病情進(jìn)展結(jié)合自身經(jīng)濟(jì)狀況綜合選擇。接下來以圣維爾醫(yī)學(xué)檢驗中心的一例案例，來介紹腫瘤基因檢測是如何在臨床診療中發(fā)揮具體作用的。臨床案例展示提要：劉女士49歲進(jìn)行宮頸癌根治術(shù)，術(shù)后不到2年又確診肺癌，如何通過基因檢測判斷是復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移還是新發(fā)腫瘤？如何進(jìn)行個體化治療？是否具有遺傳風(fēng)險？2017年（49歲）12月確診宮頸癌，行宮頸癌根治術(shù)，術(shù)后病理示，（宮頸）中分化鱗癌，盆腔淋巴結(jié)1/13可見癌轉(zhuǎn)移，術(shù)后輔助化療6個周期。2019年8月（51歲），來院檢測CT示肺部陰影，PET-CT示高代謝

6、病灶。行超聲支纖鏡活檢示：低分化鱗癌。2019年8月29日，取肺部穿刺活檢組織送檢“圣維爾實體瘤50基因檢測”。標(biāo)本經(jīng)質(zhì)控合格，標(biāo)本最終測序深度為6275X，測序質(zhì)量評估合格。2019年9月6日出具基因檢測結(jié)果顯示：MET基因14號外顯子突變（突變頻率14.9%）及FGFR3基因5倍擴(kuò)增。2019年9月17日開始進(jìn)行靶向治療，口服Capmatinib+甲磺酸樂伐替尼。2019年11月2日（一個半月后），復(fù)查CT顯示右肺部病灶基本消失。2019年12月17日（3個月后），復(fù)查PET-CT，療效評價：PR。CT: 2019/8/23(靶向治療前）CT: 2019/11/2(靶向治療1個半月）PET

7、-CT: 2019/8/23(靶向治療前）PET-CT: 2019/12/23(靶向治療3個月）2020年4月復(fù)查正常無進(jìn)展。問題1：患者的肺部病灶是復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移？還是新發(fā)腫瘤？2019年11月26日取2017年底宮頸腫瘤手術(shù)標(biāo)本進(jìn)行“實體瘤50基因檢測”?；驒z測結(jié)果顯示存在AKT1基因3號外顯子突變（突變頻率4.87%），提示患者宮頸腫瘤組織分子生物學(xué)特征與肺部腫瘤不一致，非同一來源。判斷：肺部病灶為原發(fā)性肺鱗癌。問題2：患者確診宮頸癌與肺癌兩處原發(fā)腫瘤，是否有遺傳風(fēng)險？2019年12月17日取患者2ml EDTA抗凝血進(jìn)行“遺傳性腫瘤易感基因全套檢測”，平均測序深度為576X，檢測結(jié)果提示無

8、遺傳性腫瘤相關(guān)基因的致病性突變，遺傳風(fēng)險低。備注：本次案例引用已經(jīng)過患者本人許可，僅用于科普宣傳。病例總結(jié)劉女士宮頸癌根治術(shù)后確診肺癌，通過基因檢測提示患者宮頸腫瘤組織分子生物學(xué)特征與肺部腫瘤不一致，非同一來源，判斷肺部病灶為原發(fā)性腫瘤。并根據(jù)肺部腫瘤的基因檢測結(jié)果，進(jìn)行靶向治療，口服靶向藥后3個月后復(fù)查療效評估PR。鑒于患者有兩處原發(fā)腫瘤，通過遺傳性腫瘤基因檢測排除遺傳風(fēng)險，減少患者及其家屬對于腫瘤遺傳風(fēng)險的擔(dān)憂。結(jié)語目前，通過各種腫瘤基因檢測技術(shù)與相應(yīng)的用藥指導(dǎo)，臨床上已經(jīng)幫助很多患者找到最合適的個體化診療方案，幫助了大量的病人延長生命期。但是要注意的是，由于癌癥的發(fā)病機(jī)制復(fù)雜，即使基因檢測結(jié)果顯示為患癌高風(fēng)險也不一定就會得癌癥?；驒z測可以幫助了解個人的患癌風(fēng)險，但這只能